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Directive Cadre sur l’Eau : les eaux de transitions Suivi de la macrofaune benthique des lagunes méditerranéennes en région LR et PACA
Campagne 2009
DIRECTIVE CADRE SUR L’EAU : EAUX DE TRANSITIONS EVALUATION DE LA QUALITE ECOLOGIQUE DE LA MACROFAUNE BENTHIQUE
CREOCEAN – Agence Montpellier
39 rue Jean GIROUX 34080 MONTPELLIER - France Tél : 04.99.23.31.65 Fax : 04.99.23.31.71 e-mail : [email protected] web : www.creocean.fr
Suivi des lagunes méditerranéennes en région Languedoc-Roussillon et PACA, campagne 2009
Montpellier, Juillet 2010 Dossier 08031E
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Directive Cadre sur l’Eau : les eaux de transitions Suivi de la macrofaune benthique des lagunes méditerranéennes en région LR et PACA
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SOMMAIRE
1 - INTRODUCTION ................................................................................................... 6
1.1 - LA DIRECTIVE CADRE SUR L’EAU ........................................................................... 6
1.2 - OBJECTIFS DE L’ETUDE ........................................................................................... 8
2 - MATERIEL ET METHODES ................................................................................. 9
2.1 - PLAN D’ECHANTILLONNAGE ................................................................................... 9
2.1.1 - Localisation des stations ...................................................................................................11
2.1.1 - Calendrier des interventions .............................................................................................11
2.2 - METHODE DE PRELEVEMENT ............................................................................... 20
2.2.1 - Prélèvement de la macrofaune benthique ........................................................................20
2.2.2 - Prélèvement de sédiment et mesures d’oxydo-réduction .................................................20
2.2.1 - Mesures d’eau ...................................................................................................................20
2.3 - TRI ET DETERMINATION DU BENTHOS ................................................................ 23
2.4 - CALCUL DES INDICES BIOLOGIQUES .................................................................. 23
2.4.1 - Indice de Shannon-Weaver (H’) ........................................................................................24
2.4.2 - AZTI Marine Biotic Indice (AMBI) & Coefficent Biotique (CB) ..........................................26
2.4.3 - M-AMBI .............................................................................................................................29
2.4.4 - Indice Trophique (IT) .........................................................................................................30
2.4.5 - La potentialité biologique ..................................................................................................32
2.4.6 - Indice benthique global lagunaire (IBGL) ..........................................................................34
2.4.7 - L’indice MISS-TW .............................................................................................................41
2.4.8 - EcoQ .................................................................................................................................45
2.5 - SYNTHESE ............................................................................................................... 45
3 - RESULTATS ....................................................................................................... 46
3.1 - MESURES DANS LA COLONNE D’EAU .................................................................. 46
3.1.1 - Profondeur .........................................................................................................................48
3.1.2 - Température ......................................................................................................................48
3.1.3 - pH ......................................................................................................................................48
3.1.4 - Salinité ...............................................................................................................................48
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3.2 - QUALITE DES SEDIMENTS ..................................................................................... 51
3.2.1 - Granulométrie et classification du sédiment .....................................................................51
3.2.2 - Enrichissement ..................................................................................................................53
3.2.3 - Potentiel d’oxydo-réduction (rédox) ..................................................................................55
3.2.4 - Bilan de la qualité des sédiments .....................................................................................57
3.3 - QUALITE DES PEUPLEMENTS BENTHIQUES ....................................................... 60
3.3.1 - Richesse spécifique ..........................................................................................................60
3.3.2 - Densité ..............................................................................................................................63
3.3.3 - Biomasse ...........................................................................................................................66
3.3.1 - Indices de diversité ...........................................................................................................68
3.3.2 - L’AMBI ...............................................................................................................................71
3.3.1 - Le M-AMBI ........................................................................................................................75
3.3.2 - L’indice trophique ..............................................................................................................79
3.3.3 - La Potentialité Biologique ..................................................................................................82
3.3.4 - IBGL ..................................................................................................................................87
3.3.5 - L’indice MISS-TW .............................................................................................................89
3.3.6 - Espèces dominantes .........................................................................................................91
3.3.7 - Espèces indicatrices de conditions particulières ...............................................................93
3.3.8 - Les grands types de biocénoses ......................................................................................95
3.3.9 - Bilan qualité des peuplements par station ........................................................................97
4 - DISCUSSION ET ANALYSE CRITIQUE DES INDICES ..................................... 98
4.1 - TABLEAU RECAPITULATIF DES RESULTATS ....................................................... 98
4.2 - ANALYSE CRITIQUE DES INDICES ...................................................................... 100
4.2.1 - Cohérence entre les indices ........................................................................................... 100
4.2.2 - Avantages et Inconvénients des indices ........................................................................ 102
4.2.3 - Cohérence des indices avec le dire d’expert ................................................................. 110
4.3 - CONCLUSION SUR LES INDICES ......................................................................... 118
4.3.1 - Bilan des écarts .............................................................................................................. 118
4.3.2 - Bilan des indices ............................................................................................................ 120
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LISTE DES TABLEAUX
Tableau 1. Lagunes suivies lors des campagnes de contrôle de surveillance. ...................... 10 Tableau 2 : Points GPS (WGS 84) des stations échantillonnées en 2009. ............................ 12 Tableau 3. Correspondance entre les coefficients benthiques (AMBI) et les valeurs des
coefficients benthiques .................................................................................................... 28 Tableau 4 : Potentialité biologique : valeurs seuils de référence et classes de qualité pour la
richesse et la densité. ..................................................................................................... 32 Tableau 5 : Grille de lecture de la potentialité biologique en fonction des classes de richesse
et de densité, et de l’abondance relative des espèces indicatrices de perturbation. ...... 33 Tableau 6 : Potentialité biologique : classes de qualité et codes couleur du niveau trophique.
........................................................................................................................................ 33 Tableau 7. IBGL : Valeurs seuils et classes de qualité de l’étape I de caractérisation globale
de la lagune. .................................................................................................................... 36 Tableau 8. IBGL : Valeurs seuils et classes de qualité de l’étape II de caractérisation de
l'enrichissement trophique. ............................................................................................. 37 Tableau 9. IBGL : Valeurs seuils et classes de qualité de l’étape III de caractérisation
physique du milieu. ......................................................................................................... 38 Tableau 10. IBGL : Valeurs seuils et classes de qualité de l’étape IV des autres contraintes
........................................................................................................................................ 39 Tableau 11 : Domaines de salinité. ........................................................................................ 42 Tableau 12 : Indice MISS-TW : valeurs seuils des métriques retenues pour les habitats
euryhalins, polyhalins et méso-oligohalins. ..................................................................... 44 Tableau 13. Valeurs seuils de référence des EcoQ pour l’indice de Shannon, l’AMBI, le M-
AMBI, l’indice trophique, l’IBGL et le MISS-TW. ............................................................. 45 Tableau 14. Résultats des mesures physico-chimiques de la colonne d’eau. ....................... 47 Tableau 15 : Intervalles et domaines de salinité correspondants. ......................................... 49 Tableau 16. Caractérisation de la salinité des stations. ......................................................... 50 Tableau 17 : Classification du sédiment, Ibouily (1981). ........................................................ 51 Tableau 18. Composition des sédiments en fraction fine et types rencontrés par station. .... 52 Tableau 19. Valeurs seuils et classes d’enrichissement pour la matière organique et les
nutriments azote et phosphore. ....................................................................................... 53 Tableau 20. Résultats de l’enrichissement des sédiments dans les lagunes et code couleur.
........................................................................................................................................ 54 Tableau 21. Valeurs seuils des classes de qualité du rédox en surface et en profondeur. ... 55 Tableau 22. Valeurs moyennes du rédox en surface et en profondeur. ................................ 56 Tableau 23 : Bilan de la qualité des sédiments. ..................................................................... 58 Tableau 24 : Valeurs seuils de référence pour la richesse spécifique. .................................. 60 Tableau 25 : Résultats de la richesse spécifique totale, code couleur de qualité et évolution
entre 2006 et 2009. ......................................................................................................... 62 Tableau 26 : Valeurs seuils de référence pour la densité et classes de qualité. .................... 63 Tableau 27 : Résultats des densités (en ind./m²) et évolution. .............................................. 65 Tableau 28 : Résultats des biomasses en 2009. ................................................................... 67 Tableau 29 : Valeurs seuils de référence pour l’indice de diversité de Shannon. .................. 68 Tableau 30 : Résultats de l’indices de diversité de Shannon, code couleur de qualité et
évolution entre 2006 et 2009. .......................................................................................... 70 Tableau 31 : Valeurs seuils de référence pour l’AMBI, d’après Borja et al., 2003. ................ 71 Tableau 32 : Résultats de l’AMBI, code couleur de qualité et évolution entre 2006 et 2009. 74 Tableau 33 : Valeurs de référence retenues pour le calcul du M-AMBI ................................. 75 Tableau 34 : Seuils de référence du M-AMBI ........................................................................ 75 Tableau 35 : Résultats du M-AMBI et évolution entre 2006 et 2009. ..................................... 78 Tableau 36 : Valeurs seuils de l’indice trophique. .................................................................. 79
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Tableau 37 : Résultats de l’indice trophique avec l’abondance des différents groupes trophiques et les codes couleurs de qualité de l’indice. .................................................. 81
Tableau 38 : Classe de qualité, code couleur du niveau trophique et potentialité biologique. ........................................................................................................................................ 82
Tableau 39 : Résultats de la potentialité biologique (campagne de 2009) en fonction des classes de qualité de la richesse et de la densité. .......................................................... 83
Tableau 40 : Résultat des niveaux trophiques, code couleurs de qualité et évolution entre 2006 et 2009. .................................................................................................................. 86
Tableau 41 : Résultats de l’IBGL et des étapes intermédiaires pour chaque secteur. ........... 88 Tableau 42 : Résultats de l’indice MISS-TW en fonction de la typologie des stations. .......... 90 Tableau 43 : Occurrences des espèces dominantes pas station. .......................................... 92 Tableau 44 : Occurrences des espèces indicatrices d’enrichissement du sédiment en matière
organique par station, en % de la densité totale. ............................................................ 94 Tableau 45 : Les grands types de biocénoses représentées par station. .............................. 96 Tableau 46 : Synthèse des indices et code couleur de qualité .............................................. 99 Tableau 47 : Analyse des indices : matrice des corrélations de Spearman. ........................ 101 Tableau 48 : Mode d’attribution des notes pour les indices en fonction des codes couleurs de
qualité des états. ........................................................................................................... 110 Tableau 49 : Code couleur et notes attribuées aux intervalles des notes d’experts. ........... 110 Tableau 50 : Notation des indices de 1 à 5 en fonction des codes couleurs de qualité pour
chaque lagune. .............................................................................................................. 111 Tableau 51 : Code couleur des écarts des notes des indices à la note moyenne d’expert. 112 Tableau 52 : Ecarts des notes attribuées aux indices à la note d’expert. ............................ 113 Tableau 53 : Synthèse des performances des indices d’après les écarts à l’avis d’expert. . 118
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LISTE DES FIGURES
Figure 1. Méthodologie de prélèvement de la macrofaune benthique. .................................. 21 Figure 2. log2(Ni/N) - f(Ni = N) ................................................................................................ 25 Figure 3. (Ni/N) x log2(Ni/N) = f(Ni/N) ..................................................................................... 25 Figure 4. Modèle des Indices Biotiques (Glémarec & Hily, 1981) .......................................... 27 Figure 5 : Synthèse de calcul de l’IBGL. ................................................................................ 40 Figure 6 : Indice MISS-TW : résumé schématique de la méthode statistique de traitement
des données Stations*Espèces. ..................................................................................... 41 Figure 7 : Indice MISS-TW : définition de l’état de référence dans le cas général, suivant la
distribution des métriques pour un paramètre donné. ..................................................... 43 Figure 8 : Exemple de fiche synthétique sur les caractéristiques sédimentaires et la qualité
des peuplements d’une station. ...................................................................................... 97 Figure 9 : Comparaison de l’AMBI suivant l’année de calcul du jeu de données. ................ 104 Figure 10 : Evolution de l’écart moyen de l’AMBI en fonction des versions du logiciel par
rapport à 2010. .............................................................................................................. 104
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1 - INTRODUCTION
1.1 - La Directive Cadre sur l’Eau
Du fait de leurs missions statutaires, l’Agence de l’Eau Rhône-Méditerranée-Corse et
l’IFREMER œuvrent depuis de nombreuses années en matière de connaissance, de
surveillance, de protection, de gestion et de mise en valeur du littoral méditerranéen. Ces
institutions coopèrent donc naturellement dans le cadre de la mise en place de la DCE. Elles
ont mandaté CREOCEAN pour mettre en œuvre les campagnes d’échantillonnage du
benthos des eaux de transition sur l’ensemble de la façade méditerranéenne hors Corse.
CREOCEAN est aussi en charge de l’interprétation des résultats.
Les enjeux de la Directive 2000/60/CE du Parlement Européen et du Conseil du 23 octobre
2000 (DCE) établissent un nouveau cadre pour une politique communautaire dans le
domaine de l’eau et la gestion des écosystèmes côtiers.
L’objectif de cette Directive est l’atteinte d’un bon état écologique et chimique des masses
d’eau en 2015, pour les eaux souterraines et les eaux de surface, incluant les eaux
continentales, les eaux de transition et les eaux côtières.
Conformément à son article 8, le programme de surveillance des eaux côtières et des eaux
de transition est établi de manière à dresser un tableau cohérent et complet de l’état des
masses d’eaux au sein du bassin. Il est défini dans le cadre de l’élaboration des Schémas
Directeurs des Données sur l'Eau (SDDE) prévus par la circulaire du 26 mars 2002.
Les objectifs de ce programme de surveillance sont de permettre l’appréciation de l’état
écologique des masses d’eau côtières et de transition et contribuer à la définition des
objectifs, des dérogations (reports de délais, objectifs moins stricts que le bon état et le bon
potentiel écologique) et des programmes de mesures (au sens de la Directive Cadre),
Les réseaux concernés incluent :
le réseau de surveillance comprenant :
o les contrôles de surveillance qui sont à réaliser dans une sélection de
masses d’eau représentatives de l’état des eaux, pour permettre à la
France de présenter à l’Europe un rapport sur l’état des eaux de surface ;
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o les contrôles opérationnels qui sont à réaliser dans toutes les masses
d’eau risquant de ne pas atteindre les objectifs, pour suivre l’incidence des
pressions importantes exercées par les activités humaines ;
o les contrôles d’enquête prévus lorsque le contrôle de surveillance indique
que les objectifs ne seront probablement pas atteints pour une masse
d’eau et qu’un contrôle opérationnel n’a pas encore été établi.
le réseau de sites référence : mesure des conditions de référence biologiques là
où elles existent.
le réseau d’inter-étalonnage : comparaison entre états membres des valeurs
mesurées aux bornes du bon état écologique.
Actuellement, l’étang de La Palme constitue la lagune de référence pour toutes les lagunes.
Une étude typologique réalisée par CREOCEAN (2008) sur l’ensemble des lagunes
méditerranéennes à permis de mettre en évidence de grandes différences entre les lagunes
au travers l’analyse des paramètres hydromorphologiques : l’étang de Thau par exemple est
profond et salé, alors que Crey est peu profond et quasiment pas salé. Les fonctionnements
de ces lagunes sont clairement différents, et de fait, le bon état écologique ne peut pas
s’exprimer de la même manière d’un site à l’autre, d’où la notion de types. Dans cette étude,
les types regroupant des lagunes aux caractéristiques voisines sont basés sur
l’hydromorphologie, comme la géométrie de la lagune (surface, profondeur) et certains
paramètres physicochimiques, comme le degré de salinité et la composition des sédiments
par exemple.
Pour information, de l’analyse de ces paramètres et de leur significativité, 4 grands types
sont proposés :
Type 1 : les lagunes reliées à la mer et recevant des eaux douces (présence d’un
tributaire permanent ou saisonnier), comme l’étang de Salses-Leucate ;
Type 2 : les lagunes non reliées à la mer et recevant des eaux douces, par
exemple l’étang de Scamandre ;
Type 3 : les lagunes déconnectées de la mer et ne recevant pas de tributaire,
comme l’étang des Batayolles en Camargue ;
Type 4 : les lagunes profondes, telles l’étang de Thau et l’étang de Berre.
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L’analyse à montré que le type 4 peut être intégré au type 1, ce qui ferait trois types
lagunaires.
Actuellement, un seul type de lagune est considéré. Cependant, cette étude soulève les
limites de l’utilisation des valeurs de référence de certains descripteurs du milieu, qui ne sont
basées que sur un seul type.
1.2 - Objectifs de l’étude
Cette étude s’inscrit dans les contrôles de surveillance des masses d’eau de transition sur la
façade méditerranéenne. Elle est la deuxième étude de ce contrôle, la première ayant été
réalisée en 2006. CREOCEAN est en charge des régions Languedoc-Roussillon et PACA,
STARESO est en charge de la partie Corse.
Dans un premier temps, cette deuxième campagne du réseau de surveillance a pour but de
vérifier l’évolution des lagunes au niveau du compartiment macrofaune benthique de substrat
meuble au cours des dernières années. Cette campagne a aussi pour objectif de suivre
l’évolution de la qualité des lagunes qui doivent tendre vers le Bon Etat Ecologique en 2015
défini par le réseau de référence.
Dans un deuxième temps, faisant suite au bilan de la DCE 2009, une analyse critique des
indices permet d’étudier les cohérences entre les indices biologiques et l’efficacité avec
laquelle ils discriminent les lagunes.
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2 - MATERIEL ET METHODES
2.1 - Plan d’échantillonnage
Pour cette deuxième campagne du contrôle de surveillance, 29 stations sont
échantillonnées. Le Tableau 1 fait la synthèse du plan d’échantillonnage des campagnes
2006 et 2009.
A cette liste s’ajoute une station supplémentaire dans le sud de Marette (MAS) qui a été
échantillonnée à la demande du Syndicat Mixte pour la protection et la gestion de la
Camargue Gardoise. Cette station sera intégrée aux tableaux suivants, l’effectif total des
stations échantillonnées est donc de 30.
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Tableau 1. Lagunes suivies lors des campagnes de contrôle de surveillance.
Masse d’eau Station Code Campagne
2006 Campagne
2009 T01 Canet Sud CNS X
T02 Salses-Leucate Sud LES X X Salses-Leucate Nord LEN X X
T03 La Palme Sud LAP X La Palme Nord LAP X X
T04 Bages-Sigean Sud BGS X Bages-Sigean Milieu BGM X Bages-Sigean Nord BGN X
T05b Campignol CAM X T06a Gruissan GRU X T08 Vendres VDR X T09 Grand Bagnas BAN X X
T10 Pisse Saume PIS X Thau Est TE X X Thau Ouest TW X X
T11a Or est ORE X Or ouest ORW X
T11b
Arnel ARN X Méjean Ouest MEW X X Méjean Est MEE X Prévost Ouest PRW X Prévost Est PRE X X Grec GRE X
T11c Vic VIC X Pierre Blanche PBE X
T12 Ponant PON X T13e Marette Nord MAN X
T13h Scamandre SCA X Crey CRE X
T14a Vaccarès VCS X X T14c La Palissade PLS X
T15a Berre Sud BRS X X Berre Nord BRN X X
T15b Vaïne VAI X T15c Bolmon BOL X
Total : 17 29
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2.1.1 - Localisation des stations
Les localisations des stations de la campagne de 2009 sont précisées dans le Tableau 2 et
illustrées par les cartes ci-après.
2.1.1 - Calendrier des interventions
La campagne de terrain a commencé le 10 mars 2009 sur l’étang de Vic et s'est terminée le
26 juin 2009 sur l’étang de Bolmon. Le Tableau 2 récapitule les dates et lieux des sorties.
Le terrain se faisait par équipe de 2 à 4 ; ont participé Sébastien THORIN, Thibault
SCHVARTZ, Xavier DOLBEAU ; Alexandre SOFIANOS, Carole PAPIN et Julie FRANCES.
CREOCEAN tient à remercier toutes les personnes qui ont aidé à la réalisation de ces
prélèvements : SMCG, ADENA, Aquasète, GIPREB, SMBVA, Windclub Côtières
Méditerranée, Perpignan Méditerranée Communauté d’agglomération, Alexandre FABRE
(pécheur sur Leucate), SMGEO, CELRL La Palissade, Réserve Naturelle Camargue et
SIBOJAI.
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Tableau 2 : Points GPS (WGS 84) des stations échantillonnées en 2009.
Station Date Coordonnées (WGS84)
Grand Bagnas 30/03/2009 43° 19,639’ N / 03° 31,291’ E Thau Est 30/03/2009 43° 25,000’ N / 03° 38,300’ E Thau Ouest 30/03/2009 43° 22,550’ N / 03° 35,220’ E Vic 10/04/2009 43° 29,489’ N / 03° 49,556’ E Prévost Est 14/04/2009 43° 31,748’ N / 03° 55,012’ E Méjean Ouest 14/04/2009 43° 32,659’ N / 03° 55,375’ E Pierre Blanche 14/04/2009 43° 30,379’ N / 03° 52,299’ E Berre Sud 21/04/2009 43° 24,950’ N / 05° 06,700’ E Berre Nord 21/04/2009 43° 30,676’ N / 05° 05,042’ E Vaïne 21/04/2009 43° 27,624’ N / 05° 12,280’ E La Palme Nord 27/04/2009 43° 58,007’ N / 03° 00,404’ E Marette Sud 29/04/2009 43°33,363’ N / 04°10,318’ E Marette Nord 29/04/2009 43° 33,823’ N / 04° 10,352’ E Ponant 29/04/2009 43° 33,771’ N / 04° 07,125’ E Vendres 05/05/2009 43° 15,615’ N / 03° 13,780’ E Bages-Sigean Sud 06/05/2009 43° 03,053’ N / 03° 00,948’ E Bages-Sigean Milieu 06/05/2009 43° 04,670’ N / 03° 00,330’ E Bages-Sigean Nord 06/05/2009 43° 07,552’ N / 03° 00,056’ E Campignol 06/05/2009 43° 06,220’ N / 03° 02,770’ E Gruissan 06/05/2009 43° 06,578’ N / 03° 04,956’ E Canet 07/05/2009 42° 39,415’ N / 03° 01,436’ E Salses-Leucate Sud 07/05/2009 42° 49,414’ N / 02° 59,567’ E Salses-Leucate Nord 07/05/2009 42° 52,997’ N / 03° 00,994’ E Or Est 13/05/2009 43° 34,870’ N / 04° 02,490’ E Or Ouest 13/05/2009 43° 34,421’ N / 04° 00,057’ E La Palissade 28/05/2009 43° 21,093’ N / 04° 48,636’ E Vaccarès 28/05/2009 43° 32,187’ N / 04° 37,755’ E Crey 17/06/2009 43° 37,863’ N / 04° 19,204’ E Scamandre 17/06/2009 43° 37,350’ N / 04° 21,603’ E Bolmon 24/06/2009 43° 24,806’ N / 05° 10,809’ E
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Carte 1 : Localisation des lagunes et des stations échantillonnées en 2009.
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Carte 2 : Localisation des stations des étangs de Canet et de Salses-Leucate.
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Carte 3 : Localisation des stations des étangs de La Palme, Bages-Sigean, Gruissan et Campignol.
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Carte 4 : Localisation des stations des étangs de Vendres, Grand Bagnas et Thau.
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17 Montpellier – 08031E, Juillet 2010
Carte 5 : Localisation des stations des étangs de Vic, Or, Méjean, Prévost et Pierre Blanche.
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Carte 6 : Localisation des stations des étangs de Marette, Crey, Scamandre et Vaccarès.
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Carte 7 : Localisation des stations des étangs de La Palissade, Berre, Bolmon, Vaine.
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2.2 - Méthode de prélèvement
2.2.1 - Prélèvement de la macrofaune benthique
Pour chaque station, trois sous-stations sont réalisées, espacées d’environ une dizaine de
mètres pour une meilleure représentativité de la zone. Chaque sous-station se compose de
quatre réplicas, séparés de quelques mètres l’un de l’autre. Les prélèvements sont réalisés à
l’aide d’une benne Eckmann - Birge, d’une surface de 0,0225 m². Chaque réplica correspond
à une benne. Ainsi la surface échantillonnée est de 0,09 m² par sous-station soit 0,27 m² par
station.
Les échantillons prélevés sont ensuite tamisés sur un tamis de vide de maille de 1 mm. Le
refus du tamis contenant la faune benthique mélangée à des particules grossières, des
débris coquilliers et autres fragments est conditionné dans des sacs de congélation avec une
solution aqueuse de formaldéhyde (37 % dilué à environ 7 % avec de l'eau des lagunes)
ainsi qu'une pincée de Rose Bengal.
2.2.2 - Prélèvement de sédiment et mesures d’oxydo-
réduction
Pour chaque station, un prélèvement complémentaire de sédiment est effectué pour
l'analyse de la qualité du substrat et de la structure des fonds.
Enfin, 3 carottages sont réalisés par station pour mesurer le potentiel d’oxydo-réduction des
sédiments à l’aide d’un eH-mètre Ponselle (cf. Figure 2).
2.2.1 - Mesures d’eau
Des mesures directes dans la colonne d’eau de pH, de salinité, de température et d’oxygène
sont effectuées également sur chaque station.
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Figure 1. Méthodologie de prélèvement de la macrofaune benthique.
(1) La benne Eckmann - Birge, d’une surface de
0,0225 m² est maintenue ouverte. Une fois sur le
fond, elle est refermée mécaniquement par
l’opérateur.
(2) La benne est ouverte. Le benthos (les 4
sous-échantillons) est placé dans des sacs
poubelles en plastique.
(3) Le benthos est filtré à travers un tamis de vide
de maille de 1 mm.
(4) Le refus de tamis est disposé dans des
sacs de congélation avant d’être formolé.
On ajoute du rose Bengal pour faciliter la
détermination.
(5) Arrivés au laboratoire, les organismes vivants
sont triés, séparés, identifiés et dénombrés sous
la loupe.
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(6) Les prélèvements pour les analyses de
sédiments sont effectués par un plongeur
puis conditionnés en fonction des analyses
(sac plastiques ou papier d’aluminium).
(7) Les prélèvements destinés à la mesure du
potentiel d’oxydo-réduction sont réalisés en
plongée, à l’aide d’un carottier en PVC de 4 cm de
diamètre et de 20 cm de long, percé de trous de 5
mm de diamètre, tous les 2 cm. Ces trous sont
bouchés avec un ruban adhésif avant le
prélèvement.
(2) Les mesures de potentiel d’oxydo-
réduction ont été effectuées aussitôt après
le prélèvement, à l’aide d’un eH-mètre
Ponselle (électrode de platine + électrode
de référence AgCl2). L’électrode de mesure
est placée successivement dans chaque
trou après enlèvement progressif du ruban
adhésif, tandis que l’électrode de référence
est déplacée à mesure dans le trou
précédent. Les électrodes de faible
diamètre permettent la mesure sans
déstructurer le sédiment.
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2.3 - Tri et détermination du benthos
En laboratoire, les animaux sont dénombrés et déterminés sous la loupe binoculaire jusqu'au
niveau spécifique.
Pour chaque espèce sont calculées l'abondance et la biomasse.
Le laboratoire spécialisé dans la faune benthique qui est responsable de la détermination
est :
Daniel MARTIN,
Centre d’Estudis Avançats de Blanes,
Cami de Santa Barabara,
s/n, 17300 Blanes, Girona
Espagne
Ce laboratoire détermine pour chaque échantillon fourni,
La richesse spécifique, i.e. le nombre d’espèces différentes présentes dans
l’échantillon ;
La densité, i.e. le nombre d’individus sur une surface donnée ;
La biomasse, i.e. le poids en matière sèche prélevée par groupe trophique et
embranchement ;
A partir de ces données, il sera alors possible de calculer plusieurs indices.
2.4 - Calcul des indices biologiques
Pour l’analyse des résultats, 7 indices ont été retenus : l’indice de diversité de Shannon H’,
l’AMBI, le M-AMBI, l’indice trophique IT, la potentialité biologique, l’Indice Benthique Global
Lagunaire IBGL et le MISS-TW. Ces indices sont décrits dans les paragraphes suivants. Les
valeurs seuils utilisées pour caractériser les valeurs obtenues sont détaillées dans le dernier
paragraphe de ce chapitre.
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2.4.1 - Indice de Shannon-Weaver (H’)
L’indice de Shannon-Weaver (Shannon, 1948) est un indice de diversité qui prend en
compte à la fois la richesse spécifique et l’abondance relative de chaque espèce, permettant
de caractériser l’équilibre écologique du peuplement d’un écosystème.
Ni = abondance de l’espèce i
N = abondance totale des espèces
Cet indice est maximal (H’max) quand les espèces ont des abondances identiques et il tend
vers 0 quand une espèce domine le peuplement. Ce résultat qui est souvent peu parlant, doit
être rapporté à l’indice maximal théorique du peuplement (H’max), ou accompagné de l’indice
d’équitabilité (J).
L'abondance relative par rapport au total d'une espèce i (Ni / N) va de juste au-dessus de 0
pour les espèces qui ne sont représentées que par 1 seul individu, jusqu'à 1 pour un
peuplement consistant d'une seule espèce (Ni = N).
Le résultat de la fonction log2(Ni/N) est négatif quand Ni < N et tend vers 0 quand une
espèce domine. Log2(Ni/N) = 0 quand Ni = N, donc quand le peuplement n’est constitué que
d'une seule espèce.
∑= ⎥⎦⎤
⎢⎣⎡
NNi 2logx
NNi - H'
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Figure 2. log2(Ni/N) - f(Ni = N)
Log2(Ni/N)
-7
-6
-5
-4
-3
-2
-1
00 0.0
50.1 0.1
50.2 0.2
50.3 0.3
50.4 0.4
50.5 0.5
50.6 0.6
50.7 0.7
50.8 0.8
50.9 0.9
51
Ni/N
Log2
(Ni/N
)
Donc plus une espèce est dominante, plus Ni/N tend vers 1 et plus log2(Ni/N) tend vers 0. De
ce fait, la fonction (Ni/N) x log2(Ni/N) se comporte de la façon suivante :
Figure 3. (Ni/N) x log2(Ni/N) = f(Ni/N)
(Ni/N)*Log2(Ni/N)
-0.6
-0.5
-0.4
-0.3
-0.2
-0.1
00 0.0
50.1 0.1
50.2 0.2
50.3 0.3
50.4 0.45 0.5 0.5
50.6 0.6
50.7 0.7
50.8 0.8
50.9 0.95 1
Ni/N
(Ni/N
)*Lo
g2(N
i/N)
Pour le calcul de l'indice de Shannon, le négatif de la somme des Ni/N x log2(Ni/N) de
chaque espèce du peuplement est retenu: - ∑ [Ni / N x log2 (Ni / N)].
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Le précédent graphique montre que les espèces à dominance intermédiaire (Ni/N entre 0,1
et 0,60) ont un poids plus important que les espèces rares ou celles qui sont très
dominantes.
H' sera le plus important dans des peuplements à richesse spécifique élevé avec une
répartition équitable des espèces. Les valeurs les plus basses apparaissent pour les
peuplements qui sont dominés par une seule espèce ou par un petit nombre d'espèces.
La richesse spécifique n'a, par rapport à la répartition des abondances, qu'une influence
secondaire sur le résultat.
2.4.2 - AZTI Marine Biotic Indice (AMBI) & Coefficent
Biotique (CB)
L’AMBI (AZTI Marine Biotic Index) (Borja et al., 2000), appelé aussi coefficient benthique
(CB) est basé sur les successions écologiques (Pearson & Rosenberg, 1978). Les groupes
écologiques (cf. Figure 4), au nombre de 5 (GI, GII, GIII, GIV et GV), sont basés sur la
polluosensibilité des espèces. Le groupe I comprend les espèces les plus sensibles à
l’hypertrophisation jusqu’au groupe V qui englobe les espèces opportunistes des sédiments
réduits. Cet indice est lui aussi sensible à l’effort d’échantillonnage, un trop petit nombre de
données donneront la même valeur moyenne mais avec un fort écart-type. Il présente
l’avantage d’être applicable à tous les milieux puisque basé sur une liste unique d’espèces.
La figure suivante illustre l’importance relative des différents groupes écologiques le long du
gradient de perturbations croissantes.
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Figure 4. Modèle des Indices Biotiques (Glémarec & Hily, 1981)
100%GV x 6 %GIV x 4,5 %GIII x 3 %GII x 1,5 %GI x 0AMBI ++++
=
%GI, %GII, %GIII, %GIV, %GV = abondance relative des différents groupes
écologiques par rapport à l’abondance totale.
Les valeurs de l’AMBI sont comprises entre 0 et 6. Une valeur de 0 représente un milieu non
pollué, une valeur de 6 représente une pollution majeure précédant le stade azoïque.
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Tableau 3. Correspondance entre les coefficients benthiques (AMBI) et les valeurs des coefficients benthiques
Etat du site Coefficient benthique (AMBI)
Indice Biotique
(IB)
Groupe écologique dominant
Etat de santé des communautés
Non pollué 0,0 < AMBI ≤ 0,2 0 I Normal
Non pollué 0,2 < AMBI ≤ 1,2 1 Appauvrie
Pollution légère 1,2 < AMBI ≤ 3,3 2 III Déséquilibre
Moyennement pollué 3,3 < AMBI ≤ 4,5 3 Etape de transition vers
la pollution
Moyennement pollué 4,5 < AMBI ≤ 5,0 4 IV (V) Pollué
Fortement pollué 5,0 < AMBI ≤ 5,5 5 Etape de transition vers la pollution
Fortement pollué 5,5 < AMBI ≤ 6,0 6 V Forte pollution
Pollution majeure Azoïque 7 Azoïque Azoïque
Cet indice peut être mis en relation avec l’Indice Biotique qui permet une meilleure
visualisation des résultats (cf. Tableau 3). En effet, l’AMBI donne des valeurs de 0 à 6 sous
forme de nombre décimal alors que les valeurs clés des différentes catégories de pollution
sont sous forme d’une échelle irrégulière montrant les différents niveaux de pollution.
L’Indice Biotique, reprend ces différentes catégories et les schématise sous forme d’un
nombre entier de 0 (aucune pollution) à 7 (très forte pollution), chaque catégorie
représentant un niveau de pollution. L’AMBI est donc indicateur d’une perturbation organique
du milieu.
Une communication de AZTI Marine, publiée dans le Marine Pollution Bulletin (AZTI, 2005)
donne des recommandations pour utilisation de l'AMBI et précise que dans les situations où
peu de taxa sont présents, dans des systèmes à faible salinité ou ayant un état perturbé
naturel, l'outil risque d'être moins robuste. Il est précisé, qu’à plus de 20 % d’espèces non
assignées, l’indice n’est pas fiable. Dans des milieux lagunaires, les résultats le l'AMBI
doivent donc être interprétés avec précaution et toujours en association avec d'autres
informations.
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2.4.3 - M-AMBI
Le M-AMBI a été mis au point par l’équipe de l’AZTI pour permettre de compléter les
résultats obtenus par l’AMBI.
Le calcul du M-AMBI qui est basé sur une analyse factorielle de l’AMBI, de la richesse
spécifique et de l'indice de diversité H' (indice de Shannon-Weaver) (Muxika et al., 2007)
permet donc de prendre en compte ces 3 facteurs à la fois.
Les calculs de l’AMBI et du M-AMBI sont établis à partir du logiciel mis à disposition sur le
site du laboratoire AZTI qui est à l’origine de ces indices (http://www.azti.es).
L’AMBI met en évidence les perturbations de type organique en s’appuyant sur l’analyse des
espèces présentes et leur polluosensibilité.
Le calcul du M-AMBI est basé sur les résultats obtenu avec l’AMBI pondéré par l’indice de
Shannon (H’) et la richesse spécifique (S). Pour ce calcul, il est nécessaire de définir des
stations, théoriques ou réelles, considérées comme « station de référence haute » et
« station de référence basse ». La station de référence haute est une station théorique qui
prend comme valeur la meilleure de chaque indice de l’ensemble des résultats obtenus lors
des campagnes DCE sur les lagunes. La station de référence basse est aussi une station
théorique correspondant aux pires résultats possibles.
Cependant, il faut faire attention à l’interprétation des résultats donnés par le M-AMBI. Si les
valeurs des stations de référence haute et basse sont modifiées alors les résultats du M-
AMBI vont varier. Ces résultats ne doivent être interprétés que pour un pool de stations
données. Pour comparer des stations entre elles, elles doivent avoir été calculées avec les
même « station de référence haute » et « station de référence basse ». Les 5 classes de
qualité sont définies sur la différence entre ces deux stations.
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2.4.4 - Indice Trophique (IT)
Cet indice (Word, 1990) rend compte du régime alimentaire des espèces présentes dans
l’échantillon, basé sur le principe des successions écologiques. Celles-ci sont classées en 4
groupes trophiques :
1. GT1 : les suspensivores,
2. GT 2 : les détritivores,
3. GT 3 : les dépositivores,
4. GT 4 : les espèces de substrat anaérobie.
L'objectif est d'apprécier, au travers de la structure trophique des peuplements, l'état de
dégradation des fonds du fait de l'accumulation de matière organique. Les coefficients
multiplicateurs 0, 1, 2 et 3 affectés à chaque groupe sont proportionnels au degré
d'association de l'espèce avec le sédiment vis-à-vis de sa stratégie trophique. Ainsi, les
espèces suspensivores, complètement dépendantes de la colonne d'eau, sont affectées du
coefficient le plus faible.
( )N
nnnnIT
33210100
1004321∑ +++
−=....
n1, n2, n3, n4 = abondances des toutes les espèces des groupes trophiques 1, 2, 3 et 4 ;
N = abondance totale des espèces.
Les valeurs de l'indice sont exprimées en pourcentage et varient de 0 à 100%. Elles sont
interprétées de la manière suivante :
IT > 60 : le peuplement est normal : il n’est pas affecté par l’enrichissement en
matière organique du sédiment ;
30 < IT < 60 : le peuplement est déséquilibré : il est légèrement perturbé par
l’enrichissement en matière organique du sédiment ;
IT < 30 : le peuplement est perturbé : il est affecté par la dégradation du sédiment
due à un sur-enrichissement en matière organique.
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Les valeurs seuils attribuées à l’indice trophique pour le calcul des EcoQ sont basées
arbitrairement sur ces valeurs.
La répartition des espèces selon leur mode trophique (suspensivores, détritivores,
dépositivores) dépend de la forme sous laquelle la ressource nutritive est disponible. Dans
un milieu marin riche en matière organique mais non perturbé, l’équilibre entre ces trois
groupes d’espèces est à peu près le suivant : dépositivores = 60% ; détritivores = 30% et
suspensivores = 10%. Un déséquilibre du milieu peut se traduire soit par une prolifération
des dépositivores dans le cas d’un sur-enrichissement du sédiment en matière organique,
soit par une dominance des détritivores dans des zones d’accumulation de matière
organique peu dégradée, soit par une augmentation des suspensivores lorsque les courants
importants provoquent une remise en suspension de la matière organique.
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2.4.5 - La potentialité biologique
L’IARE puis CREOCEAN ont développé depuis 1990 pour le compte de l’agence de l’eau
RMC un indice lagunaire (IBGL : Indice Benthique Global Lagunaire). Cet indice a été utilisé
depuis plusieurs années par CREOCEAN et l’IFREMER dans sa version complète (IBGL) ou
réduite (potentialité biologique).
La potentialité biologique est évaluée à partir de la richesse spécifique et des densités
totales. L'attribution d'une classe de qualité en termes de richesse et de densité se fait à
partir des valeurs seuils établies en fonction de la correspondance suivante :
Tableau 4 : Potentialité biologique : valeurs seuils de référence et classes de qualité pour la richesse et la densité.
Valeurs seuils Classes de qualité
Richesse spécifique
S > 30 espèces Très satisfaisante 21 < S < 30 espèces Satisfaisante 11 < S < 20 espèces Réduite
S < 10 espèces Très faible
Densité totale
0 nb ind./m² Nulle 1 à 200 nb ind./m² Très faible
201 à 1500 nb ind./m² Faible 1501 à 6000 nb ind./m² Normale 6001 à 8000 nb ind./m² Forte plus de 8000 nb ind./m² Très forte
En fonction des classes de richesse spécifique et de densité obtenues pour chaque station,
la grille de lecture suivante permet d’attribuer un code de couleur de qualité. En parallèle, la
présence ou la prolifération des espèces indicatrices de matière organique sont observées
pour les plus fortes densités.
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Tableau 5 : Grille de lecture de la potentialité biologique en fonction des classes de richesse et de densité, et de l’abondance relative des espèces indicatrices de
perturbation.
Richesse spécifique
Très satisfaisante Satisfaisante Réduite Très
faible
Espè
ces
indi
catr
ices
de
mat
ière
org
aniq
ue
Den
sité
Nulle Rouge
Très faible Orange Rouge Faible Bleu Vert Jaune Orange
Normale Bleu Bleu Vert Jaune Présence Forte Bleu Vert Jaune Orange
Prolifération Très forte Jaune Orange Rouge
La zone encadrée par un double trait correspond à l'échelle spécifique à l'enrichissement
trophique.
Les couleurs mentionnées dans le tableau précédent s'interprètent de la manière suivante :
Tableau 6 : Potentialité biologique : classes de qualité et codes couleur du niveau trophique.
Niveau trophique Potentialité biologique
Normal Hébergement d'un grand nombre de taxons exigeants, représentés par un nombre d'individus suffisant.
Peu élevé Disparition des espèces d'origine marine les plus sensibles à la variation des facteurs physico-chimiques.
Moyen Réduction de manière importante du nombre d'espèces exigeantes (et/ou d'origine marine), certaines espèces restantes pouvant faire l'objet de proliférations.
Elevé Disparition de toutes les espèces exigeantes, aboutissant à une forte réduction de la diversité spécifique : les densités ne sont jamais normales (plus ou moins élevées que la normale).
Très élevé Maintien uniquement des taxons les plus résistants, avec dans les cas extrêmes disparition totale de la faune benthique : les densités sont soit très faibles soit très fortes.
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2.4.6 - Indice benthique global lagunaire (IBGL)
Dans un premier temps les descripteurs utilisés sont présentés, et dans un deuxième temps
les étapes d’interprétation sont décrites.
2.4.6.1 - Les descripteurs
L’IGBL consiste à comparer les données obtenues sur chaque station à des valeurs seuil
(établies au cours de l’étude de 1999-2000, Agence de l’eau), en utilisant certains
descripteurs du milieu et de la faune benthique installée sur ce milieu :
des variables concernant la macrofaune benthique :
- la richesse spécifique ;
- la densité totale ;
- les espèces indicatrices : il s'agit de la présence d'une ou plusieurs espèces
indicatrices d'enrichissement en matière organique et de pollution. Ces
informations sont qualitatives mais une éventuelle prolifération de l'une ou de
l'autre de ces espèces est signalée.
des valeurs concernant les propriétés physico-chimiques du sédiment :
- les teneurs en matière organique, en azote total et en phosphore total dans les sédiments ;
- le potentiel d’oxydo-réduction de surface (ou rédox à 3 cm), qui
correspond à la moyenne des valeurs mesurées à 2 et 4 cm de profondeur sur
les trois carottiers ; cette variable permet de déterminer si on est en présence
ou non d’un enrichissement ponctuel et si les conditions de vie dans le
sédiment sont ou non favorables au peuplement benthique ;
- le potentiel d’oxydo-réduction en profondeur (ou rédox à moins de 10
cm), qui correspond à la moyenne des valeurs mesurées à 10, 12, 14, 16, 18
et 20 cm de profondeur sur les trois carottiers ; cette variable permet de
déterminer s’il existe ou non un enrichissement ancien du sédiment, et selon
les conditions hydrodynamiques, si la matière organique apportée au
sédiment tend à s’accumuler ou à être dégradée.
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des variables liées à la typologie du milieu :
- la salinité : la salinité d'une lagune est par nature variable. Son évaluation
doit essayer de tenir compte à la fois des valeurs moyennes de la lagune et
de l'importance des écarts saisonniers ;
- la profondeur : la profondeur est estimée à partir de la profondeur moyenne
de la lagune dans sa partie centrale ou, d'une manière générale, dans la zone
représentative des trois sous-stations d’échantillonnage par station.
2.4.6.2 - Les étapes d’interprétation
Cette phase d'interprétation se fait en trois étapes :
comparaison de la valeur du descripteur synthétique à un intervalle de valeurs
(valeurs seuil) ;
attribution à cet intervalle d'un indice de classe de qualité (0 à 100) ;
attribution à cette classe de qualité d'une appréciation qualitative (interprétation).
Par ailleurs, chaque variable apportant une information spécifique, celles-ci ont été
regroupées au sein de quatre étapes :
Etape I : Caractérisation globale de la lagune
Cette étape est basée uniquement sur l'interprétation de la richesse spécifique. Il varie
pratiquement de 0 à 60 espèces. Le tableau suivant donne les valeurs seuils et les classes
de qualité retenues :
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Tableau 7. IBGL : Valeurs seuils et classes de qualité de l’étape I de caractérisation globale de la lagune.
Paramètre Valeurs seuils Classes de qualité Interprétation
ETA
PE I
: C
AR
AC
TER
ISA
TIO
N
GLO
BA
LE D
E LA
LA
GU
NE I :
Richesse spécifique
0 0 Très forte contrainte 1 à 3 20 Très forte contrainte
4 à 10 30 Très forte contrainte 11 à 15 40 Forte contrainte 16 à 20 60 Contrainte moyenne 21 à 30 80 Peu de contraintes
> 30 100 Très peu de contraintes
Ce descripteur est sensible à tout type de contraintes, qu'elles soient liées au milieu naturel
ou à des dégradations anthropiques comme l'eutrophisation.
Etape II : Caractérisation de l'enrichissement trophique
Le degré d'enrichissement trophique peut être évalué par ses conséquences sur le
peuplement benthique ainsi que par les valeurs de rédox. Ce dernier paramètre est
particulièrement sensible à l'enrichissement organique du sédiment, cadre de vie des
organismes benthiques.
En ce qui concerne les peuplements, deux descripteurs peuvent être reliés directement à
l'enrichissement trophique : la présence d'espèces indicatrices de matière organique et de
pollution et les densités.
La présence de l'une ou de l'autre des deux espèces indicatrices de matière organique et de
pollution indique un excès de matière organique. En ce qui concerne les densités, seules les
proliférations sont indicatrices d'un fort enrichissement trophique. Les valeurs très faibles ne
sont donc pas considérées comme déclassantes vis à vis du niveau trophique.
Par ailleurs, l'absence d'une espèce indicatrice ne peut être considérée comme un signe de
bonne qualité, de multiples causes pouvant être responsables de cette absence. Dans ce
cas, il n'est pas attribué de classe de qualité.
Le tableau suivant donne les valeurs seuil et les classes de qualité retenues :
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Tableau 8. IBGL : Valeurs seuils et classes de qualité de l’étape II de caractérisation de l'enrichissement trophique.
Paramètres Valeurs seuil Classes de qualité Interprétation
ETA
PE II
: C
AR
AC
TER
ISA
TIO
N D
E L’
ENR
ICH
ISSE
MEN
T TR
OPH
IQU
E
II.1 : Espèces
indicatrices
Aucune - Pas de diagnostic Bivalves ou autres filtreurs
benthiques (espèces et abondance à définir), palourde de
taille > 2 cm
80 Milieu sain –
enrichissement moyen
Présence de Capitella capitata ou de Malacoceros fuliginosus ou
prolifération de’ Nereis ou d'une espèce du même type (Corbula gibba, spécifique d’un excès de
M.O.)
50 Enrichissement fort
Prolifération de Capitella capitata ou de Malacoceros fuliginosus 20 Enrichissement très
fort
II.2 : Densité
0 à 4000 100 Pas d'enrichissement trophique marqué
4001 à 6000 80 Enrichissement probable
6001 à 8000 40 Enrichissement marqué
> 8000 0 Milieu très dégradé par un excès de MO
II.3 : Rédox surface
> 0 100 Normal -1 à 35 80 Normal
-36 à 70 60 Moyennement enrichi
-71 à -200 40 Très enrichi -200 à -250 20 Forte dégradation
< -250 0 Très forte dégradation
II.4 : Rédox fond
> -150 100 Normal -151 à -200 80 Normal
-201 à -250 60 Moyennement enrichi
-251 à -300 40 Très enrichi -301 à -350 20 Forte dégradation
< -351 0 Très forte dégradation
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Etape III : Caractérisation physique du milieu
Il s'agit d'évaluer l'importance des contraintes physiques naturelles (profondeur et salinité)
s'exerçant sur le milieu. Si ce type de contrainte est responsable de la pauvreté d'un milieu
lagunaire (qualité globale, étape I), une amélioration du niveau trophique aura peu de
chance de se traduire par une augmentation de cette qualité.
Le tableau suivant donne les valeurs seuil et les classes de qualité retenues :
Tableau 9. IBGL : Valeurs seuils et classes de qualité de l’étape III de caractérisation
physique du milieu.
Paramètres Valeurs seuils Classes de qualité Interprétation
ETA
PE II
I : C
AR
AC
TER
ISA
TIO
N
PHYS
IQU
E D
U M
ILIE
U III.1 :
Salinité
Toujours < 5 ‰ 0 Milieu très contraignant < 10 ‰ ou variation forte 20 Milieu très contraignant 5 à 20 ‰ et variation forte 40 Milieu assez contraignant
10 à 25 ‰ 60 Milieu assez contraignant 20 à 35 ‰ 80 Milieu peu contraignant
Stable 35 ‰ 100 Milieu très peu contraignant
III.2 : Profondeur
Peu profond (0 à 1 m) avec assèchement
temporaire 20 Très forte contrainte
0,5-2 m sans assèchement 40 Forte contrainte
2 - 3 m 60 Contrainte moyenne > 3 m 100 Faible contrainte
Etape IV : Autres contraintes
Lorsque ni le niveau trophique, ni les contraintes naturelles ne permettent d'expliquer la
pauvreté du milieu, d'autres causes doivent être recherchées. Cette étape n’est pas destinée
à identifier ces autres causes mais uniquement à indiquer qu'il est nécessaire de procéder à
des investigations plus poussées.
Ces autres contraintes se traduisent par une pauvreté importante des peuplements. A la
faible qualité globale (étape I) est associé de faibles densités. Ainsi des densités inférieures
à 1500 individus/m² traduisent généralement en milieu lagunaire l'influence de contraintes
physiques.
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Le tableau suivant donne les valeurs seuils et les classes de qualité retenues :
Tableau 10. IBGL : Valeurs seuils et classes de qualité de l’étape IV des autres
contraintes
Paramètres Valeurs seuils Classes de qualité Interprétation
ETA
PE IV
: A
UTR
ES
CO
NTR
AIN
TES
IV : Densité
0 0 Très forte contrainte 1 à 100 10 Très forte contrainte
101 à 200 20 Forte contrainte 201 à 500 40 Forte contrainte
501 à 1500 70 Peu de contraintes
> 1500 100 Pas de contraintes marquées
Bilan : Calcul final de l’indice
La note finale de l’IBGL correspond à la note la plus faible obtenue par les 4 étapes. Elle est
comprise en 0 et 100.
La Figure 5 rappelle l’ensemble de la démarche du calcul de l’IBGL.
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Figure 5 : Synthèse de calcul de l’IBGL.
IQualité biocénose
II Niveau trophique
IIITypologie
IV Autres contraintes
Salinité
Densité
Richesse
Rédox surface
Rédox fond
Sp. Indicatrices
Profondeur
Densité
IBGL
ETAPES PARAMETRES 0<INDICE<100 MOYENNES MINIMUM
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Ind. par
station
Ind. par m²
Stations
Espè
ces
Normalisation
Stations
Espè
ces
Log (Ind. par m²+1)
Transformation
Stations
Espè
ces
Calcul du coefficient de
similarité de Bray-Curtis
Stat
ions
Classification pargroupementmoyen
Analyse des matrices de similarité
Détermination du niveau de coupure
Stations
2.4.7 - L’indice MISS-TW
D’après le document de B. Gouillieux et al. (2010), l’indice MISS-TW est décrit en 3 étapes :
Etape 1 : Proposition de la typologie
Dans un premier temps, une typologie des habitats est proposée à partir des données
d’abondance du benthos. Les différents peuplements benthiques sont définis par l’étude de
la structure des dendrogrammes produits par classification ascendante hiérarchique et par
l’identification des principales espèces présentes au sein des différents regroupements de
stations produits pas les dendrogrammes. La méthode statistique utilisée est présentée ci-
après par la Figure 6 :
Figure 6 : Indice MISS-TW : résumé schématique de la méthode statistique de traitement des données Stations*Espèces.
De cette première analyse, en résulte 3 typologies basées sur les domaines halins des
lagunes, repris dans le Tableau 11. Les groupes oligohalins et mésohalins sont regroupés
dans un seul groupe.
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Tableau 11 : Domaines de salinité.
Intervalle de salinité Domaine
0,5 à 5 ‰ Oligohalin 5 à 18 ‰ Mésohalin
18 à 30 ‰ Polyhalin > 30 ‰ Euryhalin
Etape 2 : Définition de l’état de référence et valeurs seuils
Dans un deuxième temps, un état de référence est défini pour chaque type d’habitat. Ces
états de références sont établis à partir des lagunes dites « non dégradées » ou « non
affectées par une dégradation », c'est-à-dire à partir de celles qui obtiennent les meilleures
notes d’après avis d’experts.
L’avis d’expert est une note moyenne, donnée par des experts de la macrofaune benthique
méditerranéenne, comprise entre 1 et 3 ; 1 correspondant à un bon état écologique.
L’état de référence d’un paramètre donné, pour chaque type, correspond à l’intervalle de
métriques compris entre les percentiles 5 % et 95 %. Cet intervalle étant censé refléter la
variabilité naturelle, c'est-à-dire l’ensemble des valeurs habituellement observées pour ce
paramètre.
La Figure 7 montre que les métriques comprises dans l’intervalle des percentiles 5 % et
95 % sont généralement les plus rencontrées, et reflètent en principe la variabilité naturelle.
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Figure 7 : Indice MISS-TW : définition de l’état de référence dans le cas général, suivant la distribution des métriques pour un paramètre donné.
Le tableau suivant reprend les valeurs des métriques retenues, correspondant aux
percentiles 5 % et 95 %, suivant les paramètres considérés et les types d’habitats.
L’intervalle compris entres ces valeurs correspond à l’état de référence, ainsi défini.
Occurrences
Métriques
Variabilité natuelle
Etat de référence
Percentile5 %
Percentile95 %
Valeuresrares
Valeuresrares
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Tableau 12 : Indice MISS-TW : valeurs seuils des métriques retenues pour les habitats euryhalins, polyhalins et méso-oligohalins.
Habitat euryhalin Habitat polyhalin Habitat méso-oligohalin
Percentile 5%
Percentile 95%
Percentile 5%
Percentile 95%
Percentile 5%
Percentile 95%
N21 0,5 0,9 0,6 0,8 0,7 0,8
ES(20)
2,3 6,8
BENTIX 2 5,3 2,1 5,6 2,1 3,7
% Amphipoda
0,6 22,2
% Gastropoda 0 2,1 0 68,1 0 2,8
% Polychaeta 4 84,4 1,2 24,8
% Endofaune 54 100 14,9 93
% Epifaune vagile
0 11
% Epifaune sessile
0 0,5 0 38,2
% GT-CO 1 27,9 1,1 22,2
% GT-DSS
0 0,8
Etape 3 : Méthode scoring
Dans un dernier temps, la méthode de scoring permet de donner une appréciation de l’état
écologique de chaque site au vue de la DCE en se rapportant aux états de référence. Ainsi,
pour chaque paramètre, une note de 1 est attribuée si on se trouve dans l’intervalle de
référence et une note de 0 si on est à l’extérieure de cet intervalle. La note finale du MISS-
TW est la moyenne des notes obtenues pour chaque paramètre.
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2.4.8 - EcoQ
A partir des valeurs trouvées pour les indices de Shannon, d’AMBI et de l’Indice Trophique, il
est possible de leur associer un code allant de « Très bon » à « Mauvais » ainsi qu’un code
couleur allant du Bleu au Rouge.
Tableau 13. Valeurs seuils de référence des EcoQ pour l’indice de Shannon, l’AMBI, le M-AMBI, l’indice trophique, l’IBGL et le MISS-TW.
EcoQ H’ AMBI M-AMBI IT IBGL MISS-TW
Très bon H’ > 4 AMBI ≤ 1,2 M-AMBI > 0,80 IT > 80 IBGL > 80 MISS-TW
> 0,80
Bon 3 < H’ ≤ 4 1,2 < AMBI ≤ 3,3
0,55 < M-AMBI ≤
0,80
60 < IT ≤ 80
60 < IT ≤ 80
0,6 < MISS-TW ≤ 0,8
Moyen 2 < H’ ≤ 3 3,3 < AMBI ≤ 4,3
0,40 < M-AMBI ≤
0,55
50 < IT ≤ 60
40 < IT ≤ 60
0,4 < MISS-TW ≤ 0,6
Pauvre 1 < H’ ≤ 2 4,3 < AMBI ≤ 5,5
0,20 < M-AMBI ≤
0,40
30 < IT ≤ 50
20 < IT ≤ 40
0,2 < MISS-TW ≤ 0,4
Mauvais H’ ≤ 1 5,5 < AMBI ≤ 7
M-AMBI ≤ 0,20 IT ≤ 30 IT ≤ 20 MISS-TW
≤ 0,2
2.5 - Synthèse
L’analyse simultanée de l’ensemble de ces informations, associées aux caractéristiques
sédimentaires des stations, permet d’évaluer l’état de la zone et son évolution depuis la
première campagne de 2006, en précisant notamment la nature du fonctionnement
écologique du milieu.
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3 - RESULTATS
Pour chaque paramètre ou indice. Les résultats sont présentés sous forme de tableaux. Les
valeurs seuils de référence, quand elles existent, sont rappelées avec les codes couleurs ou
les classes de qualités correspondantes. Les résultats de la campagne de 2009 sont
comparés à ceux de 2006.
3.1 - Mesures dans la colonne d’eau
Le tableau suivant récapitule des mesures effectuées dans la colonne d’eau sur les
différentes stations.
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Tableau 14. Résultats des mesures physico-chimiques de la colonne d’eau.
Station Profondeur (m)
Température(°C)
Salinité (‰) pH
Canet Sud 1,3 19,7 11,1 8,0 Salses-Leucate Sud 3 18,7 30,7 7,2 Salses-Leucate Nord 3 19 31,7 7,6 La Palme Nord 1 15,2 17,5 7,6 Bages-Sigean Sud 1,5 19,6 26,1 7,7 Bages-Sigean Milieu 2 18 20,5 7,8 Bages-Sigean Nord 2 15,9 21,2 7,5 Campignol 0,5 18,7 6,2 7,6 Gruissan 0,4 13,7 32,9 7,7 Vendres 0,8 15,7 6,1 7,8 Grand Bagnas 0,8 11,3 5,7 Thau Est 9,1 10,6 8,0 Thau Ouest 5,8 10,6 7,0 Or Est 1,6 19,3 5,9 7,6 Or Ouest 1,6 19,1 5,6 7,8 Prévost Est 1,2 15 15,5 8,0 Méjean Ouest 1,1 15,6 11,8 8,0 Vic 1,6 30,1 7,1 Pierre Blanche 1,1 15,5 15,4 8,0 Ponant 3 16,1 1,9 Marette Sud 0,5 13,9 4,2 Marette Nord 0,5 13,9 4,2 Scamandre 1,5 24,2 1,5 8,1 Crey 1 1,5 8,3 La Palissade 0,7 17,6 1,1 7,2 Vaccarès 1,7 16,7 18,0 7,4 Berre Sud 10 15 18,7 7,6 Berre Nord 6 15,3 18,3 7,0 Vaïne 5 15 15,3 7,6 Bolmon 1,6 19,3 4,7 8,1
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3.1.1 - Profondeur
Les stations échantillonnées présentent des profondeurs variables. Gruissan est la station la
moins profonde à 0,4 m, et Thau Est apparait comme la plus profonde à 9,1 m. De manière
générale, on retrouve :
des stations profondes (≥ 2m) à très profondes (≥ 5 m) : il s’agit des lagunes de
Salses-Leucate, Bages-Sigean, et Bolmon d’une part et de Thau et du complexe
Berre et Vaine d’autre part ;
des statons très peu profondes (<1 m) : La Palissade, Marette (Nord et Sud), Grand
Bagnas, Campignol, Gruissan et Vendres ;
des stations de profondeur intermédiaire (1 à 2 m).
3.1.2 - Température
Les températures de l’eau sont relativement homogènes (entre 15 et 20 °C). Il est à noter
tout de même que les eaux les plus froides sont rencontrées sur les lagunes échantillonnées
tôt dans la saison (fin mars 2009) : Grand Bagnas et Thau.
3.1.3 - pH
Le pH est très variable d’une lagune à l’autre avec des valeurs comprises entre 7 et 8,3.
Le pH le plus faible de 7 est rencontré au niveau de Thau Ouest et de Berre Nord.
La station de Crey présente une eau basique, avec le pH le plus fort à 8,3. Les stations de
Canet, Thau Est, Prévost Est, Méjean Ouest, Pierre Blanche et Scamandre présentent des
pH élevés, au moins égal à 8. Ces stations doivent faire l’objet d’attentions puisque cette
augmentation du pH est généralement liée à la dégradation du milieu.
3.1.4 - Salinité
Les lagunes présentent des salinités très variables, entre 1 et près de 33 ‰.
Cette mesure prise isolément est peu représentative des conditions de salinité des lagunes.
Il est donc important de connaitre les écarts moyens annuels de salinité que connaissent les
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lagunes pour caractériser les conditions du milieu. Les lagunes peuvent ainsi être classées
en grandes catégories. Pour cela, les données historiques de salinité sont compilées.
Le Tableau 15 rappelle les intervalles de salinité qui définissent les domaines halins.
Tableau 15 : Intervalles et domaines de salinité correspondants.
Intervalle de salinité Domaine
0,5 à 5 ‰ Oligohalin 5 à 18 ‰ Mésohalin
18 à 30 ‰ Polyhalin > 30 ‰ Euryhalin
Le tableau suivant renvoie la synthèse des données historiques de salinité des stations
prospectées en 2009.
Tous les domaines de salinité y sont représentés :
Les stations de type oligohalin : Scamandre, Crey et La Palissade. Ces stations
très adoucies présentent des milieux extrêmement contraignants pour l’installation
des espèces.
Les stations de type mésohalin : Campignol, Vendres, Grand Bagnas, Marette
Nord et Sud, Vaccarès et Bolmon. Ces stations aux caractéristiques assez adoucies
et variables, sont également des milieux assez contraignants.
Les stations de type polyhalin : Canet, Bages-Sigean Nord, Or Est et Ouest,
Méjean, Ponant, Berre Nord et Sud et Vaine. Ces stations présentent des milieux
visiblement sous influence marine, qui sont donc potentiellement moins
contraignants et plutôt susceptibles d’accueillir les peuplements benthiques.
Les stations de type euryhalin : Salses-Leucate Nord et Sud, La Palme, Bages-
Sigean Sud et Milieu, Gruissan, Thau Est et Ouest, Prévost, Vic et Pierre Blanche.
Ces stations aux fortes caractéristiques marines sont en principe des milieux
relativement stables et favorables à l’installation des peuplements.
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Tableau 16. Caractérisation de la salinité des stations.
Station
En moyenne sur l’année, entre 1998 et 2009, en ‰. Domaine de
salinité Minimum Maximum Amplitude Moyenne
Canet Sud 5 28 23 20 Polyhalin Salses-Leucate Sud 31 36 4 34 Euryhalin Salses-Leucate Nord 32 38 5 35 Euryhalin La Palme Nord 26 43 18 35 Euryhalin Bages-Sigean Sud 31 38 7 35 Euryhalin Bages-Sigean Milieu 27 36 9 31 Euryhalin Bages-Sigean Nord 23 34 11 29 Polyhalin Campignol 3 25 22 13 Mésohalin Gruissan 18 39 21 34 Euryhalin Vendres 11 21 10 14 Mésohalin Grand Bagnas 4 11 7 7 Mésohalin Thau Est 36 40 4 39 Euryhalin Thau Ouest 36 40 4 39 Euryhalin Or Est 18 24 6 21 Polyhalin Or Ouest 20 26 6 23 Polyhalin Prévost Est 18 39 22 32 Euryhalin Méjean Ouest 17 31 14 22 Polyhalin Vic 25 45 20 32 Euryhalin Pierre Blanche 23 42 19 32 Euryhalin Ponant 9 25 16 16 Polyhalin Marette Sud 3 15 12 8 Mésohalin Marette Nord 4 14 10 8 Mésohalin Scamandre 0 1 1 1 Oligohalin Crey 1 1 1 1 Oligohalin La Palissade 2 8 6 4 Oligohalin Vaccarès 14 16 2 15 Mésohalin Berre Sud 17 27 10 21 Polyhalin Berre Nord 15 25 10 19 Polyhalin Vaïne 15 26 11 20 Polyhalin Bolmon 5 11 5 8 Mésohalin
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3.2 - Qualité des sédiments
3.2.1 - Granulométrie et classification du sédiment
La granulométrie, et en particulier le taux de fraction fine, c’est à dire de particules
inférieures à 63 µm, permet de déterminer le type de sédiment. Le tableau suivant indique
selon les classes de fraction fine le type de sédiment rencontré, d’après la classification
d’Ibouily (1981).
Tableau 17 : Classification du sédiment, Ibouily (1981).
Fraction fine Type de sédiment
< 10% Sables purs 10 à 20 % Sables peu envasés 20 à 40 % Sables moyennement envasés 40 à 60 % Sédiment très envasé à dominance de sables 60 à 80 % Sédiment très envasé à dominance de vases
> 80 % Vases pures
Le tableau suivant présente les types des sédiments par station en fonction du taux de
fraction fine.
Il est à noter que la majorité des stations apparaissent très envasées. Les stations
caractérisées par des sables peu ou pas envasés sont rares : Campignol, Gruissan, La
Palissade. Ce sont des lagunes peu profondes.
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Tableau 18. Composition des sédiments en fraction fine et types rencontrés par station.
Station Taux de fraction fine Type de sédiment
Canet Sud 60,9 Sédiments très envasés à dominance de vases Salses-Leucate Sud 63,4 Sédiments très envasés à dominance de vases Salses-Leucate Nord 58,7 Sédiments très envasés à dominance de sables La Palme Nord 63,0 Sédiments très envasés à dominance de vases Bages-Sigean Sud 71,2 Sédiments très envasés à dominance de vases Bages-Sigean Milieu 72,1 Sédiments très envasés à dominance de vases Bages-Sigean Nord 74,1 Sédiments très envasés à dominance de vases Campignol 34,7 Sables moyennement envasés Gruissan 6,3 Sables purs Vendres 50,9 Sédiments très envasés à dominance de sables Grand Bagnas 82,8 Vases pures Thau Est 52,1 Sédiments très envasés à dominance de sables Thau Ouest 52,6 Sédiments très envasés à dominance de sables Or Est 61,8 Sédiments très envasés à dominance de vases Or Ouest 65,2 Sédiments très envasés à dominance de vases Prévost Est 68,9 Sédiments très envasés à dominance de vases Méjean Ouest 88,0 Vases pures Vic 79,7 Sédiments très envasés à dominance de vases Pierre Blanche 81,6 Vases pures Ponant 83,9 Vases pures Marette Sud 79,4 Sédiments très envasés à dominance de vases Marette Nord 88,0 Vases pures Scamandre 95,9 Vases pures Crey 41,1 Sédiments très envasés à dominance de sables La Palissade 11,2 Sables moyennement envasés Vaccarès 83,2 Vases pures Berre Sud 88,6 Vases pures Berre Nord 80,5 Vases pures Vaïne 81,8 Vases pures Bolmon 90,8 Vases pures
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3.2.2 - Enrichissement
L’enrichissement du sédiment est estimé à partir des mesures de matière organique et de
teneurs en azote et en phosphore totaux.
Ces valeurs sont comparées à des seuils de qualité proposés dans la thèse de Licari (1998)
pour les milieux lagunaires. Pour simplifier la démarche, ces seuils ont été appliqués à toutes
les lagunes quel que soit le taux de fraction fine des sédiments. Le tableau suivant présente
les valeurs seuils pour la matière organique et les nutriments azote et phosphore, indiquant
le degré d’enrichissement et le code couleur correspondant.
Tableau 19. Valeurs seuils et classes d’enrichissement pour la matière organique et les nutriments azote et phosphore.
Enrichissement Matière organique(% p.s.)
Azote kjeldahl (% p.s.)
Phosphore total (mg/kg)
Faible < 0,3 < 440
Moyen < 13,5 0,3 - 0,4 440 - 680
Fort 13,5 – 18,0 0,4 - 0,5 680 - 1255
Très fort ≥ 18,0 ≥ 0,5 ≥ 1255
Les valeurs de matière organique total, d’azote Kjeldahl et de phosphore total dans le
sédiment sont données dans le tableau suivant.
Il est à noter que les stations les plus enrichies (codes couleur Jaune à Orange) sont : La
Palme, Vendres, Thau Est et Ouest, Méjean, Marette Nord et Sud, Crey et Bolmon.
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Tableau 20. Résultats de l’enrichissement des sédiments dans les lagunes et code couleur.
Lagune MO (% p.s.)
Azote Kj (% p.s.)
Phos. Tot. (mg/kg)
Canet Sud 5,6 0,17 481 Salses-Leucate Sud 7,2 0,18 272 Salses-Leucate Nord 8,2 0,23 330 La Palme Nord 17,1 0,41 476 Bages-Sigean Sud 7,1 0,16 381 Bages-Sigean Milieu 5,9 0,2 1640 Bages-Sigean Nord 11,5 0,21 492 Campignol 3,8 0,11 454 Gruissan 3,4 0,05 275 Vendres 22,8 0,84 930 Grand Bagnas 11,9 0,33 809 Thau Est 18,7 0,44 703 Thau Ouest 17,4 0,49 542 Or Est 10,9 0,42 526 Or Ouest 12,5 0,43 521 Prévost Est 11,9 0,33 812 Méjean Ouest 16,7 0,45 1360 Vic 11,4 0,36 759 Pierre Blanche 13,3 0,35 762 Ponant 10,9 0,21 640 Marette Sud 14,2 0,55 651 Marette Nord 15,9 0,62 754 Scamandre 7,0 0,25 418 Crey 18,5 0,99 1110 La Palissade 1,5 0 370 Vaccarès 5,8 0,09 528 Berre Sud 14,5 0,2 553 Berre Nord 11,8 0,32 615 Vaïne 12,7 0,24 407 Bolmon 14,8 0,51 1110
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3.2.3 - Potentiel d’oxydo-réduction (rédox)
Le rédox traduit l’activité biologique du compartiment bactériologique du sédiment. Il
résulte d’un ensemble de processus physico-chimiques et biologiques qui ont pour
origine la dégradation de la matière organique. La matière organique déposée dans
les sédiments est dégradée par des bactéries qui consomment de l’oxygène. Si la
décomposition bactérienne de la matière organique se fait rapidement et
efficacement, les valeurs de rédox sont peu ou pas négatives. En revanche, si les
apports trophiques sont excessifs, une déficience en oxygène peut survenir et un
processus anaérobie de dégradation bactérienne succède au processus aérobie,
intensifiant le déficit en O2 et produisant du sulfure d’hydrogène. Le redox atteint alors
des valeurs très négatives. Le rédox est donc une mesure globale de la dynamique
de la dégradation de la matière organique et de son recyclage dans la chaine
alimentaire.
Le rédox est mesuré le long de la colonne sédimentaire tous les 2 cm jusqu’à 20 cm de
profondeur. Les valeurs moyennes du rédox en surface (-2 et -4 cm) et en profondeur (6 cm)
sont calculées et comparées à des valeurs seuils données par le Tableau 21 (source : IARE,
1998) :
Tableau 21. Valeurs seuils des classes de qualité du rédox en surface et en profondeur.
Enrichissement Redox surface (mV)
Redox fond (mV)
Normal > -35 > -200 Faible -36 à -70 -201 à -250 Moyen -71 à -200 -251 à -300
Fort -201 à -250 -301 à -350 Très fort < -250 < -351
Le Tableau 22 présente les valeurs moyennes de rédox de fond et de surface pour chaque
secteur, ainsi que le code couleur de qualité correspondant.
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Tableau 22. Valeurs moyennes du rédox en surface et en profondeur.
Station Rédox surface (mv)
Rédox profondeur (mv)
Canet Sud -59,5 -146 Salses-Leucate Sud 18,0 -20 Salses-Leucate Nord 31,8 -43 La Palme Nord -187,0 -212 Bages-Sigean Sud -104,0 -208 Bages-Sigean Milieu -244,5 -255 Bages-Sigean Nord -130,3 -227 Campignol -51,2 -85 Gruissan 169,9 98 Vendres 176,6 115 Grand Bagnas -82,7 -58 Thau Est -1,8 -127 Thau Ouest -127,0 -194 Or Est 89,5 27 Or Ouest 148,2 32 Prévost Est -96,7 -274 Méjean Ouest -67,0 -236 Vic -60,8 -191 Pierre Blanche -218,7 -275 Ponant -134,5 -236 Marette Sud -35,8 -186 Marette Nord 15,5 -257 Scamandre -4,3 -115 Crey -220,8 -221 La Palissade 36,3 -27 Vaccarès -14,5 -91 Berre Sud -79,8 -175 Berre Nord 9,7 -257 Vaïne -138,3 -241 Bolmon -164,5 -221
Sur l’ensemble des stations, les potentiels d’oxydo-réduction en profondeur sont normaux,
signe que la matière organique est bien dégradée dans le temps. Les stations de Berre
Nord, Marette Nord, Pierre Blanche, Prévost Est et de Bages-Sigean Milieu présente un
sédiment moyennement enrichis en profondeur.
En ce qui concerne les rédox de surface, certaines stations présentent des enrichissements
ponctuels très importants, telles que Bages-Sigean Milieu, Pierre Blanche et Crey.
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3.2.4 - Bilan de la qualité des sédiments
Le tableau suivant présente le bilan sédimentaire des stations, en s’appuyant sur
l’enrichissement du sédiment. Pour chaque paramètre, une note de 1 à 5 est attribuée à
chaque classe de qualité, où 1 est considérée comme la meilleure (code couleur Bleu) et 5 la
plus mauvaise (code couleur Rouge). Le bilan correspond à la moyenne de ces notes et se
traduit par un code couleur attribué de la même façon. La nature du sédiment vient en
complément du bilan qui indique le degré d’enrichissement.
Globalement, l’ensemble des stations apparaissent moyennement à fortement enrichies
(code couleur Vert à Jaune), ce qui reste relativement cohérent avec le milieu lagunaire.
La station de Crey présente l’enrichissement le plus important (code couleur Orange).
D’autres lagunes, au bilan sédimentaire mitigé, devraient également faire l’objet d’attentions
particulières en mettant en parallèle la qualité du peuplement. Ces stations sont La Palme,
Bages-Sigean Milieu, Vendres, Grand-Bagnas, Thau Est et Ouest, Prévost, Méjean, Pierre-
Blanche, Marette Nord et Sud et Bolmon.
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Tableau 23 : Bilan de la qualité des sédiments.
Station Type de sédiment N P MO Redoxsurface
Redox fond Bilan
Canet Sud Sédiments très envasés à dominance de vases Faible Moyen Moyen Faible Normal Bon
Salses-Leucate Sud
Sédiments très envasés à dominance de vases Faible Faible Moyen Normal Normal Bon
Salses-Leucate Nord
Sédiments très envasés à dominance de sables Faible Faible Moyen Normal Normal Bon
La Palme Nord
Sédiments très envasés à dominance de vases Fort Moyen Fort Moyen Faible Moyen
Bages-Sigean Sud
Sédiments très envasés à dominance de vases Faible Faible Moyen Moyen Faible Bon
Bages-Sigean Milieu
Sédiments très envasés à dominance de vases Faible Très
fort Moyen Fort Moyen Moyen
Bages-Sigean Nord
Sédiments très envasés à dominance de vases Faible Moyen Moyen Moyen Faible Bon
Campignol Sables moyennement envasés Faible Moyen Moyen Faible Normal Bon
Gruissan Sables purs Faible Faible Moyen Normal Normal Bon
Vendres Sédiments très envasés à dominance de sables
Très fort Fort Très
fort Normal Normal Moyen
Grand Bagnas Vases pures Moyen Fort Moyen Moyen Normal Moyen
Thau Est Sédiments très envasés à dominance de sables Fort Fort Très
fort Normal Normal Moyen
Thau Ouest Sédiments très envasés à dominance de sables Fort Moyen Fort Moyen Normal Moyen
Or Est Sédiments très envasés à dominance de vases Fort Moyen Moyen Normal Normal Bon
Or Ouest Sédiments très envasés à dominance de vases Fort Moyen Moyen Normal Normal Bon
Prévost Est Sédiments très envasés à dominance de vases Moyen Fort Moyen Moyen Moyen Moyen
Méjean Ouest Vases pures Fort Très
fort Fort Faible Faible Moyen
Vic Sédiments très envasés à dominance de vases Moyen Fort Moyen Faible Normal Bon
Pierre Blanche Vases pures Moyen Fort Moyen Fort Moyen Moyen
Ponant Vases pures Faible Moyen Moyen Moyen Faible Bon
Marette sud Sédiments très envasés à dominance de vases
Très fort Moyen Fort Faible Normal Moyen
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Marette Nord Vases pures Très fort Fort Fort Normal Moyen Moyen
Scamandre Vases pures Faible Faible Moyen Normal Normal Bon
Crey Sédiments très envasés à dominance de sables
Très fort Fort Très
fort Fort Faible Médiocre
La Palissade Sables moyennement envasés Faible Faible Moyen Normal Normal Bon
Vaccarès Vases pures Faible Moyen Moyen Normal Normal Bon
Berre Sud Vases pures Faible Moyen Fort Moyen Normal Bon
Berre Nord Vases pures Moyen Moyen Moyen Normal Moyen Bon
Vaïne Vases pures Faible Faible Moyen Moyen Faible Bon
Bolmon Vases pures Très fort Fort Fort Moyen Faible Moyen
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3.3 - Qualité des peuplements benthiques
3.3.1 - Richesse spécifique
La richesse spécifique correspond au nombre d’espèces présentes à chaque station.
Le Tableau 24 présente les seuils de référence pour la richesse spécifique avec le degré de
perturbation correspondant et le code couleur de qualité. Ses seuils sont inspirés des
classes proposées par l’indice de la potentialité biologique (jusqu’à S < 30) et par le Système
d’aide à l’interprétation des données benthiques en milieu marin et lagunaire (IARE, Agence
de l’eau Rhône Méditerranée Corse, 1998) (pour S > 30).
Tableau 24 : Valeurs seuils de référence pour la richesse spécifique.
Le tableau suivant montre les résultats pour chaque station de la richesse spécifique totale,
la classe de qualité correspondante, ainsi que l’évolution des secteurs suivis entre 2006 et
2009, en indiquant si la richesse a augmenté ( ), diminué ( ), ou si elle s’est stabilisée ( ).
En 2009 :
En 2009, sur l’ensemble des 30 stations échantillonnées, 157 espèces d’invertébrés
benthiques sont dénombrées. La richesse spécifique est en moyenne de 19 espèces par
station, avec un écart type de 14 espèces.
La station de Crey présente la richesse la plus faible avec seulement 2 espèces relevées.
Les stations de La Palme Nord, Campignol, Pierre Blanche, Scamandre, La Palissade ou
encore de Bolmon sont également très pauvres en espèces, traduisant potentiellement un
milieu très perturbé. Ces faibles résultats sont en accord avec les caractéristiques
oligohalines des lagunes de Scamandre, Crey et La Palissade. En effet, ces milieux très peu
Intervalles Interprétation Code couleur
S < 10 Milieu très perturbé 10 ≤ S < 20 Milieu instable 20 ≤ S < 30 Milieu stable et marinisé 30 ≤ S < 40 Milieu sous forte influence marine
40 ≥ S
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à nullement salés ne sont pas favorables à l’installation des peuplements, d’où le très faible
nombre d’espèces rencontrées.
La station de Salse-Leucate Nord présente la richesse la plus importante avec 49 espèces.
Les stations de Bages-Sigean Sud et Milieu sont également riches en espèces, témoignant
ainsi de la bonne richesse des peuplements benthiques dans ces milieux et de l’influence
marine à laquelle ils sont soumis.
Comparaison 2006 et 2009 :
Entre les campagnes de 2006 et de 2009, la station de La Palme Nord, qui est le site de
référence, voit sa richesse spécifique diminuer fortement de 20 à 7 espèces.
L’échantillonnage de cette station est daté du 27 avril 2009, ce qui n’est pas spécialement tôt
dans la saison et n’explique pas ce mauvais résultat. Au niveau du sédiment, cette station
s’est très envasée et enrichie entre les deux campagnes : en 2006 elle présentait un
sédiment sableux et moyennement envasé avec un très bon bilan sédimentaire, et en 2009,
le sédiment est très envasé, dominé par des vases et globalement moyennement enrichi.
Cet envasement et cet enrichissement expliquent sans doute la perte d’espèces.
En revanche, les stations de Salses-Leucate Nord, du Grand Bagnas, de Thau Ouest, et de
Berre Sud et de Berre Nord voient leurs richesses augmenter. Ceci concorde avec la
diminution de proportion de vases dans le sédiment et un bilan sédimentaire globalement
meilleur en 2009.
Les autres stations se maintiennent.
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Tableau 25 : Résultats de la richesse spécifique totale, code couleur de qualité et évolution entre 2006 et 2009.
Station 2006 2009 Evolution
Canet Sud 12 Salses-Leucate Sud 35 40 Salses-Leucate Nord 50 49 La Palme Sud 20 La Palme Nord 18 7 Bages-Sigean Sud 45 Bages-Sigean Milieu 46 Bages-Sigean Nord 26 Campignol 9 Gruissan 24 Vendres 12 Grand Bagnas 9 12 Pisse Saume 32 Thau Est 30 39 Thau Ouest 16 33 Or Est 10 Or Ouest 10 Arnel 3 Méjean Est 17 Méjean Ouest 8 12 Prévost Est 16 12 Prévost Ouest 20 Grec 12 Vic 13 Pierre Blanche 6 Ponant 14 Marette Nord 12 Marette Sud 12 Scamandre 3 Crey 2 Vaccarès 12 14 La Palissade 8 Berre Sud 16 30 Berre Nord 12 22 Vaïne 15 Bolmon 7
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3.3.2 - Densité
La densité est donnée par la moyenne des densités totales observées dans les trois sous
stations d’échantillonnage de la station concernée.
Le Tableau 26 présente les seuils de référence pour la densité totale, inspirés des intervalles
utilisés pour le calcul de la potentialité biologique. Le code couleur proposé met en évidence
qu’un état peut s’exprimer par des densités différentes. Par exemple, un état moyen (code
couleur Jaune), peut être révélé par de très fortes ou de très faibles densités.
Tableau 26 : Valeurs seuils de référence pour la densité et classes de qualité.
Intervalles de densité (nb ind./m²) Interprétation
d = 0 Nulle 1 < d < 200 Très faible
201 < d <1500 Faible 1501 < d < 6000 Normale 6001 < d < 8000 Forte
d > 8000 Très forte
Le tableau suivant montre pour chaque station la densité totale en nombre d’individus par
m², ainsi que l’évolution de la densité sur les stations suivies en 2006 et en 2009 :
augmentation ( ), diminution ( ), stabilisation ( ).
En 2009 :
En 2009, sur l’ensemble des stations échantillonnées, la densité moyenne est de
5 535 ind./m², avec un écart-type de 4 404 ind./m².
La densité maximale est atteinte au niveau de la station de Vaccarès, avec 16 515 ind./m².
Le peuplement de cette station est dominé par les bivalves Mya arenaria (39 % du
peuplement total soit 6444 ind./m²) et Scrobicularia cottardi (28 % du peuplement total soit
4622 ind./m²), l’espèce indicatrice d’enrichissement en matière organique Heteromastus
filiformis est bien représentée (22 % du total soit 3693 ind./m²).
De très fortes densités sont également observées au niveau d’autres stations. Certaines
d’entre elles sont dominés par les bivalves : Bages-Sigean Nord et Milieu avec un
peuplement fortement dominé par Mytilaster solidus (respectivement de 9456 ind./m² et 8400
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ind./m²) et Berre Sud fortement dominé par le bivalve Musculista sehosia (52 % du
peuplement total soit 4459 ind./m²).
La station du Ponant montre un peuplement très dense dominé par le gastéropode Peringia
ulvae (9615 ind./m²).
Et enfin, la station de Vic est fortement dominée par l’espèce indicatrice d’enrichissement en
matière organique : Heteromastus filiformis (8970 ind./m²).
La station de Crey présente la plus faible densité avec 130 ind./m². Les stations de Canet,
Campignol et La Palissade montrent également de faibles densités, inférieures à
1 500 ind./m², pouvant traduire un milieu contraignant et/ou perturbé.
Comparaison 2006 et 2009 :
Entre les campagnes de 2006 et de 2009, les densités ont tendance à augmenter.
De cette augmentation, des stations aux densités normales en 2006 présentent de fortes
densités en 2009 : il s’agit de Salses-Leucate Nord (6767 ind./m² en 2009, dominé à 38 %
par l’oligochète Paranais sp.) et de Berre Nord (7567 ind./m² en 2009, dominé à 46 % par le
bivalve Musculista sehousia).
De la même manière, les stations du Vaccarès (16515 ind./m², dominé par Mya arenaria à
39 % et Scrobbicularia cottardi à 28 % du peuplement total) et de Berre Sud (8630 ind./m²,
dominé par Musculista sehousia à 52 %) se retrouvent déclassées en 2009 avec de très
fortes densités.
Pour d’autres stations, cette augmentation de densité permet d’atteindre l’optimum en 2009,
avec des densités normales au niveau de Prévost Est (5033 ind./m², très fortement dominé à
82 % par le bivalve Scrobicularia cottardi), Thau Ouest (2167 ind./m²), ou encore de Salses-
Leucate Sud (2844 ind./m²).
Les stations de La Palme Nord, du Grand-Bagnas et de Méjean Ouest maintiennent leurs
densités normales.
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Tableau 27 : Résultats des densités (en ind./m²) et évolution.
Station 2006 2009 Evolution
Canet Sud 1330 Salses-Leucate Sud 752 2844 Salses-Leucate Nord 2119 6767 La Palme Sud 3163 La Palme Nord 3526 5567 Bages-Sigean Sud 6385 Bages-Sigean Milieu 12044 Bages-Sigean Nord 13926 Campignol 1448 Gruissan 2552 Vendres 5904 Grand Bagnas 3604 4030 Pisse Saume 874 Thau Est 996 7433 Thau Ouest 570 2167 Or Est 2015 Or Ouest 3322 Arnel 1463 Méjean Est 2222 Méjean Ouest 1622 2767 Prévost Est 448 5033 Prévost Ouest 2044 Grec 1022 Vic 12444 Pierre Blanche 1626 Ponant 14559 Marette Sud 3059 Marette Nord 3678 Scamandre 2944 Crey 130 La Palissade 237 Vaccarès 8867 16515 Berre Sud 967 8630 Berre Nord 4374 7567 Vaïne 4674 Bolmon 4441
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3.3.3 - Biomasse
Le tableau suivant montre les valeurs de biomasse obtenues en 2009, en grammes par m².
Les données de 2006 ne sont pas disponibles. Il n’existe pas de valeurs seuils de référence
pour la biomasse.
Sur l’ensemble des stations échantillonnées, la biomasse moyenne est de 278 g/m². Une
grande hétérogénéité s’observe sur l’ensemble des stations, avec des biomasses variant de
près de 4000 g/m² à moins de 0,5 g/m².
Les plus fortes biomasses sont observées au niveau de Bages-Sigean Nord avec 3947 g/m²,
et de Bages-Sigean Milieu avec 3546 g/m² où Mytilaster solidus explique à elle seule 99 %
de la biomasse pour ces deux stations (avec 3940 g/m² au niveau de Bages-Sigean Nord et
3500 g/m² au niveau de Bages-Sigean Sud).
La station de Crey présente la plus faible biomasse avec 0,37 g/m².
Mis à part les stations de Vaccarès, Berre Nord et Sud dont les biomasses sont de l’ordre de
200 g/m², l’ensemble des autres stations prospectées présentent de faibles biomasses,
inférieures à 35 g/m².
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Tableau 28 : Résultats des biomasses en 2009.
Station Biomasse (g/m²)
Canet Sud 2,32 Salses-Leucate Sud 7,02 Salses-Leucate Nord 13,80 La Palme Nord 26,37 Bages-Sigean Sud 34,99 Bages-Sigean Milieu 3546,10 Bages-Sigean Nord 3947,06 Campignol 5,13 Gruissan 10,29 Vendres 13,72 Grand Bagnas 8,88 Thau Est 24,50 Thau Ouest 10,87 Or Est 9,13 Or Ouest 19,72 Prévost Est 4,74 Méjean Ouest 14,08 Vic 12,80 Pierre Blanche 2,26 Ponant 3,50 Marette sud 11,49 Marette Nord 8,61 Scamandre 1,33 Crey 0,48 La Palissade 0,37 Vaccarès 195,70 Berre Sud 113,03 Berre Nord 255,78 Vaïne 33,04 Bolmon 8,24
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3.3.1 - Indices de diversité
La diversité traduit la manière dont les individus sont répartis entre les différentes
espèces présentes. Dans un peuplement non perturbé, les espèces peuvent être
nombreuses, mais aucune espèce ne domine largement les autres, ce qui se traduit
par une valeur de diversité élevée. En revanche, l’occurrence d’un déséquilibre du
peuplement se traduit par la diminution du nombre d’espèces et par la forte
dominance d’une ou de quelques espèces au détriment des autres, et ceci se traduit
par une diminution de la diversité.
Le Tableau 29 montre les valeurs seuils de l’indice de diversité de Shannon.
Tableau 29 : Valeurs seuils de référence pour l’indice de diversité de Shannon.
EcoQ H’
Très bon H’ > 4 Bon 3 < H’ ≤ 4
Moyen 2 < H’ ≤ 3 Pauvre 1 < H’ ≤ 2
Mauvais H’ ≤ 1
Le tableau suivant présente les valeurs de l’indice de diversité de Shannon obtenues pour
chaque station en 2006 et en 2009.
En 2009 :
En 2009, sur l’ensemble des secteurs échantillonnés, la diversité de Shannon est en
moyenne de 2,29 bits ± 0,90 bits. Les valeurs de l’indice sont très variables d’une lagune à
l’autre.
La meilleure diversité est rencontrée au niveau de la station de Thau Ouest (4,22 bits).
Les plus faibles diversités se retrouvent au niveau de l’étang de Crey (0,90 bits) et de
Scamandre (0,98 bits). Ces très faibles valeurs de l’indice de Shannon sont expliquées par
les très faibles richesses spécifiques observées sur ses sites (2 à 3 espèces).
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Comparaison 2006 et 2009 :
Entre 2006 et 2009, certaines stations perdent en diversité :
- Les stations de Salses-Leucate Nord et Sud sont déclassées du statut très bon à
bon, avec respectivement H’ = 3,52 bits et H’ = 3,40 bits. L’augmentation de la
richesse spécifique au niveau de ces stations n’explique pas cette diminution de la
diversité. En revanche, les dominances de Paranais sp. au niveau de la station Nord
et de Phoronis cf. psammophyla au niveau de la station Sud peuvent être mises en
cause.
- Les stations de La Palme Nord et de Prévost Est voient leur diversité diminuer et se
trouvent déclassées dans un état médiocre (H’ = 1,53 bits pour La Palme Nord et
H’ = 1,13 pour Prévost Est). Cette perte de diversité est à mettre en relation avec la
diminution de la richesse spécifique, en particulier au niveau de La Palme où
l’envasement et l’enrichissement du site expliquent les perturbations au sein du
peuplement.
D’autres stations présentent de meilleures diversités en 2009 qu’en 2006 :
- Les stations de Grand Bagnas, Méjean Ouest, Vaccarès et Berre Nord présentent
des peuplements plus diversifiés en 2009 en passant des classes médiocres à
moyennes. Cette augmentation de la diversité s’explique globalement par
l’augmentation de la richesse spécifique au sein de ces stations.
- De la même manière, la station de Thau Ouest passe d’une diversité moyenne à très
bonne (H’ = 4,22 bits) avec un peuplement qui s’enrichie.
Des stations ne montrent pas de changements de classes d’un point de vue de leur diversité,
comme la station de Thau Est qui maintient une bonne diversité (H’ = 3,46 bits) et celle de
Berre Sud qui se maintient à un niveau moyen (H’ = 2,45 bits).
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Tableau 30 : Résultats de l’indices de diversité de Shannon, code couleur de qualité et évolution entre 2006 et 2009.
Station 2006 2009 Evolution
Canet Sud 2,21 Salses-Leucate Sud 4,05 3,40 Salses-Leucate Nord 4,62 3,52 La Palme Sud 2,62 La Palme Nord 2,24 1,53 Bages-Sigean Sud 3,21 Bages-Sigean Milieu 2,19 Bages-Sigean Nord 1,62 Campignol 2,28 Gruissan 3,73 Vendres 2,28 Grand Bagnas 1,78 2,25 Pisse Saume 3,73 Thau Est 3,79 3,46 Thau Ouest 2,36 4,22 Or Est 1,88 Or Ouest 2,17 Arnel 0,68 Prévost Est 3,20 1,13 Prévost Ouest 3,29 Méjean Est 1,69 Méjean Ouest 1,67 2,63 Grec 1,35 Vic 1,27 Pierre Blanche 2,05 Ponant 1,52 Marette Sud 2,44 Marette Nord 1,77 Scamandre 0,98 Crey 0,90 La Palissade 2,95 Vaccarès 1,25 2,15 Berre Sud 2,26 2,45 Berre Nord 1,96 2,91 Vaïne 2,31 Bolmon 1,21
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3.3.2 - L’AMBI
L’AMBI est basé sur la polluosensibilité des espèces, et permet donc de renseigner
sur l’état de dégradation des stations. Il s’appuie sur les successions écologiques des
5 groupes écologiques polluosensibles des espèces : le groupe I comprenant les
espèces les plus sensibles à l’hypertrophisation jusqu’au groupe V qui englobe les
espèces opportunistes des sédiments réduits.
Le calcule de l’AMBI et du M-AMBI se fait à partir du logiciel gratuit disponible sur le site
internet de AZTI Marine.
Le tableau suivant présente les valeurs seuils de référence de l’AMBI, d’après Borja et al.
(2003).
Tableau 31 : Valeurs seuils de référence pour l’AMBI, d’après Borja et al., 2003.
Qualité écologique AMBI
Très bon AMBI ≤ 1,2 Bon 1,2 < AMBI ≤ 3,3
Moyen 3,3 < AMBI ≤ 4,3 Pauvre 4,3 < AMBI ≤ 5,5
Mauvais 5,5 < AMBI ≤ 7
Le tableau suivant présente les résultats de l’AMBI des campagnes de 2006 et de 2009 pour
chaque station, calculés en 2010.
Pour chaque campagne, le taux d’espèces non assignées par station est donné. Ces
espèces sont celles qui ne paraissent pas dans la liste de référence, ou celles auxquelles
aucun groupe de polluosensibilité n’est assigné. Un taux d’espèces non assignées
supérieure à 20 % (surligné en orange clair) remet en cause la robustesse de l’indice au
niveau de la station concernée.
La campagne de 2006 :
L’AMBI calculé en 2006 est recalculé en 2010, grâce au logiciel de l’AZTI Marine, avec la
liste de référence mise à jour.
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Il est à noter que pour le même jeu de données (campagne de 2006), les valeurs de l’AMBI
varient suivant les années auxquelles les calculs sont effectués, mais qu’aucun changement
de classes n’est observé.
Les stations de Berre Nord et Sud présente plus de 20 % d’espèces non assignées, et remet
donc en question le statut de bon état pour ces stations.
La campagne de 2009 :
En 2009, les valeurs de l’AMBI varient entre 0 au niveau de Crey et 5,46 au niveau de
Scamandre.
Les stations qui paraissent dans un très bon état au regard de l’AMBI sont les stations de
Bages-Sigean Milieu (AMBI = 0,55), Bages-Sigean Nord (AMBI = 1,15). Ces stations
paraissent comme non affectées par une pollution.
La station de Crey présente un M-AMBI de 0 mais ne traduit pas forcément un très bon état.
En effet, la station est oligohaline et n’abrite que 2 espèces, signe que le milieu est perturbé.
Mais les espèces présentes appartiennent aux groupes polluosensibles 1 et 2, ce qui ne qui
ne permet pas de déclasser la station au regard de l’AMBI. Il est d’ailleurs spécifié pour le
calcul de l’AMBI, qu’en-deçà de six espèces le résultat manque de robustesse.
Les stations qui semblent présenter des pollutions importantes sont Or Est (AMBI = 4,68) et
Scamandre (AMBI = 4,98). Au niveau de ces stations, les mauvais résultats de l’AMBI
s’expliquent par l’absence d’espèces sensibles de groupe écologiques de polluosensibilité GI
et GII (espèces les plus sensibles à l’hypertrophisation) et par la très forte majorité d’espèces
du groupe écologique de polluosensibilité GV (correspondant aux espèces opportunistes des
sédiments réduits).
La station de Bolmon présente un taux d’espèces non assignées de près de 72 %, ne
permettant pas de faire confiance au résultat de bon état pour cette station. En particulier,
les ostracodes qui sont dominants ne sont pas renseignés au niveau de leur groupe
écologique sur la liste de référence de l’AMBI. Seules des espèces du groupe écologique
intermédiaire de polluosensibilité GIII sont bien représentées.
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Comparaison 2006 et 2009 :
Entre les campagnes de 2006 et de 2009, des stations perdent une classe de qualité :
Salses-Leucate Nord (AMBI = 3,62) présente un état moyen (code couleur Jaune). La station
de Thau Ouest passe d’un très bon à un bon état (AMBI = 1,38, code couleur Vert).
Les autres stations maintiennent leur statut de bon état vis-à-vis de la pollution.
Seule la station de Méjean Ouest s’améliore entre 2006 et 2009 parmi celles qui sont suivies
lors de ces deux campagnes et présente un bon état (AMBI = 3,01, code couleur Vert).
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Tableau 32 : Résultats de l’AMBI, code couleur de qualité et évolution entre 2006 et 2009.
Stations 2006 Non
assignées (%)
2009 Non
assignées (%)
Evolution
Canet Sud 3,30 0,8 Salses-Leucate Sud 2,45 3,9 2,17 0,4 Salsles-Leucate Nord 2,18 3,5 3,62 0,2 La Palme Sud 2,45 La Palme Nord 2,99 0,1 2,56 Bages-Sigean Sud 3,66 Bages-Sigean Milieu 0,55 0,2 Bages-Sigean Nord 1,15 0,1 Campignol 2,71 Gruissan 3,43 Vendres 2,49 0,3 Grand Bagnas 2,52 2,85 0,1 Pisse Saume 2,01 8,1 Thau Est 1,94 3 2,36 0,1 Thau Ouest 0,60 2,6 1,38 Or Est 4,68 Or Ouest 3,99 Arnel 3,01 Méjean Ouest 3,40 3,01 2,7 Méjean Est 3,20 0,3 Prévost Ouest 3,41 2,4 Prévost Est 2,41 3,19 Grec 3,09 0,4 Vic 4,15 Pierre Blanche 3,5 Ponant 2,79 Marette Nord 3,02 Marette Sud 4,13 1,3 Scamandre 4,98 Crey 00,00 La Palissade 2,53 9,4 Vaccarès 2,85 0,4 2,78 0,1 Berre Sud 1,87 54,8 3,27 0,1 Berre Nord 2,97 21,7 2,87 0,4 Vaïne 2,53 Bolmon 2,98 71,8
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3.3.1 - Le M-AMBI
Le M-AMBI est fonction à la fois de la richesse spécifique, de l’indice de diversité de
Shannon et de l’AMBI. Pour calculer le M-AMBI, une station théorique de référence
de très bon état est générée, combinant les meilleurs résultats des trois paramètres.
Cette station correspond à la meilleure qualité écologique théorique possible du jeu
de donnée traité. De même, une station théorique de la plus mauvaise qualité
possible est établie avec l’AMBI minimal observé et des valeurs de richesse et de
diversité nulles.
Le Tableau 33 montre quelles sont les valeurs d’AMBI, de Shannon et de richesse spécifique
qui ont été utilisées pour calculer le M-AMBI.
Tableau 33 : Valeurs de référence retenues pour le calcul du M-AMBI
Qualité écologique AMBI H’ S
Minimale (mauvais état) 6 0 0
Maximale (très bon état) 0 4,62 50
Le Tableau 34 indique les valeurs seuils de référence du M-AMBI.
Tableau 34 : Seuils de référence du M-AMBI
Qualité écologique M-AMBI
Très bon M-AMBI > 0,80 Bon 0,55 < M-AMBI ≤ 0,80
Moyen 0,40 < M-AMBI ≤ 0,55 Pauvre 0,20 < M-AMBI ≤ 0,40
Mauvais M-AMBI ≤ 0,20
Le tableau 35 présente les résultats du M-AMBI et l’évolution des classes de qualité des
stations entre les campagnes de 2006 et de 2009. Le M-AMBI a été recalculé pour 2006 et
2009 avec le jeu de données complet des deux campagnes. La station théorique de
référence haute utilisée pour le calcul du M-AMBI correspond bien à la combinaison du
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meilleur AMBI (AMBI = 0,00), de la meilleure diversité (H’ = 4,62) et de la plus importante
richesse spécifique (S = 50) observés dans la base de donnée de 2006 et de 2009.
La campagne de 2006 :
Dans le but de comparer les données de 2006 à celles de 2009, le M-AMBI est recalculé
avec la base de données regroupant les campagnes de 2006 et 2009. En intégrant les
données actuelles, peu de différences apparaissent pour la campagne de 2006 : la station
d’Arnel passe d’un statut de très mauvais à médiocre (code couleur Orange) et la station de
Berre Sud présente un état moyen (code couleur Jaune) calculé en 2009 au lieu d’un état
médiocre (calculé en 2006).
La campagne de 2009 :
En s’appuyant sur l’analyse qui prend en compte les jeux de données des campagnes de
2006 et de 2009, la station de Scamandre (M-AMBI = 0,16) est la moins bien classée en
2009, avec un mauvais état (code couleur Rouge). Cette station est clairement déclassée
par sa très faible richesse spécifique (S = 3 espèces) et par sa très faible diversité (H’ = 0,15
bits).
D’autres stations comme Canet Sud, La Palme Nord, Or Est, Prévost Est, Vic, Pierre
Blanche, Ponant, Marette Nord et Sud et Bolmon sont classées dans des états médiocres
(code couleur Orange).
La station de Thau Ouest est la mieux notée (M-AMBI = 0,79) et se retrouve dans un bon
état (code couleur Vert), en limite de classe supérieure.
Les autres stations classées dans un bon état (code couleur Vert) sont Sasles-Leucate Nord
et Sud, Bages-Sigean Nord, Sud et Milieu, Gruissan et Thau Est.
Comparaison 2006 et 2009 :
En s’appuyant sur l’analyse qui prend en compte les jeux de données des campagnes de
2006 et de 2009, on remarque que certaines stations présentent de meilleurs états
écologiques au regard du M-AMBI en 2009. Les stations suivantes aux états médiocres en
2006 présentent des états moyens en 2009 (code couleur Jaune) : Grand Bagnas, Méjean
Ouest, Vaccarès et Berre Nord.
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D’autres stations présentent de moins bon états en 2009 qu’en 2006, signe que le milieu
perd en qualité : on notera Salses-Leucate Nord qui apparait en bon état en 2009 (M-
AMBI = 0,69, code couleur Vert). Les stations de La Palme Nord (M-AMBI = 0,37) et de
Prévost Est (M-AMBI = 0,33) sont déclassées dans des états médiocres (code couleur
Orange).
Les autres stations maintiennent leur statut entre la campagne de 2006 et celle de 2009, à
savoir un état écologique moyen pour Berre Sud et un bon état écologique pour Salses-
Leucate Sud et Thau Est et Ouest.
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Tableau 35 : Résultats du M-AMBI et évolution entre 2006 et 2009.
Station 2006 2009 Evolution
Canet Sud 0,40 Salses-Leucate Sud 0,75 0,72 Salses-Leucate Nord 0,90 0,69 La Palme Sud 0,53 La Palme Nord 0,46 0,37 Bages-Sigean Sud 0,64 Bages-Sigean Milieu 0,76 Bages-Sigean Nord 0,57 Campignol 0,43 Gruissan 0,57 Vendres 0,46 Grand Bagnas 0,40 0,43 Thau Est 0,70 0,70 Thau Ouest 0,60 0,79 Pisse Saume 0,72 Arnel 0,25 Or Est 0,28 Or Ouest 0,41 Prévost Est 0,55 0,33 Prévost Ouest 0,52 Méjean Est 0,40 Méjean Ouest 0,33 0,45 Grec 0,35 Vic 0,28 Pierre Blanche 0,34 Ponant 0,39 Marette Sud 0,37 Marette Nord 0,39 Scamandre 0,15 Crey 0,45 La Palissade 0,49 Vaccarès 0,36 0,44 Berre Sud 0,52 0,52 Berre Nord 0,40 0,54 Vaïne 0,47 Bolmon 0,32
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3.3.2 - L’indice trophique
L’indice trophique renseigne sur l'état de dégradation des fonds par l'accumulation de
matière organique. Cet indice est basé sur la structure trophique du peuplement : il
rend compte du régime alimentaire des espèces présentes dans l’échantillon. Ces
espèces sont regroupées au sein de 4 groupes trophiques : GT1 les suspensivores,
GT 2 les détritivores, GT 3 les dépositivores, et GT 4 les espèces de substrat
anaérobie.
Le Tableau 36 présente les valeurs seuils et les classes de qualité relatives à l’indice
trophique.
Tableau 36 : Valeurs seuils de l’indice trophique.
EcoQ IT
Très bon IT > 80 Bon 60 < IT ≤ 80
Moyen 50 < IT ≤ 60 Pauvre 30 < IT ≤ 50
Mauvais IT ≤ 30
Le Tableau 37 renvoie les résultats de l’indice trophique et les densités relatives aux 4
groupes trophiques pour la campagne de 2009. L’indice trophique n’a pas été calculé en
2006.
En 2009, le niveau trophique varie entre 14 (Or Est) et 99 (La Palme Nord).
Les stations de Marette Nord et Sud et d’Or Est présentent des indices trophiques très bas
(code couleur Rouge). Ces très mauvais résultats s’expliquent par l’abondance d’oligochètes
de groupe trophique GT4 vivant dans les sédiments anaérobies, en particulier Paranais sp.
bien représenté au niveau de Marette Sud (1167 ind./m²) et de Or Est (1152 ind./m²) et
Streblospio shrubsolii au niveau de Marette Nord (2244 ind./m²). Ceci indique que ces sites
sont très probablement impactés par un enrichissement fort en matière organique.
De nombreuses stations présentent des indices trophiques élevés, classées dans la
catégorie très bon (code couleur Bleu), telles que La Palme Nord, Bages-Sigean Nord et
Milieu, Thau Est, Or Ouest, Prévost Est, Méjean Ouest, Vaccarès et Berre Sud. Ces stations
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ne présentent que très peu d’espèces de substrat anaérobie (GT4) et des abondances
importantes des groupes plus sensibles comme les suspensivores (GT1) ou les détritivores
(GT2). Ces stations n’apparaissent donc pas impactées par l’enrichissement en matière
organique du sédiment.
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Tableau 37 : Résultats de l’indice trophique avec l’abondance des différents groupes trophiques et les codes couleurs de qualité de l’indice.
Station GT1 GT2 GT3 GT4 IT
Canet Sud 44 422 681 181 42 Salses-Leucate Sud 1722 570 270 281 77 Salses-Leucate Nord 1878 2052 126 2711 49 La Palme Nord 5478 41 48 0 99 Bages-Sigean Sud 2685 1241 674 1785 59 Bages-Sigean Milieu 9596 1756 681 11 91 Bages-Sigean Nord 9607 3756 559 4 88 Campignol 70 270 1107 0 43 Gruissan 489 1219 585 259 59 Vendres 248 1170 3515 970 37 Grand Bagnas 1996 589 759 685 66 Thau Est 3659 3381 393 0 81 Thau Ouest 900 689 500 78 70 Or Est 170 22 300 1522 14 Or Ouest 2563 81 485 193 84 Prévost Est 4411 285 0 337 91 Méjean Ouest 1722 552 422 70 81 Vic 2763 9107 93 481 71 Pierre Blanche 663 374 500 89 66 Ponant 3515 10878 141 26 74 Marette Sud 333 441 515 1770 26 Marette Nord 259 326 774 2319 20 Scamandre 944 30 0 1970 33 Crey 0 89 41 0 56 La Palissade 107 48 81 0 70 Vaccarès 11233 4007 1026 248 86 Berre Sud 5441 2959 204 26 87 Berre Nord 4556 1578 985 448 78 Vaïne 2293 1707 474 200 77 Bolmon 870 3259 311 0 71
GT 1 : les suspensivores, GT 2 : les détritivores, GT 3 : les dépositivores, GT 4 : les espèces de substrat anaérobie.
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3.3.3 - La Potentialité Biologique
Pour chaque secteur, en fonction de la classe de qualité de richesse spécifique et de la
classe de densité totale obtenue, on en déduit un code de qualité qui s’interprète en termes
de potentialité biologique.
Le tableau suivant présente les potentialités biologiques correspondantes aux niveaux
trophiques.
Tableau 38 : Classe de qualité, code couleur du niveau trophique et potentialité biologique.
Niveau trophique Potentialité biologique
Normal Hébergement d'un grand nombre de taxons exigeants, représentés par un nombre d'individus suffisant.
Peu élevé Disparition des espèces d'origine marine les plus sensibles à la variation des facteurs physico-chimiques.
Moyen Réduction de manière importante du nombre d'espèces exigeantes (et/ou d'origine marine), certaines espèces restantes pouvant faire l'objet de proliférations.
Elevé Disparition de toutes les espèces exigeantes, aboutissant à une forte réduction de la diversité spécifique : les densités ne sont jamais normales (plus ou moins élevées que la normale).
Très élevé Maintien uniquement des taxons les plus résistants, avec dans les cas extrêmes disparition totale de la faune benthique : les densités sont soit très faibles soit très fortes.
Le tableau suivant présente la position des lagunes dans la grille de lecture de la potentialité
biologique, permettant de comprendre quel est l’élément déclassant (richesse et/ou densité).
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Tableau 39 : Résultats de la potentialité biologique (campagne de 2009) en fonction des classes de qualité de la richesse et de la densité.
Richesse spécifique
Espèces indicatrices d'enrichis-sement en
M.O.
Densité Très
satisfaisante(> 30
espèces)
Satisfaisante(21 à 30 espèces)
Réduite (11 à 20 espèces)
Très faible(≤ 10
espèces)
Nulle (0 ind./m²)
Très faible (1 à 200 ind./m²) Crey
Faible
(200 à 1500 ind./m²)
Canet Campignol
La Palissade
Normale
(1500 à 6000 ind./m²)
Salse-Leucate Sud
Thau Ouest Gruissan
Vendres Grand
Bagnas Prévost Méjean Marette
Sud Marette
Nord Vaine
La Palme Or Est
Or Ouest Scamandre
Bolmon Pierre-
Blanche
Présence Forte
(6000 à 8000 ind./m²)
Salse-Leucate Nord
Bages-Sigean Sud
Thau Est
Berre Nord
Prolifération Très forte (> 8000 ind./m²)
Bages-Sigean Milieu
Bages-Sigean Nord
Berre Sud
Vic Vaccarès Ponant
Le tableau 40 présente les niveaux trophiques des secteurs, en 2006 et en 2009.
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En 2009 :
En 2009, la station de Bages-Sigean Milieu, combinant une richesse spécifique très
satisfaisante et de très fortes densités, ne trouve pas sa place dans la grille de lecture de la
potentialité biologique (Tableau 39). D’après les données sources, la forte densité observée
sur la station est liée à la dominance du bivalve suspensivore Mytilaster solidus avec
8400 ind/m². Cette espèce n’est pas indicatrice d’enrichissement en matière organique. La
station de Bages-Sigean Milieu peut donc être classée à un niveau trophique normal (code
couleur Bleu).
En 2009, les stations de Salses-Leucate Nord et Sud, Bages-Sigean Sud et Milieu, Gruissan
et Thau Est et Ouest présentent des niveaux trophiques normaux (code couleur Bleu).
L’étang de Crey présente un niveau trophique très élevé en raison de sa très faible richesse
spécifique (code couleur Rouge), témoignant de grandes perturbations dans le milieu qui
affectent totalement la macrofaune benthique.
Au niveau des stations apparemment soumises à un enrichissement (zone encadrée d’un
double trait au niveau du Tableau 39), l’abondance ou la prolifération d’espèces indicatrices
d’enrichissement en matière organique est mise en évidence. Les stations concernées sont
Salses-Leucate Nord, Bages-Sigean Nord, Sud et Milieu, Thau Est, Berre Nord et Sud, Vic,
Vaccarès et Ponant. Le polychète Heteromastus filiformis est présent sur l’ensemble de ces
stations, et plus particulièrement sur Vic où il prolifère (8970 ind./m²). Le polychète Paranais
sp. est abondant en particulier sur les stations de Bages-Sigean Sud et Salses-Leucate
Nord.
Comparaison 2006 et 2009 :
Entre 2006 et 2009, un certain nombre de stations présentent de très bons niveaux
trophiques (code couleur Bleu) : les stations de Salses-Leucate Nord et Sud maintiennent un
très bon niveau trophique. Les stations de Thau Est et Ouest atteignent le très bon état en
2009 et montrent que la qualité de leurs peuplements s’est très nettement améliorée.
Des stations s’améliorent et présentent un niveau trophique peu élevé en 2009 (code couleur
Vert) comme Grand Bagnas, Prévost Est et Méjean Ouest.
Les stations de Berre Nord et Sud se maintiennent à des niveaux trophiques moyens à peu
élevés (code couleur Jaune à Vert).
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Deux stations présentent de moins bons niveaux trophiques en 2009 qu’en 2006 :
- la station du Vaccarès perd une classe de qualité et présente un niveau trophique
élevé (code couleur Orange) en raison de très fortes densités (16515 ind./m², dominé
par Mya arenaria à 39 % et Scrobbicularia cottardi à 28 % du peuplement total),
- la station de La Palme voit sont niveau trophique déclassé à un niveau moyen en
raison de la diminution de la richesse spécifique (7 espèces en 2009). Ces résultats
sont en accord avec le bilan sédimentaire également moins bon en 2009 pour cette
station.
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Tableau 40 : Résultat des niveaux trophiques, code couleurs de qualité et évolution entre 2006 et 2009.
Station 2006 2009 Evolution
Canet Sud Moyen Salses-Leucate Sud Normal Normal Salses-Leucate Nord Normal Normal La Palme Nord Peu élevé Moyen Bages-Sigean Sud Normal Bages-Sigean Milieu Normal Bages-Sigean Nord Moyen Campignol Elevé Gruissan Normal Vendres Peu élevé Grand Bagnas Moyen Peu élevé Thau Est Peu élevé Normal Thau Ouest Moyen Normal Or Est Moyen Or Ouest Moyen Prévost Est Moyen Peu élevé Méjean Ouest Moyen Peu élevé Vic Elevé Pierre Blanche Moyen Ponant Elevé Marette Sud Peu élevé Marette Nord Peu élevé Scamandre Moyen Crey Très élevé La Palissade Elevé Vaccarès Moyen Elevé Berre Sud Moyen Moyen Berre Nord Peu élevé Peu élevé Vaïne Peu élevé Bolmon Moyen
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3.3.4 - IBGL
L’IBGL intègre plusieurs paramètres auxquels est attribuée une note entre 0 et 100
selon des intervalles de valeurs. Ces paramètres sont regroupés au sein de quatre
grandes étapes, traduisant la qualité biocénose, le niveau trophique, la typologie ainsi
que la densité. Pour chaque étape, une note est attribuée par la moyenne des notes
des paramètres de l’étape. Pour chaque secteur, l’IBGL correspond à la moins bonne
note obtenue dans les quatre étapes.
Ne disposant pas des données de rédox au niveau du sédiment pour la campagne de 2006,
l’IBGL n’a pas pu être calculé pour la première année du suivi.
Le tableau suivant montre pour chaque station les notes obtenues par chaque étape et la
note finale de l’IBGL pour la campagne de 2009.
En 2009, pour l’ensemble des sites étudiés, l’IBGL moyen est de 42 avec un écart-type de
16 et varie de 20 à 80.
La meilleure note est attribuée à Salses-Leucate Sud (IBGL = 80) et traduit un bon état (code
couleur Vert). Cette station est en limite de classe supérieure. Les stations de Salses-
Leucate Nord, Thau Est et Ouest ou encore de Berre Nord présentent également un bon état
du milieu (code couleur Vert). Ces stations sont profondes et marinisées, aux conditions
relativement stables et favorisant l’installation des peuplements.
Les stations de Crey et Scamandre partagent les notes les plus mauvaises (IBGL = 20) ce
qui traduit un mauvais état du milieu (code couleur Rouge) pour ces stations :
- Au niveau de Crey, l’analyse de l’IBGL montre que la mauvaise qualité du
peuplement (S = 2 espèces) s’explique par de fortes contraintes liées à la typologie
(milieu complètement dessalé), à l’enrichissement excessif et à une dégradation trop
lente de la matière organique.
- Au niveau de Scamandre, l’IBGL met en avant que la mauvaise qualité du
peuplement (S = 2) est principalement liée aux contraintes typologiques du milieu,
comme la très faible salinité.
Le milieu naturel de ces stations est donc naturellement plus pauvre.
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La majorité des autres stations présentent un état médiocre au regard de cet indice.
Tableau 41 : Résultats de l’IBGL et des étapes intermédiaires pour chaque secteur.
Station Qualité biocénose
Niveau trophique Typologie Autres
contraintes IBGL
Canet Sud 40 85 40 70 40 Salses-Leucate Sud 100 95 80 100 80 Salses-Leucate Nord 100 73 80 100 72,5 La Palme Nord 30 65 60 100 30 Bages-Sigean Sud 100 48 70 100 47,5 Bages-Sigean Milieu 100 35 60 100 35 Bages-Sigean Nord 80 38 60 100 37,5 Campignol 30 85 40 70 30 Gruissan 80 88 60 100 60 Vendres 40 93 40 100 40 Grand Bagnas 40 73 30 100 30 Thau Est 100 75 100 100 75 Thau Ouest 100 68 100 100 67,5 Or Est 30 95 50 100 30 Or Ouest 30 95 50 100 30 Prévost Est 40 53 60 100 40 Méjean Ouest 40 75 50 100 40 Vic 40 80 60 100 40 Pierre Blanche 30 28 60 100 30 Ponant 40 45 50 100 40 Marette Sud 40 80 30 100 30 Marette Nord 40 80 30 100 30 Scamandre 20 93 20 100 20 Crey 20 60 20 20 20 La Palissade 30 95 30 40 30 Vaccarès 40 65 50 100 40 Berre Sud 80 50 80 100 50 Berre Nord 80 65 80 100 65 Vaïne 40 65 80 100 40 Bolmon 30 60 30 100 30
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3.3.5 - L’indice MISS-TW
L’indice MISS-TW intègre d’une part les dires d’expert, et d’autre part une multitude d’autres
indices. Il s’appuie sur les typologies basées sur les domaines de salinité.
Le tableau suivant présente les valeurs seuils de référence pour l’indice MISS-TW.
Qualité écologique Valeurs seuils
Très bon MISS-TW > 0,80 Bon 0,6 < MISS-TW ≤ 0,8
Moyen 0,4 < MISS-TW ≤ 0,6 Pauvre 0,2 < MISS-TW ≤ 0,4
Mauvais MISS-TW ≤ 0,2
Le tableau suivant montre pour chaque station le domaine halin auquel elle est rattachée,
c'est-à-dire sa typologie, et la note de l’indice MISS-TW obtenue.
Pour l’ensemble des sites échantillonnés en 2009, l’indice MISS-TW est en moyenne de 0,5
avec un écart-type de 0,2, et varie de 0,1 à 0,9.
Plusieurs stations obtiennent la note maximale observée de 0,9 : Salses-Leucate Sud,
Vendres et Thau Est, qui paraissent dans un très bon état écologique au regard de cet indice
(code couleur Bleu).
Les stations de Scamandre et de Crey partagent la plus mauvaise note observée de 0,1 qui
traduit un mauvais état du milieu (code couleur Rouge).
Il est à noter que beaucoup de stations se situent en limite de classe : neuf stations ont un
MISS-TW de 0,6 et sont en limite de classe entre les états écologiques moyens et bons. On
y retrouve les stations de Salses-Leucate Nord, Bages-Sigean Milieu, Bages-Sigean Nord,
Thau Ouest, Prévost Est, Pierre Blanche, Berre Nord et Sud et Vaine. Quatre stations
présentent un indice de 0,4 et sont en limite entre les états écologiques pauvres à moyens.
Ces stations sont Canet Sud, Campignol, Méjean Ouest et Vacarrès.
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Tableau 42 : Résultats de l’indice MISS-TW en fonction de la typologie des stations.
Station Habitat MISS-TW
Canet Sud Polyhalin 0,4 Salses-Leucate Sud Euryhalin 0,9 Salses-Leucate Nord Euryhalin 0,6 La Palme Nord Euryhalin 0,3 Bages-Sigean Sud Euryhalin 0,7 Bages-Sigean Milieu Euryhalin 0,6 Bages-Sigean Nord Polyhalin 0,6 Campignol Mésohalin 0,4 Gruissan Euryhalin 0,7 Vendres Mésohalin 0,9 Grand Bagnas Mésohalin 0,7 Thau Est Euryhalin 0,9 Thau Ouest Euryhalin 0,6 Or Est Polyhalin 0,3 Or Ouest Polyhalin 0,3 Prévost Est Euryhalin 0,6 Méjean Ouest Polyhalin 0,4 Vic Euryhalin 0,7 Pierre Blanche Euryhalin 0,6 Ponant Polyhalin 0,7 Marette Sud Mésohalin 0,3 Marette Nord Mésohalin 0,3 Scamandre Oligohalin 0,1 Crey Oligohalin 0,1 La Palissade Oligohalin 0,3 Vaccarès Mésohalin 0,4 Berre Sud Polyhalin 0,6 Berre Nord Polyhalin 0,6 Vaïne Polyhalin 0,6 Bolmon Mésohalin 0,3
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3.3.6 - Espèces dominantes
Dans le tableau suivant figurent les espèces qui dominent. Une espèce est considérée
comme légèrement dominante quand son effectif est de 25 à 50 % de la densité totale (code
couleur Jaune), comme dominante quand elle occupe entre 50 et 75 % de la densité totale
(code couleur Orange) et comme très dominante quand son effectif dépasse 75 % du total
(code couleur Rouge).
Parmi ces espèces qui dominent le peuplement au niveau de l’ensemble des stations
certaines indiquent un enrichissement en matière organique du sédiment, comme Paranais
sp. ou Heteromastus filiformis. En raison de la dominance de ces espèces, les stations de
Salses-Leucate Nord, Bages-Sigean Sud, Thau Est, Marette Sud et plus particulièrement de
Or Est, Vic et Scamandre doivent être suivies.
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Tableau 43 : Occurrences des espèces dominantes pas station.
Station P
aran
ais
sp.
Het
erom
astu
s fil
iform
is
Hed
iste
div
ersi
colo
r
Stre
blos
pio
shru
bsol
ii
Lysi
anas
sa lo
ngic
orni
s
Cym
odoc
e tru
ncat
a Le
kane
spha
era
rugi
caud
a E
spèc
e in
déte
rmin
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d’os
traco
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Chi
rono
mus
sal
inar
ius
Mya
are
naria
Mus
culis
ta s
ehos
ia
Myt
ilast
er s
olid
us
Scr
obic
ular
ia c
otta
rdi
Per
ingi
a ul
vae
Pho
roni
s cf
. ps
amm
ophy
la
Canet 1 3 51 13 2 7 Salses-Leucate Sud 10 3 3 0 1 48Salses-Leucate Nord 38 4 1 0 3 La Palme Nord 1 6 66 Bages-Sigean Sud 28 11 0 0 32 1 Bages-Sigean Milieu 1 70 2 0 Bages-Sigean Nord 2 0 0 68 0 1 Campignol 45 2 27 5 Gruissan 3 18 3 10 Vendres 0 38 16 17 22 0 4 Grand Bagnas 0 17 5 14 50 2 Thau Est 30 0 5 Thau Ouest 5 0 8 2 Or Est 57 18 1 4 1 Or Ouest 2 4 1 18 48 Prévost Est 0 4 1 1 4 82 Méjean Ouest 4 3 1 3 35 23 11 Vic 3 72 1 0 0 21 1 Pierre Blanche 5 23 30 5 36 Ponant 5 1 0 0 2 66 22Marette Sud 38 17 20 5 Marette Nord 2 21 61 1 Scamandre 67 1 32 Crey 69 31 La Palissade 14 20 13 11 Vaccarès 0 22 2 1 0 39 0 28 Berre Sud 0 3 52 3 0 2 2 Berre Nord 6 2 0 46 7 3 Vaïne 4 1 1 46 1 1 Bolmon 72 20 2
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3.3.7 - Espèces indicatrices de conditions particulières
Dans le tableau suivant figure pour chaque station échantillonnée, les proportions d’espèces
bioindicatrices de perturbation du milieu, calculées par rapport à l’abondance totale.
L’abondance d’espèces bioindicatrices est significative à partir de 5 % environ (code couleur
Orange).
Les espèces plus particulièrement suivies ici sont :
- Les oligochètes dont Paranais sp. ;
- Parvivardium exiguum ;
- Malacoceros fuliginosus ;
- Cirriformia tentaculata ;
- Capitella capitata ;
- Corbula gibba ;
- Heteromastus filiformis.
On remarque la présence significative d’espèces bioindicatrices de perturbations montrant
que le sédiment est enrichi en matière organique au niveau des stations de Vaccarès,
Ponant, Pierre Blanche, Vic, Thau Est et Ouest, Gruissan et Bages-Sigean Sud. Au niveau
de ces stations, c’est principalement l’abondance de l’annélide polychète Heteromastus
filiformis qui indique l’enrichissement du sédiment en matière organique. Plus
marginalement, on remarque la présence du bivalve Corbula gibba ou du cnidaire
Cerianthus membranaceus au niveau de Thau Est.
Il est à noter également l’abondance significative d’espèces indicatrices d’un sédiment très
enrichi en matières organiques au niveau des stations de Prévost et de Gruissan,
principalement représentées par les annélides polychètes Capitella capitata et Cirriformia
tentaculata.
Au niveau des stations de Campignol, Scamandre, Crey, La Palissade et Bolmon, aucune
espèce indicatrice d’enrichissement du sédiment n’est relevée.
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Tableau 44 : Occurrences des espèces indicatrices d’enrichissement du sédiment en matière organique par station, en % de la densité totale.
Station Occurrence des
espèces bioindicatrices (%)
Canet 4,46 Salses-Leucate Sud 14,45 Salses-Leucate Nord 44,72 La Palme Nord 0,73 Bages-Sigean Sud 39,73 Bages-Sigean Milieu 2,03 Bages-Sigean Nord 1,57 Campignol Gruissan 31,20 Vendres 0,19 Grand Bagnas 0,46 Thau Est 36,87 Thau Ouest 8,21 Or Est 57,17 Or Ouest 1,67 Prévost Est 9,71 Méjean Ouest 4,15 Vic 74,82 Pierre Blanche 28,47 Ponant 5,49 Marette Sud 38,14 Marette Nord 2,01 Scamandre 66,92 Crey La Palissade Vaccarès 22,83 Berre Sud 3,39 Berre Nord 7,88 Vaïne 5,71 Bolmon
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3.3.8 - Les grands types de biocénoses
Les espèces benthiques sont en général adaptées à des gammes de hauteur d’eau et à des
types de sédiment spécifiques. Ainsi, les espèces présentes dans chacune des 30 stations
échantillonnées, permettent de définir le degré d’affinité de chaque peuplement avec les
diverses biocénoses décrites dans la littérature scientifique. La proportion d’espèces
représentant un type de biocénose est calculée par rapport à l’ensemble des espèces
rencontrées inféodées aux différentes biocénoses.
Pour l’ensemble des secteurs échantillonnés, 6 biocénoses types sont observées :
- la biocénose des fonds détritiques envasés (DE) ;
- la biocénose des fonds détritiques du large (DL) ;
- la biocénose des fonds lagunaires euryhalins eurythermes (LEE) ;
- la biocénose des sables fins bien calibrés (SFBC) ;
- la biocénose des sables fins de haut niveau (SFHN) ;
- la biocénose des sables vaseux de mode calme (SVMC).
Les résultats obtenus sont synthétisés dans le tableau suivant. En jaune, on retrouve les
biocénoses représentées de 20 à 50 %, en orange les biocénoses représentées à plus de
50% et en rouge celles qui sont exclusivement représentée (à 100 %).
Sur l’ensemble des secteurs, on retrouve de manière significative les espèces inféodées aux
biocénoses des fonds de type sables vaseux de mode calme (SVMC). Ces résultats sont en
accord d’une part avec les types de sédiments observés (assez vaseux voir constitués de
vases pures) et d’autre part avec le faible hydrodynamisme généralement rencontré en
milieu lagunaire.
La biocénose des fonds lagunaires euryhalins eurythermes (LEE) est également bien
représentée sur l’ensemble des stations.
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Tableau 45 : Les grands types de biocénoses représentées par station.
Lagune Types de Biocénoses (%)
DE DL LEE SFBC SFHN SVMC
Canet 83,3 16,7 Salses-Leucate Sud 10,4 9,4 5,2 18,8 56,3 Salses-Leucate Nord 4,1 55,4 15,8 4,8 19,9 La Palme Nord 40,2 59,8 Bages-Sigean Sud 4,0 2,6 29,3 64,1 Bages-Sigean Milieu 2,1 45,7 52,1 Bages-Sigean Nord 100 Campignol Gruissan 24,2 75,8 Vendres 100 Grand Bagnas 100 Thau Est 0,4 19,7 79,9 Thau Ouest 3,6 96,4 Or Est 100 Or Ouest 100 Prévost Est 35,1 64,9 Méjean Ouest 100 Vic 63,1 36,9 Pierre Blanche 3,8 96,2 Ponant 3,1 96,9 Marette Sud 99,4 0,6 Marette Nord 99,0 1,0 Scamandre Crey La Palissade Vaccarès 21,4 78,6 Berre Sud 5,5 1,4 93,2 Berre Nord 64,9 35,1 Vaïne 100 Bolmon
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3.3.9 - Bilan qualité des peuplements par station
Une analyse synthétique de la qualité des peuplements prenant en compte les
caractéristiques sédimentaires par station est présentée sous forme de fiches en annexe. En
voici un exemple :
Figure 8 : Exemple de fiche synthétique sur les caractéristiques sédimentaires et la qualité des peuplements d’une station.
Etang de Canet SudPrésentation
Coordonées (WGS 84) : 42 39,415' N / 03 01,436' ESuperficie : 600 ha.Profondeur moyenne : 0,40 m.Communication avec la mer : irrégulière, grau temporaire équipé d’un barrage à vannes.Alimentation en eau : irrégulière, plusieurs cours d’eau dont certains temporaires.Domaine halin : polyhalin, salinité variant de 5 à 28 ‰, moyenne annuelle de 20 ‰.Contraintes : fortes. Les conditions ne sont pas stables.Note d’expert : 3/3, lagune très probablement impactée.
Sédiment 2009
Le bilan sédimentaire montre un enrichissement faible à moyen, acceptable en milieu lagunaire.
Macrofaune benthique 2009
Dominance du polyquète Hediste diversicolor à 51,3 % du peuplement total. Présence non significative d’espèce indicatrices d’enrichissement en matière organique.
Bilan 2009En accord avec les dires d’experts (note de 3), le niveau de la qualité écologique du
peuplement de l’étang de Canet est moyen à médiocre, probablement en raison de
l’enrichissement du sédiment et des contraintes physiques importantes: la faible profondeur
(autour de 1m), la salinité très variable (entre 5 et 28 ‰) et le comblement important.
Type de sédiment N P MO Redoxsurface
Redoxfond Bilan
Sédiments très envasés à dominance de vases Faible Moyen Moyen Faible Normal Bon
Note expert
Nb ind./m² g/m² S H’ AMBI M-
AMBI IT Pot. Bio. IBGL MISS-
TW
3 1330 2,32 12 2,21 3,30 0,40 42 Moyen 40 0,4
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4 - DISCUSSION ET ANALYSE CRITIQUE DES INDICES
4.1 - Tableau récapitulatif des résultats
Afin d’évaluer l’état écologique de la macrofaune benthique des lagunes du bassin
méditerranéen, plusieurs indices ont été calculés :
- S, la richesse spécifique,
- H’, l’indice de diversité de Shannon,
- l’AMBI, le M-AMBI,
- l’indice trophique,
- la potentialité biologique et l’IBGL,
- le MISS-TW.
Le tableau suivant reprend de manière synthétique les résultats de chaque indice sur la base
de données de 2009 ainsi que le code couleur de qualité correspondant.
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Tableau 46 : Synthèse des indices et code couleur de qualité
Station Note expert S H' AMBI M-
AMBI IT Pot. Bio. IBGL MISS-TW
Canet Sud 3 12 2,21 3,30 0,40 42 Moyen 40 0,4 Salses-Leucate Sud 1 40 3,40 2,17 0,72 77 Normal 80 0,9 Salses-Leucate Nord 1 49 3,52 3,62 0,69 49 Normal 72,5 0,6 La Palme Nord 1 7 1,53 2,56 0,37 99 Moyen 30 0,3 Bages-Sigean Sud 1,5 45 3,21 3,66 0,64 59 Normal 47,5 0,7 Bages-Sigean Milieu 1,5 46 2,19 0,55 0,76 91 Normal 35 0,6 Bages-Sigean Nord 2,5 26 1,62 1,15 0,57 88 Moyen 37,5 0,6 Campignol 3 9 2,28 2,71 0,43 43 Elevé 30 0,4 Gruissan 2 24 3,73 3,43 0,57 59 Normal 60 0,7 Vendres 3 12 2,28 2,49 0,46 37 Peu élevé 40 0,9 Grand Bagnas 2 12 2,25 2,85 0,43 66 Peu élevé 30 0,7 Thau Est 1 39 3,46 2,36 0,70 81 Normal 75 0,9 Thau Ouest 1 33 4,22 1,38 0,79 70 Normal 67,5 0,6 Or Est 3 10 1,88 4,68 0,28 14 Moyen 30 0,3 Or Ouest 3 10 2,17 2,99 0,41 84 Moyen 30 0,3 Prévost Est 2,75 12 1,13 3,19 0,33 91 Peu élevé 40 0,6 Méjean Ouest 3 12 2,63 3,01 0,45 81 Moyen 40 0,4 Vic 2,5 13 1,27 4,15 0,28 71 Elevé 40 0,7 Pierre Blanche 2,5 6 2,05 3,50 0,34 66 Peu élevé 30 0,6 Ponant 2 14 1,52 2,79 0,39 74 Elevé 40 0,7 Marette Sud 2 12 2,44 4,13 0,37 26 Peu élevé 30 0,3 Marette Nord 2 12 1,77 3,02 0,39 20 Peu élevé 30 0,3 Scamandre 3 0,98 4,98 0,15 33 Moyen 20 0,1 Crey 2 0,90 0,00 0,45 56 Très élevé 20 0,1 La Palissade 8 2,95 2,33 0,49 70 Elevé 30 0,3 Vaccarès 1,5 14 2,15 2,78 0,44 86 Elevé 40 0,4 Berre Sud 2 30 2,45 3,27 0,52 87 Moyen 50 0,6 Berre Nord 2 22 2,91 2,87 0,54 78 Peu élevé 65 0,6 Vaïne 15 2,31 2,53 0,47 77 Peu élevé 40 0,6 Bolmon 7 1,21 2,98 0,32 71 Moyen 30 0,3
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4.2 - Analyse critique des indices
L’analyse critique des indices consiste, dans un premier temps, à étudier les corrélations
entre les indices fréquemment utilisés pour le benthos et, dans un deuxième temps, à
comparer les résultats des indices avec la qualité des lagunes habituellement observées.
4.2.1 - Cohérence entre les indices
Le calcul du coefficient de corrélation non paramétrique de Spearman a pour but d’analyser
la relation entre les indices, de manière à observer la cohérence des résultats des indices.
Une attention particulière est portée à la corrélation des indices avec la note d’expert.
La note d’expert
L’avis d’expert est une note moyenne, donnée par des experts de la macrofaune benthique
méditerranéenne, comprise entre 1 et 3 ; 1 correspondant à un bon état écologique.
Cette note d’expert est extraite du document de B. Gouillieux et al. en cours de finalisation
(Proposition d’un indicateur benthique pour la qualification des mases d’eau de transition
pour la Directive Cadre sur l’Eau, deuxième volet : Lagunes Méditerranéennes). Elle
correspond plus précisément à la moyenne des notes d’expert obtenues sur les différentes
années renseignées (entre 1998 et 2009) de la station concernée.
L’Etat Ecologique Potentiel
Afin d’estimer, à partir de l’avis d’expert, les secteurs pouvant être considérés comme pas ou
peu impactés et potentiellement impactés, un indicateur de l’Etat Ecologique Potentiel (EPP)
est calculé (B. Gouillieux et al.). Pour cela, les informations disponibles à partir des bilans sur
l’eutrophisation des lagunes édités par l’IFREMER et du rapport CEMAGREF (Appui
scientifique et méthodologique à la mise en œuvre de la Directive Cadre dur l’Eau dans les
eaux de transition) sont compilées et évaluées pour calculer l’EPP. La formule de calcul de
l’EPP est adaptée en fonction de la disponibilité de ces sources.
L’EPP est compris entre 1 et 3, et considère ainsi les stations ou les secteurs de la façon
suivante :
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- 1 ≤ EPP < 2 : station de référence ;
- 2 ≤ EPP < 3 : station potentiellement impactée ;
- EPP = 3 : station très probablement impactée.
Les notes d’expert et les EPP ont ainsi été calculées pour un ensemble de stations, sur
différentes années. L’année 2009 n’étant pas disponible, les notes finales d’experts et d’EPP
qui sont utilisées pour ce travail correspondent à la moyenne des notes obtenues par station,
sur l’ensemble des années disponibles. D’autres secteurs en revanche ne sont pas
renseignés.
Le tableau suivant renvoie les résultats de la matrice de corrélations de Spearman sur les
indices utilisés.
Sur la matrice des corrélations, les indices sont classés par ordre de complexité globale de
leur mode calcul : de la richesse spécifique S l’indice le plus simple à calculer à l’indice
MISS-TW le plus complexe.
Tableau 47 : Analyse des indices : matrice des corrélations de Spearman.
Potentialité Biologique Shannon IBGL IT AMBI M-AMBI MISS-TW Note
expert EPP
Richesse 0,623 0,620 0,843 0,298 -0,145 0,761 0,687 -0,645 -0,607
Potentialité Biologique 0,609 0,542 -0,012 0,016 0,544 0,520 -0,546 -0,515
Shannon 0,679 -0,045 -0,095 0,750 0,450 -0,394 -0,376
IBGL 0,297 -0,074 0,658 0,738 -0,480 -0,406
IT -0,429 0,273 0,220 -0,259 -0,261
AMBI -0,558 -0,136 0,298 0,199
M-AMBI 0,501 -0,561 -0,545
MISS-TW -0,284 -0,239
Note expert 0,854
En jaune, les valeurs significatives (hors diagonale) au seuil alpha=0,050 (test bilatéral)
Compléxitécroissan
tedu
mod
e de
calcul
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Seuls l’indice trophique, l’AMBI et le MISS-TW ne sont pas corrélés à la note d’expert.
Globalement, tous les indices sont corrélés entre eux, exceptés avec l’indice trophique et
l’AMBI.
Ci-après, chaque indice est repris, indiquant ses limites, ses avantages et inconvénients.
4.2.2 - Avantages et Inconvénients des indices
4.2.2.1 - La richesse
La richesse spécifique est le paramètre le mieux corrélé aux autres indices et surtout à la
note d’expert. L’avantage de ce paramètre est qu’il est le plus simple à calculer, et qu’il ne
nécessite qu’un seul type de données. Cet indicateur est certes restrictif, mais il permet
d’appréhender assez bien dans un premier temps la qualité du peuplement.
4.2.2.2 - L’indice de diversité de Shannon
L’indice de diversité de Shannon dépend de la richesse spécifique et de l’abondance des
espèces. Il est plutôt sensible aux espèces rares. Il reste facile à calculer et ne nécessite que
les données d’abondance ou de densité.
Cet indice, très couramment utilisé est faiblement corrélé à l’avis d’expert. Cependant, il
reste très bien corrélé aux autres indices comme au M-AMBI, à l’IBGL ou au MISS-TW.
4.2.2.3 - L’AMBI
L’AMBI rend compte des pollutions organiques (apports excessifs) en étant basé sur la
polluosensibilité des espèces.
Cet indice n’est pas corrélé à la note d’experts. Il est effectivement corrélé au M-AMBI qui
s’appuie sur l’AMBI. Il est corrélé à l’indice trophique qui fonctionne également sur la base de
groupes sensibles à l’enrichissement en matière organique.
Les avantages que présente l’AMBI :
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L’AMBI est facile à calculer à partir d’un logiciel libre d’accès disponible sur le site
de l’AZTI Marine.
Les inconvénients de l’AMBI :
L’AMBI rend compte de la pollution organique du milieu. Cet indice est développé
pour le milieu marin, où les apports organiques sont assez faibles. Mais comme en
lagunes ces apports sont presque toujours importants, l’AMBI est peu adapté au milieu lagunaire.
Toutes les espèces d’un même taxon n’ont pas la même polluosensibilité. La
liste d’espèces intègre les noms de genres, mais également les taxons supérieurs,
tels que les familles ou les ordres. Donc à défaut de trouver une espèce dans la liste,
on peut assigner le taxon supérieur. Or, toutes les espèces d’un même genre ne
possèdent pas la même polluosensibilité, ce qui est d’autant plus vrai au sein d’une
famille ou d’un ordre.
L’AMBI est basé sur une liste unique d’espèces, principalement d’origines
marines. En omettant des espèces d’eaux saumâtres voir d’eaux douces, une lagune
peu présenter un nombre d’espèces non assignées relativement important, et se voir
attribuée une note qui ne correspond pas réellement à son statut. Cet indicateur
développé pour le milieu marin n’est donc pas très adapté au milieu lagunaire.
L’AMBI est un outil en constante évolution et il est difficile de comparer des jeux de données traités à des moments différents. Dans le cadre du suivi de la
station d’épuration Maera à Montpellier, menée depuis 10 ans par CREOCEAN, des
jeux de données sont traités avec des versions différentes de l’AMBI. Les valeurs de
l’AMBI obtenues avec des versions antérieures sont comparées aux valeurs
obtenues avec la version actuelle :
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Figure 9 : Comparaison de l’AMBI suivant l’année de calcul du jeu de données.
2003
2006
2007
20092010
20102010
2010
0,0
0,2
0,4
0,6
0,8
1,0
1,2
1,4
Jeu de 2003 Jeu de 2006 Jeu de 2007 Jeu de 2009
AM
BI
Jeux de données traités
AMBI calculé avec la version de l'année AMBI calculé avec la version 2010
Cette analyse révèle que la valeur de l’AMBI varie en fonction des versions utilisées,
et que plus la version est ancienne, plus l’écart des valeurs de l’AMBI avec la version
actuelle est important :
Figure 10 : Evolution de l’écart moyen de l’AMBI en fonction des versions du logiciel par rapport à 2010.
0,00
0,05
0,10
0,15
0,20
0,25
0,30
0,35
0,40
Version 2003 Version 2006 Version 2007 Version 2009
Ecar
t moy
en d
e l'A
MB
I à la
ver
sion
ac
tuel
le
Version du logiciel
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4.2.2.4 - Le M-AMBI
Le M-AMBI est pondéré par la richesse, l’indice de diversité de Shannon et l’AMBI. De ce
fait, il est très bien corrélé à ces indices. Il est également bien corrélé à la note d’expert et
aux autres indices, excepté l’indice trophique.
Les avantages que présente le M-AMBI :
Le M-AMBI ne nécessite qu’un type de données pour être calculé : l’abondance des
espèces.
Il est facile à calculer et consensuel, puisqu’il se calcul à partir d’un logiciel libre
d’accès, disponible sur le site de l’AZTI Marine.
Le M-AMBI est calculé à partir d’autres indices. L’intégration de plusieurs
paramètres permet d’évaluer l’état du peuplement sous ses différents aspects,
notamment par rapport à la pollution du milieu.
Les inconvénients du M-AMBI :
Le M-AMBI est basé sur l’AMBI, qui présente des inconvénients, particulièrement
en milieu lagunaire comme vue précédemment.
Le logiciel ne prend pas en compte les doublons : une espèce qui apparait
plusieurs fois dans la liste, même orthographiée de la même manière, est considérée
comme autant d’espèces que de fois où elle apparait dans la liste. C’est une
caractéristique du logiciel à prendre en compte si on ne veut pas obtenir un plus
grand nombre d’espèces que le nombre réel dans l’échantillon, surtout lorsqu’on
traite de grandes bases de données, dans lesquelles les données sont entrées en
plusieurs fois.
Le problème du jeu de données. Le M-AMBI créé une station théorique de
référence haute, basée sur les meilleures valeurs obtenues de S, H’ et d’AMBI. De
même une station théorique basse est créée avec les moins bonnes valeurs de ces
trois paramètres qu’il est possible d’obtenir. Les stations réelles sont ensuite classées
par rapport à ces deux stations théoriques. Par conséquent, d’un jeu de données à
l’autre les stations théoriques ne sont pas forcément les mêmes. De ce fait, les notes
attribuées aux stations réelles ne sont comparables que si les jeux de données sont
traités ensembles, avec les mêmes stations théoriques. Concrètement, pour
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comparer des années, le jeu de données doit-être complet, intégrant toutes les
années en même temps. La note du M-AMBI obtenue à un temps t ne sera pas la
même à t+1 si la station de référence théorique a changé. 2 jeux de données ne peuvent être comparés que s’ils ont été traités ensemble.
Le M-AMBI donne une note singulière. Le M-AMBI permet d’identifier les mauvais
états des lagunes, mais ne permet pas d’en sortir la cause ou le type de
perturbations qui s’exercent sur le milieu.
4.2.2.5 - L’indice trophique
L’indice trophique renseigne sur le degré de perturbation du peuplement face à une pollution
de type organique.
Il n’est pas corrélé à la note d’expert, ni aux autres indices, excepté à l’AMBI, qui fonctionne
également sur la base de groupes sensibles.
Les avantages de l’indice trophique :
L’indice trophique est facile à calculer.
Les inconvénients de l’indice trophique :
Cet indice à lui seul ne permet pas d’établir la qualité écologique du peuplement benthique, mais il permet de renseigner sur les causes de
perturbations, en particulier si elles sont d’origines organiques.
Bien que l’indice trophique soit adaptable à tous les milieux, contrairement à l’AMBI
qui a été développé pour le milieu marin, en milieu lagunaire où les apports organiques sont souvent élevés, l’indice trophique devient peu discriminant et donc peu pertinent.
4.2.2.6 - La potentialité biologique
La potentialité biologique prend en compte à la fois la richesse spécifique et la densité,
qu’elle soit anormalement faible ou élevée, ce qui permet d’appréhender la qualité du
peuplement sous plusieurs angles. Cet indice rend compte du niveau trophique du
peuplement et de sa dynamique.
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Cet indice est bien corrélé à l’avis d’expert. Il l’est également avec les autres indices comme
l’IBGL, l’indice de Shannon, le MISS-TW et un peu moins bien avec le M-AMBI.
Les avantages de la potentialité biologique :
La potentialité biologique est très facile à calculer puisque seules les données
brut d’abondance suffisent.
Cet indice est spécifiquement fait pour les lagunes.
Les inconvénients de la potentialité biologique :
Le calcul de cet indice a montré que certains cas ne sont pas prévus dans la grille de lecture de la potentialité biologique. En effet, le secteur de Bages-Sigean Milieu
a montré des valeurs de densité très fortes, potentiellement indicatrices d’importantes
perturbations, combinées à une richesse qui apparait très bonne. Cette combinaison
n’étant pas prévue dans le tableau, le niveau trophique du secteur ne peut pas être
évalué sur cette base. Alors, le code couleur le plus proche est choisi après examen
des données brutes.
4.2.2.7 - L’IBGL
L’IBGL présente les meilleures corrélations avec les autres indices, excepté l’AMBI et l’indice
trophique. Il est bien corrélé avec la note d’expert.
Les avantages de l’IBGL :
C’est un indice spécifiquement développé pour les lagunes et de par son mode
de calcul, il est utilisable pour tous les types de lagunes.
L’IBGL est simple à calculer : un simple tableur suffi.
L’IBGL est un indice qui intègre plusieurs paramètres. L’analyse renseigne sur la
qualité du peuplement, son niveau trophique et sur les conditions physico-chimiques
du milieu.
Le calcul en 4 étapes permet d’identifier très facilement le type de contraintes du
milieu et ainsi d’établir un diagnostic sur l’état écologique du secteur et sur les causes
des perturbations.
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Comme les valeurs seuils sont fixées, plusieurs jeux de données peuvent être comparés directement d’une année sur l’autre.
Les inconvénients de l’IBGL :
Le calcul de l’IBGL nécessite la mesure de plusieurs paramètres : la salinité, la
salinité pour l’eau, les données de densité pour le benthos et en particulier le
potentiel rédox pour le sédiment qui nécessite un effort accru sur le terrain.
Cet indice est déclassant : la note finale de l’IBGL correspond à la note la plus
faible obtenue parmi les quatre étapes. Cependant, un paramètre seul est rarement
pénalisant.
4.2.2.8 - Le MISS-TW
L’indice MISS-TW n’est pas corrélé avec la note d’expert. En revanche, il présente d’assez
bonnes corrélations avec les autres indices, sauf avec l’AMBI et l’Indice trophique.
Les avantages du MISS-TW :
L’indice MISS-TW a été spécifiquement crée pour les lagunes.
Il intègre un grand nombre de métriques, et prend donc en compte beaucoup de
facteurs pouvant renseigner sur les perturbations du milieu.
Les inconvénients du MISS-TW :
L’indice MISS-TW intègre une multitude de paramètres, qui nécessitent plusieurs
types de données et parfois beaucoup d’informations sur les espèces.
Certains indices sont difficiles à calculer et présentent des inconvénients déjà
évoqués pour d’autres indices : l’ES(20) nécessite l’utilisation de logiciels spécifiques
qui ne sont pas libres d’accès, le calcul du BENTIX est basé sur le principe de l’AMBI,
avec une liste unique d’espèces.
Les valeurs rares ou extrêmes sont considérées comme « mauvaises » : les paramètres qui indiquent de très bonnes valeurs sont pénalisés. La note
attribuée à un secteur correspond à la moyenne des notes obtenues pour chaque
paramètre mesuré sur le secteur. Cette note est de 1 si la métrique est dans de
l’intervalle des percentiles 5 et 95, ou de 0 si la métrique fait partie des valeurs rares,
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c'est-à-dire en dehors de l’intervalle des percentiles 5 et 95. Autrement dit, les
lagunes qui présentent des paramètres aux valeurs exceptionnellement bonnes sont
pénalisées de la même manière que les lagunes qui présente des valeurs
exceptionnellement mauvaises.
La définition des valeurs seuils par le calcul des percentiles soulève deux questions : la taille du jeu de données et de la typologie :
- Le jeu de données doit être assez important pour que les valeurs seuils,
données par les percentiles 5 et 95, soient pertinentes. Autrement, un jeu de
données trop faible ne permettra pas d’identifier les valeurs rares,
considérées comme « mauvaises ».
- Ces valeurs seuils sont différentes suivant la typologie considérée. La
typologie est basée sur les données d’abondance des espèces, et dépend là
encore directement du jeu de données. Le dendrogramme obtenu à partir des
données d’abondance par classification hiérarchique ascendante est
confronté aux conditions physoco-chimiques des secteurs afin d’en sortir une
typologie. Or, à l’heure actuelle un seul type de lagune est retenu, et pas
d’autre typologie officielle n’est encore validé.
L’indice MISS-TW est le résultat d’un processus compliqué qu’il est difficile de
reproduire. La note finale attribue bien une qualité écologique au peuplement du
secteur, mais le déclassement d’un secteur ne peut être expliqué. La cause de
perturbation reste difficile à identifier avec cet indice.
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4.2.3 - Cohérence des indices avec le dire d’expert
Pour analyser la cohérence des résultats des indices et la qualité des lagunes, la note
d’expert moyenne est considérée comme la référence.
Sur ce postulat, les écarts des indices à cette note d’expert sont calculés pour chaque
lagune et chaque indice.
Dans ce but, on attribue une note de 1 à 5 en fonction de l’état écologique donné par l’indice,
avec 1 correspondant au code couleur Bleu, c'est-à-dire au très bon état, et 5 correspondant
au code couleur Rouge du mauvais état :
Tableau 48 : Mode d’attribution des notes pour les indices en fonction des codes couleurs de qualité des états.
Etat écologique Code couleur et note de qualité
Très bon 1 Bon 2
Moyen 3 Médiocre 4 Mauvais 5
De la même manière, l’avis d’expert, compris entre 1 et 3, se voit attribuer le code couleur
suivant et la note correspondante à sa valeur :
Tableau 49 : Code couleur et notes attribuées aux intervalles des notes d’experts.
Intervalles Code couleur et note correspondante
1 1 ]1 ; 2[ 2 [2 ; 3[ 3
3 4
Le tableau suivant synthétise les notes attribuées pour chaque station à la note d’expert et à
chaque indice.
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Tableau 50 : Notation des indices de 1 à 5 en fonction des codes couleurs de qualité pour chaque lagune.
Station Note expert S Pot.
Bio. H' IBGL IT AMBI M-AMBI
MISS-TW
Canet Sud 4 4 3 3 4 4 2 4 4 Salses-Leucate Sud 1 1 1 2 2 2 2 2 1 Salses-Leucate Nord 1 1 1 2 2 4 3 2 3
La Palme Nord 1 5 3 4 4 1 2 4 4 Bages-Sigean Sud 2 1 1 2 3 3 3 2 2
Bages-Sigean Milieu 2 1 1 3 4 1 1 2 3 Bages-Sigean Nord 3 3 3 4 4 1 1 2 3
Campignol 4 5 4 3 4 4 2 3 4 Gruissan 3 3 1 2 3 3 3 2 2 Vendres 4 4 2 3 4 4 2 3 1
Grand Bagnas 3 4 2 3 4 2 2 3 2 Thau Est 1 2 1 2 2 1 2 2 1
Thau Ouest 1 2 1 1 2 2 2 2 3 Or Est 4 4 3 4 4 5 4 4 4
Or Ouest 4 4 3 3 4 1 2 3 4 Prévost Est 3 4 2 4 4 1 2 4 3
Méjean Ouest 4 4 3 3 4 2 2 3 4 Vic 3 4 4 4 4 1 3 4 2
Pierre Blanche 3 5 2 3 4 2 3 4 3 Ponant 3 4 4 4 4 2 2 4 2
Marette Sud 3 4 2 3 4 5 3 4 4 Marette Nord 3 4 2 4 4 5 2 4 4 Scamandre 5 3 5 5 4 4 5 5
Crey 5 5 5 5 3 1 3 5 La Palissade 5 4 3 4 2 2 3 4
Vaccarès 2 4 4 3 4 1 2 3 4 Berre Sud 3 2 3 3 3 1 2 3 3 Berre Nord 3 3 2 3 2 2 2 3 3
Vaïne 4 2 3 4 2 2 3 3 Bolmon 5 3 4 4 2 2 4 4
Les stations de Scamandre, Crey, La Palissade, Vaine et Bolmon ne sont pas inclues dans
l’analyse puisqu’elles ne sont pas renseignées par l’avis d’expert.
La station de La Palme est considérée dans un bon état écologique par l’avis d’expert et
constitue actuellement le site de référence. En 2009, La Palme est déclassée par l’ensemble
des indices. Ces résultats très médiocres ne sont clairement pas conformes à la qualité
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habituelle de la lagune et sont très probablement liés à des conditions particulières non
représentatives de la qualité du milieu. La station de La Palme est donc écartée de l’analyse.
L’écart à la note d’expert correspond à la différence de note obtenue par une station pour un
indice donné à la note moyenne attribuée par les experts à cette station.
L’analyse consiste ensuite à étudier ces écarts sur chaque indice, en particulier à :
calculer la somme des écarts positifs et négatifs pour chaque indice (cumul des
lagunes) ce qui permet de savoir si un indice à tendance à globalement sous-évaluer
ou au contraire à surcoter la qualité des lagunes,
calculer la fréquence des zéros (différence nulle entre les résultats de l’indice et la
note d’expert) : ce qui exprime le nombre de fois où on obtient une cohérence
« parfaite » entre l’indice et la qualité « officielle » des lagunes,
calculer la fréquence des différences élevées (≥ 2 ou ≤ -2) entre les résultats de
l’indice et la note d’expert : ce qui exprime le nombre de fois où on obtient un écart
important entre le résultat de l’indice et la qualité des lagunes.
Lorsque ces écarts sont importants, on retourne aux données brutes pour tenter de
comprendre ce qui pénalise l’indice et mieux comprendre ainsi ses défauts potentiels.
Le tableau suivant montre le code couleur associé aux écarts des indices à la note d’expert
Tableau 51 : Code couleur des écarts des notes des indices à la note moyenne d’expert.
Ecart à la note d’expert Code couleur Ecart = 0 Ecart = |1| Ecart = |2| Ecart = |3|
Le tableau suivant montre les écarts des indices à la note d’expert pour chaque station.
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Tableau 52 : Ecarts des notes attribuées aux indices à la note d’expert.
Station S Pot. Bio. H' IBGL IT AMBI M-
AMBI MISS-
TW Canet Sud 0 1 1 0 0 2 0 0 Salses-Leucate Sud 0 0 -1 -1 -1 -1 -1 0 Salses-Leucate Nord 0 0 -1 -1 -3 -2 -1 -2 La Palme Nord Bages-Sigean Sud 1 1 0 -1 -1 -1 0 0 Bages-Sigean Milieu 1 1 -1 -2 1 1 0 -1 Bages-Sigean Nord 0 0 -1 -1 2 2 1 0 Campignol -1 0 1 0 0 2 1 0 Gruissan 0 2 1 0 0 0 1 1 Vendres 0 2 1 0 0 2 1 3 Grand Bagnas -1 1 0 -1 1 1 0 1 Thau Est -1 0 -1 -1 0 -1 -1 0 Thau Ouest -1 0 0 -1 -1 -1 -1 -2 Or Est 0 1 0 0 -1 0 0 0 Or Ouest 0 1 1 0 3 2 1 0 Prévost Est -1 1 -1 -1 2 1 -1 0 Méjean Ouest 0 1 1 0 2 2 1 0 Vic -1 -1 -1 -1 2 0 -1 1 Pierre Blanche -2 1 0 -1 1 0 -1 0 Ponant -1 -1 -1 -1 1 1 -1 1 Marette Sud -1 1 0 -1 -2 0 -1 -1 Marette Nord -1 1 -1 -1 -2 1 -1 -1 Scamandre Crey La Palissade Vaccarès -2 -2 -1 -2 1 0 -1 -2 Berre Sud 1 0 0 0 2 1 0 0 Berre Nord 0 1 0 1 1 1 0 0 Vaïne Bolmon
L’analyse se fait au cas par cas sur les écarts importants de |2| à |3| avec la note d’expert.
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Canet Sud et Campignol : AMBI (+2)
- Les richesses spécifiques sont faibles : S = 12 espèces à Canet et S =
9 espèces à Campignol.
- Dans les deux stations, on retrouve la forte dominance d’Hediste diversicolor
du groupe écologique de polluosensibilité intermédiaire d’AMBI GIII. Cette
espèce est ubiquiste et se retrouve également dans les milieux dessalés et
envasés.
L’AMBI sur-évalue la polluosensibilité d’Hediste diversicolor (du groupe
polluosensible de l’AMBI GIII) ce qui entraine une surcote.
Salses-Leucate Nord : IT (-3), AMBI (-2) & MISS-TW (-2)
- La richesse spécifique est très satisfaisante pour un milieu lagunaire : S = 49
espèces.
- Abondance d’oligochètes du groupe trophique GT4 (des espèces vivants en
milieu anaérobie) et du groupe polluosensible de l’AMBI GV (d’espèces
opportunistes des sédiments réduits) de près de 2600 ind./m².
- L’indice MISS-TW pénalise par l’absence de gastropodes et par le taux élevé
d’épifaune vagile.
L’Indice Trophique et l’AMBI sont probablement dépréciés à cause de
l’abondance relative des oligochètes, qui ne témoigne pas ici d’une mauvaise
qualité de la lagune puisque le nombre d’espèces est très élevé et que l’on note
également la présence d’espèces sensibles.
Bages-Sigean Milieu : IBGL (-2)
- La richesse spécifique est très satisfaisante pour un milieu lagunaire :
S = 46 espèces.
- Prolifération du bivalve Mytilaster minimus (du groupe trophique GT1 des
suspensivores) avec 8400 ind./m².
La présence de Mytilaster minimus qui fait chutter l’IBGL est probablement liée à
la présence d’un substrat particulier et non à des perturbations du milieu. Le
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problème de prolifération de bivalves suspensivores, ou d’espèces sensibles en
milieu probablement sain est soulevé ici.
Bages-Sigean Nord : IT & AMBI (+2)
- La richesse spécifique est satisfaisante : S = 26 espèces.
- Prolifération du bivalve suspensivore Mytilaster minimus (9456 ind./m²) de
groupe trophique GT1 des suspensivores et de groupe écologique GI des
espèces les plus sensibles à l’hypertrophysation.
La prolifération de l’espèce sensible Mytilaster minimus provoque sans doute la
surcote de cette station par l’indice trophique et l’AMBI. L’abondance de
suspensivores indique que le milieu est caractérisé par une bonne circulation des
eaux et donc potentiellement sain.
Gruissan : Potentialité biologique (+2)
- La richesse spécifique est satisfaisante : S = 24 espèces.
- La densité totale est normale avec 2500 ind./m².
- Pas de prolifération d’espèces : un bon équilibre entre les abondances des
espèces est observé au sein du site.
Il n’y a pas de raisons claires qui permettent de comprendre pourquoi la
potentialité biologique est surévaluée.
Vendres : Potentialité biologique (+2), AMBI (+2) & MISS (+3)
- La richesse spécifique est faible : S = 12 espèces et la densité est normale
(5904 ind./m²).
- Relatives abondances de plusieurs espèces dont Hediste diversicolor (groupe
polluosensible intermédiaire d’AMBI GIII).
Hediste diversicolor apparait comme une espèce plutôt sensible au regard de son
groupe écologique (GIII). Or cette espèce est ubiquiste et se retrouve
probablement classée dans un groupe trop sensible, comme il déjà été évoqué au
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niveau des stations de Canet et de Campignol. Ceci peut être la raison de la
surcote par l’AMBI.
Pour l’indice MISS et la potentialité biologique, il n’y a pas d’’explications
particulières. Il se pourrait que la note d’expert de Vendres soit sous-évaluée.
Thau Ouest : MISS-TW (-2)
- La richesse spécifique est satisfaisante avec 33 espèces. - Les paramètres qui pénalisent la station de Thau Ouest au regard de l’indice
MISS-TW sont : un taux d’épifaune vagile et un taux de gastropodes au
dessus des valeurs couramment observées, et un indice de rareté (N21) très
faible, rarement observé également.
La station de Thau Ouest fait partie des stations de très bonne qualité, avec des
valeurs exceptionnelles, qui n’indiquent pas forcément de perturbations d’un point
de vue écologique, mais qui pénalisent anormalement la station de par le mode
de calcul de l’indice.
Or Ouest : IT (+3), AMBI (+2)
- La richesse spécifique est faible : S = 10 espèces. - Abondance du bivalve suspensivore Scrobicularia cottardi de groupe
écologique de polluosensibilité GIII et de groupe trophique GT1 (1600 ind./m²
soit 48 % du peuplement total).
La proportion importante du bivalve suspensivore Scrobicularia cottardi a
tendance à surclasser la station au regard de l’indice trophique et de l’AMBI.
Prévost Est, Méjean Ouest, Vic : IT (+2)
- Les richesses spécifiques sont faibles, comprises entre 6 et 12 espèces.
- Relatives abondances sur ces stations d’espèces de groupes trophiques GT1
(suspensivores) et GT2 (détritivores) : bivavles scrobiculaires (GT1),
chironomes (GT1) et Heteromastus filiformis (GT2) seulement au niveau de
Vic.
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Clairement, les populations de ces stations sont denses en espèces
suspensivores et détritivores, ce qui les surclassent au regard de l’indice
trophique et de l’AMBI, malgré une faible diversité spécifique.
Berre Sud : IT (+2)
- La richesse spécifique est très satisfaisante : S = 30 espèces.
- Forte abondance du bivalve suspensivore Musculista senhousia (GT1) : 4459
ind./m².
La surcote de Berre Sud par l’indice trophique s’explique par l’abondance de
Musculista senhousia, et met en évidence le cas particulier de prolifération de
bivalves suspensivores.
Marette Nord et Sud : IT (-2)
- La richesse spécifique est faible : S = 12 espèces.
- Abondance d’Hediste diversicolor (GT3), de l’Oligochète Paranais sp. (GT4),
et du Polychète Streblospio shrubsolii (GT4).
Le déclassement des stations de Marette Nord et Sud par l’indice trophique n’est
pas forcément injustifié, mais dénote tout de même du caractère trop sensible de
l’indice à l’abondance de quelques espèces surtout quand la richesse spécifique
globale est faible.
Vaccarès : Richesse spécifique, Potentialité Biologique, IBGL & MISS-TW (-2)
- La richesse spécifique est faible : S = 14 espèces.
- La densité totale est très élevée : plus de 16 500 ind./m².
- Abondance des bivalves scrobiculaires (GT1) à 4622 ind./m² et de Mya
arenaria (GT1) à 6444 ind./m² et d’Heteromastus filiformis (GT2) à 3693
ind./m².
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L’abondance des bivalves suspensivores évoque plutôt des conditions favorables,
même. Mais les densités atteintes sont tellement élevées qu’elles déclassent la
potentialité biologique.
4.3 - Conclusion sur les indices
4.3.1 - Bilan des écarts
A la matrice de résultats, les corrélations de Spearman de chaque indice avec la note
d’expert, ainsi que les écarts à la note d’expert comptabilisés pour chaque indice sont
récapitulés dans le tableau suivant. Les différentes « performances » des indices sont ainsi
évaluées par rapport à la qualité globale admise et reconnue des lagunes (note d’expert) :
Tableau 53 : Synthèse des performances des indices d’après les écarts à l’avis d’expert.
Ecart à la note d'expert S Pot.
Bio. H' IBGL IT AMBI M-AMBI
MISS-TW
Spearman -0,645 -0,515 -0,376 -0,406 -0,261 0,199 -0,545 -0,239
Somme Ecarts positifs 3 16 6 1 19 19 6 7
Somme Ecarts négatifs -13 -4 -10 -17 -11 -6 -11 -9
Nb Ecarts = 0 10 7 8 8 5 6 7 13
Nb Ecarts ≥ 2 ou ≤ -2 2 3 0 2 9 7 0 4
En bleu : les meilleures valeurs obtenues et les corrélations supérieures à |0,5|. En rouge : les deux moins bons résultats et les corrélations non significatives.
Ce qu’indiquent les résultats de cette analyse :
La corrélation de Spearman : La richesse spécifique, la potentialité biologique et le M-AMBI sont les trois indices les mieux
corrélés à la note d’expert (corrélation significative et > |0,5|).
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L’indice de diversité de Shannon et l’IBGL sont moins biens corrélés mais la corrélation reste
significative.
L’indice trophique, l’AMBI et le MISS-TW ne sont pas corrélés (non significatif).
La somme des écarts :
L’indice trophique et l’AMBI présentent clairement le plus grand nombre d’écarts à la note
d’expert, respectivement de 30 et 25.
La richesse spécifique et l’IBGL sous-estiment souvent la qualité des lagunes. Ces résultats
soulèvent des problèmes de seuils et sans doute de typologie. En effet, les lagunes les
moins marinisées se retrouvent pénalisés par leurs faibles richesses qui est naturellement
plus faible.
Les autres indices présentent des écarts cumulés moins importants.
Le nombre d’écarts nuls :
La richesse spécifique et l’indice MISS-TW sont les deux indices qui obtiennent le plus
d’adéquation avec la note d’expert (10 à 13 fois sur 24 égales à la note d’expert ou écarts
nuls).
L’indice trophique et l’AMBI présentent le moins d’adéquation avec la note d’expert (5 à 6
écarts nuls sur 24).
Les autres indices ont des résultats intermédiaires entre 7 et 8.
Le nombre d’écarts importants ≥ 2 ou ≤ -2 :
L’indice de Shannon et le M-AMBI sont les deux indices qui ne présentent aucun écart
important à la note d’expert.
L’indice trophique et l’AMBI présentent au contraire de nombreux écarts importants
(respectivement 9 et 6).
Les autres indices ont peu d’écarts importants (entre 2 et 4).
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4.3.2 - Bilan des indices
Le bilan suivant dresse par élimination les raisons pour lesquelles des indices ne semblent
pas adaptés, dans le cadre de la DCE, à l’étude des peuplements benthiques en milieu
lagunaire.
L’indice trophique et l’AMBI
L’AMBI et l’indice trophique ne sont pas corrélés à la note d’expert et présentent les écarts
les plus importants à la note d’expert.
Ces indices sont trop sensibles à l’abondance de certaines espèces et sont parfois
pénalisants selon le groupe des espèces dominantes. D’autre part, certaines espèces sont
probablement classées dans des groupes qui ne correspondent pas à la réalité des lagunes,
comme par exemple Hediste diversicolor qui appartient aux groupes trophiques et
écologiques plutôt intermédiaires (groupe trophique GT3 et groupe écologique GIII).
De plus, l’indice trophique et l’AMBI ne sont pas corrélés aux autres indices.
Ces deux indices peuvent être écartés. On souligne que ces résultats étaient relativement
prévisibles puisque l’indice trophique et l’AMBI sont sensibles à l’enrichissement trophique et
donc peu pertinents en lagunes, où l’enrichissement est pratiquement toujours important.
Ces indices n’ont donc pas de pouvoir discriminatoire entre les lagunes.
Les autres indices sont tous potentiellement intéressants pour la DCE Lagunes.
L’IBGL
L’IBGL est corrélé à la note d’expert mais la corrélation reste plus faible que pour d’autres
indices.
Il ne présente pas un nombre important d’écarts nuls à la note d’expert, et ne comptabilise
pas non plus beaucoup d’écarts ≥ 2 ou ≤ -2. L’IBGL donne donc des résultats cohérents.
Toutefois, le nombre important d’écarts négatifs montre bien que l’IBGL est un indice
déclassant. De plus, son mode de calcul intègre des critères physiques naturels du milieu,
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qui pénalisent les stations. Ces contraintes ne sont pas (toujours) d’ordre anthropique et ne
peuvent faire l’objet d’améliorations. L’IBGL n’est donc pas l’indice le mieux adapté à la
problématique DCE qui visent à préserver ou rétablir le bon état écologique des milieux.
La richesse spécifique
La richesse spécifique est l’indice le mieux corrélé à la note d’expert et il fait partie de ceux
qui comptabilisent le plus d’écarts nuls à la note d’expert.
Toutefois, la richesse spécifique présente deux défauts principaux :
- Cet indice est trop restrictif et il est préférable de choisir pour la DCE un indice qui
intègre à la fois un critère de diversité (la richesse répond à cet impératif) mais aussi
un critère d’abondance des espèces,
- Cet indice soulève un problème de typologie. D’un point de vue global, en sous-
estimant la qualité du milieu, il met en évidence que les sites non marinisés sont
pénalisés, et qu’il est donc nécessaire de revoir les seuils en fonction de la typologie
des lagunes.
L’indice MISS-TW
Le MISS-TW n’est pas corrélé à la note d’expert.
Bien qu’il obtienne le nombre le plus important d’écarts nuls, il présente un nombre
relativement important de grands écarts (≥ 2 ou ≤ -2). L’indice MISS-TW n’est pas le mieux
adapté.
Dans un deuxième temps, on peut donc écarter de la sélection l’IBGL, la richesse spécifique et le MISS-TW. Il reste donc l’indice de Shannon, la potentialité biologique et le M-AMBI qui peuvent satisfaire les objectifs de la DCE.
L’indice de diversité de Shannon
L’indice de Shannon a l’avantage :
- de donner des résultats toujours très proches de la note d’expert (aucun écart
important) même si la corrélation de l’indice reste relativement faible par rapport à
d’autres indices,
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- d’être calculé lui aussi sur la base du nombre d’espèces et de l’abondance relative de
chaque espèce.
Son seul défaut est de n’être que peu corrélé à la note d’expert.
La potentialité biologique
La potentialité biologique est bien corrélée à la note d’expert.
Elle présente l’avantage de combiner à la fois la richesse spécifique et l’abondance des
espèces.
L’indice obtient le plus d’écart positifs mais c’est aussi celui qui a le moins d’écarts négatifs.
Le M-AMBI
Le M-AMBI a l’avantage :
- d’être bien corrélée à la note d’expert,
- de ne connaitre aucun écart important,
- d’être calculé à partir de la richesse spécifique et de l’indice de Shannon.
Le seul défaut réside dans son mode de calcul qui est basé en partie sur l’AMBI ; or, l’AMBI
donne des résultats particulièrement mauvais. La logique serait donc, si le choix de la DCE
se portait sur le M-AMBI, de le modifier légèrement pour en extraire la composante AMBI.
Ainsi, plusieurs possibilités peuvent être envisagées :
- choisir l’indice de Shannon, - choisir la potentialité biologique, - choisir le M-AMBI dans sa forme actuelle puisque la composante AMBI semble
avoir peu de poids sur la pertinence finale de l’indice, - choisir le M-AMBI dégagé de sa composante AMBI, ce qui reviendrait à créer un
nouvel indice basé sur la richesse spécifique S et l’indice de diversité de Shannon H’, mais qui serait probablement le plus pertinent de tous les indices actuels.
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ANNEXES
• Fiches synthétique par lagune
• Données brutes