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Weekly epidemiological recordRelevé épidémiologique hebdomadaire 27 MARCH 2020, 95th YEAR / 27 MARS 2020, 95e ANNÉENo 13, 2020, 95, 117–132http://www.who.int/wer

2020, 95, 117–132 No 13

Contents

117 Antigenic and genetic characteristics of zoonotic influenza A viruses and development of candidate vaccine viruses for pandemic preparedness

127 Performance of acute flaccid paralysis (AFP) surveillance and incidence of poliomyelitis, 2020

Sommaire117 Caractéristiques génétiques et

antigéniques des virus grippaux A zoonotiques et mise au point de virus vaccinaux candidats pour se préparer à une pandémie

127 Fonctionnement de la surveillance de la paralysie flasque aiguë (PFA) et incidence de la poliomyélite, 2020

117

Antigenic and genetic characteristics of zoonotic influenza A viruses and development of candidate vaccine viruses for pandemic preparedness

February 2020 The development of influenza candidate vaccine viruses (CVVs), coordinated by WHO, remains an essential component of the overall global strategy for pandemic preparedness.

Selection and development of CVVs are the first steps towards timely vaccine production and do not imply a recom-mendation for initiating manufacture. National authorities may consider the use of ≥1 of these CVVs for pilot lot vaccine production, clinical trials and other pandemic preparedness purposes based on their assessment of public health risk and need.

Zoonotic influenza viruses continue to be identified and evolve both genetically and antigenically, leading to the need for addi-tional CVVs for pandemic preparedness purposes. Changes in the genetic and anti-genic characteristics of these viruses rela-tive to existing CVVs and their potential risks to public health justify the need to select and develop new CVVs.

This document summarizes the genetic and antigenic characteristics of recent zoonotic influenza viruses and related viruses circulating in animals1 that are relevant to CVV updates. Institutions interested in receiving these CVVs should

Caractéristiques génétiques et antigéniques des virus grippaux A zoonotiques et mise au point de virus vaccinaux candidats pour se préparer à une pandémie

Février 2020 La mise au point de virus grippaux vaccinaux candidats, sous la coordination de l’OMS, demeure une composante essentielle de la stratégie mondiale globale de préparation aux pandémies.

La sélection et la mise au point de virus vacci-naux candidats représentent les premières étapes vers la production en temps utile des vaccins, mais n’impliquent pas qu’il soit recommandé d’en démarrer la fabrication. Les autorités nationales peuvent envisager d’utili-ser un ou plusieurs de ces virus vaccinaux candidats pour la production de lots pilotes de vaccins, la réalisation d’essais cliniques et d’autres activités de préparation aux pandé-mies, selon leur évaluation des risques et des besoins en matière de santé publique.

Des virus grippaux zoonotiques continuent d’être identifiés, présentant une évolution à la fois génétique et antigénique, d’où la nécessité de mettre au point des virus vaccinaux candi-dats supplémentaires pour se préparer à une éventuelle pandémie. L’évolution des caracté-ristiques génétiques et antigéniques de ces virus par rapport aux virus vaccinaux candi-dats existants et les risques potentiels qui en résultent pour la santé publique justifient que l’on sélectionne et que l’on mette au point de nouveaux virus vaccinaux candidats.

Le présent document fournit un récapitulatif des caractéristiques génétiques et antigé-niques des virus grippaux zoonotiques récem-ment isolés, ainsi que des virus apparentés qui circulent chez les animaux1 et qui présentent un intérêt pour l’actualisation des virus vacci-

1 For information relevant to other notifiable influenza virus infections in animals refer to http://www.oie.int/wahis_2/pu-blic/wahid.php/Wahidhome/Home

1 Pour toute information relative aux autres infections grippales à noti-fier chez l’animal, consulter: http://www.oie.int/wahis_2/public/wa-hid.php/Wahidhome/Home

http://www.who.int/wer

http://www.oie.int/wahis_2/public/wahid.php/Wahidhome/Home




118 WEEKLY EPIDEMIOLOGICAL RECORD, NO 13, 27 MARCH 2020

contact WHO at [email protected] or the institu-tions listed in announcements published on the WHO website.2

Influenza A(H5) Since their emergence in 1997, highly pathogenic avian influenza (HPAI) A(H5) viruses of the A/goose/Guang-dong/1/96 haemagglutinin (HA) lineage have become enzootic in some countries, have infected wild birds and continue to cause outbreaks in domestic birds and sporadic human infections. These viruses have diversified genetically and antigenically, leading to the need for multiple CVVs. Notably, H5 viruses have been detected with the N1 gene segment replaced by N2, N3, N5, N6, N8 or N9 gene segments. This summary provides updates on the characterization of A/goose/Guangdong/1/96-lineage A(H5) viruses and the current status of the development of influenza A(H5) CVVs.

Influenza A(H5) activity from 24 September 2019 to 24 February 2020No human infections with A/goose/Guangdong/1/96-lineage viruses have been reported in this period. Since 2003, there have been 24 A(H5N6) and 861 A(H5N1) human infections confirmed. A/goose/Guangdong/1/96-lineage A(H5) viruses were detected in domestic and wild birds in several countries from 24 September 2019 to 24 February 2020 (Table 1).

Antigenic and genetic characteristics of influenza A(H5) virusesThe nomenclature for phylogenetic relationships among the HA genes of A/goose/Guangdong/1/96-lineage A(H5) viruses is defined in consultation with representatives of WHO, the Food and Agriculture Organization of the United Nations (FAO), the World Organisation for Animal Health (OIE) and academic institutions.3

A(H5) viruses circulating and characterized from 24 September 2019 to 24 February 2020 belong to the following clades:

Clade 2.3.2.1a viruses were detected in domestic birds in Bangladesh and India. The majority of viruses tested from Bangladesh reacted well with a post-infection ferret antiserum raised against A/duck/Bangladesh/ 17D1012/2018, for which a CVV is in development.

Clade 2.3.2.1c viruses were detected in domestic birds in Viet Nam. Most viruses reacted well with post-infec-tion ferret antisera raised against A/duck/Vietnam/NCVD-1584/2012 and its corresponding CVV.

naux candidats. Les institutions souhaitant recevoir ces virus vaccinaux candidats devront prendre contact avec l’OMS, à l’adresse [email protected], ou avec les institutions dont les noms figurent dans les communiqués publiés sur le site Web de l’OMS.2

Grippe A(H5) Depuis leur émergence en 1997, des virus de la grippe aviaire A(H5) hautement pathogènes contenant le gène de l’hémagglu-tinine (HA) de la lignée A/goose/Guangdong/1/96 sont devenus enzootiques dans certains pays, ont infecté des oiseaux sauvages et continuent de provoquer des flambées chez les oiseaux domestiques, ainsi que des infections sporadiques chez l’homme. Ces virus se sont diversifiés sur le plan génétique et antigé-nique, ce qui impose de mettre au point plusieurs virus vacci-naux candidats. En particulier, des virus H5 ont été détectés porteurs d’une substitution génétique du segment N1 par des segments N2, N3, N5, N6, N8 ou N9. Le présent résumé fait le point sur la caractérisation des virus A(H5) de la lignée A/goose/Guangdong/1/96 et sur l’état d’avancement de la mise au point de virus candidats devant entrer dans la composition d’un vaccin contre la grippe A(H5).

Activité de la grippe A(H5) du 24 septembre 2019 au 24 février 2020Aucune infection humaine par des virus de la lignée A/goose/Guangdong/1/96 n’a été notifiée durant cette période. Depuis 2003, on a recensé 24 infections humaines confirmées par des virus A(H5N6) et 861 par des virus A(H5N1). Des virus A(H5) de la lignée A/goose/Guangdong/1/96 ont été détectés chez des oiseaux domestiques et sauvages dans plusieurs pays entre le 24 septembre 2019 et le 24 février 2020 (Tableau 1).

Caractéristiques antigéniques et génétiques des virus grippaux A(H5)La nomenclature des liens de parenté phylogénétiques existant entre les gènes HA des virus A(H5) de la lignée A/goose/Guangdong/1/96 est définie en consultation avec des représen-tants de l’OMS, de l’Organisation des Nations Unies pour l’ali-mentation et l’agriculture (FAO), de l’Organisation de la santé animale (OIE) et d’établissements universitaires.3

Les virus A(H5) circulants qui ont été caractérisés entre le 24 septembre 2019 et le 24 février 2020 appartenaient aux clades suivants:

Clade 2.3.2.1a Des virus de ce clade ont été détectés chez des oiseaux domestiques au Bangladesh et en Inde. La majorité des virus issus du Bangladesh qui ont été testés ont bien réagi avec un antisérum de furet postinfection dirigé contre la lignée A/duck/Bangladesh/17D1012/2018, à partir de laquelle un virus vaccinal candidat est mis au point.

Clade 2.3.2.1c Des virus de ce clade ont été détectés chez des oiseaux domestiques au Viet Nam. La majorité de ces virus ont bien réagi avec les antisérums de furet postinfection dirigés contre la lignée A/duck/Vietnam/NCVD-1584/2012 et ses virus vaccinaux candidats correspondants.

2 See http://www.who.int/influenza/vaccines/virus/candidates_reagents/home/en/ 3 See http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/irv.12324/epdf

2 Voir http://www.who.int/influenza/vaccines/virus/candidates_reagents/home/en/ 3 Voir http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/irv.12324/epdf

mailto:[email protected]

mailto:[email protected]

http://www.who.int/influenza/vaccines/virus/candidates_reagents/home/en/

http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/irv.12324/epdf

http://www.who.int/influenza/vaccines/virus/candidates_reagents/home/en/

http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/irv.12324/epdf

RELEVÉ ÉPIDÉMIOLOGIQUE HEBDOMADAIRE, No 13, 27 MARS 2020 119

Clade 2.3.2.1d viruses were detected in a small number of domestic birds in China in early 2019. While these viruses reacted poorly with post-infection ferret anti-serum raised to the CVV developed from A/chicken/Guiyang/1153/2016, the extent of their current circula-tion in poultry is unclear and no new CVVs are proposed at this time.

Clade 2.3.4.4b viruses were detected in wild birds in Germany, Poland and Slovakia and in domestic birds in Bulgaria, Czech Republic, Egypt, Germany, Hungary, Iran (Islamic Republic of), Nigeria, Poland, Romania, Slovakia and Ukraine with evidence for multiple sepa-rate introductions into some countries. Most recent clade 2.3.4.4b viruses reacted well with post-infection

Clade 2.3.2.1d Des virus de ce clade ont été détectés chez un petit nombre d’oiseaux domestiques en Chine au début de l’année 2019. Même si ces virus ont mal réagi avec l’antisérum de furet postinfection dirigé contre le virus vaccinal candidat mis au point à partir de A/chicken/Guiyang/1153/2016, on ne sait pas très bien dans quelle mesure ils circulent actuellement chez les volailles, et aucun nouveau virus vaccinal candidat n’est proposé pour le moment.

Clade 2.3.4.4b Des virus de ce clade ont été détectés chez des oiseaux sauvages en Allemagne, en Pologne et en Slovaquie et chez des oiseaux domestiques en Allemagne, en Bulgarie, en Égypte, en Hongrie, au Nigéria, en Pologne, en République isla-mique d’Iran, en République tchèque, en Roumanie, en Slovaquie et en Ukraine, avec des signes d’introductions multiples et distinctes dans certains pays. Les virus du clade 2.3.4.4b les plus

Table 1 Recent A(H5) activity reported to international agencies Tableau 1 Activité récente de la grippe A(H5) signalée aux agences internationales

Country, area or territory – Pays, zone ou territoire Host – HôteGenetic cladea (subtype) – Clade

génétique (sous-type)a

Bangladesh Poultry – Volaille 2.3.2.1a (H5N1)

Bulgaria – Bulgarie Poultry – Volaille 2.3.4.4 (H5N8)

China – Chine Poultry – VolailleWild birds – Oiseaux sauvages

2.3.2.1d (H5N1); 2.3.4.4h (H5N6)2.3.4.4h (H5N6)

China, Taiwan SAR – Chine, RAS de Taïwan Poultry – Volaille 2.3.4.4c (H5N2/N5);Unknown (H5N1) – Inconnu (H5N1)

Czech Republic – République tchèque Poultry – Volaille 2.3.4.4b (H5N8)

Egypt – Égypte Poultry – Volaille 2.3.4.4b (H5N8)

Germany – Allemagne Poultry – VolailleWild birds – Oiseaux sauvages

2.3.4.4b (H5N8)2.3.4.4b (H5N8)

Hungary – Hongrie Poultry – Volaille 2.3.4.4b (H5N8)

India – Inde Poultry – Volaille 2.3.2.1a (H5N1)

Indonesia – Indonésie Poultry – Volaille Unknown (H5N1) – Inconnu (H5N1)

Iran (Islamic Republic of) – Iran (République islamique d’) Poultry – Volaille 2.3.4.4b (H5N3)

Israel – Israël Wild birds – Oiseaux sauvages Unknown (H5N8) – Inconnu (H5N8)

Lao People’s Democratic Republic – République démocratique populaire lao

Poultry – Volaille 2.3.4.4h (H5N6)

Nigeria – Nigéria Poultry – Volaille 2.3.4.4b (H5N6/N8)

Poland – Pologne Poultry – VolailleWild birds – Oiseaux sauvages

2.3.4.4b (H5N8)2.3.4.4b (H5N8)

Romania– Roumanie Poultry – Volaille 2.3.4.4b (H5N8)

Saudi Arabia – Arabie saoudite Poultry – Volaille Unknown (H5N8) – Inconnu (H5N8)

Slovakia – Slovaquie Poultry – VolailleWild birds – Oiseaux sauvages

2.3.4.4b (H5N8)2.3.4.4b (H5N8)

Ukraine Poultry – Volaille 2.3.4.4b (H5N8)

Viet Nam Poultry – Volaille 2.3.2.1c (H5N1); 2.3.4.4g (H5N6); 2.3.4.4h (H5N6)

a Using proposed update to the unified nomenclature for highly pathogenic avian influenza A(H5) viruses. – Selon la mise à jour proposée de la nomenclature unifiée des virus aviaires A(H5) hautement pathogènes.


ferret antiserum raised against the CVV developed from A/Fujian-Sanyuan/21099/2017.

Clade 2.3.4.4c viruses were detected in domestic birds in Taiwan, China. Compared with the most closely related CVV, A/gyrfalcon/Washington/41088-6/2014, there were up to 15 amino acid differences in the HA. No antigenic data are available for these viruses.

Clade 2.3.4.4g viruses were detected in domestic birds in Viet Nam. These viruses were genetically similar to viruses detected in Viet Nam in recent years and reacted well with post-infection ferret antiserum raised against the CVV developed from A/Fujian-Sanyuan/21099/2017 (clade 2.3.4.4b), albeit at reduced levels.

Clade 2.3.4.4h viruses were detected in wild and domes-tic birds in China and domestic birds in the Lao People’s Democratic Republic and Viet Nam. Most of the HAs from these viruses had fewer than 10 amino acid differ-ences relative to that of A/Guangdong/18SF020/2018, the closest virus from which a CVV has been developed. The majority of viruses from China reacted well with post-infection ferret antiserum raised against this CVV.

Influenza A(H5) candidate vaccine viruses

Based on the current antigenic, genetic and epidemio-logic data, development of new A(H5) CVVs is not proposed. Availability of A(H5) CVVs is listed in Table 2.

récemment isolés ont bien réagi avec l’antisérum de furet postinfection dirigé contre le virus vaccinal candidat mis au point à partir de A/Fujian-Sanyuan/21099/2017.

Clade 2.3.4.4c Des virus de ce clade ont été détectés chez des oiseaux domestiques à Taïwan, en Chine. Ils présentaient jusqu’à 15 différences d’acides aminés au sein de l’hémagglutinine par rapport au virus vaccinal candidat le plus étroitement appa-renté, A/gyrfalcon/Washington/41088-6/2014. Aucune donnée antigénique n’est disponible pour ces virus.

Clade 2.3.4.4g Des virus de ce clade ont été détectés chez des oiseaux domestiques au Viet Nam. Ces virus étaient génétique-ment analogues à ceux détectés au Viet Nam ces dernières années et ont bien réagi avec l’antisérum de furet postinfection dirigé contre le virus vaccinal candidat mis au point à partir de A/Fujian-Sanyuan/21099/2017 (clade 2.3.4.4b), bien qu’avec une intensité réduite.

Clade 2.3.4.4h Des virus de ce clade ont été détectés chez des oiseaux sauvages et domestiques en Chine et chez des oiseaux domestiques en République démocratique populaire lao et au Viet Nam. Chez ces virus, l’hémagglutinine présentait la plupart du temps moins de 10 acides aminés de différence par rapport à celle de A/Guangdong/18SF020/2018, le virus le plus proche à partir duquel un virus vaccinal candidat a été mis au point. La majorité des virus issus de Chine ont bien réagi avec l’antisérum de furet postinfection dirigé contre ce virus vaccinal candidat.

Virus candidats destinés à la préparation d’un vaccin contre la grippe A(H5) Au vu des données antigéniques, génétiques et épidémiolo-giques actuelles, il n’est pas proposé de mettre au point de nouveaux virus vaccinaux candidats A(H5). Les virus vaccinaux candidats A(H5) disponibles sont recensés dans le Tableau 2.

Table 2 Status of influenza A(H5) candidate vaccine virus development Tableau 2 État d’avancement dans la mise au point des virus vaccinaux candidats A(H5)

Candidate vaccine viruses – Virus vaccinaux candidats Clade Institution* Available – Disponible

CDC-RG (A/Viet Nam/1203/2004) 1 CDC Yes – Oui

SJRG-161052 (A/Viet Nam/1203/2004) 1 SJCRH Yes – Oui

NIBRG-14 (A/Viet Nam/1194/2004) 1 NIBSC Yes – Oui

NIBRG-88 (A/Cambodia/R0405050/2007) 1.1 NIBSC Yes – Oui

IDCDC-RG34B (A/Cambodia/X0810301/2013) 1.1.2 CDC Yes – Oui

SJRG-166614 (A/duck/Hunan/795/2002) 2.1.1 SJCRH/HKU Yes – Oui

CDC-RG2 (A/Indonesia/5/2005) 2.1.3.2 CDC Yes – Oui

NIIDRG-9 (A/Indonesia/NIHRD11771/2011) 2.1.3.2a NIID Yes – Oui

SJRG-163222 (A/bar-headed goose/Qinghai/1A/2005) 2.2 SJCRH/HKU Yes – Oui

IBCDC-RG7 (A/chicken/India/NIV33487/2006) 2.2 CDC/NIV Yes – Oui

SJRG-163243 (A/whooper swan/Mongolia/244/2005) 2.2 SJCRH Yes – Oui

IDCDC-RG11 (A/Egypt/2321-NAMRU3/2007) 2.2.1 CDC Yes – Oui

NIBRG-23 (A/turkey/Turkey/1/2005) 2.2.1 NIBSC Yes – Oui

IDCDC-RG29 (A/Egypt/N03072/2010) 2.2.1 CDC Yes – Oui

IDCDC-RG13 (A/Egypt/3300-NAMRU3/2008) 2.2.1.1 CDC Yes – Oui


Influenza A(H7) Human infections with avian influenza A(H7N9) viruses were first reported to WHO on 31 March 2013. This summary provides updates on the characterisation of A/Anhui/1/2013 HA lineage A(H7) viruses and the current status of the development of corresponding CVVs.

Grippe A(H7) Les premiers cas d’infection humaine par des virus grippaux aviaires A(H7N9) ont été notifiés à l’OMS le 31 mars 2013. Le présent résumé fait le point sur la caractérisation des virus A(H7) contenant le gène HA de la lignée A/Anhui/1/2013 et sur l’état d’avancement de la mise au point de virus vaccinaux candidats correspondants.

Candidate vaccine viruses – Virus vaccinaux candidats Clade Institution* Available – Disponible

NIBRG-306 (A/Egypt/N04915/2014) 2.2.1.2 NIBSC Yes – Oui

SJRG-166615 (A/common magpie/Hong Kong/5052/2007) 2.3.2.1 SJCRH/HKU Yes – Oui

IDCDC-RG30 (A/Hubei/1/2010) 2.3.2.1a CDC Yes – Oui

SJ007 (A/duck/Bangladesh/19097/2013) 2.3.2.1a SJCRH Yes – Oui

SJ003 (A/barn swallow/Hong Kong/D10-1161/2010) 2.3.2.1b SJCRH/HKU Yes – Oui

NIBRG-301 (A/duck/Viet Nam/NCVD-1584/2012) 2.3.2.1c NIBSC Yes – Oui

SJ002 (A/chicken/Hong Kong/AP156/2008) 2.3.4 SJCRH/HKU Yes – Oui

IBCDC-RG6 (A/Anhui/1/2005) 2.3.4 CDC Yes – Oui

CBER-RG1 (A/duck/Laos/3295/2006) 2.3.4 FDA Yes – Oui

SJRG-164281 (A/Japanese white eye/Hong Kong/1038/2006) 2.3.4 SJCRH/HKU Yes – Oui

IDCDC-RG36 (A/chicken/Bangladesh/11rs1984-30/2011) 2.3.4.2 CDC Yes – Oui

IDCDC-RG35 (A/Guizhou/1/2013) 2.3.4.2 CDC/CCDC Yes – Oui

IDCDC-RG42A (A/Sichuan/26221/2014) (H5N6) 2.3.4.4a CDC/CCDC Yes – Oui

IDCDC-RG43A (A/gyrfalcon/Washington/41088-6/2014) (H5N8) 2.3.4.4c CDC Yes – Oui

NIID-001 (A/duck/Hyogo/1/2016) (H5N6) 2.3.4.4e NIID Yes – Oui

SJRG-165396 (A/goose/Guiyang/337/2006) 4 SJCRH/HKU Yes – Oui

IDCDC-RG12 (A/chicken/Viet Nam/NCVD-016/2008) 7.1 CDC Yes – Oui

IDCDC-RG25A (A/chicken/Viet Nam/NCVD-03/2008) 7.1 CDC Yes – Oui

Candidate vaccine viruses in preparationa – Virus vaccinaux candidats en préparationa Clade Institution Available – Disponible

A/duck/Bangladesh/17D1012/2018-like 2.3.2.1a CDC Pending – En attente

A/chicken/Guiyang/1153/2016-like 2.3.2.1d SJCRH/HKU Pending – En attente

A/chicken/Ghana/20/2015-like 2.3.2.1f CDC Pending – En attente

A/chicken/Viet Nam/NCVD-15A59/2015 (H5N6)-like 2.3.4.4f SJCRH Pending – En attente

A/Guangdong/18SF020/2018 (H5N6)-like 2.3.4.4h CCDC Pending – En attente

A/Fujian-Sanyuan/21099/2017 (H5N6)-like 2.3.4.4b CCDC Pending – En attente

A/Hubei/29578/2016b 2.3.4.4d CCDC Pending – En attente

* Institutions developing and/or distributing the candidate vaccine viruses: – Institutions distribuant les virus vaccins candidats:

CDC: Centers for Disease Control and Prevention, USA – CDC: Centers for Disease Control and Prevention, États-Unis

CCDC: Chinese Center for Disease Control and Prevention, China – CCDC: Centre chinois de contrôle et de prévention des maladies, Chine

FDA: Food and Drug Administration, USA – FDA: Food and Drug Administration, États-Unis

HKU: University of Hong Kong, Hong Kong Special Administrative Region, China – HKU: Université de Hong Kong, Hong Kong, Région administrative spéciale de la Chine

NIBSC: National Institute for Biological Standards and Control, a centre of the Medicines and Healthcare products Regulatory Agency (MHRA), United Kingdom – NIBSC: National Institute for Biological Standards and Control, un centre du Medicines and Healthcare products Regulatory Agency (MHRA), Angleterre

NIID: National Institute of Infectious Diseases, Japan – NIID: Institut national des maladies infectieuses, Japon

NIV: National Institute of Virology, India – NIV: National Institute of Virology, Inde

SJCRH: St Jude Children’s Research Hospital, USA – SJCRH: St. Jude Children’s Research Hospital, États-Unis

a Development of the A/environment/Hubei/950/2013-like CVV (clade 7.2) has been discontinued. – La mise au point du virus vaccinal candidat de type A/environment/Hubei/950/2013 a été suspendue.


Table 3 Status of influenza A(H7N9) candidate vaccine virus developmentTableau 3 État d’avancement dans la mise au point des virus vaccinaux candidats A(H7N9)

Candidate vaccine virus – Virus vaccinaux candidats Type Institution* Available – Disponible

IDCDC-RG33A (A/Anhui/1/2013) Reverse genetics – Génétique inverse CDC Yes – Oui

NIBRG-268 (A/Anhui/1/2013) Reverse genetics – Génétique inverse NIBSC Yes – Oui

NIIDRG-10.1 (A/Anhui/1/2013) Reverse genetics – Génétique inverse NIID Yes – Oui

SJ005 (A/Anhui/1/2013) Reverse genetics – Génétique inverse SJCRH Yes – Oui

NIBRG-267 (A/Shanghai/2/2013) Reverse genetics – Génétique inverse NIBSC Yes – Oui

CBER-RG4A (A/Shanghai/2/2013) Reverse genetics – Génétique inverse FDA Yes – Oui

IDCDC-RG32A (A/Shanghai/2/2013) Reverse genetics – Génétique inverse CDC Yes – Oui

IDCDC-RG32A.3 (A/Shanghai/2/2013) Reverse genetics – Génétique inverse CDC Yes – Oui

IDCDC-RG56B (A/Hong Kong/125/2017) Reverse genetics – Génétique inverse CDC Yes – Oui

IDCDC-RG56N (A/Guangdong/17SF003/2016) Reverse genetics – Génétique inverse CDC Yes – Oui

NIBRG-375 (A/Guangdong/17SF003/2016) Reverse genetics – Génétique inverse NIBSC Yes – Oui

CBER-RG7C (A/Guangdong/17SF003/2016) Reverse genetics – Génétique inverse FDA Yes – Oui

CBER-RG7D (A/Guangdong/17SF003/2016) Reverse genetics – Génétique inverse FDA Yes – Oui

Candidate vaccine virus in preparation – Virus vaccinaux candidats en préparation

Type Institution Available – Disponible

A/Guangdong/17SF003/2016-likea Reverse genetics – Génétique inverse CCDC Pending – En attente

A/Hunan/02650/2016-likea Reverse genetics – Génétique inverse CCDC Pending – En attente

A/Gansu/23277/2019-like Reverse genetics – Génétique inverse CDC Pending – En attente




FDA: Food and Drug Administration, USA – FDA: Food and Drug Administration, États-Unis


NIID: National Institute of Infectious Diseases, Japan – NIID: Institut national des maladies infectieuses, Japon


Influenza A(H7) activity from 24 September 2019 to 24 February 2020A/Anhui/1/2013-lineage A(H7N9) viruses have not been detected in this period.

Influenza A(H7) candidate vaccine viruses

Based on the current antigenic, genetic and epidemio-logic data, no new CVVs are proposed. Availability of A(H7N9) CVVs is listed in Table 3.

Activité de la grippe A(H7) du 24 septembre 2019 au 24 février 2020Aucun virus A(H7N9) de la lignée A/Anhui/1/2013 n’a été détecté durant cette période.

Virus candidats destinés à la préparation d’un vaccin contre la grippe A(H7) Au vu des données antigéniques, génétiques et épidémiolo-giques actuelles, aucun nouveau virus vaccinal candidat n’est proposé. Les virus vaccinaux candidats A(H7N9) disponibles sont recensés dans le Tableau 3.

Influenza A(H9N2)

Influenza A(H9N2) viruses are enzootic in poultry in parts of Africa, Asia and the Middle East. The majority of viruses sequenced from these regions belong to either the A/quail/Hong Kong/G1/97 (G1) or A/chicken/Beijing/1/94 (Y280/G9) lineages. Since the late 1990s, when the first human infection was identified, the detec-tion of A(H9N2) viruses from humans and swine has

Grippe A(H9N2)

Des virus grippaux A(H9N2) sont enzootiques parmi les popu-lations de volailles de certaines parties de l’Afrique, de l’Asie et du Moyen-Orient. La majorité des virus issus de ces régions qui ont été séquencés appartiennent aux lignées A/quail/Hong Kong/G1/97 (G1) ou A/chicken/Beijing/1/94 (Y280/G9). Depuis la fin des années 1990, période où le premier cas d’infection humaine a été détecté, les virus A(H9N2) n’ont que rarement


été isolés chez l’homme ou chez le porc. Pour la majorité des personnes touchées, les symptômes de la maladie associée ont été bénins et aucun signe de transmission interhumaine n’a été relevé.

Activité de la grippe A(H9N2) du 24 septembre 2019 au 24 février 2020

Cinq cas d’infection humaine par un virus A(H9N2) ont été signalés pendant cette période. Pour 2 de ces cas, l’un originaire d’Inde et l’autre du Sénégal, l’apparition de la maladie datait de la période précédente. Il s’agissait des premiers cas d’infec-tion humaine par un virus A(H9N2) signalés dans ces pays. Les 3 nouveaux autres cas d’infection humaine ont été signalés par la Chine (2) et par la Région administrative spéciale de Hong Kong de Chine (1), et les virus en cause appartenaient à la lignée Y280/G9. Toutes les personnes touchées se sont rétablies. Les virus de la lignée Y280/G9 restent prédominants dans les échan-tillons environnementaux et les populations de volailles en Chine et au Viet Nam. Des virus de la lignée G1 ont été détec-tés chez la volaille dans un certain nombre de pays d’Afrique et d’Asie.

Caractéristiques antigéniques et génétiques des virus grippaux A(H9N2)

Toutes les infections à virus A(H9N2) récemment détectées chez l’homme et parmi la volaille en Chine, ainsi que toutes les infec-tions parmi la volaille au Viet Nam, ont été causées par des virus de la lignée Y280/G9. Des virus représentatifs de ces virus récents ont bien réagi avec l’antisérum de furet postinfection dirigé contre la souche A/Anhui-Lujiang/39/2018, actuellement utilisée pour la mise au point d’un virus vaccinal candidat. Un sous-ensemble des virus détectés au Viet Nam n’a pas été bien inhibé par cet antisérum de furet postinfection, mais a bien réagi avec un antisérum de furet dirigé contre le virus vaccinal candidat A/chicken/Hong Kong/G9/97.

Les séquences de l’hémagglutinine obtenues à partir des cas d’infection humaine détectés en Inde et au Sénégal étaient apparentées à celles des virus aviaires de la lignée G1 et du virus précédemment caractérisé (A/Oman/2747/2019) issu d’un cas d’infection humaine à Oman (Figure 1). Les virus responsables de ces cas récents n’ont pas été isolés, mais des virus aviaires génétiquement apparentés provenant du Ghana, du Niger et du Nigéria ont été caractérisés sur le plan antigé-nique et ont mal réagi avec des antisérums de furet post-infection dirigés contre les virus vaccinaux candidats actuels de la lignée G1 (Tableau 4). Les virus aviaires de la lignée G1 détectés au Bangladesh étaient similaires sur le plan antigé-nique et/ou génétique à ceux détectés au cours des périodes précédentes et aux virus vaccinaux candidats disponibles de la lignée G1.

Virus candidats destinés à la préparation d’un vaccin contre la grippe A(H9N2)

Au vu des données antigéniques, génétiques et épidémiolo-giques actuelles, un virus vaccinal candidat A(H9N2) de type A/Oman/2747/2019 est proposé. Les virus vaccinaux candidats A(H9N2) disponibles et en attente sont recensés dans le Tableau 5.

been reported infrequently. In most human cases, the associated illness has been mild and there has been no evidence of human-to-human transmission.

Influenza A(H9N2) activity from 24 September 2019 to 24 February 2020

Five human cases of A(H9N2) virus infections were reported in this period. Two cases, 1 each from India and Senegal, had illness onset dates from the previous reporting period. These were the first reports of human infections with A(H9N2) viruses from these countries. The 3 other new cases were reported by China (2) and Hong Kong, Special Administrative Region, China (1) and were from the Y280/G9 lineage. All cases recovered. The Y280/G9 lineage viruses continue to predominate in environmental and poultry samples in China and Viet Nam. G1 lineage viruses were detected in poultry in a number of countries in Africa and Asia.

Antigenic and genetic characteristics of influenza A(H9N2) viruses

All recent A(H9N2) human and poultry infections in China and all poultry infections in Viet Nam, were caused by viruses of the Y280/G9 lineage. Representa-tives of these recent viruses reacted well with post-infection ferret antiserum raised against A/Anhui-Luji-ang/39/2018, from which a CVV is being developed. A subset of viruses detected in Viet Nam were not well inhibited by this post-infection ferret antiserum, but reacted well with a ferret antiserum raised against the A/chicken/Hong Kong/G9/97 CVV.

HA sequence data obtained from the human cases detected in India and Senegal were related to those of G1 lineage poultry viruses and the previously character-ized virus (A/Oman/2747/2019) from a human case in Oman (Figure 1). Viruses were not recovered from these recent cases but genetically related poultry viruses from Ghana, Niger and Nigeria were antigenically character-ized and reacted poorly with post-infection ferret anti-sera raised against the current G1 lineage CVVs (Table 4). Poultry viruses of the G1 lineage detected in Bangladesh were antigenically and/or genetically simi-lar to those detected in previous periods and to avail-able G1lineage CVVs.

Influenza A(H9N2) candidate vaccine viruses

Based on the available antigenic, genetic and epidemio-logic data, an A/Oman/2747/2019-like A(H9N2) CVV is proposed. The available and pending A(H9N2) CVVs are listed in Table 5.


Figure 1 Phylogenetic relationships of A(H9N2) G1 haemagglutinin genesFigure 1 Classification phylogénétique des gènes de l’hémagglutinine des virus grippaux A(H7N9) G1

The candidate vaccine viruses available or in preparation appear in red. The proposed vaccine candidate is indicated by (•). Human viruses are in bold font. The viruses tested in haemagglutination inhibition assay are indicated by hashes (#). The scale bar represents the number of substitutions per site. Bootstrap supports of topology are shown above selected nodes. – Les virus vaccinaux candidats disponibles ou en préparation apparaissent en rouge. Le vaccin candidat proposé est indiqué par (•). Les virus humains sont indiqués en caractères gras. Les virus testés au moyen de l’épreuve d’inhibition de l’hémagglutination sont indiqués par le symbole (#). La barre d’échelle représente le nombre de substitutions par site. Les valeurs de boostrap supportant la topologie de l’arbre sont indiquées au-dessus des nœuds sélectionnés.

0.05

A/chicken/Bangladesh/15-P-257/2018

A/chicken/Nepal/D299/2018

A/chicken/Nepal/B181/2018


A/chicken/Ghana/18VIR1513-23/2018 #

A/Senegal/0243/2019

A/chicken/Nepal/N294/2018

A/duck/Bangladesh/1009/2009

A/chicken/Jordan/436-2/2010

A/chicken/Bangladesh/BM-19-B-317/2019

A/chicken/Nepal/N244/2018


A/chicken/Nepal/BAR-563-CL/2019

A/guinea fowl/Nigeria/19VIR8424-18/2019 #

A/chicken/Israel/642/2013

A/chicken/Iran/SS5/2009

A/Bangladesh/0994/2011 #

A/chicken/Ghana/18VIR1513-13/2017 #

A/chicken/Nepal/2490/2009

A/chicken/Nepal/KTM-561-CL/2019

A/chicken/Karaj/GHA/2017

A/chicken/Nigeria/19VIR8424-13/2019 (2nd passage)


A/chicken/Nigeria/19VIR8424-6/2019 #

A/quail/Lebanon/272/2010

A/chicken/Nepal/G199/2018

A/chicken/Uchal/8293/2006

A/chicken/Siberia/03/2018

A/chicken/Uganda/MUWRP-200162/2017

A/turkey/Egypt/1341V/2013

A/Hong Kong/33982/2009 #

A/chicken/Nepal/CHI-473-CBP/2019

A/guinea fowl/Nigeria/19VIR8424-5/2019 #

A/Oman/2747/2019

A/chicken/Kuwait/9/2004

A/poultry/Pakistan/SI36/2017


A/chicken/Libya/13VIR7225-2/2013



A/chicken/Saudi Arabia/F-36365/2006

A/chicken/Saudi Arabia/D-36363/2010

A/Hong Kong/1073/99

A/quail/Dubai/302/2000

A/chicken/Saudi Arabia/EPD-22-01/2002

A/chicken/Niger/19VIR1322-37/2019 #

A/chicken/Nepal/KAI-223-CBP/2019


A/avian/Jordan/7-Y1/2004

100

100

73

100

100100

100

100

100

100

100

100

92

80

87

96

85

86

A/chicken/India/02CL788/2018A/India/TCM2581/2019


Influenza A(H1)vInfluenza A(H1) viruses are enzootic in swine populations in most regions of the world. Depending on geographic location, the genetic and antigenic characteristics of these viruses differ. Human infections with swine influenza A(H1) viruses (designated as A(H1)v viruses) have been documented previously in Asia, Europe and the Americas.

Grippe A(H1)vDes virus grippaux A(H1) sont enzootiques dans les populations porcines de la plupart des régions du monde. Les caractéristiques génétiques et antigéniques de ces virus diffèrent selon le lieu géographique. Des cas d’infection humaine par des virus grip-paux porcins A(H1) (dénommés virus A(H1)v) ont été enregistrés précédemment en Asie, en Europe et dans les Amériques.

Table 4 Haemagglutination inhibition assay of G1-lineage A(H9N2) influenza virusesTableau 4 Épreuves d’inhibition de l’hémagglutination obtenues avec les virus grippaux A (H9N2) de lignée G1

Reference antigens – Antigènes de référence Lineage – Lignée BD/0994 HK/33982

A/Bangladesh/0994/2011 G1 640 –

A/Hong Kong/33982/2009 G1 – 640

Test antigens – Antigènes d’épreuve

A/chicken/Ghana/18VIR1513-23/2018 G1 80 80

A/chicken/Ghana/18VIR1513-13/2017 G1 40 20

A/chicken/Niger/19VIR1322-37/2019 G1 20 40

A/chicken/Nigeria/19VIR8425-11/2019 G1 40 40

A/chicken/Nigeria/19VIR8424-13/2019 G1 <10 <10



A/guinea fowl/Nigeria/19VIR8424-18/2019 G1 160 80

A/guinea fowl/Nigeria/19VIR8424-5/2019 G1 80 40

Numbers in bold indicate homologous antiserum/antigen titres. – Les chiffres en caractères gras indiquent les titres d’antigènes/d’antisérum homologue.

Table 5 Status of influenza A(H9N2) candidate vaccine virus developmentTableau 5 État d’avancement dans la mise au point des virus vaccinaux candidats A(H9N2)

Candidate vaccine viruses – Virus vaccinaux candidats

Type Clade Institution*Available – Disponible

A/Hong Kong/1073/99 Wild type – Type sauvage G1 NIBSC Yes – Oui

NIBRG-91 (A/chicken/Hong Kong/G9/97) Reverse genetics – Génétique inverse Y280/G9 NIBSC Yes – Oui

IBCDC-2 (A/chicken/Hong Kong/G9/97) Conventional – Classique Y280/G9 CDC Yes – Oui

IDCDC-RG26 (A/Hong Kong/33982/2009) Reverse genetics – Génétique inverse G1 CDC Yes – Oui

IDCDC-RG31 (A/Bangladesh/994/2011) Reverse genetics – Génétique inverse G1 CDC Yes – Oui

SJ008 (A/Hong Kong/308/2014) Reverse genetics – Génétique inverse Y280/G9 SJCRH Yes – Oui

Candidate vaccine viruses in preparation – Virus vaccinaux candidats en préparation

Type Clade InstitutionAvailable – Disponible

A/Anhui-Lujiang/39/2018-like Reverse genetics – Génétique inverseConventional – Classique

Y280/G9Y280/G9

CDC/CCDCNIBSC

Pending – En attentePending – En attente

A/AnhuiOman/2747/2019-like Reverse genetics – Génétique inverse G1 CDC Pending – En attente







Influenza A(H1)v activity from 24 September 2019 to 24 February 2020One human case of an A(H1N1)v virus infection was identified in China in this period. In addition, a previously unreported A(H1N1)v case from China with an onset date of December 2018 was also identified. These A(H1N1)v cases were caused by viruses from the 1C4 (Eurasian avian-like) swine influenza virus lineage.

Antigenic and genetic characteristics of the influenza A(H1N1)v virusThe A(H1N1)v virus detected in this period had an HA that differed by 5 amino acids from that of A/Hunan/42443/2015 from which a CVV has been developed. Viruses with similar HA and NAs are known to circulate in swine in the region. No antigenic data are available from these recent viruses. Viruses of the 1C HA genetic lineage, detected in swine in Europe, were genetically and antigenically distinct from the A(H1)v A/Hunan/42443/2015 CVV and A/Netherlands/3315/2016, from which a CVV is being developed. Additional ferret antisera production and antigenic characterization are underway in order to monitor the antigenic diversity of these 1C lineage viruses.

Influenza A(H1)v candidate vaccine viruses

Based on the current antigenic, genetic and epidemio-logic data, development of new A(H1)v CVVs is not proposed. Availability of A(H1)v CVVs is listed in Table 6.

Activité de la grippe A(H1)v du 24 septembre 2019 au 24 février 2020Un cas d’infection humaine par un virus A(H1N1)v a été iden-tifié en Chine pendant cette période. De plus, un cas d’infection à A(H1N1)v, apparu en Chine en décembre 2018 et qui n’avait pas été notifié auparavant, a également été identifié. Les infec-tions à A(H1N1)v chez ces 2 cas ont été causées par des virus appartenant à la lignée 1C4 de virus grippaux porcins (virus de type aviaire de la lignée eurasienne).

Caractéristiques antigéniques et génétiques du virus grippal A(H1N1)vLe virus A(H1N1)v détecté pendant cette période possédait une hémagglutinine qui différait de 5 acides aminés de celle de la lignée A/Hunan/42443/201 à partir de laquelle un virus vaccinal candidat a été mis au point. Des virus présentant des gènes HA et NA analogues sont connus pour circuler chez les populations porcines dans la région. On ne dispose d’aucune donnée anti-génique sur ces virus récents. Les virus contenant le gène HA de la lignée 1C, détectés chez des porcs en Europe, étaient distincts, sur le plan génétique et antigénique, du virus vaccinal candidat A(H1)v A/Hunan/42443/2015 et de la lignée A/Nether-lands/3315/2016, actuellement utilisée pour la mise au point d’un virus vaccinal candidat. La production d’antisérums de furet supplémentaires est en cours, de même que la caractéri-sation des antigènes, afin de pouvoir surveiller la diversité anti-génique des virus de cette lignée 1C.

Virus candidats destinés à la préparation d’un vaccin contre la grippe A(H1)v Au vu des données antigéniques, génétiques et épidémiologiques actuelles, il n’est pas proposé de mettre au point de nouveaux virus vaccinaux candidats A(H1)v. Les virus vaccinaux candidats A(H1)v disponibles sont recensés dans le Tableau 6.

Table 6 Status of influenza A(H1)v candidate vaccine virus developmentTableau 6 État d’avancement dans la mise au point des virus vaccinaux candidats A(H1)v

Candidate vaccine viruses – Virus vaccinaux candidats Type Institution* Available – Disponible

CNIC-1601 (A/Hunan/42443/2015) (H1N1) Conventional – Classique CCDC Yes – Oui

IDCDC-RG48A (A/Ohio/9/2015) (H1N1) Reverse genetics – Génétique inverse CDC Yes – Oui

IDCDC-RG58A (A/Michigan/383/2018) (H1N2) Reverse genetics – Génétique inverse CDC Yes – Oui

Candidate vaccine viruses in preparation – Virus vaccinaux candidats en préparation

Type Institution Available – Disponible

A/Iowa/32/2016-like (H1N2) Reverse genetics – Génétique inverse CDC Pending – En attente

A/Netherlands/3315/2016-like (H1N1) Conventional – Classique NIBSC Pending – En attente

A/Ohio/24/2017-like (H1N2) Reverse genetics – Génétique inverse CDC Pending – En attente

A/Ohio/35/2017-like (H1N2) Reverse genetics – Génétique inverse NIBSC Pending – En attente





4 See https://msphere.asm.org/content/1/6/e00275-16 4 Voir https://msphere.asm.org/content/1/6/e00275-16

https://msphere.asm.org/content/1/6/e00275-16

https://msphere.asm.org/content/1/6/e00275-16


PERFORMANCE OF ACUTE FLACCID PARALYSIS (AFP) SURVEILLANCE AND INCIDENCE OF POLIOMYELITIS (DATA RECEIVED IN WHO HEADQUARTERS AS OF 3 MARCH 2020) FONCTIONNEMENT DE LA SURVEILLANCE DE LA PARALYSIE FLASQUE AIGUË (PFA) ET INCIDENCE DE LA POLIOMYÉLITE (DONNÉES REÇUES PAR LE SIÈGE DE L’OMS AU 3 MARS 2020)

Country/area Performance of AFP surveillance, 2019 Poliomyelitis casesPays/territoire Fonctionnement de la surveillance de la PFA, 2019 Cas de poliomyélite

Annualized AFP cases with 2019 2020 AFP cases non-poliomyelitis adequate WPV1 cVDPV 3, 4 WPV1 cVDPV3, 4

reported AFP rate1 specimens2 PVS1 PVDVc3, 4 PVS1 PVDVc3, 4

Cas de PFA Taux de PFA Cas de PFA avec signalés non poliomyélitique échantillons conformes2

annuel1

Regional totals – Totaux régionaux

AFR 24 438 06.06 90% 0 307 0 8

AMR 2 182 01.00 32% 0 0 0 0

EMR 25 739 12.19 90% 175 25 23 12

EUR 1 560 01.00 86% 0 0 0 0

SEAR 45 145 08.38 87% 0 6 0 0

WPR 7 173 03.46 85% 0 19 0 1

Global total – Total mondial 106 237 05.57 87% 175 357 23 21

African Region – Région africaine (AFR)

Algeria – Algérie 542 05.34 98% – – – –

Angola4 595 04.99 81% – 127 – –

Benin4 – Bénin4 310 06.36 91% – 8 – –

Botswana 23 03.47 70% – – – –

Burkina Faso4 371 04.52 83% – 1 – –

Burundi 97 01.88 95% – – – –

Cameroon – Cameroun 607 07.32 83% – – – –

Cabo Verde – Cap-Vert 3 01.34 100% – – – –

Central African Republic4 – République

centrafricaine4 227 09.19 72% – 21 – –

Chad4 – Tchad4 813 13.35 89% – 7 – –

Comoros – Comores 10 02.58 100% – – – –

Congo 189 10.60 87% – – – –

Côte d’Ivoire 417 04.92 83% – – – –

AcknowledgementsWe acknowledge the WHO Global Influenza Surveil-lance and Response System (GISRS) which provides the mechanism for detection and monitoring of emerging zoonotic influenza viruses. We thank the National Influ-enza Centres (NICs) of GISRS who contributed informa-tion, clinical specimens and viruses and associated data; WHO Collaborating Centres of GISRS for their in-depth characterization and comprehensive analysis of viruses; and WHO H5 Reference Laboratories for their comple-mentary analyses. We thank the OIE/FAO Network of Expertise on Animal Influenza (OFFLU) laboratories for their in-depth characterization and comprehensive analysis of viruses and other national institutions for contributing information and viruses. We also acknowl-edge the Global Initiative on Sharing All Influenza Data (GISAID) for the EpiFlu database and other sequence databases which were used to share gene sequences and associated information.

RemerciementsNous saluons la contribution du système mondial de surveil-lance de la grippe et de riposte (GISRS) de l’OMS, qui offre un moyen de détecter et de surveiller les virus grippaux zoono-tiques émergents. Nous remercions également: les centres natio-naux de lutte contre la grippe du GISRS, qui ont fourni des informations, des échantillons cliniques, des virus et d’autres données associées; les centres collaborateurs du GISRS de l’OMS pour leur caractérisation détaillée et leur analyse complète des virus; et les laboratoires de référence H5 de l’OMS pour leurs analyses complémentaires. Nous sommes reconnaissants aux laboratoires du Réseau d’experts sur la grippe animale (OFFLU) de l’OIE/FAO, pour leur caractérisation détaillée et leur analyse complète des virus, ainsi qu’à d’autres institutions nationales, pour les informations et les virus qu’ils ont fournis. Enfin, nous tenons à remercier l’Initiative mondiale d’échange des données sur la grippe aviaire (GISAID) pour la base de données EpiFlu et d’autres banques de données qui ont permis le partage des séquences génétiques et d’autres informations associées.




reported AFP rate1 specimens2 PVS1 PVDVc3, 4 PVS1 PVDVc3, 4 Cas de PFA Taux de PFA Cas de PFA avec signalés non poliomyélitique échantillons conformes2

annuel1

Democratic Republic of the Congo4 –

République démocratique du Congo4 3 722 09.31 86% – 85 – 1

Equatorial Guinea – Guinée équatoriale 51 20.04 92% – – – –

Eritrea – Érythrée 110 04.19 87% – – – –

Eswatini 17 03.92 100% – – – –

Ethiopia4 – Éthiopie4 1 221 02.91 91% – 11 – 3

Gabon 65 13.68 92% – – – –

Gambia 37 04.66 86% – – – –

Ghana4 650 06.63 89% – 18 – 2

Guinea – Guinée 232 04.86 92% – – – –

Guinea-Bissau – Guinée-Bissau 41 03.96 93% – – – –

Kenya 552 02.81 92% – – – –

Lesotho 15 01.90 100% – – – –

Liberia – Libéria 67 02.80 94% – – – –

Madagascar 610 06.27 94% – – – –

Malawi 187 02.41 89% – – – –

Mali 300 04.13 84% – – – –

Mauritania – Mauritanie 55 03.96 96% – – – –

Mauritius – Maurice 7 02.51 100% – – – –

Mozambique 503 04.65 74% – – – –

Namibia – Namibie 25 03.16 88% – – – –

Niger4 904 10.13 85% – 1 – –

Nigeria4 – Nigéria4 7 489 10.27 94% – 18 – 1

Reunion – Réunion ND – – – – – –

Rwanda 119 02.24 88% – – – –

Saint Helena – Saint-Hélène ND – – – – – –

Sao Tome and Principe – Sao Tomé-et-Principe 3 04.38 – – – – –

Senegal – Sénégal 172 02.96 83% – – – –

Seychelles ND – – – – – –

Sierra Leone 122 04.11 82% – – – –

South Africa – Afrique du Sud 600 03.96 86% – – – –

South Sudan – Soudan du Sud 395 07.55 90% – – – –

Togo4 155 04.57 74% – 8 – 1

Uganda – Ouganda 578 03.02 90% – – – –

United Republic of Tanzania –

République-Unie de Tanzanie 854 04.06 98% – – – –

Zambia4 – Zambie4 228 03.75 85% – 2 – –

Zimbabwe 148 02.78 89% – – – –

Region of the Americas – Région des Amériques (AMR)

Argentina – Argentine 183 01.78 29% – – – –

Bolivia (Plurinational State of) – Bolivie (État

plurinational de) 24 00.74 83% – – – –

Brazil – Brésil 445 00.98 64% – – – –

Canada 9 00.16 56% – – – –

CAREC – Centre d’épidémiologie des Caraïbes* 2 00.11 100% – – – –

Chile – Chili 61 01.89 67% – – – –

Colombia – Colombie 76 00.60 95% – – – –

Costa Rica 16 01.35 81% – – – –

Cuba 25 01.42 100% – – – –

Dominican Republic – République dominicaine 25 00.75 92% – – – –






annuel1

Ecuador – Équateur 22 00.54 86% – – – –

El Salvador 36 01.59 91% – – – –

Guatemala 71 01.09 75% – – – –

Haiti – Haïti 14 00.46 43% – – – –

Honduras 46 01.83 93% – – – –

Mexico – Mexique 840 03.01 88% – – – –

Nicaragua 25 01.25 100% – – – –

Panama 6 00.58 100% – – – –

Paraguay 26 01.18 88% – – – –

Peru – Pérou 121 01.59 67% – – – –

United States of America – États-Unis d’Amérique ND – – – – – –

Uruguay 8 01.22 – – – – –

Venezuela (Bolivarian Republic of) – Venezuela

(République bolivarienne du) 101 01.28 60% – – – –

* These countries have been grouped together for reporting purposes. – Ces pays ont été regroupés dans le but de déclarer des cas.

Eastern Mediterranean Region – Région de la Méditerranée orientale (EMR)

Afghanistan 3 768 23.03 94% 29 – 2 –

Bahrain – Bahreïn 17 08.96 100% – – – –

Djibouti 5 01.57 80% – – – –

Egypt – Égypte 1 343 05.07 93% – – – –

Iran (Islamic republic of) – Iran (République

islamique d’) 1 070 05.25 97% – – – –

Iraq 1 157 09.04 94% – – – –

Jordan – Jordanie 113 05.07 100% – – – –

Kuwait – Koweït 48 06.33 90% – – – –

Lebanon – Liban 87 07.99 90% – – – –

Libya (State of) – Libye (État de) 107 05.10 98% – – – –

Morocco – Maroc 247 02.68 84% – – – –

Oman 30 03.32 80% – – – –

Pakistan4 15 185 24.49 87% 146 22 21 12

Qatar 9 04.53 89% – – – –

Saudi Arabia – Arabie saoudite 236 02.62 93% – – – –

Somalia4 – Somalie4 361 07.67 96% – 3 – –

Sudan – Soudan 608 03.67 96% – – – –

Syrian Arab Republic4 – République arabe syrienne4 377 04.85 88% – – – –

Tunisia – Tunisie 79 02.98 75% – – – –

United Arab Emirates – Émirats arabes unis 50 04.81 90% – – – –

West Bank and Gaza Strip – Cisjordanie

et bande de Gaza 62 03.85 98% – – – –

Yemen – Yémen 780 06.49 89% – – – –

European Region – Région européenne (EUR)

Albania – Albanie 0 00.00 – – – – –

Andorra – Andorre 0 00.00 – – – – –

Armenia – Arménie 16 02.60 100% – – – –

Austria – Autriche 1 00.23 100% – – – –

Azerbaijan – Azerbaïdjan 19 00.38 100% – – – –

Belarus – Bélarus 57 03.29 89% – – – –

Belgium – Belgique NA 00.00 – – – – –

Bosnia and Herzegovina – Bosnie-Herzégovine 2 00.37 100% – – – –






annuel1

Bulgaria – Bulgarie 11 00.68 100% – – – –

Croatia – Croatie 2 00.32 50% – – – –

Cyprus – Chypre 0 00.00 – – – – –

Czechia – Tchéquie 15 00.89 53% – – – –

Denmark – Danemark ND – – – – – –

Estonia – Estonie 0 00.00 – – – – –

Finland – Finlande ND – – – – – –

France ND – – – – – –

Georgia – Géorgie 5 00.62 80% – – – –

Germany – Allemagne ND – – – – – –

Greece – Grèce 11 00.00 73% – – – –

Hungary – Hongrie 16 01.07 56% – – – –

Iceland – Islande ND – – – – – –

Ireland – Irlande ND – – – – – –

Israel – Israël 33 01.30 42% – – – –

Italy – Italie 53 00.66 66% – – – –

Kazakhstan 93 01.73 100% – – – –

Kyrgyzstan – Kirghizistan 61 02.49 93% – – – –

Latvia – Lettonie 2 00.64 100% – – – –

Lithuania – Lituanie 11 02.63 82% – – – –

Luxembourg ND – – – – – –

Malta – Malte 0 00.00 – – – – –

Moldova (Republic of) – Moldavie (République de) 4 00.46 100% – – – –

Monaco ND – – – – – –

Montenegro – Monténégro 0 00.00 – – – – –

Netherlands – Pays-Bas ND – – – – – –

North Macedonia – Macédoine du Nord 3 00.90 100% – – – –

Norway – Norvège 10 01.15 10% – – – –

Poland – Pologne 42 00.73 0% – – – –

Portugal 0 00.00 0% – – – –

Romania – Roumanie 12 00.03 83% – – – –

Russian Federation – Fédération de Russie 356 01.33 96% – – – –

San Marino – Saint Marin ND 00.39 – – – – –

Serbia – Serbie 12 00.88 100% – – – –

Slovakia – Slovaquie 0 00.00 0% – – – –

Slovenia – Slovénie 1 00.63 – – – – –

Spain – Espagne 36 00.51 50% – – – –

Sweden – Suède ND – – – – – –

Switzerland – Suisse 12 00.93 17% – – – –

Tajikistan – Tadjikistan 89 02.37 94% – – – –

Turkey – Turquie 247 01.15 81% – – – –

Turkmenistan – Turkménistan 41 01.91 100% – – – –

Ukraine 157 02.19 98% – – – –

United Kingdom – Royaume-Uni ND – – – – – –

Uzbekistan – Ouzbékistan 130 01.36 100% – – – –

South-East Asia Region – Asie du Sud-Est (SEAR)

Bangladesh 1 429 02.55 100% – – – –

Bhutan – Bhoutan 6 03.27 83% – – – –

Democratic People’s Republic of Korea –

République populaire démocratique de Corée 122 02.61 100% – – – –


India – Inde 40 674 10.89 87% – – – –Indonesia – Indonésie 1790 02.85 81% – – – –Maldives 7 06.83 71% – – – –Myanmar 418 03.43 90% – 6 – –Nepal – Népal 342 03.05 98% – – – –Sri Lanka 80 01.87 76% – – – –Thailand – Thaïlande 275 02.09 72% – – – –Timor Leste 2 00.30 50% – – – –

Western Pacific Region – Pacifique occidental (WPR)

Australia – Australie 63 03.14 46% – – – –Brunei Darussalam – Brunéi Darussalam 2 03.41 100% – – – –Cambodia – Cambodge 55 01.82 89% – – – –China4 – Chine4 5 281 03.60 92% – 1 – –China, Hong Kong SAR – Chine, Hong Kong RAS – 00.00 – – – – –China, Macao SAR – Chine, Macao RAS – 00.00 – – – – –Japan – Japon ND – – – – – –Lao People’s Democratic Republic – République démocratique populaire lao 65 05.87 82% – – – –Malaysia – Malaisie 195 04.53 75% – 3 – –Mongolia – Mongolie 5 01.44 100% – – – –New Zealand – Nouvelle-Zélande 7 01.16 57% – – – –Pacific Island countries and areas – Pays et territoires insulaires du Pacifique* 21 05.02 57% – – – –Papua New Guinea5 – Papouasie-Nouvelle-Guinée5 213 15.67 77% – – – –Philippines4 873 04.30 46% – 15 – 1Republic of Korea – République de Corée 81 02.37 85% – – – –Singapore – Singapour 5 01.62 100% – – – –Viet Nam 307 02.08 96% – – – –

* These countries have been grouped together for reporting purposes. – Ces pays ont été regroupés dans le but de déclarer des cas.

CAREC: Caribbean Epidemiology Centre; VDPV: vaccine-derived poliovirus; cVDPV1: circulating vaccine-derived poliovirus type-1; cVDPV2: circulating vaccine-derived poliovirus type-2; cVDPV3: circulating vaccine-derived poliovirus type-3. – Caribbean Epidemiology Centre, connu sous le nom de CAREC; PVDV: poliovirus dérivé d’une souche vaccinale; PVDV1c: poliovirus circulant dérivé d’une souche vaccinale de type 1; PVDV2c: poliovirus circulant dérivé d’une souche vaccinale de type 2; PVDV3c: poliovirus circulant dérivé d’une souche vaccinale de type 3.

Endemic countries are shaded. – Les pays d’endémie sont grisés.1 Annualized non-poliomyelitis AFP rate for 100 000 population aged <15 years. UNPD population data is used to calculate the non-polio AFP rate. – Taux annualisé de

PFA non poliomyélitique pour 100 000 personnes âgées de <15 ans. Les données sur la population collectées par le Programme des Nations Unies pour le développe-ment (PNUD) sont utilisées pour calculer le taux de PFA non poliomyélitique.

2 Defined as 2 stool specimens collected within 14 days of onset of paralysis, 24–48 hours apart, except for the Region of the Americas, where only 1 specimen is collected. – Défini comme 2 échantillons de selles recueillis à 24-48 heures d’intervalle dans les 14 jours suivant l’apparition de la paralysie, à l’exception de la Région des Amériques, où 1 seul échantillon est recueilli.

3 For cVDPV definition see document «Reporting and classification of vaccine-derived polioviruses» at http://polioeradication.org/wp-content/uploads/2016/09/Reporting-and-Classification-of-VDPVs_Aug2016_EN.pdf. Implementation as of 15 August 2015. Figures exclude cVDPV from non-AFP sources. – La définition d’un PVDVc est dispo-nible (uniquement en langue anglaise) dans le document «Reporting and classification of vaccine-derived polioviruses», à l’adresse http://polioeradication.org/wp-content/uploads/2016/09/Reporting-and-Classification-of-VDPVs_Aug2016_EN.pdf. Mise en œuvre au 15 août 2015. Sont exclus de ces chiffres les PVDVc de source non-PFA.

4 cVDPV2 reported in Angola, Benin, Burkina Faso, Central African Republic, Chad, China, Democratic Republic of the Congo, Ethiopia, Ghana, Niger, Nigeria, Pakistan, Philippines, Somalia, Togo and Zambia. cVDPV1 reported in Malaysia, Myanmar and Philippines. – Des cas de PVDV2c ont été signalés en Angola, au Bénin, au Burkina Faso, en Chine, en Éthiopie, au Ghana, au Niger, au Nigéria, au Pakistan, aux Philippines, en République centrafricaine, en République démocratique du Congo, en Somalie, au Tchad, au Togo et en Zambie. Des cas de PVDV1c ont été signalés en Malaisie, au Myanmar et aux Philippines.

ND – Country not reporting AFP data or country conducting supplementary poliovirus surveillance through other means (e.g. environmental, enterovirus or both) – Pays ne rapportant pas de données sur la PFA ou pays menant une politique de surveillance de la polio supplémentaire par le biais d’autres moyens (par exemple, surveillance environnementale ou des entérovirus, ou les deux).

The most recent AFP and wild poliovirus data can be found on the WHO web site (https://extranet.who.int/polis/public/CaseCount.aspx) which is updated weekly. – Les données les plus récentes concernant les cas de PFA et les poliovirus sauvages peuvent être consultées sur le site OMS suivant: https://extranet.who.int/polis/public/CaseCount.aspx, où elles sont mises à jour une fois par semaine.





annuel1

http://polioeradication.org/wp-content/uploads/2016/09/Reporting-and-Classification-of-VDPVs_Aug2016_EN.pdf




https://extranet.who.int/polis/public/CaseCount.aspx

https://extranet.who.int/polis/public/CaseCount.aspx


WHO web sites on infectious diseases – Sites internet de l’OMS sur les maladies infectieuses

Avian influenza https://www.who.int/influenza/human_animal_interface Grippe aviaire

Buruli ulcer http://www.who.int/buruli Ulcère de Buruli

Child and adolescent health and development http://www.who.int/child_adolescent_health Santé et développement des enfants et des adolescents

Cholera http://www.who.int/cholera Choléra

COVID-19 https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019 Maladie à coronavirus 2019 (COVID-19)

Dengue http://www.who.int/denguecontrol Dengue

Ebola virus disease https://www.who.int/health-topics/ebola/#tab=tab_1 Maladie à virus Ebola

Emergencies https://www.who.int/emergencies Situations d’urgence sanitaire

Epidemic and pandemic diseases https://www.who.int/emergencies/diseases Maladies épidémiques et pandémiques

Eradication/elimination programmes http://www.who.int/topics/infectious_diseases Programmes d’éradication/élimination

Fact sheets on infectious diseases http://www.who.int/topics/infectious_diseases/factsheets Aide-mémoires sur les maladies infectieuses

Filariasis http://www.filariasis.org Filariose

Global Foodborne Infections Network (GFN) http://www.who.int/gfn Réseau mondial d’infections d’origine alimentaire

Global Health Observatory (GHO) data https://www.who.int/gho Données de l’Observatoire de la santé mondiale

Global Influenza Surveillance and Response System (GISRS)

https://www.who.int/influenza/gisrs_laboratory Système mondial de surveillance et d’intervention en cas de grippe (GISRS)

Global Outbreak Alert and Response Network (GOARN)

https://www.who.int/ihr/alert_and_response/outbreak-network/en/ Réseau mondial d’alerte et d’action en casd’épidémie (GOARN)

Health topics http://www.who.int/topics/en La santé de A à Z

Human African trypanosomiasis http://www.who.int/trypanosomiasis_african Trypanosomiase humaine africaine

Immunization, Vaccines and Biologicals http://www.who.int/immunization Vaccination, Vaccins et Biologiques

Influenza https://www.who.int/influenza Grippe

International Health Regulations http://www.who.int/ihr Règlement sanitaire international

International travel and health http://www.who.int/ith Voyages internationaux et santé

Leishmaniasis http://www.who.int/leishmaniasis Leishmaniose

Leprosy http://www.who.int/lep Lèpre

Lymphatic filariasis http://www.who.int/lymphatic_filariasis Filiariose lymphatique

Malaria http://www.who.int/malaria Paludisme

Middle East respiratory syndrome coronavirus(MERS-CoV)

https://www.who.int/emergencies/mers-cov Coronavirus du syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS-CoV)

Neglected tropical diseases http://www.who.int/neglected_diseases Maladies tropicales négligées

Onchocerciasis http://www.who.int/onchocerciasis Onchocercose

OpenWHO https://openwho.org/ OpenWHO

Outbreak news http://www.who.int/csr/don Flambées d’épidémies

Poliomyelitis http://www.polioeradication.org Poliomyélite

Rabies http://www.who.int/rabies Rage

Schistosomiasis http://www.who.int/schistosomiasis Schistosomiase

Smallpox http://www.who.int/csr/disease/smallpox Variole

Soil-transmitted helminthiases http://www.who.int/intestinal_worms Géohelminthiases

Trachoma http://www.who.int/trachoma Trachome

Tropical disease research http://www.who.int/tdr Recherche sur les maladies tropicales

Tuberculosis http://www.who.int/tb and/et http://www.stoptb.org Tuberculose

Weekly Epidemiological Record http://www.who.int/wer Relevé épidémiologique hebdomadaire

WHO Lyon Office for National Epidemic Preparedness and Response

http://www.who.int/ihr/lyon Bureau OMS de Lyon pour la préparationet la réponse des pays aux épidémies

WHO Pesticide Evaluation Scheme (WHOPES) https://www.who.int/whopes/resources Schéma OMS d’évaluation des pesticides

Yellow fever http://www.who.int/csr/disease/yellowfev Fièvre jaune

Zika virus disease https://www.who.int/emergencies/diseases/zika Maladie à virus Zika

https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019

https://openwho.org/

117–132 no 13 weekly epidemiological record relevé ......118 weekly epidemiological record, no...

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