adln perpustakaan universitas airlanggarepository.unair.ac.id/29269/1/halaman depan.pdf · caused...

17
ADLN PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA SKRIPSI ANALISIS DAN ESTIMASI … AULADI I.P. ANALISIS DAN ESTIMASI PARAMETER MODEL MATEMATIKA PENYEBARAN PENYAKIT EBOLA SKRIPSI AULADI INDRA PRASTA PROGRAM STUDI S-1 MATEMATIKA DEPARTEMEN MATEMATIKA FAKULTAS SAINS DAN TEKNOLOGI UNIVERSITAS AIRLANGGA 2016

Upload: others

Post on 31-Jan-2020

0 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: ADLN PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGArepository.unair.ac.id/29269/1/HALAMAN DEPAN.pdf · caused people to be more aware of the danger of EVD that once had hugely spread in 1976

ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA

SKRIPSI ANALISIS DAN ESTIMASI … AULADI I.P.

ANALISIS DAN ESTIMASI PARAMETER MODEL MATEMATIKA

PENYEBARAN PENYAKIT EBOLA

SKRIPSI

AULADI INDRA PRASTA

PROGRAM STUDI S-1 MATEMATIKA

DEPARTEMEN MATEMATIKA

FAKULTAS SAINS DAN TEKNOLOGI

UNIVERSITAS AIRLANGGA

2016

Page 2: ADLN PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGArepository.unair.ac.id/29269/1/HALAMAN DEPAN.pdf · caused people to be more aware of the danger of EVD that once had hugely spread in 1976

ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA

i

SKRIPSI ANALISIS DAN ESTIMASI … AULADI I.P.

ANALISIS DAN ESTIMASI PARAMETER MODEL MATEMATIKA

PENYEBARAN PENYAKIT EBOLA

SKRIPSI

AULADI INDRA PRASTA

PROGRAM STUDI S-1 MATEMATIKA

DEPARTEMEN MATEMATIKA

FAKULTAS SAINS DAN TEKNOLOGI

UNIVERSITAS AIRLANGGA

SURABAYA

2016

Page 3: ADLN PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGArepository.unair.ac.id/29269/1/HALAMAN DEPAN.pdf · caused people to be more aware of the danger of EVD that once had hugely spread in 1976

ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA

SKRIPSI ANALISIS DAN ESTIMASI … AULADI I.P.

Page 4: ADLN PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGArepository.unair.ac.id/29269/1/HALAMAN DEPAN.pdf · caused people to be more aware of the danger of EVD that once had hugely spread in 1976

ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA

SKRIPSI ANALISIS DAN ESTIMASI … AULADI I.P.

Page 5: ADLN PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGArepository.unair.ac.id/29269/1/HALAMAN DEPAN.pdf · caused people to be more aware of the danger of EVD that once had hugely spread in 1976

ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA

SKRIPSI ANALISIS DAN ESTIMASI … AULADI I.P.

PEDOMAN PENGGUNAAN SKRIPSI

Skripsi ini tidak dipublikasikan, namun tersedia di perpustakaan dalam

lingkungan Universitas Airlangga, diperkenankan untuk dipakai sebagai referensi

kepustakaan, tetapi pengutipan harus seijin penulis dan harus menyebutkan

sumbernya sesuai kebiasaan ilmiah. Dokumen skripsi ini merupakan hak milik

Universitas Airlangga

iv

Page 6: ADLN PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGArepository.unair.ac.id/29269/1/HALAMAN DEPAN.pdf · caused people to be more aware of the danger of EVD that once had hugely spread in 1976

ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA

SKRIPSI ANALISIS DAN ESTIMASI … AULADI I.P.

Page 7: ADLN PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGArepository.unair.ac.id/29269/1/HALAMAN DEPAN.pdf · caused people to be more aware of the danger of EVD that once had hugely spread in 1976

ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA

SKRIPSI ANALISIS DAN ESTIMASI … AULADI I.P.

KATA PENGANTAR

Puji syukur kehadirat Allah SWT yang telah memberikan rahmat, taufiq dan

hidayah-Nya sehingga Penulis dapat menyelesaikan skripsi dengan judul

“Analisis dan Estimasi Parameter Model Matematika Penyebaran Penyakit Ebola”

dengan baik. Sholawat serta salam semoga tercurahkan kepada junjungan kita

Nabi besar Muhammad SAW, beserta keluarga dan para sahabat serta orang-

orang yang senantiasa istiqomah di jalan-Nya.

Tidak dapat dipungkiri bahwa penyusunan skripsi ini tak lepas dari begitu

banyak bantuan dan dukungan dari berbagai pihak. Pada kesempatan ini,

penyusun ingin mengucapkan terima kasih sebesar-besarnya kepada:

1. Orang tua yaitu ibu dan ayah yang selalu memberikan doa dan dukungan baik

secara moril maupun materil dalam penyusunan skripsi ini.

2. Bapak Dr. Windarto, M.Si selaku pembimbing I dan Ibu Dr. Fatmawati, M.Si

selaku pembimbing II yang memberikan bimbingan, saran, dan masukan

dalam penyelesaian skripsi.

3. Bapak Ahmadin, S. Si, M.Si selaku penguji III dan Ibu Auli Damayanti, S. Si,

M.Si selaku penguji IV yang telah memberikan saran dan masukan sehingga

skripsi ini menjadi lebih baik.

4. Bapak Dr. Eridani selaku dosen wali selama menjadi mahasiswa program

studi S-1 Matematika Fakultas Sains dan Teknologi Universitas Airlangga.

5. Dosen-dosen FST yang telah memberi ilmu yang bermanfaat kepada Penulis

hingga dapat menunjang penulisan skripsi.

vi

Page 8: ADLN PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGArepository.unair.ac.id/29269/1/HALAMAN DEPAN.pdf · caused people to be more aware of the danger of EVD that once had hugely spread in 1976

ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA

SKRIPSI ANALISIS DAN ESTIMASI … AULADI I.P.

6. Marcellia, Aji, Radifa, Hakim, Boim, Faisol, Rezza, Lista, Yanti, Nita, Isa,

Prabu, Steven, Arista, Windha, Indri, Evi, dan Renita yang membantu

maupun mendukung Penulis dalam menyelesaikan skripsi.

7. Teman-teman program studi S-1 Matematika karena kurang lebih empat

tahun bersama-sama dan selalu saling menolong selama jalannya proses

kuliah hingga saat ini.

8. Teman-teman dari program studi lain di Universitas Airlangga.

9. Semua pihak lain yang tidak dapat Penulis sebutkan seluruhnya yang telah

membantu dalam penyusunan skripsi.

Penulis telah berusaha sebaik mungkin dalam menyelesaikan skripsi ini,

namun apabila ada saran dan kritik yang membangun akan Penulis terima dengan

hati terbuka. Semoga skripsi ini dapat bermanfaat bagi para pembaca.

Surabaya, Januari 2016

Auladi Indra Prasta

vii

Page 9: ADLN PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGArepository.unair.ac.id/29269/1/HALAMAN DEPAN.pdf · caused people to be more aware of the danger of EVD that once had hugely spread in 1976

ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA

SKRIPSI ANALISIS DAN ESTIMASI … AULADI I.P.

Auladi Indra Prasta, 2016, Analisis dan Estimasi Parameter Model Matematika

Penyebaran Penyakit Ebola. Skripsi ini dibawah bimbingan Dr. Windarto, M.Si

dan Dr. Fatmawati, M.Si, Departemen Matematika, Fakultas Sains dan

Teknologi, Universitas Airlangga, Surabaya.

ABSTRAK

Penyakit ebola adalah salah satu penyakit menular yang mewabah di tahun

2014, khususnya di negara-negara di Benua Afrika. Penyakit ini disebabkan

oleh virus ebola dari family filovirus genus filoviridae. Besarnya penyebaran

penyakit ebola yang terjadi pada tahun 2014 membuat masyarakat dunia lebih

sadar akan bahaya penyakit ebola yang pernah mewabah sebelumnya pada

tahun 1976. Salah satu penyebab beberapa negara kesulitan mengendalikan

pewabahan tersebut adalah ketidaktersediaan obat dari penyakit ebola. Dengan

model matematika, dinamika penyebaran penyakit Ebola dapat diketahui dan

digunakan untuk memprediksi penyebarannya.

Skripsi ini membahas model matematika penyebaran penyakit ebola yang

terjadi di Nigeria baik secara analitik maupun numerik. Untuk mengkaji

penyebaran penyakit ebola secara numerik, dibutuhkan nilai parameter dari

model. Oleh karena itu dilakukan estimasi parameter menggunakan metode

algoritma genetika dengan data yang berdasarkan pada kasus penyebaran

penyakit ebola di Nigeria. Dari hasil analisis model diperoleh satu titik

setimbang bebas penyakit yang stabil saat . Hasil simulasi model saat

menunjukkan bahwa jumlah manusia yang terinfeksi akan menurun dan

pada akhirnya konstan. Hal ini menyebabkan jumlah manusia yang sembuh

maupun meninggal akan bernilai konstan, sedangkan jumlah manusia rentan

cenderung konstan. Saat , jumlah manusia rentan akan turun secara

konstan, sehingga jumlah manusia yang terinfeksi cenderung konstan. Hal ini

menyebabkan jumlah manusia yang sembuh dan yang meninggal naik secara

konstan.

Kata Kunci: Model matematika, Ebola, kestabilan, algoritma genetika.

viii

Page 10: ADLN PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGArepository.unair.ac.id/29269/1/HALAMAN DEPAN.pdf · caused people to be more aware of the danger of EVD that once had hugely spread in 1976

ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA

SKRIPSI ANALISIS DAN ESTIMASI … AULADI I.P.

Auladi Indra Prasta, 2016, Analysis and Parameter Estimation of Mathematical

Model of the Spread of Ebola Disease. This thesis is under advice by Dr.

Windarto, M.Si dan Dr. Fatmawati, M.Si, Mathematics Department, Faculty of

Science and Technology, Airlangga University, Surabaya.

ABSTRACT

Ebola Virus Disease (EVD) is one of the infectious diseases that spread

hugely in 2014, especially in African countries. This disease is caused by ebola

virus of family filovirus genus filoviridae. The outbreak that happened in 2014

caused people to be more aware of the danger of EVD that once had hugely

spread in 1976. One of the reasons that causes some countries can hardly

contain the spread is the unavailability of the medicine for EVD. Using

mathematical model, the dynamic of the spread of EVD can be known and used

to predict its spread.

This thesis discusses mathematical model of the spread of EVD in Nigeria

both analytically and numerically. In order to study the spread of EVD

numerically, the parameter value of the model is necessary. Therefore

parameter estimation is done using genetic algorithm with data based on spread

of EVD in Nigeria. From the model analysis, we obtain one disease free

equilibrium that is stable when the value of is less than unity. Under the

condition of valuing less than unity, the model simulation shows that the

amount of infected tends to decline and eventually constant. This results in

constant amount of both recovered and dead human, while the amount of

susceptible people tends to be constant. When the value of is more than

unity, the amount of susceptible people decreases constantly, causing the

amount of infected people to be constant. This condition leads to the constant

increase of the amount of both recovered and dead people.

Key Word: Mathematical Model, Ebola, stability, genetic algorithm.

ix

Page 11: ADLN PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGArepository.unair.ac.id/29269/1/HALAMAN DEPAN.pdf · caused people to be more aware of the danger of EVD that once had hugely spread in 1976

ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA

SKRIPSI ANALISIS DAN ESTIMASI … AULADI I.P.

DAFTAR ISI

Halaman

LEMBAR JUDUL .................................................................................................... i

LEMBAR PENGESAHAN .................................................................................... ii

PEDOMAN PENGGUNAAN SKRIPSI ................................................................ iv

SURAT PERNYATAAN TENTANG ORISINALITAS ...................................... v

KATA PENGANTAR ............................................................................................. vi

ABSTRAK ................................................................................................................ viii

ABSTRACT .............................................................................................................. ix

DAFTAR ISI ............................................................................................................ x

DAFTAR TABEL ................................................................................................... xiii

DAFTAR GAMBAR ................................................................................................ xiv

DAFTAR LAMPIRAN ............................................................................................ xvi

BAB I PENDAHULUAN ......................................................................................... 1

1.1. Latar Belakang .............................................................................................. 1

1.2. Rumusan Masalah ......................................................................................... 4

x

Page 12: ADLN PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGArepository.unair.ac.id/29269/1/HALAMAN DEPAN.pdf · caused people to be more aware of the danger of EVD that once had hugely spread in 1976

ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA

SKRIPSI ANALISIS DAN ESTIMASI … AULADI I.P.

1.3. Tujuan ........................................................................................................... 4

1.4. Manfaat ......................................................................................................... 5

1.5. Batasan Masalah ........................................................................................... 5

BAB II TINJAUAN PUSTAKA ............................................................................. 6

2.1. Ebola ............................................................................................................. 6

2.2. Sistem Persamaan Differensial ..................................................................... 8

2.3. Kestabilan Sistem Linear .............................................................................. 11

2.4. Algoritma Genetika....................................................................................... 13

BAB III METODOLOGI PENELITIAN .............................................................. 17

BAB IV PEMBAHASAN ........................................................................................ 21

4.1 Estimasi Parameter Model Matematika Penyebaran Penyakit Ebola ............ 21

4.1.1 Model Matematika Penyebaran Penyakit Ebola ................................... 21

4.1.2 Data ....................................................................................................... 24

4.1.3 Parameter-Parameter dalam Pemrograman ........................................... 25

4.1.4 Hasil ...................................................................................................... 26

4.2 Analisis Model Matematika Penyebaran Penyakit Ebola .............................. 32

4.2.1 Titik Setimbang Model ......................................................................... 33

xi

Page 13: ADLN PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGArepository.unair.ac.id/29269/1/HALAMAN DEPAN.pdf · caused people to be more aware of the danger of EVD that once had hugely spread in 1976

ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA

SKRIPSI ANALISIS DAN ESTIMASI … AULADI I.P.

4.2.2 Analisis Kestabilan Titik Setimbang..................................................... 34

4.2.3 Simulasi Numerik Model Matematika Penyebaran Penyakit ............... 36

Ebola

BAB V PENUTUP .................................................................................................... 47

5.1 Kesimpulan .................................................................................................... 47

5.2 Saran .............................................................................................................. 48

DAFTAR PUSTAKA ............................................................................................... 49

LAMPIRAN

xii

Page 14: ADLN PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGArepository.unair.ac.id/29269/1/HALAMAN DEPAN.pdf · caused people to be more aware of the danger of EVD that once had hugely spread in 1976

ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA

SKRIPSI ANALISIS DAN ESTIMASI … AULADI I.P.

DAFTAR TABEL

No Judul Halaman

4.1 Variabel dalam model matematika penyebaran

penyakit ebola 22

4.2 Parameter dalam model matematika penyebaran

penyakit ebola 22

4.3 Data riil kumulatif kasus ebola di Nigeria 25

4.4 Parameter program dan hasil estimasi parameter 27

4.5 Nilai parameter untuk simulasi numerik dalam

kondisi non endemik 36

4.6 Nilai parameter untuk simulasi numerik dalam

kondisi endemik 42

xiii

Page 15: ADLN PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGArepository.unair.ac.id/29269/1/HALAMAN DEPAN.pdf · caused people to be more aware of the danger of EVD that once had hugely spread in 1976

ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA

SKRIPSI ANALISIS DAN ESTIMASI … AULADI I.P.

DAFTAR GAMBAR

No Judul Halaman

4.1 Diagram transmisi penyebaran penyakit ebola 23

4.2 Perbandingan populasi susceptible data riil

dengan hasil perhitungan 28

4.3 Perbandingan populasi exposed data riil dengan

hasil perhitungan 29

4.4 Perbandingan populasi infectious data riil

dengan hasil perhitungan 30

4.5 Perbandingan populasi recovered data riil

dengan hasil perhitungan 31

4.6 Perbandingan populasi die data riil dengan hasil

perhitungan 32

4.7 Dinamika populasi susceptible 37

4.8 Dinamika populasi exposed 38

4.9 Dinamika populasi infectious 39

4.10 Dinamika populasi recovered 40

4.11 Dinamika populasi die 41

xiv

Page 16: ADLN PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGArepository.unair.ac.id/29269/1/HALAMAN DEPAN.pdf · caused people to be more aware of the danger of EVD that once had hugely spread in 1976

ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA

SKRIPSI ANALISIS DAN ESTIMASI … AULADI I.P.

No Judul Halaman

4.12 Dinamika populasi susceptible 42

4.13 Dinamika populasi exposed 43

4.14 Dinamika populasi infectious 44

4.15 Dinamika populasi recovered 45

4.16 Dinamika populasi die 46

xv

Page 17: ADLN PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGArepository.unair.ac.id/29269/1/HALAMAN DEPAN.pdf · caused people to be more aware of the danger of EVD that once had hugely spread in 1976

ADLN – PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA

SKRIPSI ANALISIS DAN ESTIMASI … AULADI I.P.

DAFTAR LAMPIRAN

No. Judul Lampiran

1 Kode Program Penyelesaian Estimasi Parameter Menggunakan Algoritma

Genetika

2 Kode Program Simulasi Perbandingan Hasil Penyelesaian Persamaan

Diferensial dengan Data Riil

3 Perhitungan dan

4 Kode Program Simulasi Numerik Model

5 Penentuan Parameter untuk Simulasi Numerik Kondisi Endemik

xvi