Ácidos nucléicos

FosfatoPentosa

Base púrica o

pirimidínica

(a) Estructura general de los nucleótidos

Pirimidina Purina

(b) Bases nitrogenadas

Adenina Guanina

Citosina Timina (ADN) Uracilo (ARN)

Pirimidina

Purinas

Nomenclatura de Nucleótidos y Ácidos Nucléicos

Bases Nucleósidos* Nucleótidos* Ácidos Nucléicos*

Purinas

Adenina Adenosina Adenilato RNA

Desoxiadenosina Desoxiadenilato ADN

Guanina Guanosina Guanilato ARN

Desoxiguanosina Desoxiguanilato ADN

Pirimidinas

Citosina Citidina Citidilato ARN

Desoxicitidina Desoxicitidilato ADN

Timina Timidina o Timidilato o ADN

desoxitimidina desoxitimidilato

Uracilo Uridina Uridilato ARN

Tabla 10-1

* Nucleósido y Nucleótido son términos genéricos que incluyen ambos las formas ribo- y desoxirribo-. Adviértase que estos

ribonucleósidos y ribonucleótidos se nombran simplemente como nucleósidos y nucleótidos (ej. riboadenosina como

adenosina), y los desoxirribonucleósidos y desoxirribonucleótidos como desoxinucleósidos y desoxinucleótidos (ej.

desoxirriboadenosina como desoxiadenosina). Ambas formas de nomenclatura son válidos, pero las formas más cortas

son de uso más frecuente. La Timidina es una excepción; el término ribotimidina se emplea para destacar su aparición

inusual en el ARN.

Nucleótido:

Símbolo:

Nucleósido:

Desoxiadenilato

(desoxiadenosina

5 -monofosfato)

Desoxiguanilato

(desoxiguanosina

5 -monofosfato)

Desoxitimidilato

(desoxitimidina

5 -monofosfato)

Desoxicitidilato

(desoxicitidina

5 -monofosfato)

A, dA, dAMP G, dG, dGMP T, dT, dTMP C, dC, dCMP

Desoxiadenosina Desoxiguanosina Desoxitimidina Desoxicitidina

(a) Desoxirribonucleótidos

Nucleótido:

Símbolo:

Nucleósido:

Adenilato (adenosina

5 -monofosfato)

Guanilato (guanosina

5 -monofosfato)

Uridilato (uridina

5 -monofosfato)

Citidilato (citidina

5 -monofosfato)

A, AMP G, GMP U, UMP C, CMP

Adenosina Guanosina Uridina Citidina

(b) Ribonucleótidos

Ribosa

Ribosa Ribosa

Ribosa

Inosina

7-Metilguanosina 4-Tiouridina

Pseudouridina

(b)

Adenina

Adenina AdeninaAdenina

Adenosin 5 -monofosfato Adenosin 2 -monofosfato Adenosin 3 -monofosfato Adenosin 2 , 3 -monofosfato cíclico

extremo 5 extremo 5

extremo 3 extremo 3

ADN ARN

5

3

5

3

Unión fosfodiester

AA C G T

P P P P P OH

Extremo 5 Extremo 3

Guanina

Adenina

Timina

Citosina

5

5

3

3

36 Å

3.4 Å

Surcomayor

Surcomenor

20 Å

(a) (b) (c)

36 Å

3.4 Å

Surcomayor

Surcomenor

20 Å

(a)

5

5

3

3

NuevaNueva35

Cadena parentalCadena parental Cadenas hijas

(a)

3

5

1 2

3

4

7 5

6

Base

sin-Adenosina anti-Adenosina anti-Citidina

(b)

28 Å

Forma A Forma B Forma Z

Forma A Forma B Forma Z

Giro de la hélice derecha derecha izquierda

Diámetro ~ 26 Å ~ 20 Å ~ 18 Å

Pares de bases por 11 10.5 12 vuelta de hélice

Aumento de hélice por 2.6 Å 3.4 Å 3.7 Å

par de bases

Inclinación normal de 20º 6º 7º

la base respecto al eje

Conformación de pliegue terminal C-3 terminal C-2 terminal C-2 para

del azúcar pirimidinas; C-3 para purinas

Conformación del anti anti anti para pirimidinas;enlace glucosil sin para purinas

Repetición especular

Palíndromo

5 3

35

Horquilla

(a)

5 3

(b)

53

5

3

3

5

Cruciforme

(a) Monocistrónica

(b) Policistrónica

5

5

3

3

Gen

Gen 1 Gen 2 Gen 3

(a) Monocistrónica

5 3

Gen

(b) Policistrónica

5 3

Gen 1 Gen 2 Gen 3

Cadena simpleBulbo

Bucleinterno

Horquilla

(a)

Doble hélice en horquilla

(b)

Guanina

Uracilo

ADN doble hélice

Desnaturalización Renaturalización

ADN parcialmentedesnaturalizado

Separación de hebras

Unión de hebraspor emparejamiento de bases

Hebras separadas de ADN en madejas

aleatorias

3 m

Dúplexhíbrido

Muestra 1 Muestra 2

Mezcla y

enfriamiento

Dúplex de la muestra 1

Dúplex de la muestra 2

Dúplex de la muestra 1 y 2

P P P P P P P P P

3 A AC G G C T TC

P

P

PPP

T G C C G

P

P

OH OH

P

P

P

OH

A

dATP

dGTP

(a)

––––––

––––––

–––

Hebramolde

Hebracopia

3

Copia Molde de secuencia desconocida

ADN polimerasa

cuatro dNTPs,cuatro ddNTPs

Desnaturalización

AA

T

T

C

G

G

GG

T

T

C

Resultado generado por ordenador después de

pasar por el detector de migración de bandas

Etiquetas con pigmentos en segmentos se someten a electroforésis en un gel capilar

Migración ADN

Detector

Rayo Láser

Láser

C C T G T T T G A T G G T G G T T C C G A A A T C G G

20 30 40

Etiquetas con pigmentos en segmentos de ADN, copiado delmolde de secuencia desconocida

OO – P – O – P – O – P – O – CH2

| | |

O O O

O O O

HH H

H

OHOH

Base

NMP

NDP

NTP

Abreviaturas de Ribonucleósidos 5 -fosfato

Abreviaturas de Desoxirribonucleósidos 5 -fosfato

Base Mono- Di- Tri- Base Mono- Di- Tri-

Adenina AMP ADP ATP

Guanina GMP GDP GTP

Citosina CMP CDP CTP

Uracilo UMP UDP UTP

Adenina dAMP dADP dATP

Guanina dGMP dGDP dGTP

Citosina dCMP dCDP dCTP

Uracilo dUMP dUDP dUTP

OO – P – O – P – O – P – O – CH2

|

O O O

O O O

HH H

H

OHOH

Adenina

| |

Anhídrido

Anhídrido

Éster

ATP

CH3 – C – O – C – CH3

O O

CH3 – C – O – CH3

O

Anhídrido acético,un ácido carboxílico

anhidro

Metil acetato,un éster de un ácido

carboxílico

β-Mercaptoeltilamina Ácido Pantoténico

3 -Fosfoadenosina difosfato(3 -P-ADP)

RiboflavinaNicotinamida

Coenzima A

Nicotinamida Adenina Dinucleótido (NAD+)

Flavín Adenín Dinucleótido (FAD)

β-Mercaptoeltilamina Ácido Pantoténico

3 -Fosfoadenosina difosfato(3 -P-ADP)

Coenzima A

Nicotinamida

Nicotinamida Adenina Dinucleótido (NAD+)

Riboflavina

Flavín Adenín Dinucleótido (FAD)

O O – P – O – P – O – CH2

O O

O O

HH H

H

OHO

Guanina

| |

|P

O|P

|

|

O

O

O

O

O

–

–

5

3

O

HH H

H

OHO

Guanina

P|

O

5

3

O – CH2

O

O

HH H

H

OHO

Adenina

P|

O

5

3

O – CH2

O

Adenosina 3 -5 -monofosfato cíclico(AMPc)

Guanosina 3 -5 -monofosfato cíclico(GMPc)

Guanosina 3 -difosfato,5 -difosfato(guanosina tetrafosfato)

(ppGMPpp)