23 AUGUST 2016THE BID PROGRAMME IS FUNDED BY THE EUROPEAN UNION

Origins of data: examples and illustrations Sophie Pamerlon

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Origines des données : exemples et illustrations

Sophie Pamerlon

Checklists and other taxonomical resources

Référentiels taxonomiques et autres listes de taxons

Checklists and taxonomical resources

Taxon list of reference: a valid list of species/taxa present in a given area, with their hierarchy and synonyms

Red list (at national, regional or local level): a list of taxa present in a given area with their vulnerability status

Checklist: a simple list of taxa present in a given area

Référentiels et listes taxonomiques

Référentiel taxonomique : liste valide d’espèces/taxons présents dans une région donnée, avec leur hiérarchie et synonymes

Liste rouge (nationale, régionale ou locale) : list de taxons présents dans une région donnée avec leur statut de vulnérabilité

Checklist: une liste simple de taxons présents dans une région donnée

Specimens and natural history collection materials

Spécimens et échantillons issus de collections d’histoire naturelle

Specimens and materials

Preserved specimens in formol, alcohol (fishes, herpetology collections…); mounted specimens (birds, mammals, insects)

Fossils and other paleontological materials (amber, teeth, bones…); animal or vegetal samples (DNA, organs, skin, fur, faeces…)

Herbarium sheets and vegetal materials (seeds, foliage, branches, bark, dried/preserved fruits…)

Spécimens et échantillons

Spécimens conservés dans du formol, de l’alcool (collections de poissons, d’herpétologie...) ; spécimens montés (oiseaux, mammifères, insectes...)

Fossiles et autres matériels paléontologiques (ambre, dents, os…) ; échantillons animaux ou végétaux (ADN, organes, peaux, fourrures, faeces…)

Planches d’herbier et matériel végétal (graines, feuilles, branches, écorce, fruits séchés ou conservés…)

Literature

Littérature

Examples of literature documents

PhD or Master thesis

Reports and other written documents

Published or in press scientific articles

Exemples de documents de littérature

Thèses (PhD) et rapports de Master

Rapports et autres documents écrits

Articles scientifiques publiés ou sous presse

Fieldwork records and notes

Notes et enregistrements de terrain

Fieldwork records and notes

Logs, field notes with taxa observed or collected; notes about the protocol used on the field

Citizen science logs

Surveys, assessments

Notes et enregistrements de terrain

Carnets de terrain, fiches et listes de taxons observés ou collectés, notes sur le(s) protocole(s) utilisé(s) sur le terrain

Données de sciences participatives

Enquêtes, études d’impact

Other origins of data

Autres origines possibles de données

Other origins of data

Paper maps or atlas; prints of satellite pictures

Other supports: pictures, audio, video recordings

Remote sensing data: GPS, radar or satellite data; camera traps;

Autres origines possibles de données

Cartes papier et atlas ; impressions d’images satellites

Autres supports : photos, enregistrements audio ou vidéo

Données obtenues à distance : GPS, données radar ou satellite, pièges photo/caméra

Results of the pre-workshop questionnaire (origins of data)

Résultats du questionnaire pré-atelier (origines des données)

Datasets managed by the training participants (by origin of data)

Dat

a or

igin

s fro

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artic

ipan

ts

Jeux de données gérés par les participants à l’atelier (par origines de données)

Orig

ines

des

don

nées

des

par

tcip

ants

Datasets managed by the training participants (by taxa)

Dat

a or

igin

s fro

m p

artic

ipan

ts

Jeux de données gérés par les participants à l’atelier (par taxons)

Orig

ines

des

don

nées

des

par

tcip

ants

Databases management and sharing (1 / 2)D

ata

orig

ins

from

par

ticip

ants

Gestion et partage des bases de données (1 / 2)D

ata

orig

ins

from

par

ticip

ants

Databases management and sharing (2 / 2)D

ata

orig

ins

from

par

ticip

ants

Gestion et partage des bases de données (2 / 2)D

ata

orig

ins

from

par

ticip

ants

Origins of data and Darwin Core concepts

Origines de données et concepts Darwin Core

Darwin Core standard: Cores and ExtensionsD

ata

orig

ins

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Dar

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Cor

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Darwin Core : Coeurs de standard et ExtensionsO

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Dw

C

Darwin Core standard: Cores and ExtensionsD

ata

orig

ins

and

Dar

win

Cor

e

Darwin Core standard = Core of standard + possible Extensions (star schema)

Different Cores can be used depending on the origin of the data:- Occurrence Core for natural history collection specimens and field simple

observations- Taxon Core for taxonomical lists (checklists, redlists)- Event Core for sampling events (surveys, transects, quadrats, traps…)

Extensions are used for giving more details about the data:- Simple Multimedia Extension for exchanging metadata about multimedia

resources, in particular links to image, video and audio files.- Taxon Description to exchange simple text/paragraph based taxon

descriptions.- Measurement or Facts to add information about biotic and abiotic variables- Trait descriptor- Material sample- And many more!

NOTE: Some Cores can be used as extensions too, such as the Occurrence one that can be used in addition to the Event Core.

Standard Darwin Core : Coeurs de standard et extensions

Orig

ines

de

donn

ées

et D

wC

Standard Darwin Core = Coeur de standard + éventuelles Extensions (schéma en étoile)

Différents coeurs de standard peuvent être utilisés en fonction de l’origine des données :- Coeur de standard Occurrence Core pour les collections d’Histoire Naturelle et les

observations simples de terrain- Coeur de standard Taxon pour les listes taxonomiques (référentiels, listes rouges,...)- Coeur de standard Événement (Event Core) pour les données d’échantillonnage

(relevés, transects, quadrats, pièges…)

Les Extensions sont utilisées afin de partager plus de détails sur les données :- Simple Multimedia Extension pour échanger des métadonnées sur les ressources

multimédia associées aux données, notamment des fichiers image, audio ou vidéos- Taxon Description pour échanger des descriptions de taxons sous forme de texte simple.- Measurement or Facts pour ajouter des informations sur des variables biotiques (taille,

couleur des fleurs…) ou abiotiques (pH, température de l’eau, hygrométrie…)- Description de traits d’histoire de vie- Material Sample pour décrire des échantillons (peau, os, ADN…)- Et plus encore !

NOTE: Certains coeurs de standard peuvent être utilisés comme des Extensions, comme le coeur de standard Occurrence qui peut être lié au coeur de standard Événement.

Occurrence core

Coeur de standard Occurrences

Choose the Occurrence Core on the IPTO

ccur

renc

e C

ore

Choisir le coeur de standard Occurrence sur l’IPTO

ccur

renc

e C

ore

Mapping for Occurrence DataO

ccur

renc

e C

ore

Mapping pour les données d’OccurrenceO

ccur

renc

e C

ore

Taxon Core

Coeur de standard Taxon

Choose the Taxon Core on the IPTTa

xon

Cor

e

Choisir le coeur de standard Taxon sur l’IPTTa

xon

Cor

e

Mapping for Taxonomic DataTa

xon

Cor

e

Mapping pour les données taxonomiquesTa

xon

Cor

e

Event Core

Coeur de standard Evénement d’échantillonnage

Choose the Event Core on the IPTE

vent

Cor

e

Choisir le coeur de standard Événement sur l’IPTE

vent

Cor

e

Mapping for Event Core (Sampling Data)E

vent

Cor

e

Mapping pour les données d’échantillonnageE

vent

Cor

e

Darwin Core Extensions

Extensions du Darwin Core

Where to find the ExtensionsD

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Ext

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Où trouver les ExtensionsE

xten

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Dar

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Cor

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A few examples of existing ExtensionsD

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Quelques exemples d’Extensions disponiblesE

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Dar

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Cor

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