diagnostik schieht. die erhöhte dna-dna-hybrid-stabilität er- · research product news...

APRIL 2011 DIAGNOSTIK ....................................... 1 IMMUNOLOGIE ................................... 4 ZELLKULTUR ...................................... 7 GERÄTE ............................................ 10

Szabo-Scandic _______________________________________________________________________________________________________________________

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DIAGNOSTIK

Unsere Partnerfirma NANOGEN ADVANCED

DIAGNOSTICS, die zur Gruppe ELITech gehört, hat

die Produktpalette erweitert und viele der Real-Time

PCR Kits verbessert und erneuert.

Hintergrund:

Die Sonden sind nun nicht mehr TaqMan-Sonden

sondern Hybridisierungs-Sonden namens ELITe

MGB.

ELITe MGB™ Sonden sind für folgende Technologien

entwickelt: MGBTM, SuperbasesTM und Eclipse®Dark

Quencher. Diese Kombination ermöglicht erhöhte

Sensitivität, Spezifität und einen niedrigen Fluores-

zenz-Hintergrund.

MGB™ ist ein Molekül, das an den „Minor Groo-

ve“ der Doppel Strang DNA bindet. Diese Verbin-

dung erhöht die Stabilität der Hybridisierung, die

zwischen der Sonde und der amplifizierten DNA ge-

schieht. Die erhöhte DNA-DNA-Hybrid-Stabilität er-

möglicht eine Entwicklung von kurzen Sonden mit

hoher Spezifität (Kumar et al, 1998 NAR 26: 831-

838).

ELITe MGB™ Sonden sind kurze, übereinander

greifende Sonden, die molekulare Sequenzen rasch

detektieren sowie genaue und spezifische Ergebnisse

liefern. Weiters erhöht die Spezifität von ELITe

MGBTM Sonden die Möglichkeit, zwischen einem

perfekten „Match“ und „Mismatch“ in den Targets,

verglichen mit einer analogen MGB-freien längeren

Sonde, zu unterscheiden.

SuperbasesTM sind chemisch ausgeführte Nitro-

genbasen, deren Verwendung die Sonden mit vielen

vorteilhaften Eigenschaften ausstattet, z.B. stabile

Hybridisierungsreaktion, die Hybridisierung findet

auch im Falle von Mutationen statt, keine Unter-

schiede in Tm beim Auftreten von „Mismatch“, glei-

che Affinität für alle Basen uvm.

Die Eclipse® Dark Quencher der ELITe MGBTM Son-

den können die emittierte Fluoreszenz von vielen

Fluorophoren blockieren und ermöglichen somit eine

rauschfreie Amplifikation.

Funktion der Sonden:

Bei der Amplifikation mit ELITe MGB™ Sonden wer-

den die Sonden nicht hydrolysiert, was anschließend

eine Schmelzkurvenanalyse ermöglicht.

ELITe MGB™ Sonden verwenden einen 3-Phasen

Amplifikationszyklus (siehe Abbildung):

Denaturation: Die Sonde ist frei in der Lösung

und es wird keine Fluoreszenz emittiert

Hybridisierung: Die Sonde bindet das DNA-

Template, der Reporter ist somit weit weg von

dem Dark Quencher und Fluoreszenz wird emit-

tiert.

Research Product NEWS ___________________________________________________________________________________________DIAGNOSTIK

2 _______________________________________________________________________________________________________________________ Szabo-Scandic

Extension: Während der DNA-Polymerisation

wird die Sonde von dem Target gespaltet ohne

hydrolysiert zu werden.

Eigenschaften und Vorteile der ELITe

MGBTM-Kits:

Fortgeschrittene Technologie: MGB™, Eclipse®

Dark Quencher und SuperbasesTM

Monoreagenz Format

Verkürzte Handhabung:

Gebrauchsfertiger Amplifikationsmix

Erhöhte Sensitivität: 20 µl Amplifikations-

mix + 20 µl extrahierte Probe.

Lagerung bei -20°C

(3 x Einfrieren-Auftauen möglich)

Gleichmäßige Amplifikationskonditionen

Genaue Ergebnisse: Interne Kontrolle, UNG En-

zym, Standard-Kurve

ELITe-Produkte beinhalten eine interne Kon-

trolle und den UNG anti-Verschleppungs-

Bauteil um verlässliche Ergebnisse zu

erhalten

Eine externe Standard-Kurve ermöglicht

genaue Quantifizierung des Targets

ELITe MGB Schmelzkurven Analyse:

Die Schmelzkurven Analyse besteht aus einem gra-

duellen Heizprozess wobei Fluoreszenz fortlaufend

detektiert wird. Während der ersten Stufe werden

bei niedriger Temperatur die ELITe MGB Sonden zu

single strand DNA hybridisiert. Hier werden die

Rohdaten der Fluoreszenz registriert. Bei Erhöhung

der Temperatur werden die ELITe MGB Sonden von

der DNA gelöst, sind frei in der Lösung und emittie-

ren keine Fluoreszenz, was zur Fluoreszenz-

Abnahme führt.

Die Software des Real Time PCR Geräts generiert

eine sigmoide Kurve Fluoreszenz vs. Temperatur.

Der Wendepunkt in der Graphik entspricht der

Schmelztemperatur (Tm). Die Tm wird mittels einer

weiteren Graphik (erste Ableitung) leicht erkennbar

und automatisch von der Software erkannt.

Vorteile der Schmelzkurven Analyse:

Ermöglicht die spezifische Determination der

Sonden-Amplikon-Hybrid Schmelztemperatur,

(Tm)

Ermöglicht die Identifikation von eventuellen

Mutanten Targets

Ermöglicht die Evaluierung der Zuverlässigkeit der

quantitativen Ergebnisse.

Sample 1,

Tm ~ 67°C, wild type

Sample 2,

Tm ~ 62°C, mutant

Erhältliche Produkte in ELITe MGB-

Format:

CMV, EBV, HSV1, HSV2, HHV6, HHV8, Parvovirus

B19, VZV, BKV, Adenovirus

Demnächst: Aspergillus, Chlamydia trachomatis und

MTB.

Im nächsten Newsletter erläutern wir weitere Neuig-

keiten bei NANOGEN ADVANCED DIAGNOSTICS.

Für weitere Informationen wenden Sie sich bitte an

Anna Ahlbom

Tel.: 01/4893961-58

[email protected]

DIAGNOSTIK___________________________________________________________________________________________Research Product NEWS

Szabo-Scandic ______________________________________________________________________________________________________________________

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Neuigkeiten zum Thema Clostridium difficile Dia-

gnostik von unserer Partner-Firma MERIDIAN

Bioscience Europe.

In den Guidelines der European Society of Clinical

Microbiology and Infectious Diseases (ESMID),

American Society for Microbiology (ASM) und Infec-

tious Diseases Society of America (IDSA) gemein-

sam mit der Society for Healthcare and Epidemiol-

ogy of America (SHEA) wird die Clostridium difficile

Diagnostik als Ein- oder Zwei-Stufen-Algorithmus

empfohlen.

Als alleinige Methode kann ein molekularer Test ein-

gesetzt werden.

Dazu können wir den molekularen illumigene

Clostridium difficile Test anbieten.

Über diesen Test haben wir schon ausführlich im

Newsletter April 2010 bzw. Oktober 2010 berich-

tet.

Als Zwei-Stufen-Algorithmus wird z.B. die Kombina-

tion einer Clostridium difficile GDH (Glutamat de-

hydrogenase) Bestimmung und der daraus resultie-

renden positiven Probe mittels eines molekularen

Clostridium difficile Tests empfohlen.

Für diese Variante können wir nun beide Tests an-

bieten, den GDH-Test und den obengenannten mo-

lekularen Test.

MERIDIAN Bioscience Europe hat, um die Produkt-

palette zu vervollständigen, das folgende Produkt auf

den Markt gebracht:

Premier C. difficile GDH ELISA für den

Nachweis von C. difficile Common Antigen

direkt aus Stuhlproben

Dieser ELISA liefert schnell, effizient und kosten-

günstig äußerst genaue Ergebnisse. Negative Ergeb-

nisse können in einer frühen Phase ausgeschlossen

werden. Der Negativ Predictive Value (NPV) liegt

bei 97%, die Sensitivität bei 94% und die Spezifität

bei 95%.

Die einfache Handhabung und Flexibilität erleich-

tert die Arbeit im Labor. Das schnelle (< 1 Stunde)

Protokoll spricht für sich. Die Auswertung erfolgt vi-

suell oder mittels Photometer.


Anna Ahlbom

Tel.: 01/4893961-58

[email protected]

NGAL-Test von DAKO - Methode zur schnellen Diagnose von akutem Nierenversagen

Der NGAL-Test, ein turbidimetrischer Assay, dient

zur schnellen quantitativen Bestimmung von NGAL

aus nur wenigen Tropfen humaner Urin- oder EDTA-

Plasma-Proben und kann auf vielen Plattformen,

z.B. Hitachi, Roche, Beckmann, Siemens und

Abbott programmiert werden.

Standardmethoden für die Diagnose von akuten

Nierenschäden beziehen sich meistens auf die Er-

mittlung der glomerulären Filtrationsrate (GFR) von

Cystatin C bzw. Kreatinin. Ein aussagekräftiger Wert

ist mit diesen Methoden erst nach 24-72 Stunden

ermittelbar, wodurch für die Einleitung therapeuti-

scher Maßnahmen kostbare Zeit verloren geht. Die

NGAL-Bestimmung ermöglicht bereits in einer frü-

hen Phase einer Nierenschädigung signifikante Mar-

ker-Werte zu messen.

Research Product NEWS _________________________________________________________________________________________IMMUNOLOGIE

4 _______________________________________________________________________________________________________________________ Szabo-Scandic

NGAL (neutrophil gelatinase-associated lipocalin,

Lipocalin-2, Siderocalin) ist ein neuer Biomarker für

akute Nierenschäden und wird in neutrophilen Gra-

nulozyten und in bestimmten Epithelien - z.B. den

Nierenkanälchen - expremiert. Bei Nierenschäden

steigt die Expression von NGAL in der Niere inner-

halb von 2 Stunden signifikant an und kann in Urin-

oder in Plasmaproben nachgewiesen werden. Stu-

dien haben gezeigt, dass bei 90% der Patienten

Werte über 350ng/mL einen Hinweis auf ein bevor-

stehendes Nierenversagen geben.

DAKK980111-2 The NGAL Test™ Reagent Kit

DAKK980211-2 The NGAL Test™ Calibrator Kit

DAKK980311-2 The NGAL Test™ Control Kit *A


Mag. Norbert Wahler

Tel.: 01/4893961-55

[email protected]

IMMUNOLOGIE

Formaldehyd freier RNA Gel Kit von CEDARLANE Laboratories

Die Verwendung von formaldehydfreier denaturie-

render Agarosegelelektrophorese für RNA bietet

grundlegende neue Vorteile.

Kein langes Inkubieren und kein Rezirkulieren des

Puffers mehr notwendig – Glyoxalfreie Formel

Keine Probenvorbereitung durch Denaturierung

und Probenfärbung in einem Schritt

Instant band visualization – geringer Hintergrund

und brilliantgrüne Banden OHNE der Verwendung

von Ethidium Bromid

Gefahrloses hantieren durch völlig formaldehyd-

freies Gel und Puffer

Kompatibel mit down-stream Applikationen inklu-

sive Northern Blots

Bestandteile des Kits:

Formaldehydfreie RNA Gellösung, 10X

Formaldehydfreier RNA Laufpuffer, 10X

Formaldehydfreier RNA Ladepuffer, 2X – inklusive

Bromphenolblau und Xylencyanol als Tracking

Dyes

Northern Blot Analyse von PGK1 mRNA

auf formaldehydfreiem RNA Gel

Abb. 1:

Gel A: 20 µg Hefe RNA

pro Spur aufgetragen auf

agarose/formaldehydfreiem

RNA Gel;

aufgetrennt bei 8V/cm.

Abb. 2:

Gel B: Banden wurden auf

eine Hybond N Membrane

übertragen und mit einem

radiomarkierten Oligo-

nukleotid über Nacht ge-

gen PGK1 mRNA inku-

biert.

Abb. 3:

Gel C: Membranen wurden

gestrippt und über Nacht

als Ladekontrolle mit ei-

nem Oligonukleotid gegen

SCR1 RNA geprüft.

1: untransformed control

2: High Copy PGK1 vector

3: Low Copy PGK1 vector

4: High Copy PGK1 vector

5: Low Copy PGK1 vector

IMMUNOLOGIE_________________________________________________________________________________________Research Product NEWS

Szabo-Scandic ______________________________________________________________________________________________________________________

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Abb. 4: Ethidiumbromid Färbung (linker Blot) im Ver-

gleich zu formaldehydfreiem RNA Dye (rechter Blot). Ge-

samt-RNA wurde von K562 Zellen extrahiert, die Proben

in formaldehydfreiem RNA Ladepuffer denaturiert, wobei

einer Ethidiumbromid enthielt, der andere den Formal-

dehydfreien RNA Dye und für 10 Minuten bei 65°C inku-

biert. Die Proben wurden auf einem 2%igen formalde-

hyfreiem RNA Agarosegel aufgetragen und für 1,5 Stun-

den bei 5,1 V/cm aufgetrennt.

Bestellinformation:

Kat.Nr. CEDN726-KIT

Preis: EUR 322,- (exkl. MWSt).


DI (FH) Manuel Rauner

Tel.: 01/4893961-30

[email protected]

Komplement Antikörper und Proteine von CEDARLANE Laboratories

CEDARLANE bietet sowohl zahlreiche Formate von

Reagenzien als auch eine umfangreiche Palette an

rekombinant hergestellten Proteinen und Antikörpern

an.

Angeboten werden Antikörper zu komplementären

Komponenten, Regulatoren und Rezeptoren, die

ebenfalls in verschiedensten Formaten (Fluorochro-

me, Biotin, HRP) und gereinigt erhältlich sind.

Abb. 1: Färbung eines Paraffinschnitts (formalinfixiert)

von humanem Plazentagewebe unter Verwendung von

purified anti-Human Complement Component C4b

(KatNr. CEDCL2154AP) bei einer Verdünnung von

20 µg/mL.

Abb. 2: Färbung eines Paraffinschnitts (formalinfixiert)

von humanem Prostatagewebe unter Verwendung von

purified anti-Human Factor H (Kat.Nr. CEDCL7672AP).

Abb. 3: Färbung eines Kryoschnitts von Rattenmilz unter

Verwendung von purified anti-rat Crry (Clone 512)

(Kat.Nr. CL064AP) bei einer Konzentration von 0,1

µg/mL. Vergrößerung ca. 150x.

Research Product NEWS _________________________________________________________________________________________IMMUNOLOGIE

6 _______________________________________________________________________________________________________________________ Szabo-Scandic

Abb. 4: humane RBCs mit komplement Antikörper CD59

FITC (Protectin) (KatNr. CL7673F) gefärbt. Schwarze Li-

nie: Mouse IgG1; Grüne Kurve: Kat.Nr. CL7673F

Abb. 5: Färbung eines Paraffinschnittes (formalinfixiert)

einer Hautbiopsie (4 µm) bei Läsion des frühen Pemphi-

gus vulgaris (ohne Blasenformation). Färbung mit anti-

C3d complement Antikörper (Kat.Nr. CL2904AP) weist

starkes, positives intraepidermales interzelluläres immu-

nostaining auf.



Tel.: 01/4893961-30

[email protected]

Neuer 2011 Produktkatalog von SANTA CRUZ jetzt bei Szabo-Scandic erhältlich

Wie jedes Jahr liegt auch heuer wieder bei SZABO-

SCANDIC der aktuelle SANTA CRUZ Biotechnology

Katalog 2011 auf.

Unter anderem sind darin zu finden:

Über 51.580 charakterisierte Primärantikörper

(16.720 monoklonale und 34.860 polyklonale

Antikörper)

siRNA, shRNA Plasmide und Lentivirale Partikel

zur Regulation bzw. Inaktivierung aller (100%)

bekannten humanen und murinen Gene

Über 3.360 humane und 3.175 Maus trans-

fizierte Zelllysate zur Western Blot Antikörper-

evaluierung

Über 141.000 ChemCruz Produkte (Biochemika-

lien für die Anwendung im Bereich Biomedizin,

Life Science, Molekularbiologie und Proteomics)

Die Kataloge werden derzeit ausgeschickt. Sollten

Sie in den nächsten 2 Wochen keinen bekommen

haben, kontaktieren Sie uns bitte!

Wir schicken Ihnen gerne ein Exemplar zu.



Tel.: 01/4893961-30

[email protected]

ZELLKULTUR___________________________________________________________________________________________Research Product NEWS

Szabo-Scandic ______________________________________________________________________________________________________________________

7

ZELLKULTUR

Mikrotiterplatten für die Fluoreszenz

Fluoreszenzanwendungen haben in den letzten Jah-

ren immer mehr an Bedeutung gewonnen. Entschei-

dend für den Erfolg Ihrer Arbeit und Experimente auf

diesem Gebiet ist einerseits die Wahl des richtigen

Readers. Unsere Partnerfirma BIOTEK ist einer der

führenden Hersteller von Geräten rund um die

Mikrotiterplatte. Andererseits ist es unbedingt not-

wendig auf qualitativ hochwertige Platten zurückzu-

greifen. Hier bietet unser Lieferant CORNING in der

Zwischenzeit ein breites Spektrum an Platten an, die

für den Bereich Fluoreszenz bestens geeignet sind.

Prinzipiell sollten für Arbeiten mit Fluoreszenz nicht

klare, sondern „eingefärbte“ Platten, in den meisten

Fällen schwarze Platten verwendet werden. Schwar-

ze Platten, zumeist aus Polystyrol, wurden entwi-

ckelt, um den Crosstalk von Well zu Well und das

Hintergrundrauschen bei einem Fluoreszenz Assay

zu reduzieren.

Es gibt einige grundlegende Regeln bei der Auswahl

der richtigen Platte:

Im Falle einer homogenen Lösung und einem

nicht zellbasierten Assay sollten schwarze Platten

verwendet werden. Gelesen wird von oben (Top-

Reading)

Bei einem zellbasierten Assay sollten schwarze

Platten mit und ohne Klarboden verglichen wer-

den. Gewöhnlich wird von unten gelesen

(Bottom-Reading) um ein besseres Signal-

Rauschen-Verhältnis zu erreichen

Falls nötig können Glasbodenplatten einen niedri-

geren Background bringen

Für Zellen in Suspension sollten die Ergebnisse

von Top- und Bottom-Reading verglichen werden

Als Entscheidungshilfe für Sie im Folgenden eine

Auswahl an CORNING Platten mit Kommentaren

und Erfahrungswerten unseres Lieferanten BIOTEK:

COS3915

Schwarze Platte mit Flachboden, von oben zu le-

sen

Einsatzbar für alle Wellenlängen, vor allem auch

unter 400nm

Gut für Standard Assays, nicht für Zellkultur oder

Immunoassays geeignet, ausgezeichnet für DNA

Quantifizierung mit Hoechst 33258, Picogreen

oder Ribogreen und GFP Assays mit lysierten Zel-

len

COS3694

Half Area (low volume) Version der oben be-

schriebenen COS3915

Gleiche Verwendung und Eigenschaften wie

COS3915

COS3914

Schwarze 8-well Strip-Variante der COS3915


COS3915

COS3615

Schwarze Platte mit extra dünnem, flachem Klar-

boden (Special Optics), von oben oder unten zu

lesen

Verwendbar für alle Wellenlängen, vor allem auch

über 400nm

Gut für Standard Assays, nicht für Zellkultur oder

Immunoassays geeignet

Diese Platte ist für den überwiegenden Teil der

Anwendungen geeignet

Höherer Background als Platten mit schwarzem

Boden, bei Exzitationswellenlängen unter 400nm

von unten

Verwendungsmöglichkeit: ORAC Assays, lange

kinetische Assays, die einer Abdeckung bedürfen,

Research Product NEWS __________________________________________________________________________________________ZELLKULTUR

8 _______________________________________________________________________________________________________________________ Szabo-Scandic

einige DNA Quantifizierungen mit Picogreen.

Normalerweise werden für DNA Quantifizierungen

mit Picogreen Platten mit schwarzem Boden ver-

wendet, einige Anwender berichteten aber von

der Notwendigkeit von zu unten lesen

COS3631 ist die vergleichbare Platte mit höhe-

rem Background, da sie einen dickeren Boden hat

COS3925

Schwarze Platte mit Flachboden und „high bin-

ding“ Oberfläche, von oben zu lesen

Einsetzbar für alle Wellenlängen, vor allem auch

unter 400nm

Verwendbar für Immunoassays

COS3924

Schwarze 8-well Strip-Variante der COS3925


COS3925

COS3916

Schwarze Platte mit Flachboden und Zellkultur-

behandlung


unter 400nm

Von oben nach Entfernung des Deckels zu lesen

COS3614

Schwarze Platte mit extra dünnem, flachem Klar-

boden (Special Optics), zellkulturbehandelt, von

oben oder unten zu lesen

Verwendbar für alle Wellenlängen, vor allem auch

über 400nm

Sehr gut verwendbar für GFP Assays mit leben-

den Zellen. Die Platte kann mit aufgesetztem De-

ckel von unten gelesen werden



von unten

Sollte unter 400nm angeregt werden müssen ha-

ben nur Platten mit Glasboden einen niedrigen

Background

COS3603 ist die vergleichbare Platte mit höhe-

rem Background, da sie einen dickeren Boden hat

COR3340

Schwarze Platte mit klarem Flachboden,

CORNING CellBIND Zellkultur Behandlung, zu le-

sen von unten und von oben

CellBIND verbessert vielfach die Anheftung von

schwer adhärierenden Zellen und ist eine Be-

handlung, keine Beschichtung

Höherer Background als Platten mit Special

Optics Boden

Einsetzbar für alle Wellenlängen, vor allem über

400nm



von unten

CellBIND Oberfläche ist auch in anderen Platten-

formaten (6-well bis 384-well) verfügbar

COS3601

Schwarze Platte mit klarem Flachboden, „high

binding“ Oberfläche, zu lesen von unten und von

oben


über 400nm

Verwendbar für Immunoassays wie ELISA



von unten

COS3635

Klare Flachboden-UV Platte, zu lesen von unten

und von oben

Sehr niedriger Background, allerdings etwas mehr

als schwarze Platten

Verwendbar für alle Wellenlängen, vor allem unter

300nm

Hauptzweck der Platte ist die Lesbarkeit im UV

Bereich bis hinunter auf 215nm

Auch verwendbar als gewöhnliche Assay Platte,

nicht für Zellkultur und Immunoassays

ZELLKULTUR___________________________________________________________________________________________Research Product NEWS

Szabo-Scandic ______________________________________________________________________________________________________________________

9

COS3356

Schwarze Rundbodenplatten aus Polypropylen,

von oben zu lesen


unter 400nm

Verwendbar für Assays, nicht für Zellkultur oder

Immunoassays

Etwas höherer Background als COS3915

Polypropylen ist kompatibel mit vielen organi-

schen Lösungsmitteln (z.B. DMSO)

CORNING - diverse Zellkulturplatten

6-48 Well

Zahlreiche Varianten von Platten wie COS3506,

COS3512, COS3524 und COS3548

Das Lesen von 6-, 12- und 24 Well-Platten erfor-

dert häufig einen Scan von unten. Um die opti-

sche Verteilung zu bestimmen sollte an mehreren

Stellen im Well gemessen werden. Der 5mm op-

tische Lichtleiter der BIOTEK Fluoreszenz-Reader

deckt eine Fläche mit 6,5mm Durchmesser ab.

Im Vergleich dazu verfügen andere Reader oft nur

über eine Lesefläche von 1 bis 1,5mm im

Durchmesser

Aufgrund des verwendeten Materials (klares Poly-

styrol) sind diese Platten nicht optimal für Fluo-

reszenzmessungen. Auch ist der Boden dicker als

der der entsprechenden 96 Well-Platten, folglich

kann auch der Background hoch sein, besonders

wenn von unten gelesen wird. Trotzdem werden

diese Platten von vielen Anwendern erfolgreich für

Fluoreszenzmessungen im Zellkulturbereich ver-

wendet

COS3912

Weiße Flachbodenplatte, von oben zu lesen


unter 400nm

Höherer Background als schwarze Platten, aber

niedrigerer Background als klare Platten

Nicht geeignet für Immunoassays und Zellkultur

Hauptanwendung ist die Lumineszenz, im Fluo-

reszenzbereich können weiße Platten für Time

Resolved Fluoreszenz, HTRF und Assays, die un-

ter 400nm anregen müssen verwendet werden

MAT4951

Schwarze Platte mit Glasboden, von unten und

oben zu lesen

Besonders niedriger Background

Besonders gute Performance bei Anwendungen

wie Laser Induced Fluorescence (LIF), Fluores-

cence Correlation Spectroscopy (FCS) oder Fluo-

rescent Polarization (FP)

Auch erhältlich als sterile Variante mit Deckel

(MAT4952)

Hersteller dieser Platte ist unser Lieferant Matrix

Wir stehen Ihnen gerne für alle weiteren Fragen zu

Verfügung. Darüber hinaus können wir Muster der

einzelnen Platte besorgen sowie Demogeräte bereit-

stellen.


Dr. Andreas Bergmann

Tel.: 01/4893961-40

[email protected]

Research Product NEWS ______________________________________________________________________________________________GERÄTE

10 _______________________________________________________________________________________________________________________ Szabo-Scandic

GERÄTE

BioShake – Ultraschnelle Mixer bzw. Thermomixer für kleine und kleinste Volumi-na in Mikrotiterplatten und Probengefäßen

Die BioShake-Serie ermöglicht erstmals hochpräzi-

ses und effizientes Mischen im Mikrotitermaßstab

für einen großen Applikationsbereich. Assays in

Mikrotiterplatten oder Probengefäßen können schnell

und sicher mit einstellbaren Geschwindigkeiten von

200 bis 3.000 U/min realisiert werden. Dabei ist

die BioShake-Mischtechnologie deutlich robuster,

vibrationsfreier und wartungsärmer als klassische

Schüttler.

Mischfrequenz bis 3.000 U/min

Für Mikrotiterplatten, PCR-Platten, Deep-Well-

Platten, Tubes und Glasfläschchen geeignet

Kundenspezifische Adapter auf Anfrage

Integrierte Vortex- und Short-Mix-Funktionen

3D-Shake-Control: schnelles orbitales und pro-

benschonendes Mischen

Anti-Spill-Technologie: kontrollierte planare

Mischbewegungen

Anti-Vibrationstechnologie: sehr hohe Laufruhe

ohne vibrieren und klappern

Einsparung zeitraubender Zentrifugationsschritte

nach dem Mischen

Kompakte Leichtbauweise in edler Aluminium-

ausführung

Die Bedienung des BioShake XP und BioShake iQ

erfolgt über Direktwähltasten. Zusätzlich können

durch 2 wählbare Programmtasten Zeitabläufe und

Mischbewegungen aktiviert, gespeichert und somit

komplexe Applikationen durchgeführt werden. Dies

eröffnet eine ganz neue Sichtweise auf die tägliche

Laborarbeit und optimiert bisherige Standardrouti-

nen erheblich.

Der BioShake iQ ist der High-End-Thermoshaker

der BioShake-Serie. Zusätzlich zu den Spezifikatio-

nen des BioShake XP überzeugt der BioShake iQ

durch den Einsatz einer sehr genauen Temperier-

technologie. Die Temperaturen sind ausgehend von

der Raumtemperatur bis 99°C in 0,1°C Schritten

wählbar. Die Temperaturregelgenauigkeit beträgt +/-

0,1°C, wobei die homogene Temperaturverteilung

über alle Probengefäße immer besser als +/- 1,0°C

ist.

Für die BioShake-Serie sind zusätzlich eine Viel-

zahl an standardisierten und spezifischen Adapter-

platten und Wechselblöcken erhältlich. Die Adapter

gewährleisten eine optimale Anpassung an Stan-

dard-Tubes, Lysis-Tubes, Mikrotiterplatten, Deep-

Well-Platten, Glasfläschchen und andere Probenge-

fäße.


Mag. Norbert Wahler

Tel.: 01/4893961-55

[email protected]

Elektrophorese Eco-Line

Glasplatten mit fixierten Spacern

Modulares Tanksystem für PAGE-Elektrophorese

und Blotting

Integrierte Kühloption

Gelgießsystem für 1 oder 2 Gele

Beide Größen des modularen Tanksystems der Eco-

Linie sind für eine Vielzahl von Auftrennungstechni-

ken einsetzbar. Hierzu gehören, z.B., SDS-PAGE,

sowie native, präparative Gradienten-Elektrophorese

und Blotting-Applikationen. Eco-Mini und Eco-Maxi

sind ausgelegt für die simultane Auftrennung in 1

oder 2 Gelen.

GERÄTE_______________________________________________________________________________________________Research Product NEWS

Szabo-Scandic ______________________________________________________________________________________________________________________

11

Das Elektrophorese Modul ist dank integrierter, spe-

zieller Seitenklammern einfach in der Handhabung

und garantiert in Verbindung mit dem Gelgießstand

ein auslaufsicheres System für das Gießen von Ge-

len. Nach dem Polymerisieren der Gele wird das

Elektrophorese-Modul zusammen mit den Glasplat-

ten-Sandwiches in den Puffertank eingesetzt und

bildet hier die „obere“ Pufferkammer. Austauschbare

Module ermöglichen den Wechsel zwischen

Elektrophorese und Tank-Blotting.

Eco-Mini, PAGE-Elektrophoresesystem

Modulares Tanksystem für PAGE-Elektrophorese

und Blotting

Gelgröße 9,4 cm x 8 cm (B x L)

Doppel-Gel-System

Geeignet für gegossene Gele und für die meisten

handelsüblichen Pre-Cast Fertiggele

Gelgießstand für 1 oder 2 Gele

Kühloption (integriertes Wasserzirkulationssys-

tem)

Eco-Mini ist sowohl mit selbst gegossenen Gelen, als

auch mit den meisten Fertiggelen kompatibel. In das

Elektrophorese-Modul können Glasplatten mit

10,5 cm bis 11 cm Breite und einer Länge bis zu

11 cm eingesetzt werden. Eco-Mini ist kompatibel

mit den Glasplatten von Minigel und Minigel-Twin

(beide BIOMETRA).

Die Puffertanks EB (ohne Kühloption) und EBC

(mit Kühloption) sind kompatibel mit dem Blot-

Modul für Tankblot Eco-Mini. Für Tank-Blotting An-

wendungen unter kontrollierten Temperaturbedin-

gungen sollte möglichst der Puffertank mit integrier-

ter Kühloption (EBC) verwendet werden.

Der Bigfoot-Sicherheitsdeckel ermöglicht durch

seinen speziellen Fuß eine platzsparende und siche-

re Aufbewahrung des Deckels wenn dieser nicht auf

dem Puffertank sitzt.

Gelgießstand für Eco-Mini

Der Gelgießstand ermöglicht den einfachen, schnel-

len und auslaufsicheren Aufbau von 1 oder 2 Glas-

platten-Sandwiches. Als Vorbereitung zum Gießen

der Gele werden 1 oder 2 Glasplatten-Sandwiches

in das Elektrophorese-Modul eingesetzt und mittels

seitlicher Klammern fixiert. Da die Spacer perma-

nent auf einer Glasplatte fixiert sind, entfällt der

Schritt des mühsamen Positionierens und Ausrich-

ten der Spacer.


12 _______________________________________________________________________________________________________________________ Szabo-Scandic

Anschließend werden das Elektrophorese-Modul und

die fixierten Glasplatten in den Gelgießstand einge-

setzt und mittels zweier Exzenterschrauben einfach

fixiert. Durch die Verwendung eines einzigartigen

high-tech Materials für die Dichtungen im Gel-

gießstand und spezieller Rutschhemmung in den

Seitenklammern des Elektrophorese-Moduls ist die

Auslaufsicherheit garantiert. Nach der Polymerisati-

on der Gele wird der komplette Aufbau aus

Elektrophorese-Modul und Glasplatten-Sandwiches

aus dem Gelgießstand entnommen und in den Puf-

fertank eingesetzt.

Eco-Maxi, PAGE-Elektrophoresesystem

Gelgröße 19,4 cm x 18,5 cm (B x L)

Doppel-Gel-System

Bigfoot-Sicherheitsabdeckung

Gelgießstand für 1 oder 2 Gele

Kühloption (integriertes Wasserzirkulationssys-

tem)

Eco-Maxi ist für die Verwendung von Glasplatten mit

einer Breite von 21 cm und einer Länge bis zu 20

cm ausgelegt. Weiterhin ist die Eco-Maxi mit den

Glasplatten des Maxigels (BIOMETRA) kompatibel.

Für die elektrophoretische Auftrennung unter kon-

trollierten Temperaturbedingungen wird er Einsatz

des Puffertanks EBC mit integrierter Kühloption

(Wasserzirkulationssystem) empfohlen. Hierdurch

wird das generelle Problem von Smiling-Effekten

und ineffizientere Bandentrennung bei größeren Ge-

len, verursacht durch starke Wärmeentwicklung, zu-

verlässig vermieden.


Mag. Norbert Wahler

Tel.: 01/4893961-55

[email protected]

TOptical – real time PCR System mit maximaler Flexibilität

Modulares Blockkonzept

Der TOptical setzt sich aus der Basiseinheit des

TProfessional Thermocyclers und dem TOptical Mo-

dul zusammen. Dieses modulare System ermöglicht

die Aufrüstung von bestehenden TProfessional

Thermocyclern durch das TOptical Modul zum

hochwertigen Real-Time-PCR-Gerät. Für herkömmli-

che PCR-Anwendungen stehen fünf verschiedene

Blockmodule, angefangen von 0,5mL Reaktionsge-

fäßen bis hin zur 384well Platte zur Verfügung.


Szabo-Scandic ______________________________________________________________________________________________________________________

13

Optionale Gradientenfunktion

Die richtige Annealingtemperatur zu finden ist gera-

de für Real-Time-PCR-Ansätze von wichtiger Bedeu-

tung. Oft werden zeitaufwendige Testläufe nur ein-

geschränkt durchgeführt, wodurch suboptimale Er-

gebnisse unter Routine-Bedingungen zustande

kommen. Um das Austesten von neuen Primerkom-

binationen in einem einzigen Lauf zu ermöglichen,

ist das TOptical-Modul optional mit einer Gradien-

tenfunktion erhältlich. Mit einer Gradientenspanne

von 40°C und dem Linear Gradient Tool zur Pro-

grammierung von gleich großen Temperaturabstän-

den bleiben keine Wünsche hinsichtlich der Opti-

mierungsmöglichkeiten von Real-Time-PCR-

Experimenten offen. Neue Primerpaare mit unbe-

kannten Annealingtemperaturen können schnell ge-

testet und neue Protokolle innerhalb kürzester Zeit

optimiert werden.

Flexible Filterausstattung

Das patentierte optische System des TOptical Ther-

mocyclers ist mit einem Filterrad für 6 Farbfiltermo-

dule ausgestattet. Die Ausstattung mit Farbfiltermo-

dulen lässt sich frei konfigurieren. Weiterhin kann

das System auch nachträglich aufgerüstet und somit

das Einsatzspektrum erweitert werden. Insgesamt

stehen 10 verschiedene Farbfiltermodule zur Aus-

wahl, mit denen sich das gesamte Spektrum ge-

wöhnlich verwendeter Real-Time-PCR-

Anwendungen (vom blauen bis zum roten Absorpti-

onsbereich) abdecken lässt.

Filter Wellenlänge (Abs. / Em.)

Farbstoffe

TOptical Filter Module 1

470/520nm FAM, SYBR Green, Alexa488


470/545nm JOE, VIC, HEX, Yakima Yellow


535/580nm TAMRA, DFO, Alexa 546, NED


565/605nm ROX, TexasRed, Cy3.5


630/670nm Cy5, Alexa 633, Quasar 670


660/705nm LightCycler Red 705, Alexa 680

TOptical FRET Module 1

470/580nm FAM/TAMRA


470/670nm FAM/Cy5


470/705nm FAM/Cy5.5


515/670nm JOE/Cy5


14 _______________________________________________________________________________________________________________________ Szabo-Scandic

LED Technologie

Die Anregung der Fluoreszenzfarbstoffe erfolgt über

drei LEDs in den Farben blau, weiß und rot. Die

Kombination dieser Lichtquellen erlaubt eine opti-

male Anregung der Fluoreszenzfarbstoffe über einen

weiten Spektralbereich. Anders als mit „wide blue“

LEDs lassen sich insbesondere der kurzwellige blaue

und der langwellige rote Bereich bestens anregen. In

Verbindung mit Hochleistungs-Optikfasern und ei-

nem hoch-sensitiven Channel Photo Multiplier wer-

den Intensitätsverluste in der Quantenausbeute ver-

mieden und die maximale Sensitivität sichergestellt.

Bedingt durch die Einzelanregung jedes Wells ist

zudem die Verwendung von passiven Referenzfarb-

stoffen überflüssig, was das Multiplexing mit bis zu

6 Farbstoffen erlaubt. Die Langlebigkeit der LEDs

macht einen regelmäßigen Austausch der Lichtquel-

le überflüssig und hilft damit wiederkehrende Folge-

kosten zu vermeiden.

Software

Der TOptical wird über die qPCRsoft-Software ange-

steuert. Bei der Entwicklung der Software wurde

insbesondere auf leichte Bedienbarkeit und über-

sichtliche Anordnung der Funktionselemente geach-

tet. Die Software enthält die gleiche tabellarische

bzw. graphische Programmierfunktion wie der TPro-

fessional Thermocycler. Informationen zu den Pro-

ben lassen sich in einem übersichtlichen Platten-

schema leicht eingeben und auf einen Blick erfas-

sen. Typische Auswertemethoden der Real-Time

PCR wie der absoluten und relativen Quantifizie-

rung, delta-delta Ct-Methode und Effizienzberech-

nung sind in die Software integriert. Darüber hinaus

sind Export-Tools für weitere externe Analysenpro-

gramme wie Excel, REST und qBASE vorhanden.


Mag. Norbert Wahler

Tel.: 01/4893961-55

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Take3 – Proben im Mikro-volumen-Maßstab einfach und schnell gemessen

Moderne Life-Science-Labors benötigen Mikroti-

terplatten-Detektionssysteme mit hoher Flexibilität,

um die Anforderungen verschiedener Benutzer und

diverser Assays erfüllen zu können.

Die Miniaturisierung von Assays gerät immer

mehr in den Interessensmittelpunkt, um Kosten von

Reagenzien und Probenvolumina zu reduzieren.

Während Assay-Miniaturisierung in Mikrotiterplatten

teilweise durch Verwendung von High-Through-Put-

Plattenformaten erreicht werden kann, stehen für die

Quantifizierung von Nukleinsäuren und Protein-

Proben nur wenige Hilfsmittel zur Verfügung.

Die Kombination aus Spektralphotometer und der

Take3 Multivolumen-Platte ergibt ein System, das

dem Anwender ermöglicht, Konzentration von DNA-

Proben bereits ab 2 µL zu bestimmen. Eine Vielzahl

an Assays mit unterschiedlichen Probengefäßen und

Probenmengen können in der Take3-Platte durchge-

führt werden.

Eigenschaften

16 x 2µL Proben Microspots auf einer Quarzglas-

oberfläche

1 Standard-Küvette und 2 BioCell Messpositionen

Kompatibel mit BIOTEK´s Epoch, PowerWave

XS2 und mit allen Synergy Readern

Möglichkeit der Messung in Absorbanz und Fluo-

reszenz

Vorgefertigte Messprotokolle im Gen5-Take3-

Modul

Einfache Reinigung der Quarzglasoberfläche


Szabo-Scandic ______________________________________________________________________________________________________________________

15

Applikationen

Quantifizierung von Nukleinsäuren im

Mikrovolumen

Quantifizierung von Proteinen im Mikrovolumen

In-situ fluorometrische Proteinquantifizierung

In-situ BCA-Assays

Spectral Scanning von einzelnen oder mehreren

“low volume” Proben

Konzentrationsbestimmung von

Fluoreszenzfarbstoffen

Genexpressionsassays

Zellkulturmessungen

Endpunkt- und Kinetic Assays


Dipl.Ing. Danut Laes

Tel.: 01/4893961-43

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oder an

Mag. Norbert Wahler

Tel.: 01/4893961-55

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Hybrid Reader von BIOTEK

Synergy H4 und Synergy H1 sind flexible Filter- und

Monochromatoren-Multi-Mode-Reader. Die Monoch-

romatoren entstammen der dritten Generation eines

Vierfach-Beugungsgitter-Designs, wodurch Wellen-

längen in 1 nm Schritten eingestellt werden können.

Die moderne optische Architektur unterstützt Top-

und Bottom- Fluoreszenzintensität, UV-VIS-

Absorbanz sowie High-Performance-Lumineszenz

Detektion.

Hybrid Technology™: kombiniert die Sensitivität

eines Filter-basierenden Geräts mit den Vorzügen

der Flexibilität der Monochromatoren-Optik, wo-

durch ein breites Spektrum an aktuellen Applika-

tionen abgedeckt werden kann.

Detection Modes: Fluoreszenz Intensität, Time-

Resolved Fluorescence, Fluoreszenz Polarisation,

AlphaScreen®/AlphaLISA, Lumineszenz, UV-VIS

Absorbanz, FRET, TR-FRET, BRET, Well Area

und Spectral Scanning.

Modulare und aufrüstbare Konstruktion: ver-

schiedene Basis-Modelle erhältlich, die in weite-

rer Folge aufgerüstet werden können.

Quadruple Grating System und variierbare

Bandbreitenauswahl: die Optik beinhaltet zwei

Doppel-Brechungsgitter. Dieses Design ergibt die

bestmögliche Performance für Spektral-

Aufnahmen. 4 verschiedene Bandbreiten lassen

sich beim SynergyH4 zusätzlich einstellen.

Filter und dichroische Spiegel: die Kombination

aus Filtern und dichroischen Spiegeln bietet beste

Anwendungsmöglichkeiten für Fluoreszenz Inten-

sität, Time-Resolved-Fluoreszenz und Fluoreszenz

Polarisation Applikationen.

Kompatibel mit Take3™: für DNA-

Quantifizierungen bei 260nm werden nur 2µL

Probenvolumen benötigt.



Tel.: 01/4893961-43

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Mag. Norbert Wahler

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PCRSetup - Pipettierroboter von XIRIL

In der modernen Forschung und in diagnostischen

Labors spielen PCR Assays eine wichtige Rolle. Die

gewünschte Sensitivität erfordert beim Pipettieren

von zumeist kleinen Volumina hohe Präzision und

Reproduzierbarkeit, weshalb eine Automatisierung

dieses Arbeitsprozesses verstärkt gefordert wird.


16 _______________________________________________________________________________________________________________________ Szabo-Scandic

Die Vorteile einer Automatisierung sind deutlich er-

kennbar: zeitraubendes und fehleranfälliges Handpi-

pettieren und die Gefahr einer Kreuzkontamination

können vermieden werden.

XIRIL AG, ein Schweizer Unternehmen, konnte

sich in den vergangenen Jahren als Anbieter für La-

borautomatisierung mit mittlerem und kleinem

Durchsatz im Bereich Life Science und Diagnostik

positionieren. Die Firmengründer, die auf mehr als

25 Jahre Erfahrung im Bereich Liquid Handling und

Automatisierung zurückgreifen, entwickeln Produkte,

die den aktuellen Anforderungen eines modernen

High Throughput Labors gerecht werden und stellen

mitunter auch eine günstige Alternative für den Mid-

und Low-End-Anwender dar, bei dem Platzprobleme

und limitierte Budgets im Vordergrund stehen.

XIRIL 75 Serie

XIRIL 75 ist ein ideales, für eine kleinere Probenan-

zahl konzipiertes Einstiegsgerät mit einem ausge-

zeichneten Preis-Leistungsverhältnis. Pipettieren,

Plate Handling, Auslesen von Barcodes, Schütteln

etc. können je nach Ausführung auf der kleinen

Grundfläche durchgeführt werden.

Zwei Pipettierkanäle können sich unabhängig

voneinander in der Y- und Z-Achse bewegen und

sich optimal an den Flüssigkeitsspiegel anpassen.

Spezifikation

Pumpe 250 µL 1000 µL

Volumen Bereich

2-250 µL 10-1000 µL

Präzision und Ge-nauigkeit

Pumpe Dispen-siertes Volumen

Präzision (CV%)

Ungenauig-keit (%)

250 µL 20 µL 1.0 % 2.5 %

200 µL 0.5 % 1.0 %

1000 µL

100 µL 1.0 % 3.0 %

1000 µL 0.5 % 1.0 %

Beispiel Deck-Layout für PCR-Setup

Das Layout auf einem XIRIL-Roboter X75-1-2 (1

Roboterarm und 2 Pipettierkanäle) kann leicht neu

konfiguriert werden, um individuelle Bedürfnisse

besser bedienen zu können. In der folgenden Abbil-

dung ist ein Deck-Layout abgebildet, das für die

meisten PCR-Setup- Applikationen verwendet wird.

Abb. Layout für PCR-Setup: 1: Module Decktray, 2: Tip

Waste und Liquid Waste, 3: Rack für 1,5 mL Reagenz-

gefäße, 4: Standard Decktray, 5: 96-well PCR-Platte, 6:

Standard Decktray, 7: Rack für 1,5 mL Reagenzgefäße,

8: 96-well Mikrotiterplatte, 9: High-Precision Decktray,

10: 250µl Rainin Filterspitzen, 11: Proben-Eingabe-

Fenster



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Mag. Norbert Wahler

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