Pears on co rrela tion ( Opt :0.50 %) [0.0%-1 00.0%]

Pearson correlation (Opt:0.50%) [0.0%-100.0%]

70% similarity

Fig. S1

Cluster I(Nos. 1-12)

Cluster II(Nos. 17-38)

Cluster III(Nos. 45-56)

Cluster IV(Nos. 60-71)

Cluster V(Nos. 80-84)

Isolates with≦ 5 copies of IS6110(Nos. 104-108)

Isolate No.1

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100

108