elane rivera grupo 1 jean c. seda · escherichia coli, gluconobacter suboxydans, photobacterium...
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Paloma Monroig
Elane Rivera
Roxanne Almodóvar
William Serrano
Hector Rodriguez
Juan Nieves
Jean C. Seda
Oxidasa
Hola, estoy en busca de electrones para mi amigo oxígeno!
GRUPO 1
-Definición y Características de las Oxidasas
-Ejemplos Generales y su importancia fisiológica
-Familias específicas
* Citocromo-oxidasas (mecanismo)
* Amino-oxidasas (estructura)
* Glucosa-oxidasas (reacción química)
* Sulfidril-oxidasas (ejemplo)
-Citocromo P450
-Mecanismo General de una Oxidasa
-Prueba bioquímica
Es una sub-clase de oxidoreductasa que cataliza una reacción REDOX que envuelve oxígeno molecular (O2) como el aceptador final de electrones.
Las oxidasas reducen oxígeno a uno de los siguientes:-Agua-Peróxido de hidrógeno-Superóxido (o especies tóxicas)
Óxido
-Las bacterias pueden tener más de una oxidasa.
-Las oxidasas son expresadas bajo distintas condiciones de crecimiento.
-Difieren entre sí de acuerdo a su afinidad por:
* Oxígeno molecular* Inhibidores* Actividad realizada para bombear protones.
- Por ser parte de las reacciones metabólicas que oxidan y degradan nutrientes y sustancias complejas a otras más simples, son catabólicas (fase desasimilativa).
Oxidasa Localización Importancia Fisiológica Microorganismos que la Poseen
Citocromo
Anclada en la membrana
interna
Participa en respiración celular y en cadena de transporte de
electrones.
Pseudomonas, Pasteurella, Neisseria, Aeromonas, Vibrio, Campylobacter, Brucella,
Acinetobacter, Moraxella, Agrobacterium, Bordetella, Flavobacterium, Achromobacter,
Micrococcus, Alcaligenes, Plesiomonas, Legionella, Escherichia coli.
AminoPeriplasma y/o
Citoplasma
Metabolismo celular y extracelular de aminas. Proveen
una ruta para la asimilación de N y C de fuentes de aminas inusuales.
Arthrobacter globiformis, Escherichia coli
LysilEnzima
extracelular
Participa en la formación y reparo de matriz extracelular mediante la oxidación de residuos de lisina en
elastina y colágeno. Estabilizan proteínas fibrosas. Su capacidad
catalítica depende de un cofactor de cobre y de carbonilo.
Pichia pastoris
ArseniteAnclada a la membrana
Reguladores responsables de diversas transformaciones de As,
en particular la reducción, oxidación y metilación, todo lo
cual contribuye en el transporte y los ciclos biogeoquímicos de As
Alcaligenes faecalis, Aeropyrum pernix, Sulfolobus tokodaii, Chloroflexus aurantiacus
Laccase- Oxidación de substratos, tales
Laccase-like
multicopper
Enzima extracelular
Oxidación de substratos, tales como fenoles, diaminas y metales, en adición a la reducción de O2 a
H2O.
Agrmyces salentinus, Sinorhizobium morelense,Saccharomyces cerevisae
SulfitoAnclada a la membrana
Cataliza la reacción de SO3-2 a SO4
-3
con el ferricitocromo c como el aceptador de electrones.
Aspergillus nidulans
Ubiquinol
Anclada a la membrana. Membrana plasmática, lisosomas,
retículo endoplásmico y aparato de
Golgi.
Participa en la respiración de hidrógeno y es un cargador entre
NADH, las succionatodeshidrogenasas y el sistema de
citocromos. Es importante para la transportación lineal de electrones a través de la
membrana y la translocación de Hi
Escherichia coli, Gluconobacter suboxydans, Photobacterium phosphoreum, Acetobacteraceti, Paracoccus denitrificans, Sulfolobus
acidocaldarius, Bacillus subtilis, Brucella suis
Citocromo oxidasas
• Superfamilia COX se encuentra en bacterias, archeas y eucariotas.
• Clases principales:
▫ Citocromo c oxidasa
Citocromo aa3 (2 grupos hemos a)
Citocromo caa3 (2 grupos hemos a y un grupo hemo c)
Citocromo co (1 grupo hemos c y otro b)
▫ Quinol oxidasa
Citocromo o (hemo b y hemo c)
Citocromo d (hemo b y hemo d)
Citocromo a1 (hemo b y hemo a)
Citocromo aa3 (2 grupos hemos a)
Cyt c
4e-
4e-
ae-4e-
a3
Cu B
H+
H+
H+
02
H+
4H+
H+H+H+
H+H+H+
H+H+ADP + Pi
II
I
IN
OUT
ATP
Citocromo C oxidasa
H+
H+
H+
H+
Paracoccus
denitrificans
4e-
4e-
bd
H+
02
H+
H+
H+
ADP + Pi
II
I
IN
OUT
ATP
Quinol oxidasa
b
Escherichia
coli
No hay una bomba de protones
No utiliza cobre
H+
4H+
4e-
a3
H+
02
H+
H+
H+
ADP + Pi
II
I
IN
OUT
ATP
Quinol oxidasa bo3 Escherichia
coli
No utiliza cobre
H+
4H+
H+H+H+
H+H+H+H+
H+H+H+
H+H+H+H+
Cu B
4e- b
• Son enzimas reguladoras que catalizan la oxidación de un amplio rango de aminas biogénicas incluyendo muchos neurotransmisores, histamina y aminas xenobióticas.
“flavin-containing monoamine oxidases”
(mayormente estudiada en eucariotas)
“copper-containing amine oxidases ”
(identificada en bacterias, levaduras, filamentos de hongos, plantas y animales).
En procariotas y algunos eucariotas, esta enzima provee una ruta para la utilización de varios sustratos amínicos proveídos por fuentes de nitrógeno y carbono.
Estructura :
Amino-oxidasas:
-Proteína dimérica que cataliza la oxidación de beta-D-glucosa a D-glucono-1,5-lactona, que luego se hidroliza a ácido glucónico.
-Se extrae comúnmente de Aspergillus niger.
-Utilizada en biosensores para detectar los niveles de glucosa y conocer el número de electrones pasadospor la enzima, midiendo la diferencia en cargaconectando un electrodo.
Reacción que cataliza la enzima glucosa oxidaza
-Proteínas recien sintetizadas en el periplasma son quienes le donan los electrones.
-Luego pasan los electrones a la cadena de transporteen la membrana interna (y finalmente a oxígeno).
-Las reacciones REDOX de estas proteínas permitenla adquisición de conformaciones funcionales de proteínas periplásmicas.
Sulfidril oxidasa Erv1 (puede estar presente en virus, hongos, plantas o animales)
Herrmann, JM 2007; et al.
• El citocromo P-450 es una hemoproteína con un grupo hemo(Fe-protoporfirina IX) como grupo prostético y que se encuentra en numerosas especies.
• Es el principal responsable del metabolismo oxidativo de los xenobióticos (compuesto q el organismo no puede degradar).
• En la reacción tipica catalizada por el citocromo P450, la monooxigenasa incorpora un átomo de oxígeno a un sustrato.
Se resume en:
RH + NADPH + H+ + O2 -> ROH + NADP+ + H2O
Donante
Oxidasa
O2 =
Óxido
MECANISMO GENERAL:
• Cuando la oxidasa pasa los electrones a oxígeno, los mismos no se incorporan sustrato orgánico, en cambio oxígeno acepta los electrones que han sido donados por sustratos orgánicos y pasados por otros intermediarios para convertirlo en 1 de 3 productos.
Prueba Bioquímica: Oxidasa Determina la presencia de enzimas oxidasas
Principio de la Prueba:Citocromo C oxida al aceptador artificial de electrones de tetrametil p-fenilenediamina (al 1%).
Procedimiento:- Método en placa directa
Agregar directamente 2-3 gotas de reactivo sin inundar todo el estriado.
Con el reactivo se produce en unos 10-15 segundos color violeta.
Principio de la Prueba:Citocromo C oxida al aceptador artificial de electrones del Reactivo de Kovac (tetramethyl p-fenilenediamina)
Procedimiento:
- Método en placa directaAgregar directamente 2-3 gotas de reactivo a algunas colonias. Sin inundar toda la placa y no invertirla.
Observar los cambios de color. Con el reactivo de Kovacs la reacción se produce en unos 10-15 segundos (color violeta).
Relevancia Energética
• La presencia de oxidasa se utiliza como característica fisiológica de identificación de cepas bacterianas.
• La prueba bioquímica de oxidasas determina si una bacteria produce citocromo oxidasas, por lo cual determina si utiliza oxígeno con una cadena de transporte de electrones.
Accésalo en el blog del grupo 1: MIKROMINDS
grupo1fismic.wordpress.com
MR Parsons, MA Cvery, CM Wilmot, KDS Yadav, V Blakeley, AS Corner, SEV
Phillips, MJ McPherson, PF Knowles. Crystal structure of a quinoenzyme: copper amine oxidase of
Escherichia coli at 2 å resolution. Structure. Pages 1171-1184
Groemping Y., Rittinger K. 20005. Activation and assembly of the NADPH oxidase: a
structural perspective. The Biochemical Society, London. 386(Pt 3): 401–416
Hermann JM and Köhl R. Catch me if you can! Oxidative protein trapping
in the intermembrane space of mitochondria. The Journal of Cell Biology. 2007 Feb; 176 (5): 559-
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Jalkanen S., Salmi M. 2001. Cell surface monoamine oxidases: enzymes in search of a
function. European Molecular Biology Organization; 20(15): 3893–3901
Santini J. M., vanden Hoven R. N. 2004. Molybdenum-Containing Arsenite Oxidase of the
Chemolithoautotrophic Arsenite Oxidizer NT-26. American Society for Microbiology. 186(6): 1614–1619
Soballe B., Poole R. K. 1999. Microbial ubiquinones: multiple roles in respiration, gene regulation
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REFERENCIAS