formation gephi : le logiciel gephi
TRANSCRIPT
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une
applicationUne
communautéun
consortium
Gephi is an interactive visualization and exploration platform for all kinds of networks and complex systems, dynamic and
hierarchical graphs.
Like photoshoptm for graphs
100.000 téléchargements
10 ANS d’existence
d’une communauté
1.000 Membres
sur facebook
Duke Award, JavaOne 2010 (Mathieu Bastian
un consortium
• donner à la communauté une strucutre légale • fournir une infrastructure de recherche • fournir des solutions légales pour exploiter Gephi
Objectif : Un effort de R&D pour construire des parts réutilisable et générique de gephi
https://consortium.gephi.org/
Ressources-2-
Tutoriel pour gephihttp://gephi.org/users/
http://gephi.org/tutorials/gephi-tutorial-quick_start.pdf
le GEXFhttp://gexf.net/format/
marketplacehttps://marketplace.gephi.org/
Une pierre angulaire dans le cycle deproduction des cartographies
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Techniquement, la cartographie de l’information repose sur la maîtrise des différentes étapes de la chaîne de production
• Curation, Enrichissement des données• Visualisation de graphes• Spatialisation, hiérarchisation, groupement• Finalisation cartographique
ajout de méta-données ou
de descripteurs aux données natives
Patterns à explorer Nouvelles métrique
à intégrer
Vues complémentaires
à produire
GEPHI : un élément central dans le cyclede production de la cartographie
système d’information
anayse desdonnées
cartographiegraphes interface
Comment les produire ?
• manuellement à partir de GEPHI• automatiquement à partir de scripts/A.P.I.• le plus souvent, à partir de fichier Excel ou de CSV, d’où l’intérêt de Table2Net
Les structures de graphes : un moyen puissant de croiser des données
excel, ou autre tableur
Table 2 net Gephi Sigma Js ou autre plateforme
Une opération centrale : transformer des liste ou des tables de données en
structures de graphs
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Une opération centrale : transformer des listesou des tables de données en structures de graphes
Accéder à Table2Net :http://webatlas.fr/table2net/
Générer un fichier GEXF avec Table2Net en 4 étapes :
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2
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Charger un fichier de type «CSV»
Sélectionner les options de construction d’un graphe
Télécharger le fichier au format GEXF
Une opération centrale : transformer des listesou des tables de données en structures de graphes
Accéder à Table2Net :http://webatlas.fr/table2net/
Charger un fichier de type «CSV»
Générer un fichier GEXF avec Table2Net en 4 étapes :
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Sélectionner les options de construction d’un graphe
Télécharger le fichier au format GEXF
Une opération centrale : transformer des listesou des tables de données en structures de graphes
Accéder à Table2Net :http://webatlas.fr/table2net/
Charger un fichier de type «CSV»
Sélectionner les options de construction d’un graphe
Générer un fichier GEXF avec Table2Net en 4 étapes :
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4 Télécharger le fichier au format GEXF
Une opération centrale : transformer des listesou des tables de données en structures de graphes
Accéder à Table2Net :http://webatlas.fr/table2net/
Charger un fichier de type «CSV»
Sélectionner les options de construction d’un graphe
Télécharger le fichier au format GEXF
Générer un fichier GEXF avec Table2Net en 4 étapes :
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Visualiser et mesurer les données
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composants(typologies et classifications)
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Saillances(hiérarchies)
ORGANISATION(Géographies et complémentarités)
focus(localisation et contextualisation)
Spatialiser les données : les principaux algorithmes
Mode aléatoire
Vue circulaire
Fruchterman Reingold
Radias axis
OpenOrd
Force Atlas 2
Force Atlas 2 hierarchie(taille et degrés)
hierarchie(degrés colorés)
hierarchie(centralité)
Hiérarchiser et analyser les données
Couleurs(classes)
hierarchie(degrés, noeuds)
labels hierarchie(degrés, labels)
Grouper et hiérarchiser les données
Marguerite
ZephineFantine
MmeThenardier
Thenardier
Cosette
Javert
Fauchelevent
Perpetue
Simplice
Pontmercy
Boulatruelle
Eponine
Anzelma
Gillenormand
MlleGillenormandMmePontmercyMarius
Enjolras
CombeferreProuvaireCourfeyrac
BossuetJoly
Grantaire
Gueulemer
BabetClaquesous
Montparnasse
Brujon
MmeHucheloup
Marguerite
ZephineFantine
MmeThenardierThenardier
Cosette
JavertFauchelevent
Perpetue
Simplice
Pontmercy
Boulatruelle
EponineAnzelma
Gillenormand
MlleGillenormand
MmePontmercyMariusEnjolrasCombeferreProuvaireCourfeyracBossuet
JolyGrantaire
Gueulemer
BabetClaquesous
Montparnasse
Brujon
MmeHucheloup
Grouper et hiérarchiser les données
Les cinq collèges détection statistique des communcautés
les porteurs de projets (en rouge)
Variation des couleurs en fonction des partitions
sélection(zone)
nouvel espace de travail spacialisation(radiale)
Plusieurs espaces de travail
Projet VisIR, 2010pôle de compétitivité Images et Réseaux,
GeoLayout / Géo-référencement
Migrations des dossiers patients entre structures hospitalières à l’échelle des Etats-Unis (2011).
Le géo-référencement
Le géo-référencement
http://gephi.org/2010/map-geocoded-data-with-gephi/
Le géo-référencement
Time-line et structure de données
http://fr.slideshare.net/Eldarion/ic05-cours-4http://gexf.net/format/dynamics.html
Les métriquesTaille et couleur en fonction du score de PageRank
Filtrer les donnéesFiltrage en fonction du nombre de liens par noeud
Les exports (SVG, PNG, GEXF...)