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Un concours…Un concours… L’iGEM ou International Genetically Engineered Machine est un concours international de biologie synthétique soutenu par le prestigieux Massachusetts Institute of Technology .

Cette compétition voit s’affronter des équipes d’étudiants d’horizons variés (Biologie, Physique, Chimie, Mathématiques, Informatique, Sciences économiques et sociales) et rivalisant d’innovation et d’ingéniosité pour mener à bien leur projet.

…de renommée…de renommée

internationale …internationale …

L’iGEM attire de plus en plus d’étudiants, 595 équipes ont déjà participé à cette compétition qui a maintenant atteint une envergure internationale puisque des équipes se sont constituées sur tous les continents.

En 2011, les équipes françaises engagées pour les sélections européennes ont toutes été qualifiées pour la finale au MIT à Boston. Jusqu’ici l’Université Paris-Sud, pourtant le plus grand campus de France, n’avait pas encore d’équipe.

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… … très bien organisé, très bien organisé, pour la 9ème fois pour la 9ème fois consécutive.consécutive.

Chaque équipe reçoit au début de l’été un kit de composants biologiques (appelés « biobricks ») avec lesquels les étudiants devront créer des systèmes biologiques qui opèrent dans des cellules vivantes. Ceci en combinant ou en créant de nouveaux composants durant un long travail de laboratoire pendant l’été.

Les projets des différentes équipes sont classés dans plusieurs catégories telles que l’écologie, la santé, l’énergie ou encore la biologie fondamentale.

Les équipes sont jugées sur plusieurs critères : leur projet scientifique ainsi que la réflexion sur les problèmes éthiques pouvant y être liés, leur site internet, leur présentation orale et la réalisation d’un poster, la caractérisation d’une nouvelle « biobrick », l’interaction entre les équipes et leurs actions d’informations auprès du grand public .

En raison du succès d’iGEM, il y a maintenant des étapes de qualification au niveau de chaque continent avant de participer à la finale au MIT. Pour les équipes Européennes, cette étape de qualification pour la finale aura lieu à Amsterdam.

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Une discipline en plein essorUne discipline en plein essor Depuis quelques années, une nouvelle branche de la biologie est en plein essor : la biologie synthétique. Elle est basée sur des disciplines scientifiques classiques comme la génétique mais aussi des disciplines émergentes comme par exemple l’Ingénierie des protéines et la bio-informatique. L’objectif de la biologie synthétique est de créer des nouveaux systèmes biologiques. Pour cela, plusieurs approches sont utilisées : une approche « top-down » qui vise à modifier un système biologique pour le rendre plus simple et une approche « bottom-up » qui consiste à définir des briques élémentaires dont les fonctions sont bien définies et de les assembler pour améliorer une fonction biologique d’un organisme. C’est cette dernière approche que le concours iGEM tend à développer.

Des enjeux économiques et sociétauxDes enjeux économiques et sociétaux

La biologie synthétique tout comme la biologie classique permet de comprendre d’avantage le vivant mais elle permet également de le modifier et d’en tirer des applications utiles dans différents domaines d’intérêts publiques comme la santé, l’environnement, l’énergie, l’agriculture, … et par conséquent représente un marché économique en plein essor également. Plusieurs applications ont déjà vu le jour comme :

Le production d’un anti-malaria, l’artémisinine en grande quantité par une levure alors qu’elle est initialement produite en faible quantité par une plante.

Un outils de diagnostic très sensible capable de détecter de l’ADN viral du VIH et de l’Hépatite B par exemple.

La production en grande quantité d’isoprène par une bactérie, une molécule rentrant dans la fabrication du caoutchouc et produite initialement en faible quantité par une plante.

L’amélioration des voies métaboliques d’une bactérie afin qu’elle dégrade d’avantage des produits toxiques et utilisée en bio remédiation

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Des questions éthiquesDes questions éthiques

Comme la biologie synthétique est basée sur la modification du vivant , celle-ci suscite un grand nombre d’interrogations éthiques sur la possibilité pour l’Homme de pouvoir créer la vie artificiellement et sur ses responsabilités. En effet, modifier un organisme et le rejeter dans la nature pourrait avoir des conséquences sur l’environnement et les autres organismes, c’est pourquoi il est important que ces effets soient anticipés et que ces questions soient posées au préalable. Cela soulève également la question de la brevetabilité de ces organismes modifiés, des bio-briques ou encore des gènes re-synthétisés ou optimisés pour être utilisables dans différents organismes et d’instaurer une certaine réglementation d’utilisation pour éviter d’éventuels actes malveillants. On comprend bien que la biologie synthétique est une discipline très puissante du fait des réalisations possibles mais également des applications envisageables qui touchent des domaines très sensibles et qu’il faut donc l’utiliser à bon escient. Toutes ces questions rentrent dans un véritable débat de société, le gouvernement a d’ailleurs publié un rapport en mars 2011 à la demande du Ministère de l’enseignement supérieur et de la recherche faisant un état des lieux des enjeux et questions liés à la biologie synthétique. Mais pour que chaque citoyen puisse se faire une idée sur ces questions, il est important qu’il puisse être informé sur la biologie synthétique et sensibilisé aux questions liées à cette discipline. C’est également un des buts du concours iGEM qui pousse les équipes participantes à organiser des actions de sensibilisation à la biologie synthétique. Notre équipe, très soucieuse de ces questions s’engage à ouvrir le débat en réalisant des interviews d’experts scientifiques, de sociologues mais également de personnes non initiées à la biologie synthétique. Nous souhaiterions également organiser des conférences et des expositions itinérantes.

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D’étudiants venant de tous les horizons tous plus motivés les uns que les autres D’étudiants venant de tous les horizons tous plus motivés les uns que les autres !!

Le plus grand campus de France à enfin son équipe au concours iGEM, elle se compose :

« Le concours iGEM me permet de participer à un projet de grande envergure, ainsi que d'échanger des connaissances avec des personnes motivées. Faire partie de cette équipe est donc une véritable expérience enrichissante. »

Ingé 5 Info

M2 Bio-informatique et

Bio-statistiques

L3 Physique

M1 Maths

Zarah AliZarah Ali

Marc BouffardMarc Bouffard

Pierre MoreauPierre Moreau

L3 Biologie Santé

Julien Julien Rabinow

Rabinow

L2 Maths-Info

1ère année

Magistère Physico-Chimie

Moléculaire

Benjamin Vignard

Benjamin Vignard

Andy Degaugue

Andy Degaugue

M1 Ingénierie

des Biomolécules

Thibaut Di Méo

Thibaut Di Méo

1ère année

Magistère Physico-Chimie

Moléculaire

DorianeDoriane Menigaux

Menigaux

Séverine Maire

Séverine Maire

M1 Ingénierie

des Biomolécules

1ère année

Magistère de Biologie

et de Biotechnologies

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D’étudiants venant de tous les horizons tous plus motivés les uns que les autres D’étudiants venant de tous les horizons tous plus motivés les uns que les autres !!

Le plus grand campus de France à enfin son équipe au concours iGEM, elle se compose :

Maxime Lacuve

Maxime Lacuve

1ère année

Magistère Physico-Chimie

Moléculaire

Jérémie Mathurin

Jérémie Mathurin

1ère année

Magistère Physico-Chimie

Moléculaire

Yohann Petiot

Yohann Petiot

L2 Maths-Info

Geoffrey Costilhes

Geoffrey Costilhes

1ère année

Magistère de Biologie et

Biotechnologies

William Fontanaud

William Fontanaud

1ère année

Magistère de Biologie et

Biotechnologies

David ZamordDavid Zamord

L1 Biologie Chimie

Sciences de la Terre

Lucille Garnier

Lucille Garnier « La biologie synthétique est un domaine de la biologie encore méconnu, je suis très curieuse et la nouveauté m’attire. Enfin un vrai projet de recherche au sein d’une équipe plus que motivée ! Et partager notre travail avec les autres étudiants du monde entier, que demander de plus ? » 1ère année

Magistère de Biologie et

Biotechnologies

« Je suis actuellement étudiant en première année du Magistère de Biologie et Biotechnologie de l'Université Paris-Sud. J'ai décidé de participer au concours iGEM car cela représente pour moi une formidable occasion de sortir des sentiers battus du parcours universitaire, d’apprendre à développer ses propres projets et de continuer à enrichir ses connaissances scientifiques aux contacts d'étudiants d'horizons divers. »

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Sylvie Lautru, Jean-Luc Pernodet et Philippe Bouloc sont chercheurs CNRS à l'Institut de Géné-

tique et Microbiologie de l'Université Paris-Sud. Ils partagent une passion pour la microbiologie et leur expertise couvre une grande variété d'organismes comprenant la bactérie modèle Escherichia coli, le producteur d'antibiotiques Streptomyces et le pathogène Staphylococcus aureus. Leurs ap-proches expérimentales sont à la fois globales et mécanistiques et leur intérêts fondamentaux,

biotechnologiques et biomédicaux. Ils assureront l'enca-drement scientifique de l'équipe iGEM Paris-Saclay 2012.

Thảo Nguyên LE LAM - Doctorant 1ère année - Institut de Génétique et Microbiologie

J'aime la biologie, la nature et explorer la vie. C'est merveilleux de pouvoir combiner la

biologie et la technologie pour créer des produits utiles aux personnes. La biologie

synthétique est exactement ce que je recherche ! Avec l'équipe Paris-Saclay, j'espère

pouvoir créer librement, explorer et conquérir de nouveaux horizons scientifiques.

Solenne ITHURBIDE - Doctorant 1ère année - Institut de Génétique et Microbiologie

J’ai découvert le concours iGEM en 2011 et j’ai tout de suite adhéré au concept tant

pour le côté scientifique qu’humain. Je suis très contente de pouvoir participer à la

création de cette nouvelle équipe qui va, je suis sûre, aller loin dans la compétition

grâce à sa motivation ! Je souhaiterai également pérenniser l’existence de cette

équipe pour les années à venir car il me parait indispensable que le campus Paris-

Saclay soit représenté !

De Chercheurs «De Chercheurs « les Instructors » qui conseillent et les Instructors » qui conseillent et

supervisent l’avancement du projet supervisent l’avancement du projet !!

De Doctorants «De Doctorants « les Advisorsles Advisors » qui encadreront les étudiants durant » qui encadreront les étudiants durant

l’été l’été !!

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Mais c’est aussi:

Une Association loi 1901!

Une Association loi 1901!

SynthéBiol Paris-Saclay

Elle a été créée en Janvier 2012. Son but est de promouvoir

la biologie synthétique auprès de tous les publics

et de soutenir l’équipe pour sa participation au concours.

L’association et l’équipe sont hébergées et soutenues par

l’Université Paris-Sud et l’Institut de Génétique et Microbiologie d’Orsay.

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Bien entendu, la participation à un concours de cette envergure a un coût. Il nous faut un budget conséquent pour les inscriptions et les déplacements, notamment pour les sélections européennes et pour la finale aux Etats-Unis si nous sommes qualifiés

(et nous sommes bien déterminés à traverser l’Atlantique !) mais également pour se fournir le matériel nécessaire à la réalisation du projet et pour tous les frais connexes.

- BUDGET PREVISIONNEL -

Frais d’inscription 8 100 €

Inscription de l’Equipe à l’iGEM 1 700 €

Inscription de l’équipe pour le concours européen* 3 200 €

Inscription de l’équipe pour le concours mondial* 3 200 €

Frais de déplacement et d’hébergement* 14 000 €

Déplacements et hébergements à Amsterdam 2 500 €

Déplacements et hébergements à Boston 11 500 €

Gratification des stagiaires** 8 721 €

Consommables de laboratoire 20 000 €

Communication et frais de fonctionnement 2 000 € Tutorat de deux doctorants de l’Institut de Génétique

et Microbiologie 11 400 €

Total 64 221 €

Soutien de l’Université Paris-Sud 11 400 €

Total 52 821 € *Frais calculés pour un total de 10 étudiants et de 3 encadrants * * Pour pouvoir travailler au sein de l’Université, les étudiants doivent signer une convention de stage avec l’Université, si celle-ci

dépasse 40 jours, une gratification est obligatoire.

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La biologie synthétique est en train de révolutionner l’industrie des biotechnologies et a déjà de grandes influences dans les domaines de la santé, la médecine, de l’énergie et de l’environnement. Le concours iGEM est le plus grand rendez-vous annuel des biologistes synthéticiens. C’est une grande opportunité pour votre entreprise d’avoir une grande visibilité et de collaborer avec les leaders du nouveau domaine de la biologie synthétique venant du monde entier. De nombreuses entreprises françaises ont déjà accordé leur confiance à d’autres équipes iGEM. C’est le cas de QIAGEN, GATC biotech, Biomérieux, EDF ou encore des Fondations comme Schuller Bettencourt. Alors pourquoi pas vous ? De plus votre soutien ne passera pas inaperçu. Outre la publicité que l’équipe vous fera, depuis sa création, le concours iGEM fait régulièrement l’objet d’articles et de reportages dans la presse écrite régionale et nationale (le Monde, Libération, Sciences et avenir), un bon moyen pour vous d’apparaître dans ces médias ! Au delà de la simple participation au concours, l’équipe iGEM Paris-Saclay s’engage aussi dans une démarche pédagogique et citoyenne visant à faire connaitre la biologie synthétique et à ouvrir le débat sur les enjeux et les problèmes éthiques que cette dernière est en mesure de soulever. C’est également pour les jeunes participants une autre façon d’apprendre les Sciences. Ainsi d’une certaine manière vous soutenez également la Recherche et l’Education. Et parce que ce sont ces jeunes qui seront les Ingénieurs ou Docteurs de demain qui postuleront dans votre entreprise, c’est l’occasion de vous faire connaître auprès d’eux !

Enfin, en soutenant l’équipe, vous participez à un beau projet scientifique et humain et bénéficiez de l’image jeune, innovante et dynamique associée à cette compétition.

Pourquoi nous apporter votre soutien ?Pourquoi nous apporter votre soutien ?

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En nous apportant un support financier ...En nous apportant un support financier ...

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… ou matériel et technique :… ou matériel et technique :

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Adresse mail Adresse mail

[email protected]

Site internet Site internet

www.igem-paris-saclay.u-psud.fr

Page Facebook Page Facebook

www.facebook.com/IgemParisSaclay2012

Site officiel du concours iGEM : Site officiel du concours iGEM :

ung.igem.org

SynthéBiol ParisSynthéBiol Paris--SaclaySaclay

Jean-Luc Pernodet

Institut de Génétique et Microbiologie

Bâtiments 400

UFR des Sciences - Université Paris-Sud 11

15, rue Georges Clémenceau

F 91405 ORSAY Cedex

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Scannez avec votre smartphone

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