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NF VALIDATION 16140 VALIDATION AFNOR CERTIFICATION DE LA METHODE LUMIPROBE 24 Listeria monocytogenes pour la détection de Listeria monocytogenes Protocole pour les produits d’alimentation humaine et les échantillons d’environnement RAPPORT DE SYNTHESE  JUILLET 2014  V1 Laboratoire expert : Fabricant : ISHA Europrobe 25 avenue de la République Le Gemellyon Nord 91300 MASSY 57 boulevard Vivier Merle FRANCE 69429 LYON CEDEX 03 FRANCE Ce rapport d’analyse ne concerne que les objets soumis aux analyses. Sa reproduction n’est autorisée que sous forme de facsimilé photographique intégral. Il comporte 39 pages. Seuls certains essais reportés dans ce document sont couverts par l’accréditation de la Section Laboratoire du COFRAC. Ils sont identifiés par le symbole (*). Essais réalisés à l’ISHA : 25 avenue de la République, 91300 Massy, France.

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NF VALIDATION 16140 

VALIDATION AFNOR CERTIFICATION DE LA METHODE 

LUMIPROBE 24 Listeria monocytogenes 

pour la détection de Listeria monocytogenes 

Protocole pour les produits d’alimentation humaine et les échantillons d’environnement 

RAPPORT DE SYNTHESE – JUILLET 2014 – V1 

Laboratoire expert :  Fabricant : ISHA  Europrobe 25 avenue de la République  Le Gemellyon Nord 91300 MASSY  57 boulevard Vivier Merle FRANCE  69429 LYON CEDEX 03 

FRANCE 

Ce rapport d’analyse ne concerne que les objets soumis aux analyses. Sa reproduction n’est autorisée que sous forme de  fac‐similé photographique  intégral.  Il comporte 39 pages. Seuls certains essais  reportés dans ce document sont couverts par  l’accréditation de  la Section Laboratoire du COFRAC.  Ils sont  identifiés par  le symbole (*). Essais réalisés à l’ISHA : 25 avenue de la République, 91300 Massy, France.

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Europrobe  LUMIPROBE 24 Listeria monocytogenes  Juillet 2014 

Institut scientifique d’Hygiène et d’Analyse

Table des matières 1. Introduction ................................................................................................................................................. 3

1.1.  Date(s) et historique de validation ...................................................................................................... 3 

1.2.  Principe et protocole de la méthode alternative ................................................................................ 3 

1.3.  Méthode de référence à laquelle la méthode alternative a été comparée ........................................ 3 

1.4.  Domaine d’application ........................................................................................................................ 3 

2. Résultats de la validation initiale (2005) ..................................................................................................... 4

2.1.  Etude comparative des méthodes ....................................................................................................... 4 

2.1.1.  Exactitude, spécificité et sensibilité relatives .............................................................................. 4 

2.1.2.  Niveau de détection relatif .......................................................................................................... 5 

2.1.3.  Sélectivité .................................................................................................................................... 5 

2.1.4.  Praticabilité .................................................................................................................................. 5 

2.2.  Essais complémentaires ...................................................................................................................... 5 

2.3.  Etude interlaboratoires ....................................................................................................................... 5 

3. Résultats de l’étude d’extension (2006) ...................................................................................................... 7

3.1.  Etude comparative des méthodes ....................................................................................................... 7 

3.1.1.  Exactitude, spécificité et sensibilité relatives .............................................................................. 7 

3.1.2.  Niveau de détection relatif .......................................................................................................... 9 

3.1.3.  Sélectivité .................................................................................................................................... 9 

3.1.4.  Praticabilité .................................................................................................................................. 9 

3.2.  Etude interlaboratoires ....................................................................................................................... 9 

3.2.1.  Résultats ...................................................................................................................................... 9 

3.2.2.  Calculs statistiques .................................................................................................................... 10 

4. Conclusions ................................................................................................................................................ 12

Annexes Annexe 1 : protocoles de la méthode alternative Annexe 2 : protocole de la méthode de référence Annexe 3 : résultats bruts AC, SP, SE de la validation initiale Annexe 4 : résultats bruts du niveau de détection relatif de la validation initiale Annexe 5 : résultats bruts de la sélectivité de la validation initiale Annexe 6 : résultats bruts AC, SP, SE de l’étude d’extension Annexe 7 : résultats bruts du niveau de détection relatif de l’étude d’extension Annexe 8 : résultats bruts de la sélectivité de l’étude d’extension 

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Europrobe  LUMIPROBE 24 Listeria monocytogenes  Juillet 2014 

Institut scientifique d’Hygiène et d’Analyse

1. Introduction

1.1. Date(s) et historique de validation La méthode LUMIPROBE 24 Listeria monocytogenes a été validée par AFNOR Certification sous la marque NF Validation 16140 en décembre 2005 sous le numéro d’attestation EUR 15/03 ‐12/05 : 

‐ décembre 2005 : validation initiale (produits laitiers hors fromage de type Cantal et Salers), ‐ décembre 2006 : extension pour tous produits et échantillons d’environnement (hors environnement d’élevage), ‐ décembre 2009 : première reconduction sans modification de la méthode, ‐ novembre 2013 : deuxième reconduction sans modification de la méthode. 

1.2. Principe et protocole de la méthode alternative Le test LUMIPROBE 24 Listeria monocytogenes est une méthode assurant en 24 heures la détection rapide et spécifique de Listeria monocytogenes dans différentes matrices. Les performances de sensibilité de ce test permettent de  limiter  à 22 heures  la phase  initiale d’enrichissement  en bouillon.  La présence de  Listeria monocytogenes  est  ensuite  révélée  par  un  test  d’hybridation  ADN  /ARN  ribosomal  en  phase  solide,  de réalisation simple et adaptée au laboratoire de routine. Le test LUMIPROBE 24 Listeria monocytogenes est basé sur une réaction d’hybridation de sondes nucléiques en  phase  solide.  L’ARN  ribosomal  de  la  bactérie  cible  est  libéré  par  lyse  cellulaire  et  capturé  par  un oligonucléotide  spécifique  fixé  sur  un  support  inerte.  L’ARN  ribosomal  ainsi  capturé  est  hybridé  avec  un deuxième oligonucléotide marqué qui permettra la révélation par une réaction de chimiluminescence. 

L’Interprétation des résultats est réalisée comme suit : ‐ Valeur RLU de l’échantillon > valeur seuil  résultat positif ‐ Valeur RLU de l’échantillon ≤ valeur seuil  résultat négatif ‐ Valeur seuil = [Valeur en RLU du contrôle négatif] X 3 

Le protocole de la méthode est représenté en annexe 1. 

1.3. Méthode de référence à laquelle la méthode alternative a été comparée La norme NF EN ISO 11290‐1/A1 (02/2005), méthode horizontale pour la recherche et le dénombrement de Listeria monocytogenes a été utilisée. Le protocole de la méthode est présenté en annexe 2. 

1.4. Domaine d’application Le  domaine  d’application  est  le  suivant  :  tous  produits  d’alimentation  humaine  et  échantillons d’environnement (hors environnement d’élevage). Dans  la  catégorie  des  produits  laitiers,  les  fromages  de  type  Cantal  et  Salers  sont  exclus  du  domaine d’application de la méthode alternative.

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Europrobe  LUMIPROBE 24 Listeria monocytogenes  Juillet 2014 

Institut scientifique d’Hygiène et d’Analyse

2. Résultats de la validation initiale (2005)

2.1. Etude comparative des méthodes 

2.1.1. Exactitude, spécificité et sensibilité relatives Des essais ont été effectués en 2005 sur 62 échantillons de produits laitiers avec 30 échantillons positifs (dont 50 % naturellement contaminés) et 32 échantillons négatifs. Tous les échantillons ont été analysés en simple par les deux méthodes. Les types de matrices analysés sont répertoriés dans  le tableau 1 et  les résultats bruts sont résumés dans l’annexe 3. 

Catégorie  Type  Nombre de positifsa  Nombre de négatifs  Total 

Produits laitiers 

Fromages au lait cru /laits crus Fromages et laits pasteurisés Produits fermentés 

19 8 3 

15 17 ‐ 

34 25 3 

Total  30  32  62 

Tableau 1 : nombre et nature des échantillons testés (a : positifs par l’une ou l’autre des méthodes) 

Les couples de résultats des méthodes de référence et alternative pour l’ensemble des produits sont présentés dans le tableau 2. 

Réponse Méthode de référence 

positive (R+) Méthode de référence 

négative (R‐) 

Méthode alternative positive (A+)  PA = 25  PD = 2 

Méthode alternative négative (A‐) ND = 3 

dont 0 PPND NA = 32 

dont 3 PPNA 

Tableau 2 : résultats des essais pour les deux méthodes (PA : accord positif, NA : accord négatif, ND : déviation négative, PD : déviation positive, PP : présumé positif avant confirmation, A+ : positifs confirmés, A‐ : négatifs immédiats et négatifs après confirmation quand présomptifs positifs) 

Les pourcentages obtenus, par rapport à la méthode de référence, sont les suivants : 

Exactitude relative : 92%

Spécificité relative : 89%

Sensibilité relative : 94%

La sensibilité a également été recalculée en tenant compte de l’ensemble des positifs confirmés (ceci inclut les positifs supplémentaires de la méthode alternative), comme indiqué dans le tableau 3. 

Pour la méthode de référence :  Pour la méthode alternative : 

(PA + ND) / (PA + PD + ND) = 93 %  (PA + PD) / (PA + PD + ND) = 90 % 

Tableau 3 : Sensibilité relative recalculée 

Les résultats montrent l’existence de 5 résultats discordants : 3 déviations négatives avec deux échantillons naturellement contaminés et un échantillon artificiellement contaminé et 2 déviations positives avec deux échantillons de lait cru naturellement contaminés. Selon l’annexe F de la norme ISO 16140, le nombre de discordants Y étant inférieur à 6 (Y=PD+ND=5), aucun test statistique ne peut être réalisé pour comparer les deux méthodes. En  conclusion,  les  performances  de  la  méthode  LUMIPROBE  24  Listeria  monocytogenes  apparaissent équivalentes à celles de la méthode de référence. 

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Europrobe  LUMIPROBE 24 Listeria monocytogenes  Juillet 2014 

Institut scientifique d’Hygiène et d’Analyse

2.1.2. Niveau de détection relatif Des essais ont été effectués avec une matrice lait cru et une souche de L. monocytogenes (code L68) isolée du même type de matrice. Les résultats bruts sont résumés en annexe 4. Six réplicats ont été effectuées avec six niveaux de contamination dont le contrôle négatif. Les résultats obtenus sont présentés dans le tableau 4. 

Souche  Aliment  LOD50 Méthode de référence  LOD50 Méthode alternative 

L. monocytogenes  Lait cru  0,5 [ 0,4 ; 0,8 ]  1,9 [ 1,0 ; 3,6 ] 

Tableau 4 : Niveau de détection relatif en UFC/25 g selon le test de Spearman‐Kärber (LOD50 avec intervalle de confiance) 

Les niveaux de détection relatifs obtenus pour la matrice lait cru varient de 0,4 à 0,8 UFC/25 g pour la méthode de référence et de 1,0 à 3,6 UFC/25 g pour la méthode alternative. 

2.1.3. Sélectivité 50 souches de Listeria monocytogenes et 33 souches non L. monocytogenes ont été testées. Les résultats bruts sont résumés dans l’annexe 5. L’ensemble des souches cibles a donné un résultat positif par la méthode alternative.  Pour les souches non cibles, 4 souches [(L. grayi (L02), L. innocua (L51), L. ivanovii (L45) et L. welshimeri (L06)] ont donné un  résultat positif en utilisant  le bouillon TSB pour  l’enrichissement. L’application du protocole complet de la méthode alternative montre que ces 4 souches donnent un résultat négatif. Des  réactions  croisées  ont  été  obtenues  avec  3  autres  souches  [(Lactobacillus  casei  (R96),  Lactobacillus leichmanii (R98) et Lactobacillus plantarum (R97)]. Ce résultat a été obtenu même en appliquant le protocole complet de  la méthode alternative et des colonies  suspectes ont été observées sur  les milieux de culture utilisés pour la méthode de référence. De ce fait, 4 échantillons de produits probiotiques contenant une concentration importante de Lactobacillus casei ont été analysés par la méthode alternative et le résultat est négatif pour les 4 essais. 

2.1.4. Praticabilité Délai d’obtention des résultats : L’obtention des résultats positifs se fait en 4 à 7 jours avec la méthode alternative en incluant la confirmation par les tests classiques de la norme de référence, contre 4 à 12 jours avec la méthode de référence. 

L’obtention des résultats négatifs se fait en 1  jour avec  la méthode alternative contre 2 à 5  jours (voire 12 jours) avec la méthode de référence. 

Dans le cas de résultats présumés positifs par la méthode alternative, mais rendus négatifs après confirmation, les résultats négatifs sont obtenus en 2 à 5 jours. 

2.2. Essais complémentaires A la demande du Bureau Technique, des investigations complémentaires ont été effectuées sur les 3 souches de Lactobacillus ayant donné une réaction croisée avec la méthode alternative. Des essais ont été réalisés avec différentes méthodes avec le même le lot de souches utilisé durant l’étude préliminaires et les résultats sont positifs. Mettant en doute la pureté de ce lot de souches, des essais ont été réalisés avec de nouvelles souches de Lactobacillus et les résultats obtenus avec la méthode alternative sont négatifs quelle que soit la souche testée. 

2.3. Etude interlaboratoires L’étude interlaboratoires a été réalisée en 2005 avec 10 laboratoires collaborateurs selon l’ancien référentiel des études préliminaire et collaborative d’AFNOR Certification (révision 7). Les analyses ont été effectuées sur 

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Europrobe  LUMIPROBE 24 Listeria monocytogenes  Juillet 2014 

Institut scientifique d’Hygiène et d’Analyse     

des échantillons de  lait pasteurisé, contaminés artificiellement avec une souche de Listeria monocytogenes 1/2 b aux 4 niveaux suivants : 

‐ niveau 0 ‐ niveau compris entre 1 et 10 UFC par 25 mL, ‐ niveau compris entre 5 et 50 UFC par 25 mL, ‐ niveau compris entre 10 et 100 UFC par 25 mL, 

 Les laboratoires ont testé, par la méthode alternative, 8 échantillons (2 par niveau de contamination), soient 80 analyses au  total pour  l’ensemble des  laboratoires collaborateurs. Les  résultats  sont présentés dans  le tableau 5.  

Taux cibles (UFC/25 mL) 

Taux réels (UFC/25 mL) 

Résultats attendus  Résultats obtenus  Concordance en pourcentage Négatif  Positif  Négatif  Positif 

0  0  20  0  20  0  100 

1 à 10  7  0  20  1  19  95 

5 à 50  31  0  20  0  20  100 

10 à 100  59  0  20  0  20  100 

Tableau 5 : Résultats de l’étude interlaboratoires  L’ensemble  des  données montre  qu’un  seul  laboratoire  a  obtenu  un  résultat  non  attendu.  Il  s’agit  d’un échantillon faiblement contaminé. Les isolements à partir du bouillon d’enrichissement sur milieux sélectifs montrent l’absence de colonies caractéristiques pour cet échantillon ce qui suggérerait l’absence de cellules cibles.  L’étude interlaboratoires montre que le test LUMIPROBE 24 Listeria monocytogenes est fidèle avec un taux de concordance de 99% entre les résultats obtenus et les résultats attendus.     

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Europrobe  LUMIPROBE 24 Listeria monocytogenes  Juillet 2014 

Institut scientifique d’Hygiène et d’Analyse     

3. Résultats de l’étude d’extension (2006) Cette étude avait pour but d’évaluer  les performances du  test LUMIPROBE 24 Listeria monocytogenes par rapport  à  la méthode  de  référence  pour  l’ensemble  des  produits  d’alimentation  humaine  (hors  produits laitiers) et les échantillons d’environnement (hors environnement d’élevage).  Deux protocoles ont été testés, un protocole général et un protocole spécifique pour  les produits crus. De plus,  un  protocole  de  confirmation  des  résultats  présumés  positifs  a  été  testé  à  l’aide  de  deux milieux chromogènes : ALOA et RAPID’L.mono.  

3.1. Etude comparative des méthodes  

3.1.1. Exactitude, spécificité et sensibilité relatives Des essais ont été effectués en 2006 sur 242 échantillons : 49 % des échantillons positifs sont naturellement contaminés. 148 échantillons ont été analysés selon le protocole général et 94 selon le protocole spécifique. Les catégories suivantes ont été étudiées : 

‐ produits carnés,  ‐ produits de la mer,  ‐ produits végétaux,  ‐ échantillons d’environnement. 

 Tous  les échantillons ont été analysés en simple par  les deux méthodes et  les résultats bruts sont résumés dans l’annexe 6.  

Catégorie  Type  Nombre de positifsa  Nombre de négatifs  Total 

Produits carnés 

Viandes crues Volaille Charcuteries 

13 10 11 

6 9 11 

19 19 22 

Total  34  26  60 

Produits de la mer 

Poissons crus Fruits de mer, préparations Poissons fumés 

10 9 11 

2 16 12 

12 25 23 

Total  30  30  60 

Produits végétaux 

Végétaux crus Végétaux surgelés Végétaux cuisinés 

15 10 4 

16 4 12 

31 14 16 

Total  29  32  61 

Echantillons d’environnement 

Eaux diverses Prélèvements de surface 

8 22 

3 28 

11 50 

Total  30  31  61 

Total  123  119  242 

Tableau 6 : nombre et nature des échantillons (a : positifs par l’une ou l’autre des méthodes)  Les couples de résultats des méthodes de référence et alternative par catégorie de produits sont présentés dans le tableau 7 (produits laitiers inclus). 

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Europrobe  LUMIPROBE 24 Listeria monocytogenes  Juillet 2014 

Institut scientifique d’Hygiène et d’Analyse

Catégorie  Réponse Méthode de référence 

positive (R+) 

Méthode de référence 

négative (R‐) 

Produits carnés Méthode alternative positive (A+)  PA= 28  PD= 2 

Méthode alternative négative (A‐) ND= 4 

dont 0 PPND NA= 26 

dont 0 PPNA 

Produits de la mer Méthode alternative positive (A+)  PA= 28  PD= 2 

Méthode alternative négative (A‐) ND= 0 

dont 0 PPND NA= 30 

dont 0 PPNA 

Produits végétaux Méthode alternative positive (A+)  PA= 27  PD= 1 

Méthode alternative négative (A‐) ND= 1 

dont 0 PPND NA= 32 

dont 0 PPNA 

Echantillons d’environnement 

Méthode alternative positive (A+)  PA= 27  PD= 0 

Méthode alternative négative (A‐) ND= 3 

dont 0 PPND NA= 31 

dont 0 PPNA 

Produits laitiers Méthode alternative positive (A+)  PA= 25  PD= 2 

Méthode alternative négative (A‐) ND= 3 

dont 0 PPND NA= 32 

dont 3 PPNA 

Total Méthode alternative positive (A+)  PA= 135  PD= 7 

Méthode alternative négative (A‐) ND= 11 

dont 0 PPND NA= 151 

dont 3 PPNA 

Tableau 7 : résultats des essais pour les deux méthodes (PA : accord positif, NA : accord négatif, ND : déviation négative, PD : déviation positive, PP : présumé positif avant confirmation, A+ : positifs confirmés, A‐ : négatifs immédiats et négatifs après confirmation quand présomptifs positifs) 

Les pourcentages obtenus, par rapport à la méthode de référence, sont les suivants : 

Exactitude relative : 95% (94%)*

Spécificité relative : 96% (96%)*

Sensibilité relative : 93% (92)** : calculs tenant compte des produits laitiers

La sensibilité a également été recalculée en tenant compte de l’ensemble des positifs confirmés (ceci inclut les positifs supplémentaires de la méthode alternative), comme indiqué dans le tableau 8. 

Pour la méthode de référence :  Pour la méthode alternative : 

(PA + ND) / (PA + PD + ND) = 95 %  (PA + PD) / (PA + PD + ND) = 93 % 

Tableau 8 : Sensibilité relative recalculée 

Toutes catégories confondues,  l’ensemble des résultats montre  l’existence de 18 résultats discordants  : 11 déviations  négatives  (4  produits  carnés,  1  produit  végétal,  3  échantillons  d’environnement  et  3  produits laitiers) et 7 déviations positives  (2 produits carnés, 2 produits de  la mer, 1 produit végétal et 2 produits laitiers). Selon l’annexe F de la norme NF EN 16140, le nombre de discordants Y étant de 18 (Y = 7 + 11), avec m = 7 et M = 4 et sachant que m>M, les deux méthodes ne sont pas significativement différentes. 

En conclusion, les performances du test LUMIPROBE 24 Listeria monocytogenes apparaissent équivalentes à celles de la méthode de référence. 

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3.1.2. Niveau de détection relatif Des essais ont été effectués sur des couples souche/matrice pour  l’ensemble des catégories étudiées. Les résultats bruts sont résumes dans l’annexe 7.  Six répétitions ont été effectuées avec six niveaux de contamination dont  le contrôle négatif pour chaque catégorie.  Les résultats obtenus sont présentés dans le tableau 9.  

Souche  Aliment  LOD50 Méthode de référence  LOD50 Méthode alternative 

L. monocytogenes 3 a  Saumon fumé  1,3 [ 0,8 ; 2,1 ]  2,2 [ 1,4 ; 3,5 ] 

L. monocytogenes ½ b  Rillettes  0,6 [ 0,4 ; 0,9 ]  0,9 [ 0,6 ; 1,5 ] 

L. monocytogenes ½ c  Crudités  0,6 [ 0,4 ; 0,9 ]  0,7[ 0,6 ; 0,9 ] 

L. monocytogenes ½ a  Eau de rinçage  0,5 [ 0,3 ; 0,8 ]  0,6 [ 0,4 ; 2,0 ] 

Tableau 9 : Niveau de détection relatif en UFC/25 g selon le test de Spearman‐Kärber (LOD50 avec intervalle de confiance)  Les niveaux de détection relatifs obtenus pour  la méthode alternative sont relativement  identiques à ceux obtenus pour la méthode de référence, quel que soit le couple matrice/souche utilisé.  La  limite de détection de  la méthode alternative  se  situe entre 0,4 et 3,5 UFC/25 g ou mL et  la  limite de détection de la méthode de référence se situe entre 0,3 et 2,1 UFC/25 g ou mL.  

3.1.3. Sélectivité L’exclusivité n’a pas été réalisée et les résultats obtenus dans l’étude de validation initiale ont été reconduits. Les essais réalisés sur 50 souches de Listeria monocytogenes montrent que l’ensemble des souches testées a été détecté par la méthode alternative. Les résultats bruts sont résumés dans l’annexe 8.  

3.1.4. Praticabilité Délai d’obtention des résultats : L’obtention des résultats positifs se fait en 2 à 3  jours avec  la méthode alternative en utilisant  le nouveau protocole  de  confirmation  (7  jours  avec  la méthode  alternative  en  incluant  la  confirmation  par  les  tests classiques de la norme de référence), contre 4 à 12 jours avec la méthode de référence. L’obtention des résultats négatifs se fait en 1  jour avec  la méthode alternative contre 2 à 5  jours (voire 12 jours) avec la méthode de référence.  

3.2. Etude interlaboratoires L’étude interlaboratoires a été réalisée en 2006 avec 11 laboratoires collaborateurs selon le référentiel NF EN ISO 16140. Les analyses ont été effectuées sur des échantillons de pâté, contaminés artificiellement avec une souche de Listeria monocytogenes 1/2 b isolée d’une charcuterie aux 3 niveaux suivants : 

‐ niveau 0 ‐ niveau légèrement supérieur au niveau de détection relatif (3 CFU /25g) ‐ niveau 10 fois supérieur au niveau précédent (30 CFU /25g) 

 Les laboratoires ont testé, par les deux méthodes, 8 réplicats pour chaque niveau de contamination, soient 528 analyses au total pour l’ensemble des laboratoires collaborateurs.  

3.2.1. Résultats Les résultats de l’étude interlaboratoires sont présentés dans le tableau 10.

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Niveaux de contamination 

Nombre total d'échantillons 

Nombre d'échantillons 

analysés 

Nombre de résultats exploités 

Nombre de résultats négatifs 

Nombre de résultats positifs 

REF  ALT  REF  ALT 

0  88  88  80  80  80  0  0 

1  88  88  80  1  1  79  79 

2  88  88  80  0  0  80  80 

Tableau 10 : Résultats de l’étude interlaboratoires de 2006  Les  résultats  d’un  laboratoire  n’ont  pas  été  exploités  car  5  résultats  discordants  ont  été  observés  (des échantillons non contaminés ont été trouvés positifs). Le  laboratoire évoque une erreur de manipulation avec un risque  important de contamination croisée. En effet, l’identification de la souche de L. monocytogenes isolée de ces échantillons montre qu’il s’agit du même sérotype que la souche utilisée pour la contamination artificielle.  

3.2.2. Calculs statistiques  

Exactitude relative, sensibilité relative, spécificité relative Les  valeurs  de  l’exactitude  relative,  de  la  spécificité  relative  et  de  la  sensibilité  relative  pour  l’étude interlaboratoires et pour l’étude comparative sont précisées dans le tableau 11.  

Paramètre  Etude interlaboratoires  Etude comparative 

Exactitude relative  99%  94% 

Spécificité relative  100%  96% 

Sensibilité relative  99%  92% 

Tableau 10 : Paramètres AC, SP, SE de  l’étude  interlaboratoires de 2006, comparaison avec  les données de l’étude comparative  Les résultats de l’étude collaborative sont supérieurs à ceux obtenus lors de l’étude préliminaire, en raison de la plus grande diversité d’échantillons testés lors de l’étude comparative. La sensibilité a également été recalculée en tenant compte de l’ensemble des positifs confirmés (ceci inclut les positifs supplémentaires de la méthode alternative), comme suit :  

Pour la méthode de référence :  Pour la méthode alternative : 

(PA + ND) / (PA + PD + ND) = 100%  (PA + PD) / (PA + PD + ND) = 99% 

 

Degré d’accord, concordance et odds ratio Le tableau 11 indique les valeurs pour la méthode alternative.  

Niveau de contamination  Degré d’accord  Concordance  COR 

L0  100%  100%  1 

L1  98%  97%  1,52 

L2  100%  100%  1 

Tableau 11 : Valeurs du degré d’accord, de la concordance et de l’odds ratio pour la méthode alternative  Le tableau 12 indique les valeurs pour la méthode de référence. 

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Europrobe  LUMIPROBE 24 Listeria monocytogenes  Juillet 2014 

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Niveau de contamination  Degré d’accord  Concordance  COR 

L0  100%  100%  1 

L1  100%  100%  1 

L2  100%  100%  1 

Tableau 12 : Valeurs du degré d’accord, de la concordance et de l’odds ratio pour la méthode de référence  La variabilité de la méthode alternative (degré d’accord, concordance, odds ratio) est identique à celle de la méthode de référence.     

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4. Conclusions

Etudes comparatives de 2005 et de 2006Les  performances  de  la méthode  Lumiprobe  24  Listeria monocytogenes  sont  comparables  à  celles  de  la méthode de référence EN ISO 11290‐1 et EN ISO 11290‐1/A1. 

L’étude de validation a porté sur 304 échantillons des différentes catégories testées : ‐ produits laitiers, ‐ produits carnés, ‐ produits de la mer, ‐ produits végétaux, ‐ échantillons d’environnement. 

L’exactitude relative obtenue est de 94 %,  la sensibilité relative est de 92 %, et  la spécificité relative est de 96%. 18 résultats discordants ont été obtenus : 7 résultats positifs supplémentaires et 11 résultats faux négatifs. 

Le niveau de détection  relatif de  la méthode  Lumiprobe 24  Listeria monocytogenes et de  la méthode de référence a été évalué pour l’ensemble des catégories. Il varie de 0,6 à 2,2 CFU / 25 g (mL) de produit et de 0,5 à 1,3 CFU  / 25 g  (mL) de produit  respectivement pour  la méthode alternative et pour  la méthode de référence. 

La spécificité de la méthode Lumiprobe 24 Listeria monocytogenes est satisfaisante. 

Etude interlaboratoires de 2006Les valeurs de l’exactitude relative, de la sensibilité relative et de la spécificité relative obtenues suite à l’étude interlaboratoires sont supérieures à celles obtenues lors de l’étude comparative. 

La variabilité de la méthode alternative, mise en évidence par les calculs du degré d’accord, de la concordance et des odds ratio, est similaire à celle de la méthode de référence. 

Fait à Massy, le 31 juillet 2014 François Le Nestour 

Responsable de l’Unité Innovation Biologie 

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Annexe 1

Protocole de la méthode alternative

Protocole général de la méthode alternative

ETAPE 1 : ENRICHISSEMENT 25 g (mL) d’échantillon + 225 mL de bouillon RM

Incubation (37 ± 1) °C de (24 ± 2) heures

ETAPE 2 : LYSE CELLULAIRE (1) Transfert de 40 µL du bouillon RM incubé dans 40 µL de tampon de lyse

Incubation (37 ± 1) °C de 15 minutes sous agitation (500 tr/min).

ETAPE 3 : HYBRIDATION (1) Ajouter 90 µL de tampon d’hybridation et incuber 45 minutes à (50±1)°C

sous agitation (500 tr/min). Rincer 2 fois puis laver 2 fois avec le tampon de lavage

ETAPE 4 : REACTION AVEC LE CONJUGUE (1) Ajouter 100 µL de solution de conjugué et incuber 15 minutes à (37±1)°C

sous agitation (500 tr/min). Laver 4 fois avec le tampon de lavage

ETAPE 5 : AJOUT DU SUBSTRAT (1) Ajouter 100 µL de substrat et incuber 15 minutes à température ambiante à l’obscurité

Lire les résultats au moyen d’un luminomètre

Tous les résultats positifs sont confirmés à partir de 100 µL du bouillon d’enrichissement : - soit en mettant en œuvre les tests classiques décrits dans les méthodes normalisées par le CEN, l’ISO (incluant l’étape de purification), - soit sur une gélose chromogène de formulation Agar selon Ottaviani et Agosti, ou sur une gélose chromogène issue d’une méthode bénéficiant de la marque NF VALIDATION.

Remarque : (1) : volumes pour des tests en microplaque

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Protocole spécifique de la méthode alternative

ETAPE 1 : PRE-ENRICHISSEMENT ET ENRICHISSEMENT 25 g (mL) d’échantillon + 75 mL de bouillon RML

Incubation (37±1) °C de 6 à 8 heures Repiquage de 10 mL de RML incubé dans 90 mL de bouillon RML

Incubation (37±1) °C de 16 à 20 heures

ETAPE 2 : LYSE CELLULAIRE (1)

Transfert de 40 µL du bouillon RML incubé dans 40 µL de tampon de lyse Incubation (37 ± 1) °C de 15 minutes sous agitation (500 tr/min).

ETAPE 3 : HYBRIDATION (1)

Ajouter 90 µL de tampon d’hybridation et incuber 45 minutes à (50±1)°C sous agitation (500 tr/min).

Rincer 2 fois puis laver 2 fois avec le tampon de lavage

ETAPE 4 : REACTION AVEC LE CONJUGUE (1)

Ajouter 100 µL de solution de conjugué et incuber 15 minutes à (37±1)°C sous agitation (500 tr/min). Laver 4 fois avec le tampon de lavage

ETAPE 5 : AJOUT DU SUBSTRAT (1)

Ajouter 100 µL de substrat et incuber 15 minutes à température ambiante à l’obscurité

Lire les résultats au moyen d’un luminomètre

Tous les résultats positifs sont confirmés à partir de 100 µL du bouillon d’enrichissement :

- soit en mettant en œuvre les tests classiques décrits dans les méthodes normalisées par le CEN, l’ISO (incluant l’étape de purification), -soit sur une gélose chromogène de formulation Agar selon Ottaviani et Agosti, ou sur une gélose chromogène issue d’une méthode bénéficiant de la marque NF VALIDATION.

Remarque : (1) : volumes pour des tests en microplaque

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Annexe 2

Protocole de la méthode de référence

Protocole de la méthode de référence NF EN ISO 11290-1 et NF EN ISO 11290-1/A1 (02/2005)

Prise d’essai de X g/ mL +

9 X ml de bouillon Fraser demi

Incubation (24±3) heures à (30±1) °C

Isolement sur géloses sélectives : gélose selon O A (1) et Palcam (2)

Transfert de 0,1 mL de l’enrichissement primaire dans 10 mL de milieu Fraser

(1) Incubation (24±3) et (24±3) heures à (37±1) °C

Incubation (48±2) heures à (37±1)°C

(2) Incubation (48± 3) heures à (37±1) °C

Isolement sur géloses sélectives : gélose selon O A (1) et Palcam (2)

(1) Incubation (24±3) et (24±3) heures à (37±1) °C

(2) Incubation (48±3) heures à (37±1) °C

Présence de colonies caractéristiques de Listeria spp (5 colonies par gélose à tester)

Confirmation du genre Listeria spp

Identification de l’espèce -recherche de l’hémolyse -utilisation des glucides

-test de CAMP

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Annexe 3

Résultats bruts (AC, SE et SP)

Validation initiale (2005)

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Annexe 4

Résultats bruts (Niveau de détection relatif)

Validation initiale (2005)

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Annexe 5

Résultats bruts (Sélectivité)

Validation initiale (2005)

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Annexe 6

Résultats bruts (AC, SE et SP)

Extension (2006)

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Annexe 7

Résultats bruts (Niveau de détection relatif)

Extension (2006)

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Annexe 8

Résultats bruts (Sélectivité)

Extension (2006)

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