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PubMed文献检索 天津医科大学图书馆 天津医科大学图书馆

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Page 1: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

PubMed文献检索

天津医科大学图书馆天津医科大学图书馆

Page 2: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

教学内容教学内容

一 P bM d简介一、PubMed简介

二 检索规则与常用检索技术二、检索规则与常用检索技术

三 检索方式与途径三、检索方式与途径

四 检索结果处理四、检索结果处理

五、注册五、注册

六、练习题六、练习题

Page 3: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

P bM d简介一、PubMed简介

1.PubMed基本情况

2 P bM d的由来 2.PubMed的由来

3.PubMed的特点3.PubMed的特点

4.PubMed的数据收录范围

5.PubMed主页

Page 4: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

P bM d简介一、PubMed简介

1.PubMed基本情况

PubMed是美国NLM所属的国家生物技术信息 PubMed是美国NLM所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的一个以Web方式向用户提供服务的生物医学文献检索系统 是继提供服务的生物医学文献检索系统,是继MEDLINE数据库国际联机检索和光盘检索之后推出的 种网络免费检索方式后推出的一种网络免费检索方式。

Page 5: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

P bM d简介一、PubMed简介

包括3 000多万篇来自MEDLINE和其他 包括3,000多万篇来自MEDLINE和其他生命科学期刊的生物医学文献

早可回溯到 年 早可回溯到1948年

提供部分全文和其他相关资源的链接 提供部分全文和其他相关资源的链接

Page 6: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

P bM d简介一、PubMed简介

2.PubMed的由来

创刊: 早可以追溯到1879年美国NLM编译出版的医学文献检索刊物《医学索引》(Index Medicus, IM)。(Index Medicus, IM)。

Page 7: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

P bM d简介一、PubMed简介

1964年:为了实现IM的自动化编辑出版,NLM开发了“医学文献分析与检索系统”NLM开发了 医学文献分析与检索系统( Medical Literature Analysis andRetrieval System 简称MEDLARS)Retrieval System, 简称MEDLARS).

目前MEDLARS已拥有40多个数据库,其中 重要 大 且发展 早的为中 重要、 大、且发展 早的为MEDLINE(MEDLARS ON LINE) 生物医学数据库学数据库

Page 8: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

P bM d简介一、PubMed简介

1971年 MEDLINE正式建成联机数据库 1971年: MEDLINE正式建成联机数据库,并通过MEDLARS开展国际联机检索服务。

自MEDLINE投入联机检索服务以来 一直成 自MEDLINE投入联机检索服务以来, 直成为MEDLARS 大的使用频率 高的数据库。

Page 9: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

P bM d简介一、PubMed简介

1983年:随着光盘技术的发展,MEDLINE光盘数据库建成,并得到了广泛的应用。泛的应用。

1997年9月26日 MEDLINE网络版开通1997年9月26日, MEDLINE网络版开通,取名PubMed,并向全球免费开放。

Page 10: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

P bM d简介一、PubMed简介

很多医务工作者宁可在每次检索时都花上成倍的时间 却不愿花上几个小时去花上成倍的时间,却不愿花上几个小时去认真研究一下PubMed。"君欲善其事,必先利其器" P bM d就好像 把功能强大的枪利其器",PubMed就好像一把功能强大的枪,你决不能仅仅满足于知道扣动扳机就可以发射子弹 更重要的是 你要知道如何利发射子弹,更重要的是,你要知道如何利用准星瞄准,如何把这把枪的功能发挥到及至。

Page 11: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

P bM d简介3 Pubmed的特点

一、PubMed简介3.Pubmed的特点

收录生物医学权威期刊 多收录生物医学权威期刊 多

世界上70多个国家的7000多种权威期刊

多种检索方法 多条检索途径 多种检索方法,多条检索途径

时效性极强

回溯年代久远(1948年至今)

利用MeSH作为转换词表,标引质量高利用 作为转换词表,标引质量高

部分文献可以免费获取全文

检全率 检准率高 检全率、检准率高

Page 12: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

P bM d简介

的数据收录范围

一、PubMed简介

4.PubMed的数据收录范围

MEDLINE

Publisher supplied citationsPreMedlinePublisher supplied citations(出版商提供的书目信息)

与NCBI其它数据库的链接

Page 13: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

基本情况4.1 MEDLINE基本情况

出版:美国国家医学图书馆(NationalLibrary of Medicine NLM)Library of Medicine, NLM)。

印刷版 1879联机版 联机版 1971

光盘版 1983 网络版 1997

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MEDLINE数据库简介MEDLINE数据库简介

收录范围:收录7000余种权威期刊,包含50种语言 涉及 多个国家 约 万篇 年 内容涉语言,涉及80多个国家,约40万篇/年。内容涉及生物医学各个领域;85%原文为英语。

回溯年代:1948年至今

每条记录标有[indexed for MEDLIEN]标记 每条记录标有[indexed for MEDLIEN]标记

Page 15: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

MEDLINE数据库简介

学科范围:

MEDLINE数据库简介

学科范围: 基础生命科学 临床生命科学

生物科学 解剖学

组织学 化学与药物组织学 化学与药物

心理学 社会医学

农业 医技设备学 农业 医技设备学

医技工业学 医学信息学

使用词表 (医学主题词表)使用词表:MeSH(医学主题词表)

Page 16: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

4.2 PreMEDLINE

是一种由正在加工处理中的文献记录组成的数据库 这些新记录还未被标引 暂时的数据库,这些新记录还未被标引,暂时存放在PreMEDLINE数据库中。每天更新,经过标引(增加主题词 文献类型 数据经过标引(增加主题词、文献类型、数据库存取号等字段)以后转入Medline,一旦记录被转入到Medline数据库,就被从记录被转入到Medline数据库,就被从PreMEDLINE数据库中删除。每条记录标有[in Process]标记有[in Process]标记。

Page 17: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

New Data

Collect

Pre MedlinePre-Medline新信息

MedlineProcess

一周以后

PubMed

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4 3 Publisher-Supplied Citation(出版商提供的书目信息)

4.3 Publisher-Supplied Citation

出版商直接向PubMed提供的非M dli 收录的电子刊物 如Medline收录的电子刊物,如:Science或Nature中的地质学文献等。每条记录标有[ as supplied by publishers]标记。publishers]标记。

Page 19: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

[PubMed-indexed for MEDLINE]

[PubMed-as supplied by publisher][PubMed as supplied by publisher]

[P bM d i ][PubMed-in process]

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PubMed与MEDLINE的区别PubMed与MEDLINE的区别

Page 21: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

4 4与NCBI其它数据库的链接4.4与NCBI其它数据库的链接

Nucleotide:DNA序列数据库

P i 蛋白质序列数据库 Protein:蛋白质序列数据库

Genome:基因组序列数据库 Genome:基因组序列数据库

Structure:分子结构模型数据库

OMIM:人类孟德尔遗传学在线数据库

PMC P bM d中 免费全文期刊检索 PMC: PubMed中心,免费全文期刊检索

Page 22: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

与NCBI其它42个数据库的链接与NCBI其它42个数据库的链接

Page 23: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

PubMed主页 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed

页面介绍基本检索输入框

高级检索入口基本检索输入框

个人空间

P b d简介Pubmed简介

检索指南检索工具: 其他资源:

主题词数据库检索指南特定文献检索

临床咨询专题咨询

主题词数据库期刊数据库临床试验等

Page 24: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

二、检索规则及检索技术

Page 25: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

检索规则检索规则

1 自动转换匹配1、自动转换匹配

PubMed具有对检索词的自动转换匹配功能。

对于输入检索框的检索词,PubMed按4个转换表

进行对照 匹配和转换 然后进行检索进行对照、匹配和转换,然后进行检索。

① MeSH表:包括MeSH的主题词、副主题词、款目词词。

②期刊刊名表: 所收录的刊名全称、缩写和ISSN③短 表 献篇名 摘中 的短③短语表:文献篇名或文摘中出现的短语

④著者索引表: PubMed所收录的的作者姓名组成。

Page 26: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

检索规则

1、自动转换匹配

检索规则

1、自动转换匹配

如果在4个词表的任何一个中找到匹配的内

容,则匹配结束。

例如:如果输入的检索词在主题词转换表中 例如:如果输入的检索词在主题词转换表中

找到与其相匹配的主题词,则使用该主题词

进行检索并结束匹配 不会在其他词表中进进行检索并结束匹配,不会在其他词表中进

行匹配。

Page 27: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

检索规则

1、自动转换匹配

检索规则

1、自动转换匹配

如果输入的单个词在4个词表中都未找到匹配的内容 其将被在All fi ld 中进行检索配的内容,其将被在All fields中进行检索;如果输入的词组未找到匹配的内容,该词组将被拆成单词并分别对其进行匹配后将组将被拆成单词并分别对其进行匹配后将匹配结果以AND连接。

输入的检索词被自动匹配后的具体检索式可通过检索结果页面右侧的Search details栏中查看。

Page 28: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

如:renal failure renal 如insufficiency[MeSH Terms] OR (renal[All Fields] AND insufficiency[All(renal[All Fields] AND insufficiency[All Fields]) OR renal insufficiency[All Fields] OR (renal"[All Fields] ANDFields] OR (renal [All Fields] AND failure…

结果显示页右侧Details显示系统自动匹配转换

的检索词

Page 29: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

检索规则检索规则

2、短语检索:

如果在短语上加双引号 P bM d将不执行如果在短语上加双引号, PubMed将不执行

自动转换功能,也不进行MeSH词的扩检。

例: “lung cancer”例: lung cancer

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常用的检索技术常用的检索技术

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1.布尔检索

Page 33: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

1.布尔检索

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2.截词检索(又称通配符检索)

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2.截词检索

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3.字段限制检索

Page 37: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

P b d常用字段Pubmed常用字段

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字 标常用字段标识符

文摘

第 著者单位地址第一著者单位地址

出版商提供文献识别号

著者群

版权说明

参考评论文献

合著者

文献参考评论

定稿版定稿版

校样版

输入日期

输入完成日期

电子出版日期

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电子出版日期电子出版日期

文献出版日期

数据加入PubMed日期

文献勘误

参考文献勘误

全部著者姓名全部著者姓名

全部调研者姓名

作为文章主题的著者全称作为文章主题的著者全称

文献相关注释

基金编号

基因符号

期编号

资助调研者资助调研者

资助调研单位

国际标准期刊号国际标准期刊号

美国立医学图书馆识别号

期刊全称

Page 40: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

后修订日期

规范词表词

规范词确立日期规范词确立日期

系统组织的文摘

版权拥有者版权拥有者

题录提供机构的识别号

病史相关与原始记录病史相关与原始记录

其他关键词

提供其他关键词的机构提供其他关键词的机构

数据提供者机构

文章总页数

出版商提供数据时间

期刊出版国

数据库文献编号

Page 41: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

作为主题词的个人姓名

出版状态

文献类型文献类型

出版模式(纸张或电子)

参考文献数

已撤回的文献已撤回的文献

酶或化学物质代码

正在撤消中的文章

初版文献

修订和再版的文章

子专题文档

太空署提供的数据

二次文献数据库以及文章讨论的分子序列访问号原文来源原文来源引用了病例的文献内部处理代码

标准期刊缩写

文献标题翻译标题更新文献更新文献文献正在更新期刊卷号

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4.扩展检索

Page 43: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

*5.加权检索(主要用于Mesh主题词检索)

加权检索的基本方法是:在每个提问词后面给定一个数

值表示其重要程度 这个数值称为权 在检索时 先查值表示其重要程度,这个数值称为权,在检索时,先查

找这些检索词在数据库记录中是否存在,然后计算存在

的检索词的权值总和 权值之和达到或超过预先给定的的检索词的权值总和。权值之和达到或超过预先给定的

阈值,该记录即为命中记录。

加权检索的加权检索的侧重点侧重点于判定检索词或字符串在满足检索逻加权检索的加权检索的侧重点侧重点于判定检索词或字符串在满足检索逻

辑后对文献命中与否的影响程度。

运用加权检索可以命中核心概念文献,因此它是一种缩

小检索范围提高检准率的有效方法。

Page 44: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

三、检索方式与途径

1、基本检索2、高级检索3、主题词检索3、主题词检索4、期刊检索5 题录检索5、题录检索6、临床咨询

临床试验7、临床试验

Page 45: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

1、基本检索1、基本检索 1.1 自由词检索

在检索栏中输入在检索栏中输入: 一个或多个检索词 (系统默认空格为AND检

索)索)

例:aloe psoriasis(芦荟治疗牛皮癣的文献)

Page 46: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

1、基本检索1、基本检索 1.2 词组检索

对于输入PubMed的多词词组,PubMed会查询词组索引,对于输 的多词词 会 询词 索引

如果查到相应词组则将其作为一个检索词来检索。如

果未查到相应词组 则将其拆分成单个词 分别进行果未查到相应词组,则将其拆分成单个词,分别进行

检索并以逻辑和(AND)进行组配。

Page 47: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

1、基本检索1、基本检索 1.2 词组检索

如:single cell相当于检索single AND cell。可通

过如下方式强制将其作为一个词组进行检索过如下方式强制将其作为一个词组进行检索:

1.加双引号:“single cell”加双引号 g

2.加标段标识[tw]: single cell[tw]

3.使用短横线“-”将两词连接起来:single-cell

4 使用截词符*:single cell*4.使用截词符*:single cell*

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Page 49: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

1、基本检索1、基本检索 1.3 字段限制检索

Page 50: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

字 标常用字段标识符

Affiliation[AD] :第一作者所属单位和地址

Author[AU]:作者姓名

Language[LA]:原文语种

chinese [la] 或 chi [la] (前3个字母)

MeSH Terms[MH]:主题词

自动扩展下位主题词;如需关闭该功能,使[mh:noexp] MeSH Subheadings[SH]:副主题词

自动扩展下位副主题词;如需关闭该功能,使用[sh:noexp]

Page 51: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

字 标常用字段标识符

Publication Date[DP] :出版时间1998/03[dp]; 1998[dp]; 1996:1998[dp]; 1998/01:1998/04 [dp]

P bli ti T [PT] 出版类型 Publication Type[PT]:出版类型

review[pt]文章题名 Title[TI] :文章题名

Text Words[TW]:文本词包括Titl Ab t t M SH T M SH S bh di Ch i l包括Title, Abstract, MeSH Terms, MeSH Subheadings, Chemical Substance Names, Personal Name as Subject 等字段

Title/Abstract[TIAB]:题名摘要Title/Abstract[TIAB]:题名摘要

刊名: Source[SO] 、Journal[Jour] 、Journal Title Abbreviation[TA][ ]

Page 52: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

1、基本检索1、基本检索 1.3 字段限制检索(标题、语种)

在检索栏中输入在检索栏中输入:例:liver cancer[ti] AND

chinese[la]

Page 53: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

1、基本检索1、基本检索 1.3 字段限制检索(刊名)

在检索栏中输入在检索栏中输入: 刊名输全称或MEDLINE认

可的标准缩写形式可的标准缩写形式,[so]例:JAMA [so]

Page 54: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

1、基本检索1、基本检索 1.3 字段限制检索 (刊名)

在检索栏中输入在检索栏中输入: 刊名输全称或MEDLINE认

可的标准缩写形式可的标准缩写形式,[jour]例:JAMA [jour]

Page 55: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

1、基本检索1、基本检索 1.3 字段限制检索 (刊名)

在检索栏中输入在检索栏中输入: 刊名输全称或MEDLINE认

可的标准缩写形式可的标准缩写形式,[ta]例:JAMA [ta]

Page 56: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

1、基本检索1、基本检索 1.4 著者检索

作者书写格式西方人姓名书写格式:First name、Middle Name、Last name。

如:美国肯尼迪总统名为: John Frank Kenedy,Kenedy为Last name(姓)。

F k为Middl 比较少看到 多看到 J h F K d Frank为Middle name,比较少看到,多看到 John F. Kenedy,中间名缩写了。

如果看到姓名中间有逗号,则逗号前一定是姓。如: Kenedy, John F.

中国人姓名格式:Last name、First name。

如 钟世镇 就有如下拼写形式可供检索如:钟世镇,就有如下拼写形式可供检索:

Zhong shizhen

shizheng zhong shizheng zhong

zhong sz zhong s

Page 57: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

1、基本检索1、基本检索 1.4 著者检索

姓在前,名首字母缩写在后,姓在前,名首字母缩写在后,之间要有空格

在检索栏中输入: 例:Wong JS / Wong Julia S 例:Wong JS / Wong Julia S

Page 58: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University
Page 59: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

1、基本检索1、基本检索 1.5 截词检索

截词检索:可通过在词干后加“*”检索以该词干开头的所有词的文献。需要注意的是:截词检索将关闭

的自 单 功能 的扩 检PubMed的自动单词匹配功能以及Mesh主题词的扩展检索功能 。

如:输入heart attack*,不会启动自动匹配功能检索与之匹配的Mesh主题词“Myocardial Infarction”及其下位更专指的主题词的相关文献其下位更专指的主题词的相关文献。

截词功能 多可使用600个词形变化。超过600个会显示如下图的提示信息示如下图的提示信息。

Page 60: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University
Page 61: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

1、基本检索1、基本检索 PubMed在检索时忽略一些常用的英语词汇,下表为禁用词列表下表为禁用词列表

Page 62: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

2、高级检索2、高级检索

检索式编制通过检索框后面的通过检索框后面的“Show Index list”选项可查询在所有字段或某一特定字段中

布尔逻辑检索技术段或某一特定字段中的索引,可以从索引中选择一个或几个词来完善检索策略

检索字段

来完善检索策略。

Page 63: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

2、高级检索2、高级检索

检索式编号可替代检索式进行输入检索如:#5 AND #6索如可组配检索式,如:#1 OR #2,

#1 AND child点击编号可对检索式进行删除 保存点击编号可对检索式进行删除、保存等操作

检索历史

检索式 检出结果

检索时间

Page 64: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

检索历史(简称检索史)

检索史按检索式运行的顺序列出各检索式,包括检索式序号、检索策略、检索时间、检索到的文献条数。

检索史 多保存 条检索式 检索史将在离 检索史 多保存100条检索式,检索史将在离开PubMed或其他Entrez数据库8小时后消失。

单击检索式后的文献数链接可显示该检索式的检索结 单击检索式后的文献数链接可显示该检索式的检索结果。

可通过检索式的序号对检索策略进行组配 可通过检索式的序号对检索策略进行组配

单击检索史窗口上方的Download history或者Clear History按钮可将所有检索式下载或者删除History按钮可将所有检索式下载或者删除。

Page 65: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University
Page 66: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University
Page 67: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University
Page 68: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

例题1:例题1:

检索有关胃肠癌(gastrointestinal

cancer,gastrointestinal neoplasms)

术 护 方面的术后护理(postoperative care)方面的

文献文献。

Page 69: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

点击检索点击检索

Page 70: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University
Page 71: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

3 主题词检索3、主题词检索

文献太多,如何保证查全和查准?

M h词表帮助您!Mesh词表帮助您!

它是美国国立医学图书馆编制的权威性主题词表。它是美国国立医学图书馆编制的权威性主题词表。

Mesh在文献检索中的重要作用主要表现在两个方面:

准确性(准确揭示文献内容的主题)和专指性。

Page 72: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

3 主题词检索

主题词(S bj t H di )是经人工规范化处理的 能

3、主题词检索

主题词(Subject Heading)是经人工规范化处理的 能

表达文章主题概念的语词。所谓规范化处理,就是在文献存

储时,对文献中的同义词、近义词、多义词等加以严格的控

制和规范,使得同一主题概念的文献相对集中在一个主题词

下。

主题词 关键词主题词 关键词

禽流感 禽流感、鸟流感、家禽瘟症、鸡瘟

Neoplasms Neoplasm、Tumors、Tumor、Cancerꞏꞏꞏꞏꞏ

Aspirin Aspirin、Acetylsalicylic Acid、Micristin、SolprinꞏꞏꞏꞏꞏAspirin Aspirin、Acetylsalicylic Acid、Micristin、Solprin

Page 73: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

1、第一种进入方法

Page 74: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

2、第二种进第 种进入方法

Page 75: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University
Page 76: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

3 主题词检索3、主题词检索

例题2: 利用主题词检索途径,检索近有关肝 利用主题词检索途径,检索近有关肝癌诊断(liver cancer, diagnosis)方面的英文文献的英文文献。

Page 77: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

3 主题词检索3、主题词检索

输入检索词输入检索词

词义解释

主题词轮排表主题词轮排表

Page 78: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

副主题词

主题词加权、不扩展选项(默认选项)不扩展选项(默认选项)

Page 79: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

可对检索结果进行限定。如果进行了限定,系统默认以下的操作如果进行了限定,系统默认以下的操作都进行此限定,如要进行新的检索应将限定清除“clear”。

Page 80: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

主题词加权检索

Page 81: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University
Page 82: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

主题词不扩展检索(系统默认按照扩展进行检索)

Page 83: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University
Page 84: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

入口词入口词

上位主题词

主题词

上位主题词

树状结构下位主题词

Page 85: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

MeSH检索的优点MeSH检索的优点

查全同义词:如:renal/kidney failure; tongue cancer/tumor…

查全子概念:如 h i / t kid f il ATN如:chronic/acute kidney failure, ATN

根据树形结构调整检索词

缩小 不扩展下位词 或选用某个下位词缩小:不扩展下位词,或选用某个下位词;

扩大:选用上位词,或选用多个同位词;

了解同一概念的同义词 近义词 供自由词检索参考 了解同一概念的同义词、近义词,供自由词检索参考

提高文献相关度

标有MeSH词的都是文章的主题 筛去非主题的文章标有MeSH词的都是文章的主题,筛去非主题的文章

Major Topic Headings(加权,重点论述的主题)

Page 86: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

MeSH检索的缺陷MeSH检索的缺陷

人工标引费时, 新论文还未标MeSH词( In Process),用MeSH会漏检。

Medline不收录的文献,Supplied by publisher的文献,不标MeSH词。

新词、一些很专指的概念没有对应的规范词。

如 SARS(03年词表中没有) 舌根癌如:SARS(03年词表中没有),舌根癌

查上述类型的文献需结合自由词检索

Page 87: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

4 期刊检索4、期刊检索

通过输入刊名全称或缩写、ISSN号等浏览期刊出版社通过输入刊名全称或缩写、 SS 号等浏览期刊出版社等详细信息。

提供期刊:提供期刊:

在PMC中的免费全文链接

在Nucleotide,Protein,Pubmed等库中的记录链接。等库

相关的其他期刊

……

Page 88: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

1、第一种进入方法

Page 89: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

2、第二种进入方法入方法

Page 90: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

4 期刊检索4、期刊检索

Page 91: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

4 期刊检索4、期刊检索

如果刊名是Mesh词(如:Gene Therapy、Science、Cell),或刊名是单个单词Science、Cell),或刊名是单个单词(Scanning),如只想将其作为刊名检索,需加刊名字段标识[so]、[ta]、[jour]。加刊名字段标识[so]、[ta]、[jour]。

推荐使用刊名全称或缩写查找,因为有些过早的文献没有ISSN的文献没有ISSN。

Page 92: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

4 期刊检索4、期刊检索

例题3:检索《 》刊登的所有文献篇数检索《Lancet》刊登的所有文献篇数。

Page 93: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University
Page 94: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University
Page 95: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

清除之前的检索式

创刊年代 1823年创刊年代:1823年

出版频率:周刊

主题词:医学

Page 96: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

可对检索结果进行限定

Page 97: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

5 题录检索5、题录检索

通过输入文献出处信息 查找特定文献 通过输入文献出处信息,查找特定文献。

(刊名要准确,缩写要标准;著者姓名大小写不敏感)感)

有两种方式:

单 引文匹配( )1、单一引文匹配(Single Citation Matcher)输入已知的信息,可得到相应的特定文

献,如投稿遗漏的页码或第二、三作者等。

2、成组引文匹配(Batch Citation Matcher)允许一次输入多条检索要求,返回结果为相

应文献的PMID。应文献的PMID。

Page 98: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

进入Single Citation Matcher进入Single Citation Matcher

单一引文匹配

Page 99: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

如果希望检索结果的专指性更强 可以填写更多的已知信如果希望检索结果的专指性更强,可以填写更多的已知信息 ,如:

journal,date, volume, author name, title words

Page 100: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

5 题录检索

例题4

5、题录检索

例题4:检索1975年发表在Taiwan yi xue检索1975年发表在Taiwan yi xue hui za zhi 上, 由Chang PY撰写的文献的合著者的文献的合著者。

Page 101: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University
Page 102: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

检索表达式

合著者

Page 103: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

进入Batch Citation Matcher进入Batch Citation Matcher

成组引文匹配

Page 104: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University
Page 105: PubMed文献检索 - Tianjin Medical University

6 临床咨询6、临床咨询(获取循证医学证据)

利用PubMed 提供的“Clinical Queries”功能,获取各种类型的循证医学证据获取各种类型的循证医学证据。

只需在检索框中输入疾病名称或干预手段等检索词 点击S h 即可获取系统评价 M t 分词,点击Search,即可获取系统评价、Meta分析、临床试验等循证医学证据。

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供查找疾病的病因、诊断、治疗 预后的

查找疾病的系统评价文献

查找医学遗传学方面的文献

治疗、预后的文献

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供查找疾病的病因 诊断病因、诊断、治疗、预后的文献

供查全或查准

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7 临床试验7、临床试验(获取循证医学证据)

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7、临床试验7、临床试验

美国国立医学图书馆研制开发的临床试验数据库 收录了美国及世界170多个国家经注册据库。收录了美国及世界170多个国家经注册登记的8万多条临床试验的详细信息,是十分重要的循证医学信息资源。重要的循证医学信息资源。

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四 检索结果处理四、检索结果处理

1、显示方式选择

输2、输出方式选择

3、全文的获取及相关链接3、全文的获取及相关链接

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1 显示方式选择(Di l tti )1、显示方式选择(Display settings )

显示格式选择(format ):

summary(默认格式:题名、作者、刊summary(默认格式:题名、作者、刊名)

Abstract (文摘格式)Abstract (文摘格式)

Medline(包括所有字段,并有字段标识符)

增加网页显示的记录数(items per page ) 增加网页显示的记录数(items per page ) 排序选择(sort by):

可按日期 作者 刊名 题名等顺序排列可按日期、作者、刊名、题名等顺序排列。

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2、输出方式选择(send to) File:保存检索结果为文本文件

Clipboard 剪贴板 多次检索 可暂存每次Clipboard 剪贴板,多次检索,可暂存每次检索需下载的记录, 后一起保存。 多允许存储500条 保留8小时许存储500条,保留8小时。

Email: 通过邮件发送

Collections:将检索结果存到My NCBI中Order:全文传递服务,需帐号 收费Order:全文传递服务,需帐号、收费。

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3 全文的获取及相关链接3、全文的获取及相关链接

1、联机获取全文(文摘中超链接)1、联机获取全文(文摘中超链接)

在文摘显示的界面上通过刊名(彩色活动图标)链接电子期刊的网站,部分能获取该文献的电子全文。电子期刊的网站,部分能获取该文献的电子全文。

2、PubMed Central(PMC)PMC是美国国立医学图书馆生命科学期刊文献的免费PMC是美国国立医学图书馆生命科学期刊文献的免费数据化文档、访问该数据库可不加任何限制获取全文。

3 Linkout(全文外部资源链接)3、Linkout(全文外部资源链接)

“Linkout”链接了PubMed的全文电子期刊网站,在有效的IP地址控制下 如图书馆订购了“Linkout”在有效的IP地址控制下,如图书馆订购了“Linkout”链接的电子期刊,就可获取这些电子期刊全文。(必须在校园网物理地址范围内)须在校园网物理地址范围内)

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五 注册五、注册

PubMed提供个性化服务(My NCBI),用户可通过注册(免费)享受包括保存检索式、信可通过注册(免费)享受包括保存检索式、信息提醒(Alerts)等个性化服务。

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练习题

1.分别通过基本检索和主题词检索两种途径检索2008年以来有关萎缩性胃炎药物治疗(atrophic gastritis, drug therapy)方面的英文文献。

(1)基本检索途径:①检索式;②限定条件;③检索结果篇数。

(2)主题词检索途径:①主题词;②副主题词;③检索式;④检索结果篇数;⑤其中一篇文献的篇名、第一作者、文献出处、PMID号码。

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练习题

2.利用高级检索途径,检索天津医科大学(tianjinmedical university)姚智(yao z)教授2011年发表在Peptides的文献。写出:(1)文献题录;(2)第一作者;(3)通讯作者;(4)PMID号码;(5)该文相关文献篇数 ( )该文所在期刊卷期篇数 ( )该刊第 卷献篇数;(6)该文所在期刊卷期篇数;(7)该刊第一卷年份。

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练习题

3.通过“Journals in NCBI Databases”检索《The American journal of pathology》(美国病理学杂志),写出:(1)刊名缩写(NLM Title Abbreviation);(2)创刊年份;(3)发刊频次;(4)出版国别 ( )出版物类型出版国别;(5)出版物类型。

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练习题

4.检索2008年以来有关小细胞肺癌(small cell lung cancer, SCLC)方面的文献。写出:cell lung cancer, SCLC)方面的文献。写出:(1)检索式;(2)检索结果篇数;(3)免费全文篇数;(4)综述篇数篇数;(4)综述篇数。

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练习题

5.PubMed提供个性化服务(My NCBI),用户可通过注册(免费)享受包括保存检索式、信息提醒等个性化服务。根据本人学科专业设置Alerts。

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练习题

6.检索早期非小细胞肺癌外科治疗系统评价的文献,写出:(1)检索式;(2)检索篇数。

检索检索词:

非小细胞肺癌:

non-small cell lung carcinoma,NSCLC外科治疗: surgery therapy早期:early stage;early period;early periods

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谢谢!谢谢!