reaxys user guide 2015 by bitek chems

User Guide

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Reaxys workflow

• Multi-Step Reactions • Reaction Dossiers • Experimental Procedure • SD/Scopus link • PubChem

• Analysis View • Filtering/Ranking • Find Similar Reactions • List Manipulation

• Ask Reaxys • ReaxysTree • Molecular Formula • MarvinSketch • Create Structure Template from Names • Similarity • Combine Search

• Report • Export • Alert

Search Search

Results

Refine

Results

Synthesis

Plan Export

• AutoPlan • Synthesis Planner • Commercial Availability



Login https://www.reaxys.com

• ID license → https://www.reaxys.com 에 접속하여 ID/PW로 Login

• IP license → https://www.reaxys.com 에 접속하면 자동 Login

License type 별 접속








All rights reserved. Search

• Reactions: 구조/반응식을 이용한 반응 정보 검색 • Substances, Names, Formulas: 구조, Chemical name, CAS-RN 등 chemical identifier를 이용한 물질 정보 검색

1. Search Type • Ask Reaxys: 문구 또는 키워드를 입력하여 손쉽게 검색

• Literature: 저자, 특허 번호 등을 이용한 서지 정보 검색 • ReaxysTree: 문헌 검색 키워드 분류 체계를 이용한 서지 정보 검색


All rights reserved. Search

2. Ask Reaxys • Ask Reaxys 검색 창 하단의 “Examples” 를 클릭하면 Substance ,Reaction, Citation검색을 위한 키워드 및 문구 예제를 종류별로 상세하게 확인 가능

3. Drawing 빈 화면 double click 시 생성되는 drawing editor창에 검색하고자 하는 Reaction 또는 structure drawing ※ 기본 설정된 editor는 MarvinSketch이며 다른 editor로 변경 가능 MarvinSketch는 Java 프로그램 설치 후 이용 가능

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5. Search Type

• Search as (reaction에서의 역할) Product /Starting material / Any role /Reagent or Catalyst

• Search by (구조 인식 방법) As drawn /Substructure/Similarity



4. Create Structure Template

from Names

물질명으로 검색하고자 할 때 click하여

아래와 같은 물질명을 입력.

입력 후 해당되는 구조가 자동 전환되어

Query 창에 나타나며,

입력된 구조로 검색

IUPAC, Generic Name, Common Name

InChi Key

CAS-RN

SMILES

6.Combine Search

Input한 Reaction/compound 정보 중 찾고자 하는 Reaction

condition/ 물질의 property의 type 또는 value/range를

입력하여 상세 정보 검색



7.Molecular Formula

주기율표를 기본으로 한 “Molecular

Formula Builder” 를 통해 검색하고자

하는 물질의 분자식을 쉽게 입력하여

검색

Search Results -Reactions

1.Reaction 정보

• Yield

• Reaction conditions

• Reference



2. Reaction dossiers

같은 reaction의 reference가 journal과

patent 둘 다 있을 경우 해당 reference

정보를 한 페이지에 통합

Search Results -Reactions

3.Experimental Procedure

Patent에서 발췌한

experimental procedure 확인

5.View citing articles

• 해당 journal 의 서지 인용 정보 • Scopus 로의 link



4.Full Text

해당 journal 의 원문 확인 시

클릭하면 journal site로 link

(원문 확인은 journal 에 대한

별도 계정 필요)

6. 저자 정보 확인

• 소속/연구동향 정보

• Scopus 로의 link

7.Multi-step reaction

Multi-step reaction의 경우 “View

Scheme”을 click 하면 전체 step을

확인할 수 있음

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Search Results -Substances Copyright© 2015 by BITEK CHEMS Inc.


Substances 정보

• Structure

• Structure Data

• Available Data

-Identification

-Physical Data

-Spectra

-Bioactivity&Ecotox

-Use&Application

Search Results -Substances

(Find similar)



Find similar

• 검색 결과의 물질 구조와 유사한

구조의 물질 확인


All rights reserved. Search Results -Substances

(Find similar)

Find similar

• 검색 결과의 물질 구조와 유사한

구조의 물질 확인 및 각 물질의

similarity 정도 확인 및 정렬

Refine Results

1.Analysis View Analysis View 기능은 검색 결과를 histogram으로 display하여 각 기준 간의 상관관계 분석을 용이하게 함 • 그림과 같이, Histogram A에서 선택한 solvent 종류(붉은 색)에 따라

Histogram B에서 해당되는 Reagent/Catalyst가 노란색으로 표시되고 해당 되는 결과만 Limit to/Exclude 로 filtering 하여 확인 가능



Refine Results

2. Filter

검색 결과를 특정 조건으로 refine

• Reaction condition

-Substructure(구조)/Yield/Solvent 등

• 서지 정보

- Doc. Type/Publication Year 등

※Substance 검색 시에도 property 및

서지 정보에 의한 filter 기능 지원



4.Find similar reactions

해당 reaction과 구조적으로

유사한 reaction 확인

3.Rank

검색 결과를 특정 기준으로 정렬

• Reaction condition

-Yield/MW of product

• 서지 정보

-Number of References/

Publication Year 등

※Substance 검색 시에도 property

및 서지 정보에 의한 Rank 기능 지원

Refine Results

5.List Manipulation

History에서 확인한 검색 이력 중

여러 항목이 동일하고, 특정 항목이 상이한

이력끼리 비교, 분석할 수 있음

• 2개의 결과를 선택한 후 “Combine

hitsets” 을 Click. 아래와 같은 연산자를

선택하여 비교 분석이 가능함

• Combine option:

Merge/Overlap/Exclude



Synthesis Planner/AutoPlan

Synthesize

검색 결과 중 합성 route를

설계하고자 하는 물질 하단의 “synthesize”를 click

“Manually’ 또는 “by Autoplan (with options) “ 선택

• Manually: 합성 pathway을 하나씩 선택하여 설계

• By AutoPlan: “My settings”에서 설정된 Plan 수, branch

수, step 수 등에 따라 자동 설계

• By AutoPlan(with options): 해당 화면에서 설정한 Plan

수, branch 수,step 수 등에 따라 자동 설계



Autoplan

자동 설계된 Synthesis plan(최대 10개)

• 설정한 option에 따라 Yield가 높은 순으로

합성 route 자동 설계

• User가 원하는 pathway로 수정, 추가 ,삭제 할 수 있음



Export

Output

설계한 합성 route 또는 검색 결과를

PDF, MS- Word, MS-Excel 형태로

추출 및 저장



Report

Report 연구에 필요한 특정 data 을 선택하여 동료들 과의 data 공유 및 의견 교환을 용이하게 함 • 특정 정보(전체 query, citation data, property, reaction 등)의 왼쪽 하단에 종이가 접힌 그림 이 나타났을 때 “Report”에 copy

•“Report”에 수집한 data에 의견을 포함하여 Reaxys 내에서 동료들에게 Email로 보내는 기능 지원



Alert

Alert 설정

검색 사항(Query)에 대해 업데이트되는

data 알림 서비스 설정 시 검색 결과 화면

또는 History 의 “Create Alert” click하여

Alert 이름 및 업데이트 알림 주기 설정(Email로 알림)

*Alert 기능 이용 시에는 Reaxys 페이지

우측 상단의 “Register”에서 개인 계정

생성하여 추가 로그인 후 이용 가능



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