ref_seq pah

7

Click here to load reader

Upload: alvi-pba-santiago

Post on 01-Jun-2018

215 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: ref_seq pAH

8/9/2019 ref_seq pAH

http://slidepdf.com/reader/full/refseq-pah 1/7

PAH   cDNA Sequence Compiled by S.Byck, P.M.Nowacki, and Max Caccione.

This Reference Sequence (simplified) is deposited in GenBank: U49897.

This sequence is derived from the following:Partial 5'UTR sequence, Konecki et al., 1992.

Exon sequences, Kwok et al., 1985.

Partial Intron sequences, Svensson (thesis) and others.

Other  DiLella 1986, Kwok (1992).

Polymorphisms are indicated in color above the reference sequence where available.

Polymorphisms were obtained from the following sources:

red from Gulberg primer sequence.

purple from Kalaydjieva et al., 1996.

blue from DiLella intron data.

dark green from Abadie et al., 1989.light blue from Woo primer sequence.

olive green from Svensson 5'UTR sequence.

NOTE:Where a nucleotide is inserted, the reference and inserted nucleotides are written above the reference.

Where a nucleotide is deleted, 'del' is written above the reference nucleotide

This document is color coded, the color version is in MS Excel format and is available at http://data.mch.mcgill.ca/pahdb_new/pahdb_sequence.html

Pvu II GC  

C A G C T G G G G G T A A G G G G G G

    -       4       7       2

    -       4       7       1

    -       4       7       0

    -       4       6       9

    -       4       6       8

    -       4       6       7

    -       4       6       6

    -       4       6       5

    -       4       6       4

    -       4       6       3

    -       4       6       2

    -       4       6       1

    -       4       6       0

    -       4       5       9

    -       4       5       8

    -       4       5       7

    -       4       5       6

    -       4       5       5

    -       4       5       4

Gre

C G G A T T A T T C A T A T A A T T G T T A T A C C A G A C G G T C G C

    -       4       5       3

    -       4       5       2

    -       4       5       1

    -       4       5       0

    -       4       4       9

    -       4       4       8

    -       4       4       7

    -       4       4       6

    -       4       4       5

    -       4       4       4

    -       4       4       3

    -       4       4       2

    -       4       4       1

    -       4       4       0

    -       4       3       9

    -       4       3       8

    -       4       3       7

    -       4       3       6

    -       4       3       5

    -       4       3       4

    -       4       3       3

    -       4       3       2

    -       4       3       1

    -       4       3       0

    -       4       2       9

    -       4       2       8

    -       4       2       7

    -       4       2       6

    -       4       2       5

    -       4       2       4

    -       4       2       3

    -       4       2       2

    -       4       2       1

    -       4       2       0

    -       4       1       9

    -       4       1       8

CAAT Gre Ap-2   A G G C T T A G T C C A A T T G C A G A G A A C T C G C T T C C C A G G

    -       4       1       7

    -       4       1       6

    -       4       1       5

    -       4       1       4

    -       4       1       3

    -       4       1       2

    -       4       1       1

    -       4       1       0

    -       4       0       9

    -       4       0       8

    -       4       0       7

    -       4       0       6

    -       4       0       5

    -       4       0       4

    -       4       0       3

    -       4       0       2

    -       4       0       1

    -       4       0       0

    -       3       9       9

    -       3       9       8

    -       3       9       7

    -       3       9       6

    -       3       9       5

    -       3       9       4

    -       3       9       3

    -       3       9       2

    -       3       9       1

    -       3       9       0

    -       3       8       9

    -       3       8       8

    -       3       8       7

    -       3       8       6

    -       3       8       5

    -       3       8       4

    -       3       8       3

    -       3       8       2

C T T C T G A G A G T C C C G G A A G T G C C T A A A C C T G T C T A A

    -       3       8       1

    -       3       8       0

    -       3       7       9

    -       3       7       8

    -       3       7       7

    -       3       7       6

    -       3       7       5

    -       3       7       4

    -       3       7       3

    -       3       7       2

    -       3       7       1

    -       3       7       0

    -       3       6       9

    -       3       6       8

    -       3       6       7

    -       3       6       6

    -       3       6       5

    -       3       6       4

    -       3       6       3

    -       3       6       2

    -       3       6       1

    -       3       6       0

    -       3       5       9

    -       3       5       8

    -       3       5       7

    -       3       5       6

    -       3       5       5

    -       3       5       4

    -       3       5       3

    -       3       5       2

    -       3       5       1

    -       3       5       0

    -       3       4       9

    -       3       4       8

    -       3       4       7

    -       3       4       6

CACCC Ap-2  

T C G A C G G G G C T T G G G T G G C C C G T C G C T C C C T G G C T T

    -       3       4       5

    -       3       4       4

    -       3       4       3

    -       3       4       2

    -       3       4       1

    -       3       4       0

    -       3       3       9

    -       3       3       8

    -       3       3       7

    -       3       3       6

    -       3       3       5

    -       3       3       4

    -       3       3       3

    -       3       3       2

    -       3       3       1

    -       3       3       0

    -       3       2       9

    -       3       2       8

    -       3       2       7

    -       3       2       6

    -       3       2       5

    -       3       2       4

    -       3       2       3

    -       3       2       2

    -       3       2       1

    -       3       2       0

    -       3       1       9

    -       3       1       8

    -       3       1       7

    -       3       1       6

    -       3       1       5

    -       3       1       4

    -       3       1       3

    -       3       1       2

    -       3       1       1

    -       3       1       0

 Ap-2 GC 

C T T C C C T T T A C C C A G G G C G G G C A G C G A A G T G G T G C C

    -       3       0       9

    -       3       0       8

    -       3       0       7

    -       3       0       6

    -       3       0       5

    -       3       0       4

    -       3       0       3

    -       3       0       2

    -       3       0       1

    -       3       0       0

    -       2       9       9

    -       2       9       8

    -       2       9       7

    -       2       9       6

    -       2       9       5

    -       2       9       4

    -       2       9       3

    -       2       9       2

    -       2       9       1

    -       2       9       0

    -       2       8       9

    -       2       8       8

    -       2       8       7

    -       2       8       6

    -       2       8       5

    -       2       8       4

    -       2       8       3

    -       2       8       2

    -       2       8       1

    -       2       8       0

    -       2       7       9

    -       2       7       8

    -       2       7       7

    -       2       7       6

    -       2       7       5

    -       2       7       4

CACCC 

T C C T G C G T C C C C C A C A C C C T C C C T C A G C C C C T C C C C

    -       2       7       3

    -       2       7       2

    -       2       7       1

    -       2       7       0

    -       2       6       9

    -       2       6       8

    -       2       6       7

    -       2       6       6

    -       2       6       5

    -       2       6       4

    -       2       6       3

    -       2       6       2

    -       2       6       1

    -       2       6       0

    -       2       5       9

    -       2       5       8

    -       2       5       7

    -       2       5       6

    -       2       5       5

    -       2       5       4

    -       2       5       3

    -       2       5       2

    -       2       5       1

    -       2       5       0

    -       2       4       9

    -       2       4       8

    -       2       4       7

    -       2       4       6

    -       2       4       5

    -       2       4       4

    -       2       4       3

    -       2       4       2

    -       2       4       1

    -       2       4       0

    -       2       3       9

    -       2       3       8

GC 

T C C G G C C C G T C C T G G G C A G G T G A C C T G G A G C A T C C G

    -       2       3       7

    -       2       3       6

    -       2       3       5

    -       2       3       4

    -       2       3       3

    -       2       3       2

    -       2       3       1

    -       2       3       0

    -       2       2       9

    -       2       2       8

    -       2       2       7

    -       2       2       6

    -       2       2       5

    -       2       2       4

    -       2       2       3

    -       2       2       2

    -       2       2       1

    -       2       2       0

    -       2       1       9

    -       2       1       8

    -       2       1       7

    -       2       1       6

    -       2       1       5

    -       2       1       4

    -       2       1       3

    -       2       1       2

    -       2       1       1

    -       2       1       0

    -       2       0       9

    -       2       0       8

    -       2       0       7

    -       2       0       6

    -       2       0       5

    -       2       0       4

    -       2       0       3

    -       2       0       2

Cre

GG   G GA

G C A G G C T G C C C T G G C C T C C T G C G T C A G G A C A A G C C C

    -       2       0       1

    -       2       0       0

    -       1       9       9

    -       1       9       8

    -       1       9       7

    -       1       9       6

    -       1       9       5

    -       1       9       4

    -       1       9       3

    -       1       9       2

    -       1       9       1

    -       1       9       0

    -       1       8       9

    -       1       8       8

    -       1       8       7

    -       1       8       6

    -       1       8       5

    -       1       8       4

    -       1       8       3

    -       1       8       2

    -       1       8       1

    -       1       8       0

    -       1       7       9

    -       1       7       8

    -       1       7       7

    -       1       7       6

    -       1       7       5

    -       1       7       4

    -       1       7       3

    -       1       7       2

    -       1       7       1

    -       1       7       0

    -       1       6       9

    -       1       6       8

    -       1       6       7

    -       1       6       6

GC 

C T del

 A C G A G G G G C G T T A C T G T G C G G A G A T G C A C C A C G C A A

    -       1       6       5

    -       1       6       4

    -       1       6       3

    -       1       6       2

    -       1       6       1

    -       1       6       0

    -       1       5       9

    -       1       5       8

    -       1       5       7

    -       1       5       6

    -       1       5       5

    -       1       5       4

    -       1       5       3

    -       1       5       2

    -       1       5       1

    -       1       5       0

    -       1       4       9

    -       1       4       8

    -       1       4       7

    -       1       4       6

    -       1       4       5

    -       1       4       4

    -       1       4       3

    -       1       4       2

    -       1       4       1

    -       1       4       0

    -       1       3       9

    -       1       3       8

    -       1       3       7

    -       1       3       6

    -       1       3       5

    -       1       3       4

    -       1       3       3

    -       1       3       2

    -       1       3       1

    -       1       3       0

del

G A G A C A C C C T T T G T A   A C T C T C T T C T C C T C C C T A G T G

    -       1       2       9

    -       1       2       8

    -       1       2       7

    -       1       2       6

    -       1       2       5

    -       1       2       4

    -       1       2       3

    -       1       2       2

    -       1       2       1

    -       1       2       0

    -       1       1       9

    -       1       1       8

    -       1       1       7

    -       1       1       6

    -       1       1       5

    -       1       1       4

    -       1       1       3

    -       1       1       2

    -       1       1       1

    -       1       1       0

    -       1       0       9

    -       1       0       8

    -       1       0       7

    -       1       0       6

    -       1       0       5

    -       1       0       4

    -       1       0       3

    -       1       0       2

    -       1       0       1

    -       1       0       0

    -       9       9

    -       9       8

    -       9       7

    -       9       6

    -       9       5

    -       9       4

C G A G G T T A A A A C C T T C A G C C C C A C G T G C T G T T T G C A

    -       9       3

    -       9       2

    -       9       1

    -       9       0

    -       8       9

    -       8       8

    -       8       7

    -       8       6

    -       8       5

    -       8       4

    -       8       3

    -       8       2

    -       8       1

    -       8       0

    -       7       9

    -       7       8

    -       7       7

    -       7       6

    -       7       5

    -       7       4

    -       7       3

    -       7       2

    -       7       1

    -       7       0

    -       6       9

    -       6       8

    -       6       7

    -       6       6

    -       6       5

    -       6       4

    -       6       3

    -       6       2

    -       6       1

    -       6       0

    -       5       9

    -       5       8

A A C C T G C C T G T A C C T G A G G C C C T A A A A A G C C A G A G A

    -       5       7

    -       5       6

    -       5       5

    -       5       4

    -       5       3

    -       5       2

    -       5       1

    -       5       0

    -       4       9

    -       4       8

    -       4       7

    -       4       6

    -       4       5

    -       4       4

    -       4       3

    -       4       2

    -       4       1

    -       4       0

    -       3       9

    -       3       8

    -       3       7

    -       3       6

    -       3       5

    -       3       4

    -       3       3

    -       3       2

    -       3       1

    -       3       0

    -       2       9

    -       2       8

    -       2       7

    -       2       6

    -       2       5

    -       2       4

    -       2       3

    -       2       2

START

1 2 3 4 5

M e t S e r T h r A l a V a l

C C T C A C T C C C G G G G A G C C A G C A T G T C C A C T G C G G T C

    -       2       1

    -       2       0

    -       1       9

    -       1       8

    -       1       7

    -       1       6

    -       1       5

    -       1       4

    -       1       3

    -       1       2

    -       1       1

    -       1       0

    -       9

    -       8

    -       7

    -       6

    -       5

    -       4

    -       3

    -       2

    -       1

       1 2 3 4 5 6 7 8 9       1       0

       1       1

       1       2

       1       3

       1       4

       1       5

5'UTR E1

<- ->

6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17

L e u G l u A s n P r o G l y L e u G l y A r g L y s L e u S e r A s p

C T G G A A A A C C C A G G C T T G G G C A G G A A A C T C T C T G A C

       1       6

       1       7

       1       8

       1       9

       2       0

       2       1

       2       2

       2       3

       2       4

       2       5

       2       6

       2       7

       2       8

       2       9

       3       0

       3       1

       3       2

       3       3

       3       4

       3       5

       3       6

       3       7

       3       8

       3       9

       4       0

       4       1

       4       2

       4       3

       4       4

       4       5

       4       6

       4       7

       4       8

       4       9

       5       0

       5       1

18 19 20

2.1.1

Copyright 1997, PAH Mutation Analysis Consortium.

Page 2: ref_seq pAH

8/9/2019 ref_seq pAH

http://slidepdf.com/reader/full/refseq-pah 2/7

P h e G l y G l n

T T T G G A C A G g t g a g c c a c g g c a g c c t g a g c t g c t c a

       5       2

       5       3

       5       4

       5       5

       5       6

       5       7

       5       8

       5       9

       6       0

g t t a g g g g a a t t t g g g c c t c c a g a g a a a g a g a t c c g

a a g a c t g c t g g t g c t t c c t g g t t t c a t a a g c t c a g t

a a g a a g t c t g a a t t c g g a a g g c t g c c t g g c c t c t g c

g t c a g g a c a g c c a g a g g g c g t t a c t g t g c g g a g a t g

c a c a g a a g a g a c a c c t t t g t a c t c t c t c t c t c c t a g

t g c g a g t a a t c a g c c a g t g t c g t t g a a c g t c g t c t a

c t a g g c t a a g a

t t a t g c a a g a t t t a a c t a g a a g a a a

g

g a g t t c a t g c t t g c t t t g t c c a t g g a g g t t t a a c a g

g a a t g a a t t g c t a a a c t g t g g a a a a t g t t t t a a a c a

21 22 23 24 25 26

G l u T h r S e r T y r I l e G l

a a t g c a t c t t a t c c t g t a g G A A A C A A G C T A T A T T G A

       6       1

       6       2

       6       3

       6       4

       6       5

       6       6

       6       7

       6       8

       6       9

       7       0

       7       1

       7       2

       7       3

       7       4

       7       5

       7       6

       7       7

E2

27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38

u A s p A s n C y s A s n G l n A s n G l y A l a I l e S e r L e u I l

A G A C A A C T G C A A T C A A A A T G G T G C C A T A T C A C T G A T

       7       8

       7       9

       8       0

       8       1

       8       2

       8       3

       8       4

       8       5

       8       6

       8       7

       8       8

       8       9

       9       0

       9       1

       9       2

       9       3

       9       4

       9       5

       9       6

       9       7

       9       8

       9       9

       1       0       0

       1       0       1

       1       0       2

       1       0       3

       1       0       4

       1       0       5

       1       0       6

       1       0       7

       1       0       8

       1       0       9

       1       1       0

       1       1       1

       1       1       2

       1       1       3

39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50

e P h e S e r L e u L y s G l u G l u V a l G l y A l a L e u A l a L y

C T T C T C A C T C A A A G A A G A A G T T G G T G C A T T G G C C A A

       1       1       4

       1       1       5

       1       1       6

       1       1       7

       1       1       8

       1       1       9

       1       2       0

       1       2       1

       1       2       2

       1       2       3

       1       2       4

       1       2       5

       1       2       6

       1       2       7

       1       2       8

       1       2       9

       1       3       0

       1       3       1

       1       3       2

       1       3       3

       1       3       4

       1       3       5

       1       3       6

       1       3       7

       1       3       8

       1       3       9

       1       4       0

       1       4       1

       1       4       2

       1       4       3

       1       4       4

       1       4       5

       1       4       6

       1       4       7

       1       4       8

       1       4       9

51 52 53 54 55 56

s V a l L e u A r g L e u P h e G l u   a

A G T A T T G C G C T T A T T T G A G g t c a g t g c t a c a a t c a t

       1       5       0

       1       5       1

       1       5       2

       1       5       3

       1       5       4

       1       5       5

       1       5       6

       1       5       7

       1       5       8

       1       5       9

       1       6       0

       1       6       1

       1       6       2

       1       6       3

       1       6       4

       1       6       5

       1       6       6

       1       6       7

       1       6       8

g t t t g t c t t g g a t a a t g t c g t a g c a a a c t t c c a t g t

t c t t t t c t a g t t a g a t g c a a t g a a a a g a a c a c a g g a

t c t g g a a c a g g

c t g a a c t c t c c a t t t g t t g c g t t a g

g t t t t c c t g t t c t g g t t c t g c a t c t t t g g c c t g c g t

t a g t t c c t g t g a c t g t c t c c t c a c c c   t   c c c c a t t c t

57 58 59 60 61 62 63 64 65

t   G l u A s n A s p V a l A s n L e u T h r H i s I l e

c t c g t c t a g G A G A A T G A T G T A A A C C T G A C C C A C A T T

       1       6       9

       1       7       0

       1       7       1

       1       7       2

       1       7       3

       1       7       4

       1       7       5

       1       7       6

       1       7       7

       1       7       8

       1       7       9

       1       8       0

       1       8       1

       1       8       2

       1       8       3

       1       8       4

       1       8       5

       1       8       6

       1       8       7

       1       8       8

       1       8       9

       1       9       0

       1       9       1

       1       9       2

       1       9       3

       1       9       4

       1       9       5

E3

66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77

G l u S e r A r g P r o S e r A r g L e u L y s L y s A s p G l u T y r

G A A T C T A G A C C T T C T C G T T T A A A G A A A G A T G A G T A T

       1       9       6

       1       9       7

       1       9       8

       1       9       9

       2       0       0

       2       0       1

       2       0       2

       2       0       3

       2       0       4

       2       0       5

       2       0       6

       2       0       7

       2       0       8

       2       0       9

       2       1       0

       2       1       1

       2       1       2

       2       1       3

       2       1       4

       2       1       5

       2       1       6

       2       1       7

       2       1       8

       2       1       9

       2       2       0

       2       2       1

       2       2       2

       2       2       3

       2       2       4

       2       2       5

       2       2       6

       2       2       7

       2       2       8

       2       2       9

       2       3       0

       2       3       1

78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89

G l u P h e P h e T h r H i s L e u A s p L y s A r g S e r L e u P r o

G A A T T T T T C A C C C A T T T G G A T A A A C G T A G C C T G C C T

       2       3       2

       2       3       3

       2       3       4

       2       3       5

       2       3       6

       2       3       7

       2       3       8

       2       3       9

       2       4       0

       2       4       1

       2       4       2

       2       4       3

       2       4       4

       2       4       5

       2       4       6

       2       4       7

       2       4       8

       2       4       9

       2       5       0

       2       5       1

       2       5       2

       2       5       3

       2       5       4

       2       5       5

       2       5       6

       2       5       7

       2       5       8

       2       5       9

       2       6       0

       2       6       1

       2       6       2

       2       6       3

       2       6       4

       2       6       5

       2       6       6

       2       6       7

90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101

A l a L e u T h r A s n I l e I l e L y s I l e L e u A r g H i s A s p

G C T C T G A C A A A C A T C A T C A A G A T C T T G A G G C A T G A C

       2       6       8

       2       6       9

       2       7       0

       2       7       1

       2       7       2

       2       7       3

       2       7       4

       2       7       5

       2       7       6

       2       7       7

       2       7       8

       2       7       9

       2       8       0

       2       8       1

       2       8       2

       2       8       3

       2       8       4

       2       8       5

       2       8       6

       2       8       7

       2       8       8

       2       8       9

       2       9       0

       2       9       1

       2       9       2

       2       9       3

       2       9       4

       2       9       5

       2       9       6

       2       9       7

       2       9       8

       2       9       9

       3       0       0

       3       0       1

       3       0       2

       3       0       3

102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113

I l e G l y A l a T h r V a l H i s G l u L e u S e r A r g A s p L y s

A T T G G T G C C A C T G T C C A T G A G C T T T C A C G A G A T A A G

       3       0       4

       3       0       5

       3       0       6

       3       0       7

       3       0       8

       3       0       9

       3       1       0

       3       1       1

       3       1       2

       3       1       3

       3       1       4

       3       1       5

       3       1       6

       3       1       7

       3       1       8

       3       1       9

       3       2       0

       3       2       1

       3       2       2

       3       2       3

       3       2       4

       3       2       5

       3       2       6

       3       2       7

       3       2       8

       3       2       9

       3       3       0

       3       3       1

       3       3       2

       3       3       3

       3       3       4

       3       3       5

       3       3       6

       3       3       7

       3       3       8

       3       3       9

114 115 116 117 118

L y s L y s A s p T h r V (a l)

A A G A A A G A C A C A G g t a a g a a t t a g a g g a a t t t t g c a

       3       4       0

       3       4       1

       3       4       2

       3       4       3

       3       4       4

       3       4       5

       3       4       6

       3       4       7

       3       4       8

       3       4       9

       3       5       0

       3       5       1

       3       5       2

Copyright 1997, PAH Mutation Analysis Consortium.

Page 3: ref_seq pAH

8/9/2019 ref_seq pAH

http://slidepdf.com/reader/full/refseq-pah 3/7

a c a t a a g t a a c t c a c a t g t c t t a t a

a t g t t c t g c c a a

118

V a

t c t g t a c t c a g g a c g t t g c c t t c t c t g t g t t t c a g T

       3       5       3

E4

119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130

l P r o T r p P h e P r o A r g T h r I l e G l n G l u L e u A s p A r

G C C C T G G T T C C C A A G A A C C A T T C A A G A G C T G G A C A G

       3       5       4

       3       5       5

       3       5       6

       3       5       7

       3       5       8

       3       5       9

       3       6       0

       3       6       1

       3       6       2

       3       6       3

       3       6       4

       3       6       5

       3       6       6

       3       6       7

       3       6       8

       3       6       9

       3       7       0

       3       7       1

       3       7       2

       3       7       3

       3       7       4

       3       7       5

       3       7       6

       3       7       7

       3       7       8

       3       7       9

       3       8       0

       3       8       1

       3       8       2

       3       8       3

       3       8       4

       3       8       5

       3       8       6

       3       8       7

       3       8       8

       3       8       9

131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142

g P h e A l a A s n G l n I l e L e u S e r T y r G l y A l a G l u L e

A T T T G C C A A T C A G A T T C T C A G C T A T G G A G C G G A A C T

       3       9       0

       3       9       1

       3       9       2

       3       9       3

       3       9       4

       3       9       5

       3       9       6

       3       9       7

       3       9       8

       3       9       9

       4       0       0

       4       0       1

       4       0       2

       4       0       3

       4       0       4

       4       0       5

       4       0       6

       4       0       7

       4       0       8

       4       0       9

       4       1       0

       4       1       1

       4       1       2

       4       1       3

       4       1       4

       4       1       5

       4       1       6

       4       1       7

       4       1       8

       4       1       9

       4       2       0

       4       2       1

       4       2       2

       4       2       3

       4       2       4

       4       2       5

143 144 145 146 147

u A s p A l a A s p H i s P r o   t g t c

G G A T G C T G A C C A C C C T g t g a g t c c a t g g c c c g t a g a

       4       2       6

       4       2       7

       4       2       8

       4       2       9

       4       3       0

       4       3       1

       4       3       2

       4       3       3

       4       3       4

       4       3       5

       4       3       6

       4       3       7

       4       3       8

       4       3       9

       4       4       0

       4       4       1

t g

t g a g a t t t t t t g a c a

a a t c c a c a g c g a g g a g g c t c a

a g g t a a a t c a g g g a a g t t a c t a a t a a g g t g t c a c t t

a c a a t a t c t g g t a g g a g a g c t a a g t t t a a c c c g a g a

c t t t a g t t t t a g g g t a t a c c c a a g g g a a g g a g a g a t

g c a c t g t c a t g g c t t t a g a g c c c c c a t t c a a a g c a t

t c a t a a a g g t a c c a g a c c t c t t c c t a t g a a g c c t t g

148 149 150

G l y P h e L y s

a a a a a t c a g g t g t c t c t t t t c t c c t a g G G T T T T A A A

       4       4       2

       4       4       3

       4       4       4

       4       4       5

       4       4       6

       4       4       7

       4       4       8

       4       4       9

       4       5       0

E5

151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162

A s p P r o V a l T y r A r g A l a A r g A r g L y s G l n P h e A l a

G A T C C T G T G T A C C G T G C A A G A C G G A A G C A G T T T G C T

       4       5       1

       4       5       2

       4       5       3

       4       5       4

       4       5       5

       4       5       6

       4       5       7

       4       5       8

       4       5       9

       4       6       0

       4       6       1

       4       6       2

       4       6       3

       4       6       4

       4       6       5

       4       6       6

       4       6       7

       4       6       8

       4       6       9

       4       7       0

       4       7       1

       4       7       2

       4       7       3

       4       7       4

       4       7       5

       4       7       6

       4       7       7

       4       7       8

       4       7       9

       4       8       0

       4       8       1

       4       8       2

       4       8       3

       4       8       4

       4       8       5

       4       8       6

163 164 165 166 167 168 169 170

A s p I l e A l a T y r A s n T y r A r g H i (s)

G A C A T T G C C T A C A A C T A C C G C C A g t a a g t c t g c c t t

       4       8       7

       4       8       8

       4       8       9

       4       9       0

       4       9       1

       4       9       2

       4       9       3

       4       9       4

       4       9       5

       4       9       6

       4       9       7

       4       9       8

       4       9       9

       5       0       0

       5       0       1

       5       0       2

       5       0       3

       5       0       4

       5       0       5

       5       0       6

       5       0       7

       5       0       8

       5       0       9

g c t t g t t g a g g g g a a g a g a g a a a a a c a c a c c c c t a g

del

c c t g c t t c t c c c t t g c c c t c a t c c a g t t g a g g a t g g

a a a a t a c c a g c a t g a a g a g t a a t c t t g c a c g c c c t c

g c t c a a g c c t t c g t c a c t g g t c c c g c c a c c a a a c g t

t t c g g c g a g a a g c a g g c c a t t a t c g c c g g c a t g g c g

g c c g a c g c g c t g g g c t a c t t c t t g c t g c g t t c c g a c

g c g a g g c t g g a t g g c c t t c c c c a t t a t g a t t a

g a a t

t t t c t c t t c a a a t a a t g g t a g t a a a t t c a c t g t a g c

a a g t g a t g g c a g c t c a c a g g t t c t g g t c c c c g a c t c

c c t c t g c t a a c c t a a c c t g c a t t c t g c t g t g c c c c t

del ga tt

g c c c t g c c t t g a g c a c c t a t t t t g t g c c t g t a t t c t

170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181

(H i) s G l y G l n P r o I l e P r o A r g V a l G l u T y r M e t G l u

a g T G G G C A G C C C A T C C C T C G A G T G G A A T A C A T G G A G

       5       1       0

       5       1       1

       5       1       2

       5       1       3

       5       1       4

       5       1       5

       5       1       6

       5       1       7

       5       1       8

       5       1       9

       5       2       0

       5       2       1

       5       2       2

       5       2       3

       5       2       4

       5       2       5

       5       2       6

       5       2       7

       5       2       8

       5       2       9

       5       3       0

       5       3       1

       5       3       2

       5       3       3

       5       3       4

       5       3       5

       5       3       6

       5       3       7

       5       3       8

       5       3       9

       5       4       0

       5       4       1

       5       4       2

       5       4       3

E6

182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193

G l u G l u L y s L y s T h r T r p G l y T h r V a l P h e L y s T h r

G A A G A A A A G A A A A C A T G G G G C A C A G T G T T C A A G A C T

       5       4       4

       5       4       5

       5       4       6

       5       4       7

       5       4       8

       5       4       9

       5       5       0

       5       5       1

       5       5       2

       5       5       3

       5       5       4

       5       5       5

       5       5       6

       5       5       7

       5       5       8

       5       5       9

       5       6       0

       5       6       1

       5       6       2

       5       6       3

       5       6       4

       5       6       5

       5       6       6

       5       6       7

       5       6       8

       5       6       9

       5       7       0

       5       7       1

       5       7       2

       5       7       3

       5       7       4

       5       7       5

       5       7       6

       5       7       7

       5       7       8

       5       7       9

194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205

L e u L y s S e r L e u T y r L y s T h r H i s A l a C y s T y r G l u

C T G A A G T C C T T G T A T A A A A C C C A T G C T T G C T A T G A G

       5       8       0

       5       8       1

       5       8       2

       5       8       3

       5       8       4

       5       8       5

       5       8       6

       5       8       7

       5       8       8

       5       8       9

       5       9       0

       5       9       1

       5       9       2

       5       9       3

       5       9       4

       5       9       5

       5       9       6

       5       9       7

       5       9       8

       5       9       9

       6       0       0

       6       0       1

       6       0       2

       6       0       3

       6       0       4

       6       0       5

       6       0       6

       6       0       7

       6       0       8

       6       0       9

       6       1       0

       6       1       1

       6       1       2

       6       1       3

       6       1       4

       6       1       5

206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217

T y r A s n H i s I l e P h e P r o L e u L e u G l u L y s T y r C y s

T A C A A T C A C A T T T T T C C A C T T C T T G A A A A G T A C T G TCopyright 1997, PAH Mutation Analysis Consortium.

Page 4: ref_seq pAH

8/9/2019 ref_seq pAH

http://slidepdf.com/reader/full/refseq-pah 4/7

       6       1       6

       6       1       7

       6       1       8

       6       1       9

       6       2       0

       6       2       1

       6       2       2

       6       2       3

       6       2       4

       6       2       5

       6       2       6

       6       2       7

       6       2       8

       6       2       9

       6       3       0

       6       3       1

       6       3       2

       6       3       3

       6       3       4

       6       3       5

       6       3       6

       6       3       7

       6       3       8

       6       3       9

       6       4       0

       6       4       1

       6       4       2

       6       4       3

       6       4       4

       6       4       5

       6       4       6

       6       4       7

       6       4       8

       6       4       9

       6       5       0

       6       5       1

218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229

G l y P h e H i s G l u A s p A s n I l e P r o G l n L e u G l u A s p

G G C T T C C A T G A A G A T A A C A T T C C C C A G C T G G A A G A C

       6       5       2

       6       5       3

       6       5       4

       6       5       5

       6       5       6

       6       5       7

       6       5       8

       6       5       9

       6       6       0

       6       6       1

       6       6       2

       6       6       3

       6       6       4

       6       6       5

       6       6       6

       6       6       7

       6       6       8

       6       6       9

       6       7       0

       6       7       1

       6       7       2

       6       7       3

       6       7       4

       6       7       5

       6       7       6

       6       7       7

       6       7       8

       6       7       9

       6       8       0

       6       8       1

       6       8       2

       6       8       3

       6       8       4

       6       8       5

       6       8       6

       6       8       7

230 231 232 233 234 235 236

V a l S e r G l n P h e L e u G l n T (h r)

G T T T C T C A A T T C C T G C A G A g t a a g t c c a c a t c a g g g

       6       8       8

       6       8       9

       6       9       0

       6       9       1

       6       9       2

       6       9       3

       6       9       4

       6       9       5

       6       9       6

       6       9       7

       6       9       8

       6       9       9

       7       0       0

       7       0       1

       7       0       2

       7       0       3

       7       0       4

       7       0       5

       7       0       6

gg gc   del

t c a a t g c c c t g a g a a a g t t g g g g g a g g a t t g a g g c a

g a g g a g a g g g a a

t t a t g t g a c t a c t c c a c t a c c a a a g

gc

g t c t c c t a g t g c c t c t g a c t g a g t g g t g a t g a g c t t

236 237 238

t   (T) h r C y s T h r

t g a g t t t t c t t t c t t c t t t t c a t c c c a g C T T G C A C T

       7       0       7

       7       0       8

       7       0       9

       7       1       0

       7       1       1

       7       1       2

       7       1       3

       7       1       4

E7

239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250

G l y P h e A r g L e u A r g P r o V a l A l a G l y L e u L e u S e r

G G T T T C C G C C T C C G A C C T G T G G C T G G C C T G C T T T C C

       7       1       5

       7       1       6

       7       1       7

       7       1       8

       7       1       9

       7       2       0

       7       2       1

       7       2       2

       7       2       3

       7       2       4

       7       2       5

       7       2       6

       7       2       7

       7       2       8

       7       2       9

       7       3       0

       7       3       1

       7       3       2

       7       3       3

       7       3       4

       7       3       5

       7       3       6

       7       3       7

       7       3       8

       7       3       9

       7       4       0

       7       4       1

       7       4       2

       7       4       3

       7       4       4

       7       4       5

       7       4       6

       7       4       7

       7       4       8

       7       4       9

       7       5       0

251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262

S e r A r g A s p P h e L e u G l y G l y L e u A l a P h e A r g V a l

T C T C G G G A T T T C T T G G G T G G C C T G G C C T T C C G A G T C

       7       5       1

       7       5       2

       7       5       3

       7       5       4

       7       5       5

       7       5       6

       7       5       7

       7       5       8

       7       5       9

       7       6       0

       7       6       1

       7       6       2

       7       6       3

       7       6       4

       7       6       5

       7       6       6

       7       6       7

       7       6       8

       7       6       9

       7       7       0

       7       7       1

       7       7       2

       7       7       3

       7       7       4

       7       7       5

       7       7       6

       7       7       7

       7       7       8

       7       7       9

       7       8       0

       7       8       1

       7       8       2

       7       8       3

       7       8       4

       7       8       5

       7       8       6

263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274

P h e H i s C y s T h r G l n T y r I l e A r g H i s G l y S e r L y s

T T C C A C T G C A C A C A G T A C A T C A G A C A T G G A T C C A A G

       7       8       7

       7       8       8

       7       8       9

       7       9       0

       7       9       1

       7       9       2

       7       9       3

       7       9       4

       7       9       5

       7       9       6

       7       9       7

       7       9       8

       7       9       9

       8       0       0

       8       0       1

       8       0       2

       8       0       3

       8       0       4

       8       0       5

       8       0       6

       8       0       7

       8       0       8

       8       0       9

       8       1       0

       8       1       1

       8       1       2

       8       1       3

       8       1       4

       8       1       5

       8       1       6

       8       1       7

       8       1       8

       8       1       9

       8       2       0

       8       2       1

       8       2       2

275 276 277 278 279 280 281

P r o M e t T y r T h r P r o G l u P r (o)

C C C A T G T A T A C C C C C G A A C C g t g a g t a c t g t c c t c c

       8       2       3

       8       2       4

       8       2       5

       8       2       6

       8       2       7

       8       2       8

       8       2       9

       8       3       0

       8       3       1

       8       3       2

       8       3       3

       8       3       4

       8       3       5

       8       3       6

       8       3       7

       8       3       8

       8       3       9

       8       4       0

       8       4       1

       8       4       2

c t

a g c t a c c a g t t g c c a g g c a c a a t g a g c g c c a t c t t t

t

t c c t g c t g c a a g a a t g a g g t t t g g g t t c a g t t g c t g

g c t g g t c c a c a g g c t a g t t g t g t a g a c t g t t t g c t c

g t a g t a c t a a g a a c a t t c a t c t a t t c t g a g t t t g c t

c a t c a g a g a g c a g

c a t t c t t t c t g c c c a t t c c t c a t

g t a g a a a g a c t g a g t c t g g c t t g g c t t a a a c c t c c t

281 282

(P r) r A

c c c c t c c g a g c t c t c t g t g c t t t c t g t c t t t c a g T G

       8       4       3

       8       4       4

E8

283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294

s p I l e C y s H i s G l u L e u L e u G l y H i s V a l P r o L e u P

A C A T C T G C C A T G A G C T G T T G G G A C A T G T G C C C T T G T

       8       4       5

       8       4       6

       8       4       7

       8       4       8

       8       4       9

       8       5       0

       8       5       1

       8       5       2

       8       5       3

       8       5       4

       8       5       5

       8       5       6

       8       5       7

       8       5       8

       8       5       9

       8       6       0

       8       6       1

       8       6       2

       8       6       3

       8       6       4

       8       6       5

       8       6       6

       8       6       7

       8       6       8

       8       6       9

       8       7       0

       8       7       1

       8       7       2

       8       7       3

       8       7       4

       8       7       5

       8       7       6

       8       7       7

       8       7       8

       8       7       9

       8       8       0

295 296 297 298 299 300 301 302 303 304

h e S e r A s p A r g S e r P h e A l a G l n P h e S e r G l n

T T T C A G A T C G C A G C T T T G C C C A G T T T T C C C A G g t a a

       8       8

       1

       8       8

       2

       8       8

       3

       8       8

       4

       8       8

       5

       8       8

       6

       8       8

       7

       8       8

       8

       8       8

       9

       8       9

       0

       8       9

       1

       8       9

       2

       8       9

       3

       8       9

       4

       8       9

       5

       8       9

       6

       8       9

       7

       8       9

       8

       8       9

       9

       9       0

       0

       9       0

       1

       9       0

       2

       9       0

       3

       9       0

       4

       9       0

       5

       9       0

       6

       9       0

       7

       9       0

       8

       9       0

       9

       9       1

       0

       9       1

       1

       9       1

       2

g g a a t g g a t t t t t t a g c c t t c t a g t t a t a g g t c t g t

g a c c t g a a t t t c t c a a a t g a g t t g a g c c c a g g g a g g

g g t c c t c a t g c c c t c t g c a a g a g c g g a a a c c a g g t a

c a g t t c t a t g a t c c c a c c t a a a t g g g t g t g t g g t t c

t g g g a a g c t a a a t a c c c a t t t g g a g a t c a a g c a t g g

g g t t g g t g a a t c a c t c a t c c t c t g a a g a c t g g t a t t

g g t g a a t c a c t c a t c c t c t g a a t c a t a t g t g t g t t c

t t c t a c g t g a c t a a t c t c a t t t t t c c t g c t g a g a c c

Copyright 1997, PAH Mutation Analysis Consortium.

Page 5: ref_seq pAH

8/9/2019 ref_seq pAH

http://slidepdf.com/reader/full/refseq-pah 5/7

t t t a c t a c c t g a a g c c t c c t g a t t a g t

t c t g t g a t t

c t a t a a c a t a t g g g c a g g a a a g a c t t g a t a a c a c a c

t c a g g g t c t a t g t g g g c t g t t c t g a a g g c a t c t g g c

c a c c c a t c a c c t t t t t a t g g c c a a g t a c t a g g t t g g

t t c t g t g g t t c c a a t t a c a g g a a c a g a a c a g g t t c t

305 306 307 308 309 310

G l u I l e G l y L e u A l a S e r

a t t t t c c c c c a a t t a c a g G A A A T T G G C C T T G C C T C T

       9       1       3

       9       1       4

       9       1       5

       9       1       6

       9       1       7

       9       1       8

       9       1       9

       9       2       0

       9       2       1

       9       2       2

       9       2       3

       9       2       4

       9       2       5

       9       2       6

       9       2       7

       9       2       8

       9       2       9

       9       3       0

E9

311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322

L e u G l y A l a P r o A s p G l u T y r I l e G l u L y s L e u A l a

C T G G G T G C A C C T G A T G A A T A C A T T G A A A A G C T C G C C

       9       3       1

       9       3       2

       9       3       3

       9       3       4

       9       3       5

       9       3       6

       9       3       7

       9       3       8

       9       3       9

       9       4       0

       9       4       1

       9       4       2

       9       4       3

       9       4       4

       9       4       5

       9       4       6

       9       4       7

       9       4       8

       9       4       9

       9       5       0

       9       5       1

       9       5       2

       9       5       3

       9       5       4

       9       5       5

       9       5       6

       9       5       7

       9       5       8

       9       5       9

       9       6       0

       9       6       1

       9       6       2

       9       6       3

       9       6       4

       9       6       5

       9       6       6

323

T h r

A C A g t a a g t c c c t t c t c t c c c t g g g t g g a t g g t g g a

       9       6       7

       9       6       8

       9       6       9

gt

g t g c t a t a g g c t a t g g c c c t c a g g t c t t t g a a a c t c

t c t a c t c c t g g a g c a g g t a t c t g g g a a a a a t a c a g t

g t g t a a c t t c a a g t a

t c a t c c c a g t c a a g g t g a c a c

cg

a t a a a a t t a a c c a t c a t a g a g t g t g c t c t c a g a t t g

324 325 326 327 328 329 330 331

del   I l e T y r T r p P h e T h r V a l G l u P

a c t t t c c a t t c c a g A T T T A C T G G T T T A C T G T G G A G T

       9       7       0

       9       7       1

       9       7       2

       9       7       3

       9       7       4

       9       7       5

       9       7       6

       9       7       7

       9       7       8

       9       7       9

       9       8       0

       9       8       1

       9       8       2

       9       8       3

       9       8       4

       9       8       5

       9       8       6

       9       8       7

       9       8       8

       9       8       9

       9       9       0

       9       9       1

E10

332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343

h e G l y L e u C y s L y s G l n G l y A s p S e r I l e L y s V a l T

T T G G G C T C T G C A A A C A A G G A G A C T C C A T A A A G G C A T

       9       9       2

       9       9       3

       9       9       4

       9       9       5

       9       9       6

       9       9       7

       9       9       8

       9       9       9

       1       0       0       0

       1       0       0       1

       1       0       0       2

       1       0       0       3

       1       0       0       4

       1       0       0       5

       1       0       0       6

       1       0       0       7

       1       0       0       8

       1       0       0       9

       1       0       1       0

       1       0       1       1

       1       0       1       2

       1       0       1       3

       1       0       1       4

       1       0       1       5

       1       0       1       6

       1       0       1       7

       1       0       1       8

       1       0       1       9

       1       0       2       0

       1       0       2       1

       1       0       2       2

       1       0       2       3

       1       0       2       4

       1       0       2       5

       1       0       2       6

       1       0       2       7

344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355

y r G l y A l a G l y L e u L e u S e r S e r P h e G l y G l u L e u G

A T G G T G C T G G G C T C C T G T C A T C C T T T G G T G A A T T A C

       1       0       2       8

       1       0       2       9

       1       0       3       0

       1       0       3       1

       1       0       3       2

       1       0       3       3

       1       0       3       4

       1       0       3       5

       1       0       3       6

       1       0       3       7

       1       0       3       8

       1       0       3       9

       1       0       4       0

       1       0       4       1

       1       0       4       2

       1       0       4       3

       1       0       4       4

       1       0       4       5

       1       0       4       6

       1       0       4       7

       1       0       4       8

       1       0       4       9

       1       0       5       0

       1       0       5       1

       1       0       5       2

       1       0       5       3

       1       0       5       4

       1       0       5       5

       1       0       5       6

       1       0       5       7

       1       0       5       8

       1       0       5       9

       1       0       6       0

       1       0       6       1

       1       0       6       2

       1       0       6       3

l n

A G g t a t g a c c t t c a c a g g a a c c a a g g a t a g a t t t a a

       1       0       6       4

       1       0       6       5

a a g t g g t g g g t a c a g a a a a c c a t t a t t g t g c t t t c a

a t a t t g t t g a a a c c c t a t t t g t a t c c g t t t t g a t a t

g c a a c c t g g g a a c t c a t t c t c c a g t g a a t t

c t c c c t

t g g c t g t a g t t t t a g a t a g g c t a t a a g g t a g a a c c t

a t a t g t g c a a a t a a t t t g g c t c a c a g c a t t t g g g a c

t g t g g t g t a g a a g g a a t c g g g t t g a g a t g a g a g a a g

g g g c a c a a a t g g c c t a t g g g a t g c a g c a g g g a a t a c

t g a t c c t g a t t t a a c a g t g a t a a t a a c t t t t c a c t t

356 357 358 359 360 361 362 363 364

a   T y r C y s .L e u S e r G l u L y s P r o L y s L

g g g g c c t a c a g T A C T G C T T A T C A G A G A A G C C A A A G C

       1       0       6       6

       1       0       6       7

       1       0       6       8

       1       0       6       9

       1       0       7       0

       1       0       7       1

       1       0       7       2

       1       0       7       3

       1       0       7       4

       1       0       7       5

       1       0       7       6

       1       0       7       7

       1       0       7       8

       1       0       7       9

       1       0       8       0

       1       0       8       1

       1       0       8       2

       1       0       8       3

       1       0       8       4

       1       0       8       5

       1       0       8       6

       1       0       8       7

       1       0       8       8

       1       0       8       9

       1       0       9       0

E11

365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376

e u L e u P r o L e u G l u L e u G l u L y s T h r A l a I l e T l n A

T T C T C C C C C T G G A G C T G G A G A A G A C A G C C A T C C A A A

       1       0       9       1

       1       0       9       2

       1       0       9       3

       1       0       9       4

       1       0       9       5

       1       0       9       6

       1       0       9       7

       1       0       9       8

       1       0       9       9

       1       1       0       0

       1       1       0       1

       1       1       0       2

       1       1       0       3

       1       1       0       4

       1       1       0       5

       1       1       0       6

       1       1       0       7

       1       1       0       8

       1       1       0       9

       1       1       1       0

       1       1       1       1

       1       1       1       2

       1       1       1       3

       1       1       1       4

       1       1       1       5

       1       1       1       6

       1       1       1       7

       1       1       1       8

       1       1       1       9

       1       1       2       0

       1       1       2       1

       1       1       2       2

       1       1       2       3

       1       1       2       4

       1       1       2       5

       1       1       2       6

377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388

s n T y r T h r V a l T h r G l u P h e G l n P r o L e u T y r T y r V

A T T A C A C T G T C A C G G A G T T C C A G C C C C T G T A T T A C G

       1       1       2       7

       1       1       2       8

       1       1       2       9

       1       1       3       0

       1       1       3       1

       1       1       3       2

       1       1       3       3

       1       1       3       4

       1       1       3       5

       1       1       3       6

       1       1       3       7

       1       1       3       8

       1       1       3       9

       1       1       4       0

       1       1       4       1

       1       1       4       2

       1       1       4       3

       1       1       4       4

       1       1       4       5

       1       1       4       6

       1       1       4       7

       1       1       4       8

       1       1       4       9

       1       1       5       0

       1       1       5       1

       1       1       5       2

       1       1       5       3

       1       1       5       4

       1       1       5       5

       1       1       5       6

       1       1       5       7

       1       1       5       8

       1       1       5       9

       1       1       6       0

       1       1       6       1

       1       1       6       2

389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400

a l A l a G l u S e r P h e A s n A s p A l a L y s G l u L y s V a l ACopyright 1997, PAH Mutation Analysis Consortium.

Page 6: ref_seq pAH

8/9/2019 ref_seq pAH

http://slidepdf.com/reader/full/refseq-pah 6/7

T G G C A G A G A G T T T T A A T G A T G C C A A G G A G A A A G T A A

       1       1       6       3

       1       1       6       4

       1       1       6       5

       1       1       6       6

       1       1       6       7

       1       1       6       8

       1       1       6       9

       1       1       7       0

       1       1       7       1

       1       1       7       2

       1       1       7       3

       1       1       7       4

       1       1       7       5

       1       1       7       6

       1       1       7       7

       1       1       7       8

       1       1       7       9

       1       1       8       0

       1       1       8       1

       1       1       8       2

       1       1       8       3

       1       1       8       4

       1       1       8       5

       1       1       8       6

       1       1       8       7

       1       1       8       8

       1       1       8       9

       1       1       9       0

       1       1       9       1

       1       1       9       2

       1       1       9       3

       1       1       9       4

       1       1       9       5

       1       1       9       6

       1       1       9       7

       1       1       9       8

r (g)

G g t g a g g t g g t g a c a a a g g t g a g c c a c t a g c t c t g g

       1       1       9       9

g g g c c t c c t g a c t g g t g c c a c t c a t c t g t g g g t g g t

tgg   del   c aac

t c c a g g a g a g t g g a c t c c a a t g t c t a c a g t a t t t g t

cc

a c a t a g a c a g t t t c t c t c c a t g t t c t c a c c t c t t

t g

g t c g t t a a g g a t c c c g t c t a g g g a g g t g t c c t g t t t

c c t a a a a a a g a a g t a a a a t g c c a c t g a g a a c t c t c t

t a a g a c t a c c t t t c t c c a a a t g g t g c c c c t t c a c t c

400 401 402 403 404 405

(A r) g A s n P h e A l a A l a T

a a g c c t g t g g t t t t g g t c t t a g G A A C T T T G C T G C C A

       1       2       0       0

       1       2       0       1

       1       2       0       2

       1       2       0       3

       1       2       0       4

       1       2       0       5

       1       2       0       6

       1       2       0       7

       1       2       0       8

       1       2       0       9

       1       2       1       0

       1       2       1       1

       1       2       1       2

       1       2       1       3

E12

406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417

h r I l e P r o A r g P r o P h e S e r V a l A r g T y r A s p P r o T

C A A T A C C T C G G C C C T T C T C A G T T C G C T A C G A C C C A T

       1       2       1       4

       1       2       1       5

       1       2       1       6

       1       2       1       7

       1       2       1       8

       1       2       1       9

       1       2       2       0

       1       2       2       1

       1       2       2       2

       1       2       2       3

       1       2       2       4

       1       2       2       5

       1       2       2       6

       1       2       2       7

       1       2       2       8

       1       2       2       9

       1       2       3       0

       1       2       3       1

       1       2       3       2

       1       2       3       3

       1       2       3       4

       1       2       3       5

       1       2       3       6

       1       2       3       7

       1       2       3       8

       1       2       3       9

       1       2       4       0

       1       2       4       1

       1       2       4       2

       1       2       4       3

       1       2       4       4

       1       2       4       5

       1       2       4       6

       1       2       4       7

       1       2       4       8

       1       2       4       9

418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429

y r T h r G l n A r g I l e G l u V a l L e u A s p A s n T h r G l n G

A C A C C C A A A G G A T T G A G G T C T T G G A C A A T A C C C A G C

       1       2       5       0

       1       2       5       1

       1       2       5       2

       1       2       5       3

       1       2       5       4

       1       2       5       5

       1       2       5       6

       1       2       5       7

       1       2       5       8

       1       2       5       9

       1       2       6       0

       1       2       6       1

       1       2       6       2

       1       2       6       3

       1       2       6       4

       1       2       6       5

       1       2       6       6

       1       2       6       7

       1       2       6       8

       1       2       6       9

       1       2       7       0

       1       2       7       1

       1       2       7       2

       1       2       7       3

       1       2       7       4

       1       2       7       5

       1       2       7       6

       1       2       7       7

       1       2       7       8

       1       2       7       9

       1       2       8       0

       1       2       8       1

       1       2       8       2

       1       2       8       3

       1       2       8       4

       1       2       8       5

430 431 432 433 434 435 436 437 438 439

l n L e u L y s I l e L e u A l a A s p S e r I l e A s n S (e r)

A G C T T A A G A T T T T G G C T G A T T C C A T T A A C A g t a a g t

       1       2       8       6

       1       2       8       7

       1       2       8       8

       1       2       8       9

       1       2       9       0

       1       2       9       1

       1       2       9       2

       1       2       9       3

       1       2       9       4

       1       2       9       5

       1       2       9       6

       1       2       9       7

       1       2       9       8

       1       2       9       9

       1       3       0       0

       1       3       0       1

       1       3       0       2

       1       3       0       3

       1       3       0       4

       1       3       0       5

       1       3       0       6

       1       3       0       7

       1       3       0       8

       1       3       0       9

       1       3       1       0

       1       3       1       1

       1       3       1       2

       1       3       1       3

       1       3       1       4

       1       3       1       5

del del del del

a a t t t a c a c c t t a c g a g g c c a c t c g g t t t c t c a g t a

a t c g a a g a c t g t c t t t c c c t a c c a t c g c c a t a g g

a g

c a c c c a g c t c a t c c a a g a a g g c c c a c t t a t c c c c t a

g t c t t t c a c t a g g a c a c t t g a a g a g t t t t t g c t t a t

gt/ga

t a t a c a a g t g g c c c a t t t t g a t g g t g t t t t t c t t t g

439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450

(S) e r G l u I l e G l y I l e L e u C y s S e r A l a L e u G l u L

t a g G T G A A A T T G G A A T C C T T T G C A G T G C C C T C C A G A

       1       3       1       6

       1       3       1       7

       1       3       1       8

       1       3       1       9

       1       3       2       0

       1       3       2       1

       1       3       2       2

       1       3       2       3

       1       3       2       4

       1       3       2       5

       1       3       2       6

       1       3       2       7

       1       3       2       8

       1       3       2       9

       1       3       3       0

       1       3       3       1

       1       3       3       2

       1       3       3       3

       1       3       3       4

       1       3       3       5

       1       3       3       6

       1       3       3       7

       1       3       3       8

       1       3       3       9

       1       3       4       0

       1       3       4       1

       1       3       4       2

       1       3       4       3

       1       3       4       4

       1       3       4       5

       1       3       4       6

       1       3       4       7

       1       3       4       8

E13

451 452   STOP

y s I l e L y s T e r

A A A T A A A G T A A A G C C A T G G A C A G A A T G T G G T C T G T C

       1       3       4       9

       1       3       5       0

       1       3       5       1

       1       3       5       2

       1       3       5       3

       1       3       5       4

       1       3       5       5

       1       3       5       6

       1       3       5       7

       1       3       5       8

       1       3       5       9

  3'UTR

->

A G C T G T G A A T C T G T T G A T G G A G A T C C A A C T A T T T C T

T T C A T C A G A A A A A G T C C G A A A A G C A A A C C T T A A T T T

G A A A T A A C A G C C T T A A A T C C T T T A C A A G A T G G A G A A

A C A A C A A A T A A G T C A A A A T A A T C T G A A A T G A C A G G A

T A T G A G T A C A T A C T C A A G A G C A T A A T G G T A A A T C T T

T T G G G G T C A T C T T T G A T T T A G A G A T G A T A A T C C C A T

A C T C T C A A T T G A G T T A A A T C A G T A A T C T G T C G C A T T

T C A T C A A G A T T A A T T A A A A T T T G G G A C C T G C T T C A T

T C A A G C T T C A T A T A T G C T T T G C A G A G A A C T C A T A A A

G G A G C A T A T A A G G C T A A A T G T A A A A C A C A A G A C T G T

C A T T A G A A T T G A A T T A T T G G G C T T A A T A T A A A T C G T

Copyright 1997, PAH Mutation Analysis Consortium.

Page 7: ref_seq pAH

8/9/2019 ref_seq pAH

http://slidepdf.com/reader/full/refseq-pah 7/7

A A C C T A T G A A G T T T A T T T T C T A T T T T A G T T A A C T A T

G A T T C C A A T T A C T A C T T T G T T A T T G T A C C T A A G T A A

A T T T T C T T T A G G T C A G A A G C C C A T T A A A A T A G T T A C

A A G C A T T G A A C T T C T T T A G T A T T A T A T T A A T A T A A A

A A C A T T T T T G T A T G T T T T A T T G T A A T C A T A A A T A C T

G C T G T A T A A G G T A A T A A A A C T C T G C A C C T A A T C C C C

A T A A C T T C C A G T A T C A T T T T C C A A T T A A T T A T C A A G

T C T G T T T G G G A A A C A C T T T G A G G A C A A T T T T G A T G C

A G C A G A T G T T G A C T A A A G G C T T G G T T G G T A G A T A T T

C A G G A A A T G T T C A C T G A A T A A A A T A A G T A A A T A C A T

T A T T G A A A A G C A A A T C T G T A T A A A T G T G A A A T T T T T

A T T T G T A T T A G T A A T A A A A C A T T A G T A G T T T

Copyright 1997, PAH Mutation Analysis Consortium.