structure - function investigations on antiviral peptides

26
Journal of the University of Chemical Technology and Metallurgy, 47, 2, 2012, 113-138 STRUCTURE - FUNCTION INVESTIGATIONS ON ANTIVIRAL PEPTIDES (REVIEW) L. Vezenkov 1 , M. Nikolova 2 , I. Minchev 1 1 University of Chemical Technology and Metallurgy 8 Kliment Ohridsky, 1756 Sofia, Bulgaria E-mail: [email protected] 2 National Center of Infectious and Parasitic Disease, Sofia, Bulgaria ABSTRACT In 1898, Friedrich Loeffler and Paul Frosch found evidence that the cause of foot-and-mouth disease in livestock was an infectious particle smaller than any bacteria. This was the first clue to the nature of viruses, genetic entities that lie somewhere in the grey area between living and non-living states. Viruses cause a number of diseases in eukaryotes. In humans, smallpox, the common cold, chickenpox, influenza, shingles, herpes, polio, rabies, Ebola, hanta fever, and AIDS are examples of viral diseases. Even some types of cancer - though definitely not all have been linked to viruses. Our attention was attracted from two very important types of viruses Picornaviruses and HIV. To date, no therapy has been approved for the treatment of picornavirus infections. However, efforts to develop an antiviral that is effective in treating picornavirus-associated diseases are ongoing. Several key steps in the picornaviral replication cycle, involving structural as well as nonstructural proteins, have been identified as valuable targets for inhibition. HIV infection (Human Immunodeficiency Virus), caused by the retrovirus strains HIV-1 and HIV-2, has produced a world-wide impact during the last 20 years. The HIV-specific CD8 T cell (CTL) response is inefficient, leading to viral persistence and disease progression to AIDS in the absence of specific antiretroviral therapy (ART). Therefore, the mechanisms of perturbed CTL differentiation in the HIV+ patients are a matter of intensive research. This review summarizes our contributions to these areas including the development of synthetic picornavirus inhibitors, and HIV-1 peptides for in vitro detection of the virus-specific CTL Keywords: picornavirus inhibitors, CD160, HIV infection, T cell receptors, 3C inhibitors, peptidomimetics. Received 10 January 2012 Accepted 12 March 2012 PICORNAVIRUS INHIBITORS INTRODUCTION The picornavirus family is one of the largest virus families known, consisting of nine genera: aphtovirus, cardiovirus, enterovirus, erbovirus, hepatovirus, kobuvirus, parechovirus, rhinovirus, and teschovirus [1]. The human enteroviruses are divided into 5 types: polio- virus (PV); human enteroviruses A (HEV A)-including coxsackie viruses A 2-9, 10, 12, 14, 16 and human en- terovirus 71; human enteroviruses B (HEV B)- including

Upload: truongtuong

Post on 10-Feb-2017

215 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: structure - function investigations on antiviral peptides

L. Vezenkov, M. Nikolova, I. Minchev

113

Journal of the University of Chemical Technology and Metallurgy, 47, 2, 2012, 113-138

STRUCTURE - FUNCTION INVESTIGATIONS

ON ANTIVIRAL PEPTIDES

(REVIEW)

L. Vezenkov1, M. Nikolova2, I. Minchev1

1 University of Chemical Technology and Metallurgy

8 Kliment Ohridsky, 1756 Sofia, Bulgaria

E-mail: [email protected] National Center of Infectious and Parasitic Disease,

Sofia, Bulgaria

ABSTRACT

������������ ���������������������� ������������� ����������� �������������������������������������� �

���������� �������� ��������������������� ��� �!��������������� ���������������������������"���� ������������

������������������"������������������"������������"������� �#����� �����������������������������������

������������������$������ ������ ����� � �����$��������%������"������������������������&���������������������

'�()�����$��������������������� �&������������������ �� ��������"�������������������*�������������������������

+������������������� ���������������������������������������,�� �������������-�# �!���������������������

��������������������������������� ���������� ���� �-���������������������������������������������� �����

�����"�� ����������� ������������������"��" �)����������������������� ���������� ����� � ����������"

��� ���������������������� ���������������������������������������������"������������� �-�#���� ����.-����

��������� �� ��#��/�� ��������������������������-�#�������-�#�0���������� ����������������� �����"

���������01����� �!���-�#���� � �2(��!� ���� .2!�/��������� �� ���� ����� �����"��������������� ������������

��"���������'�()������������ �������� � ������������������.'3!/ ��!�������������� ������������������2!�

������������������-�#4����������������������������������� � �!��������������%������ ������������������

������ ����"��������������������������� �� �������������������-�#������������������������� ����������

������� � �2!�

5������6�� ���������������2(�71��-�#���� �����!� ����� �������82������������������� �

Received 10 January 2012

Accepted 12 March 2012

PICORNAVIRUS INHIBITORS

INTRODUCTION

����������� ������������������������������� �

������������������������������������������ ��

������� ��� ������ ��� ����� ��� �������� ��

��� �� ����������� ��������� �������������� ������

����� ��������� ���������������������������������

�� ��!"#$%�� ��������� ����&�!'(#�&$ ��� ���

��)��������� ����&�* +���,���*���-���.�����������

����� ��/�%������������� ����0�!'(#�0$ ���� ���

Page 2: structure - function investigations on antiviral peptides

Journal of the University of Chemical Technology and Metallurgy, 47, 2, 2012

114

��)������� �� ����&+��0

� 0

.�� �)��� ���� � 11� ��� �

����� ��.+%�� ��������� ���

��2�!'(#�2$

���� �

�����)��������� �����&���&

����&

�1��&

����&

�/ **��&

*-���

��������� ����3�!'(#�3$ ��� ���������� ���

.4�� /,� ��� 4/%� ������ ������ ���� !0(#$%� �����

������ ����&� !"(# &$%� ������ ������ ���� � 0

!"(# 0$��!�������$��*����������������������������

�� �������� ������� ��� ���� �� ���� ���� ���� ��������

(����� ���5����� ���2������ �����&������� ��

5����� �� ��� ���������� ������� ��������� ��� ���

�������������6����������7������������ ���������

����-,���������������������������������������

�1�����������������������&������� ���� ��������

8��� �� �� ����������� �������� ������� ��� ����

8��� �� �� ������������������� ��� ����5������

������������������������� ��!(92#$���������������

���������������������������������� �����-���������

���������������������� ���� ������������������

���������������������������� ���������� ����� ���

�������������������������������������������������

������������������������������������ ���� ���� ���

� �����������������������������+.,��.��/��

������ ������������ �������������� ��&

���0������)��������� ����������� �������� �����

������ ���������������������2�)��������� ����!&���

:$������������������������������������������������

����������������������������������3 �������������

���������� ������������������������� ��������������

�� ������������������ �������������������������������

�������������������������; �������2�)�������:��� ���

����������������������������� �����������������

������2�)�������0��� �����&�����������������������

2�)�������:��� ������� ��������<������7 �����

������������������� ������6������7�����������6�

������������7��4��

����������������������������������������������

�� ���������������������������� ����������������

���=����=�� ���������������������������� �

�� ���� ��������� ���������� � ���������������� �

�������������������������������������� ��������������

���������������+���&���������������� ��������������

&����� ��������������/�,,,�� ������������������

����������>?����������@���������� ������������������

�����������������������A� ������������������� �

�������������������,��

� B�� ��� ���� ����� �������� ���� ���

��������������������������(�������������� ��

������ ����������������������������������� ��!"#$%

������ ���������� ���� ����� ���������������

���������� ������������������� ������ ��������������

������ ����������

���������������� ���� ���������������������

����

������ �����������

��� �!����"�#

���������������$� "��������"��������

�����������%�����

��&�� �������

���������������' ���� ���������( ������ �����������

��� �!�����

� ���� ����������'�� ���!�����%)���"����

�� ��"������

� ��������������������$����������

�$��(�**

������!�����

� �������������������

���������������+� ���� �����������������*��,�

�$������

������ �����������

��� �!����"��

���������������- ���������������� ��$���$ .�"������������������

������!�������

��������������������!������#

���������2����������������� ��������� ���������������C�����������*��

Page 3: structure - function investigations on antiviral peptides

L. Vezenkov, M. Nikolova, I. Minchev

115

� ��������� ����&�!'(#�&$ ��� ������)������

�� ����&�* +���,���*���-���.���������������� ��/�%

������������ ����0�!'(#�0$ ���� ������)������

�� ����&+��0

� 0

.���)��� ����� 11���������� �

�.+%��

��������� �����2�!'(#�2$

���� ������)��������� ���

&���&

����&

�1��&

����&

�/ **��&

*-��� ��������� ����3�!'(#

3$ � ��� ���������� ����.4��/,����4/%��������

����� ���� !0(#$%������� ������ ���� �&� !"(# &$%

������������ �����0�!"(# 0$�!�������$������

���������������� � ������� �

"������ �������������� �����������������

��������������������� ��1,��������������������������

�������������������)���������D�����������������

����������� ��� �� ����������#"�����#"-��#"����

#"1�� � ������������ �������5E&���������

���������� ����)��������/�,,������������ ����������

������� ������� �*������� ��������������� ��� �

���������������������������������������������

�������������� �� �������������������������@����

��� ���� ������� ��� ��������� ���� ������� ���� ��* �/��

B����������������������� �� ������� ���������

��� �������������� ���������� ����������������)���

�������������������������������������� �� ������

�������� ���-�!'5#�-$���1��������������������

����� � ������� ����� ������ ���� ���������� ��� ������� ���

��� ��� ������������������������������ ��������

������������������������������������ ����������

������������ ��������������������������������������

�������������������������������������������������

� ��������������1���4���&�������������������� �

�������� ���� �� ����������������������������

��� ������������ ���������� ���������� ���������#"��

(����� ���������������������� �������������� ������

5E&���������������������������������� � ������

������#"��!��10$�������������������F��������������

�� ���� ���� ������ ������ ����� ������� �� �����

������������������������������������������������ �

����������������������� ����������"���"*����"1�

���������������������� �� ����������#"�����#"-�!"�$�

����������� �� ����������!"*����"1$����+���9��

������������������������������ �������� ���������

������"������*&��12����123��������������13�������

5E& ��������5E&������������*2��������������

�������������������� ����������������������5E&

�*,�����*0��*02��1&����1&0��������������������

��������� ��� ������������������������������5E&

����� � ��������������������������5E&������ ��

������������� ����������������������� ������������

���������������������������� �������5E&������ ���

��������� � �����������������13����������������

���� ���� �� �������@��� ����� ��� ��� ��� ��������

���������������������� �������������������������

���������������������������������������������������

�������&������������������������������������ ����,-

����,��������� ���������������������������������������

���������

������������ ���������

G����������������������������� �����������

���������������0������ ����&����0������� �@������

������������������������������������������������

�������������������������� ���������� ������ ����

��� �����������������������������F�������������

�� ���

������������������������������������������������ ����

������������������������������� ���������������������

������������� ��������%

������������������ �����������������������������%

�5E&��������@����%

�"������������������

3 ������������*,����������������������������

������������������������������ ���� ����������#"�

!����������$������������� �������������������������

���������������������������1&���12�������������

�������������?��������������������� �������������������

8���������������������������� ��������!#"�$����������

��������������������������������������������� ��������

������� ����������������������������������������H�

����� ��!������*$������������������������ ����������

����� ��������� ��������������#"����1I����������

���������������

�2��������������� �H������� ����������������)����

�����@�������� ������������������� ����������

��������������������

� �������� ��������� =� � ������ ������������

�����������@�������@�����@������* !J ����)���@��$

��@�����@����!'00$������)���������������

� ��������������� ���� ���������������� ���� ���

��� � ������%

���������������

2����� ����������� ����������������������

����������������� ���������D�������������������

Page 4: structure - function investigations on antiviral peptides

Journal of the University of Chemical Technology and Metallurgy, 47, 2, 2012

116

���� ��� �������� ������� ����������� ������ ����� ��

������ ����������� �������������������������

�����������������#"���������� �����������������

0�����������������������������������������������

�������K'������������������������������������������

��������� �� ���� ������������ ������������

��������������������������������)���������������

����������������������� ��������������������

G��������� ������������������������� ���������

#"�������������������� ������ ��� �� ���������� ���

������������������������������������������� �����

����������� ���������������������������������

��������������5E&��G������������������� ��������������

�������� �; ���� ������ ������ ��� ������� ���)��������

G��������������������������������� ��������

������������������� �� ��������������������������

���������������������������������� ���������

������������&���������� ����������� ��������H�

�������������� �����8����*����������������������

�����������������������������������������������

������� ���������������*� *���

3���)�����������������H����/����������������

����� ����� ����� ������������ ������������ ����������

������������������������������������������� �����

�� ���������������������������������������� ���

�������������������������

H���-+�-������� ���; ��������� �������"����

GG������������������������������������ ����!5#�*1���

1+$������������� ��!��)�������� ��&*�$�

�H���-+�-�������������������� ��������� �����

� �������������������������������)�@������������������

� ������������������������� �������������������������

����� ������������

H�� .�.,��� ������� ��� ��������� �������

����������������������������������������������������

��� �������� ���������������>��� ����������

����������������� ��� ��������� ���������� ��� �� ���

��������)����������������

H��.14-1�����������������������������������

������� ��� �� ������������ �� ��������� ��� ���

������������ ���������������������

������������������ ���������������� �� �

���H��.�.,���� ����������������������)��������������

��� ������������ ��������� ��H��.14-1������������

��� ������������ ����������������� �� ��������

����� �� 0�&� ��� ���� ������� 0����� ?��������

9��������"����L�����0"5BM�����E�������'������������

G���� ��� ���������������?2'������ ������?�����

"�� ���!������1$�

0�& �44�!0�����?���������9��������"����L���$�

������������������������������ ��������������������

������������������������������������ �������������

������������ �����*. *4��

���������������������

B���������������)����������� ������������ �

��������������������� �������������������*+ 1*��

���������� ����������������������������������� ����

���������)�������� ����������� �����893#��� ��������

����������&��� ���11 1/���������������������������������

��������������������������������������� ����������

���������������������������������������� ��*�,,,

��������������1��14������������������������������������

������� ������������������� ������������������

���������������������)�� ����������������L��*&����12

���������G���������� ����������� ������������*&

��������!*&��$�� �����������������������*&����������

������"������������2�������� �� ���������������

����*&�������'5# *� ���������� ������������������

������������������������ ���������������������

�1+��-,�������������������� �������� ��������

� ����������������������������*&�������������������"��

������� ���������������������������������������*&

�������������������������������������������������

��������12+����13+���� �����-����&�����������������

����������������������������)�������������������� ��

������*��H������� ���

WIN 54954 WIN 61605 WIN 63843

Page 5: structure - function investigations on antiviral peptides

L. Vezenkov, M. Nikolova, I. Minchev

117

����������������������#",�� �������������������������

������@������������ � �������12�������������������

�������� ������������������K� K�����������������

���������12������������������12�� ����������������5E&

��������5E&�����������13�!123$��-*��-1��

����(������ ���������������; ��������������

���������������������� �� ���� �������������12����

����������������������������������������������--

-4���'��������� �����������������������������������

��������������� ������������ �������� ��������������

��������� ����������)������������������������

��� ��� �; ������ ��� ����������� �������� �������

���� ���������������������5���� �����������1 3��� �

� �����N ������������������ ���; �����������������

12����������������������������������������������

��������� �� ����� ���������� ���������� ���������� ��

������������������ ���������-*��-.��-/��-+���,��

?�������������������������������� ������ ���

������������������������������������������������

�������������������������������� ����������������

������������������������������������������@�����

������������'5#�12"���� �4��

9���� ����������������������������������� �

� �����'5# �-�12"�������������� ������������

��������������� ������������)������������������

��������� ���������������������������������������

"�� "�F� ������ ���������� ?���� �� �����������������

�)����������������������������������������������

������1��2���� ���:�&���������������0�����?���������9������

"����L�����0"5BM����E�������'�������������G���� ��������������?2'

����� ������?����� �"�� ���

Page 6: structure - function investigations on antiviral peptides

Journal of the University of Chemical Technology and Metallurgy, 47, 2, 2012

118

���� ��������� ����������� ���"������)������� ����

�������������������������������������������

���������������

RESULTS AND DISCUSSION

������ � �������12���������!12"$�����������

���������������)��������� �� �������������������������

�����������������������������������������������������

����������������������-*��-+���,���+��.,���3 ������������

� ����� ���� 12"� ��� ������� ������ ��������������

����������������������� ��������������������������

��������.� .-���L����� ����������������������������

�� ����12"������������������ ��� ����� ��� �� �����

�����������*�������������������������������� �������

��������� ���������� �����������������������������

������&���������)������������������������������ ��

����������12"������������������������������������

��������������������12"�� �������' '�� L� "��

K� K�� "� B'��� ������������� ��������������

��� ����������������M L� "�� K� 9�����������

���!8�����$���������������������M L� "�� K� B'���

����������������������������������� ��������������

����!9?2$��������)������12"�����������������������

.*��.���..��

�������������������������������������������

� �����"1������������������������L� ��������������

�������� ������ �@���������������/������������

������-��"�����������12������������������

Page 7: structure - function investigations on antiviral peptides

L. Vezenkov, M. Nikolova, I. Minchev

119

���������������� ����� ��������������������������������

9����� ��������������������������� ��������� ����

��9�������������� ��������������������� ������ ����

��)������������������������������������������-��

? ����� ���� ��"*����"

1��������� �� �������

�� ����������12"��������� ��������������������

��������������������������������������������������

��������� �������@��� ��� ����������� ���� ��� ������

����E ������������������� �������������������

��; ���� �.� .-��

H��������������������������������� ����������

��������������������������� ��������������������������

������������������������; ����M L� "�� K� B'���

������������������ ���������������������������� ��

12"� �������� ��������� !8���� �$� �./���B � ������������

���������������

�3���������������������)������� ��F����

��������������������������%

�G������������������������������������������

����������������"���"

*����"

1���������������������

!����� ���������$%

�G��������������������� �� ��F���� �����

����� ������F����������!����� �����������$�

������������������������������������������

����������������.4 /��������������������������������)

������ !/* /.������ ������������������ � ����� ���� �

H3NNH

HN

NH

N

HO

O

O

O

NH2O

CO2

O-+

P1P2P3P4 P1' P2'

Fig. 1. Structure of the minimal 3CP substrate composition.[54].

H3NNH

HN

NH

N

HO

O

O

O

NH2O

CO2O

-+

P1P2P3P4 P1' P2'

O NH

HN

NH

Mihael acceptor

O

O

O

NH2O

Fig. 2. Transformation model of 3CP substrate into its inhibitor.

Scheme 1. Synthesis of the N-pyrrolcarboxylic acids.

Page 8: structure - function investigations on antiviral peptides

Journal of the University of Chemical Technology and Metallurgy, 47, 2, 2012

120

����� ���������� ��!� ������='�� 2�����=B2'1$�����

����� ����� ��������� �� ���� � ������ ����� !2'1 �

2.'

�2'

* ����!2'

1$*2'2'

* $

? ����������������������������������������

�����������������/�������1�����������������������

����� ��/��������@������ ��������������������������

�������� ��� ����������� �����//��/4���������������

������������������������� ��/�������������������

���������������������������� �����������������

!M L� "�� K� B'$��������������������� ���� ���

���; � ��������������!����$��8������������������

�����������������������������������������������

��� �����������������������E �����������������

G������������� ���� ������������� �������� �����

����������������������G�������� �������������� �

� ���������������������������� �����������������

����������G���� �������������� ��������������������������

�������������� ������������������������!������. ��$�

������ ����� ����5��������)�����������������

������� �������������������� ������������������������

��� ���������2� ������������� ����

�����������������������������)������ �������

�������������������������������������G���� �������������

���������������������������������������������������

N

OO

R3

O

NH

NHO

O

OH

NH2

O

R1

R2

N

OO

R3

O

OH

R1

R2

N

OO

R3

O

NH

NHO

O

O

NH2

O

R1

R2

N

OO

R3O

NH

O

O

O NH2

R1

R2

N

OO

O

NH

O

OH

O NH2

R3R2

R1

b

a

c

d

�����������

�������

�1 �2 �3

����

���������

-H -H-H-H

-Cl-Cl

-CH3-CH3-CH2-CH(CH3)2

-H -H

-OCH3-OCH3

����������

-CH2C6H5-CH2C6H5

13 and 15

6, 8 and 10

���

Sheme 2. Synthesis of compounds 6-15.

Page 9: structure - function investigations on antiviral peptides

L. Vezenkov, M. Nikolova, I. Minchev

121

� ���!�����"��"���������)���������������������������

���������������)�����' �������������������� ��������

K������ ���������������������������������������

�����@�������� �������������@����������������

������������������������������� ������������

������������������������������������������������

������������������ ������ ������������������������

����� ������������� ������������������������@��

���� ��51�!����� ����!#�$$�������������������

�����������5�� � ���5

*��������� ������� ����$����

�����������������������������������B2'1 ��� ���

�������������� ��������� ��������� � �������

��������������������������� ����������� ����������

�� �� ���������� �������"���������������������

��������������������������� ���������������@��

����� ����� �������������������������������������

������������������ ������ ����������������������������

�������������������� ���

?������ �� � ����������� ������������������ ���

��������� ����� �������"�����"

*������������G�������������

�������������������K�����"������������������������

����12"���������������������������������������"*�����

����� ����� ����� �� ���� ��� ���������� ����� ��� ���������

E���������������������������������� ����������

�������������������������� ����������������������

��� 12"���������� ��*��� ����� ���������� �������� ��

����� ����� �������E ����2 ���� ������������������

������������12"������������� �������������������

����������������������������*���/���?�������������������

� ������ ���������������������������������������

�������@�����@���������@����������������������"-��

"�F������������ ������������ �� ��������������������

��������� ��-�� ./��� ����� ����� ��� ���� ��� ����������

������������)�����������������������������������

���������������������������������������'������

� ��������12"��������������/+��4,��

B ������ �������������������������������������

������������"-����������� ������������������������

��������������������������������/��

'���� ��� ����� ���� ��������� ��� ������ ��

����� �����������������������������12"�� ������

�����������������������������@����������������� ��

�����������������������������������������������

��� ����������� ����� ��� ������ ������������ ��������

��������������������������� ����������������

������ �� � ������������������������������������ ��

�������������������� �� ����������������@������

�� ����������� �������������� �����������������

������������������ ����������������������������������

����������� ������ ����������������������� � ��������

������������������� ����4� 4*��

0�@�����@���� �������� ���� ������������

��������� G����@���� !��$� �������� ���������������

������������������&� ������� ������������������

�������� �������� ���� ��� ���������� �����@���� ��� �

� ������ ������� G� �������� ��� ���� ���� �� ����������

���������&����������������������������������������� ���� �������; �

�����������������2�)�������� ��0��������������8L��������//��/4��

I

Compound

II

Antiviral

activity

III

/( di- dt) in

mm *

I II III

6. - ≤ 5 mm 14. - ≤ 5 mm

7. + ≈ 12 mm 15. ± ≈ 10 mm

8. - ≤ 5 mm 16. - ≤ 5 mm

9. - ≤ 5 mm 17. - ≤ 5 mm

10. - ≤ 5 mm 18. - ≤ 5 mm

11. ± ≈

10 mm 19. - ≤ 5 mm

12. - ≤ 5 mm Ref-

guanidine

hydrochloride

++ 21-40 mm

13. ± ≈

10 mm

Page 10: structure - function investigations on antiviral peptides

Journal of the University of Chemical Technology and Metallurgy, 47, 2, 2012

122

�����������41 4/���'��������������F�������� ����

������������������� �����������G����@��������������

����������������������G������� ������� ������������

����������G����@�����������������������E ����2

���� ����������������� ��������������������������

��������������������������������"1����������'������

����������������������������������� ��������������

��������12"�������������������!8�����$�������������

�����@����������� ��� ��� ��� �������� ������ ���

��������������������������������������� ����������

�������� 2'*E' �� 2'O2' ��������� ���������@���

����������������� ����������������������������

� �����������������������������������������������������

������������������������������ ��������������

����������� �� ���' ����"- �L� �"1 �"���"* �K��"�

K���"�F �"��"*F B'�

G� ���� ��� �� ��� ���� ��� ���� ��� �������

� ����� �������"1���������������������4������ ���������

�������� �� ��' &�� "�� K� B'�!&��O&���G����L� �

'����"�������$���� ���������@��������������������E

�D���2 ���� �������������@����8 ������������

���������������������������"������"*��������������� ���

������ ������������������E ���� ���������������

��������������������������������P�2'*E'��G�� K� B'�

���P�2'*E'��"� K� B'������P�2'

*E'��&� K� B'�

���P�2'*E'��'�� K� B'��������P�2'

*E'���� K�

B'������������@�������������������' G�� K� B'��'

"� K� B'��' &� K� B'��' '�� K� B'��' ��

K� B'���������������' &� "�� K� B'��' G�� "��

K� B'��' '�� "�� K� B'��' L� "�� K� B'��'

"� "�� K� B'��' �� "�� K� B'������������@��

�����������

&�����������/������ ���������������� �� �

'!G�&�$ &�� "�� K� B'!G�$����������� �������

�������� �� �����P�2'*E'��0�� K� B'�!0��OG����"��

&���'�����$�������������������� 12"� � ������

��������������� �������@������ �9 ������ �������

�������������������������������� �������������

�������������������������� ���� �������; � ��������

��������������)��������� �������0��!2# 0�$���������

�� �� ������ !L?� *��$� �� ���������� ����� ��� G��

"�� K� G���G�&� '�� "�� K� B'����G�&� L�

"�� K� G����������������������������������������

�������������L?� *������2# 0����������� ���K�

���"�����"������"

*���������������������12"�� ������

������������ �������@���!G�$���G����@���������������

!G�&�$��������� �� �����������������2 �!"�F�����

���$� ��D��E ���� �� !"-��������$��&����� ���

������������P�2'*E'��G�� K� B'�������P�2'

*E'�

�� K� B'���� ������� �����������������������

��������������������������������������2"(��������

����� ��� ������������� ������ ��� �������

����� ����������������������� ��������������������

����������������������������������������������������

������������������� ��������*������������������������

�����������������5E&��K �������������������������

������������� ��� ��������� �����������������

���������������������������������������G�������������

� �����������������������������������������������

���������������������������������������������������

������������5E&�����������*+���'�����������������

�������������5E&����������������������������

���)������������������ �������������������G������

������� ����������������������������������������

���� ����� ��������� �����!�$�������� �� �� ��

���������� ������������ ������������ �����������������

������*2�!�*2$���������������������� ����������

�44����&��������������� �������� ������������������

��������������������������������������������

����� ������������������������������������������

; ��������������������������������

G��������������������������������� ���������

������� ������ *2� ��� ��)�������� �� 0-� ��� ���

� ���������� �����������������)������!K&3.�$���

���������������������������������� �� �������

�������������������� ����� �������������������������

������������� ����������; �������������������

����.��3������ ������������� �����������������)�����

K&3.�����������)�������0��� ��*2�������������

���������������)������)�����������"� K� #�� L��

K� L���������������������; �����������������������

��)�������� ��0-��������������������������������� ���

�������� ��� �������)�������0 ����������� ���������

�� �� ������������������������ �������� �������

��� ���������� �4+��� G����� ��� ������� �������

���������������������������������������������������

' "� K� !B0@�$ #�� L�� K� !B0@�$ L�� B'�� 8�

"� K� !B0@�$ #�� L�� K� !B0@�$ L��%B'��2� "�

K� !B0@�$ #�� L�� K� !B0@�$ L�� B'��' "�

K� !B0@�$ #�� L�� K� !B0@�$ L��#E'*�� 8� "�

K� !B0@�$ #�� L�� K� !B0@�$ L��#E'*��2� "�

K� !B0@�$ #�� L�� K� !B0@�$ L��#E'*��+,��+������

�������� ������������!8� $������� ��������������

����������*+������������!2�$��������������� �����

Page 11: structure - function investigations on antiviral peptides

L. Vezenkov, M. Nikolova, I. Minchev

123

�� ������������� ��������������������������������

��� �������������� ���� ��������������������������

����������� ������H��������������5���&����

5����

G�� ��� ���� ����� ���������� ��� ����� �����

��������������������������� ��������������������������

������������������"� K� #�� L�� K� L�������������

����������������'L& 351�������!� ����� ����������

�� $�

H���������������������������� �� ���������

K&3.������� ��������������������������������

�����������

���������������� �������������������������

� ������������������������%

*��������� ��������� ���������� �����������

�����������Q ��@��������%

1����������������2 �����������)��� �������

����������������2BE'*�!������� ����$�

������� �������������������������������������

��� ���������� �������������

������� ���� �������; ���������������%

����2"(���������������������������%

������ ������������������������ ����)��������� �

0�������������������!8L������$���������������@������

��������������������������)����������������������

G��������������������������������������������

������������������������������������������ �����

1����.��G��������������������������������Q ����)����

� �������������� �������������������������������

������������������ ��!����� ���������������!$�

��������������������� ���� �������; ���������������

������������������� ����������������������������������

�����@������������������ ������������������ ���1

���.��������������������������������������������

���������������� �������������������������������

�������������������������������������

CD8 T CELL RESPONSE IN HIV INFECTION. CD160AS A MARKER OF EFFICIENT CTL RESPONSEINTRODUCTION

2�����)���234R��������������� !2�L$�����

�������������������������������� ��������

���0�12-03 �41252.�60770�1

�� ������8��9:);�<�5��6���8��9:);�<�6���:� �

�� ������8��9:);�<�5��6���8��9:);�<�6���4�� �

�� ������8���5��6���8���6���:� �

�� ������8���5��6���8���6���4�� �

�� 7�������8��9:);�<�5��6���8��9:);�<�6��=:� �

�� 7�������8��9:);�<�5��6���8��9:);�<�6���4�� �

�� 7�������8���5��6���8���6��=:� �

�� 7�������8���5��6���8���6���4�� �

�� ��������8��9:);�<�5��6���8��9:);�<�6���:� >

� � ��������8��9:);�<�5��6���8��9:);�<�6���4�� >

��� ��������8���5��6���8���6���:� �

��� ��������8���5��6���8���6���4�� �

���!� 8��!��� ?@@?

������.��&������������������� ������������� �� ������� ���� �������; �� �����������������

��)�������� ��0��������������8L��������

9�1��1��:����������������;�<.�����

�/��������

������������������%������

��������������$ ���%���;����<�

≤ =���;� ± = ≤ <� ≤ �1���;�4����1��� ≤ <� ≤ 01���;�44��0� ≤ <� ≤ >1���;�444��<��?�>1���

Page 12: structure - function investigations on antiviral peptides

Journal of the University of Chemical Technology and Metallurgy, 47, 2, 2012

124

������������������+*���2�L ������������������ ���

��������������������������������������������������

��������� ������ ����������������������'G# ���

��������+1���(���������'G# ��������������� ������ �

������� �������������� ����� �������������������

�������������� ����� ����������+1��+-���"����

������������'G# ���������2�L�����������������������

��234 ����������������� 234R��� ������ ������

������������������������������������������������

���������������������������� ���'G# �����������+��

+.���8�������'G# ���������2�L�����������������������

�������������� �������+/��+4���G�������������������

������������������� ���������������������� ��

������������������++���&���� ���� �������������

������������ �������� �������������'G# ����������

2�L������������������������������������������

��������� ������������������������D��������

'G# ������������������ ����������������������

�������� ��,, �,*���2���; ������ ���������������

������������������������234R������������������

��������������������������

B����������� ��������������2�L�� ����������

����������������������������23*4����23*/���

���� ��������������+*���,1���,-���������������������

23.*L����������������,������������; ����)������

���23-�5,� ���23-�5&� �������� ��,. �,/��� ���

������������23�.���,4���23�/���,+����,���*0-�������

EC5����*����2������������������������������������

234R���� ������������ ����������� ������)������

���225/��2N25�����225�������� ���������������

� ����������������23*4D23*/D23-�5&��������2�L

������������� �������� �������� �� ����� ������ ��

���������� ��������� ���1�� ��-��� '������� ���

���������������������������������������� ��������

��������������������������������������������������

����EC� ����� � ����� �������0S���� ������

�� ���������23�.,������)������������234������������� ����

����������������)�����������������������23*4 23.*L#

23-�5,R���D��23-�5&R� � ������ ����� ��/�� ����

�������� ��������D�������� ��� �������� � �����

���4���23�.,���� ������������K"G ������������

����������������� ����������'L& G������ �������+��

G�������������������� �� ���� ������ ���23*4 ���

�������������������������� ���������25D231�������)

����� ����������������������������������������@�

!���$��L��������������������� ������!L&�$����� ����

������� !�25$� � ����� ���� ���� ������ ����� ��*,���H�

���������� ���� ��������� �� ����������������� ��

0S��R234���������������'G# ��R�� �A�������*����"��

������ ��� � ���� ������������ ���� ������� ������

23�.,��)�����������������234������������� �������

������� ��������� ������ �����������'G# �R���

������

8����������������� �����23�.,��)���������������

���23*4D23*/ �������������)���� ���������������

�����'G#R���������!1��� ���������������� ����

'G# ��R�����������������'�����������G������ ��3��������

?�����$� ����������������) ������� ��������'G#

���������������!�O�*4$���**���G���������� �A�����23�.,

�)�����������������������������������������������

�������������� ������!���������*/�T����*��T�������������$�

����������������� �������� ���� �����23*/R23*4R

� ���� �������G�'G#R�� �A�����23�.,��)����������

�������������������������������������� �����!�����

���.+�T�����*/�T����U�,�,,�$�����������������������

���������� �����!���������*,�T$��!8���1$�

�� ��� �)������� ���23�.,������ ��� �� ���

�� ������'G#�������������� �A���������; ������������

�����������; ������������������8 ������������)���

�������23�.,���'G#R�������������������������23-

����� ����� ��!&2$���������)���������� ��������

�������� ���������������������23�.,R23*4 �� ����

���������������������������������������23-�&2�!��U

,�,�$� ��� �� ����2314�&02���234R��� ������ !��U

,�,,�$����������������23�.,R23*/ �2�L�� ��������

����������������������������������2314�&02���������

���������� ������������!��U�,�,�$��E��� ��������

����������������������������23*/R23*4 �� �����

8������ �������� ���������� �)������� ��

23�.,���234R����������������������������������)��

���������

G����������������@������������)��������������

234������������������ �V���'G#������������������

��@��� ��������� ���������� ��� ��� �������

������������������'G#�K���!?LSE�#&�L$��'G#����

!GLC("#'K#$��(0#�09L8��!KL2�L#&9L$����29#

��.��!EL#"9#&�#$������������������������8���

����������������� ����������������*1��

���� ������������������������?""?��8���

��������� ���� ���� ��������� ���������� ��� ��������

8��� '��!��$ B'�� � 8��� ��!�0 $ B'�� 8���

&�!��$ B'���8��� ?�!�0 $ B'��8��� ���!�0 $ B'�

8��� L��!��$ B'�� 8��� 2��!��$ B'�� 8���

K� !B�0 $ B'�

Page 13: structure - function investigations on antiviral peptides

L. Vezenkov, M. Nikolova, I. Minchev

125

Fig. 3. Expression of CD160 on cytotoxic subsets defined by CD27/CD28 markers in HIV- healthy controls (A) and in HIV+patients (B). Blood samples were stained with the combination CD160/CD27/CD8/CD28. Only CD8high cells were analyzed,additionally gated as indicated for each pair of dot-plots. Percentage of CD160+ cells in the particular gate is shown.

Page 14: structure - function investigations on antiviral peptides

Journal of the University of Chemical Technology and Metallurgy, 47, 2, 2012

126

����������� ������������������������� ���

����������������������� ���������������������������������

���� ����G8E�������������6�����7����� ��������

�����������������������������������������������������

������������������������������?�������������!/�=���

��$�����������������@������234�����������������

�; ����������������������������� �������������

���������������&���� �������������������������������

������������������ ������������������������������

�������� ������������������������������� ��������

������ ���6��7�������

���������� ����������� ��� ���������

���� ���������������������������������������������

����� �������������������������������������������

�������������������������������������������

�����������282�!���������������������$����(LG?&

�������������������,,�T�����������������+��T�����

����������282���������� ����� ��������������

&������������*�,�W�������������������������

��������������� ��������1/�2���T�2B*����������

�������W���� ��� �������������@�����������X��*�����

�� ��"'&��&����*��� ���*���WQ���� ��0�������&�!03$

�"�#�������$�%���&�������� ������������

�'(�� ��������

)� ���

����

�$��

*��

����

�+�

�$���

*,��

����

��

���� �������!��� ������� � � � � �

�-��@�-�$

@

�-����-�$@ �-����-�$�

�,A*, � $ 43 *,,� 43

��A*, *�� 43 ,�� 43

�-��@�-� �

�-��@�-� �

@

�-���

�-� ��

�$A*, �(, �

- ! ��

�*�� �

- ! �� ��A*, *(� *�*�

�-�$@�-� �

�-�$>�-� �

@

�-�$�

�-� ��

�(A*, ��,

43

$*�� �

- ! �� � A*, � *���

6����!���������!� ������ ����������"���"� �������

����������� ������ ����������"���"� �������

4������%� �� "����943<

BC�D"�����E�����

������/��"���������������)����������� ������������������'G#R�� �A�����

Page 15: structure - function investigations on antiviral peptides

L. Vezenkov, M. Nikolova, I. Minchev

127

������������� �����)���-����2���������� ������

������� �������� ����� ���� �F�� ��� ������ ��

����@��� ��� ����� ���������� ���� ��������� ��

G8EQR23.+R����������������������*�,,,�234���23-

�������������������������������

H���������������� ���������������)������������

��������������������)�������������������K����"����29#

���(0#������������*��� ���������'G#R������������

���� �� ��� �� ���3�������� ������� ���� ,�,��T

G8EγR23.+R�234�������23-R���������������� ����

�������� ���� ��������������� ���������������

������������������������G��*D*����������!�/�T$������

�������������������������)����������������������������

����������������������G��4�T�����������������������

���234�����������������������������������23-�������

������������"'& �� ����� ���������������)���������

������������ ������ �� ���� � ��� ������� ����������

�� � �������������������������234R����23-R��

����� � ������ !��������� ���� ���� *��� ���*.��� ���� ���+�

�����������%���U�,�,�$��8������������������������)��

� ��������������������������������������� �������

������)��������������������������������������������

����������������������������23�., 23*/ �����������

���������������������������������� ��������������)

������!������4$���� �������������)���������������234����

��������'G#R����������������������������)������

���23�.,������ ���

8 ���� ������ ������������ ���� �)������� ��

23�.,������ �������������234������ �������������

���������� ��������� ������ �����������'G# �R

�������� ��������������������������������������

!'&&5�$�

������ ������ ����-��������� ��������������

�������'&&5������4�������������������������������

�����!O*+$�����������!O�.$����������&�������

��������������� ����������/���������?LSE�#&�L

�"� ������� �� ������� *� ,� �+�

�25���� �%� �16��������

F�- (@274G@�-�@1 ����

�#*, �#�� - ! ��

�C5 ���� �%� �16

��������

�#�, �#�� - ! ��

0)5���� �%� �16

��������

�#** �#�� - ! ��

�16������������� � #, ��#( - ! ��

6����� �% �������!����16

��H����

�-� �@�-�$>

F%����-�@1 ����

*�#,

��#,

43

�-� �@�-��@

��#$

��#�

43

�-����-�$@

�$#�

�,#�

43

�-� ���-�$�

��#(

*�#�

- ! ��

�-� ���-���

� #�

*�#

- ! ��

�-����-�$�

*$#*

*�#�

43

������4��2�������������������������������������!&$����� ��������!0$�������)������������

9�:���@������A�����;�B)������"�� ���

γ

Page 16: structure - function investigations on antiviral peptides

Journal of the University of Chemical Technology and Metallurgy, 47, 2, 2012

128

!K���// �4�$����������@������ ��������������������

����8������������ ��*1�� �� ���� ����������� ���

����������'G# ���������234��������������������������

��������������23�.,������ �����������������������

����������������������������������������������������

���� ����)����������G8EQ���"9E2������ ����

��������������� �����'G# �R�����������������������

��/K����������������������������������@������

23�.,��������������)�� ������ ������������������

23�.,��������������������������!��� 231-�G�9

�&�$����� �����0�������&��������������*��������

���������������������������������2�����������������

�.������������������@��������������������� ������

��������&���� ������������������������������������

(��&��� .���������/���� 0�����������/����

3��9F<

�#,�

7I�#����I�#$�

���9����<

�#,(

7I�#�,��I�# �

2�%� ����!������9����"�<

�#�(

12��!�3�- ! ��

�-���9 ����AG�<

- ! ��

7I*#���I�#��

56

9���.4� �����A��<

�#$,

7I�#����I�#(�

�16� �������9�-*��)�<

�#�(

7I�#(��I�#�(

�-� �@�169F<�

- ! ��

12� !�3��- ! ��

�-, @�169F<

�#�(

7I�#���I�#��

�-,$@�169F<

�#�(

7I�#*���I�#�,

������+��#���������� �������������������������������������������'&&5�Y�

Fig. 4. CD160+CD8high cells are rich in Granzyme B PMNC from HIV-1+ treatment-naive patients were stained with CD160/GranzymeB/CD8/CD28 The gating strategy is demonstrated on the dot-plot (A). The expression of Granzyme B wasanalyzed separately for CD160+CD8high (histogram B) and CD160-CD8high cells (histogram C). A representative example offive independent experiments is shown.

Page 17: structure - function investigations on antiviral peptides

L. Vezenkov, M. Nikolova, I. Minchev

129

���������������������������G8EQR23.+R234����

������

������������� ������������������������������

�������������������������K� ��&���O*+�����������

��� �����������������������������'&&5������K� �

0���O��.�����������������������������������

B � �� ���� ������� �� ������������ �������

�����������������23�.,R234������ ������������������

�����������!����*+�T�������* �.�T����������1�T�

���� ��=� �4�T�� ��U� ,�,,�$�23�.,R234����� � ����

��������������23-R���������� ������ ��������������

�����������&�� ����������������������������������

��������������������������������23�.,��)��������

234�����������������������������������������������

'&&5������������������������ �����!������+$��H�

���� ���������23�.,���������������������� �����

�������� ��������� ������ ������������������������

������������� ��� ��� ��������� �� �������'G#

�R����������������������������2�L�� �����������

8 ����������������������23�.,R234��������

��������������������������� �������@����0�!8����-$

��� ��� ��� �� � ����������� ������������ ��'G# �R

� �A�����

����������������)������������ � ���������234

������� ������� ��'L& &Y,*,�� ������� �������

��������������� ���������������'G# ����� �������

Fig. 5. The CD160+CD8high subset contains HIV-1 specific lymphocytes. (A) Correlation between percentage of CD8high cellssecreting IFNγ after stimulation with p17 Gag and percentage of CD160+CD8high cells. (B) Distribution of IFNγ + CD8high cellsbetween the CD160+ and CD160- subsets after stimulation with p17 Gag. Unstimulated or p17 Gag-stimulated PMNC werestained with a combination of CD160/IFNγ/CD8/CD69 mAbs and analyzed by flow cytometry. CD8high-gated lymphocytesare presented in the dot-plots. All stimulated CD8high cells expressing IFNγ co-expressed CD69. Percents of IFNγ+CD69+CD8high cells are indicated. An example representative of 10 different patients is shown.

Page 18: structure - function investigations on antiviral peptides

Journal of the University of Chemical Technology and Metallurgy, 47, 2, 2012

130

����������/K����"�����������K������������234����������

���������������������� �)����������23.+����G8EQ�

1.��������������������������K���������������� �����

� ��������������������������23.+R�G8EQR������

�������������,������1���T�����234����������������

!����,�4/�T$�G������������������������� �����

23�.,R�234����������������������������������������

����������G8EQR�23.+R�234������������!5�O�,�/*����U

,�,,,���8����-&$��8������������ ����������������������

� �������G8EQ������������������23�.,R����23�.,

�����������23.+R��234�����=����������������������

����� �������������������������������,�� ��������

������� �V���'G# ��� �A������B��������������*�T

!Z�*.$������������� ����������2�L������� �������

����23�.,R������� ��������� ������ �������*,� ��

�,,�T������������������������&��������������)�����

����������8����0�

8��������������������������2� ���� �����

��� ���23�.,������ �����������G8EQ���� ����

��������������/K����H��������������������������

�� ���� �������������23�.,��������� �����������

������� ��������������������������������������

��� ����)����������G8EQ���"9E2������ ����

��������������� �V���'G# �R�����������������������

��/K����������������������������������@������

23�.,� ���������&���� ��������� �������� ������

���� ��������� �������� ��� ���� ��������� ��� G8EQR

23.+R�234����� ������� &� ������������ �)������ ��

�������8�������H������23�.,��&������������

���������G8EQ��)�������!8�����&$�������������23�.,

�&�������������������������������������234����

��������������G8EQ��!8�����2$������������������/K��

�����!8�����0$��H���� �����"9E2����������������

��������������������������������G8EQ�R�23.+R

Fig. 6. Cross-linking of CD160 molecules augments the intracellular expression of IFNγ in response to p17 Gag stimulation.PMNC were incubated with anti-CD160 mAb alone (A), 5 µg/ml p17Gag peptide alone (B), or 5 µg/ml p17Gag in the presenceof anti CD160 mAb (C) for 16h. Brefeldin A was added at 2h of incubation. The cells were harvested, permeabilized andstained with a combination of IFNγ/CD69/CD4/CD8 mAbs as described in Material and Methods. CD8high-gated lymphocytesare presented on the dot-plots. Percentages of IFNγ+CD69+ CD8high cells are indicated. A representative experiment isshown on dot-plots (A) – (C). (D) Summarized results for eight different patients (mean ± SD).

Page 19: structure - function investigations on antiviral peptides

L. Vezenkov, M. Nikolova, I. Minchev

131

234����������������������������������/K�����������

*�4�Z���������4�4�Z���/������������������������������

�����������/K��D23�.,�&����� ����� ��������

������23�.,������ ������ ���� ����������G8EQ����

� ����� ��� �� � ������������ ���������� ��� ��� ���

��/K�� ����������25D231�������)�!8�����3$�

H������ �������������23�.,R234������ ����

������� ��� ������������������ � ������������� ��

��� �������������������������������������������

��������'G# ����������

DISCUSSION

&� ���� ��� �������� ����� ���� �������� ��

��������@��������������)�������������������������

� ������� ������� ��*-��� "��������� �� ����� �� �� �

���������234����������������������������23*/����23*4

����� ������������; ������������ �������������1

� ���������������� �������������23*/R23*4R�

23*/R23*4 ����23*/ 23*4 ���G�����������������

������������������������������������������������

���������� � ������������������������������������

�������������������������������������������������

������������� ����������G�����������������������

'G# �����������������)������������ ����������������

����23*/R23*4 �� ���������������������������

���� ��������������������������������� �������*���

?����� �������������������������������������������

������������ ������������)�����������; ������������

���� ������������������'G#�����������*.���B���������

�����23*/R��������������� ���'G#�����������������

�����������������������*/����������������� ���������

��������������������)��������������������������������

���������������������������������������������

H���� �������������������23�.,������ �������

��������234���������������������'G#���������

��� ���������� ��������������������������������

������)��������������*4���>������������ �A������'G#R

��������������������@�����������������)������

���23�.,������������������������������� ������

�������23*/R23*4R����������

&��������������������������������)������

���������������������������������������������)��

� ���������'G#R���������������������������������

�������������������������������������������������

����������� �������H������������������������������

����������������������������� ��������������D�

23-�&2��B������������������� ����������������23�.,

�)��������������������������������23-�&2��������

��� �������������������������������������������

�� ��������)����������23�.,���������������� ���� �

������ � ������������ ����23*/R�23*4 � ���23*/

23*4 �� �������9��������)���������23�.,R�� �

����������������������������������������������������

�����������������������������������������)���������

23�.,������ ��� ������� ��������� ���� ���������� ��

23*/R23*4 �234���������

G�� ��������� �����������������������������

��������� ���������23�.,������������'G# ��������

� �������������������������� ����������������� ����

��*+����� ��23�.,���������������)�������������

��������2�L������������23-����������������23*4

�)��������������� �������������������������� ��

�������������������������� �����������������������

��������������������� ��������������)����������� �

���������������23�.,� ���������� �������&��23�.,

������������������������������������ ����������9'2 G

����� ���� ��,4��� ������� ����������� � ����� �����

��������� ������ �� ���� ����������� �� ����9'2 G

�)���������D�����������)����������9'2 G���������

��������������������������������������������������

��,+�� ��,��� G�� ���� ������� ���� ����������� ����

����������������� ��������'G# ���������234R��

�����������������������������������������������

� �������� ����� ����� ; ���������� ��������� ���234

�������������������� ����������H��� ��������������

������ �������� ����� ����� ���� ���� ������������

�����������������������������������������)����

��������� ������ ��� ����� � ������� ���������� ? ��

����� ������ ���������� �����������������������

����������� ������������� ���������������23�.,

��������������������

G����� �����23�.,� �����234R�����������

��������������������������������������������

������������������ � �� ������������������������

�����������������'G# ����������

CONCLUSIONS

>����� ��������������������������������������

������� ��� � ����� �� �������� ��� ��������� ���K�

����������������� ����K� ����������������������

�����������������������������*-������ �����

��� ��� ��� ���������� ��; ����M L� "�� K� 2'B�

Page 20: structure - function investigations on antiviral peptides

Journal of the University of Chemical Technology and Metallurgy, 47, 2, 2012

132

�����������������@����������������������@����?���

��������������� ��������������������������������

���������������� ������������� ������������ �����

�� ���������������������������@����������������������

��������������������������������

G��� ����� ��� ���� ������ ������� ����� �

�������������������������)���� ��������2 ���� �

������������ �� ������������������� ��������� �����

��������� �� �� ���� � � �� ����������� ��� ��

������������������������������� �� ��������

&�����������*�������������������� �������"�

K� #�� L�� K� L������ ��������������� ������

������ ���� �������@��� ��� ������� ��� ��������

��������������������G��������������������������

������������������������)���� �������������� �����

������������������������������������������ ��

E���������������������������� �������

��������� ����'G#�� (0#� ���29#���������� ���

�������@������������ ��������������������������������

���������������������������� ���23-����234��

�������������8������������������������������ ��

��������� ���� �� ������������� ���������� ����� ���

�������@��� ��������� ��� ������� ��������� ��� ��������

������������������������������� ������ ���������

�����)���������������������23�.,�����234��

���������������� ������� ����������/��������

?LSE�#&�L�!K���// �4�$����������@������ ��������������

��������������������������������������������������

����������������������� �����������'G#R��������

���������������������������������������

REFERENCES

���9�C��#�����������(����� �����������������������

<9���@��7��+/+��2�1.,��!��5 ����$�

*��&�9�[�C����8��0����"��2�����������'�������

'�������E�\��C�������?�9��L�����"�3��9����&�2�

"��������� ��� ?���� ��� �K�� ?������� �+++�

"������������G�6#� ����)������?����������

��� ���� G���������2��������� �����)�������

#� ���7��(����#��5���������9��'��#���8� ; ��

2��9���0������3��'��L���2�������2��'���2�����(��0��

(�����9��C���L����?��9���9�������\���9����9��&��

9�K�����3�� \��� "�����2��5��� ���H�����5�0�

&��������"�����E�� S���=�?��3���������++.�

1��'�&��5�������&����������������������� ������

����� �����&�����2����2���������1������*,,,�

*.�=*/��

-��L�&��0�����'�2��L�������9�"��9 �� ����&�2�

"��������� 2�� 0����9�C�EA����� "����

��������������������� ���������������������

�� ������������� ��������������������\�#����

/��� *,,��� ��.*�=��.*+�

���3��K���������&��9�����(��0�������8��C�����K�

2���������"��������������������������������

�)��������������������� �����������&���������

����������������� ��������������������#����5���

1/�� *,,.�� ��=*1�

.��#�5��5����������B��� ������������������� �

�������������#�������1--��*,,.��+=�.�

/�� &�0�� ?����� 9�� 5���� &����@�� \�� &����@

&��@; �����H��"�����5�'��9���������G��?�������

9�&��C�����\�9��0�����\�?��5�����L���������������

������� ����������(����������������������� �@�

��������� ������ ������������������������

������������������������� �����\&9&��/1���+.,�

��*�=��*.�

4��&��5�����3�\��0��������3��9�����G�� �����FF�*,,,

G�� �����

+��9�'��?������(����� ������������3����������

���������?����"������G�����3�����1��*,,*��-,=

-/�

�,��?�2��0 ������&�E��8��@��������'���������&��&�

8���"���������/1��*,,.��*�.*=*�.4�

����&�����9��3��"������G���#�������(���3��2���;�

\����E�����5����G���� ����C����������>���������

L� ����9����������������,��0 1,,,�L� ���

0���� ��� ?��������� G�������� ��� "������ �

5����������9��������5�������5�������� *,,4�

H�����"����������G����� ���

�*��\�9��'������[�'��L���5��0����������\�9��'��������

9��2���������� ������������� �� ������������

�����*�+�]����� �����?��������**+���+4����1�4

�1.��

�1��9�K��5������� (��&���� \�H�� (������� (�&�

8����������������?� �� ������ ��������

������� ������ ����������������������������

����� �����E�� ���1�/���+4����-� ��1�

�-��9��L ���K��#�����K��C�����\��9����(��&�����

������ �� �����9����� ���������������� ����

?������ *1��� �+4/�� �4* �+��

����5��&�������(��8����3��?� �����K��8�)��3��5�������

8��0������������ ������������� �� ���������

�� �� ������������� �����*�+�]����� �����E�

Page 21: structure - function investigations on antiviral peptides

L. Vezenkov, M. Nikolova, I. Minchev

133

� ��� 11/�� �+4+�� /,+ /���

�.��?��C������\��?������9�?��2�������9�K��5������

3�2��"�������������������� �� ������ �����

��� �����������&�!'5#�&$��\��9����0������*�,�

�+4+�� +� ��*�

�/��5�&��K���� �3�\�� 8������ �5�?�� 8 A������ \�"�

G���������\�9��'���������� ������������� �

� �������������� ���"����E�����&�����?����>�?�&��

4+�� �++*�� *,.� *,.��

�4��9�K�� 5������� ���� ����� ����������� #���

G�� ����*���+4+���-1 �.��

�+��C���� ��E��?�����0L��5�������"K��L����K5�

&����2\��3���&\��(����(&��'������5��L��

\\��������H���?��&�����2H��H�����(��"�

������ �� �����������@�������������������

�)����������������� ��5E&��E�� ���*+����4�.�

�+4��� � �-/ ��1�

*,����9��#�����E��9��� ����9��2�����"������ ��*2

����� 8 ����� � ��� (����������� ���#���

5E&��\��#������/����++/��4/�+ 4/.��

*���9�\��B�����9�"��8�)��9�\��8������9�8�C ����K�3�

3�����9&��9�C������ G� ����� ��������� ���HGE

��/������������� ����� ������������ ��� ��

&��������&�����2����������*/��+4���441=44.�

**��K�3��3�����9�&��9�C������9�\��B�����#��&� �����

2�\��B������� ��!-�� 3����� * �)�@����$����)��

������� ���)�@������ G�������� ��� ������� �

��������\��9����2������*4���+4���+,.=�+�,�

*1��9�"��8�)��9�\��B�����H�\��?������9�&���9�C�����

"��������������� ������������ �� ������

���HGE���/������������������ ���&�������

&�����2���������1,���+4.����,=��.�

*-��K�3��3�����9�\��B�����&�9������ �������9�&

9�C������ 5�2�� B�������� (�K��9��������9�K�

5���������\��?������(����������������������

����� ��� ��� ����)���� �� ���� ��������� ��������

������� � ��� ����� � �-�� \��9���� 2�����

����+44�� �-,=�--�

*���K�3�3�����3��2 ���������5�2��B��������9�\��B����

\�"��9��������#��&� ������9�&��9�C�������?�

������������ �� �=����������� ���������������� �

���� ������������)�@������������� ����������

���\��9����2�������!���+4+��-�,=-���

*.��K�3��3�����3��2 ���������3�L�#��������\�"�9�������

��5�0�������E��#�������5�2�B����������\��E��@��\�

H��@���� #��K������3�2�� "������ 8�\��3 ����

&��������� ������������������@��������� ����

�������������)�����\��9����2�����������++1��1*-,=

1*�,�

*/��K�3��3�����3�L��#����������\��E��@����5��0������

9�&��L����E��#�������?��&��� ���3�2��"������8�\�

3 �����B)����@����� ��� ����� ������������ ������

����� �� ����� ��� ������� ��� ����)����

&������� ������������\��9����2������������++-�

*-*�=*-1.�

*4��9�K��H������K�3��3�����9�2��5������9�\��B�����8�\�

3 �����9�&�9�C������G��������������������������

���HGE��-+�-����������� ����� ������������ �

� ���&���������&�����2������������� �+4+�

*,.+=*,/-�

*+��L�&��2���� ����G��������&��������� �����������

�������������������� ��5E&��#���������$���+.4�

-,4=-�/�

1,���3��2�������\�L��9�������?� �����������������

�������������� ��������������� ��� ��������

������������ �� ����#���������$���+.���.�=/-�

1��0��L������H�8�����K��0��@ ��&��?�������� G

����� ��������� ��� ����������� ��� ������ �� ���� ��

� �������E�� ���������+.*��+/=+4�

1*��H�&��5���������\�5��3�����5�\��9�&������(�&�������

G�H��9�L���� \��K�\��3�)��� 8�9�� ?�������� \�

&������� ����������� �������?���������"�� �+.��

��4=��+�

11��9��C�����3��'����������'��M��������'�\�

(������0��E���� ?��@�������������� ��������

�������������'00����� ������������������

� +��������������������������������������*2�

\��K���#����������*,,,��4+�=+,��

1-��K��?������'�\��(������8��� ������ ���������*

!����� ����)���@��$��@�����@����������������

���������������������&��� ����������\��K���#�����

.�� !"�� �$���+4*�����=��-�

1����?�(��"�� ���3�2��3�������(�&��(�����(��H�����

K ����� ���������� ��������������� ���9�����

��������� ����������������������*2��\��#������$��

�+4.�� .14=.-.�

1.��(�2��'�����\���\�&��'�����3�2��3�L���

"������� ��� ������ �� ����� �������� ����

��)�������� ��&�.� ����� ������'2����)�������

� ����� ������@�����@������&�������5�����!���+4*�

11+=1-.�

1/���C��?� �����&�9��C����3��9�2�����\�H�E�����

H�5�� ?������ ?��8�����5����������� ��������

��������������������� ����� ������������ ��

Page 22: structure - function investigations on antiviral peptides

Journal of the University of Chemical Technology and Metallurgy, 47, 2, 2012

134

�� ����������� �� ��� ������ \��#������$��� �+4��

+*�=+*+�

14��3�L��2������&��C� ����"����������������� �� ���

���� ���������� ����� �����2����?����'�

���?������[ ����0������!����+.*���=**�

1+���K��?�������?� �� ���� ������������ �������

������� �����\��G�� �����������++,��*1 -/�

-,��"��?�����?��\��\��������L��E�A�����"������ ����

�������2 �������9���������G� �����������++,�

��� �44�

-���E�\��0�)����&��5���@���'�3��L�������?�(��?����������

&�9��'� ���������?����\�"��H�������?� �� �

����������������)�������� ��0-�*&����������

����@������������������������������������������

\��#������� ��*,,.���-��=�-.*�

-*��'�K��C� ��������(��H������#���������������&

5����0���������$����+44��/,�=/�-�

-1��2�C��L����(��H������"���������� ��������� ��

������� �������������(������������*&�� ��

������������������������������������������123���

�������� ����������#��������������+44��-,�=-�-�

--��0�&��9���������������������� 12�����������

2������� ����������� �� ����� ��������� ������

"�����?�����-���++����-1+=�--��

-���0��\��\����5�\��3��K� ���"�'��\�������0�(��"� �����

(�� #�����"������ ��������123� ��� ����������

������������������������������ ���������"�

��������\��K���#������.+�!"��/$���+44���.*/=�.1.�

-.��3�&��9���������H�H��?������5�&��8����0��2����

K�� 0 ����@���H�� ?������ \�(��#����������2�&�

\�����'�(��9�(�����2�L�K��������?� �� ����

� �������� ��12����������������������� ����

������������������5E& ����������������������

����������� ��������������2����//���++-��/.�=

//��

-/���9��&�������9�9��2�������0�&��9��������9�E�

\������"���������12�������������������������

����� ������� ��� ���������� ����� ����������

������E�� ���������++-��/*=/.�

-4��L�L��9��������&�0��H�����3�H��K������'�0��"������

\�\��&�����3�\��8������2�(��2������\�9��'�����

2�������� �� ������������ ��123��������#�����

��������������������� ��� ��� ����5E& ��

������5E&� ����������� \�� #������ ���� *,,/�

1�41=1�+.�

-+��H��K��3� �������0��L��?������()������������ �

������������������� ������������ �� �������

����������������� ����@������9���������5�����$��

�++1�� /4�=4**�

�,�� &�� (��K��������� �� #��9�� 0������ ��� &�� "�

3��������"������ ����������������� 12�� �

������������� ��������������������� �������

�������������������������������8(0?�L�������+-�

�+4.�� *�1=*�+�

����"��?���3���������?��(��H������5��(��0������?��&�

8 �����&��C��"������3��&��9���������2��&��L���

?��'��5��������� \�� "���� \�� ���9���������� (�� ?�

L������������ 5�� M�� �� \�� ������� 2�� (�� 8����9�

H��������\��H��9������5��&��8����(��L��0����?�

L��0������\��(��#��'���3��9��3�L���������?����

H������?� �� � �����������������������������

������������ ������������������� �������� �

12����������������������9����������������� �

� � ����������� ������\��9����2������-4���++4��*4,.=

*4�4�

��*��"��?���3���������?��(��H������5��(��0������?��&�

8 �����&��C��"�������3��&��9���������?��'��5�����

\�����9�������������\��"����5��M�� ��\���������(�

?��L���������������9��0��������9��H�����������L������

2��(��8����\��H��9������5��&��8����(��L��0���

?��L��0������3��9��3�L��������?�����H�����

?� �� � ������������� ���������� ��� ����������

���� ������������������� �������� ��12���

����������������*��"��������� �� � ����������� �

�����\��9����2������-����++4��*4�+=*41-�

��1��?�(��H������C��B�������L��L�������?�'���5�����

S�N���?�&��8 �����3�&��9���������5�&��L����

��8��'���������&�C��"�������\�H��9�����GGG�

5�&��8����(�L��0����2�(��8����?�L��0�����

?�(��H���������������� ��������� ��������� ��

� �������� ��12����������3���������������

��������������� �������������������� �� �����

�������"���� ���������������������������\��9���

2������ -��� �++4�� */4.=*4,��

�-��"�?��3���������5��M�� ��?�(��H��������\��"���

&�C��C�����C��B�����?�&��8 �����L�?��M�����

8�2��9���������(�L��0����\�H��9�����GGG��&�C�

"�������2�(��8����9�&��0�������?�L��0������3�&�

9���������5�&��8���� ?��� �H������ ?� �� �

�������������������� ��������������������

�������� ��12�������������������0������9���

2�����L�������,��*,,,��-�=-4�

Page 23: structure - function investigations on antiviral peptides

L. Vezenkov, M. Nikolova, I. Minchev

135

����"�?��3���������5��M�� ��?�(��H��������\��"���

?�'��5������?�(��C�������S��5 ���&�����������

����� ������������������������������� ��

���� �����������������������������������*,,���HB

,��,4+-�

�.��9��N����[�9��H����N��2����C��H����"�K��H���

? E������������ ��� ������ ��������� ��������� ��

� �������� ��12����������0������9����2����

L������ �� ��*,,,��*,+/=*�,,�

�/��"�?��3���������?�(��H��������\��"����5��M�� �

\����9����������\�K���������?�&��8 �����&�C�

"�������3�&�9���������2�(�8����(�L��0����?�L�

0������\�H��9�����GGG��5�&�8����?���H�����

?� �� � ������������ ��� ���������� ����������

� �������� ��12�����������������������

���E �������������������0������9����2�����L�����

+���+++��*�4+=*�+-������������������������

�4��3�&��9���������"�?��3���������?�(��H������?�&�

8 ����� &�C�� "������� L�?�� M������ ��8�

'���������5�&��L�������\��"����\����9���������

5��M�� ��\���������2�(��8����\�H��9������5�&�

8����(�L�0����?�L�0������9�&��0�������3�9�

3�L������?����H������?� �� � �����������������

�������� ����������������������������� ��

����� ��12���������������������������������

������������ ������������ ������������"����E����

&�����?����>?&��+.���+++����,,,=��,,/�

�+��C��9����������\�B� ������5��>�� ����?���������C�

'���������C����������� ���E��?������2�������

�����������������)�������� ��12���������������

������ �������!*$��G���������������"*����"-����

� ����0�������0����������0���������� ���++.����*4=

��*+�

.,��K��C�����&��H�������H�2��5 �������"������������

����������������� �������������(������0��������

!����++*���=�.�

.���9��K��2������������"��L�2��������? ��������

; ����������� ��� ����� ��12��������� ��

�������������������������\��0�����2������!�$���.�

�++,�� +,.* +,.��

�.*��!�$�"��?��3����������()����B�������������

����"�����������*��*,,����// �4-�

������!�$�[��9��H����"���������������������������

�������������������������������������������

����������"����3 ��5������*���+++���+/ *�+�

������!�$�[��9��H�����' �������� ��12��������

����������������������������()����B������

������ ����"�������4��+���++4������ ���.�

.1��G��?������������&��0�����B�������@�����������

���������� ������������G��"�����"������0�������

0��������5����2��� ���!���*���+./����/ .*�

.-��9�?��L������������G�����������12�2�������"�������

����"������������2 �������9����2������-�X�*�

*,,-�� �*1+ �*�1�

.���"�?��3��������������\��"����?� �� � 0�����3�

�����?������������0����������(��� ��������G����

�����' ���5����� ��12�"������� G��������� 4�

"��������������B�����@��������B�����0�����������

* "����� 2�������"���������������� \��9���

2������"���*,,1��-�/* -�4��

..��[�9��H����"���������������������������������

�����������������������������������������

�������"����3 ���5�����$!���+++���+/ *�+�

./��G��9��������?��#�����������L��#�@������&��0�A���

#��9� ������L��E�������� K������#�����������9�

2@� @����&��K��������3������?�����������0��

��������(��� ��������&������������"���� 2�

������"����������������"�����^�"�������L��

������"��+��*,,/��+�/ +**�

.4��&��K���� ���3���2���������"������E��9��������

�+/-��("��41X�.��� �++-�

.+��E��3�������&��0�A����3��S������?��#�����������G�

E���������?���������&� �����)���������&�������

&�����������E���3�������������"������&�������

"����@���������*,,.��./, ./-�

/,��&��0�A����X?��#�����������X"��"��������6E���"�

����'���@����?������@������(��� �����G�#���

���"��������� ��� ���������7��L��������3 ��3�

����^�3���������.�X/��*,,+���,4 ��/�

/���&��9��������("��41�.����++-�

/*�� &�� 0�A���� ?�� #����������� &�� E������ 6E��

���������)���������@������������������� �

��� �����������7��\� ������>����2����������

9��������NNN#___��*,,1��*.1 *.4�

/1��&��0�A����3�S������?��#�����������?����������

��������� ����������� ��� ��������� ���������

��� ������������������& ��������GF>�������

���?�����6?���C���B������7 �8�� �������2����������

*�� *,,-�� *.1 *.4�

/-��&��0�A����?��#�����������3��S������"��"������6E�

������������ ������������ �������������

���������������������������������������

Page 24: structure - function investigations on antiviral peptides

Journal of the University of Chemical Technology and Metallurgy, 47, 2, 2012

136

���7��\��>����2�������������9����!?����$������-�

*,,-�� 1/1 1+,�

/���\��H���?����?�� ������\��&���2�����?�������$��+�

�++1�� 1-,/�

/.��\��&��'��L������\��H�' ���������������L�����

1.��+���++����-,�

//��&�?��K��������L���E����������M��E�� �������2��

$��� + �,�� �++4�� 441 44/�

/4����&��G�����������9���������M��E�� �������2����$!�

/ 4�� �++/�� ��. �*��

/+��"�3���(��������3�\���H�������3�H��&���������9�H�

3������\��9���2�����������++����/�

4,��"�3��(�������(�8��9�����\��#�A������������"�&�

� �������3�&���&������0��K������&��?��������\�

&���2�����?�������"���++*����4�-�

4����G��9�������L������#�@������L�L��#�@������9�

"�������9 ������ ������������������������������

��������������������������0�������������� ����

����� �� � ����������������������!(�������"��&�

2����������(��9����� M� ����K��E��"�"�������

���� ���'��������� ������������������������*,,4�

1,/ 1�*�� *,,4����������� G?0E�� +/4 +., /.*,

1* 1�

4*��G��9�������3��3�������L��#�@������L��E��������

K������&��K��������&�������������������K�

�������� �������� ��������� ���� ?""?� ��

K� !B'$ � B&�����G���\��"�����5��������������*,�,�

*11 *14�

41��5�����C����@�����2�����������'�����������2���

����������+4-��-.+ -+4�

4-��9��K��������5�����G����@�������0�@�����@���

?���������&��������"������++/�

4���(�K��0����5���E���������C���0������� ����

C� ���&��������"������++4�

4.��&�8��"�@�������� � �������'����������� ��L���� ��

?��������\���H�����^�?�����++/�

4/����L�K���������'�����������2�������������0��������

�+4�� G?0E�, �4* ,�-*� *�

44��C��&���� ?������� ?��0������� \��#��������$ �

�+4-�� +**�

4+��\��9��������?��\ ������#��������!�"�����*,,���1��

�1 �G���E��9��������L����#�@������L�E�������� K�����

9��G��2@� @��&��?��K��������E�������� ������"�

K� #�� L�� K� L���� ?� �� � ��������� �� �����

0 ����2�����2��� ����������*,,.���/ �+�

+���G��E��9�������L�����#�@������L��E�������� K����

���&��?��K��������E���������������)���������"�

K� #�� L�� K� L����3������ ���������������

�����������������������������������*4 ���( ����

"�������?������ ��!(�������9��8�������9��8�����

2��K�������\��?������$��"��������*,,-����-�

��-.�

+*��5�&�H�����L����G�\�9�����0�����L�(��K�������

' ���234R��������������������������������

�� �����E�� ��G�� �����1��*,,1��+1��=�+1+�

+1��L��9 �����\��' ���������?�����������?�����L��2����

9��\��9�(������2�����)�� � ����� �������������

���������������������������������� �����

� ������������� �������������������E��(����\�

9�����������++/���*./ �*/-�

+-�� ?�L�� 5����� \����� ���3����C�5�� 8������ \�

C������"��C� ����'��E����������0��������C�

&�������� \�� B� ���� (�� E� ���� \�� 0������ C�?�

9��3������&��\��9�9��������8��&��"� �����2�

����)��������������������� ���������������'G#

�����������'G# �������������� ������E�������\�

2����G�������� !���++4���/�4 �/.��

+������9������5��?��������2��?������9��2�����'�2�

L����9�&�9�����&������������������� 234

�����������������������������������������

��� �������� �����D� ��� ��� ����������� ��

��� ������������������������ ������; ���

\��#�������!���++4���.-� ��.+�

�+.��\�(��?�����@��9�\��C �����?��?�����K��?����������

9�&��?�����9�&��L������"��5��@��C����� 5��@�

9��3��������� 0�\�� ?������� \��K�������9�&�

8�����3�2��9���������(�"��5������E�L��L�����

C�&��5������2��������������������������

� ������������� �������������234R�������

�������?�������!�����+++��4�/ �4.,�

+/��8��0 ������9��8������?��K������9�L��K� ����

S��5�������3 ���� ����������� ������ �����

�������� ��!'G#$ ���������������)���� ����������

������������������'G#�������������������������

����������������������'G# ��������23-R�������

#��������!!$���++.��*-4 *�1�

+4��B�B��S����0�3��H������234R������� ��� ��

��� ����������� �� �� ����� G� ������������� ��

���������������������������������������������

�����&����G�� ����������++/��*/1 1���

++��&�\��9�9��������?�L��5����� \�����2��� ������ �

�����������'G#��E�� ���"� ��*,,���+4, +4/�

�,,��B�B��S����H������������������`����F������������

'G# ���������������G�� �����!"��*,,1��./ /*�

Page 25: structure - function investigations on antiviral peptides

L. Vezenkov, M. Nikolova, I. Minchev

137

�,���2��0�����0�H����������������������������

'G# �� ��������� ������������ ��� ������������

�������2 ��B���G�� ����������+++��-�� �-�+�

�,*��K�\��E������2����������������� �����������

��������������&G3?���������E�� ��-�,��*,,��

�,,* �,,/�

�,1��9��&@ ���� \�'��"���������L�L��L�����23*4 ��

�������������&����������� ����������������

\��G�� ������$ ���++1����-/ ���+�

�,-��3�� ���0������ ?��C��������9�'�� ���B����3�

'�����8��9��������8��������� ����������

���� ��������������234R�� �������� ������23*/

����������������� ��������G�� �����!���*,,*�

�4. �+��

�,��� 8�� ?��� �����3�� L�����5�� 8�����9�� L�����&�

L�@��������������� �����������������������

���������������������������������������������

� �������E�� ���" ����+++��/,4� /�*�

�,.��3��'������"��&��0�����9��'��5����0��'�������

?��5��C����� K�����9��5��C�����5��&��#��L���

"������������� ������������������������

������������ ���234R����������\��()���9����

����� �++/�� �-,/ �-�4�

�,/��9��9������������"�2��0���������(���������

������������)����������23-���������������

� ������������ ����������������������

����)������������� ���234�������2�L���

�����������)�����23-�5B�!>2'L�$���\��G�� ����

����� *,,���.�.� �.�/,�

�,4��9�\��"��������3�(��?�������3��#�������\�2��2�������

"��5������2 ������������������������������ �

���� ��� ������ ������234R����������������

��������� ����� 23�.� � ����� �)�������� \�

G�� �������"��*,,,����-4 ���*�

�,+��9�"�H�������9�5��H������C��9�����5��'�����

\�K��?�������&�\��2����������L�����������)��

��������� ����� � ���������������������)����

����������������������23�/R�23*4 �234R��

�������� ��������G�� ������������+++���--1 --+�

��,�\�9��0���������E�\��C��������9�5��0������3�5�

&���@����0�\��'�����L�(��2������\�"��2���@@���\�

C �� ��?�&��9�� ������9��2�����9��5������

3�2��3� ����5��&��C� ���()����������23�/���

����� ����������� ����������������� �� ���

�������������������234R����������0������� ���*,,1�

*/�� � */*,�

������3�(��?�������9��2������9��&��� ���9��2�����

9�\��"�������"��0������3��#�������"��K ���� ����3�

L������\�2��2��������"��5�������������������

�������*0-�����)������������������ ���234R

����������������������������\��G�� ����������*,,��

.�.� .�/,�

��*��"�&�0�����L�9��5������3��2� ����\�'��L� ����0�

'����������H��C �A����� ?�9��L����5�&��#�

L����2�����������������������)��������������

����� �� ����������������������� �����234R

23-�5&R�23*/ �� ������������ \�� G�� ����

��$�� *,,,�� �+�, �+�/�

��1��C��8 ������S��?������'������������?��B����9�

����� �����8 ��������)����������������������

�������225������ ��������� ��������������

�����������234R����������\��G�� ����������*,,*�

***� **1*�

��-��K��9 �����9��L�����?������ ��������������

�������������������225/����2N25����������

����������������9������ �������� ��*,,1��1*�

11-�

�����&��0�� �����(��K� ������ ?�(���9�������#�

?��������G K��9�� ��\��3� ������L��0� ������

(�3��2���������0S����&�������������������

��� ���� ������ ������������ �����������

�������� ����� � ��������������� ������)��� ���������

"����E�����&�����?����>?&�+����++-��+�1.� �+�-,�

��.��&��& �������&��0�� �����L��0� �������&�3�

2������5�?��0� ������?�3��#�����&����"������9�\�

5��������L�9��E������K�\��8������2����

���0S�����������G��� ����������������)������

��EC��������2�L������������������������������

����������\���G�� �����������++4��*/4,� �*/+,�

��/��9��E���������L��0� �������&��0�� �����()���

������� ����9'2������� G��������������0S��

����������234��������������������������� ����

�������������������������������������������

�����3��9�����"��&����&��0�� �����2��0 �������

2��2�����(��2�����9��3��'����� ?��K������9�

'������3��'�����#��'��A����S��\�����?��9� ��

\��9��������5�� ?�����@ &����@�� ?�� ?�����3�

?�������L��� ���9��>� �������(��������?������

(��#���������'��M����!(���$�L� �������������#GG�

H�����2����3������������&�������B)����>���

"������B)�����*,,*��.41 .4.�

��4��'���������������9��� ����9������� �����3����

������������ ���234!R$��������������������

��������D������������������\��G�� ���������

Page 26: structure - function investigations on antiviral peptides

Journal of the University of Chemical Technology and Metallurgy, 47, 2, 2012

138

*,,*�� ��14 ���,�

��+��?��&�������\��9�; ����K�\��8������&��������

"�L��0� ��������"��5�����H��0������K��B����L�

0� �������&��0�� �����2 �����������9'2������

G������������������������� ������������� ����

������������������������������� ������������\�

G�� �����.*���+++���**1�=�**.�

�*,��9��E���������&��9��� 2������L��0� �������&�

0�� �����0S��D23�.,�������� ����������25

���������� ��������� ������ ������������)��

���������������������� ������������23*4��)���

�����G���G�� ������"��*,,*��--�� �-���

�*���&��0�� �����2��5������#��?��������3��0��� ���

K��L�����L��0� �������?�������������������

���'G#�������������� �; ��� ��������231R234R

"0L����������2�L�����������"����E�����&�����?���

>?&��� ���++1��+-*/ +-1,�

�**��9��9 ��������9��E���������L��#�@������C��C������

&��9�������&��0�� �����L��0� �������'���������

������ ���� ����������� ����23��.,���������

������������'G#��R��������������������������

� ��������������)�������������"����� G���"������

3������!��*��*,,-��*, *1�

�*1��8�������K�0���5�L��E������?���������������������

������� ����@���+ �� ���������)������������

�������G���\��"�����"�����5������$���++,���.� �/-�

�*-��5�&�H����L����G�\�9�����0������L�(��K�������

' ���234R�������������������������������

����� �����E�� ��G�� �������1��*,,1���+1��

�*���#��&������"�5�3 ����9��2�������������9����

234R��������������������������������������

������������������� ������������E�� ��9���

�����4��*,,*��1/+�

�*.��"��2����������������?��������� �������������

'G# ���������234�����������������E�� ���"� �

*,,��� �,. ����

�*/��#�&������(������3��������������������������

'G#����������\��G�� ����������*,,*��1.., 1...�

�*4��9�&�E����������L��-19��� 2������L��0� ������

&�0�� �����0S��D23�.,�������� ����������25

���������� ��������� ������ ������������)��

���������������������� ������������23*4��)���

�����G����G�� ��������-��*,,*X��--��

�*+��9�'��E���������9�E���9 ��������'�0����������C�

C�������L��#�@������&��9�������L��0� �������&�

0�� ���������23��.,R�234�����������)���������

� �����������������������������'&&5����'G#

R����������2�����G�� ��������!����*,,���+. �,��