TREE OF LIFE WEB PROJECTEl Sistema de los Tres Dominios es una forma de clasificación evolutiva, que se basa en las diferencias que se han encontrado en las secuencias de nucleótidos en los ribosomas, así como en el ARN de transferencia de la celular, la estructura celular y de los lípidos, etcétera.

Propone que un ‘ancestro’, una célula antepasada común también llamado progenote, dio cabida a tres tipos diferente de célula, cada una representaría un dominio. Los tres dominios son Archaea (arqueobacterias), Eubacteria (bacterias ‘de verdad’), y Eukarya (eucariotas).

Se enfocará exclusivamente en el dominio Eubacteria, que también es conocido sólo como Bacteria. Éstos son microorganismos procariontes, es decir, de organización muy sencilla, pequeño tamaño (1-10 micrómetros) y de estructura unicelular.

Dentro de este dominio se encuentran muchas ramas evolutivas:

Aquificae (acuíficas) Viven en ambientes calientes, como manantiales terrestres calientes. Son quimilitoautótrofos fijadores primarios del carbono. Los géneros Aquife, Calderobacterium, Hydrogenobacter, Thermocrinis, Hydroogenothermus, Persephonella, Sulfurihydrogenibium, Balnearium, Desulfurobacterium y Thermovibrio pertenecen a este filo.

Thermotogae (termótogas) Son termófilos o hipertermófilos cuyas células se envuelven en una membrana exterior adicional. Anaerobios que metabolizan carbohidratos. Reduce cistina y tiosulfato a sulfuro de hidrógeno. Los géneros Thermotonga, Fervidobacterium, Geotoga, Marinitoga, Petrotoga y Thermosipho pertenecen a este filo.

Thermodesulfobacteria (termodesulfobacterias) Grupo de termófilas anaerobias reductoras de sulfato. Unen lípidos con glicerol. Los géneros Thermodesulfobacterium y Thermodesulfatator pertenecen a este filo.

Chrysiogenetes (crisiogenetas) Son anaerobias. Representadas ppalmente por Chrysiogenes arsenatis, que en vez de respirar oxígeno, respira arseniato (la forma oxidada del arsénico) y usa acetato como donante de electrones.

Nitrospira Grupo de gram negativas, son nitro-oxidantes. Los géneros Nitospira, Leptospirilum, Magnetobacterium y Thermodesulfovibrio pertenecen a este filo.

Deferribacteres (ferrobacterias) Son bacilos acuáticos, móviles y anaerobios. Tienen metabolismo variado pero por lo general reducen hierro lll. Habitan en aguas termales. Los géneros Deferribacter, Denitrovibrio, Flexistipes, Geovibrio, Synergistes y Caldithrix pertenecen a este filo.

Chloroflexi Son filamentosas y poseen una sola membrana celular (monodérmicas), su pared externa de peptidoglicano es muy delgada. Forman colonias encerradas en evolturas filamentosas, muchas son termófilas. Los géneros Chloroflexus, Chloronema, Heliothrix, Roseiflexus, Oscilochloris, Herpetosiphon, Anaerolinea y Caldilinea pertenecen a este filo.

Thermomicrobia (termomicribios) Son termófilas aerobias Gram positivas o negativas. Los géneros Thermomicrobium roseum y Thermomicrobium fosteri pertenecen a este filo.

Fibrobacteres (fibrobacterias) Incluyen muchas de las bacterias estomacales que permiten la degradación de la celulosa a los rumiantes. El género Fibrobacter succiogenes pertenece a este filo, que a su vez deriva a los Fibrobacter succiongenes succiongenes, Fibrobacter succiongenes alongatus y Fibrobacter intestinalis.

Progenote

Eubacteria

Eucaria

Arquea

Proteobacterias Uno de los ppales. grupos de bacteruas. Incluyen una variedad de patógenos y otras más de vida libre. Tienen una pared celular formada principalmente de lipopolisacáridos y su morfología es muy variable, desde bacilos hasta cocos simples. Algunos tienen flagelos. Los géneros Alpha proteobacteria, Beta proteobacteria, Gamma proteobacteria, Delta proteobacteria y Epsilon proteobacteria pertenecen a este filo.

Planctomycetes (planctomicetos) Son acuáticas, flageladas, con al menos una fase móvil. Son encontradas en agua dulce, salobre y marina. Tienen forma ovoide o esférica debido a la ausencia de pared celular. Los géneros Gemmata Isosphera y Pirellula pertenecen a este filo.

Chlamydiae (clamidias) Son endosimbiontes o patógenos intracelulares obligados. Muchas de estas bacterias coexisten en sus hospedadores específicos cuyo estado asintomático, se cree, proporciona un reservorio natural para estas bacterias. Infectan células eucariotas. Los géneros Chlamydopjila, Neochlamydia, Parachlamydia, Rhabdochlamydia, Simkania y Waddlia pertenecen a este filo.

Spirochaetes (espiroquetas) Sus célula es alargada y enrollada helicoidalmente. Poseen una membrana externa formada por múltiples capas (vaina externa) que rodea completamente el cilindro protoplasmático. Cuentan con unos flagelos especializados denomidados ‘filamentos axiales’ situados entre la envoltura celular y el cilindro protoplasmático que producen un movimiento giratorio. Pueden tener 3 tipos de movimiento: en medio líquido, rotación alrededor de su eje, contracciones flexulosas y movimiento helicoidal. Los géneros pertenecientes a este filo son Borrelia, Brachyspira, Brevinema, Clevelandina, Cristispira, Diplocalyx, Hollandina, Leptonema, Leptospira, Pillotina, Serpulina y Treponema.

Bacteroidetes Son anaerobias, tienen amplia distribución en el medio ambiente,incluyendo suelo, sedimentos, agua de mar y hasta en el tracto digestivo de animales. Los géneros Acetofilamentum, Acetomicrobium, Acetothermus, Alistipes, Anaerophaga, Anaerorhabdus, Bacteroides, Belliella, Dysgonomonas, Marinilabilia, Megamonas, Porphyromonas, Prevotella, Rikenella, Tannerella, Aequorivita, Arenibacter, Bergeyella, Blattabacterium, Capnocytophaga, Cellulophaga, Chitinophaga, Chryseobacterium, Coenonia, Crenothrix, Croceibacter, Cyclobacterium, Cytophaga, Dyadobacter,, Empedobacter, Flammeovirga, Flavobacterium, Flectobacillus, Flexibacter, Flexithrix, Gelidibacter, Gillisia, Haliscomenobacter, Hongiella, Hymenobacter, Lewinella, Meniscus, Mesonia, Microscilla, Muricauda, Myroides, Ornithobacterium, Pedobacter,, Persicobacter,,,, Polaribacter, Psychroflexus, Psychroserpens, Reichenbachia, Rhodothermus, Riemerella, Runella, Salegentibacter, Salinibacter, Saprospira, Sphingobacterium, Spirosoma, Sporocytophaga, Tenacibaculum, Thermonema, Toxothrix, Weeksella y Zobellia.

Chlorobi Son conocidas como bacterias verdes del azufre, las cuales realizan la fotosíntesis anoxigénica. Se encuentran en zonas anaerobias de los lagos. Los géneros Chlorobium, Ancalochloris, Chlorobaculum, Chloroherpeton, Pelodictyon y Prosthecocloris perteneces a este filo.

Actinobacteria (actinomicetos) Son gram positivas. La mayoría de ellas se encuentra en la tierra e incluyen algunas de las más típicas formas de vida terrestre, jugando u rol importante en la descomposición de materia orgánica, tales como la celulosa y quitina. Renuevan las reservas de nutrientes en la tierra. Hay otras más que habitan en las plantas y animales, incluyendo algunos patógenos. Algunas forman filamentos ramificados que se asemejan a los micelios de los no relacionados fungi. La mayoría son aerobias. Los géneros Acidiicrobiales, Actinomycetales, Coriobacteriales, Rubrobacteriales y Bifidobacteriales perteneces a este filo.

Deinococcus-thermus (hadobacteria) Son anaerobias, con una pared celular muy gruesa, pero incluyen dos membranas. Se dividen en varios grupos: *Deinococcus: Deinococcus radiodurans, Deinococcus geothermalis, Deinococcus grandis, Deinococcus indicus, Deinococcus murrayi, Deinococcus proteolyticus, Deinococcus radiopugnans*Thermus: Thermus aquaticus, Thermus antranikianii, Thermus brockianus, Thermus filiformis, Thermus igniterrae, Thermus oshimai, Thermus scotoductus, Thermus thermophilus*Marinithermus hydrothermalis: Meiothermus, Meiothermus ruber, Meiothermus cerbereus, Meiothermus chliarophilus, Meiothermus silvanus, Meiothermus taiwanensis*Oceanithermus profundus*Vulcanithermus mediatlanticus

Cyanobacteria (cianobacyerias) Comprende a las bacterias capaces de realizar fotosíntesis oxigénica. Son los únicos procariontes que llevan a cabo este tipo de fotosíntesis, por ello tambiñen se les llamo oxifotobacterias. Los plastos son sus ‘descendientes’ por endosimbiosis. Tienen cinco subsecciones:

*Subseccion I: Chamaesiphon, Chroococcus, Cyanobacterium, Cyanobium, Cyanothece, Dactylococcopsis, Gloeobacter, Gloeocapsa, Gloeothece, Microcystis, Prochlorococcus, Prochloron, Synechococcus, Synechocystis.*Subseccion II: Cyanocystis, Dermocarpella, Stanieria, Xenococcus, Chroococcidiopsis, Myxosarcina, Pleurocapsa.

*Subseccion III: Arthrospira, Borzia, Crinalium, Geitlerinema, Halospirulina, Leptolyngbya, Limnothrix, Lyngbya, Microcoleus, Oscillatoria, Planktothrix, Prochlorothrix, Pseudanabaena, Spirulina, Starria, Symploca, Trichodesmium, Tychonema.*Subseccion IV: Anabaena, Anabaenopsis, Aphanizomenon, Calothrix, Cyanospira, Cylindrospermopsis, Cylindrospermum, Nodularia, Nostoc, Rivularia, Scytonema, Tolypothrix.*Subseccion V: Chlorogloeopsis, Fischerella, Geitleria, Iyengariella, Nostochopsis, Stigonema

Firmicutes (endobacteria) Tienen una estrcutura celular Gram positiva (la mayoría), este grupo se ha restringido a bacterias base de formas relacionadas, llamado grupo de contenido GC bajo, en contraposición con la actinobacteria que tiene GC alto. Tienen forma de bacilo y a veces de coco. Muchos producen endosporas, para sobrevivir en condiciones extremas. Se encuentran en diversos hábitats e incluyen algunos patógenos notables. Los géneros Clostridia, Mollicutes y Bacilli pertenecen a este filo.

Fusobacteria Son anaerobias obligadas con lipopolisacáridos. Son bacilos que se encuentran como comensales o patógenos. Los géneros Fusobacterium, Ilyobacter, Leptotrichia, Propionigenium, Sebaldella, Streptobacillus, Sneathia y Cetobacterium ceti pertenecen a este filo.

Verrucomicrobia Contiene sólo unas pocas especues, han sido encontradas en agua dulce, del suelo, agua de mar y heces humanas. Algunas se han encontrado en asociación con huéspedes eucariotas, incluyendo protistas y nematodos.Se sugiere que muchas de éstas son abundantes e importantes para el medio ambiente. Los géneros Opitutus, Prosthecobacter, Verrucomicrobium, Victivallis y Xiphinematobacter pertencen a este filo.

Acidobacteria Sus miembros son fisiológicamente diversos, siendo algunos de ellos acidófilos, es común en suelos. Los géneros Acidobacterium capsulatum, Geothrix fermentans y Holophaga foetida pertenecen a este filo.

Dictyoglomi Carcterizado por ser hipertermófilo, quimioorganotrofo y anaerobio. Tienen una pared de tres capas. Los géneros Dictyoglomus thermophilum y Dictyoglomus turgidum pertenecen a este filo.

Gemmatiomonadetes El primer miembro de este grupo fue descubierto en 2003 e el fandgo de un sistema de tratamiento de aguas residuales. Tiene forma de bacilo, es aerobio y parece replicarse por gemación. Otras especies de este filo no se han catalogado aún. No contienen DAP en su envoltura celular. El género Gemmatiomonas aurantiaca pertenece a este filo.

BIBLIOGRAFÍA Y MESOGRAFÍA:

Un mundo de bacterias / México, D.F. : UNAM, Campus Morelos, Instituto de Biotecnología, 2014 Tree of Life Web Project, consultado 3/sept/2015:

http://tolweb.org/Life_on_Earth/1

http://tolweb.org/Eubacteria/2