Übung 11 – genregulation bei prokaryoten · trp selbst inhibiert das erste enzym der trp...
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Übung 11 – Genregulation bei ProkaryotenÜbung 11 Genregulation bei Prokaryoten
Konzepte:Konzepte:
Entwicklungs‐/gewebespezifische Genexpression
Coexpression funktional überlappender Gene
Entwicklungs /gewebespezifische Genexpression
Positive Genregulation
Negative Genregulation
cis‐/trans‐Regulation
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1. Auf welchen Ebenen kann Genregulation stattfinden?
Definition Genregulation:Die Kontrolle eines Gentranskripts und seines Genproduktes.
Transkription Translation
TranskriptTranskript
DNA StrukturDNA Struktur
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2. Was versteht man unter einem Operon?
Definition Operon:e o Ope oEinheit aus Promotor, Operator und codierenden Sequenzen von zwei oder mehr Genen.
Beispiel lac Operon:
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3. Erklären Sie die positive und negative Regulation des lac‐Operons. Welchen Einfluß hat die Glucosekonzentration auf die Expression?
CAP‐cAMP Systembhä i labhängig von Glucose
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4. Woran bindet der lac‐Repressor?a) Lactose und DNAb) RNA‐Polymerasec) RNA‐Polymerase und DNAd) β‐Galactosidase, Permease und Transacetylase.e) Promotor und Lactose
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5. Der Repressor IS kann keinen Induktor binden, da die Bindestelle defekt ist. Wie wird das lac‐Operon in einer Zelle exprimiert, die sowohl I als auch IS enthält?
E. coli ist haploid Voraussetzung für 2
Allele von I ist Diploidief dfür dieses Gen!
Is Mutanten reagieren nicht auf den Induktor konstitutive Bdg. Des
Das I Gen reguliert die Synthese des
Repressormoleküls R
Die Anwesenheit des Repressors I+ ist
d i t üb di
Repressors auf dem Operator
Das Repressormolekül R löst sich durch Binden
dominant über die Abwesenheit des Repressors I‐
I+/Is Zellen Kompetetive Reaktion
zwischen WT Repressor Rlöst sich durch Binden des Induktors vom Operator mRNA
zwischen WT Repressor R und mutantem Repressor
RsStatistisch max. 1 Runde Transkr. d. betr. Operons
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6. Wie wird das lac‐Operon bei a) hohem und b) niedrigem Glucosespiegel exprimiert?
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7. Was versteht man unter Attenuation?
Arten der Regulation des Tryptophan Operons:1. Trp Repressor bindet nur an den Operator, wenn er selbst an Trp gebunden ist
Trp = Induktor aber Funktion gegensätzlich zum lac Operonp g g p
2. Trp selbst inhibiert das erste Enzym der Trp Biosynthesenegative Feedback‐Inhibierung
Repressives System in dem Überschuss eines Produktes (Trp) zum Abschalten der Enzyme führt, die dieses Produkt synthetisieren
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Weiteres Level der Regulation wurde durch trpR‐ (Repressor Locus abwesend)Weiteres Level der Regulation wurde durch trpR (Repressor Locus abwesend) Mutanten bekannt: ‐ trpR‐ Mutanten produzieren auch in Anwesenheit von Trp weiterhin Trp mRNA
kRepressor inaktivwenn diese Mutanten auf Medium ohne Trp transferiert werden, produzieren sie auf einmal 10X mehr Trp mRNAda Repressor inaktiv kann das nicht mit normaler Derepression des Operators durch die Abwesenheit von Trp erklärt werden
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trpR‐ Mutanten mit konstitutiver Trp mRNA Synthese weisen Deletion in Region 4 der Leadersequenz auf (Doppelmutante)Sek ndärstr kt r ischen Regionen 3 nd 4 kann nicht entstehenSekundärstruktur zwischen Regionen 3 und 4 kann nicht entstehen kein Transkriptions‐Terminierungs‐Loop komplettes Operon wird transkribiert
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8. Was ist gemeint?a) Dieses Molekül akkumuliert im Cytoplasma der Bakterien bei niedrigem
Glucosespiegel Es ist essentiell für das Signal der KatabolitrepressionGlucosespiegel. Es ist essentiell für das Signal der Katabolitrepression. b) Dieses regulatorische Protein bindet an cAMP und stimuliert die Bindung der RNA‐
Polymerase an den Promotor des lac‐Operons.c) Dieser Begriff beschreibt den Effekt genetischer Elemente auf andere Elemente wennc) Dieser Begriff beschreibt den Effekt genetischer Elemente auf andere Elemente, wenn
sie benachbart zu diesen liegen. Z.B. hat ein Operator diesen Effekt auf die nachfolgen‐den Gene.
d) Ein Umweltmolekül welches die Transkription eines Operons aktiviertd) Ein Umweltmolekül, welches die Transkription eines Operons aktiviert. e) Eine Region eines Operons, die dem Repressor die Bindung ermöglicht. f) Ein Set von Genen, deren RNA in einem Molekül synthetisiert wird. g) Dieser Begriff beschreibt die Beschleunigung/Aktivierung von Transkription, wie z.B. g) g g g/ g p ,
durch cAMP‐CAP.h) Dieser Begriff bezeichnet ein Protein, welches an den Operator bindet. i) Regulation durch Faktoren, die die Transkription verhindern.j) Genregion, an welcher die RNA‐Polymerase bindet, um die Transkription zu starten.
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8. Was ist gemeint?a) Dieses Molekül akkumuliert im Cytoplasma der Bakterien bei niedrigem
Glucosespiegel Es ist essentiell für das Signal der KatabolitrepressionGlucosespiegel. Es ist essentiell für das Signal der Katabolitrepression.
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8. Was ist gemeint?b) Dieses regulatorische Protein bindet an cAMP und stimuliert die Bindung der RNA‐
Polymerase an den Promotor des lac OperonsPolymerase an den Promotor des lac‐Operons.
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8. Was ist gemeint?c) Dieser Begriff beschreibt den Effekt genetischer Elemente auf andere Elemente, wenn
sie benachbart zu diesen liegen Z B hat ein Operator diesen Effekt auf die nachfolgensie benachbart zu diesen liegen. Z.B. hat ein Operator diesen Effekt auf die nachfolgen‐den Gene.
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8. Was ist gemeint?d) Ein Umweltmolekül, welches die Transkription eines Operons aktiviert.
Beispiel lac Operon:
Induktor
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8. Was ist gemeint?e) Region eines Operons, die dem Repressor die Bindung ermöglicht.
O = Operator
Beispiel lac Operon:
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8. Was ist gemeint?f) Ein Set von Genen, deren RNA in einem Molekül synthetisiert wird.
Beispiel lac Operon:
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8. Was ist gemeint?g) Dieser Begriff beschreibt die Beschleunigung/Aktivierung von Transkription, wie z.B.
durch cAMP CAPdurch cAMP‐CAP.
Positive Regulation
Negative Regulation
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8. Was ist gemeint?h) Dieser Begriff bezeichnet ein Protein, welches an den Operator bindet.
Beispiel lac Operon:
alternativ: Aktivator
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= allosteric site:Fungiert als Schalter, der die DNA‐Bindedomäne in funktionalen oderBindedomäne in funktionalen oder nicht funktionalen Zustand versetzt.
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8. Was ist gemeint?i) Regulation durch Faktoren, die die Transkription verhindern.
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8. Was ist gemeint?j) Genregion, an welcher die RNA‐Polymerase bindet, um die Transkription zu starten.
B i i l l O
P = PromotorBeispiel lac Operon:
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