(1997) assessment of genetic relationships

8/19/2019 (1997) Assessment of Genetic Relationships

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H e r e d i t y 7 8 ( 1 9 9 7 ) 4 0 3 — 4 0 9 R e c e i v e d 4 A p r i l 1 9 9 6

A s s e s s m e n t o f g e n e t i c r e l a t i o n s h i p s a m o n g

s e x u a l a n d a s e x u a l f o r m s o f A i l i u m c e p a

u s i n g m o r p h o l o g i c a l t r a i t s a n d R A P D m a r k e r s

M A U D L E T H I E R R Y D E N N E Q U I N * , O L I V I E R P A N A U D , T H I E R R Y R O B E R T A N D

A G N E S R I C R O C H

L a b o r a t o i r e E v o l u t i o n e t S y s t é m a t i q u e , b â t i m e n t 3 6 2 , U n i v e r s i t é P a r i s - S u d . U R A C N R S 2 1 5 4 , 9 1 4 0 5 O r s a y c e d e x ,

F r a n c e

T h e

s p e c i e s A l l i u m c e p a i n c l u d e s t w o m a j o r c r o p s o n t h e b a s i s o f m o r p h o l o g i c a l t r a i t s a n d

t y p i c a l r e p r o d u c t i o n m o d e : s e x u a l l y r e p r o d u c e d b i e n n i a l o n i o n s a n d v e g e t a t i v e l y p r o p a g a t e d

p e r e n n i a l s h a l l o t s w h i c h r a r e l y f l o w e r . I n a d d i t i o n , t h e s e e d - p r o p a g a t e d s h a l l o t , a r e c e n t l y

r e l e a s e d v a r i e t y w i t h i n t e r m e d i a t e p h e n o t y p e f o r l i f e h i s t o r y , h a s b e e n d e s c r i b e d a n d u s e d b y

b r e e d e r s . A j o i n t a n a l y s i s u s i n g m o l e c u l a r m a r k e r s ( r a n d o m a m p l i f i e d p o l y m o r p h i c D N A ,

R A P D ) a n d m o r p h o l o g i c a l c h a r a c t e r s w a s u n d e r t a k e n f o r t h e a s s e s s m e n t o f g e n e t i c d i v e r s i t y

a n d c r o p c l a s s i f i c a t i o n a m o n g A l l i u m c e p a g e n o t y p e s . A m o r p h o l o g i c a l s t u d y d e s c r i b i n g g r o w t h .

a n d d e v e l o p m e n t w a s c a r r i e d o u t o n a n e s t e d s a m p l i n g ( 3 4 a c c e s s i o n s ) f r o m t w o g e o g r a p h i c a l

o r i g i n s ( E u r o p e a n o r t r o p i c a l ) a n d o f d i f f e r e n t p l a n t s t a t u s ( i m p r o v e d v a r i e t i e s o r l o c a l

e c o t y p e s ) . F o u r p r i m e r s g e n e r a t e d 2 4 r e p r o d u c i b l y s c o r a b l e D N A b a n d s w h i c h g a v e i n d i v i d u a l

f i n g e r p r i n t i n g f o r r e p r e s e n t a t i v e a c c e s s i o n s o f b o t h o n i o n s a n d s h a l l o t s . O u r r e s u l t s i n d i c a t e

t h a t t h e s e e d - p r o p a g a t e d s h a l l o t i s m o r e c l o s e l y r e l a t e d t o o n i o n s t h a n t o v e g e t a t i v e l y p r o p a -

g a t e d s h a l l o t s a n d , m o r e o v e r , r e v e a l a g e o g r a p h i c a l s t r u c t u r e o f g e n e t i c d i v e r s i t y . T h e e v o l u -

t i o n a r y s i g n i f i c a n c e o f t h e s e d a t a i s d i s c u s s e d .

K e y w o r d s :

A l l i u m

c e p a , d i v e r s i t y , o n i o n , R A P D , r e p r o d u c t i v e s t r a t e g y , s h a l l o t .

I n t r o d u c t i o n

T h e

d o m e s t i c a t i o n p r o c e s s o f A l l i u m c e p a i s v e r y

a n c i e n t , a s s h o w n b y t h e p r e s e n c e o f o n i o n s i n E g y p t

5 0 0 0 y e a r s a g o . A c c o r d i n g t o Z e v e n & Z h u k o v s k y

( 1 9 7 5 ) , t h e r e i s e i t h e r a s i n g l e c e n t r e o f o r i g i n f o r

b o t h o n i o n s a n d s h a l l o t s l o c a t e d i n c e n t r a l A s i a o r

t w o d i f f e r e n t c e n t r e s l o c a t e d i n t h e s a m e a r e a .

N o w a d a y s s e l e c t i o n a n d i s o l a t e d c u l t i v a t i o n h a v e

p r o d u c e d a l a r g e s p e c t r u m o f l o c a l l y a d a p t e d v a r i -

e t i e s w i t h r e s p e c t t o d a y l e n g t h r e s p o n s e f o r b u l b i n g .

L o c a l e c o t y p e s d i s p l a y a h i g h g e n e t i c v a r i a b i l i t y f o r

t r a i t s s u c h a s p h o t o p e r i o d , p r e c o c i t y o f b u l b i n g a n d

b u l b d o r m a n c y ( R o u a m b a e t a l . , 1 9 9 3 ) . H o w e v e r ,

t h e i n f l u e n c e o f g e o g r a p h i c a l d i s t r i b u t i o n i n r e s p e c t

o f d a y l e n g t h r e s p o n s e o n t h e s t r u c t u r e o f g e n e t i c

d i v e r s i t y i s i n s u f f i c i e n t l y s t u d i e d .

T h e s p e c i e s A . c e p a d i s p l a y s d i f f e r e n t r e p r o d u c t i v e

m o d e s : s e x u a l r e p r o d u c t i v e o n i o n s ( a l l o g a m o u s a n d

p r o t a n d r o u s ) a n d v e g e t a t i v e l y p r o p a g a t e d s h a l l o t s .

R e c e n t c l a s s i f i c a t i o n s o f A . c e p a s u g g e s t a p a r t i t i o n

* C o r r e s p o n d e n c e . E - m a i l : l e t h i e r @ p s i s u n . u - p s u d . f r

1 9 9 7 T h e G e n e t i c a l S o c i e t y o f G r e a t B r i t a i n .

4 0 3

o f t h e s p e c i e s i n t o t h r e e b o t a n i c a l g r o u p s ( H a n e l t e t

a l . , 1 9 9 2 ) : t h e C o m m o n O n i o n g r o u p , c o n s t i t u t e d b y

s e x u a l r e p r o d u c t i v e o n i o n s , t h e A g g r e g a t u m g r o u p ,

f o r m e d w i t h v e g e t a t i v e l y p r o p a g a t e d s h a l l o t s , a n d

t h e P r o l i f e r u m g r o u p , w h i c h p r e s e n t s v e g e t a t i v e l y

p r o p a g a t e d o n i o n s p r o d u c i n g b u l b l e t s ( t o p s e t ) .

A s e x u a l s h a l l o t s h a v e b e e n p l a c e d i n t h e s p e c i e s

A . a s c a l o n i c u m ; h o w e v e r , i t s i n t e r f e r t i l i t y w i t h A .

c e p a ( A t k i n , 1 9 5 3 ) w a s t h e r e a s o n f o r c o n s i d e r i n g

b o t h a s t h e s a m e s p e c i e s ( A . c e p a ) . T h e e x i s t e n c e o f

t h o s e t w o i n t e r f e r t i l e f o r m s s u g g e s t s t h e p r e s e n c e o f

a n e v o l u t i o n a r y c o n t i n u u m b e t w e e n a s e x u a l f o r m

a n d a v e g e t a t i v e l y r e p r o d u c e d f o r m s e l e c t e d a g a i n s t

f l o w e r i n g d u r i n g t h e d o m e s t i c a t i o n p r o c e s s . O n i o n s

a n d a s e x u a l s h a l l o t s c a n b e d i f f e r e n t i a t e d b y

m o r p h o l o g i c a l c h a r a c t e r s ( s i n g l e , l a r g e b u l b f o r

o n i o n s v s . b u l b l e t s f o r s h a l l o t s ) , b y t h e i r r e p r o d u c -

t i v e m o d e ( s e x u a l r e p r o d u c t i o n v s . a s e x u a l r e p r o d u c -

t i o n ) a n d b y t h e i r l i f e c y c l e ( b i e n n i a l f o r o n i o n s v s .

p e r e n n i a l f o r s h a l l o t s ) .

T a x o n o m y a n d g e n e t i c d i v e r s i t y w i t h i n t h e g e n u s

A l l i u m h a v e a l r e a d y b e e n s t u d i e d b y i s o z y m e s ,

r D N A , r e s t r i c t i o n f r a g m e n t l e n g t h p o l y m o r p h i s m


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4 0 4 M . L E T H I E R R Y D E N N E Q U I N E T A L .

( R F L P ) a n d R A P D m a r k e r s . S t u d i e s u s i n g i s o z y m e s

h a v e m e a s u r e d g e n e t i c v a r i a b i l i t y o f b e t w e e n - a n d

w i t h i n - p o p u l a t i o n v a r i a t i o n ( P e f f l e y & O r o z c o -

C a s t i l l o , 1 9 8 7 ; R o u a m b a e t a t . , 1 9 9 3 ) . T a x o n o m i c

s t u d i e s c a r r i e d o u t w i t h R F L P m a r k e r s r e v e a l e d

h i g h d i f f e r e n t i a t i o n b e t w e e n s p e c i e s , e s p e c i a l l y f o r

s p e c i e s b e l o n g i n g t o t h e s e c t i o n C e p a ( B r a d e e n &

H a v e y , 1 9 9 5 ) . R F L P m a r k e r s h a v e b e e n u s e d a t a n

i n t r a s p e c i f i c l e v e l i n o r d e r t o a n a l y s e g e n e t i c s i m i l a r -

i t i e s b e t w e e n o n i o n s w i t h d i f f e r e n t k i n d s o f

d a y l e n g t h r e s p o n s e ( B a r k & H a v e y , 1 9 9 5 ) . G e n e t i c

r e l a t i o n s h i p s b e t w e e n A . c e p a a n d A . f i s t u l o s u m w e r e

r e p o r t e d b y R i c r o c h e t a t . ( 1 9 9 2 ) u s i n g i n s i t u h y b r i d -

i z a t i o n o f r D N A s e q u e n c e s .

R A P D m a r k e r s a r e u s e f u l f o r d e t e r m i n i n g t h e

d i s t r i b u t i o n o f g e n e t i c v a r i a b i l i t y w i t h i n a n d a m o n g

t a x o n o m i c u n i t s a n d h a v e b e e n a p p l i e d f o r t h i s

p u r p o s e i n d i f f e r e n t s p e c i e s , e s p e c i a l l y o n c l o n e s

( C a s t i g l i o n e e t a l . , 1 9 9 3 ) . T h e y h a v e b e e n u s e d i n A .

s a t i v u m ( M a a B & K l a a s , 1 9 9 5 ) a n d i n A . c e p a

( W i l k i e e t a l . , 1 9 9 3 ; B o h a n e c e t a L , 1 9 9 5 ) .

I n t h i s s t u d y , w e a s s e s s e d t h e e f f i c i e n c y o f u s i n g

c h o s e n m o r p h o l o g i c a l c h a r a c t e r s a n d R A P D

m a r k e r s t o e x a m i n e t h e d i s t r i b u t i o n o f g e n e t i c d i v e r -

s i t y a m o n g s e v e r a l a c c e s s i o n s o f s e x u a l a n d a s e x u a l

f o r m s o f A . c e p a r e p r e s e n t i n g a w i d e g e o g r a p h i c a l

r a n g e . M o r e o v e r , w e a d d r e s s e d t h e q u e s t i o n o f

w h e t h e r t h e s e e d - p r o p a g a t e d s h a l l o t b e l o n g s t o t h e

o n i o n o r s h a l l o t g r o u p s .

M a t e r i a l s a n d m e t h o d s

G r o w t h c o n d i t i o n s

S e e d s o f 1 9 a c c e s s i o n s o f o n i o n s a n d b u l b i e t s o f 2 1

s h a l l o t a c c e s s i o n s w e r e p l a n t e d b e t w e e n 2 a n d 1 0

F e b r u a r y a n d c u l t i v a t e d u n d e r s t a n d a r d c o n d i t i o n s

i n g r e e n h o u s e s a t P a r i s - S u d U n i v e r s i t y

( F r a n c e )

( T a b l e 1 ) . D u r i n g t h e p e r i o d o f g r o w t h a n d d e v e l o p -

m e n t , t h e m e a n m i n i m u m a n d m a x i m u m t e m p e r a -

t u r e r a n g e d f r o m 1 5 t o 3 2 ° C . F o r e a c h f o r m ,

e c o t y p e s ( c o m i n g f r o m g e r m p a s m c o l l e c t i o n s ) a n d

i m p r o v e d v a r i e t i e s ( c u r r e n t l y u n d e r s e l e c t i o n o r

c o m m e r c i a l v a r i e t i e s ) f r o m t r o p i c a l a n d E u r o p e a n

o r i g i n s w e r e c h o s e n . T h e s e e d - p r o p a g a t e d s h a l l o t

w a s t h e F r e n c h c o m m e r c i a l v a r i e t y ' C u i s s e d e

P o u l e t ' , c u l t i v a t e d i n t h e w e s t e r n r e g i o n o f F r a n c e .

B o t h s e e d s a n d b u l b l e t s w e r e c u l t i v a t e d .

M o r p h o l o g i c a l

a n a l y s i s

P l a n t

m a t e r i a l T h e n u m b e r o f a n a l y s e d i n d i v i d u a l s

p e r a c c e s s i o n w a s c h o s e n a c c o r d i n g t o r e p r o d u c t i v e

m o d e . F o r s e x u a l l y r e p r o d u c e d o n i o n s 1 0 i n d i v i d u a l s

p e r a c c e s s i o n w e r e a n a l y s e d . F o r v e g e t a t i v e l y p r o p a -

g a t e d s h a l l o t s t h r e e i n d i v i d u a l s p e r c l o n e w e r e

s t u d i e d . A m o n g 2 1 s h a l l o t a c c e s s i o n s , 1 4 a c c e s s i o n s

w e r e u s e d i n t h e m o r p h o l o g i c a l s t u d y . N o m o r p h o -

l o g i c a l d a t a w e r e r e c o r d e d o n s e v e n a c c e s s i o n s t h a t

f l o w e r e d . F o r t h e s e e d - p r o p a g a t e d s h a l l o t , 1 0 i n d i -

v i d u a l s ( b o t h f r o m s e e d s a n d b u l b l e t s ) w e r e

a n a l y s e d .

C h a r a c t e r i s t i c s d e s c r i b i n g g r o w t h a n d d e v e l o p -

m e n t l i s t e d i n T a b l e 2 w e r e c h o s e n b e c a u s e t h e y

h a v e b e e n s h o w n t o b e v a l u a b l e d e s c r i p t o r s o f o n i o n

a n d s h a l l o t l i f e h i s t o r y ( M e s s i a e n e t a l . , 1 9 9 3 ) . E v e r y

w e e k , b u l b a n d n e c k d i a m e t e r s o f o n i o n s w e r e m e a s -

u r e d d u r i n g t h e d e v e l o p m e n t c y c l e i n o r d e r t o d e t e r -

m i n e a b u l b r a t i o . W h e n m a x i m a l b u l b d i a m e t e r i s

t w i c e m i n i m a l n e c k d i a m e t e r ( R 2 ) , i t i n d i c a t e s t h e

o n s e t o f b u l b i n g ( B r e w s t e r , 1 9 7 7 ) . T h e n u m b e r o f

d a y s f r o m s o w i n g t o R 2 w a s c a l c u l a t e d . L e a f n u m b e r

o f o n i o n s a n d s h a l l o t s w a s s c o r e d e v e r y w e e k u n t i l

h a r v e s t i n g . T h e o t h e r c h a r a c t e r i s t i c s w e r e d e t e r -

m i n e d a t m a t u r i t y . A p l a n t w a s d e t e r m i n e d a s

m a t u r e w h e n 5 0 p e r c e n t o f l e a v e s w i l t e d a n d w e r e

r e c u m b e n t o n t h e g r o u n d . A t h a r v e s t o n i o n b u l b s

a n d s h a l l o t b u l b l e t s w e r e d r i e d a t 8 0 ° C f o r 4 8 h a n d

t h e d r y m a t t e r c o n t e n t w a s m e a s u r e d .

D a t a a n a l y s i s T h e d a t a r e c o r d e d f r o m t h e 3 3

a c c e s -

s i o n s o f o n i o n s a n d v e g e t a t i v e l y p r o p a g a t e d s h a l l o t s

w e r e s u b m i t t e d t o m u l t i v a r i a t e s t a t i s t i c a l a n a l y s i s .

T h e c o m b i n e d p r o c e d u r e d e s c r i b e d b y S a r r &

P e r n è s ( 1 9 8 8 ) w a s u s e d . T h i s p r o c e d u r e i n v o l v e s

a

p r i n c i p a l c o m p o n e n t a n a l y s i s , a c l u s t e r i n g a l g o r i t h m

u s i n g t h e E u c l i d i a n d i s t a n c e c a l c u l a t e d f r o m t h e

d a t a m a t r i x , a n d a d i s c r i m i n a n t a n a l y s i s . I t a l l o w s

a n

a c c u r a t e d e s c r i p t i o n o f p h e n o t y p i c v a r i a t i o n a n d i t s

o r g a n i z a t i o n w i t h i n t h e g e n e p o o l s t u d i e d .

M o l e c u l a r

s t u d y

P l a n t

m a t e r i a l E i g h t E u r o p e a n a n d t r o p i c a l o n i o n

a c c e s s i o n s w e r e c h o s e n . T h e y r e p r e s e n t e d t h e

d a y l e n g t h r e s p o n s e s p e c t r u m o f l o c a l e c o t y p e s a n d

i m p r o v e d v a r i e t i e s . P e r a c c e s s i o n , 1 — 1 0 i n d i v i d u a l s

w e r e s c o r e d f o r R A P D a n a l y s i s . T h i s s a m p l i n g

s c h e m e e n s u r e d r e p r e s e n t a t i o n o f a l a r g e

g e o g r a p h i -

c a l a n d e c o t y p i c r a n g e . F o r s h a l l o t s , t h e 1 4

a c c e s -

s i o n s r e p r e s e n t a t i v e o f e c o t y p e s a n d c o m m e r c i a l

c l o n e s w e r e c h o s e n . B e c a u s e t h e s h a l l o t

s a m p l e

c o n t a i n e d o n l y 1 4 a c c e s s i o n s ( 1 7 g e n e t i c i n d i v i d -

u a l s ) , t h e s a m p l e s i z e w a s t o o s m a l l t o a s s e s s t h e

g e o g r a p h i c a l d i s t r i b u t i o n o f t h e g e n e t i c v a r i a b i l i t y .

F o r t h e s e e d - p r o p a g a t e d s h a l l o t , e i g h t o f t h e 1 0 i n d i -

v i d u a l s t e s t e d i n t h e m o r p h o l o g i c a l

a n a l y s i s w e r e

e x a m i n e d .

T h e G e n e t i c a l S o c i e t y o f G r e a t B r i t a i n , H e r e d i t y , 7 8 , 4 0 3 — 4 0 9 .


3/7

A S S E S S M E N T O F D I V E R S I T Y I N A L L I U M C E P A 4 0 5

T a b l e 1 P l a n t

s t a t u s

a n d g e o g r a p h i c a l o r i g i n o f A l l i u m c e p a a c c e s s i o n s

s t u d i e d i n a

m o r p h o l o g i c a l a n a l y s i s ( M ) a n d i n a m o l e c u l a r s t u d y ( R A P D )

O n i o n s

E c o t y p e s

E u r o p e a n o r i g i n

R o s é d e R o s c o f f 3 3 A ( F r a n c e ) ' , O P *

0 - 0 1 M

R A P D

R o s é d e R o s c o f f 3 3 B ( F r a n c e ) , O P

0 - 0 2

M

R a l o l e t t e d e s C é v e n n e s ( F r a n c e ) a , O P

0 - 0 3

M

M u s e a u d e l i è v r e 4 7 A ( F r a n c e ) , O P

0 - 0 4

M R A P D

T r o p i c a l o r i g i n

T i n t i l o u ( B u r k i n a F a s o ) h , O P

0 - 0 5

M

R A P D

4 N i ( N i g e r ) " , O P

0 - 0 6

M

I m p r o v e d v a r i e t i e s


J a u n e h â t i f d e V a l e n c e ( S p a i n ) , O P

0 - 0 7

M

J a u n e e s p a g n o l ( S p a i n ) , O P

0 - 0 8

M

R A P D

R o u g e e s p a g n o l ( S p a i n ) d , O P

0 - 0 9

M

B l a n c d e P a r i s ( F r a n c e ) c , O P

0 - 1 0

M

A u x o n e ( F r a n c e ) e , O P

0 - 1 1

M

R A P D


S h o r t d a y h y b r i d ( U S A ) 1 , F , * *

0 - 1 2

M

V i o l e t d e G a l m i M a 0 2 7 ( M a u r i t a n i a ) 1 , O P

0 - 1 3

M

R A P D

V i o l e t

d e G a l m i 1 6 3 4 ( I v o r y C o a s t ) 1 , O P

0 - 1 4

M

R A P D

V i o l e t

d e G a l m i N o 5 ( S e n e g a l ) 1 , O P

0 - I S

M

S h o r t d a y w h i t e ( U S A ) 1 , O P

0 - 1 6

M

R i o S o l o ( U S A ) " , F ,

0 - 1 7

M

R A P D

R i o E n r i q u e ( U S A ) h , F ,

0 - 1 8

M

R i o R a d j i r e d ( U S A ) " , F ,

0 - 1 9

M

V e g e t a t i v e l y p r o p a g a t e d s h a l l o t s

E c o t y p e s


E 2 ( F r a n c e )

S - U i

M

R A P D

E 9 g l o b e ( F r a n c e ) '

S - 0 2

M

E 1 4 ( F r a n c e )

S - 0 3

M

E 1 5 l o n g ( F r a n c e )

S - 0 4

M

R A P D

E 1 8 g l o b e ( F r a n c e )

S - O S

M


G u i n é e ( G u i n e a ) '

S - 0 6

M

A b i d j a n ( I v o r y C o a s t ) 1

S - 0 7

M

B r a z z a v i l l e ( C o n g o ) 1

S - 0 8

M

R A P D

O A E G ( G u i n e a ) 1

S - 0 9

M

I m p r o v e d v a r i e t i e s


E l ( F r a n c e )

S - l U

R A P D

E 3 ( F r a n c e )

S - l i

M

R A P D

E 4 ( F r a n c e ) '

S - 1 2

R A P D

E 7 ( F r a n c e )

S - 1 3

R A P D

E 1 0

g l o b e ( F r a n c e ) '

S - 1 4

R A P D

E l i g l o b e ( F r a n c e ) '

S - i S

M

R A P D

E 1 3 l o n g a n d ' g r i s e ' ( F r a n c e ) '

S - 1 6

M

R A P D

E 1 6 e x p e r i m e n t a l , g l o b e ( F r a n c e ) '

S - 1 7

R A P D

E 1 7 g l o b e ( F r a n c e ) '

S - 1 8

R A P D

E 1 9 e x p e r i m e n t a l , g l o b e ( F r a n c e ) '

S - 1 9

R A P D

E c h a l o t e

g r i s e ( F r a n c e ) "

S - 2 0

M

R A P D


O i g n o n b l a n c ( I v o r y C o a s t ) "

S - 2 1

M

S e e d - p r o p a g a t e d s h a l l o t s


C u i s s e d e p o u l e t ( F r a n c e ) ' , O P

S P - 1

M

R A P D

T h e

o r i g i n s o f a c c e s s i o n s a r e i n d i c a t e d i n b r a c k e t s .

E c o l e N a t i o n a l S u p é r i e u r e d ' H o r t i c u l t u r e d e V e r s a i l l e s ( F r a n c e ) ; " I n s t i t u t N a t i o n a l

d ' E t u d e s

e n R e c h e r c h e A g r o n o m i q u e ( B u r k i n a - f a s o ) ; c C l a u s e ( F r a n c e ) ;

d V i l m o r i n ( F r a n c e ) ; C o o p d ' o r

( F r a n c e ) ; ' d p a l m e r s s e e d ( U S A ) ; 1 T r o p i c a s e m ( S e n e g a l ) ; h R i o

C o l o r a d o ( U S A ) ; I n s t i t u t

N a t i o n a l d e R e c h e r c h e A g r o n o m i q u e d e P l o u d a n i e l ( F r a n c e ) ; ' C e n t r e d e c o o p e r a t i o n

I n t e r n a t i o n a l e e n R e c h e r c h e A g r o n o m i q u e p o u r l e D é v e l o p p e m e n t d e L a R e u n i o n ( F r a n c e ) ;

" R u n g i s m a r k e t ( F r a n c e ) ; ' L e s j a r d i n i e r s d ' A n j o u e t d u P o i t o u a A l l o n n e s ( F r a n c e ) .

* O p e n p o l l i n a t e d ; * * F , h y b r i d .



4/7


T a b l e 2

L i s t o f t r a i t s m e a s u r e d o n o n i o n s a n d v e g e t a t i v e l y p r o p a g a t e d s h a l l o t s

O n i o n s

S h a l l o t s

L e a f n u m b e r ( L N )

L e a f n u m b e r ( p e r c l u s t e r o f b u l b i e t s ) ( L N )

L e a f n u m b e r a t R 2 ( L N R 2 )

B u l b i e t d i a m e t e r ( B D )

B u l b d i a m e t e r ( B D ) B u l b i e t h e i g h t ( B H )

B u l b h e i g h t ( B H )

B u l b i e t f r e s h m a t t e r c o n t e n t ( B F M C )

F r e s h m a t t e r c o n t e n t ( F M C )

D r y m a t t e r c o n t e n t ( D M C )

P l a t e l e n g t h ( P L )

A x i l l a r y b u d s n u m b e r ( A B N )

B u l b i e t d r y m a t t e r c o n t e n t ( B D M C )

B u i b l e t p l a t e l e n g t h ( B P L )

B u i b l e t n u m b e r ( B N )

D a y s n u m b e r f r o m s o w i n g t o R 2 ( D N R 2 )

R A P D a m p l i f i c a t i o n

D N A

w a s i s o l a t e d f r o m f r e s h l e a f m a t e r i a l ( 0 . 7 g ) b y

a C T A B m e t h o d b a s e d o n t h a t o f S a g h a i - M a r o o f e t

a . ( 1 9 8 4 ) . O n e o f f o u r l O - m e r o l i g o n u c l e o t i d e s :

O P A - 0 4 ( 5 ' - A A T C G G G C T G - 3 ' ) , O P A - 1 9 ( 5 ' -

C A A A C G T C G G - 3 ) ,

O P A - 2 0 ( 5 ' - G T T G C G A T C C -

3 ' ) a n d O P B - 1 1 ( 5 ' - G T A G A C C C G T - 3 ' ) ( O p e r o n

t e c h n o l o g i e s I n c . , A l a m e d a , C a l i f o r n i a , U S A ) w e r e

u s e d f o r e a c h a m p l i f i c a t i o n . C o n d i t i o n s r e p o r t e d b y

B o h a n e c e t

a l .

( 1 9 9 5 ) w e r e i m p r o v e d . E a c h r e a c t i o n

( 2 5

1 t L )

c o n s i s t e d o f 1 m o f M g C I 2 , 4 m e a c h o f

d A T P , d C T P , d G T P , d T T P ( B o e h r i n g e r - M a n h e i m ,

G e r m a n y ) , 4 0 0 f l M p r i m e r , 0 . 5 U o f T a q D N A p o l y -

m e r a s e ( A p p l i g e n e - O n c o r , F r a n c e ) , 1 x r e a c t i o n

b u f f e r ( 1 m r v i M g C I 2 , 2 0 m r v i T r i s H C I p H 8 . 0 , e t h y l e -

n e d i a m i n e t e t r a a c e t i c a c i d ( E D T A ) 1 m i , d i t h i o -

t h r e i t o l 1 m , g l y c e r o l 5 0 p e r c e n t ) . T h e r e a c t i o n

m i x w a s o v e r l a i d w i t h a d r o p o f m i n e r a l o i l a n d

i n c u b a t e d i n a t h e r m a l c y c l e r ( t h e r m a l c y c l e r 4 8 0 ,

P e r k i n E l m e r - C e t u s , U S A ) p r o g r a m m e d a s f o l l o w s :

4 8 c y c l e s o f 1 m m d e n a t u r a t i o n a t 9 4 ° C , 1 m m

a n n e a l i n g a t 3 7 ° C a n d 1 . 5 m m e x t e n s i o n a t 7 2 ° C ,

f o l l o w e d b y f i n a l e x t e n s i o n a t 7 2 ° C f o l l o w e d b y

a

c o o l i n g a t 4 ° C . T u b e s c o n t a i n i n g a l l r e a c t i o n

p r o d u c t s e x c e p t t e m p l a t e D N A w e r e u s e d a s

c o n t r o l . T e n m i l l i l i t r e s o f a m p l i f i c a t i o n p r o d u c t s

w e r e e l e c t r o p h o r e s e d i n 3 p e r c e n t a g a r o s e g e l s i n

0 . 5 x T B E . W e u s e d q X D N A d i g e s t e d w i t h H a e I H

a s a m o l e c u l a r w e i g h t m a r k e r .

D a t a

a n a l y s i s

E a c h

a m p l i f i c a t i o n w a s r e p e a t e d t h r e e t i m e s . T h e

v i s i b l e a n d r e p r o d u c i b l e b a n d s w e r e s c o r e d a s

p r e s e n t ( 1 ) o r a b s e n t ( 0 ) . S i m i l a r i t y i n d i c e s ( F ) f r o m

J a c c a r d ( 1 9 0 8 ) a n d N d & L i ( 1 9 7 9 ) w e r e c a l c u l a t e d .

G e n e t i c d i s t a n c e s ( 1 - F ) w e r e u s e d t o b u i l d a d e n d r o -

g r a m a c c o r d i n g t o t h e U P G M A c l u s t e r i n g p r o c e d u r e .

B e c a u s e r e s u l t s u s i n g t h e t w o i n d i c e s w e r e s i m i l a r ,

o n l y t h e d e n d r o g r a m b a s e d o n t h e N e i a n d L i

d i s t a n c e i s s h o w n . T h e B o o l e a n m a t r i x w a s a l s o

s u b m i t t e d t o f a c t o r i a l c o r r e s p o n d e n c e a n a l y s i s

( M o r r i s o n , 1 9 9 0 ) . T h i s m u l t i v a r i a t e p r o c e d u r e i s

s i m i l a r t o a p r i n c i p a l c o m p o n e n t a n a l y s i s e x c e p t f o r

c o m p u t a t i o n o f c o o r d i n a t e s a l o n g a x e s w h i c h i s

b a s e d o n a x 2

d i s t a n c e .

R e s u l t s

M o r p h o l o g y a n d l i f e h i s t o r y

T h e l i f e h i s t o r y o f t h e s e e d - p r o p a g a t e d s h a l l o t w a s

o b s e r v e d f r o m s o w i n g s e e d s o r f r o m p l a n t i n g b u l b s .

F r o m s e e d , o n e l a r g e b u l b w a s o b t a i n e d w h i c h

r a p i d l y d i v i d e d t o p r o d u c e a c l u s t e r o f s m a l l b u l b s .

W h e n o n e b u l b w a s p l a n t e d i t f u r t h e r d i v i d e d t o

f o r m a c l u s t e r o f s m a l l b u l b s , f o l l o w e d b y f l o w e r i n g

i n t h e s e c o n d y e a r .

T h e p r i n c i p a l c o m p o n e n t a n a l y s i s b a s e d o n

m o r p h o l o g i c a l

c h a r a c t e r s

( d a t a

n o t s h o w n )

s u g g e s t e d t h a t p h e n o t y p i c d i v e r s i t y w a s o r g a n i z e d i n

t w o a n d t h r e e m a j o r c l u s t e r s f o r o n i o n s a n d

v e g e -

t a t i v e l y p r o p a g a t e d s h a l l o t s , r e s p e c t i v e l y . T h i s s t r u c -

t u r e w a s c o n f i r m e d b y a c l u s t e r i n g a l g o r i t h m

f o l l o w e d b y a d i s c r i m i n a n t a n a l y s i s w h i c h a l l o w e d

a

f i n a l c l a s s i f i c a t i o n ( T a b l e 3 ) .

I n o n i o n s , t h e m o s t d i s c r i m i n a n t v a r i a b l e s

w e r e

b u l b f r e s h m a t t e r c o n t e n t ( F M C ) a n d b u l b

h e i g h t

( B H ) , b o t h d e s c r i p t o r s o f b u l b y i e l d . M o r e o v e r , B H

i s a m o r p h o l o g i c a l c h a r a c t e r r e f l e c t i n g s e l e c t i o n f o r

b u l b s h a p e . G e o g r a p h i c a l d i s t i n c t i o n w a s l e s s

o b v i o u s f o r v e g e t a t i v e l y p r o p a g a t e d s h a l l o t s t h a n f o r

o n i o n s . T h r e e c l u s t e r s w e r e d i s c r i m i n a t e d b y t h r e e

m a j o r v a r i a b l e s : b u l b i e t p l a t e l e n g t h ( B P L ) , l e a f

n u m b e r ( L N ) a n d b u i b l e t f r e s h m a t t e r c o n t e n t

( B F M C ) . C l u s t e r s 1 a n d 2 i n c l u d e d a l l t h e E u r o p e a n

a c c e s s i o n s ( b o t h i m p r o v e d v a r i e t i e s o r l o c a l

e c o t y p e s ) ; t h e f i r s t o n e w a s c o m p o s e d o f a c c e s s i o n s

t h a t p r e s e n t e d a v e r y g o o d y i e l d , a n d t h e s e c o n d

o n e



5/7

b p

1 3 5 3

1 0 7 8

8 7 2

6 0 3

1 2 3 4 5 6 7 8 9 1 0 1 1 1 2 1 3 1 4 1 5 1 6 1 7


w a s f o r m e d b y l o w y i e l d a c c e s s i o n s w h i c h h a v e h i g h

v a l u e s f o r v a r i a b l e s d e p i c t i n g l i f e h i s t o r y ( L N , B P L ) .

C l u s t e r t h r e e c o n t a i n e d a l l t h e t r o p i c a l a c c e s s i o n s .

T h e y w e r e c h a r a c t e r i z e d b y l o w y i e l d v a l u e s s i m i l a r

t o t h e v a l u e s o f c l u s t e r 2 . V a r i a b l e s ( L N a n d B F M C )

i n v o l v e d i n t h e d i s c r i m i n a n t a n a l y s i s o f v e g e t a t i v e l y

p r o p a g a t e d s h a l l o t s d e s c r i b e c a r b o h y d r a t e a l l o c a t i o n

f r o m l e a v e s t o s t o r a g e o r g a n s . C o n c e r n i n g t h e s e e d -

p r o p a g a t e d s h a l l o t , w e n o t i c e d t h e e m e r g e n c e o f

b o t h s e e d s a n d b u l b l e t s ( t o p s e t s ) w i t h i n u m b e l s .

D i f f e r e n t i a t i o n

o f s e x u a l a n d a s e x u a l f o r m s b a s e d

o n R A P D m a r k e r s

T h e

c h o i c e o f t h e f o u r p r i m e r s i n t h i s p r e s e n t s t u d y

w a s b a s e d o n t h e p o l y m o r p h i s m r e v e a l e d i n p r e v i o u s

s t u d i e s o n A l l i u m s p e c i e s ( W i l k i e e t a l . , 1 9 9 3 ;

B o h a n e c e t a . , 1 9 9 5 ) . T h e s e f o u r p r i m e r s g e n e r a t e d

a t o t a l o f 2 4 r e p r o d u c i b l e b a n d s s c o r e d f o r s t a t i s t i c a l

a n a l y s i s . A n e x a m p l e o f p a t t e r n s u s i n g p r i m e r O P A

1 9 f o r d i f f e r e n t a c c e s s i o n s o f o n i o n s h o w s p o l y m o r -

p h i s m w i t h i n a n d b e t w e e n a c c e s s i o n s ( F i g . 1 ) .

R A P D a n a l y s i s d i d n o t i d e n t i f y a n y b a n d s p e c i f i c t o

o n e o f t h e t h r e e f o r m s ( o n i o n s , v e g e t a t i v e l y p r o p a -

g a t e d s h a l l o t s o r t h e s e e d - p r o p a g a t e d s h a l l o t ) .

H o w e v e r , s o m e b a n d s w e r e m o r e f r e q u e n t i n o n e

f o r m t h a n i n a n o t h e r .

T h e d e n d r o g r a m ( F i g . 2 ) a n d t h e t w o f a c t o r i a l

c o m p o n e n t a n a l y s e s ( d a t a n o t s h o w n ) f r o m a n a l y s i s

o f R A P D b a n d s s h o w e d a d i f f e r e n t i a t i o n b e t w e e n

t h e ' e c h a l o t e g r i s e ' ( S - 1 6 a n d S - 2 0 ) , t h e v e g e t a t i v e l y

p r o p a g a t e d s h a l l o t s a n d t h e o n i o n s . T h e s e e d - p r o p a -

g a t e d s h a l l o t i s c l o s e r t o o n i o n s t h a n t o v e g e t a t i v e l y

p r o p a g a t e d s h a l l o t s . T h e d i f f e r e n t i a t i o n i s m a i n l y i n

T a b l e 3 R e s u l t s o f d i s c r i m i n a n t a n a l y s i s f o r o n i o n s a n d s h a l l o t s b a s e d o n m o r p h o l o g y a n d l i f e c y c l e t r a i t s

O n i o n s

S h a l l o t s

C l u s t e r n u m b e r

% o f w e l l - c l a s s i f i e d i n d i v i d u a l s

D i s c r i m i n a n t p o w e r o f t h e c a n o n i c a l v a r i a b l e s

T h e m o r e d i s c r i m i n a n t v a r i a b l e s

C l u s t e r 1

C l u s t e r 2

C l u s t e r 3

2

1 0 0

0 . 9 3

F M C , B H *

0 - 0 1 , 0 - 0 2 , 0 - 0 3 ,

0 - 0 4 , 0 - 0 9 , 0 - 1 0 ,

0 - 1 1

0 - 0 5 , 0 - 0 6 , 0 - 0 7 ,

0 - 0 8 , 0 - 1 2 , 0 - 1 3 ,

0 - 1 4 , 0 - 1 5 , 0 - 1 6 ,

0 - 1 7 , 0 - 1 8 , 0 - 1 9

3

1 0 0

0 . 9 5 ; 0 . 7 3

B P L , L N , B F M C *

S - 0 1 , S - 0 2 , S - 0 3 ,

S - i s , S - 1 6

S - 0 4 , S - i l , S - O S ,

S - 2 0

S - 0 6 , S - 0 7 , S - 0 8 ,

S - 0 9 , S - 2 1

* S e e T a b l e 2 f o r a b b r e v i a t i o n s .

F i g . 1 P a t t e r n s o b t a i n e d w i t h o n e

p r i m e r ( O P A 1 9 ) f o r i n d i v i d u a l s o f

t h r e e a c c e s s i o n s o f o n i o n s . L a n e 1 :

l a d d e r ; l a n e s 2 — 6 : D N A f r o m f i v e i n d i -

v i d u a l s o f a c c e s s i o n ' J a u n e e s p a g n o l ' ;

l a n e s 7 — 1 1 : D N A f r o m f i v e i n d i v i d u a l s

o f a c c e s s i o n ' V i o l e t d e G a l m i 1 6 3 4 ' ;

l a n e s 1 2 — 1 7 f r o m s i x i n d i v i d u a l s o f

a c c e s s i o n ' V i o l e t d e G a l m i M a 0 2 7 ' .



6/7


S - i s e

S - 2 0 e

s - o a t I :

S - l i e

S - 1 4

5 - 1 2

S - I a

s - a l

S - l i e

s - I s 8

S - 0 4 e

S - I 9 e I

S - 1 3 e

S - 1 8 e

0 - l i e

0 - 1 7 1

0 - 1 3 1

0 - 0 1 e -

s p - 1

0 - 0 8 0

0 - 0 4 e

0 - 1 3 1

0 - 0 4 e

0 - 1 3 1

0 - 1 4 t h

0 - 0 4 e

0 - 1 4 1 1 :

0 . 0 8 e

0 - 0 5 1

F i g .

2 D e n d r o g r a m s h o w i n g t h e d i f f e r e n t i a t i o n o f o n i o n s ,

s e e d - a n d v e g e t a t i v e l y p r o p a g a t e d s h a l l o t s ( s e e T a b l e 1

f o r a c c e s s i o n d e t a i l s ) b u i l t b a s e d o n t h e N e i a n d L i

d i s t a n c e ( e , e u r o p e a n o r i g i n ; t , t r o p i c a l o r i g i n ) .

r e l a t i o n t o t h e r e p r o d u c t i v e m o d e ; b u t w i t h i n e a c h

f o r m d i f f e r e n t i a t i o n b y g e o g r a p h i c a l o r i g i n ( t r o p i c a l

o r E u r o p e a n ) w a s o b s e r v e d .

D i s c u s s i o n

T h e

m o r p h o l o g i c a l s t u d y s h o w e d t h a t t h e s e e d - p r o p -

a g a t e d s h a l l o t c o n s t i t u t e s a n i n t e r m e d i a t e f o r m w i t h

l i f e h i s t o r y o f b o t h s e x u a l a n d a s e x u a l f o r m s . T h e

l i f e c y c l e o f t h e s e e d - p r o p a g a t e d s h a l l o t i s b i e n n i a l

a n d c h a r a c t e r i z e d b y b u l b l e t ( t o p s e t s ) p r o d u c t i o n

( s i m i l a r t o v e g e t a t i v e g r o w t h o f v e g e t a t i v e l y p r o p a -

g a t e d s h a l l o t s ) f o l l o w e d b y s e e d p r o d u c t i o n ( s i m i l a r

t o o n i o n s ) . T h e p r e s e n c e o f a t r a n s i e n t s t a g e i n i t s

l i f e h i s t o r y c h a r a c t e r i z e d b y t h e f o r m a t i o n o f a s i n g l e

l a r g e b u l b i s n o t c o m p a r a b l e t o t h e o n s e t o f b u l b i n g

o f o n i o n s . C o n s e q u e n t l y , t h e o n s e t o f b u l b i n g d e t e r -

m i n e d b y t h e b u l b r a t i o ( R 2 ) c o u l d n o t b e s c o r e d .

T h e s e x u a l c h a r a c t e r i s t i c o f i t s l i f e h i s t o r y p r e v e n t e d

a n y c o m p a r i s o n w i t h t h e v e g e t a t i v e r e p r o d u c t i o n o f

t h e a s e x u a l f o r m . H o w e v e r , t h i s f i r s t p a r t o f t h e

s t u d y c o n f i r m e d g e o g r a p h i c a l d i f f e r e n t i a t i o n b o t h

f o r o n i o n s a n d v e g e t a t i v e l y p r o p a g a t e d s h a l l o t s .

W i t h i n o n i o n s t h e t w o c l u s t e r s r e f l e c t e d E u r o p e a n

a n d t r o p i c a l o r i g i n s , w i t h t h e e x c e p t i o n o f t w o E u r o -

p e a n v a r i e t i e s ( ' J a u n e h â t i f d e V a l e n c e ' a n d ' J a u n e

e s p a g n o l ' ) w i t h i n t h e t r o p i c a l c l u s t e r . T h e l a t t e r a r e

s h o r t - d a y v a r i e t i e s w i t h a l o w d a y l e n g t h r e q u i r e m e n t

f o r b u l b i n g t h a t c a n b e c u l t i v a t e d i n t r o p i c a l a r e a s

a n d i n s o u t h e r n E u r o p e . D i f f e r e n c e s b e t w e e n c l u s -

t e r s p r o b a b l y r e f l e c t v a r i a t i o n i n s e l e c t i o n f o r y i e l d

c h a r a c t e r i s t i c s s u c h a s b u l b s h a p e . A s i m i l a r

p h e n o m e n o n w a s o b s e r v e d w i t h i n t h e a s e x u a l f o r m ,

w h i c h m a y h a v e e i t h e r a l a r g e n u m b e r o f s m a l l b u l b -

l e t s o r a s m a l l n u m b e r o f l a r g e b u l b i e t s . C o n c e r n i n g

t h e s e e d - p r o p a g a t e d s h a l l o t , t h e p r e s e n c e o f b u l b i e t s

( t o p s e t s ) w a s p r o b a b l y c a u s e d b y s t r e s s e d g r o w t h

c o n d i t i o n s

i n g r e e n h o u s e s . T h i s r e p r o d u c t i v e

s t r a t e g y i s a t r a i t o b s e r v e d i n m a n y w i l d t a x a s u c h a s

A . v i n e a l e , r a r e l y i n t h e C o m m o n O n i o n

g r o u p b u t

s t i l l f r e q u e n t l y i n t h e P r o l i f e r u m g r o u p .

T h e u s e o f n e u t r a l m a r k e r s a l l o w e d t h e s e e d -

p r o p a g a t e d s h a l l o t t o b e c o m p a r e d w i t h o n i o n s a n d

v e g e t a t i v e l y p r o p a g a t e d s h a l l o t s . N o t s u r p r i s i n g l y ,

t h e d e n d r o g r a m ( F i g . 2 ) s h o w e d t h a t d i f f e r e n t i a t i o n

i n r e l a t i o n t o r e p r o d u c t i v e m o d e w a s m o r e a n c i e n t

t h a n t h e g e o g r a p h i c a l d i f f e r e n t i a t i o n . T h e ' e c h a l o t e

g r i s e ' ( S - 1 6 a n d S - 2 0 ) n e v e r

f l o w e r s i n n a t u r a l c o n d i -

t i o n s , a l t h o u g h f l o w e r i n g c a n b e i n d u c e d b y s e v e r e

s t r e s s . I t s d i v e r g e n c e f r o m t h e o t h e r v e g e t a t i v e l y

p r o p a g a t e d s h a l l o t s h a s a l r e a d y b e e n s u g g e s t e d f r o m

m o r p h o l o g i c a l c h a r a c t e r i s t i c s s u c h a s b u l b s k i n ,

u m b e l m o r p h o l o g y a n d r o o t t y p e ( M e s s i a e n e t a . ,

1 9 9 3 ) . O u r r e s u l t s a r e i n a g r e e m e n t w i t h t h i s o b s e r -

v a t i o n . T h e m o l e c u l a r s t u d y s u g g e s t s t h a t t h e s e e d -

p r o p a g a t e d s h a l l o t s h o u l d b e c l a s s i f i e d i n t h e o n i o n

c l u s t e r . F u r t h e r m o r e t h e d e n d r o g r a m r e v e a l e d t h a t

t h i s s e x u a l f o r m w a s c l o s e r t o E u r o p e a n o n i o n s t h a n

t o t r o p i c a l o n e s .

T h e g e o g r a p h i c a l d i f f e r e n t i a t i o n f o u n d i n t h e

m o r p h o l o g i c a l s t u d y w a s c o n f i r m e d b y R A P D

p o l y m o r p h i s m . R o u a m b a ( 1 9 9 2 ) h a s p r o p o s e d t h a t

f r o m t h e p r i m a r y c e n t r e o f d i v e r s i t y l o c a t e d i n

c e n t r a l A s i a t w o i n d e p e n d e n t p a t h w a y s o f m i g r a t i o n

t o E u r o p e a n d t o A f r i c a l e d t o a d a p t i v e r a d i a t i o n o f

o n i o n s . I f t h i s h y p o t h e s i s i s v a l i d , o u r r e s u l t s s h o w

t h a t g e n e f l o w h a s p r o b a b l y o c c u r r e d b e t w e e n E u r o -

p e a n a n d t r o p i c a l g e n e p o o l s a f t e r t h e i r i n i t i a l

d i f f e r e n t i a t i o n .

F u r t h e r s t u d i e s o n t h e d i v e r s i t y f o u n d i n w i l d

s p e c i e s ( s u c h a s A . p s k e m e n s e o r A . v a v i l o v i i ) w i l l



7/7


h e l p t o d e t e r m i n e w h e t h e r t h e d o m e s t i c a t i o n

p r o c e s s o f A . c e p a h a s l e d t o a d e c r e a s e i n g e n e t i c

d i v e r s i t y t h r o u g h b o t t l e n e c k e v e n t s .

A c k n o w l e d g e m e n t s

W e

t h a n k P r o f e s s o r A . S a r r , P r o f e s s o r M . K l a a s , D r

H J . M a a B a n d D r J . S h y k o f f f o r v a l u a b l e c o m m e n t s

o n t h e m a n u s c r i p t . W e g r a t e f u l l y a c k n o w l e d g e D r R .

K a h a n e , D r F . C o h a t , D r A . R o u a m b a , M r E .

G o r i n , M r 0 . D a v i d a n d M r s C . D e s f e u x f o r k i n d l y

p r o v i d i n g p l a n t m a t e r i a l .

R e f e r e n c e s

A T K I N ,

J . D . 1 9 5 3 . G e n e t i c a n d C y t o l o g i c a l S t u d i e s o f t h e

H y b r i d A l l i u m c e p a x A l l i u m a s c a l o n i c u m . P h . D . t h e s i s ,

U n i v e r s i t y o f C a l i f o r n i a ( D a v i s ) , C A .

B A R K , 0 . H . A N D H A V E Y ,

M . j .

1 9 9 5 .

S i m i l a r i t i e s a n d r e l a -

t i o n s h i p s a m o n g p o p u l a t i o n s o f t h e b u l b o n i o n a s e s t i -

m a t e d b y n u c l e a r R F L P s . T h e o r A p p . G e n e t . , 9 0 ,

4 0 7 — 4 1 4 .

B O H A N E C , B . , J A K S E , M . A N D J A V O R N I K , B . 1 9 9 5 . S t u d i e s o f

g y n o g e n e s i s i n o n i o n ( A i l i u m c e p a L . ) : i n d u c t i o n p r o c e -

d u r e s a n d g e n e t i c a n a l y s i s o f r e g e n e r a n t s . P l a n t S c i . ,

1 0 4 ,

2 1 5 — 2 2 4 .

B R A D E E N , J . M . A N D H A V E Y , M . i . 1 9 9 5 . R e s t r i c t i o n f r a g -

m e n t l e n g t h p o l y m o r p h i s m s r e v e a l c o n s i d e r a b l e n u c l e a r

d i v e r g e n c e w i t h i n a w e l l - s u p p o r t e d m a t e r n a l d a d e i n

A l l i u m s e c t i o n C e p a ( A l l i a c e a e ) . A m . J . B o t . , 8 2 ,

1 4 5 5 — 1 4 6 2 .

B R E W S T E R , J . L . 1 9 7 7 . T h e p h y s i o l o g y o f o n i o n . H o r t .

A b s t r . , 4 7 ,

1 7 — 2 3 .

C A S T I G L I O N E , S . , W A N G , G . , D A M I A N I , 0 . , B A N D I , C . , B I S O F F I ,

S . A N D S A L A , F . 1 9 9 3 . R A P D f i n g e r p r i n t s f o r i d e n t i f i c a -

t i o n a n d f o r t a x o n o m i c s t u d i e s o f e l i t e p o p l a r ( P o p u l u s

s p p . ) c l o n e s . T h e o r A p p . G e n e t . , 8 7 , 5 4 — 5 9 .

H A N E L T , P . , S C H U L T Z E - M O T E L , J . , F R I T S C H , R . , K R U S E , J . ,

M A B , H . 1 . , O H L E , H . A N D P I S T R I C K , K . 1 9 9 2 . I n f r a g e n e r i c

g r o u p i n g o f A i l i u m —

t h e

G a t e r s l e b e n a p p r o a c h . I n :

H a n e l t , P . , H a m m e r , K . a n d K n u p f f e r , H . ( e d s ) T h e

G e n u s A l l i u m — T a x o n o m i c P r o b l e m s a n d G e n e t i c R e s o u r -

c e s , P r o c e e d i n g s o f a n I n t e r n a t i o n a l S y m p o s i u m , p p .

1 0 7 — 1 2 3 . G a t e r s l e b e n .

T h e

G e n e t i c a l S o c i e t y o f G r e a t B r i t a i n , H e r e d i t y , 7 8 , 4 0 3 — 4 0 9 .

J A C C A R D , P . 1 9 0 8 . N o u v e l l e s r e c h e r c h e s s u r I a d i s t r i b u t i o n

f i o r a l e . B u l l . S o c . V a u d . S c i . N a t . , 4 4 , 2 2 3 — 2 7 0 .

M A A B , H . I . A N D K L A A S , M . 1 9 9 5 . I n f r a s p e c i f i c d i f f e r e n t i a -

t i o n o f g a r l i c ( A l l i u m s a t i v u m L . ) b y i s o z y m e s a n d

R A P D m a r k e r s . T h e o r A p p . G e n e t . , 9 1 , 8 9 — 9 7 .

M E S S I A E N , C . M . , C O H A T , J . , L E R O U X , J . P . , P I C H O N , M . A N D

B E Y R I E S , A . 1 9 9 3 . I n : I N R A ( e d . ) L e s A l l i u m A l i m e n -

t a i r e s R e p r o d u i t s p a r V o i e V e g e t a t i v e , p p . 1 9 5 — 1 9 8 . P a r i s .

M O R R I S O N , D . F . 1 9 9 0 . M u l t i v a r i a t e S t a t i s t i c a l M e t h o d s , 3 r d

e d n . M c G r a w - H i l l P u b l i s h i n g C o m p a n y , N e w Y o r k .

N E I ,

M . A N D

L I ,

W .

H . 1 9 7 9 . M a t h e m a t i c a l m o d e l f o r s t u d y -

i n g g e n e t i c v a r i a t i o n i n t e r m s o f r e s t r i c t i o n e n d o n u -

c l e a s e s . P r o c . N a t . A c a d . S c i . U S . A . , 7 4 , 5 2 6 7 — 5 2 7 3 .

P E F F L E Y , E . B . A N D O R O Z C O - C A S T I L L O , c . 1 9 8 7 . P o l y m o r -

p h i s m o f i s o z y m e s w i t h i n p l a n t i n t r o d u c t i o n s o f A i l i u m

c e p a L . a n d A i l i u m f i s t u l o s u m L . H o r t S c i . , 2 2 , 9 5 6 — 9 5 7 .

R I C R O C H , A . , P E F F L E Y , E . B . A N D B A K E R , R . j .

1 9 9 2 .

C h r o m o s o m a l l o c a t i o n o f r D N A i n A i l i u m : i n s i t u

h y b r i d i z a t i o n u s i n g b i o t i n - a n d f l u o r e s c e i n - l a h e l l e d

p r o b e . T h e o r A p p . G e n e t . , 8 3 , 4 1 3 — 4 1 8 .

R O V A M B A , A . 1 9 9 2 . A n a l y s e c o n j o i n t e p a r l e s m a r q u e u r s

a g r o - m o r p h o l o g i q u e s e t l e s a l i o z y m e s d e I a d i v e r s

g é n é t i q u e d e p o p u l a t i o n s d ' o i g n o n ( A l l i u m c e p a L . )

d ' A f r i q u e d e l ' O u e s t . M . S c . t h e s i s , U n i v e r s i t y o f P a r i s

V I .

R O U A M B A , A . , R I C R O C H , A . A N D S A R R , A . 1 9 9 3 . C o l l e c t i n g

o n i o n s g e r m p l a s m i n w e s t A f r i c a . F A O / I B P R G P l a n t

G e n e t i c R e s o u r c e s N e w s l . , 9 4 / 9 5 , 1 5 — 1 7 .

S A G H A I - M A R O O F , M . A . , S O L I M A N , K . M . , J O R G E N S E N , R . A .

A N D A L L A R D , R . w . 1 9 8 4 . R i b o s o m a l D N A s p a c e r l e n g t h

p o l y m o r p h i s m i n b a r l e y : M e n d e l i a n i n h e r i t a n c e ,

c h r o m o s o m a l l o c a t i o n a n d p o p u l a t i o n d y n a m i c s . P r o c .

N a t . A c a d . S c i . U S A . , 8 1 , 8 0 1 4 — 8 0 1 8 .

S A R R , A . A N D P E R N E S , i . 1 9 8 8 . A n a l y s e s m u l t i v a r i é e s d e

d e s c e n d a n c e s d e r é t r o c r o i s e m e n t s d e d i s t o r s i o n s d e

s é g r é g a t i o n d e c a r a c t è r e s q u a n t i t a t i f s c h e z l e m u

( P e n n i s e t u m s y p h o i d e s ( B u r m . ) S t a p f e t H u b b . ) . G e n o m e ,

3 0 , 4 1 1 — 4 2 2 .

W I L K I E , S . E . , I S A A C , P . 0 . A N D S L A T E R , R . . i . 1 9 9 3 . R a n d o m

a m p l i f i e d D N A ( R A P D ) m a r k e r s f o r g e n e t i c a n a l y s i s i n

A l l i u m . T h e o r A p p . G e n e t . , 8 6 , 4 9 7 — 5 0 4 .

Z E V E N , A . C . A N D Z H U K O V S K Y , P . M . 1 9 7 5 . D i c t i o n a t y o f

C u l t i v a t e d P l a n t s a n d t h e i r C e n t r e s o f D i v e r s i t y , p p .

2 1 9 — 2 4 4 . C e n t r e f o r A g r i c u l t u r a l P u b l i s h i n g a n d D o c u -

m e n t a t i o n , W a g e n i n g e n .

(1997) assessment of genetic relationships

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