jurnal rizkaa

Journal Reading

Respiratory Viruses and Bacteriaamong Pilgrims

during the 2013 Hajj

Rizka

JUDUL

Virus dan Bakteri Pernapasan Diantara Jamaah

Haji Selama Ibadah Haji 2013

PENULISSamir Benkouiten, Rémi Charrel, Khadidja Belhouchat, Tassadit

Drali, Antoine Nougairede,

Nicolas Salez, Ziad A. Memish, Malak al Masri, Pierre-Edouard

Fournier, Didier Raoult,

Philippe Brouqui, Philippe Parola, and Philippe Gautret

PENDAHULUAN

Lebih dari 2 juta Muslim berkumpul setiap tahun di

Arab Saudi untuk berziarah ke tempat-tempat suci

Islam yang dikenal sebagai Haji.

Penyakit pernapasan merupakan penyebab utama

konsultasi dalam fasilitas perawatan kesehatan primer

di Mina, Arab Saudi, selama haji

Pneumonia adalah penyebab utama rawat inap di unit

perawatan intensif

Sejumlah penelitian telah menunjukkan prevalensi yang

tinggi dari gejala pernapasan antara jamaah

Virus pernapasan, terutama virus influenza, adalah

penyebab paling umum dari infeksi pernapasan akut di

antara jamaah

Kami baru-baru ini melaporkan akuisisi infeksi

rhinovirus dan Streptococcus pneumoniae oleh

jamaah Perancis selama musim haji 2012 dan

menyorot potensi penyebaran infeksi ini ke negara

asal jamaah haji setelah mereka kembali

Namun, tidak satupun dari para jamaah Perancis

positif untuk coronavirus sindrom pernapasan Timur

Tengah (Mers-CoV) tahun 2012 dan 2013

Dalam studi ini, kami mengumpulkan spesimen

hidung dan tenggorokan yang dipasangkan dan

diambil dari jamaah dewasa yang berangkat dari

Marseille, Prancis ke Mekah, Arab Saudi, untuk

musim haji 2013

TUJUAN PENELITIAN

Tujuan utamanya adalah untuk menentukan

prevalensi virus dan bakteri pernapasan yang paling

umum setelah kembalinya jamaah dari haji

Tujuan kedua adalah untuk mengevaluasi variasi

tahunan potensi akuisisi patogen pernapasan ini

dengan membandingkan hasil dari musim haji 2012

dan 2013

METODE

Peziarah yang direncanakan untuk berpartisipasi dalam

haji 2013 direkrut pada 15 September 2013, di sebuah

agen perjalanan khusus pribadi di Marseille, Perancis,

yang menyelenggarakan perjalanan ke Mekkah

Calon peserta diminta untuk berpartisipasi dalam

penelitian atas dasar sukarela jika mereka ≥ 18 tahun

dan mampu memberikan persetujuan

Peserta

Desain Studi

Studi kohort prospektif

Peserta diambil sampel dan ditindaklanjuti sebelum berangkat

dari Prancis (pada 2 Oktober 2013) dan segera sebelum

meninggalkan Arab Saudi (pada 24 Oktober 2013)

Setelah dimasukkan dalam penelitian ini, peserta

diwawancarai oleh penyidik berbahasa Arab yang

menggunakan kuesioner standar pra-perjalanan yang

mengumpulkan informasi mengenai karakteristik demografi

dan riwayat kesehatan masing-masing peserta

Sebuah kuesioner pasca-perjalanan yang mengumpulkan

data dan informasi klinis mengenai status dan kesesuaian

vaksinasi dengan langkah-langkah pencegahan dilakukan

selama wawancara tatap muka 2 hari sebelum jamaah

kembali ke Prancis oleh penyidik tunggal yang

bergabung dengan jamaah setelah haji

Demam subjektif didefinisikan sebagai perasaan demam

menurut laporan para jamaah

Influenza-like illness (ILI) didefinisikan sebagai adanya

batuk, sakit tenggorokan, dan demam subjektif

Spesimen pernafasan

Spesimen sampel hidung dan tenggorokan yang telah

dipasangkan, dikumpulkan dari masing-masing peserta

dengan menggunakan rigid cotton-tipped swab

applicators (Medical Wire and Equipment, Corsham,

UK) 10 hari (September 22, 2013) sebelum peserta

berangkat dari Prancis (spesimen pra-Haji) dan hanya 1

hari (23 Oktober 2013) sebelum mereka meninggalkan

Arab Saudi (spesimen pasca-Haji)

Spesimen hidung dan tenggorokan yang dikumpulkan

dari peserta ditempatkan di media transportasi virus

(Virocult dan Transwab, masing-masing; Sigma, St.

Louis, MO, USA) pada saat pengumpulan dan disimpan

pada 20 °C sebelum diangkut ke laboratorium di

Marseille untuk penyimpanan pada -80 °C dalam waktu

48 jam dari pengumpulan

Deteksi Virus Pernapasan

Sampel hidung secara independen diuji seperti yang

dijelaskan untuk virus influenza A/H3N2, virus influenza B,

virus influenza C, dan A (H1N1) virus pdm09; human

adenovirus; human bocavirus, human cytomegalovirus;

human coronaviruses (HCoVs); human enterovirus; human

metapneumovirus; human parainfluenza viruses (HPIVs);

human parechovirus; human respiratory syncytial virus; and

human rhinovirus (HRV) dengan menggunakan real-time

reverse transcription PCRs

HCoVs dan HPIVs manusia terdeteksi dengan

menggunakan HCoV/HPIV R-Gene Kit

(Argene/bioMérieux, Marcy l’Etoile, France)

Sampel HCoV-positif maka di-genotipe dengan

menggunakan FTD Respiratory Pathogens 21 Kit

(Diagnostik Jalur Cepat, Luksemburg, Luksemburg)

Deteksi Bakteri Pernapasan

Sampel tenggorokan secara independen diuji seperti yang

dijelaskan dengan menggunakan PCR real-time kuantitatif

untuk Streptococcus pneumoniae, Neisseria meningitidis,

Bordetella pertusis, dan Mycoplasma pneumoniae

Urutan semua primer dan penyelidikan telah dilaporkan.

Dalam penelitian ini, reaksi dilakukan dengan menggunakan

7900HT Fast Real-Time PCR System (Applied Biosystems,

Foster City, CA, USA)

Analisis statistik

Pearson χ2 dan Fisher exact test, yang sesuai, digunakan

untuk menganalisis variabel kategori

Analisis statistik dilakukan dengan menggunakan SPSS paket

perangkat lunak versi 17 (SPSS Inc, Chicago, IL, USA)

nilai p ≤0.05 dianggap signifikan

Hasil

Sebanyak 129 orang diundang untuk berpartisipasi dalam penelitian iniPeserta : 77 perempuan (59,7%) dan 52 laki-laki (40,3%) rata-rata (SD) usia 61,7 (9,8) tahun (rentang usia 34-85 tahun) (Tabel 1)Meskipun sebagian besar (94,6%) peserta lahir di Afrika utara, sebagian besar (94,5%) telah hidup selama bertahun-tahun di Marseille atau kota-kota sekitarnya. Lebih dari setengah dari peserta (52,7%) dilaporkan memiliki ≥ 1 penyakit kronis

Karakteristik Peserta Studi

Semua kuesioner pasca-perjalanan diselesaikan Selama 3-minggu tinggal di Arab Saudi (03-24

Oktober 2013), sebagian besar (90,7%) jamaah memiliki ≥ 1 gejala pernapasan, termasuk :– batuk (86,8%)– sakit tenggorokan (82,9%)– rhinorrhea (72,1%)– mialgia (50,4%)– demam (49,6%)– dyspnea (21,7%), – serta 47,3% memenuhi kriteria untuk ILI yang dilaporkan

sendiri (41,3% pada tahun 2012 vs 47,3% pada tahun 2013; p = 0,325)

Fitur klinis

Timbulnya gejala pernapasan mencapai puncak pada minggu

kedua (minggu 41) setelah kedatangan jamaah di Mekah dan

penurunan sesudahnya

90 (69,8%) jamaah masih memiliki gejala pernapasan sebelum

meninggalkan Arab Saudi pada saat sampling (minggu 43)

Hanya 1 jamaah (0,8%) dirawat di rumah sakit selama tinggal

di Arab Saudi (untuk pneumonia yang tidak tercatat)

Tidak ada kematian yang terjadi

Langkah pencegahan, 51,2% dari peserta melaporkan menerima

vaksinasi pneumokokus (Pneumo 23) dalam 5 tahun terakhir, yang

secara signifikan lebih tinggi daripada tingkat pada tahun 2012 (35,9%

pada tahun 2012 vs 51,2% pada tahun 2013; p = 0,013)

Tidak ada yang menerima vaksin influenza 2013 sebelum berangkat

untuk haji, namun 44,2% melaporkan telah menerima vaksin influenza

musiman pada tahun 2012 (31,8% di antara peserta <65 tahun vs

65,8% di antara peserta > 65 tahun; p = 0,001)

Selama tinggal di Arab Saudi, 53,5% jamaah melaporkan baik masker

yang sering digunakan (9,3%) atau penggunaan sesekali (44,2%);

93,0% menggunakan saputangan sekali pakai; 49,6% melaporkan sering

mencuci tangan; dan 67,4% menggunakan pembersih tangan

Gejala ILI kurang banyak dilaporkan oleh orang yang melaporkan

menerima vaksin influenza pada tahun 2012 dibandingkan dengan

laporan oleh orang yang tidak divaksinasi (34,1% vs 61,5%, masing-

masing; p = 0,009) (rasio ganjil 0,32, 95% CI 0,14-0,76)

Sebaliknya, tidak ada tindakan pencegahan lainnya ditemukan menjadi

efektif dalam mencegah gejala ILI selama tinggal di Arab Saudi

Spesimen sampel hidung pra-Haji dan pasca-Haji diperoleh dari

121 (93,8%) dan 129 (100%) masing-masing peserta

Sebanyak 26 (21,5%) dari 121 spesimen pra-Haji yang diuji

positif untuk virus ≥1 dibandingkan dengan 50 (38,8%) dari 129

spesimen pasca-Haji yang diuji (p = 0,003)

Selain itu, 36 (29,8%) peserta telah mengakuisisi ≥1 virus selama

tinggal di Arab Saudi

Deteksi Virus Pernapasan

Prevalensi coronavirus E229 manusia (HCoV-E229) secara

signifikan lebih tinggi pada spesimen pasca haji dari pada spesimen

pra-Hajj (12,4% vs 0%; p <0,001)

Sebuah prevalensi tinggi HRV diamati pada spesimen pra-Haji dan

pasca-Haji (14,0% dan 14,7%, masing-masing; p = 0,88)

Dari 19 peserta dengan spesimen pasca-Haji positif untuk HRV, 17

(89,5%) telah memperoleh infeksi selama mereka tinggal di Arab

Saudi

Prevalensi virus influenza A dan B secara signifikan lebih tinggi pada

spesimen pasca-Haji daripada spesimen pra-Hajj(7,8% vs 0%; p =

0,002)

Coronavirus HKU1, NL63, dan OC43; human enterovirus; human

metapneumovirus; HPIV; dan human respiratory syncytial virus juga

diperoleh selama tinggal di Arab Saudi oleh rendahnya proporsi peserta

Dari 50 peserta dengan spesimen pasca-Haji positif untuk ≥1 virus

pernapasan, 43 (86,0%) melaporkan ≥1 gejala pernapasan selama

mereka tinggal di Arab Saudi, 37 di antaranya (86,0%) masih memiliki

gejala pernapasan pada saat sampling

dari 79 peserta dengan spesimen pasca-Haji negatif untuk virus

pernapasan, 74 (93,7%) melaporkan ≥1 gejala pernapasan selama

mereka tinggal Arab Saudi, 53 di antaranya (71,6%) masih memiliki

gejala pernapasan pada saat sampling

Tak satu pun dari langkah-langkah pencegahan ditemukan efektif

dalam mencegah virus pernafasan pada spesimen pasca haji

Spesimen tenggorokan Pre-Haji dan pasca-Haji diperoleh dari 126

(97,7%) dan 129 (100%) masing-masing peserta

Tak satu pun dari peserta positif untuk N. meningitidis, B.

pertusis, atau M. pneumoniae

Sebanyak 63 (50,0%) dari spesimen 126 pra-Hajj diuji dan 80

(62,0%) dari 129 spesimen pasca-Haji yang diuji positif untuk S.

pneumoniae (p = 0,053)

Deteksi Bakteri Pernapasan

80 peserta dengan spesimen pasca-Haji positif untuk S.

pneumoniae, 29 (36,3%) telah memperoleh infeksi selama

mereka tinggal di Arab Saudi

63 peserta spesimen pra-Hajj positif untuk S. pneumoniae, 12

(19,0%) kemudian memiliki spesimen pasca-Haji yang negatif

untuk S. pneumoniae

10 (83,3%) di antaranya melaporkan telah menerima obat

antimikroba selama mereka tinggal di Arab Saudi:– 7 menerima amoksisilin

– 2 menerima amoksisilin dan ciprofloxacin

– 1 menerima azitromisin

80 peserta spesimen pasca-Hajj positif yang untuk S.

pneumoniae, 73 (91,2%) melaporkan ≥1 gejala

pernapasan selama mereka tinggal di Arab Saudi, 56

(76,7%) di antaranya masih memiliki gejala pernapasan

pada saat sampling

Di antara 66 peserta yang melaporkan telah menerima vaksinasi

pneumokokus dalam 5 tahun sebelum bepergian ke Arab Saudi, 37

(56,1%) memiliki spesimen pasca-Haji yang positif untuk S.

pneumoniae

Prevalensi S. pneumoniae dalam spesimen pasca-Haji secara

signifikan lebih rendah pada orang yang melaporkan menggunakan

pembersih tangan selama mereka tinggal di Arab Saudi daripada

pada peserta yang tersisa (55,2% vs 76,2%; p = 0,021) (rasio odds

0,39, 95% CI 0,17-0,88) dan sedikit lebih rendah pada orang yang

melaporkan mencuci tangan lebih sering dari biasanya selama

mereka tinggal di Arab Saudi dari pada orang yang melaporkan

mencuci tangan biasa (54,7% vs 69,2%; p = 0,08)

80 peserta spesimen pasca-Hajj yang positif untuk S. pneumoniae,

27 (33,8%) koinfeksi dengan ≥1 virus (Gambar 2). Dari 49 peserta

spesimen pasca-Haji yang negatif untuk S. pneumoniae, 23 (46,9%)

terinfeksi dengan virus ≥1 (33,8% vs 46,9%; p = 0,14)

DISKUSI Dalam studi ini, kami mengkonfirmasi bahwa haji dikaitkan dengan

terjadinya peningkatan gejala pernafasan di sebagian besar jamaah

8 dari 10 jamaah menunjukkan akuisisi patogen pernapasan hidung

atau tenggorokan

Kami menegaskan dominasi HRV dan S. pneumoniae antara patogen

yang diperoleh selama jamaah tinggal

Kami juga menyoroti akuisisi coronavirus selain Mers-CoV,

terutama HCoV-E229, oleh jamaah selama ibadah haji 2013Pada

2012 dan 2013, hasil skrining untuk infeksi Mers-CoV di kohort

yang berbeda pada jamaah, termasuk kelompok ini, adalah negatif

Akhirnya, kami menemukan bahwa dibandingkan dengan perolehan

HRV dan HCoV-E229, virus influenza diperoleh pada frekuensi yang

lebih rendah di kalangan jamaah

Penelitian ini merupakan kelanjutan dari studi kami sebelumnya pada tahun

2012

Kita memperluas penyelidikan terhadap virus tambahan, termasuk human

bocavirus, human cytomegalovirus, coronaviruses, human parechoviruses,

HPIV, dan menunjukkan frekuensi tinggi infeksi HCoV-E229 pada jamaah

yang kembali dari ibadah haji

Prevalensi HRV lebih rendah pada 2012 dibandingkan tahun 2013, baik

sebelum berangkat dari Perancis (3,0% pada tahun 2012 vs 14,0% pada

tahun 2013; p = 0,001) dan sebelum meninggalkan Arab Saudi (8,4% pada

tahun 2012 vs 14,7% pada tahun 2013; p = 0,092)

Namun, sampel yang diperoleh dari jamaah sebelum berangkat dari

Prancis selama studi 2012 disimpan pada suhu kamar (20 °C) untuk

≤ 30 hari sebelum diproses

Protokol ini mungkin telah mengakibatkan degradasi materi genetik,

yang mungkin berkontribusi meremehkan frekuensi infeksi pada

2012

Pada 2013, semua sampel yang dikumpulkan selama periode

penelitian disimpan pada -80 °C dalam waktu 48 jam dari

pengumpulan

Prevalensi S. pneumoniae juga secara signifikan lebih rendah pada

tahun 2012 dibandingkan tahun 2013 sebelum jamaah berangkat dari

Perancis (7,3% vs 50,0%; p <0,001) dan sebelum mereka

meninggalkan Arab Saudi (19,5% vs 62,0%; p <0,001)

Namun, pada studi 2012, spesimen swab hidung yang dikumpulkan

dari peserta bukan spesimen swab tenggorokan, yang digunakan

dalam studi 2013

Dalam studi selanjutnya, memeriksa jamaah pada interval yang lebih

sering mungkin memberikan informasi yang berguna

Batuk saat haji kemungkinan hasil dari infeksi saluran pernapasan

oleh berbagai virus pernafasan, termasuk HRV dan HCoV-E229,

yang diketahui menyebabkan infeksi saluran pernapasan ringan atau

serius

Hasil kami tidak dapat diekstrapolasi untuk semua jamaah. Sebuah

studi skala besar didasarkan pada desain yang sama dan dilakukan di

sejumlah besar jamaah dari berbagai negara akan berguna

Vaksinasi dengan vaksin pneumokokus konjugasi harus

dipertimbangkan untuk orang dengan faktor risiko medis untuk

penyakit pneumokokus invasif

Penggunaan pembersih tangan selama tinggal di Arab Saudi

dilaporkan oleh lebih dari dua pertiga dari jamaah di survei kami dan

dikaitkan dengan prevalensi yang lebih rendah dari pengangkutan S.

pneumoniae

Studi intervensi sangat dibutuhkan yang mengevaluasi efektivitas

influenza dan vaksin pneumokokus dan penggunaan pembersih

tangan dan memonitor gejala pernapasan dan pengangkutan patogen

pernafasan pada kohort besar jamaah.

P I C O

Patient/population 129 jamaah pada tahun 2013

Intervention Diuji oleh PCR untuk virus dan bakteri pernapasan

Comparison-

Outcome– untuk menentukan prevalensi virus dan bakteri pernapasan

yang paling umum setelah kembalinya jamaah dari haji

– untuk mengevaluasi variasi tahunan potensi akuisisi patogen

pernapasan ini dengan membandingkan hasil dari musim haji

2012 dan 2013

Terima kasih…