ribozimas jrq

JULIO RUIZ QUIROZ

DNA cleavage catalysed by the ribozyme from Tetrahymena

Herschlag D. & Cech T.

Nature 1990, 344: 405-409

JULIO RUIZ QUIROZ

1982 CechProtozoo ciliado Tetrahymena thermophylaObservó que el corte y empalme de un intrón del Pre-RNA era autocatalíticoPor su característica de clivar otras cadenas de RNASe les denominó RIBOZIMAS

Hipotesis: “mundo de RNA”

Su estructura a semejanza de las enzimas, presenta plieguesLo que da origen a estructuras tridimensionales

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RNA como enzima

Algunos RNA son capacesde catalizar reacciones químicasdel mismo modo que las enzimas:son las ribozimas

Ribozimahammerhead

Participan en el procesadodel RNA transcrito primarioy en la formación de enlacepeptídico en la síntesis deproteínas.

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El 2-OH’ del RNA, actúa como nucleófilo catalítico

Reacción catalizada por la ribozima hammerhead

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RIBOZIMAS NATURALES

GRUPO I INTRON Remueven intrones mediante dos

transesterificaciones produciendo uniones 3’-5’ y un 3’.OH

GRUPO II INTRONProducen el autoclivaje de intrones vía dos transesterificaciones, produciendo una unión inicial 2’-5’ y un 3’OH

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Reacciones catalizadas por las ribozimas: grupo I intrón (NOH: 3'-OH de una guanosina), grupo II intrón (NOH: 2'-OH de una adenosina dentro del intrón) y RNasaP (NOH: H2O).

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RIBOZIMAS

RIBONUCLEASA (RNAsa) PCataliza la hidrólisis sitio específica de

precursores de RNA

HAMMERHEAD (Cabeza de martillo)Cataliza el clivaje sitio-específico de sus

propias uniones fosfodiester por un ataque nucleofílico del 2’-OH al fosfato al ser escindido

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Estructura terciaria

Scott et al and Klug, Science 1996

HAMMERHEAD RIBOZIMA

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RIBOZIMAS

TIPO VIRUS DE LA HEPATITIS DELTA (HDV) Y HORQUILLA (HAIRPIN)

Catalizan la misma reacción que la ant., y son responsables de clivar intermed. generados durante la replicación de HDV y de virus satélites de RNA de las plantas.

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RIBOZIMA HAIRPIN

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RIBOZYMA DE LA HEPATITIS DELTA

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Ribozima derivada del Tetrahymena thermophylaCataliza el clivaje de secuencias específicas de un oligodeoxinucleótido

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Vía del auto-emplamamiento de T.termophila pre-ribosomal RNA

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La ribozima de Tetrahymena ... 1010 vecesSe creia que el sustrato solo era RNACech reportaQue la ribozima Tetrahymena cataliza el clivaje de secuencia específica de DNA monocatenario.La caracterización de esta reacción servirá para entender mejorLas interacciones sustrato-ribozima.

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