association study of candidate gene marker of fat to
TRANSCRIPT
การศกษาความสมพนธของยนเครองหมายทเกยวของกบลกษณะสดสวนไขมนตอโปรตนในน านมในโคนม1
ลกผสมไทยโฮลสไตน 2
Association study of candidate gene marker of fat to protein ratio of milk in Thai Holstein crossbred 3
บทคดยอ: การศกษาครงนมวตถประสงคเพอศกษาผลของยนหลก LEP, ARL4, ATP1A1, HP3,BTN, STAT5A ตอ4
ลกษณะสดสวนไขมนตอเปอรเซนตโปรตนในน านมจากตวอยางของโคนมลกผสมไทยโฮสไตน โดยทาการเกบตวอยาง5 5
เลอด (หรอ...)ของโคนมลกผสมไทยโฮสไตนจ านวน145 ตวอยาง นามาตรวจสอบรปแบบจโนไทปของแตละยน ดวย6
เทคนค PCR-RFLP ผลจากการวเคราะหรปแบบจโนไทปจากกลมยนทศกษาพบ 2 รปแบบ (ATP1A1, HP3, BTN) และ 3 7
รปแบบ (LEP, ARL4A, STAT5A ) มความถแตละรปแบบเกน 5 เปอรเซนต แสดงใหเหนถงความหลากหลายของตวอยาง8
ทน ามาใชศกษา และผลจากการวเคราะหความสมพนธระหวางยนกบลกษณะสดสวนไขมนตอโปรตนพบรปแบบของยน 9
ATP1A1 มแนวโนมทจะสมพนธกบสดสวนไขมนตอโปรตนโดยพบวาจโนไทป AB มแนวโนมของคาสดสวนไขมนตอ10
โปรตนสงกวาจโนไทป BB นอกจากนจโนไทป AB ยงมแนวโนมของคาเปอรเซนตไขมนสงกวา จโนไทป BB ดวยเชนกน 11
ดงนนจากการศกษาครงนพบวามความเปนไปไดทจะน ายน ATP1A1 มความเปนไปไดทจะน าไปใชเปนยนเครองหมาย12
ส าหรบสดสวนไขมนตอโปรตนในน านมส าหรบโคนมลกผสมไทยโฮลสไตน 13
ค าส าคญ: สดสวนไขมนมนตอโปรตน ยนเครองหมาย โคนมไทยลกผสมโฮลสไตน 14
ABSTRACT: The objective of this study was to study effect of major genes follow LEP, ARL4, ATP1A1, HP3, 15
BTN, and STAT5A. That gene may be associated with fat to protein ratio which we use 145 cows Thai-16
Holstein crossbred for collect and perform using PCR-RFLP analysis. The results found genotype frequency of 17
genes more than 5 percentages which we can conclude have polymorphism in this population. In addition the 18
result of association between major genes with fat to protein ratio we found the pattern ATP1A1 gene have 19
tentative association with fat to protein ratio which AB genotype show high fat to protein ratio than BB 20
genotype. Also AB genotype of ATP1A1 has tentative association with fat percentage too. So the result of this 21
study we found probability candidate gene is ATP1A1 to fat to protein ratio. 22
Keywords: fat to protein ratio, candidate gene, Thai-Holstein crossbred 23
ขอคดเหน[c1]: ควรเปลยนชอเรองใหม เนองจากชอเรองไมสอกบเนอหา เพราะในเนอหามทง ไขมน โปรตน สดสวนไขมนตอโปรตน และปรมาณนานม 305 วน เชน “การศกษาความสมพนธของยน LEP,
ARL4, ATP1A1, HP3,BTN, STAT5A ตอปรมาณ และคณภาพของนานมโคนมลกผสมไทยโฮลสไตน”
ขอคดเหน[c2]: แนะน ำอำจจะลองปรบชอเรองภำษำองกฤษเปน Study on candidate gene marker
associated with fat to protein ratio of milk in Thai-Holstein crossbred
ขอคดเหน[c3]: ควรระบวธการและเครองมอทใชวเคราะห
ขอคดเหน[c4]: ระบคา P-value
ขอคดเหน[c5]: นาจะแนะนาใหมการศกษาเพอยนยนผลอกครงมากกวาทจะแนะนาใหนาไปใชเลย เนองจากเปนเพยงแนวโนม
ขอคดเหน[c6]: ปรบใหสอดคลองกบทแกไขในภาษาไทยใหม/ ใน abstract ยงมความหมายไมชดเจนในบางประโยค โดยแนะน าปรบการเขยน abstract ใหม โดยไดแนะน าตามทแกไขเบองตน ...อยางไรกผ วจยสามารถเขยนภาษาองกฤษดวยรปประโยคแบบอนได
ขอคดเหน[c7]: ไมสอกบ “ยนเครองหมาย” นาจะเปน gene marker หรอ genetic marker
2
24
บทน า 25
ผลจากการคดเลอกทางพนธกรรมเพอเพมการใหผลผลตน านมในโคนมแมจะเพมศกยภาพในการใหผลผลต26
น านมไดสงขน แตกลบสงผลกระทบตอประสทธภาพการสบพนธ และ ระยะเวลาในการใชงานโคนมต าลง มความเสยงตอ27
การเกดโรค รวมถงการเกดปญหาดานสมดลพลงงานเนองจากแมโคมความตองการใชพลงงานในการใหผลตน านมตาม28
การใหผลผลตทเพมขน และผลกระทบดงกลาวจะยงสงผลมาขนหากไดรบผลกระทบจากปจจยทางดานสภาพภมอากาศ29
รวมดวย ผลจากการขาดสมดลพลงงานในแมโคนนเปนปจจยทท าใหเกดปญหาดานสขภาพตอแมโคนนคอ มความเสยง30
ตอการเกดโรค และสงผลตอการใหผลผลตน านมตลอดระยะการใหน านม (Patton et al., 2007; Nydam et al., 2009) ซง31
ทผานมามการแกไขปญหาสมดลพลงงานโดยเนนการจดการรวมถงการคดเลอกทางพนธกรรมซงเปนแนวทางหนงท32
น ามาใชในการแกปญหาดงกลาว ลกษณะสมดลพลงงานมตวชวดทแสดงใหเหนถงการเกดภาวะขาดสมดลพลงงานหลาย33
ปจจย แตพบวาลกษณะสดสวนไขมนตอโปรตน (Fat to protein ration, FPR) เปนตวชวดทงายและสามารถชวดภาวะ34
สมดลพลงงานได Toni et al. (2011) พบวาการเปลยนแปลงของเปอรเซนตไขมน และเปอรเซนตโปรตนในน านมของโคนม35
ในชวงหลงคลอดเปนชวงทขาดสมดลพลงงานจะมเปอรเซนตไขมนเพมขน แตมเปอรเซนตโปรตนต าลง พรอมทงเมอ36
พจารณาสหสมพนธระหวาง FPR กบลกษณะสมดลพลงงานในชวงใหผลผลตน านมระหวางวนท 15 ถง วนท 90 ของการ37
ใหผลผลตท 0.62 ซงเปนสหสมพนธทอยในระดบปานกลางนนแสดงใหเหนวา FPR สามารถน ามาใชเปนตวชวดสมดล38
พลงงานในโคนมได และเมอพจารณาคาอตราพนธกรรมของลกษณะ FPR อยในชวง0.20-0.54 (Buttchereit et al., 39
2011) ผลจากการรายงานคาอตราพนธกรรมดงกลาวแสดงใหเหนวาลกษณะ FPR มความสามารถในการแสดงออกทาง40
พนธกรรมไดด ศนยผลตน าเชอพนธโคนม (2552) กลาววาการประเมนพนธแบบดงเดมใชเวลา 5-6 ป ซงนานกวาระบบ41
การประเมนพนธจโนม (genome) ทใชเวลาเพยง 2-3 ป เนองดวยเทคโนโลยดานอณพนธศาสตรใชขอมลทางพนธกรรม42
ของสตวรวมกบวธการดงเดม (conventional breeding) เพอประเมนพนธกรรม จงชวยใหมความแมนย าและ43
ความกาวหนาทางพนธกรรมของลกษณะทตองการปรบปรงพนธสงขน (จรรตน และคณะ, 2553) ซงขอมลทางพนธกรรม44
ทนยมคอ candidate gene เปนเครองหมายทางพนธกรรมทมอทธพลตอการแสดงออกของลกษณะทสนใจอยางชดเจน 45
ขอคดเหน[c8]: เขยนใหกระชบมากกวาน เกรนยาวมากไป และเขยนใหครอบคลมถงลกษณะอนๆ ทจะทาการศกษาดวย เพราะเนนเฉพาะ FPR อยางเดยว
ขอคดเหน[c9]: หมายถง GEBV หรอไม หากใชควรเขยนอธบายและระบใหชดเจน
ขอคดเหน[c10]: ควรม Ref.
3
จากการแสดงออกของล าดบเบสทแตกตางกนสงผลใหอลลลและการแสดงออกของลกษณะนนแตกตางกนอยางชดเจนจง46
เปนวธทไดรบความนยม 47
ส าหรบการตรวจหายนทมความสมพนธกบลกษณะการแสดงออกของลกษณะสดสวนไขมนตอโปรตน คอยน 48
Leptin (LEP) อยบนโครโมโซมแทงท 4 ซงเปนเปปไทดฮอรโมนทผลตจากเซลลไขมนมบทบาทตอการท างานของระบบ49
ประสาทสวนกลาง ทเกยวของกบการท างานของไฮโปทาลามสทควบคมเกยวกบการกนได สมดลพลงงาน ระบบสบพนธ 50
และมความสมพนธกบการใหผลผลตน านม (Liefers et al., 2002) ยน ADP-ribosylation factor-like 4A (ARL4A) อยบน51
โครโมโซมแทงท 4 ในโคนมท าหนาทเปน สารตงตน (substrate) ของเอมไซม N-myristoyltransferase และมผลตอ52
พลาสมาเมมแบรนซงม pH เปนตวควบคม การท างาน รวมทงเปนยนทเกยวของกบการขนสงสารระหวางเซลล โดยโคนม53
ในชวงของการใหน านมนนพบวามการแสดงออกของยนดงกลาวมากทสดพบวามความสมพนธตอการใหผลผลตน านม 54
(Irmgard et al., 2007; Rincon et al., 2009) ยน ATPase Na+/K+ transporting alpha 1 (ATP1A1) เปนรปรางชนด55
หนงของ enzyme The bovine Na+, K+-ATPase ซงมรปแบบชนดเอลฟา เอมไซมดงกลาวมความเกยวของใน56
กระบวนการตอบสนองตอสภาวะเครยดเนองจากความรอนทมผลใหเกดภาวะ oxidative stress และยงไวตอการ57
เปลยนแปลงของ Na+, K+ ทเกดจากภาวะ oxidative stress รวมทงยงเปนตวชวดในการควบคมระบบฮอรโมนของทง58
สองไอออน (Liu et al., 2010) ยน Heat Shock Protein 70-2 (HP3) เปนยนทมบทบาทในการชวยบกปองและรกษา59
สภาพของเซลลจากหลายปจจยยกตวอยางเชน ความรอนทจะสงผลกระทบตอเซลล (จฬานย, 2553) ยนดงกลาวจงม60
ความสมพนธกบลกษณะการทนตอสภาพอากาศรอนในโคนม ยน Butyrophillin (BTN) เปนโปรตนชนดหนงซงพบไดใน 61
Milk fat globule membrane ของสตวเลยงลกดวยนมเปนยนทควบคมลกษณะองคประกอบโปรตนและไขมนในโคนม62
ลกผสมโฮลสไตนฟรเชยน (สายใจ และคณะ, 2553; Ogorevc et al., 2009 as cited by Ron et al. 2007) ความสมพนธ63
ของ polymorphisms ใน exon ท 7 ของยน BTN/HaeIII และBTN/SchI ซงพบวาทงสองสวนมการแสดงออกทแตกตางกน64
ของเปอรเซนตไขมน สวนลกษณะปรมาณโปรตน และผลผลตน านมสมพนธกบ BTN/HaeIII (Muszynska et al., 2010) 65
ยน Signal Transducer and Activator of Transcription 5A (STAT5A) เปนปจจยหนงทเกยวของกบตอมน านม และม66
ผลตอการท างานของโปแลคตน (Prolactin) ,การแสดงออกของยนโปรตนน านม SNP ใน STAT5A มความเกยวของกบ67
ลกษณะผลผลตน านม เปอรเซนตไขมน ในโคนมพนธ Jersey, Polish Black และ White, และ US Holstein cattle ( 68
Khatib et al., 2008) ซงจากรายงานของยนดงกลาวจะเหนวาแตละยนมผลตอการเปลยนแปลงและเกยวของกบ69
ขอคดเหน[c11]: นาจะเปน “การรายงานยนทเกยวของกบกระบวนการสรางไขมน โปรตน และผลผลตนานม เชน...” เนองจาก Ref. ทนามาอางอง ไมไดพดถง FPR โดยตรง
4
เปอรเซนตไขมนและโปรตนดงนนในการศกษาครงนจงมวตถประสงคเพอศกษาความสมพนธผลของรปแบบยนหลก 70
LEPLeptin, ARL4, ATP1A1, HP3,BTN, และ STAT5A ตอลกษณะสดสวนไขมนตอเปอรเซนตโปรตนในน านม 71
72
วธการศกษา 73
ตวอยางและขอมลทใชในการศกษา 74
การศกษาครงนใชตวอยางเลอด?และขอมลจากแมโคนมลกผสมไทยโฮลสไตนจ านวน 145 ตว จากบรษทโคนม75
ฟารมโชคชย จงหวดนครราชสมา โดยแมโคแตละตวนนจะตองปรากฏขอมล ระดบเลอด วนทเกด วนทคลอด รวมทง76
ขอมลลกษณะทางเศรษฐกจดงน ขอมลการใหผลผลตน านม305วน (Aggregated milk yield 305-day, Milk 305-day) 77
เปอรเซนตไขมนนม (Milk fat percentage, %Fat) เปอรเซนตโปรตนนม (Milk protein percentage, %Pro) และสดสวน78
ไขมนตอโปรตน (Fat to protein ratio; FPR) 79
การสกดดเอนเอ 80
การสกดดเอนเอจากน าตวอยางเลอดโดยน ามาปนดวยความเรว 3,000 รอบตอนาท เปนเวลา 15 นาท เพอแยก81
เอาสวนของเมดเลอดขาวทแยกอยชนบนของชนเมดเลอดแดงใสหลอดใหม ลางตะกอนเมดเลอดแดงทปะปนมากบสวน82
ของเมดเลอดขาวดวย 0.9 เปอรเซนต NaCl ปรมาณ 4-5 มลลลตร เขยาเซลลใหสะอาด จากนน น าไปปนในเครองปน83
เหวยงทความเรว 2,500 รอบตอนาท เปนเวลา 5 นาท และท าซ าอก 2 ครง น าตะกอนทไดใสลงใน micro tube ขนาด 1.5 84
มลลลตร จากนนเตม Solution No.1 ปรมาณ 370 L ผสมใหเขากนดวย vortex ทงไวทอณหภมหอง 15 นาท (เขยา85
หลอดทก 5 นาท)น าไปปนทความเรว 10,000 rpm นาน1 นาท เทสวนใสทงเหลอไวแตตะกอน เตม Solution No.2 86
ปรมาณ 500 l vortex ประมาณ 5 วนาท น าไปปนทความเรว 10,000 rpm นาน 1 นาท เทสวนใสทงเหลอไวแตตะกอน87
ท าซ าขอ 4-5 อก 1 ครงลางตะกอนโดยการเตม Solution No.3 ปรมาณ 500 l จากนนน าไปปนทความเรว 10,000 rpm 88
นาน 1 นาท เทสวนใสทงเหลอไวแตตะกอน ผงตะกอนทงไวใหแหงทอณหภมหอง นาน 15 นาท เตมสารละลาย TE buffer 89
(หรอ DNA hydration) ปรมาณ 10-20 l (ขนกบปรมาณเลอดทใชเรมตน) Vortex นาน 5 วนาท น าไปอนใน water bath 90
หรอใน thermoblock ทอณหภม 55 oC นาน 2 ชม. ปนครงสดทายทความเรว 10,000 rpm นาน 5 นาท ดดเฉพาะสวนใส91
ของสารละลายดเอนเอใสลงในหลอดใหม และเกบทอณหภม -20 oC รอการใชงานตอไป 92
ขอคดเหน[c12]: ควรเพม วปส.หรอไม เนองจากในเนอหามมากกวาสดสวนไขมนตอโปรตนในนานม
ขอคดเหน[c13]: โปรดระบขอมลทนามาวเคราะหหาคา EBV วามกตวอยางในแตละลกษณะ (ใช 145 ตว?) พรอมทงใหเหตผลประกอบวาเหตใดจงใชทงชดขอมลลกษณะปรากฏ (คาสงเกต) และคา EBV
ทาไมไมเลอกอยางใดอยางหนง
ขอคดเหน[c14]: ควรใชค าใหสม าเสมอทงเอกสาร ตรวจสอบใหละเอยด
ขอคดเหน[c15]: หรอสามารถเขยนใหกระชบไดโดยใสอางองวธการจากงานวจยคนอนททาเชนเดยวกน เพอเปนการกระชบเนอหา (เนองจากวารสารแกนเกษตรก าหนดเนอหาไมเกน 15 หนา)
ขอคดเหน[c16]: (ดดมาเทาไหร)
ขอคดเหน[c17]: วธการสกดดเอนเอ ควรมอางองวธการ โดยเฉพาะการใช
สารละลาย solution 1, 2,,3 ผวจยควรให รายละเอยดถงสารทใชในแตละ solution)
ขอคดเหน[c18]: (ประกอบดวยอะไรบางหรอของบรษทอะไรระบใหชดเจน)
ขอคดเหน[c19]: ประกอบดวยอะไรบางหรอของบรษทอะไรระบใหชดเจน)
ขอคดเหน[c20]: ประกอบดวยอะไรบางหรอของบรษทอะไรระบใหชดเจน)
ขอคดเหน[c21]: (vortex เขยนความหมายไทยดวยจะชวยผอานเขาใจมากขน ยกตวอยางเชน ผสมสารละลายดวยการเขยา (vortex) ซงแนะน าผวจยให ความส าคญการเขยนภาษาไทยในรายละเอยดทสามารถอธบายได)
ขอคดเหน[c22]: (ควรมการใชภาษาไทยอธบาย water bath)
ขอคดเหน[c23]: นาจะระบวามการตรวจสอบคณภาพและปรมาณ DNA ทสกดไดอยางไรกอนทจะ น าไปวเคราะหตอไป
5
การตรวจสอบจโนไทปของยนดวยเทคนค Polymerase Chain Reaction -Restriction Fragment Length 93
Polymorphism (PCR-RFLP) 94
ดเอนเอทสกดไดถกน าไปเพมชนสวนยนโดยใชเทคนค PCR ในแตละปฏกรยา ประกอบดวยดเอนเอตนแบบ 95
(DNA template) ทมความเขม 50 ng/µl ปรมาตร 1 ไมโครลตร,10X PCR-buffer ปรมาตร 1 ไมโครลตร, MgCl2 ปรมาตร 96
0.8 ไมโครลตร, dNTPs (1.0 mM/each) ปรมาตร 1 ไมโครลตร, Primer forward และ Primer reverse (Table 1) อยาง97
ละปรมาตร 1 ไมโครลตร, 5 U/µl Taq DNA Polymerase ปรมาตร 0.1 ไมโครลตร และปรบปรมาตรดวย sterile water ให98
มปรมาตรรวมทงสน 10 ไมโครลตร โดยมวงรอบการท า PCR อณหภม Initial denaturation 94 ºC 5 นาท Denaturation 99
94 ºC 30 วนาท Annealing ดงแสดงใน Table 1 Extention 72 ºC 30 วนาท จ านวน 30 รอบ และ Final extention 72 ºC 100
5 นาท จากนนน ามาตดดวยเอมไซมตดจ าเพาะการตรวจสอบจดตดทใชในแตละยนดงแสดงใน Table 1 101
Table 1 PCR primers and PCR-RFLP conditions to detect genetic variation of LEP ATP1A1 ARL4A HP3 BTN 102
and STAT5A genes. 103
Genes 5’-sequence-3’
Forward / reverse primer
Annealing
Temperatures
PCR sizes
(bp)
Restriction
enzymes References
LEP F:GTCTGGAGGCAAAGGGCAGAGT
R:CCACCACCTCTGTGGAGTAG
62 ºC 30 sec 522 BsaAI
LEP F:TGGAGTGGCTTGTTATTTTCTTCT
R:GTCCCCGCTTCTGGCTACCTAACT
62 ºC 30 sec 400 Sau3AI Liefers et al.,
(2002)
ATP1A1 F:TGAGCAACCAACGCAACACT
R:TGGAACTGCAATCACTGAGGT
62 ºC 30 sec 330 Rsal
ARL4A F:TTACTGCGACTTGGACCAGTT
R:GTCCACGACAAACACAATGC
60 ºC 30 sec 501 Ddel
HP3 F:GCACCACCTACTCCTGCGTA
R:CTTCATGTCCGACTGCACCA
60 ºC 30 sec 230 Hpy188I
BTN F:TGGAGCTCTATGGAAATGGG
R:TACCCAACAGGAAGAAACAG
60 ºC 30 sec 501 HaeIII สายใจ และคณะ
(2553)
STAT5A F:CCAGGGTGCATACAGGACAG 60 ºC 30 sec 224 MspA1I He et al., (2011)
ขอคดเหน[c24]: แนะน าใชภาษาไทย น ากลนฆาเชอ (sterile water)
ขอคดเหน[c25]: Ref.นนาจะมเพยง Leptin gene
6
R:GCAGGTTACGAGGACTCAGG
การวเคราะหขอมล 104
วเคราะหขอมลดวยโปรแกรม SAS เพอวเคราะหความสมพนธระหวางความถจโนไทป และ คาสงเกตและคาการ105
ผสมพนธ (Estimated Breeding Value, EBV) ของลกษณะFPR ส าหรบการพจารณาความถจโนไทปนนหากพบต ากวา 5 106
เปอรเซนตของฝงจะไมน ามาหาความสมพนธของรปแบบยนกบลกษณะทน ามา วเคราะหคา EBV ของแตละลกษณะดวย107
โปรแกรม REML จากนนน ามาหาความสมพนธของยนกบลกษณะทศกษาโดยใชหลกการ Generalize Linear Model, 108
(GLM) ภายใตโมเดล [1] ส าหรบหาคาสมพนธกบคาสงเกต และโมเดล [2] ส าหรบศกษาความสมพนธกบคา EBV 109
[1] 110
[2] 111
เมอ = คาสงเกตของลกษณะ FPR, และ Ym = คาEBV ของลกษณะ FPR, F%, P%, และMY305, = คาเฉลย112
ของลกษณะทศกษา, = อทธพลของระดบเลอด i (i=1เมอระดบเลอด ≤80.9%HF, 2 เมอระดบเลอด 81%- 113
93.6%HF, 3 เมอระดบเลอด≥ 93.7%HF ) = อทธพลของอายเมอคลอดท j = อทธพลของฤดเมอ114
คลอดทk, = อทธพลของปเมอคลอดทl = อทธพลของรปแบบจโนไทป m ( m = ยน LEP, 115
ARL4A, ATP1A1, HP3, BTN and STAT5A) และ genotype ของยน combine ของยน = ความคลาดเคลอน 116
ผลการศกษาและวจารณ 117
การศกษาขอมลพนฐานทางดานลกษณะปรากฏ (phenotype) ของลกษณะ FPR, F%, P%, และMY305 ดง118
แสดง Table 2 เพอน ามาวเคราะหหายนเครองหมาย (Candidate gene) ทมความสมพนธกบลกษณะดงกลาว เมอ119
พจารณาลกษณะปรากฏของ FPR พบคาเฉลยของขอมลโคนมลกผสมโฮลสไตนทน ามาศกษาครงน อยในชวง 0.68 ถง 120
2.48 ผลจากคา FPR ดงกลาวแสดงใหเหนถงโคนมกลมนอาจจะประสบกบปญหาภาวะขาดสมดลพลงงานเนองจากมคา 121
FPR ต ากวา 1 และมากกวา 2 ซงเปนตวชวดวาหากโคนมมคา FPR ต าหรอสงกวาชวงดงกลาวนนโคนมมความเสยงทจะ122
ประสบกบปญหาขาดสมดลพลงงาน (Toni et al., 2011) เมอพจารณาลกษณะอนจากรายงานคา MY305 ใน Table 2 123
พบวามคาสงกวา รายงานของ จรรตน และสายญ (2546); จรรตน และคณะ (2553) เลกนอย ซงรายงานคา MY305 อย124
ขอคดเหน[c26]: ระบโมเดลทใชในการวเคราะห EBV
ของแตละลกษณะดวย
ขอคดเหน[c27]: แตละอทธพลควรระบดวยวาเปนอทธพลคงท หรอ อทธพลสมในทกๆ อทธพล
ขอคดเหน[c28]: ขอความนเขยนใหมใหชดเจน
7
ในชวง 2,746.9 ถง 4,556.84 Z (ระบหนวย)ส าหรบผลของลกษณะ F% และP% พบวามคาเฉลยอยในชวงใกลเคยงกบ125
รายงานของ ธระ (2553) 126
Table 2 Data description of aggregated milk 305 days, percentage of milk fat and milk protein, the ratio of fat 127
to protein. 128
Traits Mean Standard Deviation Min Max
Fat percentage ( %,) 4.38 2.39 0.72 8.88
Protein percentage (%) 3.14 0.62 2.05 6.89
Fat to protein ratio 1.58 0.90 0.30 3.83
Milk 305-day (kg) 4,674.97 1,054.49 2525.18 7699.77
129
รปแบบความถจโนไทปและความถอลลล 130
ผลจากการตรวจสอบลกษณะรปแบบทางพนธกรรม (Genotype) ของกลมยน LEP/Sau3AI, LEP/BsaAI, 131
ARL4A, ATP1A1, HP3, BTN, และSTAT5A พบยนทแสดงรปแบบจโนไทป ได 3 รปแบบคอ LEP, ARL4A, และSTAT5A 132
และยนทพบจโนไทปเพยง 2 รปแบบจโนไทปคอ ATP1A1, HP3, และBTN ดงแสดงใน Table 3 เมอพจารณาการปรากฏ133
ของความถจโนไทป และความถอลลล พบวาบางรปแบบมความถคอนขางต า อาจเนองจากความถของกลมตวอยางท134
น ามาศกษานน ไดรบผลกระทบจากการคดเลอกเพอเพมประสทธภาพของการใหผลผลต ซงพจารณาไดจากยน 135
LEP/Sau3AI ทมความถจโนไทป AA AB และ BB เทากบ0.51, 0.40, 0.09 ตามล าดบ และแสดงความถอลลล Aเทากบ 136
0.71, และอลลล B เทากบ 0.29 จะเหนไดวารปแบบ BB พบนอยทสดในกลมตวอยาง นนแสดงใหเหนวารปแบบดงกลาว137
อาจมผลตอการใหผลผลตน านมต า อยางไรกตาม Liefers et al. (2002) กลบพบวาอลลล B มผลตอการใหผลผลตน านม138
สง แตกลบปรากฏในฝงนอยกวาอลลล A ซงอาจจะเปนผลมาจากอทธพลแบบ Pleiotropic ของยนLEP และเมอพจารณา139
ถงการแสดงออกของยน LEP ตอการใหผลผลตน านม Clempson et al. (2011) พบวาการแสดงออกของยน LEP 140
เกยวของกบการใหผลผลตน านมทต าแหนง A59V โดยลกษณะ Homozygous TT สงผลใหมการลดผลผลตน านม 1,365 141
กโลกรมตลอด MY305 นอกจากน Javanmard et al. (2010) พบวาลกษณะ Heterozygous AB ยงมความสมพนธกบ142
การใหผลผลตไขมนสง จากทกลาวมาจงอาจเปนสาเหตทท าใหลกษณะ Homozygous ดงกลาวถกคดออกจากฝงโคนม 143
ขอคดเหน[c29]: ควรระบจ านวน n ทนามาวเคราะหดวย และไมแนใจวาตารางนเปนของผ เขยนเอง หรออางอง หากอางองใหใส Ref. ดวย
ขอคดเหน[c30]: ควรใสรปภาพ gel ของแตละยนวาแตละ genotype มรปแบบเปนอยางไร และแตละ band มขนาดเทาไหรระบใหชดเจน เพอผอานจะไดนาไปศกษาตอได และระบรปแบบจโนไทปไดตรงกน
ขอคดเหน[c31]: (.ขอความ”รปแบบมความถคอนขางต า อาจเนองจากความถของกลมตวอยางทน ามาศกษานน ไดรบผลกระทบจากการคดเลอกเพอเพมประสทธภาพของการใหผลผลต“ผ วจยควรมเอกสารสนบสนนขอความดงกลาว ราบไดอยางไรวาความถยนนนๆ นอยเนองมาจากการคดเลอก ซงแสดงความคดเหนแตขาดหลกฐานทชดเจน )
ขอคดเหน[c32]: (ขาดผลการศกษาความสมพนธกบปรมาณน านม ผวจยยงไมนาสรปเชนนได ถาจะพดถงความสมพนธกบลกษณะทางการผลผลตควรมผลการวเคราะหมาสนบสนน)
ขอคดเหน[c33]: Pleiotropic effect คอ ยนต าแหนงหนงมผลในการควบคมลกษณะมากกวาหนงลกษณะ ซงไมนาจะเปนเหตเปนผลของเหตการณน ควรอภปรายใหม
ขอคดเหน[c34]: ชอยอของยนใหทาเปนตวเอยง
แกไขทงเอกสาร/ (เชค format การเขยนชอยนใหสอดคลองตามหลกสากล จะใชตวเอยง หรอตวตง ควรเลอกใชใหเปนรปแบบเดยวกน)
ขอคดเหน[c35]: ชอยอของยนใหทาเปนตวเอยง แกไขทงเอกสาร
8
ยน ATP1A1 พบรปแบบ AB และ BB ซงมความถจโนไทป 0.59 และ 0.41 ตามล าดบ จะเหนวารปแบบ AA ไมปรากฏใน144
ฝงตวอยางซงเมอพจารณาการแสดงออกของยนดงกลาว Liu et al. (2010) พบรปแบบ Heterozygous AB เปนรปแบบท145
สามารถทนตอสภาวะเครยดเนองจากความรอนไดกวาจโนไทปอนดงนนรปแบบ Homozygous AA ทไมปรากฏในกลม146
ตวอยางนนอาจจะเปนกลมโคมความสามารถในการทนรอนแตอาจจะถกคดออกจากฝงเนองจากการเพมผลผลตน านม147
โดยการเพมระดบเลอดโฮลสไตนจนท าใหระดบเลอดพนเมองไทยต ามาก ยน HP3 ปรากฏ 2 รปแบบจโนไทปคอ AA และ 148
AB มความถเทากบ 0.58 และ0.42 ความถอลลล A=0.79 และB=0.21 การปรากฏเพยง 2 รปแบบจโนไทปไมพบรปแบบ 149
BB เนองจาก จฬานย (2553) ศกษาความแตกตางของยนดงกลาวระหวาง 2 สายพนธพบวาโคพนธพนเมองไทยปรากฏ150
ได 2 รปแบบจโนไทปและ โคนมโฮลสไตนฟรเชยนนนไมพบรปแบบใดจงท าใหในการศกษาครงนพบรปแบบยน 2 รปแบบ 151
เนองจากตวอยางทใชในการศกษาเปนโคนมลกผสมกบพนธพนเมองไทย ยนBTN ซงเปนยนทพบ 2 รปแบบจโนไทปม152
ความถ AA=0.85, AB=0.15 และความถอลลล A=0.93, B=0.07 สอดคลองกบ สายใจ และคณะ (2553) พบรปแบบจโน153
ไทปของยน BTN ได 2 รปแบบและไมพบรปแบบ BB ซงเมอพจารณาความสมพนธของแตละรปแบบจโนไทป 154
Bhattacharay et al. (2006) พบวาจโนไทป AA มความสมพนธตอลกษณะทเกยวของกบคณภาพของน านมเชน 155
เปอรเซนตองคประกอบในน านม (Solid percentage, Solid %), เปอรเซนตองคประกอบไมรวมไขมนนม (Solid Not Fat 156
percentage, SNF %) และเปอรเซนตไขมนสงทสดม และจโนไทป BB เปนจไนไทปทแสดงเปอรเซนตไขมนต าสด157
นอกจากน Muszynska et al.(2010) พบวาGGHealll/AGschIเปนกลมทมเปอรเซนตไขมนต าทสดจากทกลาวมาอาจมผลท า158
ใหไมพบรปแบบ BB เนองจากเปนรปแบบทไมมความสมพนธกบลกษณะทดตอการใหผลผลต ส าหรบรปแบบยนของ 159
ARL4A นนยงไมมรายงานวารปแบบใดทมผลตอลกษณะการใหผลผลต และเมอพจารณา STAT5A นนเปนเพยงยนเดยว160
ทแตละรปแบบมความถทใกลเคยงกน 161
Table 3 The genotype and allele frequenciesy of each gene in Thai-Holstein crossbred. 162
Genes Related traits
No.
Animal
(n1)
Genotypic frequencies Allelic frequencies
AA (n) AB (n) BB (n) A B
LEP/Bsa1AI Fertility 142 0.10 (15) 0.37 (52) 0.53 (75) 0.29 0.71
ขอคดเหน[c36]: ควรใชภาษาเขยนวา “เทากบ” และเรยบเรยงประโยคใหม แทนสญลกษณ “=” เชน อลล A และ B มความถเทากบ 0.93 และ 0.07
ตามล าดบ เปนตน
9
LEP/Sau3AI Milk yield 145 0.51 (74) 0.40 (58) 0.09 (13) 0.71 0.29
ARL4A Milk yield 145 0.65 (94) 0.28 (41) 0.07 (10) 0.79 0.21
ATP1A1 Heat tolerance 145 0 0.59 (86) 0.41 (59) 0.30 0.70
HP3 Heat tolerance 143 0.58 (83) 0.42 (60) 0 0.79 0.21
BTN Fat percentage 128 0.85 (109) 0.15 (19) 0 0.93 0.07
STAT5A Protein percentage 133 0.34 (45) 0.40 (53) 0.26 (35) 0.54 0.46
1n is number of animal 163
แนะน าผวจยปรบตารางท 3 ใหม เนองจากในตารางท 3 เปนสวนของผลของความถยนและจโนไทป เทานน สวน related 164
traits ผวจยไมไดศกษาเอง ขอมลสวนนไมควรอยในตารางผลการทดลอง แตเปนสวนหนงของ วรรณกรรมทเกยวของ 165
166
ความสมพนธของยนเครองหมายตอลกษณะปรากฏ 167
สดสวนไขมนตอโปรตน 168
จากผลการศกษาในครงนไมพบความสมพนธระหวางลกษณะสดสวนไขมนตอโปรตนกบยน LEP, ARL4A, 169
BTN, และSTAT5A แตอยางไรกตามยงคงพบวายน ATP1A1 และ HP3 มแนวโนมสมพนธกบลกษณะสดสวนไขมนตอ170
โปรตน (P<0.15) ดงแสดงใน Table 4 และ Table 5 โดยรปแบบ AB ของยน ATP1A1 มแนวโนมท าใหคา FPR สงกวา171
รปแบบ BB และเมอพจารณาคาทางพนธกรรมพบวารปแบบ BB มแนวโนมท าใหคา FPR สงกวารปแบบ AB (Table 5) 172
และส าหรบยน HP3 พบวารปแบบ AA มแนวโนมท าใหคา FPR สงกวารปแบบ AB เชนเดยวกบคาทางพนธกรรมพบวา173
รปแบบ AA มแนวโนมท าใหคา FPR สงกวารปแบบ AB 174
เปอรเซนตไขมน 175
จากผลการศกษาในครงนไมพบความสมพนธของยน LEP, ARL4A, HP3, BTN, และSTAT5A ตอเปอรเซนต176
ไขมนนมแตอยางไรกตามพบวายน ATP1A1 มแนวโนมสมพนธกบลกษณะ F% (P<0.1) ดงแสดงใน Table 4 และ Table 177
5 โดยพบรปแบบ AB มแนวโนมทใหมเปอรเซนตไขมนสงกวารปแบบ BB แตเมอพจารณาคาทางพนธกรรมของกลบไมพบ178
ความแตกตางระหวาง 2 รปแบบ (Table 5) เมอพจารณายน LEP สอดคลองกบ Liefers et al. (2002); Chebel et al. 179
(2008) ทไมพบความสมพนธของรปแบบยน LEP กบคาสงเกต เชนเดยวกบยน BTN ซง สายใจ และคณะ (2553) ไมพบ180
ขอคดเหน[c37]: ควรใส genotype ดานบนแถวนดวย เนองจาก genotype ไมใช AA AB และ BB
ขอคดเหน[c38]: ) แนะน าใหใสคา P ทวเคราะหได จะใหขอมลไดชดเจนกวา
ขอคดเหน[c39]: 4 (ตาราง 4 และ 5 ใช
อธบายผลการทดลองแตกตางกน ในหวขอทผไมวจยไมไดกลาวถง EBV เลย ใหตดตารางท 5 ออกจากสวนน และเมอจะกลาวถงผล EBV จงจะใชอธบายได
ขอคดเหน[c40]: แนะน าใหใสคา P ทวเคราะหได จะใหขอมลไดชดเจนกวา
10
ความแตกตางในแตละรปแบบของยน BTN ตอคาสงเกต แตเมอพจารณาความสมพนธกบคาทางพนธกรรม สายใจ และ181
คณะ (2553) พบวารปแบบยนของ BTN มความสมพนธกบเปอรเซนตไขมน ผลจากการศกษาในครงนตางจาก 182
(Bhattacharay et al. 2006) ซงพบความสมพนธระหวางยนกบคาสงเกตโดยจโนไทป AA เปนกลมทแสดงเปอรเซนต183
ไขมนสงสด และส าหรบยน STAT5A สอดคลองกบ He et al. (2011) ซงไมพบความสมพนธของยนตอการแสดงออกของ184
เปอรเซนตไขมน 185
เปอรเซนตโปรตน 186
ส าหรบการศกษาความสมพนธของรปแบบยนพบเพยงยน ATP1A1 ทมความสมพนธกบเปอรเซนตโปรตน 187
(P<0.05) ดงแสดงใน Table 5 โดยพบรปแบบ AB มคาทางพนธกรรมของลกษณะดงกลาวสงกวารปแบบ BB แตไมพบ188
ความสมพนธของรปแบบยนกบคาเปอรเซนตโปรตน ส าหรบยน LEP, ARL4A, HP3, BTN, และSTAT5A จากการศกษา189
ครงนไมพบความสมพนธของตอคาสงเกต เมอพจารณายน LEPสอดคลองกบ Liefers et al. (2002) ทไมพบความสมพนธ190
รปแบบยนตอคาสงเกต ตางจาก Chebel et al. (2008)ทพบวารปแบบ AB มความผลท าใหเปอรเซนตโปรตนสงกวา191
รปแบบ AA และ BB ยนBTN สายใจ และคณะ (2553); Bhattacharay et al. 2006) ไมพบความแตกตางในแตละรปแบบ192
ของยน BTN ตอคาสงเกต แตเมอพจารณาความสมพนธกบคาทางพนธกรรม สายใจ และคณะ (2553) พบวาม193
ความสมพนธของรปแบบยน BTN ตอเปอรเซนตโปตน ยนSTAT5A ตางจาก He et al. (2011) ซงพบความสมพนธของ194
รปแบบยนตอคาสงเกตโดยพบวารปแบบ AG และ GG มผลตอเปอรเซนตโปรตนมากกวารปแบบ AA 195
Table 4 Association analysis tests (P-value) for %Fat, %Pro, FPR, and Milk 305-day with genotype of various 196
genes. 197
Genes Genotype %Fat %Pro FPR Milk 305-day
LS SE LS SE LS SE LS SE
LEP/BsaAI
AA 4.15 1.04 3.17 0.29 1.68 0.43 4833.96 345.63
AB 4.63 0.57 3.05 0.16 1.73 0.26 4943.55 264.26
BB 4.11 0.50 3.07 0.15 1.40 0.23 4805.50 240.81
P-value1/ 0.57 0.90 0.30 0.80
LEP/Sau3AI AA 4.42 0.52 3.03 0.15 1.53 0.24 4687.27 259.35
AB 4.70 0.57 3.05 0.16 1.73 0.26 4765.38 262.22
ขอคดเหน[c41]: (หนวย)
ขอคดเหน[c42]: SE หรอ SEM? ถาเปน SEM กรณาแกไขในทก Table
11
BB 4.38 1.06 3.14 0.29 1.76 0.44 4865.08 368.59
P-value 0.82 0.91 0.60 0.84
ARL4A
AA 4.68 0.50 3.04 0.15 1.64 0.23 4772.93 244.25
AB 4.09 0.60 3.04 0.17 1.55 0.27 4713.00 265.89
BB 4.51 1.06 2.74 0.29 1.66 0.47 3956.54 411.03
P-value 0.49 0.51 0.90 0.07
ATP1A1
AB 4.81 0.50 3.08 0.15 1.71 0.23 4731.21 242.90
BB 4.05 0.55 2.96 0.16 1.41 0.25 4762.49 272.63
P-value 0.09 0.30 0.13 0.86
HP3
AA 4.67 0.51 3.00 0.15 1.72 0.23 4635.37 243.72
AB 4.24 0.56 3.10 0.17 1.41 0.26 4958.54 259.52
P-value 0.35 0.43 0.14 0.07
BTN
AA 4.38 0.58 3.06 0.17 1.48 0.26 4815.97 254.03
AB 4.44 0.75 2.89 0.22 1.85 0.33 4893.91 293.70
P-value 0.92 0.36 0.19 0.79
STAT5A
AA 4.66 0.63 3.06 0.18 1.73 0.28 4804.06 270.32
AG 4.03 0.61 3.02 0.18 1.43 0.27 4803.81 261.78
GG 4.78 0.69 2.97 0.21 1.72 0.33 4956.30 268.89
P-value 0.37 0.87 0.39 0.79
1/P-value The P-value for significant in the same column in each gene แนะน าปรบประโยคใหม ความหมายยง198
ไมสมบรณ 199
200
1. แนะน าปรบหวตารางใหมความชดเจน 201
2. ผวจยควรใหขอมลตวยอในตารางดวย เชน LS และ SE เปนคาอะไร 202
3. แนะน าผวจยใสคา P ในคอลมนเดยวกบคา LS 203
204
ผลผลตน านม 305 วน 205
ผลจากการศกษาความสมพนธของรปแบบยนตอMY305 ไมพบความสมพนธของยนทศกษาตอลกษณะ206
ดงกลาวแตพบแนวโนมของยน ARL4A และ HP3 มความสมพนธกบลกษณะดงกลาวดงแสดงใน Table 4 และ Table 5 207
12
ยน ARL4A มแนวโนมทสมพนธลกษณะMY305 (P< 0.1) โดยรปแบบ AA มแนวโนมใหผลผลตน านมสงสด แตเมอ208
พจารณาจากคาทางพนธกรรมพบวารปแบบ AB ใหผลผลตน านมสงสด (P<0.05) (Table 5) เมอพจารณายนHP3 พบ209
แนวโนมทจะมความสมพนธกบ MY305 ตอทงลกษณะฟโนไทป และคาทางพนธกรรมเมอพจารณาคาฟโนไทปพบวา 210
HP3-AB มแนวโนมใหผลผลตน านมสงกวา BB ท (P<0.1) เชนเดยวกบคาEBV ทพบวา AB นนมแนวโนมสงกวา BB ท 211
(P<0.15) 212
เมอพจารณายน LEP สอดคลองกบ Chebel et al. (2008); Javanmard et al. (2010)ทไมพบความสมพนธรปแบบยนตอ213
คาสงเกต ตางจาก Liefers et al. (2002) ทพบความสมพนธของรปแบบยน AB มความผลท าใหผลผลตน านมสงกวา214
รปแบบ AA และ BB ยน ATP1A1 ตางจาก Liu et al. (2012) ซงพบความสมพนธระหวางยนตอการใหMY305 โดยพบวา 215
ATP1A1-CC เปนกลมทใหผลผลตน านมต าสดแตกตางจากกลมอน และจากรายงานของ ยนBTN สายใจ และคณะ 216
(2553); Zegeye et al. (1999) ซงไมพบความแตกตางในแตละรปแบบของยน BTN ตอคาสงเกต ตางจาก Bhattacharay 217
et al. (2006) ซงพบรปแบบยน AA ทมผลท าตอการใหผลผลตน านมสง ยนSTAT5A สอดคลองกบ He et al. (2011) ซง218
ไมพบความสมพนธของยนตอการแสดงออกของเปอรเซนตไขมน 219
ความสมพนธระหวางสองยนเครองหมายตอลกษณะปรากฏ 220
เมอพจารณาความสมพนธระหวางยนแบบ combination ดงแสดงใน Table 6 ไมพบความสมพนธระหวางยน 221
combination กบ F% และP% แตพบวามยนบางกลมเมอ combination กนแลวมความสมพนธกบลกษณะFPR โดยพบ222
ความสมพนธระหวางยน combination กบFPR โดยมคยนcombination ทมผลตอลกษณะฟโนไทปคอ LEP/BsaAIxBTN, 223
LEP/Sau3AIxBTN และ ATP1A1xBTN เมอพจารณาคยนทมผลทงลกษณะทางฟโนไทปและคาEBVนนพบวามเพยง 224
ATP1A1xBTN ซงพบวาจโนไทป ABAB นนมแนวโนมของคาFPR สงทสด และเมอพจารณาคาEBVจะพบวา จโนไทป225
ดงกลาวมแนวโนมอยในกลมทสงเชนกน ท (P<0.1) แตส าหรบLEP/BsaAIxBTN และLEP/SauAIxBTN นนพบเพยงกลม226
ยนดงกลาวมความสมพนธกบคาฟโนไทปแตไมพบความสมพนธของกลมยนดงกลาวตอคาEBV ส าหรบLEP/BsaAIxBTN 227
พบจโนไทป BBAA แสดงคาFPRต าสดแตกตางจาก จโนไทป ABAA ท (P<0.05) และระหวางLEP/Sau3AIxBTN พบจโน228
ไทป AAAA ทแสดงคาFPRต าแตกตางจากจโนไทป ABAA ท (P<0.05) 229
Table 5 Association tests (P-value) for %Fat_EBV, %Pro_EBV, FPR_EBV, and Milk 305-day_EBV with 230
genotype of various genes. 231
13
Genes Genotype %Fat_EBV %Pro_EBV FPR_EBV Milk 305-day_EBV
LS SE LS SE LS SE LS SE
Leptin/BsaAI
AA -0.34 0.19 -0.08 0.048 -0.02 0.02 98.72 76.09
AB 0.06 0.07 -0.02 0.019 0.01 0.01 235.69 39.62
BB 0.04 0.07 0.01 0.017 0.00 0.01 176.27 34.24
P-value1/ 0.16 0.24 0.39 0.23
Leptin/Sau3
AI
AA 0.05 0.06 0.00 0.017 0.00 0.01 178.95 34.37
AB 0.02 0.07 -0.01 0.018 0.01 0.01 226.60 37.65
BB -0.34 0.19 -0.08 0.048 -0.02 0.02 121.04 81.14
P-value 0.17 0.30 0.50 0.42
ARL4A
AA 0.06 0.06 -0.00 0.015 0.00 0.01 182.28ab 29.76
AB -0.05 0.09 -0.01 0.022 0.01 0.01 259.69b 44.10
BB -0.12 0.20 -0.08 0.048 0.01 0.02 2.58a 94.58
P-value 0.47 0.30 0.83 0.04
ATP1A1
AB -0.02 0.06 0.01a 0.015 -0.01 0.01 215.21 31.10
BB 0.07 0.07 -0.04b 0.019 0.02 0.01 160.26 38.49
P-value 0.38 0.03 0.08 0.27
HP3
AA 0.05 0.06 -0.01 0.015 0.01 0.01 158.56 32.18
AB -0.01 0.08 0.01 0.020 -0.01 0.01 236.16 36.88
P-value 0.52 0.54 0.15 0.12
BTN
AA 0.00 0.06 -0.01 0.014 -0.00 0.01 196.52 28.49
AB 0.00 0.13 -0.02 0.030 0.01 0.01 252.25 69.20
P-value 0.99 0.70 0.72 0.46
STAT5A
AA 0.07 0.09 -0.02 0.021 -0.00 0.01 245.70 44.05
AG 0.04 0.08 0.01 0.019 0.01 0.01 184.93 40.49
GG -0.06 0.10 -0.02 0.025 0.01 0.01 179.34 50.69
P-value 0.57 0.61 0.85 0.51
ขอคดเหน[c43]: ตดออก
14
1/P-value The P-value for significant in the same column in each gene ดค าแนะน าทใหไวในตารางท 4 232
a,b within a column in each gene with no common superscript are different (P<0.05) 233
234
Table 6 Association tests (P-value) for %Fat, %Fat_EBV, %Pro , %Pro_EBV, FPR , and FPR_EBV, with 235
genotype combine of various genes. 236
Genes Genotype %Fat %Fat_EBV %Pro %Pro_EBV FPR FPR_EBV
LS SE LS SE LS SE LS SE LS SE LS SE
LEP/BsaAI
x BTN
ABAA 5.15 0.70 0.05 0.09 3.02 0.21 -0.02 0.02 1.90b 0.30 0.01 0.01
BBAA 3.96 0.64 -0.01 0.08 3.09 0.20 0.01 0.02 1.20a 0.28 -0.01 0.01
BBAB 4.55 0.86 0.10 0.16 2.94 0.27 -0.02 0.03 1.88ab 0.37 0.03 0.02
P-value1/ 0.16 0.78 0.84 0.53 0.02 0.21
LEP/Sau3
Aix
BTN
AAAA 4.01 0.63 0.01 0.08 3.08 0.20 0.01 0.02 1.24a 0.28 -0.01 0.01
AAAB 4.68 0.83 0.10 0.15 2.93 0.26 -0.03 0.03 1.92b 0.36 0.02 0.02
ABAA 5.07 0.70 0.03 0.08 3.03 0.21 -0.02 0.02 1.85ab 0.30 0.01 0.01
P-value 0.20 0.88 0.83 0.59 0.04 0.33
ATP1A1x
BTN
ABAA 4.47 0.63 -0.08 0.07 3.13 0.19 0.01 0.01 1.46a 0.27 -0.01a 0.01
ABAB 5.05 0.93 0.04 0.17 2.86 0.26 -0.01 0.03 2.30b 0.38 0.02ab 0.02
BBAA 3.98 0.67 0.12 0.09 2.96 0.20 -0.04 0.02 1.28a 0.30 0.02b 0.01
BBAB 3.63 1.06 -0.04 0.18 2.92 0.31 -0.03 0.04 1.11a 0.45 -0.01ab 0.02
P-value 0.56 0.38 0.56 0.40 0.06 0.07
1/P-value The P-value for significant in the same column in each gene 237 a,b within a column in each gene with no common superscript are different (P<0.05) 238
การวเคราะห combination อธบายเพมเตมดวยวาท าไมถงไมครอบคลมการ combination ของทกยน และผวจย239
มหลกการเลอกวเคราะห combination อยางไร ในการเลอก combine จโนไทปจะใหขอมลอะไรเพมเตม เพราะ240
เนอหาสวนนมส าคญทจะสามารถอธบายไดตอไปถงผลของยนแตละต าแหนง และหรอแสดงออกรวมกนของ241
ยน หรออทธพลอนๆ ขอใหผวจยใหขอมลเพมเตมดวย 242
243
244
15
สรป 245
ผลจากการศกษายนเพอหาความสมพนธกบลกษณะสดสวนไขมนตอโปรตน ส าหรบน าไปใชในการประเมน246
สภาวะขาดสมดลพลงงาน จากยนทมความเกยวของกบการเปลยนแปลง เปอรเซนตไขมน และเปอรเซนตโปรตน จากกลม247
ตวอยางโคนมลกผสมไทยโฮลสไตน เมอพจารณาความถจโนไทปและความถอลลลจะเหนวาจโนไทปในแตละยนมความถ248
เกน 5 เปอรเซนตของตวอยางทน ามาศกษาในครงน ซงแสดงใหเหนวากลมตวอยางทศกษานนยงคงมความหลากหลายท249
สามารถน ายนดงกลาวมาใชในการคดเลอกได และเมอพจารณาความแตกตางระหวางปรมาณความถจโนไทปในแตละ250
ยนแสดงใหเหนถงกลมตวอยางทศกษานนไดผานการคดเลอกมาแลวจงท าใหบางจโนไทปพบไดนอยมาก และจากการ251
พจารณาความสมพนธระหวางยนกบสดสวนไขมนตอโปรตนพบเพยงมแนวโนมยนATP1A1 และHP3 ทจะสมพนธกบ252
สดสวนไขมนตอโปรตนซงเมอพจารณาแนวโนมของทงสองยนพบวายนATP1A1 นนมความเหมาะสมตอการน าไปใช253
มากกวายนHP3 เนองจากพบแนวโนมทจะมความสมพนธกบทงคาฟโนไทปและ EBV ของลกษณะสดสวนไขมนตอ254
โปรตน สงกวา ยนHP3 โดยATP1A1-AB เปนจโนไทปทมแนวโนมคาสดสวนไขมนตอโปรตนสงกวาจโนไทป BB 255
นอกจากนนยงพบวายนATP1A1 มแนวโนมทจะมความสมพนธกบลกษณะเปอรเซนตไขมนดวย และเมอพจารณา256
ความสมพนธระหวางการท ายนcombineกบสดสวนไขมนตอโปรตน พบวายน LEPxBTN นนมความสมพนธกบสดสวน257
ไขมนตอโปรตนอยางมนยส าคญและพบ ATP1A1xBTN มแนวโนมทจะมความสมพนธกบสดสวนไขมนตอโปรตน แต258
อยางไรกตามเมอพจารณาจากความสมพนธของจนโนไทปกบ EBV แลวพบวาATP1A1xBTN นนเปนยนเพยงกลมเดยวท259
มแนวโนมทจะสมพนธกบสดสวนไขมนตอโปรตนโดยพบวาจโนไทปcombineของยน ATP1A1xBTN-ABAB เปนจโนไทป260
ทมแนวโนมคาสดสวนไขมนตอโปรตนสงกวากลมอน ดงนนจากการศกษาในครงนจะเหนวายนATP1A1 นนมแนวโนมทม261
ความสมพนธกบสดสวนไขมนตอโปรตน และเมอพจารณาจากการท ายนcombine แลวพบวา ATP1A1xBTN มแนวโนมท262
จะสมพนธกบสดสวนไขมนตอโปรตนเชนกน นนแสดงใหเหนวาสามารถใชแคเพยงยน ATP1A1 ทมรปแบบจโนไทป AB 263
แสดงถงกลมโคนมทมแนวโนมจะแสดงคาสดสวนไขมนตอโปรตนสงกวาจโนไทปอน 264
เอกสารอางอง 265
จรรตน แสนโภชน และสายนต บวบาน. 2546. การประเมนคาทางพนธกรรมของลกษณะผลผลตน านมส าหรบโคนมใน266
ประเทศไทย. เวชชสารสตวแพทย. 33: 79-90. 267
ขอคดเหน[c44]: - เขยนใหกระชบมากขน/ สรปยาว และใชค าฟ มเฟอย ลดค าทมความหมายซ า -โดยขอใหสรปวาผลการทดลองบอกวาเกดอะไรขนไมตองเขยนผลการทดลองซ าอกรอบ
16
จรรตน แสนโภชน, สายณห บวบาน, และกนกพร ไตรวทยากร. 2553. อทธพลของยนหลก DGAT1 ตอผลผลตและ268
คณภาพน านมในโคนมลกผสมไทย-โฮลสไตน. วารสารเทคโนโลยชวภาพการผลตปศสตว.1: 9-21. 269
จรรตน แสนโภชน, สายณห บวบาน, มนตชย ดวงจนดา, และวฒไกร บญคม. 2553. การประเมนพนธกรรมของลกษณะ270
การใหผลผลตน านมในโคนมลกผสมโฮลสไตนในแตละภมภาคของประเทศไทยโดยใชโมเดลวนทดสอบรเกรซชน271
สม. แกนเกษตร. 38: 55-56. 272
จฬานย นวมจตร. 2553. การศกษาเปรยบเทยบรปแบบและล าดบนวคลโอไทดของยน HSP70-2 ระหวางโคพนเมองไทย273
และโคโฮลสไตนฟรเชยน. วทยานพนธปรญญาวทยาศาสตรบญฑต มหาวทยาลยขอนแกน, ขอนแกน. 274
ธระ รกความสข. 2553. ปญหาพลงงานขาดสมดลในโคนมลกผสมโฮลสไตนฟรเชยนทเลยงในฟารมรายยอยเขตภาค275
ตะวนตกของประเทศไทย รายงานวจยฉบบสมบรณ คณะสตวแพทยศาสตร มหาวทยาลยเกษตรศาสตร. 276
ศนยผลตน าเชอพอพนธโคนม. 2552. การพฒนาระบบประเมนพนธกรรมจโนมเพอการปรบปรงพนธส าหรบลกษณะท277
ส าคญทางเศรษฐกจของโคนมในประเทศไทย.แหลงขอมล: http://www.dpogenetics.com/index. php? 278
Option = com_ content&view=article&id=170: คนเมอ 20 กนยายน 2557. 279
สายใจ ชนสข, ณชย ศราธพนธ, และกลยา เกงวกยกรรม. 2553. การศกษาการแสดงออกของยน Butyrophillin ตอ280
ปรมาณไขมนในน านมโคนมลกผสมไทย-โฮสไตน. วารสารเทคโนโลยชวภาพการผลตปศสตว. 1: 22-32. 281
Bhattacharya, T. K., S. S. Misra, F. D. Sheikh, S. Sukla, P.Kumar, and A. Sharma. 2006. Effect of Butyrophilin 282
gene polymorphism on milk quality traits in crossbred cattle. Asian-Aust. J. Anim. Sci. 19: 922-926. 283
Buttchereit, N., E. Stamer, W. Junge, and G. Thaller. 2011. Short communication: Genetic relationships among 284
daily energy balance, feed intake, body condition score, and fat to protein ratio of milk in dairy cows. 285
J. Dairy Sci. 94: 1586-1591. 286
Chebel, R. C., F. Susca, and J. E. P. Santos. 2008. Leptin genotype is associated with lactation performance 287
and health of Holstein cows. J. Dairy Sci. 91: 2893-2900. 288
Clempson, A. M., G. E. Pollott, J. S. Brickell, N. E. Bourne, N. Munce, and D. C. Wathes. 2011. Evidence that 289
leptin genotype is associated with fertility, growth, and milk production in Holstein cows. J. Dairy Sci. 290
94: 3618-3628. 291
He, X. M., X. Chu, L. Qiao, J. N. He, P. Q. Wang, T. Feng, R. Di, G. L. Cao, L. Fang, and Y. F. An. 2011. 292
Polymorphisms of STAT5A gene and their association with milk production traits in Holstein cows. 293
Mol Biol Rep. 39: 2901-2907. 294
Heuera, C., W. M. Van Straalenb, Y. H. Schukkena, A. Dirkzwagerb, and J. P. T. M. Noordhuizen. 2000. 295
Prediction of energy balance in a high yielding dairy herd in early lactation: model development and 296
precision. Livest. Prod. Sci. 65: 91-105. 297
17
Irmgard, H., A. Thompson, Christopher M. Sanderson, and S. Munro. 2007. The Arl4 Family of small G 298
proteins can recruit the cytohesin Arf6 exchange factors to the plasma membrane. Curr. Biol. 17: 299
711-716. 300
Javanmard, A., K. Khaledi, N. Asadzadeh, and A. R. Solimanifarjam. 2010. Detection of polymorphism in the 301
Bovine Leptin (LEP) gene: association of a single nucleotide polymorphism with breeding value of 302
milk traits in Iranian Holstein Cattle. J. Mol. Genet. 2: 10-14. 303
Khatib, H., R. L. Monson, V. Schutxkus, D. M. Kohl, G. L. M. Rosa, and J. J. Rutledge. 2008. Mutation in the 304
STAT5A Gene Are Associated with Embryonic Survival and Milk Composition in Cattle. J. Dairy Sci. 305
91: 784-793. 306
Liefers, S. C., M. F. W. te Pas, R. F. Veerkamp, and T. van der Lende. 2002. Associations between Leptin 307
Gene Polymorphisms and Production, Live Weight, Energy Balance, Feed Intake, and Fertility in 308
Holstein Heifers. J. Dairy Sci. 85: 1633-1638. 309
Liu, Y. X., X. Zhou, D. Q. Li, Q. W. Cui, and G. L. Wang. 2010. Association of ATP1A1 gene polymorphism with 310
heat tolerance traits in dairy cattle. Genet. Mol. Res. 9: 891-896. 311
Liu, Y. X., C. H. Xu, T. Y. Gao, and Y. Sun. 2012. Polymorphisms of the ATP1A1 gene associated with mastitis 312
in dairy cattle. Genet. Mol. Res. 11: 651-660. 313
Madeja, Z., T. Adamowicz, A. Chmurzynska, T. Jankowski, J. Melonek, M. Switonski, and T. Strabel. 2004. 314
Short Communication: Effect of leptin gene polymorphisms on breeding value for milk production 315
traits. J. Dairy Sci. 87: 3925-3927. 316
Muszynska, M., I. Szatkowska, W. lhelm Grzesiak, A. Dybus, and D. Zaborski. 2010. Two single nucleotide 317
polymorphisms within bovine butyrophilin gene (BTN/HaeIII and BTN/SchI) and their association with 318
milk performance traits in Jersey cattle. Arch. Tierz. 53: 501-509. 319
Nydam, D. V., P. A. Ospina, T. Stokol, and T. R. Overton. 2009. Evaluation of the effect of non-esterified fatty 320
acid (NEFA) and β-hydroxybutyrate (BHB) concentrations on health, reproduction and production in 321
transition dairy cattle from the northeast USA. Paper presented at the 71st Conference for Feed 322
Manufacturers Proceedings of the Cornell Nutrition, New York. 323
Ogorevc, J., T. Kunej, A. Razpet, and P. Dovc. 2009. Database of cattle candidate genes and genetic 324
markers for milk production and mastitis. Anim. genet. 40: 832-835. 325
Patton, J., D. A. Kenny, S. McNamara, J. F. Mee, F. P. O’Mara, M. G. Diskin, and J. J. Murphy. 2007. 326
Relationships among milk production, energy balance, plasma analytes, and reproduction in 327
Holstein-Friesian cows. J. Dairy Sci. 90: 649-658. 328
18
Rincon, G., A. Islas-Trejo, J. Casellas, Y. Ronin, M. Soller, E. Lipkin, and J. F. Medrano. 2009. Fine mapping 329
and association analysis of a quantitative trait locus for milk production traits on Bos taurus autosome 330
4. J. Dairy Sci. 92: 758-764. 331
Sharifzadeh, A., A. Doosti, and S. Moshkelani. 2010. Genetic Polymorphism at the leptin Gene in Iranian 332
Holstein cattle by PCR-RFLP. J. Anim. Vet. Adv. 9: 1420-1422. 333
Toni, F., L. Vincenti, L. Grigoletto, A. Ricci, and Y. H. Schukken. 2011. Early lactation ratio of fat and protein 334
percentage in milk is associated with health, milk production, and survival. J. Dairy Sci. 94: 1772-335
1783. 336
Zegeye, A., M. Ashwell, S. Ogg, C. Rexroad, and I. H. Mather. 1999. RFLP markers in the bovine butyrophilin 337
gene. Anim. Genet. 30: 382-405. 338
Zegeye, A. 2003. Quantitative trait loci and promoter analysis of the bovine butyrophilin gene. P.H.D. Thesis. 339
Maryland University, Maryland. 340