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76
Ecología de microorganismos rizosfericos asociados a cultivos de arroz del Tolima y Meta Daniel Uribe Vélez Grupo de Microbiología Agrícola Instituto de Biotecnología

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Page 1: Daniel uribe velez

Ecología de microorganismos rizosfericos asociados a cultivos de

arroz del Tolima y Meta

Daniel Uribe Vélez

Grupo de Microbiología Agrícola

Instituto de Biotecnología

Page 2: Daniel uribe velez

Ecología de microorganismos rizosfericos asociados a cultivos de

arroz del Tolima y Meta

Ministerio de Agriculturay Desarrollo Rural

FEDEARROZ

Page 3: Daniel uribe velez

Indice• Introducción

• Características físicas y químicas del suelo

• Recuentos microbianos

• Caracterización enzimática del suelo

• Microorganismos no cultivables

• Microorganismos en acción

Page 4: Daniel uribe velez

Incremento Precios Alimentos

• Crecimiento económico de la India y China

• Cambio climático

• Biocombustibles

• Crisis Energética: Precio de transporte

Precio fertilizantes

Page 5: Daniel uribe velez

Precio Internacional del Arroz de los últimos 10 años

http://www.mongabay.com/images/commodities/charts/rice.html

Page 6: Daniel uribe velez

Precio Mundial de Fertilizantes

Page 7: Daniel uribe velez

Mapa reflejando el tamaño de países en relación al número de

habitantes con menos de 1 dólar al día

Zeigler & Barclay 2008

Page 8: Daniel uribe velez

Incremento de Rendimiento en Producción de Arroz

Zeigler & Barclay 2008

Page 9: Daniel uribe velez

Amino ácidos, ácidos orgánicos, azucaresfenoles, polisacáridos y proteínas

5% - 21%fotosintato

Walker et al 2003. (Plant Physiology 132: 44-51)

Page 10: Daniel uribe velez

Comunidad

Rizosférica

Fijación

N2Toma de

H2O

Estabilización

suelo

Promoción

Crecim.

Biocontrol

Simbiosis

Efectos Benéficos

Flujo de

nutrientes

Liberación

de enzimas

AdhesiónAlelopatias Competencia

Fitotoxicidad

EnfermedadEfectos Neutros

Efectos

Dañinos

Efectos Rizosféricos Sobre el Crecimiento Vegetal

Page 11: Daniel uribe velez

Entre el 60% - 70% del N se pierde por volatilización y lixiviación

NO3

NO3

NO3

NO3

Page 12: Daniel uribe velez

Esquema Metodológico

Determinar el papel de microorganismos edáficos y factores físico químicos asociados a la calidad de suelo en fincas arroceras del departamento del Tolima y Meta

Diseño y Evaluación de estrategias de fertilización de dos fincas del Tolima y dos del Meta

Page 13: Daniel uribe velez

Esquema Metodológico

Determinar el papel de microorganismos edáficos y factores físico químicos asociados a la calidad de suelo en fincas arroceras del departamento del Tolima y Meta

Recuento total de microorganismos

cultivables

Determinar y analizarLos factores fisico quimicos

del suelo

Recuento de grupos Funcionales

Fijadores de N2

Solubilizadores de PDegradadores de lig. Y Cell

Determinación de la actividad metabolica y enzimatica de los suelos

Diversidad de microorganismosno cultivables

Page 15: Daniel uribe velez

Muestreo

4 Fincas de Villavicencio

4 Fincas de Acacias

Page 16: Daniel uribe velez

Muestreo

Page 17: Daniel uribe velez

Finca/

Caracter

o

I II III IV V VI VII VIII

Fecha de

siembra

1 20 Abrí/08 19 Abrí/08 7 Abrí/08 7 Abr/08 27 Ab/08 28 Abrí/08 29 Abrí/08 13 Ab/08

2 18 Juli/09 12 Ago/09 Descanso 1 Ag/09 ND Descanso 23 Juni/09 23 Jn/09

Textura 1 FArA. F A FA FA F Ar F Ar F Ar F Ar

2 ND ND ND ND F Ar F Ar F Ar F Ar

Humedad

%

1 53.2 ND 45.6 36.1 47.4 53.7 32.7 52.2

2 47.12 42.28 43.27 32.03 57.90 36.14 37.11 49.95

pH 1 6.1 5.7 5.5 5.5 5.9 6.3 6.8 5.9

2 5.6 5.8 5.7 5.8 5.8 6.3 5.9 6.3

Variedad 1 Fede 60 Fede 60 Fede 60 Fede 60 Fede 60 Fede 60 Fede 60 Fede 60

2 Colombia 21 Fede 60 Descanso Fede 60 Fed 275 Descanso Fede 275 Fede 60

Densidad

siembra

kg /Ha

1 180 166 ND 140 200 200 150 150

2 ND 210 ND 225 Descanso 180 200

Area

sembrada

1 8.0 Ha 9.0 Ha 6.5 Ha 12 Ha. 1.2 Ha 3.0 Ha 4.5 Ha 13 Ha.

2 11 Ha 9.0 Ha 11 Ha 14 Ha 1.5 Ha 3.0 Ha 9 Ha 13 Ha

Producció

n

Kg/Ha

1 9000 9687 6875 8785 6437.5 8125 9000 9125

2 5269 ND Descanso 6250 7187.5 Descanso 4375 6250

Resumen TolimaNorte Sur

Page 18: Daniel uribe velez

Finca/

Caracter

Año IX X XI XII XIII XIV XV XVI

Textura 1 FAr F FAr FAr F F F F

2 FArL FAr FAr FArA FAr F FL FAr

Humedad 1 37 40 52.3 62 72.3 33.1 31.4 36.1

2 44.7 51.5 54.0 55.5 44.3 42.0 76.7 50.7

pH 1 4.9 4.8 5.4 5.3 5.2 5.7 4.6 4.5

2 5.6 5.2 5.5 5.5 5.5 5.7 5.3 5.2

Variedad 1 Fedearroz

369

Fortaleza Fedearroz

369

Fedearroz

369

Fedearroz

369

Fedearroz

369

Fedearroz

369

Fedearr

oz 369

2 Fedear 174 Fedear

174

Fortaleza Descanso Fedear

369

Descanso Descanso Improar

15 - 50

Densidad

siembra

Kg/Ha

1 160 200 230 230 230 230 170 170

2 ND ND 220 Descanso 230 Descanso Descanso ND

Área

sembrad

1 19 Ha 15 Ha 12 Ha 10 Ha 10 Ha 20 Ha 12 Ha 18 Ha

2 8 Ha 11 Ha 12 Ha 10 Ha 10 Ha 20 Ha 11 Ha 3.5 Ha

Produc

Kg/Ha

1 5938 4688 5300 6200 6700 5625 5687 5500

2 ND ND 4935 Descanso 5937 Descanso Descanso ND

Resumen MetaSecano Inundado Secano

Page 19: Daniel uribe velez

Esquema Metodológico

Determinar el papel de microorganismos edáficos y factores físico químicos asociados a la calidad de suelo en fincas arroceras del departamento del Tolima y Meta

Recuento total de microorganismos

cultivables

Recuento de grupos Funcionales

Fijadores de N2Solubilizadores de P

Degradadores de lig. Y Cell

Determinar y analizarLos factores fisico quimicos

del suelo

Determinación de la actividad metabolica y enzimatica de los suelos

Diversidad de microorganismosno cultivables

Page 20: Daniel uribe velez

Análisis Físico Químico por ZonasVariables MS MI TN TS

MS ES T MI ES T TN ES T TS ES T

pH 4,70 0,09 c 5,40 0,11 b 5,70 0,14 ab 6,23 0,21 a

%MO 2,86 0,11 ns 2,70 0,26 ns 3,56 0,63 ns 2,48 0,18 ns

Ca 1,77 0,19 b 1,58 0,20 b 5,29 1,05 b 14,65 1,44 a

Mg 0,59 0,04 b 0,37 0,06 b 2,04 0,55 a 3,31 0,59 a

K 0,30 0,06 ns 0,28 0,02 ns 0,26 0,03 ns 0,37 0,06 ns

Na 0,27 0,14 ns 0,17 0,03 ns 0,17 0,03 ns 0,23 0,01 ns

Al 1,59 0,09 a 0,87 0,30 a 0,00 0,00 0,00 0,00

CIC 9,38 0,40 b 7,69 1,43 b 12,33 1,74 b 19,03 1,18 a

P 17,91 2,55 ns 42,15 11,93 ns 19,12 9,92 ns 30,93 4,22 ns

Cu 2,76 0,34 b 2,15 0,49 b 2,81 0,82 b 5,36 0,56 a

Fe 219,50 23,36 b 426,75 32,64 a 254,25 39,18 b 289,50 45,06 ab

Mn 43,60 7,47 ns 44,58 5,37 ns 166,38 50,62 ns 74,33 17,08 ns

Zn 3,27 0,80 bc 1,39 0,28 c 6,44 0,75 a 5,44 0,92 ab

B 0,24 0,02 ns 0,26 0,01 ns 0,34 0,04 ns 0,25 0,02 ns

NT 0,22 0,01 ns 0,17 0,02 ns 0,20 0,03 ns 0,14 0,01 ns

NH4 27,78 4,00 ab 42,13 5,72 a 13,15 1,99 cb 2,99 1,49 c

N-NO3 29,45 3,84 a 9,09 3,26 b 7,46 1,26 b 3,00 1,21 b

%Hum 36,13 1,79 ns 54,93 8,34 ns 43,74 3,52 ns 46,50 4,79 ns

Arcilla 24,00 2,83 ns 26,00 2,58 ns 19,75 4,87 ns 31,00 1,73 ns

Limo 41,50 3,30 a 35,00 0,82 a 18,25 1,11 b 35,00 2,86 a

Arena 34,50 4,65 b 39,00 1,83 b 62,00 5,69 a 33,75 3,66 b

Producti 5453 270 b 5956 310 b 8589 601 a 8172 619 a

Page 21: Daniel uribe velez

Análisis Físico Químico por ZonasVariables MS MI TN TS

MS ES T MI ES T TN ES T TS ES T

pH 4,70 0,09 c 5,40 0,11 b 5,70 0,14 ab 6,23 0,21 a

%MO 2,86 0,11 ns 2,70 0,26 ns 3,56 0,63 ns 2,48 0,18 ns

Ca 1,77 0,19 b 1,58 0,20 b 5,29 1,05 b 14,65 1,44 a

Mg 0,59 0,04 b 0,37 0,06 b 2,04 0,55 a 3,31 0,59 a

K 0,30 0,06 ns 0,28 0,02 ns 0,26 0,03 ns 0,37 0,06 ns

Na 0,27 0,14 ns 0,17 0,03 ns 0,17 0,03 ns 0,23 0,01 ns

Al 1,59 0,09 a 0,87 0,30 a 0,00 0,00 0,00 0,00

CIC 9,38 0,40 b 7,69 1,43 b 12,33 1,74 b 19,03 1,18 a

P 17,91 2,55 ns 42,15 11,93 ns 19,12 9,92 ns 30,93 4,22 ns

Cu 2,76 0,34 b 2,15 0,49 b 2,81 0,82 b 5,36 0,56 a

Fe 219,50 23,36 b 426,75 32,64 a 254,25 39,18 b 289,50 45,06 ab

Mn 43,60 7,47 ns 44,58 5,37 ns 166,38 50,62 ns 74,33 17,08 ns

Zn 3,27 0,80 bc 1,39 0,28 c 6,44 0,75 a 5,44 0,92 ab

B 0,24 0,02 ns 0,26 0,01 ns 0,34 0,04 ns 0,25 0,02 ns

NT 0,22 0,01 ns 0,17 0,02 ns 0,20 0,03 ns 0,14 0,01 ns

NH4 27,78 4,00 ab 42,13 5,72 a 13,15 1,99 cb 2,99 1,49 c

N-NO3 29,45 3,84 a 9,09 3,26 b 7,46 1,26 b 3,00 1,21 b

%Hum 36,13 1,79 ns 54,93 8,34 ns 43,74 3,52 ns 46,50 4,79 ns

Arcilla 24,00 2,83 ns 26,00 2,58 ns 19,75 4,87 ns 31,00 1,73 ns

Limo 41,50 3,30 a 35,00 0,82 a 18,25 1,11 b 35,00 2,86 a

Arena 34,50 4,65 b 39,00 1,83 b 62,00 5,69 a 33,75 3,66 b

Producti 5453 270 b 5956 310 b 8589 601 a 8172 619 a

Page 22: Daniel uribe velez

Análisis de PCA de Variables Físicas y Químicas

A. Primer año B. Segundo año

-0.4 -0.2 0.0 0.2 0.4 0.6

-0.4

-0.2

0.0

0.2

0.4

0.6

PC1 (45.1)

PC

2(2

4.9

)

1

2

3

4

5

6

7

8

910

11

12

13

1415

16

-4 -2 0 2 4

-4-2

02

4

Ca

MgCICFe

Mn

NT

L

S

Page 23: Daniel uribe velez

Conclusiones• 1) Los suelos del Meta y Tolima se diferenciaron por el material parental lo

cual se ve reflejado en las características físicas y químicas y el estatus nutricional del suelo en cada zona.

• 2) El Tolima, de mayor fertilidad, presenta pH con valores levemente ácidos a neutros, y mayor concentración de nutrientes como el Ca, Mg y Zn.

• 3) Los suelos del Meta, son suelos ácidos con altas concentraciones de Al, Fe y Mn, bajas concentraciones de Ca y Mg. Estos suelos se diferenciaronpor el sistema de cultivo (secano e inundado).

• 4) El Tolima se diferencio en dos subregiones, Tolima sur con fertilidad media, suelos ligeramente ácidos, altos niveles de CIC, Ca, Cu y Zn. Tolima norte con fertilidad baja, moderadamente ácidos, altos contenidos de MO y niveles ideales de Ca, medios de Mg, K, Cu y exceso de Fe, Mn, Zn y S.

• La uniformidad en términos de %CO, K, P y %NT para las 4 zonas muestreadas podría ser efecto de la constante actividad agrícola.

Page 24: Daniel uribe velez

Esquema Metodológico

Determinar el papel de microorganismos edáficos y factores físico químicos asociados a la calidad de suelo en fincas arroceras del departamento del Tolima y Meta

Recuento total de microorganismos

cultivables

Recuento de grupos Funcionales

Fijadores de N2Solubilizadores de P

Degradadores de lig. Y Cell

Determinar y analizarLos factores fisico quimicos

del suelo

Determinación de la actividad metabolica y enzimatica de los suelos

Diversidad de microorganismosno cultivables

Page 25: Daniel uribe velez

Recuento Bacteriano: Agar nutritivo

Recuento Hongos: Agar sabouraud dextrosa ASD

Recuento de Actinos: Agar Caseina Almidon

Esquema Metodológico

Diluciones seriadas

Page 26: Daniel uribe velez

Fijadores Biológicos de Nitrógeno

Page 27: Daniel uribe velez

Solubilizadores de Fosfato

Fosfato tricalcico

Fosfato de aluminio

Page 28: Daniel uribe velez

Microorganismos Ligninolíticos y Celulolíticos

Lignina alcalina

Carboximrtil Celulosa

Celulosa

Page 29: Daniel uribe velez

Estructuras micorrícicas observadas

A. Hifas y vesículas B. Hifas y arbúsculos C. Glomus sp.

Page 30: Daniel uribe velez

MUESTRAS % CT % CV %CA %CH

ZONA

NORTE

LIEVANO-ARMERO

FINCA 1 8,00% 0,50% 0,00% 7,50%

FINCA 2 16,50% 0,00% 0,00% 16,50%

FINCA 3 61,50% 11,00% 4,00% 46,50%

FINCA 4 55,50% 12,00% 0,00% 41,50%

ZONA

SUR SALDAÑA

-ESPINAL

FINCA 5 45,00% 6,00% 13,00% 26,00%

FINCA 6 21,50% 7,00% 0,00% 14,50%

FINCA 7 9,50% 5,00% 0,00% 4,50%

FINCA8 21,50% 3,50% 0,00% 18,00%

Porcentaje de Colonización de HFMA

en Raíces de Arroz en Tolima

CT= Colonización total, CV= Colonización vesículas,

CA= Colonización arbúsculos, CH= Colonización de hifas

Page 31: Daniel uribe velez

Porcentaje de Colonización de HFMA en Raíces de Arroz en Meta

SISTEMA% CT % CV %CA % CHI

%

CHE

SECANO

Finca 9 39,7 14,0 0,0 39,0 4,5

Fin. 10 33,5 7,5 0,0 31,5 5,2

Fin. 15 47,0 8,5 2,5 46,5 3,0

Fin. 16 68,7 18,5 0,75 64,5 12,7

INUNDADO

Fin. 12 43,5 8,0 6,2 38,0 9,2

Fin. 13 8,2 3,2 0,2 3,7 4,0

Fin. 14 2,5 0,0 0,0 1,5 1,0

CT= Colonización total, CV= Colonización vesículas,

Page 32: Daniel uribe velez

Análisis de PCA de Mos

CultivablesTolimaA. Primer año B. Segundo año

-0.5 0.0 0.5

-0.5

0.0

0.5

PC1 (72.2)

PC

2 (

20

.5)

1

2

3

4

5

6

7

8

-2 -1 0 1 2

-2-1

01

2

Nfb

CFA

CAF

Page 33: Daniel uribe velez

Análisis de PCA de MOs Cultivables Meta

A. Primer año. B. Segundo año

Page 34: Daniel uribe velez

Efecto de Distribución deGrupos Funcionales

Projection of the variables on the factor-plane ( 1 x 2)

Active

AN

Nfb

ARA

HSF_1

CFA_1

HCL_1

-1,0 -0,5 0,0 0,5 1,0

Factor 1 : 55,66%

-1,0

-0,5

0,0

0,5

1,0

Fa

cto

r 2

: 2

5,2

0%

Projection of the cases on the factor-plane ( 1 x 2)

Cases with sum of cosine square >= 0,00

Labelling variable: ID

Active

TN1

TN2

TN3

TN4

TS5TS6

TS7

TS8

MV9

MV10

MA11

MA12

MA13

MA14

MV15

MV16

-4 -3 -2 -1 0 1 2 3 4 5 6

Factor 1: 55,66%

-4

-3

-2

-1

0

1

2

3

4

Facto

r 2:

25,2

0%

Page 35: Daniel uribe velez

BCELHCEL Hlig AN Nfb ACT PDA CFC CFA FH AF BSF HSF

pH -0,062 -0,251 0,455 0,504 0,67 -0,64 -0,68 -0,36 -0,48 -0,8 -0,4 0,157 -0,25% CO -0,436 -0,311 0,046 -0,36 -0,2 -0,21 -0,37 -0,4 -0,51 -0 -0,4 0,113 0,01

Ca -0,334 -0,063 0,143 0,682 0,88 -0,58 -0,48 -0,52 -0,25 -0,8 -0,3 0,089 -0,4Mg -0,443 -0,055 0,067 0,503 0,71 -0,48 -0,47 -0,42 -0,24 -0,7 -0,3 0,32 -0,37K -0,358 0,455 -0,13 0,404 0,34 0,024 -0,05 -0,24 0,268 -0,1 0,45 -0,1 -0,16

Mg/K -0,215 -0,341 0,411 0,307 0,57 -0,64 -0,58 -0,24 -0,53 -0,7 -0,5 0,418 -0,28

Ca/K -0,102 -0,287 0,413 0,53 0,77 -0,7 -0,56 -0,39 -0,47 -0,8 -0,5 0,149 -0,32

Ca+Mg/K -0,126 -0,302 0,418 0,491 0,74 -0,7 -0,57 -0,36 -0,48 -0,8 -0,5 0,206 -0,31Al 0,044 0,307 -0,41 -0,15 -0,2 0,579 0,667 0,257 0,331 0,35 0,48 0,122 0,04CIC -0,416 -0,089 0,097 0,5 0,71 -0,51 -0,43 -0,53 -0,32 -0,7 -0,3 0,213 -0,39

P 0,255 0,047 -0,18 0,185 0,02 0,173 0,298 0,085 0,43 0,21 -0 -0,21 -0

Fe 0,399 0,196 -0,21 -0,15 -0,3 0,268 0,277 0,119 0,402 0,39 0,2 -0,58 0,35

Mn -0,286 -0,513 -0,13 -0,55 -0,5 -0,03 -0,11 -0,25 -0,35 -0,1 -0,3 0,251 0,23

N-NO3 -0,572 0,214 -0,23 0,413 0,54 -0,27 -0,26 -0,27 0,14 -0,4 0,06 0,215 -0,27Arcilla -0,028 0,518 -0,4 0,665 0,5 0,025 0,188 -0,43 0,404 -0,3 0,43 -0,5 -0,37Limo 0,336 0,582 -0,2 0,295 0,15 0,537 0,608 0,247 0,669 0,32 0,71 0,043 0,11

Arena -0,226 -0,657 0,327 -0,52 -0,3 -0,39 -0,52 0,025 -0,67 -0,1 -0,7 0,201 0,09%Humedad 0,384 0,351 -0,26 0,11 -0 0,228 0,429 0,022 0,335 0,21 0,31 -0,35 0,21

Correlaciones Microorganismos y Físicos y Químicos 2do Año

Page 36: Daniel uribe velez

Conclusiones• 1) Se encontró un número importante de microorganismos

asociados a la solubilización y mineralización de fosfato a la FBN y organismos celulolíticos en los suelos arroceros del Tolima y Meta.

• 2) Los recuentos de los diferentes grupos funcionales de microorganismos fueron influenciados por las características físicas y químicas del suelo.

– El contenido de Ca+ parece favorecer los FBN pero inhibe los Sol de P.

– El contenido de nitrato favorece los Sol de P.

– El pH y la textura del suelo afectan la distribución de los diferentes grupos funcionales particularmente Sol de P y celulolíticos.

– Cationes como Ca+ y Mg+ y sus fracciones ejercen un efecto muy importante sobre la distribución de los diferentes grupos funcionales.

Page 37: Daniel uribe velez

Esquema Metodológico

Determinar el papel de microorganismos edáficos y factores físico químicos asociados a la calidad de suelo en fincas arroceras del departamento del Tolima y Meta

Recuento total de microorganismos

cultivables

Recuento de grupos Funcionales

Fijadores de N2Solubilizadores de P

Degradadores de lig. Y Cell

Determinar y analizarLos factores fisico quimicos

del suelo

Determinación de la actividad metabolica y enzimatica de los suelos

Diversidad de microorganismosno cultivables

Page 39: Daniel uribe velez

Tolima (1)

Fincas

1 2 3 4 5 6 7 8

nmol

es d

e et

ileno

106

g-1h-1

0

10

20

30

40

50

60

70

Meta (1)

Fincas

9 10 11 12 13 14 15 16

0

100

200

300

400

500

cb

c

a

a

a

ab

ab ab

Tolima (2)

Fincas

1 2 3 4 5 6 7 8

0

2000

4000

6000

8000

10000

12000

14000

16000

cb c c

b b

a

bb

Meta (2)

Fincas

9 10 11 12 13 14 15 16

0

100

200

300

400

500

ba

b ba

ba

b b

a

nmol

es d

e et

ileno

106

g-1h-1

Actividad Nitrogenasa

Page 40: Daniel uribe velez

Actividad ProteasaTolima (1)

Fincas

1 2 3 4 5 6 7 8

µg d

e tir

osin

a g-1

h-1

0

200

400

600

800

1000

cb

ba

aa

dc

dcd

dc

Meta (1)

Fincas

9 10 11 12 13 14 15 16

0

100

200

300

400

500

600

dc

bcb

d

a

b b b

Tolima (2)

Fincas

1 2 3 4 5 6 7 8

µg d

e tir

osin

a g-1

h-1

0

20

40

60

80

100

120

140

160

Meta (2)

Fincas

9 10 11 12 13 14 15 16

0

200

400

600

800

1000

1200

1400

1600

1800

cbc

cb c ccb

a

b

Page 41: Daniel uribe velez
Page 42: Daniel uribe velez

abc

ab

abc

abc

abc c

a

bc

0

10

20

30

40

50

1 2 3 4 5 6 7 8

ugr

amo

s d

e ρ

-nit

rofe

no

l x g

-1 s

ue

lo s

eco

x

h-1

Fincas

B - GLUCOSIDASA II AÑO TOLIMA

ab

ab

b b

b

b

a

b

0

10

20

30

40

50

60

9 10 11 12 13 14 15 16ugr

amo

sd

e ρ

-nit

rofe

no

lx g

-1 s

ue

lo s

eco

x

h-1

Fincas

B - GLUCOSIDASA II AÑO - META

Actividad Celulolítica

Page 43: Daniel uribe velez

d

c c

b b

a

dd

0

20

40

60

80

100

120

140

160

180

1 2 3 4 5 6 7 8

ugr

amo

s d

e ρ

-nit

rofe

no

l x g

-1 s

ue

lo s

eco

x

h-1

Fincas

ARILSULFATASA I AÑO - TOLIMA

0

20

40

60

80

100

120

140

160

1 2 3 4 5 6 7 8

ugr

amo

s d

e ρ

-nit

rofe

no

l x g

-1 s

uel

o s

eco

x h

-1

Fincas

ARILSULFATASA II AÑO - TOLIMA

ab

a

a

a

aa

a

0

50

100

150

200

250

9 10 11 12 13 14 15 16ugr

amo

s d

e ρ

-nit

rofe

no

l x g

-1 s

ue

lo

seco

x h

-1

Fincas

ARILSULFATASA I AÑO - META

Cd

b

d

a

e

dc

d

cd

b

cb

dcd

aa

0

50

100

150

200

250

300

350

9 10 11 12 13 14 15 16

ugr

amo

s d

e ρ

-nit

rofe

no

l x g

-1 s

uel

o

seco

x h

-1

Fincas

ARILSULFATASA II AÑO - META

Actividad Enzimática

Arilsulfatasa

Page 44: Daniel uribe velez

FINCAS

1 2 3 4 5 6 7 8

um

ole

s d

e p

-nitro

fen

ol/g

r su

elo

se

co

/ho

ra

0

10

20

30

40

Fosfatasa acida

Fosfatasa alcalina

bcbc

cd

ab

bc

d

c

a

a a a

b

bcbc

c

b

FINCAS

9 10 11 12 13 14 15 16

um

ole

s d

e p

-nitro

feno

l/gr

de s

uelo

seco/h

ora

0

10

20

30

40

Fosfatasa acida

Fosfatasa alcalina

abc

e

d

ab

abc

ad

c

b

a a

bc bc

bc

d

e

Actividad Fosfatasa

Acida y Alcalina

Page 45: Daniel uribe velez

Actividad Fosfatasa Acida y Alcalina

0

50

100

150

200

250

300

350

400

450

1 2 3 4 5 6 7 8

FOSFATASA ACIDA Y ALCALINA II AÑO - TOLIMA

a

a ab a

a

a

b

cdd

cdb

a a

bc

FOSFATASA ACIDA FOSFATASA ALCALINA

ugr

amo

s d

e ρ

-nit

rofe

no

l x g

-1 s

ue

lo

ab

bcd

0

50

100

150

200

250

300

350

400

450

500

9 10 11 12 13 14 15 16

FOSFATASA ACIDA Y ALCALINA II AÑO - META

FOSFATASA ACIDA FOSFATASA ALCALINA

ugr

amo

s d

e ρ

-nit

rofe

no

l x g

-1 s

ue

lo s

eco

bc

c

b

b

c

b

aa

d

ba

cdd d

bc

Page 46: Daniel uribe velez

Resumen de Actividades Enzimáticas Por Zona de Estudio

Enzimas

MS MI TN TS

MS ES T MI ES T TN ES T TS ES T

ARA 86,74 20,51 b 227,93 31,80 a 34,89 2,21 c 29,64 3,23 c

Prot 80,793 3,0893 b 105,88 14,0579 b 278,307 22,2776 a 94,551 5,3192 b

Aril 68,3945 2,6937 ns 89,6152 8,44076 ns 74,4547 3,24318 ns 74,2112 6,2321 ns

FAC 27,6314 1,25322 a 16,854 1,66794 b 30,3381 0,5463 a 30,4262 1,06168 a

FAL 9,3311 0,696602 a 2,28076 0,314124 b 2,49151 0,371642 b 8,21998 0,539493 a

Page 47: Daniel uribe velez

Correlaciones Enzimas y Físicos y Químicos 2do Año

ARIL FAC FAL ARA P. ARA PRO B-GlucpH -0,637 -0,129 0,472 0,669 -0,277 -0,613 0,031

Ca -0,433 0,064 0,747 0,642 -0,281 -0,48 0,301Mg -0,415 0,101 0,677 0,473 -0,328 -0,488 0,467

K 0,097 0,203 0,497 0,142 -0,037 0,046 0,07

Ca/Mg -0,084 -0,235 0,027 0,173 0,289 0,014 -0,702

Mg/K -0,472 0,059 0,423 0,408 -0,469 -0,572 0,368

Ca/K -0,48 0,011 0,501 0,566 -0,383 -0,539 0,175Ca+Mg/K -0,485 0,021 0,492 0,54 -0,406 -0,553 0,217

Na -0,406 -0,292 0,436 0,23 -0,024 -0,458 0,262

Al 0,616 0,097 -0,085 -0,219 0,176 0,484 0,14

CIC -0,388 0,11 0,708 0,503 -0,315 -0,49 0,441P -0,308 -0,453 -0,449 -0,039 0,507 0 -0,437

Fe 0,409 0,08 -0,407 -0,434 0,205 0,575 -0,485

Mn -0,127 0,041 -0,138 -0,127 -0,249 -0,23 0,434Zn -0,266 -0,104 0,209 -0,038 -0,15 -0,28 0,614

NT 0,098 0,263 0,002 -0,184 -0,108 0,085 0,465

N-NO3 -0,166 0,197 0,548 0,196 -0,149 -0,265 0,548

Limo 0,367 -0,034 0,032 -0,111 0,348 0,611 -0,093Arena -0,329 0,085 -0,199 -0,021 -0,386 -0,455 0,225

%Humedad 0,678 0,319 -0,072 -0,399 0,042 0,741 0,027

Page 48: Daniel uribe velez

Esquema MetodológicoAislar y caracterizar

fijadores de N2,solubilizadores de P y

degradadores de cell y lig

Determinar el papel de microorganismos edáficos y factores físico químicos asociados a la calidad de suelo en fincas arroceras del departamento del Tolima y Meta

Recuento total de microorganismos

cultivablesRecuento de grupos

FuncionalesFijadores de N2

Solubilizadores de PDegradadores de lig. Y Cell

Determinar y analizarLos factores fisico quimicos

del suelo

Determinación de la actividad metabolica y enzimatica de los suelos

Diversidad de microorganismosno cultivables

Page 49: Daniel uribe velez

DIVERSIDAD DE MICROORGANISMOS NO CULTIVABLES

Estandarización de extracción de ADN de

suelos y Extracción de ADN

Amplificación de genes

16S rDNA ITS por PCR

Selección de primers y estandarización de condiciones de PCR

Estandarización de DGGE (Denaturing gradient Gel

Electrophoresis): gradiente denaturante, tiempo de

corrida, voltaje.

Separación de

productos de PCR

(por Composición)

Análisis molecular

Page 50: Daniel uribe velez

Tolima y meta año 1MPM 16.1 15.1 14.1 13.1 12.1 11.1 10.1 9.1 8.1 7.1 6.1 5.1 4.1 3.1 2.1 1.1 173

Page 51: Daniel uribe velez

Tolima año 1, réplicas 1 y 28.2.2 8.2.1 7.2.2 7.2.1 6.2.2 6.2.1 5.2.2 5.2.1 4.2.2 4.2.1 3.2.2 3.2.1 2.2.2 2.2.1 1.2.2 1.2.1

Page 52: Daniel uribe velez

Tolima y Meta año 216.1 15.1 14.1 13.1 12.1 11.1 10.1 9.1 8.1 7.1 6.1 5.1 4.1 3.1 2.1 1.1

Page 53: Daniel uribe velez
Page 54: Daniel uribe velez
Page 55: Daniel uribe velez

Análisis de 16S rDNA

Año I y II

9 15 10 16 1113 12 7 8 14 4 5 6 2 1 3 8 4 3 2 1 7 6 5 13 10 9 15 16 14 12 11

Primer Año Segundo Año

Page 56: Daniel uribe velez

Diversidad y Riqueza BacteriasFINCA

Riqueza

(No. de

OTUS)

Diversidad

(Shannon)

Dominancia

(Simpson_1/

D)

Equitativi

dad

(Pielou)

1 9 2,19 0,84 0,99

2 10 2,31 0,87 1,00

3 8 2,08 0,85 1,00

4 12 2,44 0,89 0,98

5 10 2,28 0,88 0,99

6 10 2,16 0,83 0,94

7 17 2,71 0,91 0,96

8 16 2,73 0,92 0,98

9 15 2,71 0,92 1,00

10 12 2,46 0,90 0,99

11 9 2,16 0,86 0,98

12 11 2,32 0,88 0,97

13 9 2,19 0,87 0,99

14 10 2,24 0,88 0,97

15 8 2,09 0,85 1,00

16 10 2,30 0,88 0,99

Page 57: Daniel uribe velez

DGGE Hongos• Marcador Filogenético → Secuencia

intergénica ITS 1 y 2 entre 18S y 28S

PCR 1

PCR 2

EF4

Page 58: Daniel uribe velez

Análisis de Hongos Tolima y Meta año 1

H IV 16.1 15.1 14.1 13.1 12.1 11.1 10.1 9.1 8.1 7.1 6.1 5.1 4.1 3.1 2.1 1.1 H II

Page 59: Daniel uribe velez

Tolima y Meta año 216.2 15.2 14.2 13.2 12.2 11.2 10.2 9.2 8.2 7.2 6.2 5.2 4.2 3.2 2.2 1.2 H IV H II

Page 60: Daniel uribe velez

Análisis de 18S-ITS rDNA Año I y II

10 14 16 11 12 15 6 3 1 2 4 5 13 8 7 9 7 8 13 14 15 16 11 12 9 10 3 4 6 1 2 5

Primer Año Segundo Año

Page 61: Daniel uribe velez

Diversidad y Riqueza HongosFINCA

Riqueza

(No. de

OTUS)

Diversidad

(Shannon)

Dominancia

(Simpson_1/D)

Equitativid

ad (Pielou)

1 11 2,38 0,90 0,99

2 15 2,70 0,93 1,00

3 9 2,18 0,89 0,99

4 10 2,29 0,90 0,99

5 18 2,88 0,94 0,99

6 15 2,68 0,93 0,98

7 15 2,68 0,93 0,99

8 12 2,44 0,91 0,98

9 15 2,70 0,93 0,99

10 18 2,86 0,94 0,99

11 11 2,38 0,90 0,99

12 10 2,27 0,89 0,98

13 14 2,61 0,92 0,99

14 13 2,53 0,92 0,98

15 13 2,54 0,92 0,99

16 13 2,54 0,92 0,99

Page 62: Daniel uribe velez

Conclusiones• 1) La estructura de la comunidad procariotica está

determinada por las condiciones físico-químicas del suelo, las cuales están determinadas por el origen del mismo y las prácticas de manejo del cultivo.

• 2) El marcador molecular del gen 16S rDNA, es más adecuado (en comparación al marcador de ITS), para identificar diferencias entre la estructura de la población microbiana en las zonas evaluadas.

• 3) La aplicación de enmiendas bacterianas para la mejora de la fertilización del cultivo de arroz, debe tener en consideración las condiciones físicas y químicas del suelo.

• 4) Los suelos estudiados, presentan una alta diversidad de hongos representados por el número de OTUs por finca.

Page 63: Daniel uribe velez

Esquema Metodológico

Determinar el papel de microorganismos edáficos y factores físico químicos asociados a la calidad de suelo en fincas arroceras del departamento del Tolima y Meta

Diseño y Evaluación de estrategias de fertilización de dos fincas del Tolima y dos del Meta

Page 64: Daniel uribe velez

Evaluación de Enmiendas Microbianas en una soca de arroz en el Municipio de Saldaña

Tratamiento Aislamiento

T1 Bacillus sp.

T2 Enterobacter sp.

T3 SP13AHSFC01

T4 SP10AHCAF03

T5 Control Pos. Sol P

T6 Control Pos. FBN

T7 Control No inoculado

Page 65: Daniel uribe velez

Soca de Arroz Luego de Corte con Guadaña

Page 66: Daniel uribe velez

Rebrote de la Soca

Page 67: Daniel uribe velez

Soca en Saldaña

Page 68: Daniel uribe velez

Efecto de Aplicación de Hongo Celulolítico al Tamo

Inoculante Trich

oder

ma

sp.

Altura

planta

(cm)

Peso de

1000

granos

Granos.

Panícula-1

Vaneami

ento (%)

No.

Panículas

.m-2

Rendimie

nto (t/ha)

%

Incre

Rend

Bacillus sp. + 103,1 1,2a 25,66 4,0 a 80 5,2a 2,0 0,5a 496 41,6 a 5,73 0,4a 32

- 92,95 1,0 b 18,25 0,8 a 67 1,5 b 2,48 1,2 a 448 23,5 a 4,34 0,1b

Enterobacter sp.

+ 97,31 1,1 a 24,75 1,0 a 92 3,8 a 4,05 1,6 a 589 14,8 a 6,02 0,6 a 32

- 87,6 0,81 b 19,63 2,8 a 66 3,5 b 2,11 1,5a 431 20,9 b 4,55 0,2a

SP13AHSFC01 + 101,4 1,3 a 25,13 1,5 a 78 6,6 a 2,37 1,5ª 420 52,0 a 5,73 0,8 a 21

- 92,38 1,0 b 20,88 2,5 a 67 4,3 a 2,76 1,7ª 496 17,0 a 4,73 0,3a

SP10AHCAF03 + 99,92 1,0 a 23,00 3,9 a 99 7,1 a 2,57 0,6ª 543 21,5 a 5,77 0,3a 21

- 89,75 1,0 b 20,88 3,8 a 80 6,3 a 6,73 1,9ª 408 27,0 b 4,77 0,3b

Control Pos Sol de P

+ 100,8 1,0a 23,50 1,7 a 93 4,5 a 7,05 3,4ª 543 21,5 a 5,56 0,2a 9

- 89,33 1,0 b 22,75 2,3 a 84 8,0 a 2,48 1.0a 429 40,4 b 5,11 0,4a

Control PosFBN

+ 102,9 1,1 a 22,25 1,6 a 80 4,9 a 4,03 0,9ª 515 55,1 a 5,70 0,2a 21

- 88,73 0,8 b 20,63 1,1 a 74 3,3 a 2,64 1,3ª 454 37,0 b 4,70 0,2b

Control Neg + 100,0 1,1 a 24,88 1,6 a 88 6,0 a 6,31 2,3ª 528 25,0 a 6,15 0,4 a 36

- 91,75 0,9 b 18,38 1,8 b 71 7,2 a 4,89 1,7ª 422 15,9 b 4,51 0,3b

Page 69: Daniel uribe velez

Evaluación de enmiendas microbianas en un cultivo de arroz en Lérida Tolima

Tratamiento Microorganismo

T1 Bacillus sp

T2 Enterobacter sp.

T3 13HSFC01

T4 10HCAF03

T5 Micorrizas

T6 Control Pos Sol de P

T7 Control Pos FBN

T8 Control Neg

Page 70: Daniel uribe velez

Resultados de RendimientoEnsayo de Lérida

Tratamiento Altura de

planta (cm)

No.

Panículas/m2

Peso de 1000

granos

(g)

Vaneamiento

(%)

No. granos/

Panícula

Rendimiento

(T/ha)

Bacillus sp 90,61 1,36 y c 642 57,98 a 25,26 0,543 a 27,32 2,004 a 529,9 61,1a 5,72 0,4a

Enterobacter

sp. 93,51 0,91 b 641 25,79 a 26,81 0,487 a 24,64 2,274 a 456,55 75,6a 5,56 0,46 a13HSFC01 92,90 0,95 b 615 19,28 a 25,90 0,821 a 24,40 2,763 a 585,10 77,4a 5,71 0,43 a

10HCAF03 92,5 0,92 bc 598 40,08 a 26,35 2,311 a 24,79 1,763 a 398,85 98,3a 6,01 0,56 aMicorrizas 90,92 1,18 c 600 55,79 a 25,81 1,158 a 29,64 3,029 a 444,35 48,2a 6,39 0,31 a

Control Neg 94,50 0,90 a 585 43,95 a 22,57 1,647 a 17,32 1,290 a 592,45 49,2a 5,77 0,21 a

Control Pos. FBN 91,91 0,85 c 624 89,56 a 25,82 1,652 a 23,09 3,862 a 436,75 99,9a 5,16 0,32 a

Control Pos Sol de P 95,25 0,92 a 575 52,42 a 26,41 2,244 a 27,80 4,466 a 512,70 90,1a 5,68 0,16 a

Page 71: Daniel uribe velez

Evaluación de Enmiendas Microbianas en la Finca Capachos (Meta)

Tratamiento Aislamiento

T1 C9N

T2 C 5,6,7 N

T3 Control Pos FBN

T4 C9N/SP13AHSFC01

T5 SP13AHSFC01

T6 SP10AHCAF03

T7 Control Pos Sol de P

T8 Micorriza

T9 Testigo

Page 72: Daniel uribe velez

Evaluación de Variables de Crecimiento y Rendimiento

TratamientoAltura planta

(cm)

Granos.

Panícula-1

Vaneamiento

(%)

Longitud de

panícula

(cm)

No.

Panículas.

m-2

Rendimiento

(t/ha)

C9N 71,30x 1,2 a 70 10,49 a 27,77 4,5 a 18,90 0,9 a 621 56,7 a 3,26 0,31 a

C 5,6,7 N 71,15 0,9 a 60 16,84 a 23,67 5,6 a 18,93 0,7 a 683 56,7 a 3,29 0,36 a

Control Pos

FBN

71,17 1,7 a 59 16,09 a 24,00 1,0 a 18,47 1,2 a 609 22,7 a 3,83 0,37 a

C9N/

13HSFC01

68,44 0,9 b 68 5,03 a 28,10 3,3 a 18,97 0,6 a 717 107,9 a 3,67 0,44 a

13HSFC01 71,53 1,3 a 47 11,00 a 22,10 1,7 a 18,35 0,7 a 768 184,0 a 3,99 0,05 a10HCAF03 67,98 1,2 b 69 10,33 a 20,10 2,0 a 18,93 0,6 a 665 58,6 a 4,31 0,12 a

Control Pos

Sol de P

68,08 1,4 b 65 3,51 a 22,50 0,6 a 19,03 0,2 a 696 30,0 a 3,29 0,37 a

Micorriza 65,90 1,4 c 58 5,70 a 34,73 6,5a 18,67 0,4 a 660 26,6 a 3,91 0,19 a

Control 72,53 1,3 a 54 1,00 a 19,55 5,6 a 18,65 0,0 a 666 42,0 a 3,73 0,00 a

Page 73: Daniel uribe velez

Relación Entre el Contenido de N,P y K a 70 DDG y Rendimiento

Tratamiento C9N C 5,6,7 NControl Pos

FBNC9N/11A-HSFC-01

11A-HCFH-02

Control Pos Sol de P Micorriza

granos/pan. Vs. N 0,23 0,96 0,98 0,16 0,96 0,18 0,94granos/pan. Vs. P 0,51 0,14 0,82 0,70 1,00 0,32 0,83granos/pan. Vs. K 0,94 0,46 0,31 0,89 0,16 0,72 0,46van. Vs. N 0,58 0,99 0,85 1,00 0,96 0,42 0,24van. Vs. P 0,17 0,05 0,97 0,06 1,00 0,97 0,03van. Vs. K 0,98 0,20 0,31 0,00 0,16 0,02 0,78pan./m2 Vs. N 0,55 0,85 0,48 0,88 0,06 0,75 0,92pan./m2 Vs. P 0,20 0,05 0,04 0,00 0,00 0,00 0,32pan./m2 Vs. K 0,99 0,02 0,12 0,08 0,80 1,00 0,31peso 1000 g vs. N 0,06 0,24 0,03 0,57 0,16 0,01 0,12peso 1000 g vs. P 0,75 0,60 0,15 0,70 0,31 0,83 0,11peso 1000 g vs. K 0,78 0,25 0,64 0,50 0,96 0,22 0,63

Rendimiento Vs. N 0,14 0,01 0,98 0,04 0,13 0,71 1,00

Rendimiento Vs. P 0,62 0,01 0,83 0,78 0,04 0,79 0,56Rendimiento Vs. K 0,88 0,07 0,33 0,93 0,69 0,17 0,75

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Conclusiones Pruebas de Campo

• La aplicación de una enmienda microbiana con microorganismos celulolíticos, en el cultivo de soca, permitió incrementos significativos en el rendimiento (superiores al 21%).

• Los tratamientos donde se aplicaron los microorganismos (particularmente el tratamiento con micorrizas), tuvo un efecto sobre el vaneamiento en el arroz.

• Es relevante realizar estudios que permitan determinar el efecto del uso de microorganismos en el vaneamiento en el arroz con el objeto de mejorar las dosis de fertilizantes y microorganismos para resultados óptimos.

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Gracias!!Investigador Principal: Daniel Uribe Vélez, PhD

Universidad Nacional de Colombia Pontificia Universidad Javeriana• Luz Marina Melgarejo, PhD Ivonne Gutiérrez M.Sc• Jimena Sánchez Nieves, PhD (C) Adriana Matiz Villamil• Nubia C. Moreno Sarmiento, MSc• Fabio Aristizabal, PhD Fedearroz• Javier Vanegas, PhD (C ) Dr. Miguel Diago• Yaneth Rodríguez I.A. I.A. Elkin Florez• Mayra Beltrán M.Sc, Ing. Agrónomos del Tolima y Meta• Adriana Sanabria M.Sc• Diana Cristancho Bact. Biocultivos• Catalina Camelo, Bi Dr. Gonzalo Sarmiento• Francy Marentes, I.A Edgar Moller, I.A.

Page 76: Daniel uribe velez

Gracias!!Ministerio de Agriculturay Desarrollo Rural

FEDEARROZ