-
Smart Templates for Chemical Identification in GCxGC-MSQingPing Tao1, Stephen E. Reichenbach2, Mingtian Ni3, Arvind Visvanathan2, Michael Kok2, Luke L. Waltman1
1GC Image, LLC, Lincoln, NE2Computer Science & Engineering Dept., University of Nebraska-Lincoln3Microsoft Corp., Redmond, WAQ. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
GCxGC
Peak Template Matching
Smart Templates
Building Smart Multi-type Templates
Conclusions and Future WorkIntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkQ. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkGCxGCObjective of GCxGC AnalysisChemical IdentificationOutlineGCxGCTwo independent separations for the entire sampleGCxGC data can be processed as a digital imageMass spectrometry (MS) data provides rich information for identification
Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
GC ChromatogramGCxGC Total Ion Chromatogram IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkGCxGCObjective of GCxGC AnalysisChemical IdentificationOutlineGCxGCQ. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
Chart1
-0.3331816569
0.4130423643
14.9817934476
44.2993776075
98.1568650496
175.912076898
294.466299646
460.853605953
657.6836849605
787.8113270727
794.1001662003
800.9297899046
752.4350446532
736.9819775089
767.7716093692
758.4972497704
22977.487811035
2402.4975069373
703.7430291824
551.0362365304
470.2777570738
363.7344507998
349.5465674606
2978.1244803352
144.4874902795
44.1610444718
107.8134906885
31.6264623637
16.7234176351
18.5789591973
122.2297772393
107.2819625208
109.1335116021
172.9512164219
214.8990617422
90.4568666736
159.6362580376
203.5578817629
19.6238899762
530.6504676838
284.9153564306
18.460434994
15.4648651224
14.4626175463
394.9514891876
847.5641928028
86.686051055
1309.8071272135
2567.8598015687
1121.5604145445
3451.4348663924
1250.1986193216
4737.1200673116
3217.485596367
21914.0355145094
1778.754371709
5180.913453256
14162.8028556605
17056.6072334304
3825.116693499
17522.0519657529
15789.8177942988
2603.0619075529
1536.7255068218
3282.9217648012
6660.2354949299
3908.4818214818
5174.2373353989
9449.6769686697
50908.8510388328
8137.3603449255
316.2798473489
1018.5565097445
576.4573447172
434.3910046933
941.2089789315
1160.2716948694
937.9162567287
3147.2658240456
2890.9277690156
25498.5515101849
14359.269437478
8397.0509236021
11305.9814098644
3345.0823012888
2741.3242412263
1433.2899515612
24467.7665966291
24313.0980100048
3570.2266449968
4867.0235167649
30965.3977685008
10846.4127300349
3322.7201970031
9378.338262196
14832.5287236745
2642.2730828072
8250.3860284366
16392.3836274503
3309.0996023498
11842.7337141804
9602.9601781016
3119.6178375546
12032.7912262195
8591.1960336935
3821.596887965
2543.4529745788
1039.1863218016
312.7337351722
7537.18631934
57172.0751692361
24627.4217718036
6062.8410147819
2459.7827736397
1704.4423857414
5688.1084746531
6096.6643932207
6971.3604744403
5133.4970460054
4520.5206908229
2060.3728988722
3326.0452878527
12569.2018012856
7533.8031727998
6322.9835304018
6160.5991130476
16191.5466961329
9992.2116292687
10990.6861341946
17741.1691184131
9992.252480904
6063.9297723466
20226.6209101128
17057.7720340344
5805.0838690757
10910.9213451439
13028.8780270147
5309.5649261809
6230.6849012656
13743.0481993915
22403.9920995082
14028.2769401914
6039.6899744686
11492.0898882934
11539.3211294998
3072.5386372668
3194.6253893863
21853.6536180434
19465.7430162929
10351.8287089415
6761.285526471
4523.9488878213
2978.9864359281
2268.2912945866
4481.9133041232
5053.1536925758
12350.2758680605
51740.6724088102
42682.3370430073
4820.0490208049
10491.8359282906
9611.3196690758
4998.6797683177
4811.6836644633
3218.3559889745
5085.6059987295
5419.5196692677
7253.4781705844
9791.6829780227
17220.7850972823
7808.6602571438
9785.1073125076
7168.3280743018
7632.3095784272
9915.0755747143
11316.4807908593
12365.1496233942
16324.3404612835
12096.9014140705
8250.3526169094
7166.1568934395
6752.2353195308
8685.2906474188
8067.5704950787
3807.9405743237
5732.0553898649
7605.994935635
12759.1613836449
17296.7198538016
13561.9576893851
6207.6193360361
12713.7057468426
13664.1911758736
6411.2565335921
4626.8211051837
3145.3366598116
4136.512408889
6429.2910564073
5918.463789499
6467.3737478872
9885.389017565
11573.6324623065
6318.3488337495
5987.469252553
6961.2242934888
32762.2146895592
62780.2209744243
16398.1248223043
11518.0009955625
7296.425925923
5016.0772911373
3843.2520697321
4056.4719661706
4823.2247107776
6450.3927571564
8323.9197702353
10325.4073062816
7318.9706483334
5784.754374751
10912.1534585302
13662.5637972795
10621.8460176695
9545.1542176149
11530.8831782996
7959.2474417741
9092.1332375852
8606.7590060464
5952.8447718636
6432.4897658324
5683.5741938717
9369.4415078766
10733.2448464196
11185.1362093156
12090.6920565229
12702.4769801287
8180.0752462887
11238.2288804196
8274.0423758251
6804.7049619314
13289.9551455443
8335.4637653139
5821.1224782069
8332.1848583147
7784.3334714767
7673.9520324332
9347.9954687793
9028.8931791069
8856.0301691263
7357.8640151355
6622.943919981
7503.6672553463
9097.195608645
32047.6482157836
60902.892118028
16799.7363022389
6241.9658677851
5558.2970880678
6163.3422947478
7212.6113739566
12828.7860132425
20617.2139930044
9961.7709863421
9447.491431206
13837.2436263265
7999.1028798238
5685.9003055494
7877.4753584064
7960.2403508768
8469.8677903316
10723.4554726244
9957.3000067673
9479.0520213917
7638.2972396497
9389.9501255284
8723.5787693983
7221.2783810924
9629.8350768332
12250.231616979
11867.6812645077
12596.8656881063
13035.1557183432
12868.8107917145
15288.9625045189
10416.4748420229
19875.1124247128
20771.8291385923
15125.6165963898
17117.7217353656
11301.1062012547
11436.0812888414
10794.9275079837
17163.0016323833
14147.0729577005
8973.2753658133
8428.3431006921
8053.8136712152
12739.4273478076
48374.897226663
64748.6413051375
15223.5568297482
8447.6709959735
9190.3153208901
10217.0842107223
10434.9855267198
9122.1254042652
10817.3644620103
13244.6919316376
10416.0358550582
9745.2461095941
9684.2113619504
8232.0468456262
6056.3670796001
7235.9672107059
9504.557229613
11592.9351513157
14386.5095203688
11160.6743309578
7573.6735435523
8855.5655102108
12860.4826943978
14450.2259748665
11781.4355490262
10392.3943714723
12894.8950153906
11772.5232208953
16650.5262595883
13127.5338186161
15605.0324613983
18130.013682445
10852.8253797238
12255.2338111893
26311.3697690233
21199.4716420987
15565.7681102672
13798.3835727139
11108.6195517481
11011.671736503
12227.6391804561
20875.6406996017
38979.2267823214
80283.3322227216
38492.6115728046
13745.6137074448
10770.3133277772
9830.9253565435
11753.2491677146
14912.7760608994
13181.9283016972
9069.6472783197
9719.7347883242
10173.66943663
11416.6097201286
11809.6467978349
10026.4682308277
10915.2827613646
10477.4151439425
8953.3183773158
9683.254728056
12971.6841925857
14140.1585958486
13952.8350589922
14573.9883505699
12986.6588573046
12621.0304606096
14584.2106614406
18674.8034713528
32694.2581893811
21541.9610093107
14614.1410580827
14808.9412972713
9602.7161742974
10895.8122971296
13505.2520108964
17549.8916952128
14302.1351627428
12244.4796064755
11277.5440258756
13583.4924850574
16482.16422553
29863.3035204433
68803.6117532872
53914.855847687
16375.523241692
14525.2657732109
16505.0469041564
14468.0191202041
11170.5927883153
9583.3466595129
9846.461876969
12907.4426731156
13383.4808846023
12564.9916151644
11107.1384474903
10289.2076803732
10936.6077709163
12392.2754804549
13781.5647829699
12735.4569044675
16533.4899242559
20904.311679595
16830.4381084455
17030.8795253115
19986.8652323154
18571.5489700283
21368.5912381112
20801.8757450293
16442.2866251397
17717.5273490006
15403.528484219
13187.1197149117
13787.5998615567
13503.047079534
12819.8623464653
11111.802017293
12013.7081802358
13945.866895101
17894.3220663895
29420.9256141632
72413.5704701366
54858.6416707904
17995.2195063232
17552.069295474
16939.7595238874
15723.7791599775
13701.9889026548
12686.8254065101
12237.6466247172
12932.8295738602
13978.8063662428
14146.2010211451
12926.7138258888
12541.0232864523
13131.9779591329
12953.6361187644
14872.3845104811
19130.108522612
25692.7032771332
42130.269077653
30249.2324456213
18539.9406964184
18954.0130146686
22578.0647237245
22727.5136877517
19994.668595655
22413.5453693501
18840.0343125894
17658.9736377412
14765.8658343529
13674.6305945178
16121.3809974597
17599.7349699717
17642.9398919969
16793.0057160622
28047.5059451959
67911.1026824333
79430.5844568574
26234.0355396197
33831.3293205728
51999.6458178292
28412.6082598113
21321.5562000755
20045.0758626804
16828.5025930063
15497.7228125127
17453.4837070306
16308.1816562475
15432.4021032443
18693.0678704986
18946.5624737552
20864.5526839432
26534.2001214486
25207.0529021282
21124.95409929
26630.5077994066
28306.7143157734
22350.2087456927
22476.717702954
22383.0501038516
21301.3580584428
23362.1387672942
19894.4243184726
18006.1884686859
18175.2510494554
18631.7825784566
18891.5677910828
17449.3754811401
18710.2957470179
24343.7700218653
53128.8459988482
92246.1990658615
39475.4281272648
21969.1635165503
30126.3332727903
57116.8810926495
42515.1144006917
22813.9665674696
22671.6073317073
19304.7256147096
19256.7038956807
18619.8646726132
18390.5992267393
20896.9623601397
27456.8978537421
29676.2008906494
25345.6443842345
22553.6819096123
21677.5857735871
21778.3419903143
25543.5818744776
28497.0022727617
27194.1098558589
22798.7234254144
25409.2206734756
21977.8278369391
19254.3980550197
19749.0551573755
21454.4297018792
22859.8045823557
21894.7820388212
22772.2197356448
37248.2161408362
77273.4131830397
77176.328471126
26996.6772652531
22626.1685159741
22433.8102089712
23227.8923186099
22766.7362773763
20284.5446220987
20759.1385065002
20523.6551965487
19017.147674761
18972.6673506532
20559.3476293512
24849.3778535124
27481.1313169485
26366.4776101651
22669.3585466778
20520.0904190856
22098.2812721695
23416.0546331047
26315.8044127006
24465.338931177
23917.1841610041
23632.7404854937
20641.8120466532
20595.3320638941
20776.664384739
22045.4631049813
20941.6159016199
19339.8721475488
30011.4802803821
69104.8102231192
68472.7080727462
26476.674484246
21469.1424544361
21446.573310563
20133.0906100558
19638.4457884559
19782.5981089728
18958.1266056159
17590.3983393417
16696.0754304942
17664.5841328499
21200.2497735666
22496.6919226021
21114.8482753474
19631.9849409591
18322.0445704866
19251.6987619244
22130.9917266926
23585.6040385249
20565.8998983103
19945.5690722429
21580.1526806439
19813.497865793
22165.4634739375
21354.8869795786
18603.4267097577
18536.9481396528
19100.0996010309
36027.5514849475
67266.6497584171
34617.7938430397
19842.9442030084
18254.1138180179
18593.9940465185
17989.0930333925
16926.4466113783
16820.6936400159
16420.3930907507
16546.0348113003
19861.4394379496
22275.8615909497
19863.2064012114
19230.1898576572
18641.8803864665
17492.0057535257
17955.9835869859
18288.8181399223
19848.7774905781
19043.2208727254
19727.3266355484
21619.8662005726
18173.5772193293
20858.6147053819
23131.8313830666
17929.0520431015
17066.3260028094
24804.563089203
49464.1862464643
50076.0424533382
21116.4651221416
18007.1165405647
18801.4463273712
18303.5907330352
17754.673408078
16821.9010478755
16863.0312651596
15964.0280708258
17721.0659152967
21043.5216235063
21528.3041324546
18370.5231458506
18238.4558282788
17392.1133045249
18099.2589183646
18419.9351874367
19672.1763618901
18864.2906618449
19897.3146372335
17565.9954375371
17236.1266751502
16701.0014571815
16180.3701027293
16247.1240598264
19006.532087367
38214.9807328293
50004.9152965782
22293.7055315956
18237.1405392779
18029.0006580054
17416.301954168
17726.21229305
18536.3512919261
16859.4650074114
15824.9505198482
17701.9070559187
18155.7912635824
17735.4773095088
17336.9721542782
15750.7992961706
15903.6475578942
16214.2801471438
17664.3462595721
16404.6416833305
17168.1814496076
18136.2396420989
15764.9803559814
15215.7266646182
14933.9530901413
14454.733428082
17187.3801747204
33008.0248111974
43728.4050933902
21869.3396452045
16094.8350233567
15569.1597946125
15893.2237932677
15040.4678489769
15111.8182860385
15027.0949365416
14940.2590246654
16301.4129765606
15387.0340290749
14430.6287633839
15063.4355774536
14311.7107757516
14903.0721674611
15259.148047789
15361.6506333304
14487.3652500591
15766.8524731727
14746.3666985615
13102.2862321607
13401.7107350206
12756.4936003501
13413.0999519642
25459.5417624453
35704.2078596508
20220.4685348547
14971.4602019184
13640.6307191975
13360.6236736055
12880.6190065282
12463.2726486381
12002.2555766354
13084.6001539891
13560.0215143906
13936.3764529451
12705.2835403943
12298.462947611
12392.5373215666
13029.7812823717
14142.0074357567
13182.9894746444
12993.7112412667
12691.4414894047
12300.3203566641
11589.9661003212
11110.2567021821
11417.1965121691
18453.6954333259
28485.5991477599
17810.6403563793
12480.09075346
11377.4672043072
10638.2539346906
10723.6757114774
10858.3262180501
10714.333523638
11709.1211337433
11123.418902576
11300.9438460919
10813.0637501329
10771.6102251356
10545.3969831832
12088.3667037758
12382.8347345939
11445.3888681945
11220.1384970835
10293.1913317943
9674.127042943
9368.9766492165
9556.747535626
12378.3692849784
21888.7836217263
15296.5660170883
9608.6720886311
9570.8842933237
9272.2136024039
8925.5479943027
8724.4448458019
9194.0062305383
9609.993068984
9240.3686863498
9527.6796015704
9512.5119331924
9142.7932512146
9062.6109342828
9742.311336296
9259.1930830384
8876.3016158002
9386.6806404968
8177.9975965144
7803.807823357
7727.2190138095
8084.9332619302
14288.565788773
15262.1995199796
8641.8204329352
7376.5642858178
7331.8593653436
7051.5935983933
7559.8518236447
8769.3005033032
8687.1394404507
7457.5629727763
7359.585447978
7561.8925455715
7273.3916995884
7098.3332860395
7276.8004215271
7400.438669528
7156.0642640194
7389.5330811957
6594.8320355194
6548.7329232565
6773.0193609614
8038.2805126762
12112.8280693317
9689.0446139188
6051.2669990094
6108.4447491378
6021.5899902571
5870.2537755267
6504.9483532434
7077.0044814438
6608.4068738839
5931.3620159998
5588.0780180544
5387.062297767
5332.6189072568
5785.1326599379
5604.7981526646
5223.053708427
5515.9929479495
5299.6007269969
5358.9934219111
5376.2747619524
6432.4862226424
8305.889786429
6873.7365392742
4816.8658154415
4378.0213213276
4694.664777697
4873.5874757278
5012.072920986
4839.1247244463
4689.1978157437
4468.9148843575
4200.8718425205
3990.7555971027
3999.437920152
4199.6123870768
4670.9639152225
4799.9971395423
4254.0885116292
3825.3258468107
3893.8832677636
4584.8888304082
6215.7548492855
5200.0817361944
3686.6175744799
3577.7569743936
3291.0509610175
3123.6759008941
3114.3403826832
3417.213859865
3210.450563878
3117.8764097596
3025.9960082334
3073.7603389139
3461.728870654
3566.9666267869
3181.8780182478
3114.3514264231
2930.8825142144
2689.8409775516
2645.1373561765
3408.0232818902
4199.444578518
3298.8503654507
2535.3929183344
2446.0155270853
2434.0533579308
2514.079900066
2528.0960125408
2362.8665971662
2220.7216811567
2230.7842845687
2209.6530533119
2097.9423619636
2289.3333964728
2314.3470174542
2289.6455412423
2276.1665898635
2103.9359023341
2005.2984472488
2265.8241312354
2748.5483697756
2306.5935725752
1880.1758570802
1785.6438182147
1705.1592086676
1756.4948472602
1807.0442657044
1808.2481171205
1843.4518959288
1922.3195214378
1900.8008433514
1710.6037178359
1745.1960273296
1689.8038276783
1633.5063649789
1582.4314519931
1575.7488214014
1698.2927754113
2092.3333853147
2350.2275013271
2099.5928845442
2044.900608099
1875.0579261943
1658.5727243209
1591.7587146349
1529.6528182973
1522.5100906926
1533.8395443814
1544.5177458004
1509.9519704821
1519.788784889
1533.9073086256
1541.3481234272
1501.7111268973
1482.338771493
1524.5722907316
1739.6039658739
1672.5119353624
1581.2061365577
1613.4761089496
1565.3740458448
1562.5139462407
1595.3414195501
1585.2739923735
1601.6642458281
1666.3424934404
1669.6156895572
1631.4700308256
1620.1739222072
1669.3652196008
1686.7429963663
1675.5356423226
1692.8316495358
1742.7298340042
1813.5719616094
1727.8502323656
1681.0566824324
1735.9874515349
1781.4407940927
1803.4726370836
1747.22769154
1689.1841695524
1794.2957233296
1791.050381448
1846.3420529816
1831.8306077055
1842.3995750024
1838.6334355782
1868.5769304946
1834.2505732068
Time
Response
one_d
20.0333333333-0.3331816569
40.06666666670.4130423643
60.114.9817934476
80.133333333344.2993776075
100.166666666798.1568650496
120.2175.912076898
140.2333333333294.466299646
160.2666666667460.853605953
180.3657.6836849605
200.3333333333787.8113270727
220.3666666667794.1001662003
240.4800.9297899046
260.4333333333752.4350446532
280.4666666667736.9819775089
300.5767.7716093692
320.5333333333758.4972497704
340.566666666722977.487811035
360.62402.4975069373
380.6333333333703.7430291824
400.6666666667551.0362365304
420.7470.2777570738
440.7333333333363.7344507998
460.7666666667349.5465674606
480.82978.1244803352
500.8333333333144.4874902795
520.866666666744.1610444718
540.9107.8134906885
560.933333333331.6264623637
580.966666666716.7234176351
60118.5789591973
621.0333333333122.2297772393
641.0666666667107.2819625208
661.1109.1335116021
681.1333333333172.9512164219
701.1666666667214.8990617422
721.290.4568666736
741.2333333333159.6362580376
761.2666666667203.5578817629
781.319.6238899762
801.3333333333530.6504676838
821.3666666667284.9153564306
841.418.460434994
861.433333333315.4648651224
881.466666666714.4626175463
901.5394.9514891876
921.5333333333847.5641928028
941.566666666786.686051055
961.61309.8071272135
981.63333333332567.8598015687
1001.66666666671121.5604145445
1021.73451.4348663924
1041.73333333331250.1986193216
1061.76666666674737.1200673116
1081.83217.485596367
1101.833333333321914.0355145094
1121.86666666671778.754371709
1141.95180.913453256
1161.933333333314162.8028556605
1181.966666666717056.6072334304
12023825.116693499
1222.033333333317522.0519657529
1242.066666666715789.8177942988
1262.12603.0619075529
1282.13333333331536.7255068218
1302.16666666673282.9217648012
1322.26660.2354949299
1342.23333333333908.4818214818
1362.26666666675174.2373353989
1382.39449.6769686697
1402.333333333350908.8510388328
1422.36666666678137.3603449255
1442.4316.2798473489
1462.43333333331018.5565097445
1482.4666666667576.4573447172
1502.5434.3910046933
1522.5333333333941.2089789315
1542.56666666671160.2716948694
1562.6937.9162567287
1582.63333333333147.2658240456
1602.66666666672890.9277690156
1622.725498.5515101849
1642.733333333314359.269437478
1662.76666666678397.0509236021
1682.811305.9814098644
1702.83333333333345.0823012888
1722.86666666672741.3242412263
1742.91433.2899515612
1762.933333333324467.7665966291
1782.966666666724313.0980100048
18033570.2266449968
1823.03333333334867.0235167649
1843.066666666730965.3977685008
1863.110846.4127300349
1883.13333333333322.7201970031
1903.16666666679378.338262196
1923.214832.5287236745
1943.23333333332642.2730828072
1963.26666666678250.3860284366
1983.316392.3836274503
2003.33333333333309.0996023498
2023.366666666711842.7337141804
2043.49602.9601781016
2063.43333333333119.6178375546
2083.466666666712032.7912262195
2103.58591.1960336935
2123.53333333333821.596887965
2143.56666666672543.4529745788
2163.61039.1863218016
2183.6333333333312.7337351722
2203.66666666677537.18631934
2223.757172.0751692361
2243.733333333324627.4217718036
2263.76666666676062.8410147819
2283.82459.7827736397
2303.83333333331704.4423857414
2323.86666666675688.1084746531
2343.96096.6643932207
2363.93333333336971.3604744403
2383.96666666675133.4970460054
24044520.5206908229
2424.03333333332060.3728988722
2444.06666666673326.0452878527
2464.112569.2018012856
2484.13333333337533.8031727998
2504.16666666676322.9835304018
2524.26160.5991130476
2544.233333333316191.5466961329
2564.26666666679992.2116292687
2584.310990.6861341946
2604.333333333317741.1691184131
2624.36666666679992.252480904
2644.46063.9297723466
2664.433333333320226.6209101128
2684.466666666717057.7720340344
2704.55805.0838690757
2724.533333333310910.9213451439
2744.566666666713028.8780270147
2764.65309.5649261809
2784.63333333336230.6849012656
2804.666666666713743.0481993915
2824.722403.9920995082
2844.733333333314028.2769401914
2864.76666666676039.6899744686
2884.811492.0898882934
2904.833333333311539.3211294998
2924.86666666673072.5386372668
2944.93194.6253893863
2964.933333333321853.6536180434
2984.966666666719465.7430162929
300510351.8287089415
3025.03333333336761.285526471
3045.06666666674523.9488878213
3065.12978.9864359281
3085.13333333332268.2912945866
3105.16666666674481.9133041232
3125.25053.1536925758
3145.233333333312350.2758680605
3165.266666666751740.6724088102
3185.342682.3370430073
3205.33333333334820.0490208049
3225.366666666710491.8359282906
3245.49611.3196690758
3265.43333333334998.6797683177
3285.46666666674811.6836644633
3305.53218.3559889745
3325.53333333335085.6059987295
3345.56666666675419.5196692677
3365.67253.4781705844
3385.63333333339791.6829780227
3405.666666666717220.7850972823
3425.77808.6602571438
3445.73333333339785.1073125076
3465.76666666677168.3280743018
3485.87632.3095784272
3505.83333333339915.0755747143
3525.866666666711316.4807908593
3545.912365.1496233942
3565.933333333316324.3404612835
3585.966666666712096.9014140705
36068250.3526169094
3626.03333333337166.1568934395
3646.06666666676752.2353195308
3666.18685.2906474188
3686.13333333338067.5704950787
3706.16666666673807.9405743237
3726.25732.0553898649
3746.23333333337605.994935635
3766.266666666712759.1613836449
3786.317296.7198538016
3806.333333333313561.9576893851
3826.36666666676207.6193360361
3846.412713.7057468426
3866.433333333313664.1911758736
3886.46666666676411.2565335921
3906.54626.8211051837
3926.53333333333145.3366598116
3946.56666666674136.512408889
3966.66429.2910564073
3986.63333333335918.463789499
4006.66666666676467.3737478872
4026.79885.389017565
4046.733333333311573.6324623065
4066.76666666676318.3488337495
4086.85987.469252553
4106.83333333336961.2242934888
4126.866666666732762.2146895592
4146.962780.2209744243
4166.933333333316398.1248223043
4186.966666666711518.0009955625
42077296.425925923
4227.03333333335016.0772911373
4247.06666666673843.2520697321
4267.14056.4719661706
4287.13333333334823.2247107776
4307.16666666676450.3927571564
4327.28323.9197702353
4347.233333333310325.4073062816
4367.26666666677318.9706483334
4387.35784.754374751
4407.333333333310912.1534585302
4427.366666666713662.5637972795
4447.410621.8460176695
4467.43333333339545.1542176149
4487.466666666711530.8831782996
4507.57959.2474417741
4527.53333333339092.1332375852
4547.56666666678606.7590060464
4567.65952.8447718636
4587.63333333336432.4897658324
4607.66666666675683.5741938717
4627.79369.4415078766
4647.733333333310733.2448464196
4667.766666666711185.1362093156
4687.812090.6920565229
4707.833333333312702.4769801287
4727.86666666678180.0752462887
4747.911238.2288804196
4767.93333333338274.0423758251
4787.96666666676804.7049619314
480813289.9551455443
4828.03333333338335.4637653139
4848.06666666675821.1224782069
4868.18332.1848583147
4888.13333333337784.3334714767
4908.16666666677673.9520324332
4928.29347.9954687793
4948.23333333339028.8931791069
4968.26666666678856.0301691263
4988.37357.8640151355
5008.33333333336622.943919981
5028.36666666677503.6672553463
5048.49097.195608645
5068.433333333332047.6482157836
5088.466666666760902.892118028
5108.516799.7363022389
5128.53333333336241.9658677851
5148.56666666675558.2970880678
5168.66163.3422947478
5188.63333333337212.6113739566
5208.666666666712828.7860132425
5228.720617.2139930044
5248.73333333339961.7709863421
5268.76666666679447.491431206
5288.813837.2436263265
5308.83333333337999.1028798238
5328.86666666675685.9003055494
5348.97877.4753584064
5368.93333333337960.2403508768
5388.96666666678469.8677903316
540910723.4554726244
5429.03333333339957.3000067673
5449.06666666679479.0520213917
5469.17638.2972396497
5489.13333333339389.9501255284
5509.16666666678723.5787693983
5529.27221.2783810924
5549.23333333339629.8350768332
5569.266666666712250.231616979
5589.311867.6812645077
5609.333333333312596.8656881063
5629.366666666713035.1557183432
5649.412868.8107917145
5669.433333333315288.9625045189
5689.466666666710416.4748420229
5709.519875.1124247128
5729.533333333320771.8291385923
5749.566666666715125.6165963898
5769.617117.7217353656
5789.633333333311301.1062012547
5809.666666666711436.0812888414
5829.710794.9275079837
5849.733333333317163.0016323833
5869.766666666714147.0729577005
5889.88973.2753658133
5909.83333333338428.3431006921
5929.86666666678053.8136712152
5949.912739.4273478076
5969.933333333348374.897226663
5989.966666666764748.6413051375
6001015223.5568297482
60210.03333333338447.6709959735
60410.06666666679190.3153208901
60610.110217.0842107223
60810.133333333310434.9855267198
61010.16666666679122.1254042652
61210.210817.3644620103
61410.233333333313244.6919316376
61610.266666666710416.0358550582
61810.39745.2461095941
62010.33333333339684.2113619504
62210.36666666678232.0468456262
62410.46056.3670796001
62610.43333333337235.9672107059
62810.46666666679504.557229613
63010.511592.9351513157
63210.533333333314386.5095203688
63410.566666666711160.6743309578
63610.67573.6735435523
63810.63333333338855.5655102108
64010.666666666712860.4826943978
64210.714450.2259748665
64410.733333333311781.4355490262
64610.766666666710392.3943714723
64810.812894.8950153906
65010.833333333311772.5232208953
65210.866666666716650.5262595883
65410.913127.5338186161
65610.933333333315605.0324613983
65810.966666666718130.013682445
6601110852.8253797238
66211.033333333312255.2338111893
66411.066666666726311.3697690233
66611.121199.4716420987
66811.133333333315565.7681102672
67011.166666666713798.3835727139
67211.211108.6195517481
67411.233333333311011.671736503
67611.266666666712227.6391804561
67811.320875.6406996017
68011.333333333338979.2267823214
68211.366666666780283.3322227216
68411.438492.6115728046
68611.433333333313745.6137074448
68811.466666666710770.3133277772
69011.59830.9253565435
69211.533333333311753.2491677146
69411.566666666714912.7760608994
69611.613181.9283016972
69811.63333333339069.6472783197
70011.66666666679719.7347883242
70211.710173.66943663
70411.733333333311416.6097201286
70611.766666666711809.6467978349
70811.810026.4682308277
71011.833333333310915.2827613646
71211.866666666710477.4151439425
71411.98953.3183773158
71611.93333333339683.254728056
71811.966666666712971.6841925857
7201214140.1585958486
72212.033333333313952.8350589922
72412.066666666714573.9883505699
72612.112986.6588573046
72812.133333333312621.0304606096
73012.166666666714584.2106614406
73212.218674.8034713528
73412.233333333332694.2581893811
73612.266666666721541.9610093107
73812.314614.1410580827
74012.333333333314808.9412972713
74212.36666666679602.7161742974
74412.410895.8122971296
74612.433333333313505.2520108964
74812.466666666717549.8916952128
75012.514302.1351627428
75212.533333333312244.4796064755
75412.566666666711277.5440258756
75612.613583.4924850574
75812.633333333316482.16422553
76012.666666666729863.3035204433
76212.768803.6117532872
76412.733333333353914.855847687
76612.766666666716375.523241692
76812.814525.2657732109
77012.833333333316505.0469041564
77212.866666666714468.0191202041
77412.911170.5927883153
77612.93333333339583.3466595129
77812.96666666679846.461876969
7801312907.4426731156
78213.033333333313383.4808846023
78413.066666666712564.9916151644
78613.111107.1384474903
78813.133333333310289.2076803732
79013.166666666710936.6077709163
79213.212392.2754804549
79413.233333333313781.5647829699
79613.266666666712735.4569044675
79813.316533.4899242559
80013.333333333320904.311679595
80213.366666666716830.4381084455
80413.417030.8795253115
80613.433333333319986.8652323154
80813.466666666718571.5489700283
81013.521368.5912381112
81213.533333333320801.8757450293
81413.566666666716442.2866251397
81613.617717.5273490006
81813.633333333315403.528484219
82013.666666666713187.1197149117
82213.713787.5998615567
82413.733333333313503.047079534
82613.766666666712819.8623464653
82813.811111.802017293
83013.833333333312013.7081802358
83213.866666666713945.866895101
83413.917894.3220663895
83613.933333333329420.9256141632
83813.966666666772413.5704701366
8401454858.6416707904
84214.033333333317995.2195063232
84414.066666666717552.069295474
84614.116939.7595238874
84814.133333333315723.7791599775
85014.166666666713701.9889026548
85214.212686.8254065101
85414.233333333312237.6466247172
85614.266666666712932.8295738602
85814.313978.8063662428
86014.333333333314146.2010211451
86214.366666666712926.7138258888
86414.412541.0232864523
86614.433333333313131.9779591329
86814.466666666712953.6361187644
87014.514872.3845104811
87214.533333333319130.108522612
87414.566666666725692.7032771332
87614.642130.269077653
87814.633333333330249.2324456213
88014.666666666718539.9406964184
88214.718954.0130146686
88414.733333333322578.0647237245
88614.766666666722727.5136877517
88814.819994.668595655
89014.833333333322413.5453693501
89214.866666666718840.0343125894
89414.917658.9736377412
89614.933333333314765.8658343529
89814.966666666713674.6305945178
9001516121.3809974597
90215.033333333317599.7349699717
90415.066666666717642.9398919969
90615.116793.0057160622
90815.133333333328047.5059451959
91015.166666666767911.1026824333
91215.279430.5844568574
91415.233333333326234.0355396197
91615.266666666733831.3293205728
91815.351999.6458178292
92015.333333333328412.6082598113
92215.366666666721321.5562000755
92415.420045.0758626804
92615.433333333316828.5025930063
92815.466666666715497.7228125127
93015.517453.4837070306
93215.533333333316308.1816562475
93415.566666666715432.4021032443
93615.618693.0678704986
93815.633333333318946.5624737552
94015.666666666720864.5526839432
94215.726534.2001214486
94415.733333333325207.0529021282
94615.766666666721124.95409929
94815.826630.5077994066
95015.833333333328306.7143157734
95215.866666666722350.2087456927
95415.922476.717702954
95615.933333333322383.0501038516
95815.966666666721301.3580584428
9601623362.1387672942
96216.033333333319894.4243184726
96416.066666666718006.1884686859
96616.118175.2510494554
96816.133333333318631.7825784566
97016.166666666718891.5677910828
97216.217449.3754811401
97416.233333333318710.2957470179
97616.266666666724343.7700218653
97816.353128.8459988482
98016.333333333392246.1990658615
98216.366666666739475.4281272648
98416.421969.1635165503
98616.433333333330126.3332727903
98816.466666666757116.8810926495
99016.542515.1144006917
99216.533333333322813.9665674696
99416.566666666722671.6073317073
99616.619304.7256147096
99816.633333333319256.7038956807
100016.666666666718619.8646726132
100216.718390.5992267393
100416.733333333320896.9623601397
100616.766666666727456.8978537421
100816.829676.2008906494
101016.833333333325345.6443842345
101216.866666666722553.6819096123
101416.921677.5857735871
101616.933333333321778.3419903143
101816.966666666725543.5818744776
10201728497.0022727617
102217.033333333327194.1098558589
102417.066666666722798.7234254144
102617.125409.2206734756
102817.133333333321977.8278369391
103017.166666666719254.3980550197
103217.219749.0551573755
103417.233333333321454.4297018792
103617.266666666722859.8045823557
103817.321894.7820388212
104017.333333333322772.2197356448
104217.366666666737248.2161408362
104417.477273.4131830397
104617.433333333377176.328471126
104817.466666666726996.6772652531
105017.522626.1685159741
105217.533333333322433.8102089712
105417.566666666723227.8923186099
105617.622766.7362773763
105817.633333333320284.5446220987
106017.666666666720759.1385065002
106217.720523.6551965487
106417.733333333319017.147674761
106617.766666666718972.6673506532
106817.820559.3476293512
107017.833333333324849.3778535124
107217.866666666727481.1313169485
107417.926366.4776101651
107617.933333333322669.3585466778
107817.966666666720520.0904190856
10801822098.2812721695
108218.033333333323416.0546331047
108418.066666666726315.8044127006
108618.124465.338931177
108818.133333333323917.1841610041
109018.166666666723632.7404854937
109218.220641.8120466532
109418.233333333320595.3320638941
109618.266666666720776.664384739
109818.322045.4631049813
110018.333333333320941.6159016199
110218.366666666719339.8721475488
110418.430011.4802803821
110618.433333333369104.8102231192
110818.466666666768472.7080727462
111018.526476.674484246
111218.533333333321469.1424544361
111418.566666666721446.573310563
111618.620133.0906100558
111818.633333333319638.4457884559
112018.666666666719782.5981089728
112218.718958.1266056159
112418.733333333317590.3983393417
112618.766666666716696.0754304942
112818.817664.5841328499
113018.833333333321200.2497735666
113218.866666666722496.6919226021
113418.921114.8482753474
113618.933333333319631.9849409591
113818.966666666718322.0445704866
11401919251.6987619244
114219.033333333322130.9917266926
114419.066666666723585.6040385249
114619.120565.8998983103
114819.133333333319945.5690722429
115019.166666666721580.1526806439
115219.219813.497865793
115419.233333333322165.4634739375
115619.266666666721354.8869795786
115819.318603.4267097577
116019.333333333318536.9481396528
116219.366666666719100.0996010309
116419.436027.5514849475
116619.433333333367266.6497584171
116819.466666666734617.7938430397
117019.519842.9442030084
117219.533333333318254.1138180179
117419.566666666718593.9940465185
117619.617989.0930333925
117819.633333333316926.4466113783
118019.666666666716820.6936400159
118219.716420.3930907507
118419.733333333316546.0348113003
118619.766666666719861.4394379496
118819.822275.8615909497
119019.833333333319863.2064012114
119219.866666666719230.1898576572
119419.918641.8803864665
119619.933333333317492.0057535257
119819.966666666717955.9835869859
12002018288.8181399223
120220.033333333319848.7774905781
120420.066666666719043.2208727254
120620.119727.3266355484
120820.133333333321619.8662005726
121020.166666666718173.5772193293
121220.220858.6147053819
121420.233333333323131.8313830666
121620.266666666717929.0520431015
121820.317066.3260028094
122020.333333333324804.563089203
122220.366666666749464.1862464643
122420.450076.0424533382
122620.433333333321116.4651221416
122820.466666666718007.1165405647
123020.518801.4463273712
123220.533333333318303.5907330352
123420.566666666717754.673408078
123620.616821.9010478755
123820.633333333316863.0312651596
124020.666666666715964.0280708258
124220.717721.0659152967
124420.733333333321043.5216235063
124620.766666666721528.3041324546
124820.818370.5231458506
125020.833333333318238.4558282788
125220.866666666717392.1133045249
125420.918099.2589183646
125620.933333333318419.9351874367
125820.966666666719672.1763618901
12602118864.2906618449
126221.033333333319897.3146372335
126421.066666666717565.9954375371
126621.117236.1266751502
126821.133333333316701.0014571815
127021.166666666716180.3701027293
127221.216247.1240598264
127421.233333333319006.532087367
127621.266666666738214.9807328293
127821.350004.9152965782
128021.333333333322293.7055315956
128221.366666666718237.1405392779
128421.418029.0006580054
128621.433333333317416.301954168
128821.466666666717726.21229305
129021.518536.3512919261
129221.533333333316859.4650074114
129421.566666666715824.9505198482
129621.617701.9070559187
129821.633333333318155.7912635824
130021.666666666717735.4773095088
130221.717336.9721542782
130421.733333333315750.7992961706
130621.766666666715903.6475578942
130821.816214.2801471438
131021.833333333317664.3462595721
131221.866666666716404.6416833305
131421.917168.1814496076
131621.933333333318136.2396420989
131821.966666666715764.9803559814
13202215215.7266646182
132222.033333333314933.9530901413
132422.066666666714454.733428082
132622.117187.3801747204
132822.133333333333008.0248111974
133022.166666666743728.4050933902
133222.221869.3396452045
133422.233333333316094.8350233567
133622.266666666715569.1597946125
133822.315893.2237932677
134022.333333333315040.4678489769
134222.366666666715111.8182860385
134422.415027.0949365416
134622.433333333314940.2590246654
134822.466666666716301.4129765606
135022.515387.0340290749
135222.533333333314430.6287633839
135422.566666666715063.4355774536
135622.614311.7107757516
135822.633333333314903.0721674611
136022.666666666715259.148047789
136222.715361.6506333304
136422.733333333314487.3652500591
136622.766666666715766.8524731727
136822.814746.3666985615
137022.833333333313102.2862321607
137222.866666666713401.7107350206
137422.912756.4936003501
137622.933333333313413.0999519642
137822.966666666725459.5417624453
13802335704.2078596508
138223.033333333320220.4685348547
138423.066666666714971.4602019184
138623.113640.6307191975
138823.133333333313360.6236736055
139023.166666666712880.6190065282
139223.212463.2726486381
139423.233333333312002.2555766354
139623.266666666713084.6001539891
139823.313560.0215143906
140023.333333333313936.3764529451
140223.366666666712705.2835403943
140423.412298.462947611
140623.433333333312392.5373215666
140823.466666666713029.7812823717
141023.514142.0074357567
141223.533333333313182.9894746444
141423.566666666712993.7112412667
141623.612691.4414894047
141823.633333333312300.3203566641
142023.666666666711589.9661003212
142223.711110.2567021821
142423.733333333311417.1965121691
142623.766666666718453.6954333259
142823.828485.5991477599
143023.833333333317810.6403563793
143223.866666666712480.09075346
143423.911377.4672043072
143623.933333333310638.2539346906
143823.966666666710723.6757114774
14402410858.3262180501
144224.033333333310714.333523638
144424.066666666711709.1211337433
144624.111123.418902576
144824.133333333311300.9438460919
145024.166666666710813.0637501329
145224.210771.6102251356
145424.233333333310545.3969831832
145624.266666666712088.3667037758
145824.312382.8347345939
146024.333333333311445.3888681945
146224.366666666711220.1384970835
146424.410293.1913317943
146624.43333333339674.127042943
146824.46666666679368.9766492165
147024.59556.747535626
147224.533333333312378.3692849784
147424.566666666721888.7836217263
147624.615296.5660170883
147824.63333333339608.6720886311
148024.66666666679570.8842933237
148224.79272.2136024039
148424.73333333338925.5479943027
148624.76666666678724.4448458019
148824.89194.0062305383
149024.83333333339609.993068984
149224.86666666679240.3686863498
149424.99527.6796015704
149624.93333333339512.5119331924
149824.96666666679142.7932512146
1500259062.6109342828
150225.03333333339742.311336296
150425.06666666679259.1930830384
150625.18876.3016158002
150825.13333333339386.6806404968
151025.16666666678177.9975965144
151225.27803.807823357
151425.23333333337727.2190138095
151625.26666666678084.9332619302
151825.314288.565788773
152025.333333333315262.1995199796
152225.36666666678641.8204329352
152425.47376.5642858178
152625.43333333337331.8593653436
152825.46666666677051.5935983933
153025.57559.8518236447
153225.53333333338769.3005033032
153425.56666666678687.1394404507
153625.67457.5629727763
153825.63333333337359.585447978
154025.66666666677561.8925455715
154225.77273.3916995884
154425.73333333337098.3332860395
154625.76666666677276.8004215271
154825.87400.438669528
155025.83333333337156.0642640194
155225.86666666677389.5330811957
155425.96594.8320355194
155625.93333333336548.7329232565
155825.96666666676773.0193609614
1560268038.2805126762
156226.033333333312112.8280693317
156426.06666666679689.0446139188
156626.16051.2669990094
156826.13333333336108.4447491378
157026.16666666676021.5899902571
157226.25870.2537755267
157426.23333333336504.9483532434
157626.26666666677077.0044814438
157826.36608.4068738839
158026.33333333335931.3620159998
158226.36666666675588.0780180544
158426.45387.062297767
158626.43333333335332.6189072568
158826.46666666675785.1326599379
159026.55604.7981526646
159226.53333333335223.053708427
159426.56666666675515.9929479495
159626.65299.6007269969
159826.63333333335358.9934219111
160026.66666666675376.2747619524
160226.76432.4862226424
160426.73333333338305.889786429
160626.76666666676873.7365392742
160826.84816.8658154415
161026.83333333334378.0213213276
161226.86666666674694.664777697
161426.94873.5874757278
161626.93333333335012.072920986
161826.96666666674839.1247244463
1620274689.1978157437
162227.03333333334468.9148843575
162427.06666666674200.8718425205
162627.13990.7555971027
162827.13333333333999.437920152
163027.16666666674199.6123870768
163227.24670.9639152225
163427.23333333334799.9971395423
163627.26666666674254.0885116292
163827.33825.3258468107
164027.33333333333893.8832677636
164227.36666666674584.8888304082
164427.46215.7548492855
164627.43333333335200.0817361944
164827.46666666673686.6175744799
165027.53577.7569743936
165227.53333333333291.0509610175
165427.56666666673123.6759008941
165627.63114.3403826832
165827.63333333333417.213859865
166027.66666666673210.450563878
166227.73117.8764097596
166427.73333333333025.9960082334
166627.76666666673073.7603389139
166827.83461.728870654
167027.83333333333566.9666267869
167227.86666666673181.8780182478
167427.93114.3514264231
167627.93333333332930.8825142144
167827.96666666672689.8409775516
1680282645.1373561765
168228.03333333333408.0232818902
168428.06666666674199.444578518
168628.13298.8503654507
168828.13333333332535.3929183344
169028.16666666672446.0155270853
169228.22434.0533579308
169428.23333333332514.079900066
169628.26666666672528.0960125408
169828.32362.8665971662
170028.33333333332220.7216811567
170228.36666666672230.7842845687
170428.42209.6530533119
170628.43333333332097.9423619636
170828.46666666672289.3333964728
171028.52314.3470174542
171228.53333333332289.6455412423
171428.56666666672276.1665898635
171628.62103.9359023341
171828.63333333332005.2984472488
172028.66666666672265.8241312354
172228.72748.5483697756
172428.73333333332306.5935725752
172628.76666666671880.1758570802
172828.81785.6438182147
173028.83333333331705.1592086676
173228.86666666671756.4948472602
173428.91807.0442657044
173628.93333333331808.2481171205
173828.96666666671843.4518959288
1740291922.3195214378
174229.03333333331900.8008433514
174429.06666666671710.6037178359
174629.11745.1960273296
174829.13333333331689.8038276783
175029.16666666671633.5063649789
175229.21582.4314519931
175429.23333333331575.7488214014
175629.26666666671698.2927754113
175829.32092.3333853147
176029.33333333332350.2275013271
176229.36666666672099.5928845442
176429.42044.900608099
176629.43333333331875.0579261943
176829.46666666671658.5727243209
177029.51591.7587146349
177229.53333333331529.6528182973
177429.56666666671522.5100906926
177629.61533.8395443814
177829.63333333331544.5177458004
178029.66666666671509.9519704821
178229.71519.788784889
178429.73333333331533.9073086256
178629.76666666671541.3481234272
178829.81501.7111268973
179029.83333333331482.338771493
179229.86666666671524.5722907316
179429.91739.6039658739
179629.93333333331672.5119353624
179829.96666666671581.2061365577
1800301613.4761089496
180230.03333333331565.3740458448
180430.06666666671562.5139462407
180630.11595.3414195501
180830.13333333331585.2739923735
181030.16666666671601.6642458281
181230.21666.3424934404
181430.23333333331669.6156895572
181630.26666666671631.4700308256
181830.31620.1739222072
182030.33333333331669.3652196008
182230.36666666671686.7429963663
182430.41675.5356423226
182630.43333333331692.8316495358
182830.46666666671742.7298340042
183030.51813.5719616094
183230.53333333331727.8502323656
183430.56666666671681.0566824324
183630.61735.9874515349
183830.63333333331781.4407940927
184030.66666666671803.4726370836
184230.71747.22769154
184430.73333333331689.1841695524
184630.76666666671794.2957233296
184830.81791.050381448
185030.83333333331846.3420529816
185230.86666666671831.8306077055
185430.91842.3995750024
185630.93333333331838.6334355782
185830.96666666671868.5769304946
1860311834.2505732068
one_d
Time
Response
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkGCxGCObjective of GCxGC AnalysisChemical IdentificationOutlineObjective of GCxGC AnalysisSeparate individual peaks from backgroundQuantify each peakIdentify the peaks for chemicals of interest
Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkGCxGCObjective of GCxGC AnalysisChemical IdentificationOutlineChemical Identification with GCxGCAutomated approachesLibrary search Such as NIST Mass Spectral LibraryRule-based techniques: Such as constrain expressions based on retention times or mass spectrumPattern matching: markers, chemical retention pattern.Challenges:Data inconsistencies: retention time variationsData and task complexities: multi-dimension, many peaksSolution: combined approach (Smart templates) with peak template matching constraint expressions
Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkGCxGCObjective of GCxGC AnalysisChemical IdentificationOutlineOutlinePeak template matchingSmart TemplatesComputer Language for Identifying Chemicals (CLIC)Smart TemplatePeak template matching with CLICBuilding Smart Multi-type TemplatesInteractive tools for building smart multi-type templatesAutomatically generating CLIC for peaksAutomatically generating peak sets with markers.Conclusion and Future WorksQ. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkChemical Identification ProcessFundamental DifficultyPeak Template MatchingIdentify compounds by matching previously known peaks to unidentified peaksA peak template is a set of annotated peaks with:Computed features such as peak location (2D retention times)Assigned information such as compound nameA target peak is a set of unannotated peaks that have computed featuresPeak template matching tries to establish as many correspondences as possible from template peaks to target peaksQ. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkChemical Identification ProcessFundamental DifficultyChemical Identification ProcessConstruct a peak template:Created by a chemist through interactive annotationMatch template and target peaksApply the template: assign information from template to target peaksQ. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkChemical Identification ProcessFundamental DifficultyFundamental Difficulty of Peak Template MatchingPeak pattern distortions:Peaks for the same compound may appear at different retention times in different imagesBasic solution:Search all allowable matches from template peaks to target peaks under some retention time windows Find a transformation that maximize the number of matched peaksQ. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
Challenges:Searching transformations in a large space is computationally expensiveFalse identifications may happen when two target peaks are very close together
A solution: Smart TemplateIntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkChemical Identification ProcessFundamental DifficultyFundamental Difficulty of Peak Template MatchingQ. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MSB1B2B3peak1peak2
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkComputer Language for Identifying Chemicals (CLIC) Example CLIC ExpressionsPeak Template Matching with CLICSmart TemplatesObjective:Reduce the number of allowable matchingsReduce ambiguous matchingsReduce human interventionApproach:Add more constraints other than retention time patternsCLICQ. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkComputer Language for Identifying Chemicals (CLIC) Example CLIC ExpressionsPeak Template Matching with CLICComputer Language for Identifying Chemicals (CLIC)CLIC [Reichenbach et al., 2004] is a language to express constraints on GCxGC retention times, peak characteristics, and mass spectral characteristics:Functions of retention timesFunctions of peak characteristicsFunctions of mass spectraLogical and arithmetic operatorsComparative operators: , , =, Addition, subtraction, negation (-) and parenthesesLogical operators: and(&), or (|), and negation(!)Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkComputer Language for Identifying Chemicals (CLIC) Example CLIC ExpressionsPeak Template Matching with CLICComputer Language for Identifying Chemicals (CLIC)Functions characterizing chromatographic properties and mass spectral characteristics are key features of CLIC.Retention(2) returns the retention time of the peak on the second column.Intensity(40) returns the intensity value of the indicated channel (m/z = 40) in the mass spectrum of the peak.Ordinal(40) returns the ordinal position of the indicated channel (m/z = 40 in a mass spectrum) in the intensity-ordered multi-channel array of the peak.
Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkComputer Language for Identifying Chemicals (CLIC) Example CLIC ExpressionsPeak Template Matching with CLICExample CLIC ExpressionsAlkanesCriteria (Welthagen et al. 2003): Base peak 57 or 71 and second largest peak 71 or 57. No time rule is needed for this group, but a retention window of 1.0 1.5s can be used.CLIC Expression:(Ordinal(57) 2) & (Ordinal(71) 2) & (Retention(2) 1.0) & (Retention(2) 1.5)
Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkComputer Language for Identifying Chemicals (CLIC) Example CLIC ExpressionsPeak Template Matching with CLIC
Peak Template Matching with CLICEach peak in the template has an optional CLIC expressionFirst, find a set of possible matches by using the retention time pattern Then, prune the matching space based on CLIC expressionsFinally, search for the best matchingThe combination of chromatographic retention time patterns and CLIC expressions can improve both speed and accuracy of automated chemical identification for GCxGCWe call it a Smart template
Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuilding Smart Multi-type TemplatesSmart Template has been implemented in GC Image software.Interactive tools for building Multi-type Templates Peaks, groups, graphics, text objects and chemical structuresInteractive tools for building CLIC expressionsA GUI that resembles a calculator for users to create and test CLIC expressionsAn interface for specifying a CLIC expression for each template peakInterfaces to match and apply templates
Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart templateAuto CLICAuto chemical grouping with markersBuild Multi-type templateConstruct and edit template with peaks and other structures:Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart TemplateAuto CLICAuto chemical grouping with markersBuild Smart Template Example with Grob Mix1) Build a template from the original image Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart TemplateAuto CLICAuto chemical grouping with markersBuild Smart Template Example with Grob Mix2) Wrong match because of peak pattern distortions:Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart TemplateAuto CLICAuto chemical grouping with markersBuild Smart Template Example with Grob Mix3) Smart template solution:a) Create CLIC expression for NonanalQ. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart TemplateAuto CLICAuto chemical grouping with markersBuild Smart Template Example with Grob Mixb) Specify CLIC expression for Nonanal template peak:Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart TemplateAuto CLICAuto chemical grouping with markersBuild Smart Template Example with Grob Mix4) Matching with Smart Template:Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart TemplateAuto CLICAuto chemical grouping with markersAuto CLICAutomatically generate CLIC expressions for peaks: CLIC function: Match()NIST matching function returns the similarity between two mass spectraValue range is [0, 1000]Higher is the value, more similar are the two mass spectra CLIC expression, Match() > threshold, can be used to identify chemicals.The mass spectrum of the peak is Automatically generate the threshold
Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart TemplateAuto CLICAuto chemical grouping with markersAuto CLICAutomatically generate matching threshold:The similarities between this peak and all other peaks should be less than the thresholdThe threshold has the large margins from this peak and all other peaksFor example: peak 1 represents blob B1B1. Match() = 1000B2. Match() = 600B3. Match() = 400Match() > 800Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MSB2B3peak1B104006001000800B2B3B1
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart TemplateAuto CLICAuto chemical grouping with markersAuto CLIC1) Set Auto CLIC functionQ. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart TemplateAuto CLICAuto chemical grouping with markersAuto CLIC2) Generate CLICQ. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart templateAuto CLICAuto chemical grouping with markersAuto chemical grouping with markersGroup peaks based on their retention time patterns:Build natural clusters of peaksEach cluster is represented by a polygonA template may consist of a set of groups (polygons)
Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart templateAuto CLICAuto chemical grouping with markersAuto chemical grouping with markersQ. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS29 clusters created by single linkage hierarchical clustering algorithm
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart templateAuto CLICAuto chemical grouping with markersAuto chemical grouping with markersAutomatically generate markers for groups (polygons)Template matching is based on peaksEach group needs markersA marker is a significant peak in the groupMarkers are at evenly distributed locations to represent the retention time pattern of the groupAuto marker:Cluster all peaks in a groupPick the largest peak in each cluster as a marker
Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart templateAuto CLICAuto chemical grouping with markersAuto chemical grouping with markers1) Set Auto Marker function
Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart templateAuto CLICAuto chemical grouping with markersAuto chemical grouping with markers2) Generate markers
Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart templateAuto CLICAuto chemical grouping with markersAuto chemical grouping with markers2) Generate markers
Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkConclusions and Future WorkSmart Template matching can be used to automatically identify chemicals in GCxGC-MS dataThe combination of retention time patterns and constraints greatly reduces ambiguity and speeds processingFuture work: Enhanced GUIMore CLIC functionsSemi-automated or automated template constructionAuto CLIC and Auto Marker are just two first steps
Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS
-
IntroductionPeak Template MatchingComputer Language for Identifying Chemicals Peak Template Matching with CLICConclusions and Future WorkCurrent work is supported by NSF and NIHQuestions?Software: [email protected] www.gcimage.comLicensing: [email protected] www.zoex.com
Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS