smart templates for chemical identification in gcxgc-ms qingping tao 1, stephen e. reichenbach 2,...

Smart Templates for Chemical Identification in GCxGC-MSQingPing Tao1, Stephen E. Reichenbach2, Mingtian Ni3, Arvind Visvanathan2, Michael Kok2, Luke L. Waltman1

1GC Image, LLC, Lincoln, NE2Computer Science & Engineering Dept., University of Nebraska-Lincoln3Microsoft Corp., Redmond, WAQ. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS

GCxGC

Peak Template Matching

Smart Templates

Building Smart Multi-type Templates

Conclusions and Future WorkIntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkQ. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS

IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkGCxGCObjective of GCxGC AnalysisChemical IdentificationOutlineGCxGCTwo independent separations for the entire sampleGCxGC data can be processed as a digital imageMass spectrometry (MS) data provides rich information for identification

Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS

GC ChromatogramGCxGC Total Ion Chromatogram IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkGCxGCObjective of GCxGC AnalysisChemical IdentificationOutlineGCxGCQ. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS

Chart1

-0.3331816569

0.4130423643

14.9817934476

44.2993776075

98.1568650496

175.912076898

294.466299646

460.853605953

657.6836849605

787.8113270727

794.1001662003

800.9297899046

752.4350446532

736.9819775089

767.7716093692

758.4972497704

22977.487811035

2402.4975069373

703.7430291824

551.0362365304

470.2777570738

363.7344507998

349.5465674606

2978.1244803352

144.4874902795

44.1610444718

107.8134906885

31.6264623637

16.7234176351

18.5789591973

122.2297772393

107.2819625208

109.1335116021

172.9512164219

214.8990617422

90.4568666736

159.6362580376

203.5578817629

19.6238899762

530.6504676838

284.9153564306

18.460434994

15.4648651224

14.4626175463

394.9514891876

847.5641928028

86.686051055

1309.8071272135

2567.8598015687

1121.5604145445

3451.4348663924

1250.1986193216

4737.1200673116

3217.485596367

21914.0355145094

1778.754371709

5180.913453256

14162.8028556605

17056.6072334304

3825.116693499

17522.0519657529

15789.8177942988

2603.0619075529

1536.7255068218

3282.9217648012

6660.2354949299

3908.4818214818

5174.2373353989

9449.6769686697

50908.8510388328

8137.3603449255

316.2798473489

1018.5565097445

576.4573447172

434.3910046933

941.2089789315

1160.2716948694

937.9162567287

3147.2658240456

2890.9277690156

25498.5515101849

14359.269437478

8397.0509236021

11305.9814098644

3345.0823012888

2741.3242412263

1433.2899515612

24467.7665966291

24313.0980100048

3570.2266449968

4867.0235167649

30965.3977685008

10846.4127300349

3322.7201970031

9378.338262196

14832.5287236745

2642.2730828072

8250.3860284366

16392.3836274503

3309.0996023498

11842.7337141804

9602.9601781016

3119.6178375546

12032.7912262195

8591.1960336935

3821.596887965

2543.4529745788

1039.1863218016

312.7337351722

7537.18631934

57172.0751692361

24627.4217718036

6062.8410147819

2459.7827736397

1704.4423857414

5688.1084746531

6096.6643932207

6971.3604744403

5133.4970460054

4520.5206908229

2060.3728988722

3326.0452878527

12569.2018012856

7533.8031727998

6322.9835304018

6160.5991130476

16191.5466961329

9992.2116292687

10990.6861341946

17741.1691184131

9992.252480904

6063.9297723466

20226.6209101128

17057.7720340344

5805.0838690757

10910.9213451439

13028.8780270147

5309.5649261809

6230.6849012656

13743.0481993915

22403.9920995082

14028.2769401914

6039.6899744686

11492.0898882934

11539.3211294998

3072.5386372668

3194.6253893863

21853.6536180434

19465.7430162929

10351.8287089415

6761.285526471

4523.9488878213

2978.9864359281

2268.2912945866

4481.9133041232

5053.1536925758

12350.2758680605

51740.6724088102

42682.3370430073

4820.0490208049

10491.8359282906

9611.3196690758

4998.6797683177

4811.6836644633

3218.3559889745

5085.6059987295

5419.5196692677

7253.4781705844

9791.6829780227

17220.7850972823

7808.6602571438

9785.1073125076

7168.3280743018

7632.3095784272

9915.0755747143

11316.4807908593

12365.1496233942

16324.3404612835

12096.9014140705

8250.3526169094

7166.1568934395

6752.2353195308

8685.2906474188

8067.5704950787

3807.9405743237

5732.0553898649

7605.994935635

12759.1613836449

17296.7198538016

13561.9576893851

6207.6193360361

12713.7057468426

13664.1911758736

6411.2565335921

4626.8211051837

3145.3366598116

4136.512408889

6429.2910564073

5918.463789499

6467.3737478872

9885.389017565

11573.6324623065

6318.3488337495

5987.469252553

6961.2242934888

32762.2146895592

62780.2209744243

16398.1248223043

11518.0009955625

7296.425925923

5016.0772911373

3843.2520697321

4056.4719661706

4823.2247107776

6450.3927571564

8323.9197702353

10325.4073062816

7318.9706483334

5784.754374751

10912.1534585302

13662.5637972795

10621.8460176695

9545.1542176149

11530.8831782996

7959.2474417741

9092.1332375852

8606.7590060464

5952.8447718636

6432.4897658324

5683.5741938717

9369.4415078766

10733.2448464196

11185.1362093156

12090.6920565229

12702.4769801287

8180.0752462887

11238.2288804196

8274.0423758251

6804.7049619314

13289.9551455443

8335.4637653139

5821.1224782069

8332.1848583147

7784.3334714767

7673.9520324332

9347.9954687793

9028.8931791069

8856.0301691263

7357.8640151355

6622.943919981

7503.6672553463

9097.195608645

32047.6482157836

60902.892118028

16799.7363022389

6241.9658677851

5558.2970880678

6163.3422947478

7212.6113739566

12828.7860132425

20617.2139930044

9961.7709863421

9447.491431206

13837.2436263265

7999.1028798238

5685.9003055494

7877.4753584064

7960.2403508768

8469.8677903316

10723.4554726244

9957.3000067673

9479.0520213917

7638.2972396497

9389.9501255284

8723.5787693983

7221.2783810924

9629.8350768332

12250.231616979

11867.6812645077

12596.8656881063

13035.1557183432

12868.8107917145

15288.9625045189

10416.4748420229

19875.1124247128

20771.8291385923

15125.6165963898

17117.7217353656

11301.1062012547

11436.0812888414

10794.9275079837

17163.0016323833

14147.0729577005

8973.2753658133

8428.3431006921

8053.8136712152

12739.4273478076

48374.897226663

64748.6413051375

15223.5568297482

8447.6709959735

9190.3153208901

10217.0842107223

10434.9855267198

9122.1254042652

10817.3644620103

13244.6919316376

10416.0358550582

9745.2461095941

9684.2113619504

8232.0468456262

6056.3670796001

7235.9672107059

9504.557229613

11592.9351513157

14386.5095203688

11160.6743309578

7573.6735435523

8855.5655102108

12860.4826943978

14450.2259748665

11781.4355490262

10392.3943714723

12894.8950153906

11772.5232208953

16650.5262595883

13127.5338186161

15605.0324613983

18130.013682445

10852.8253797238

12255.2338111893

26311.3697690233

21199.4716420987

15565.7681102672

13798.3835727139

11108.6195517481

11011.671736503

12227.6391804561

20875.6406996017

38979.2267823214

80283.3322227216

38492.6115728046

13745.6137074448

10770.3133277772

9830.9253565435

11753.2491677146

14912.7760608994

13181.9283016972

9069.6472783197

9719.7347883242

10173.66943663

11416.6097201286

11809.6467978349

10026.4682308277

10915.2827613646

10477.4151439425

8953.3183773158

9683.254728056

12971.6841925857

14140.1585958486

13952.8350589922

14573.9883505699

12986.6588573046

12621.0304606096

14584.2106614406

18674.8034713528

32694.2581893811

21541.9610093107

14614.1410580827

14808.9412972713

9602.7161742974

10895.8122971296

13505.2520108964

17549.8916952128

14302.1351627428

12244.4796064755

11277.5440258756

13583.4924850574

16482.16422553

29863.3035204433

68803.6117532872

53914.855847687

16375.523241692

14525.2657732109

16505.0469041564

14468.0191202041

11170.5927883153

9583.3466595129

9846.461876969

12907.4426731156

13383.4808846023

12564.9916151644

11107.1384474903

10289.2076803732

10936.6077709163

12392.2754804549

13781.5647829699

12735.4569044675

16533.4899242559

20904.311679595

16830.4381084455

17030.8795253115

19986.8652323154

18571.5489700283

21368.5912381112

20801.8757450293

16442.2866251397

17717.5273490006

15403.528484219

13187.1197149117

13787.5998615567

13503.047079534

12819.8623464653

11111.802017293

12013.7081802358

13945.866895101

17894.3220663895

29420.9256141632

72413.5704701366

54858.6416707904

17995.2195063232

17552.069295474

16939.7595238874

15723.7791599775

13701.9889026548

12686.8254065101

12237.6466247172

12932.8295738602

13978.8063662428

14146.2010211451

12926.7138258888

12541.0232864523

13131.9779591329

12953.6361187644

14872.3845104811

19130.108522612

25692.7032771332

42130.269077653

30249.2324456213

18539.9406964184

18954.0130146686

22578.0647237245

22727.5136877517

19994.668595655

22413.5453693501

18840.0343125894

17658.9736377412

14765.8658343529

13674.6305945178

16121.3809974597

17599.7349699717

17642.9398919969

16793.0057160622

28047.5059451959

67911.1026824333

79430.5844568574

26234.0355396197

33831.3293205728

51999.6458178292

28412.6082598113

21321.5562000755

20045.0758626804

16828.5025930063

15497.7228125127

17453.4837070306

16308.1816562475

15432.4021032443

18693.0678704986

18946.5624737552

20864.5526839432

26534.2001214486

25207.0529021282

21124.95409929

26630.5077994066

28306.7143157734

22350.2087456927

22476.717702954

22383.0501038516

21301.3580584428

23362.1387672942

19894.4243184726

18006.1884686859

18175.2510494554

18631.7825784566

18891.5677910828

17449.3754811401

18710.2957470179

24343.7700218653

53128.8459988482

92246.1990658615

39475.4281272648

21969.1635165503

30126.3332727903

57116.8810926495

42515.1144006917

22813.9665674696

22671.6073317073

19304.7256147096

19256.7038956807

18619.8646726132

18390.5992267393

20896.9623601397

27456.8978537421

29676.2008906494

25345.6443842345

22553.6819096123

21677.5857735871

21778.3419903143

25543.5818744776

28497.0022727617

27194.1098558589

22798.7234254144

25409.2206734756

21977.8278369391

19254.3980550197

19749.0551573755

21454.4297018792

22859.8045823557

21894.7820388212

22772.2197356448

37248.2161408362

77273.4131830397

77176.328471126

26996.6772652531

22626.1685159741

22433.8102089712

23227.8923186099

22766.7362773763

20284.5446220987

20759.1385065002

20523.6551965487

19017.147674761

18972.6673506532

20559.3476293512

24849.3778535124

27481.1313169485

26366.4776101651

22669.3585466778

20520.0904190856

22098.2812721695

23416.0546331047

26315.8044127006

24465.338931177

23917.1841610041

23632.7404854937

20641.8120466532

20595.3320638941

20776.664384739

22045.4631049813

20941.6159016199

19339.8721475488

30011.4802803821

69104.8102231192

68472.7080727462

26476.674484246

21469.1424544361

21446.573310563

20133.0906100558

19638.4457884559

19782.5981089728

18958.1266056159

17590.3983393417

16696.0754304942

17664.5841328499

21200.2497735666

22496.6919226021

21114.8482753474

19631.9849409591

18322.0445704866

19251.6987619244

22130.9917266926

23585.6040385249

20565.8998983103

19945.5690722429

21580.1526806439

19813.497865793

22165.4634739375

21354.8869795786

18603.4267097577

18536.9481396528

19100.0996010309

36027.5514849475

67266.6497584171

34617.7938430397

19842.9442030084

18254.1138180179

18593.9940465185

17989.0930333925

16926.4466113783

16820.6936400159

16420.3930907507

16546.0348113003

19861.4394379496

22275.8615909497

19863.2064012114

19230.1898576572

18641.8803864665

17492.0057535257

17955.9835869859

18288.8181399223

19848.7774905781

19043.2208727254

19727.3266355484

21619.8662005726

18173.5772193293

20858.6147053819

23131.8313830666

17929.0520431015

17066.3260028094

24804.563089203

49464.1862464643

50076.0424533382

21116.4651221416

18007.1165405647

18801.4463273712

18303.5907330352

17754.673408078

16821.9010478755

16863.0312651596

15964.0280708258

17721.0659152967

21043.5216235063

21528.3041324546

18370.5231458506

18238.4558282788

17392.1133045249

18099.2589183646

18419.9351874367

19672.1763618901

18864.2906618449

19897.3146372335

17565.9954375371

17236.1266751502

16701.0014571815

16180.3701027293

16247.1240598264

19006.532087367

38214.9807328293

50004.9152965782

22293.7055315956

18237.1405392779

18029.0006580054

17416.301954168

17726.21229305

18536.3512919261

16859.4650074114

15824.9505198482

17701.9070559187

18155.7912635824

17735.4773095088

17336.9721542782

15750.7992961706

15903.6475578942

16214.2801471438

17664.3462595721

16404.6416833305

17168.1814496076

18136.2396420989

15764.9803559814

15215.7266646182

14933.9530901413

14454.733428082

17187.3801747204

33008.0248111974

43728.4050933902

21869.3396452045

16094.8350233567

15569.1597946125

15893.2237932677

15040.4678489769

15111.8182860385

15027.0949365416

14940.2590246654

16301.4129765606

15387.0340290749

14430.6287633839

15063.4355774536

14311.7107757516

14903.0721674611

15259.148047789

15361.6506333304

14487.3652500591

15766.8524731727

14746.3666985615

13102.2862321607

13401.7107350206

12756.4936003501

13413.0999519642

25459.5417624453

35704.2078596508

20220.4685348547

14971.4602019184

13640.6307191975

13360.6236736055

12880.6190065282

12463.2726486381

12002.2555766354

13084.6001539891

13560.0215143906

13936.3764529451

12705.2835403943

12298.462947611

12392.5373215666

13029.7812823717

14142.0074357567

13182.9894746444

12993.7112412667

12691.4414894047

12300.3203566641

11589.9661003212

11110.2567021821

11417.1965121691

18453.6954333259

28485.5991477599

17810.6403563793

12480.09075346

11377.4672043072

10638.2539346906

10723.6757114774

10858.3262180501

10714.333523638

11709.1211337433

11123.418902576

11300.9438460919

10813.0637501329

10771.6102251356

10545.3969831832

12088.3667037758

12382.8347345939

11445.3888681945

11220.1384970835

10293.1913317943

9674.127042943

9368.9766492165

9556.747535626

12378.3692849784

21888.7836217263

15296.5660170883

9608.6720886311

9570.8842933237

9272.2136024039

8925.5479943027

8724.4448458019

9194.0062305383

9609.993068984

9240.3686863498

9527.6796015704

9512.5119331924

9142.7932512146

9062.6109342828

9742.311336296

9259.1930830384

8876.3016158002

9386.6806404968

8177.9975965144

7803.807823357

7727.2190138095

8084.9332619302

14288.565788773

15262.1995199796

8641.8204329352

7376.5642858178

7331.8593653436

7051.5935983933

7559.8518236447

8769.3005033032

8687.1394404507

7457.5629727763

7359.585447978

7561.8925455715

7273.3916995884

7098.3332860395

7276.8004215271

7400.438669528

7156.0642640194

7389.5330811957

6594.8320355194

6548.7329232565

6773.0193609614

8038.2805126762

12112.8280693317

9689.0446139188

6051.2669990094

6108.4447491378

6021.5899902571

5870.2537755267

6504.9483532434

7077.0044814438

6608.4068738839

5931.3620159998

5588.0780180544

5387.062297767

5332.6189072568

5785.1326599379

5604.7981526646

5223.053708427

5515.9929479495

5299.6007269969

5358.9934219111

5376.2747619524

6432.4862226424

8305.889786429

6873.7365392742

4816.8658154415

4378.0213213276

4694.664777697

4873.5874757278

5012.072920986

4839.1247244463

4689.1978157437

4468.9148843575

4200.8718425205

3990.7555971027

3999.437920152

4199.6123870768

4670.9639152225

4799.9971395423

4254.0885116292

3825.3258468107

3893.8832677636

4584.8888304082

6215.7548492855

5200.0817361944

3686.6175744799

3577.7569743936

3291.0509610175

3123.6759008941

3114.3403826832

3417.213859865

3210.450563878

3117.8764097596

3025.9960082334

3073.7603389139

3461.728870654

3566.9666267869

3181.8780182478

3114.3514264231

2930.8825142144

2689.8409775516

2645.1373561765

3408.0232818902

4199.444578518

3298.8503654507

2535.3929183344

2446.0155270853

2434.0533579308

2514.079900066

2528.0960125408

2362.8665971662

2220.7216811567

2230.7842845687

2209.6530533119

2097.9423619636

2289.3333964728

2314.3470174542

2289.6455412423

2276.1665898635

2103.9359023341

2005.2984472488

2265.8241312354

2748.5483697756

2306.5935725752

1880.1758570802

1785.6438182147

1705.1592086676

1756.4948472602

1807.0442657044

1808.2481171205

1843.4518959288

1922.3195214378

1900.8008433514

1710.6037178359

1745.1960273296

1689.8038276783

1633.5063649789

1582.4314519931

1575.7488214014

1698.2927754113

2092.3333853147

2350.2275013271

2099.5928845442

2044.900608099

1875.0579261943

1658.5727243209

1591.7587146349

1529.6528182973

1522.5100906926

1533.8395443814

1544.5177458004

1509.9519704821

1519.788784889

1533.9073086256

1541.3481234272

1501.7111268973

1482.338771493

1524.5722907316

1739.6039658739

1672.5119353624

1581.2061365577

1613.4761089496

1565.3740458448

1562.5139462407

1595.3414195501

1585.2739923735

1601.6642458281

1666.3424934404

1669.6156895572

1631.4700308256

1620.1739222072

1669.3652196008

1686.7429963663

1675.5356423226

1692.8316495358

1742.7298340042

1813.5719616094

1727.8502323656

1681.0566824324

1735.9874515349

1781.4407940927

1803.4726370836

1747.22769154

1689.1841695524

1794.2957233296

1791.050381448

1846.3420529816

1831.8306077055

1842.3995750024

1838.6334355782

1868.5769304946

1834.2505732068

Time

Response

one_d

20.0333333333-0.3331816569

40.06666666670.4130423643

60.114.9817934476

80.133333333344.2993776075

100.166666666798.1568650496

120.2175.912076898

140.2333333333294.466299646

160.2666666667460.853605953

180.3657.6836849605

200.3333333333787.8113270727

220.3666666667794.1001662003

240.4800.9297899046

260.4333333333752.4350446532

280.4666666667736.9819775089

300.5767.7716093692

320.5333333333758.4972497704

340.566666666722977.487811035

360.62402.4975069373

380.6333333333703.7430291824

400.6666666667551.0362365304

420.7470.2777570738

440.7333333333363.7344507998

460.7666666667349.5465674606

480.82978.1244803352

500.8333333333144.4874902795

520.866666666744.1610444718

540.9107.8134906885

560.933333333331.6264623637

580.966666666716.7234176351

60118.5789591973

621.0333333333122.2297772393

641.0666666667107.2819625208

661.1109.1335116021

681.1333333333172.9512164219

701.1666666667214.8990617422

721.290.4568666736

741.2333333333159.6362580376

761.2666666667203.5578817629

781.319.6238899762

801.3333333333530.6504676838

821.3666666667284.9153564306

841.418.460434994

861.433333333315.4648651224

881.466666666714.4626175463

901.5394.9514891876

921.5333333333847.5641928028

941.566666666786.686051055

961.61309.8071272135

981.63333333332567.8598015687

1001.66666666671121.5604145445

1021.73451.4348663924

1041.73333333331250.1986193216

1061.76666666674737.1200673116

1081.83217.485596367

1101.833333333321914.0355145094

1121.86666666671778.754371709

1141.95180.913453256

1161.933333333314162.8028556605

1181.966666666717056.6072334304

12023825.116693499

1222.033333333317522.0519657529

1242.066666666715789.8177942988

1262.12603.0619075529

1282.13333333331536.7255068218

1302.16666666673282.9217648012

1322.26660.2354949299

1342.23333333333908.4818214818

1362.26666666675174.2373353989

1382.39449.6769686697

1402.333333333350908.8510388328

1422.36666666678137.3603449255

1442.4316.2798473489

1462.43333333331018.5565097445

1482.4666666667576.4573447172

1502.5434.3910046933

1522.5333333333941.2089789315

1542.56666666671160.2716948694

1562.6937.9162567287

1582.63333333333147.2658240456

1602.66666666672890.9277690156

1622.725498.5515101849

1642.733333333314359.269437478

1662.76666666678397.0509236021

1682.811305.9814098644

1702.83333333333345.0823012888

1722.86666666672741.3242412263

1742.91433.2899515612

1762.933333333324467.7665966291

1782.966666666724313.0980100048

18033570.2266449968

1823.03333333334867.0235167649

1843.066666666730965.3977685008

1863.110846.4127300349

1883.13333333333322.7201970031

1903.16666666679378.338262196

1923.214832.5287236745

1943.23333333332642.2730828072

1963.26666666678250.3860284366

1983.316392.3836274503

2003.33333333333309.0996023498

2023.366666666711842.7337141804

2043.49602.9601781016

2063.43333333333119.6178375546

2083.466666666712032.7912262195

2103.58591.1960336935

2123.53333333333821.596887965

2143.56666666672543.4529745788

2163.61039.1863218016

2183.6333333333312.7337351722

2203.66666666677537.18631934

2223.757172.0751692361

2243.733333333324627.4217718036

2263.76666666676062.8410147819

2283.82459.7827736397

2303.83333333331704.4423857414

2323.86666666675688.1084746531

2343.96096.6643932207

2363.93333333336971.3604744403

2383.96666666675133.4970460054

24044520.5206908229

2424.03333333332060.3728988722

2444.06666666673326.0452878527

2464.112569.2018012856

2484.13333333337533.8031727998

2504.16666666676322.9835304018

2524.26160.5991130476

2544.233333333316191.5466961329

2564.26666666679992.2116292687

2584.310990.6861341946

2604.333333333317741.1691184131

2624.36666666679992.252480904

2644.46063.9297723466

2664.433333333320226.6209101128

2684.466666666717057.7720340344

2704.55805.0838690757

2724.533333333310910.9213451439

2744.566666666713028.8780270147

2764.65309.5649261809

2784.63333333336230.6849012656

2804.666666666713743.0481993915

2824.722403.9920995082

2844.733333333314028.2769401914

2864.76666666676039.6899744686

2884.811492.0898882934

2904.833333333311539.3211294998

2924.86666666673072.5386372668

2944.93194.6253893863

2964.933333333321853.6536180434

2984.966666666719465.7430162929

300510351.8287089415

3025.03333333336761.285526471

3045.06666666674523.9488878213

3065.12978.9864359281

3085.13333333332268.2912945866

3105.16666666674481.9133041232

3125.25053.1536925758

3145.233333333312350.2758680605

3165.266666666751740.6724088102

3185.342682.3370430073

3205.33333333334820.0490208049

3225.366666666710491.8359282906

3245.49611.3196690758

3265.43333333334998.6797683177

3285.46666666674811.6836644633

3305.53218.3559889745

3325.53333333335085.6059987295

3345.56666666675419.5196692677

3365.67253.4781705844

3385.63333333339791.6829780227

3405.666666666717220.7850972823

3425.77808.6602571438

3445.73333333339785.1073125076

3465.76666666677168.3280743018

3485.87632.3095784272

3505.83333333339915.0755747143

3525.866666666711316.4807908593

3545.912365.1496233942

3565.933333333316324.3404612835

3585.966666666712096.9014140705

36068250.3526169094

3626.03333333337166.1568934395

3646.06666666676752.2353195308

3666.18685.2906474188

3686.13333333338067.5704950787

3706.16666666673807.9405743237

3726.25732.0553898649

3746.23333333337605.994935635

3766.266666666712759.1613836449

3786.317296.7198538016

3806.333333333313561.9576893851

3826.36666666676207.6193360361

3846.412713.7057468426

3866.433333333313664.1911758736

3886.46666666676411.2565335921

3906.54626.8211051837

3926.53333333333145.3366598116

3946.56666666674136.512408889

3966.66429.2910564073

3986.63333333335918.463789499

4006.66666666676467.3737478872

4026.79885.389017565

4046.733333333311573.6324623065

4066.76666666676318.3488337495

4086.85987.469252553

4106.83333333336961.2242934888

4126.866666666732762.2146895592

4146.962780.2209744243

4166.933333333316398.1248223043

4186.966666666711518.0009955625

42077296.425925923

4227.03333333335016.0772911373

4247.06666666673843.2520697321

4267.14056.4719661706

4287.13333333334823.2247107776

4307.16666666676450.3927571564

4327.28323.9197702353

4347.233333333310325.4073062816

4367.26666666677318.9706483334

4387.35784.754374751

4407.333333333310912.1534585302

4427.366666666713662.5637972795

4447.410621.8460176695

4467.43333333339545.1542176149

4487.466666666711530.8831782996

4507.57959.2474417741

4527.53333333339092.1332375852

4547.56666666678606.7590060464

4567.65952.8447718636

4587.63333333336432.4897658324

4607.66666666675683.5741938717

4627.79369.4415078766

4647.733333333310733.2448464196

4667.766666666711185.1362093156

4687.812090.6920565229

4707.833333333312702.4769801287

4727.86666666678180.0752462887

4747.911238.2288804196

4767.93333333338274.0423758251

4787.96666666676804.7049619314

480813289.9551455443

4828.03333333338335.4637653139

4848.06666666675821.1224782069

4868.18332.1848583147

4888.13333333337784.3334714767

4908.16666666677673.9520324332

4928.29347.9954687793

4948.23333333339028.8931791069

4968.26666666678856.0301691263

4988.37357.8640151355

5008.33333333336622.943919981

5028.36666666677503.6672553463

5048.49097.195608645

5068.433333333332047.6482157836

5088.466666666760902.892118028

5108.516799.7363022389

5128.53333333336241.9658677851

5148.56666666675558.2970880678

5168.66163.3422947478

5188.63333333337212.6113739566

5208.666666666712828.7860132425

5228.720617.2139930044

5248.73333333339961.7709863421

5268.76666666679447.491431206

5288.813837.2436263265

5308.83333333337999.1028798238

5328.86666666675685.9003055494

5348.97877.4753584064

5368.93333333337960.2403508768

5388.96666666678469.8677903316

540910723.4554726244

5429.03333333339957.3000067673

5449.06666666679479.0520213917

5469.17638.2972396497

5489.13333333339389.9501255284

5509.16666666678723.5787693983

5529.27221.2783810924

5549.23333333339629.8350768332

5569.266666666712250.231616979

5589.311867.6812645077

5609.333333333312596.8656881063

5629.366666666713035.1557183432

5649.412868.8107917145

5669.433333333315288.9625045189

5689.466666666710416.4748420229

5709.519875.1124247128

5729.533333333320771.8291385923

5749.566666666715125.6165963898

5769.617117.7217353656

5789.633333333311301.1062012547

5809.666666666711436.0812888414

5829.710794.9275079837

5849.733333333317163.0016323833

5869.766666666714147.0729577005

5889.88973.2753658133

5909.83333333338428.3431006921

5929.86666666678053.8136712152

5949.912739.4273478076

5969.933333333348374.897226663

5989.966666666764748.6413051375

6001015223.5568297482

60210.03333333338447.6709959735

60410.06666666679190.3153208901

60610.110217.0842107223

60810.133333333310434.9855267198

61010.16666666679122.1254042652

61210.210817.3644620103

61410.233333333313244.6919316376

61610.266666666710416.0358550582

61810.39745.2461095941

62010.33333333339684.2113619504

62210.36666666678232.0468456262

62410.46056.3670796001

62610.43333333337235.9672107059

62810.46666666679504.557229613

63010.511592.9351513157

63210.533333333314386.5095203688

63410.566666666711160.6743309578

63610.67573.6735435523

63810.63333333338855.5655102108

64010.666666666712860.4826943978

64210.714450.2259748665

64410.733333333311781.4355490262

64610.766666666710392.3943714723

64810.812894.8950153906

65010.833333333311772.5232208953

65210.866666666716650.5262595883

65410.913127.5338186161

65610.933333333315605.0324613983

65810.966666666718130.013682445

6601110852.8253797238

66211.033333333312255.2338111893

66411.066666666726311.3697690233

66611.121199.4716420987

66811.133333333315565.7681102672

67011.166666666713798.3835727139

67211.211108.6195517481

67411.233333333311011.671736503

67611.266666666712227.6391804561

67811.320875.6406996017

68011.333333333338979.2267823214

68211.366666666780283.3322227216

68411.438492.6115728046

68611.433333333313745.6137074448

68811.466666666710770.3133277772

69011.59830.9253565435

69211.533333333311753.2491677146

69411.566666666714912.7760608994

69611.613181.9283016972

69811.63333333339069.6472783197

70011.66666666679719.7347883242

70211.710173.66943663

70411.733333333311416.6097201286

70611.766666666711809.6467978349

70811.810026.4682308277

71011.833333333310915.2827613646

71211.866666666710477.4151439425

71411.98953.3183773158

71611.93333333339683.254728056

71811.966666666712971.6841925857

7201214140.1585958486

72212.033333333313952.8350589922

72412.066666666714573.9883505699

72612.112986.6588573046

72812.133333333312621.0304606096

73012.166666666714584.2106614406

73212.218674.8034713528

73412.233333333332694.2581893811

73612.266666666721541.9610093107

73812.314614.1410580827

74012.333333333314808.9412972713

74212.36666666679602.7161742974

74412.410895.8122971296

74612.433333333313505.2520108964

74812.466666666717549.8916952128

75012.514302.1351627428

75212.533333333312244.4796064755

75412.566666666711277.5440258756

75612.613583.4924850574

75812.633333333316482.16422553

76012.666666666729863.3035204433

76212.768803.6117532872

76412.733333333353914.855847687

76612.766666666716375.523241692

76812.814525.2657732109

77012.833333333316505.0469041564

77212.866666666714468.0191202041

77412.911170.5927883153

77612.93333333339583.3466595129

77812.96666666679846.461876969

7801312907.4426731156

78213.033333333313383.4808846023

78413.066666666712564.9916151644

78613.111107.1384474903

78813.133333333310289.2076803732

79013.166666666710936.6077709163

79213.212392.2754804549

79413.233333333313781.5647829699

79613.266666666712735.4569044675

79813.316533.4899242559

80013.333333333320904.311679595

80213.366666666716830.4381084455

80413.417030.8795253115

80613.433333333319986.8652323154

80813.466666666718571.5489700283

81013.521368.5912381112

81213.533333333320801.8757450293

81413.566666666716442.2866251397

81613.617717.5273490006

81813.633333333315403.528484219

82013.666666666713187.1197149117

82213.713787.5998615567

82413.733333333313503.047079534

82613.766666666712819.8623464653

82813.811111.802017293

83013.833333333312013.7081802358

83213.866666666713945.866895101

83413.917894.3220663895

83613.933333333329420.9256141632

83813.966666666772413.5704701366

8401454858.6416707904

84214.033333333317995.2195063232

84414.066666666717552.069295474

84614.116939.7595238874

84814.133333333315723.7791599775

85014.166666666713701.9889026548

85214.212686.8254065101

85414.233333333312237.6466247172

85614.266666666712932.8295738602

85814.313978.8063662428

86014.333333333314146.2010211451

86214.366666666712926.7138258888

86414.412541.0232864523

86614.433333333313131.9779591329

86814.466666666712953.6361187644

87014.514872.3845104811

87214.533333333319130.108522612

87414.566666666725692.7032771332

87614.642130.269077653

87814.633333333330249.2324456213

88014.666666666718539.9406964184

88214.718954.0130146686

88414.733333333322578.0647237245

88614.766666666722727.5136877517

88814.819994.668595655

89014.833333333322413.5453693501

89214.866666666718840.0343125894

89414.917658.9736377412

89614.933333333314765.8658343529

89814.966666666713674.6305945178

9001516121.3809974597

90215.033333333317599.7349699717

90415.066666666717642.9398919969

90615.116793.0057160622

90815.133333333328047.5059451959

91015.166666666767911.1026824333

91215.279430.5844568574

91415.233333333326234.0355396197

91615.266666666733831.3293205728

91815.351999.6458178292

92015.333333333328412.6082598113

92215.366666666721321.5562000755

92415.420045.0758626804

92615.433333333316828.5025930063

92815.466666666715497.7228125127

93015.517453.4837070306

93215.533333333316308.1816562475

93415.566666666715432.4021032443

93615.618693.0678704986

93815.633333333318946.5624737552

94015.666666666720864.5526839432

94215.726534.2001214486

94415.733333333325207.0529021282

94615.766666666721124.95409929

94815.826630.5077994066

95015.833333333328306.7143157734

95215.866666666722350.2087456927

95415.922476.717702954

95615.933333333322383.0501038516

95815.966666666721301.3580584428

9601623362.1387672942

96216.033333333319894.4243184726

96416.066666666718006.1884686859

96616.118175.2510494554

96816.133333333318631.7825784566

97016.166666666718891.5677910828

97216.217449.3754811401

97416.233333333318710.2957470179

97616.266666666724343.7700218653

97816.353128.8459988482

98016.333333333392246.1990658615

98216.366666666739475.4281272648

98416.421969.1635165503

98616.433333333330126.3332727903

98816.466666666757116.8810926495

99016.542515.1144006917

99216.533333333322813.9665674696

99416.566666666722671.6073317073

99616.619304.7256147096

99816.633333333319256.7038956807

100016.666666666718619.8646726132

100216.718390.5992267393

100416.733333333320896.9623601397

100616.766666666727456.8978537421

100816.829676.2008906494

101016.833333333325345.6443842345

101216.866666666722553.6819096123

101416.921677.5857735871

101616.933333333321778.3419903143

101816.966666666725543.5818744776

10201728497.0022727617

102217.033333333327194.1098558589

102417.066666666722798.7234254144

102617.125409.2206734756

102817.133333333321977.8278369391

103017.166666666719254.3980550197

103217.219749.0551573755

103417.233333333321454.4297018792

103617.266666666722859.8045823557

103817.321894.7820388212

104017.333333333322772.2197356448

104217.366666666737248.2161408362

104417.477273.4131830397

104617.433333333377176.328471126

104817.466666666726996.6772652531

105017.522626.1685159741

105217.533333333322433.8102089712

105417.566666666723227.8923186099

105617.622766.7362773763

105817.633333333320284.5446220987

106017.666666666720759.1385065002

106217.720523.6551965487

106417.733333333319017.147674761

106617.766666666718972.6673506532

106817.820559.3476293512

107017.833333333324849.3778535124

107217.866666666727481.1313169485

107417.926366.4776101651

107617.933333333322669.3585466778

107817.966666666720520.0904190856

10801822098.2812721695

108218.033333333323416.0546331047

108418.066666666726315.8044127006

108618.124465.338931177

108818.133333333323917.1841610041

109018.166666666723632.7404854937

109218.220641.8120466532

109418.233333333320595.3320638941

109618.266666666720776.664384739

109818.322045.4631049813

110018.333333333320941.6159016199

110218.366666666719339.8721475488

110418.430011.4802803821

110618.433333333369104.8102231192

110818.466666666768472.7080727462

111018.526476.674484246

111218.533333333321469.1424544361

111418.566666666721446.573310563

111618.620133.0906100558

111818.633333333319638.4457884559

112018.666666666719782.5981089728

112218.718958.1266056159

112418.733333333317590.3983393417

112618.766666666716696.0754304942

112818.817664.5841328499

113018.833333333321200.2497735666

113218.866666666722496.6919226021

113418.921114.8482753474

113618.933333333319631.9849409591

113818.966666666718322.0445704866

11401919251.6987619244

114219.033333333322130.9917266926

114419.066666666723585.6040385249

114619.120565.8998983103

114819.133333333319945.5690722429

115019.166666666721580.1526806439

115219.219813.497865793

115419.233333333322165.4634739375

115619.266666666721354.8869795786

115819.318603.4267097577

116019.333333333318536.9481396528

116219.366666666719100.0996010309

116419.436027.5514849475

116619.433333333367266.6497584171

116819.466666666734617.7938430397

117019.519842.9442030084

117219.533333333318254.1138180179

117419.566666666718593.9940465185

117619.617989.0930333925

117819.633333333316926.4466113783

118019.666666666716820.6936400159

118219.716420.3930907507

118419.733333333316546.0348113003

118619.766666666719861.4394379496

118819.822275.8615909497

119019.833333333319863.2064012114

119219.866666666719230.1898576572

119419.918641.8803864665

119619.933333333317492.0057535257

119819.966666666717955.9835869859

12002018288.8181399223

120220.033333333319848.7774905781

120420.066666666719043.2208727254

120620.119727.3266355484

120820.133333333321619.8662005726

121020.166666666718173.5772193293

121220.220858.6147053819

121420.233333333323131.8313830666

121620.266666666717929.0520431015

121820.317066.3260028094

122020.333333333324804.563089203

122220.366666666749464.1862464643

122420.450076.0424533382

122620.433333333321116.4651221416

122820.466666666718007.1165405647

123020.518801.4463273712

123220.533333333318303.5907330352

123420.566666666717754.673408078

123620.616821.9010478755

123820.633333333316863.0312651596

124020.666666666715964.0280708258

124220.717721.0659152967

124420.733333333321043.5216235063

124620.766666666721528.3041324546

124820.818370.5231458506

125020.833333333318238.4558282788

125220.866666666717392.1133045249

125420.918099.2589183646

125620.933333333318419.9351874367

125820.966666666719672.1763618901

12602118864.2906618449

126221.033333333319897.3146372335

126421.066666666717565.9954375371

126621.117236.1266751502

126821.133333333316701.0014571815

127021.166666666716180.3701027293

127221.216247.1240598264

127421.233333333319006.532087367

127621.266666666738214.9807328293

127821.350004.9152965782

128021.333333333322293.7055315956

128221.366666666718237.1405392779

128421.418029.0006580054

128621.433333333317416.301954168

128821.466666666717726.21229305

129021.518536.3512919261

129221.533333333316859.4650074114

129421.566666666715824.9505198482

129621.617701.9070559187

129821.633333333318155.7912635824

130021.666666666717735.4773095088

130221.717336.9721542782

130421.733333333315750.7992961706

130621.766666666715903.6475578942

130821.816214.2801471438

131021.833333333317664.3462595721

131221.866666666716404.6416833305

131421.917168.1814496076

131621.933333333318136.2396420989

131821.966666666715764.9803559814

13202215215.7266646182

132222.033333333314933.9530901413

132422.066666666714454.733428082

132622.117187.3801747204

132822.133333333333008.0248111974

133022.166666666743728.4050933902

133222.221869.3396452045

133422.233333333316094.8350233567

133622.266666666715569.1597946125

133822.315893.2237932677

134022.333333333315040.4678489769

134222.366666666715111.8182860385

134422.415027.0949365416

134622.433333333314940.2590246654

134822.466666666716301.4129765606

135022.515387.0340290749

135222.533333333314430.6287633839

135422.566666666715063.4355774536

135622.614311.7107757516

135822.633333333314903.0721674611

136022.666666666715259.148047789

136222.715361.6506333304

136422.733333333314487.3652500591

136622.766666666715766.8524731727

136822.814746.3666985615

137022.833333333313102.2862321607

137222.866666666713401.7107350206

137422.912756.4936003501

137622.933333333313413.0999519642

137822.966666666725459.5417624453

13802335704.2078596508

138223.033333333320220.4685348547

138423.066666666714971.4602019184

138623.113640.6307191975

138823.133333333313360.6236736055

139023.166666666712880.6190065282

139223.212463.2726486381

139423.233333333312002.2555766354

139623.266666666713084.6001539891

139823.313560.0215143906

140023.333333333313936.3764529451

140223.366666666712705.2835403943

140423.412298.462947611

140623.433333333312392.5373215666

140823.466666666713029.7812823717

141023.514142.0074357567

141223.533333333313182.9894746444

141423.566666666712993.7112412667

141623.612691.4414894047

141823.633333333312300.3203566641

142023.666666666711589.9661003212

142223.711110.2567021821

142423.733333333311417.1965121691

142623.766666666718453.6954333259

142823.828485.5991477599

143023.833333333317810.6403563793

143223.866666666712480.09075346

143423.911377.4672043072

143623.933333333310638.2539346906

143823.966666666710723.6757114774

14402410858.3262180501

144224.033333333310714.333523638

144424.066666666711709.1211337433

144624.111123.418902576

144824.133333333311300.9438460919

145024.166666666710813.0637501329

145224.210771.6102251356

145424.233333333310545.3969831832

145624.266666666712088.3667037758

145824.312382.8347345939

146024.333333333311445.3888681945

146224.366666666711220.1384970835

146424.410293.1913317943

146624.43333333339674.127042943

146824.46666666679368.9766492165

147024.59556.747535626

147224.533333333312378.3692849784

147424.566666666721888.7836217263

147624.615296.5660170883

147824.63333333339608.6720886311

148024.66666666679570.8842933237

148224.79272.2136024039

148424.73333333338925.5479943027

148624.76666666678724.4448458019

148824.89194.0062305383

149024.83333333339609.993068984

149224.86666666679240.3686863498

149424.99527.6796015704

149624.93333333339512.5119331924

149824.96666666679142.7932512146

1500259062.6109342828

150225.03333333339742.311336296

150425.06666666679259.1930830384

150625.18876.3016158002

150825.13333333339386.6806404968

151025.16666666678177.9975965144

151225.27803.807823357

151425.23333333337727.2190138095

151625.26666666678084.9332619302

151825.314288.565788773

152025.333333333315262.1995199796

152225.36666666678641.8204329352

152425.47376.5642858178

152625.43333333337331.8593653436

152825.46666666677051.5935983933

153025.57559.8518236447

153225.53333333338769.3005033032

153425.56666666678687.1394404507

153625.67457.5629727763

153825.63333333337359.585447978

154025.66666666677561.8925455715

154225.77273.3916995884

154425.73333333337098.3332860395

154625.76666666677276.8004215271

154825.87400.438669528

155025.83333333337156.0642640194

155225.86666666677389.5330811957

155425.96594.8320355194

155625.93333333336548.7329232565

155825.96666666676773.0193609614

1560268038.2805126762

156226.033333333312112.8280693317

156426.06666666679689.0446139188

156626.16051.2669990094

156826.13333333336108.4447491378

157026.16666666676021.5899902571

157226.25870.2537755267

157426.23333333336504.9483532434

157626.26666666677077.0044814438

157826.36608.4068738839

158026.33333333335931.3620159998

158226.36666666675588.0780180544

158426.45387.062297767

158626.43333333335332.6189072568

158826.46666666675785.1326599379

159026.55604.7981526646

159226.53333333335223.053708427

159426.56666666675515.9929479495

159626.65299.6007269969

159826.63333333335358.9934219111

160026.66666666675376.2747619524

160226.76432.4862226424

160426.73333333338305.889786429

160626.76666666676873.7365392742

160826.84816.8658154415

161026.83333333334378.0213213276

161226.86666666674694.664777697

161426.94873.5874757278

161626.93333333335012.072920986

161826.96666666674839.1247244463

1620274689.1978157437

162227.03333333334468.9148843575

162427.06666666674200.8718425205

162627.13990.7555971027

162827.13333333333999.437920152

163027.16666666674199.6123870768

163227.24670.9639152225

163427.23333333334799.9971395423

163627.26666666674254.0885116292

163827.33825.3258468107

164027.33333333333893.8832677636

164227.36666666674584.8888304082

164427.46215.7548492855

164627.43333333335200.0817361944

164827.46666666673686.6175744799

165027.53577.7569743936

165227.53333333333291.0509610175

165427.56666666673123.6759008941

165627.63114.3403826832

165827.63333333333417.213859865

166027.66666666673210.450563878

166227.73117.8764097596

166427.73333333333025.9960082334

166627.76666666673073.7603389139

166827.83461.728870654

167027.83333333333566.9666267869

167227.86666666673181.8780182478

167427.93114.3514264231

167627.93333333332930.8825142144

167827.96666666672689.8409775516

1680282645.1373561765

168228.03333333333408.0232818902

168428.06666666674199.444578518

168628.13298.8503654507

168828.13333333332535.3929183344

169028.16666666672446.0155270853

169228.22434.0533579308

169428.23333333332514.079900066

169628.26666666672528.0960125408

169828.32362.8665971662

170028.33333333332220.7216811567

170228.36666666672230.7842845687

170428.42209.6530533119

170628.43333333332097.9423619636

170828.46666666672289.3333964728

171028.52314.3470174542

171228.53333333332289.6455412423

171428.56666666672276.1665898635

171628.62103.9359023341

171828.63333333332005.2984472488

172028.66666666672265.8241312354

172228.72748.5483697756

172428.73333333332306.5935725752

172628.76666666671880.1758570802

172828.81785.6438182147

173028.83333333331705.1592086676

173228.86666666671756.4948472602

173428.91807.0442657044

173628.93333333331808.2481171205

173828.96666666671843.4518959288

1740291922.3195214378

174229.03333333331900.8008433514

174429.06666666671710.6037178359

174629.11745.1960273296

174829.13333333331689.8038276783

175029.16666666671633.5063649789

175229.21582.4314519931

175429.23333333331575.7488214014

175629.26666666671698.2927754113

175829.32092.3333853147

176029.33333333332350.2275013271

176229.36666666672099.5928845442

176429.42044.900608099

176629.43333333331875.0579261943

176829.46666666671658.5727243209

177029.51591.7587146349

177229.53333333331529.6528182973

177429.56666666671522.5100906926

177629.61533.8395443814

177829.63333333331544.5177458004

178029.66666666671509.9519704821

178229.71519.788784889

178429.73333333331533.9073086256

178629.76666666671541.3481234272

178829.81501.7111268973

179029.83333333331482.338771493

179229.86666666671524.5722907316

179429.91739.6039658739

179629.93333333331672.5119353624

179829.96666666671581.2061365577

1800301613.4761089496

180230.03333333331565.3740458448

180430.06666666671562.5139462407

180630.11595.3414195501

180830.13333333331585.2739923735

181030.16666666671601.6642458281

181230.21666.3424934404

181430.23333333331669.6156895572

181630.26666666671631.4700308256

181830.31620.1739222072

182030.33333333331669.3652196008

182230.36666666671686.7429963663

182430.41675.5356423226

182630.43333333331692.8316495358

182830.46666666671742.7298340042

183030.51813.5719616094

183230.53333333331727.8502323656

183430.56666666671681.0566824324

183630.61735.9874515349

183830.63333333331781.4407940927

184030.66666666671803.4726370836

184230.71747.22769154

184430.73333333331689.1841695524

184630.76666666671794.2957233296

184830.81791.050381448

185030.83333333331846.3420529816

185230.86666666671831.8306077055

185430.91842.3995750024

185630.93333333331838.6334355782

185830.96666666671868.5769304946

1860311834.2505732068

one_d

Time

Response

IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkGCxGCObjective of GCxGC AnalysisChemical IdentificationOutlineObjective of GCxGC AnalysisSeparate individual peaks from backgroundQuantify each peakIdentify the peaks for chemicals of interest


IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkGCxGCObjective of GCxGC AnalysisChemical IdentificationOutlineChemical Identification with GCxGCAutomated approachesLibrary search Such as NIST Mass Spectral LibraryRule-based techniques: Such as constrain expressions based on retention times or mass spectrumPattern matching: markers, chemical retention pattern.Challenges:Data inconsistencies: retention time variationsData and task complexities: multi-dimension, many peaksSolution: combined approach (Smart templates) with peak template matching constraint expressions


IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkGCxGCObjective of GCxGC AnalysisChemical IdentificationOutlineOutlinePeak template matchingSmart TemplatesComputer Language for Identifying Chemicals (CLIC)Smart TemplatePeak template matching with CLICBuilding Smart Multi-type TemplatesInteractive tools for building smart multi-type templatesAutomatically generating CLIC for peaksAutomatically generating peak sets with markers.Conclusion and Future WorksQ. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS

IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkChemical Identification ProcessFundamental DifficultyPeak Template MatchingIdentify compounds by matching previously known peaks to unidentified peaksA peak template is a set of annotated peaks with:Computed features such as peak location (2D retention times)Assigned information such as compound nameA target peak is a set of unannotated peaks that have computed featuresPeak template matching tries to establish as many correspondences as possible from template peaks to target peaksQ. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS

IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkChemical Identification ProcessFundamental DifficultyChemical Identification ProcessConstruct a peak template:Created by a chemist through interactive annotationMatch template and target peaksApply the template: assign information from template to target peaksQ. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS

IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkChemical Identification ProcessFundamental DifficultyFundamental Difficulty of Peak Template MatchingPeak pattern distortions:Peaks for the same compound may appear at different retention times in different imagesBasic solution:Search all allowable matches from template peaks to target peaks under some retention time windows Find a transformation that maximize the number of matched peaksQ. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS

Challenges:Searching transformations in a large space is computationally expensiveFalse identifications may happen when two target peaks are very close together

A solution: Smart TemplateIntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkChemical Identification ProcessFundamental DifficultyFundamental Difficulty of Peak Template MatchingQ. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MSB1B2B3peak1peak2

IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkComputer Language for Identifying Chemicals (CLIC) Example CLIC ExpressionsPeak Template Matching with CLICSmart TemplatesObjective:Reduce the number of allowable matchingsReduce ambiguous matchingsReduce human interventionApproach:Add more constraints other than retention time patternsCLICQ. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS

IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkComputer Language for Identifying Chemicals (CLIC) Example CLIC ExpressionsPeak Template Matching with CLICComputer Language for Identifying Chemicals (CLIC)CLIC [Reichenbach et al., 2004] is a language to express constraints on GCxGC retention times, peak characteristics, and mass spectral characteristics:Functions of retention timesFunctions of peak characteristicsFunctions of mass spectraLogical and arithmetic operatorsComparative operators: , , =, Addition, subtraction, negation (-) and parenthesesLogical operators: and(&), or (|), and negation(!)Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS

IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkComputer Language for Identifying Chemicals (CLIC) Example CLIC ExpressionsPeak Template Matching with CLICComputer Language for Identifying Chemicals (CLIC)Functions characterizing chromatographic properties and mass spectral characteristics are key features of CLIC.Retention(2) returns the retention time of the peak on the second column.Intensity(40) returns the intensity value of the indicated channel (m/z = 40) in the mass spectrum of the peak.Ordinal(40) returns the ordinal position of the indicated channel (m/z = 40 in a mass spectrum) in the intensity-ordered multi-channel array of the peak.


IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkComputer Language for Identifying Chemicals (CLIC) Example CLIC ExpressionsPeak Template Matching with CLICExample CLIC ExpressionsAlkanesCriteria (Welthagen et al. 2003): Base peak 57 or 71 and second largest peak 71 or 57. No time rule is needed for this group, but a retention window of 1.0 1.5s can be used.CLIC Expression:(Ordinal(57) 2) & (Ordinal(71) 2) & (Retention(2) 1.0) & (Retention(2) 1.5)


IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkComputer Language for Identifying Chemicals (CLIC) Example CLIC ExpressionsPeak Template Matching with CLIC

Peak Template Matching with CLICEach peak in the template has an optional CLIC expressionFirst, find a set of possible matches by using the retention time pattern Then, prune the matching space based on CLIC expressionsFinally, search for the best matchingThe combination of chromatographic retention time patterns and CLIC expressions can improve both speed and accuracy of automated chemical identification for GCxGCWe call it a Smart template


IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuilding Smart Multi-type TemplatesSmart Template has been implemented in GC Image software.Interactive tools for building Multi-type Templates Peaks, groups, graphics, text objects and chemical structuresInteractive tools for building CLIC expressionsA GUI that resembles a calculator for users to create and test CLIC expressionsAn interface for specifying a CLIC expression for each template peakInterfaces to match and apply templates


IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart templateAuto CLICAuto chemical grouping with markersBuild Multi-type templateConstruct and edit template with peaks and other structures:Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS

IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart TemplateAuto CLICAuto chemical grouping with markersBuild Smart Template Example with Grob Mix1) Build a template from the original image Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS

IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart TemplateAuto CLICAuto chemical grouping with markersBuild Smart Template Example with Grob Mix2) Wrong match because of peak pattern distortions:Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS

IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart TemplateAuto CLICAuto chemical grouping with markersBuild Smart Template Example with Grob Mix3) Smart template solution:a) Create CLIC expression for NonanalQ. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS

IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart TemplateAuto CLICAuto chemical grouping with markersBuild Smart Template Example with Grob Mixb) Specify CLIC expression for Nonanal template peak:Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS

IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart TemplateAuto CLICAuto chemical grouping with markersBuild Smart Template Example with Grob Mix4) Matching with Smart Template:Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS

IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart TemplateAuto CLICAuto chemical grouping with markersAuto CLICAutomatically generate CLIC expressions for peaks: CLIC function: Match()NIST matching function returns the similarity between two mass spectraValue range is [0, 1000]Higher is the value, more similar are the two mass spectra CLIC expression, Match() > threshold, can be used to identify chemicals.The mass spectrum of the peak is Automatically generate the threshold


IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart TemplateAuto CLICAuto chemical grouping with markersAuto CLICAutomatically generate matching threshold:The similarities between this peak and all other peaks should be less than the thresholdThe threshold has the large margins from this peak and all other peaksFor example: peak 1 represents blob B1B1. Match() = 1000B2. Match() = 600B3. Match() = 400Match() > 800Q. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MSB2B3peak1B104006001000800B2B3B1

IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart TemplateAuto CLICAuto chemical grouping with markersAuto CLIC1) Set Auto CLIC functionQ. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS

IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart TemplateAuto CLICAuto chemical grouping with markersAuto CLIC2) Generate CLICQ. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS

IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart templateAuto CLICAuto chemical grouping with markersAuto chemical grouping with markersGroup peaks based on their retention time patterns:Build natural clusters of peaksEach cluster is represented by a polygonA template may consist of a set of groups (polygons)


IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart templateAuto CLICAuto chemical grouping with markersAuto chemical grouping with markersQ. Tao, S. E. Reichenbach, et al.Multi-type Templates in GCxGC-MS29 clusters created by single linkage hierarchical clustering algorithm

IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart templateAuto CLICAuto chemical grouping with markersAuto chemical grouping with markersAutomatically generate markers for groups (polygons)Template matching is based on peaksEach group needs markersA marker is a significant peak in the groupMarkers are at evenly distributed locations to represent the retention time pattern of the groupAuto marker:Cluster all peaks in a groupPick the largest peak in each cluster as a marker


IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart templateAuto CLICAuto chemical grouping with markersAuto chemical grouping with markers1) Set Auto Marker function


IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkBuild Multi-type templateBuild Smart templateAuto CLICAuto chemical grouping with markersAuto chemical grouping with markers2) Generate markers


IntroductionPeak Template MatchingSmart TemplatesBuilding Smart Multi-type TemplatesConclusions and Future WorkConclusions and Future WorkSmart Template matching can be used to automatically identify chemicals in GCxGC-MS dataThe combination of retention time patterns and constraints greatly reduces ambiguity and speeds processingFuture work: Enhanced GUIMore CLIC functionsSemi-automated or automated template constructionAuto CLIC and Auto Marker are just two first steps


IntroductionPeak Template MatchingComputer Language for Identifying Chemicals Peak Template Matching with CLICConclusions and Future WorkCurrent work is supported by NSF and NIHQuestions?Software: [email protected] www.gcimage.comLicensing: [email protected] www.zoex.com


smart templates for chemical identification in gcxgc-ms qingping tao 1, stephen e. reichenbach 2,...

Documents

gcxgcmsqingping tao1

future workq

entire samplegcxgc data

michael kok2

mingtian ni3

arvind visvanathan2

waltman11gc image

rich information