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Juan C. del Pozo SubDirector CBGP (UPMINIA) Universidad Politécnica de Madrid (UPM) Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (INIA) La Biotecnología en La Agricultura del futuro III Congreso sobre Fertilización Madrid 25 Septiembre 2019

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Page 1: La Biotecnología en La Agricultura del futuro...P3 Lab Research Services ... Informe PWH: El futuro del sector agrícola Español 2018 ... - La solubilidad es menos dependiente del

Juan C. del Pozo SubDirector CBGP (UPM–INIA)

Universidad Politécnica de Madrid (UPM) –

Instituto Nacional de Investigación y

Tecnología Agraria y Alimentaria (INIA)

La Biotecnología en La Agricultura del futuro

III Congreso sobre

Fertilización

Madrid 25 Septiembre 2019

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MAIN BUILDING Main Building: 7.391 m2

CBGP Facilities and Research Services

P3 Lab

Research Services

Microscopy and Cell Biology.

HT metabolomics platform.

P3 biological containment facility.

Fermenter (200 L)

Electrophysiology Lab.

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Plant Growth Facilities

Surface 542 m2

Laboratory 123 m2

Plant Growth surface 350 m2

Sustainable Greenhouses

Surface 1,200 m2

Greenhouses 611 m2

Biosafety P2 (x GMOs) 200 m2

Research Services: Plant Growth Facilities/Greenhouses

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Uno de nuestro compromisos: contribuir a alcanzar los ODS

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Las plantas son la base de la vida .. (y la sociedad)

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Importancia de la agricultura en la sociedad y la economía

Participación biotecnología vegetal

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Los retos de la agricultura 2050: Cantidad y Calidad

CRECIMIENTO POBLACIONAL

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Terreno arable

INCREMENTO

PRODUCCIÓN

SOSTENIBLE

La superficie cultivable es finita

Tierras con potencial de incorporación al sistema de producción

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El frágil equilibrio entre el bienestar y la sostenibilidad

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¿ES POSIBLE ALIMENTAR

A LA POBLACIÓN MUNDIAL

DE UNA FORMA SOSTENIBLE?

¿Y DENTRO DE 50 o 100 AÑOS?

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Sector agrícola

Viable, competitivo innovador

Sostenibilidad

económica

Aumento producción

Mejorar la eficiencia

Orientación al mercado

Reducción costes

Sostenibilidad

social

Incremento calidad

de trabajo

Empleo de calidad

Mejora de las Técnicas

Sostenibilidad

medioambiental

Mejora de la eficiencia

del uso de recursos

Mitigación cambio climático

Mejora/adaptación de los

cultivos

Ciencia y sostenibilidad del sistema agrícola

Biotecnología vegetal

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Respuesta posiblemente sea multidisciplinar, pero sin duda el uso de

la Biotecnología en su mas amplia definición será necesaria para

alcanzar estos objetivos.

¿Cómo lo podemos hacer?

Investigación sobre

las necesidades

actuales y futuras

Transferencia de

Conocimiento a las

empresas sector agro-

alimentario

Desarrollo de

Herramientas

Biotecnológicas

Investigación

Cooperación Implementación

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Informe PWH: “El futuro del sector agrícola Español” 2018

Principales preocupaciones del sector agrícola

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RSA: Arquitectura del sistema radicular Nutrientes: factor limitante del crecimiento y producción

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Sistema radicular vs parte area

Producción

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El sistema radicular es esencial para la nutrición vegetal

La formación y disposición de las

raíces en el suelo es importante para

la captación de nutrientes y agua

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Condiciones

del suelo

microbes

Nutrientes

H2O

Salinidad,

etc

El sistema radicular es esencial para la nutrición vegetal

La formación y disposición de las raíces en el suelo

es importante para la captación de nutrientes y agua

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Microorganismos

fijadores de nitrógeno

RSA: Arquitectura del sistema radicular Interacción raíz-organismos

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Fijación de Nitrógeno

Pros: barato y eficiente 170 millones Tn /año

Cons: Rhizobium solo infectan a una

determinado grupo leguminosas y de

especies próximas a las leguminosas.

Reacción química Haber Bosch

Alta temperatura

Alta presión

Costoso

70 millones Tn/año

Producción de Nitrógeno

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Erik Stokstad Science, 20 VOL 353 ISSUE 6305

Fijación de Nitrógeno en cereales: ¿un sueño o una realidad?

Aproximaciones:

Reestablecer las señales en los

cereales para que interaccionen

con las bacterias fijadoras

Introducir los genes de la

nitrogenasa en los cereales

(Transgénesis)

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Effect of the inoculation with Pf-5 X940 on (a) Arabidopsis growth and (b) ammonium

production.

Setten L, Soto G, (2013)

Biología sintética: Fijación de Nitrógeno por bacterias

Introducción de los genes nif (fijadores de N

atmosférico) en la bacteria Pseudomonas

protegens Pf-5. Su inoculación permite la

supervivencia de plantas de Arabidopsis sin

fuente de nitrógeno.

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INFORMACION PARA RESPONDER A UNA NECESIDAD

RESPUESTA A LO QUE ESTÁ PASANDO O CREEES QUE ESTÁ PASANDO

CONSTRUCTORES DE LA RESPUESTA LO QUE HA PASANDO

LO QUE ESTA PASANDO

EFECTO DE LO QUE HA PASADO

Genes al Servicio de la agricultura

consumidor

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Genes y la evolución de la agricultura

SlMYB12

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Secuenciación de genomas Información para

responder a una necesidad

Método Sanger

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Coste actual genoma humano

<1,000 €

NGS

https://www.genome.gov/

Genómica masiva

+200,000 proyectos

+50,000 eucariotas https://gold.jgi.doe.gov/statistics

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Los genomas vegetales contienen la información para el futuro de la agricultura

Se han secuenciado los genomas de los

principales cultivos agrícolas

(tenemos el “código fuente”)

la nueva revolución genómica

verde “inteligente”

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Evolución de la superficie de cultivos

transgénicos (izquierda, millones de

hectáreas) y distribución de la superficie

entre los países (derecha

Transgénicos: repercusión en la agricultura y la sociedad

181,5 millones de hectáreas

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Disponemos de herramientas

(CRISPR/Cas9) muy precisas

para EDITAR LOS GENOMAS

e introducir mutaciones o

modificaciones de los genes

La edición génica está revolucionando la biotecnología

Mutaciones

Regulación de

la expresión

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La edición génica está revolucionando la biotecnología

TALEN: (Transcription

Activator Like Effector

Nucleases)

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Ejemplos de éxito de la edición génica

manzano

yuca

vid

Banana

naranja

Caña de azucar

Fresa

Patata

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Fósforo es un nutriente esencial

Membrane phospholipids

DNA and RNA

ATP

Phosphorus (P) is

assimilated and used as

phosphate (Pi) which

depending on the pH is

H2PO4- ,HPO4

2- or PO43-

H H H

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RSA: Arquitectura del sistema radicular La deficiencia de Pi reduce severamente la producción agrícola

No phosphate

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Las plantas absorben un pequeño porcentaje del Pi aplicado

en los fertilizantes

El fosfato: Macronutriente que se

extrae. Recurso limitado (100 años??)

Producción en industria a

apartir de fosfato calcico:

Ca3(PO4)2 + H2SO4 → H3PO4 +

CaSO4 (yeso).

Pocos productores: China,

USA y Marruecos

Caro y limitado

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Búsqueda de nuevos genes, rutas, metabolitos

o microorganismos

1) Desarrollar nuevas variedades que absorban mas Pi en

suelos pobres, reduciendo la fertilización. Mejora

genética clásica; transgénicas; edición génica.

2) Desarrollo de nuevas tecnologías para reciclar el Pi de

los residuos urbanos y agrícolas. Costoso

3) Desarrollo de nuevos fertilizantes más eficientes.

RSA: Arquitectura del sistema radicular Nuevas estrategias para prevenir o retrasar la crisis del Pi

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Economía circular: Bioremediación-nutrición

Uso de especies vegetales como biofactorias

descontaminantes-productoras de nutrientes

Identificación

de variedades

mas eficientes

y adaptadas

Bioremediación

de purines

Producción de

proteína vegetal

Biofertilizantes

Desarrollo de

biofactorias

Variabilidad

Natural Generación

de mutantes

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Fosfitos son sales de ácido fosfórico con el fosforo en estado reducido (+3)

Phosphite Phosphate Fosfitos (Phi), Phi se propuso como fertilizante alternativo - La solubilidad es menos dependiente del pH. - Es menos reactivo con compuestos del suelo. Mayor cantidad en forma libre -No es toxico para los humanos o animales

RSA: Arquitectura del sistema radicular El Fosfito (Phi) no puede ser usado por las plantas

sin embargo no puede ser metabolizado por las plantas, Se usa como fungicida, ya que no puede ser metabolizado, pero compite con fosfato

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Substrate specificity of PTXD

RSA: Arquitectura del sistema radicular P. Stszeri es capaz de metabolizar fosfito y generar fosfato

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TRA

NSG

ENIC

C

ON

TRO

L NO Pi PHOSPHATE PHOSPHITE

0 20 40 80 20 40 80 mg.kg

RSA: Arquitectura del sistema radicular Tabaco transgénico metaboliza Phi

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No P Pi Phi

Phi effectively

promotes

transgenic

plant growth

while

reducing

weed growth.

López-Arredondo and Herrera-Estrella, Nature Biotechnology 2012.

RSA: Arquitectura del sistema radicular Plantas PTXD fertilizadas con Phi no tienen malas hierbas

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Weeds are not killed, but

grow slowly and do not

compete with your crop

RSA: Arquitectura del sistema radicular Phi controla el crecimiento de las malas hierbas sin matarlas

y generando un manto que evita erosión y excesiva

evaporación

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Lab 180 CBGP: desarrollo radicular

y deficiencia de fosfato

Nuevos sistemas de crecimiento

D-Root®

Root-cooler®.

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Las deficiencias nutricionales modulan la arquitectura radicular

Den Herder et al. (2010)

+Pi -Pi

Gruber et al., 2013

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La iluminación de la raíz afecta negativamente la respuesta a la deficiencia de Pi

-Pi (2µM) Reducción del crecimiento radicular

Pelos radicales más largos

Incrementa la densidad de raíces laterales

el ratio raíz/parte aérea

Mas antocianinas

Cambios metabólicos

Pi

Silva et al. 2019, New Phytologist

Deficiencia de fosfato

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Mapa de riesgo de desertificación de España

Crecimiento

Floración

Respuesta a patógenos

¿Efecto sobre la fertilización,

la nutrición de la planta o la

Interacción con el microbioma?

Cambio climático: efecto sobre la nutrición vegetal

35

35ºC

35ºC

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Shoot 35ºC ---------------- Root 22ºC

35ºC ---- 35ºC

Incrementos de temperatura reduce el sistema radicular y la acumulación de Pi (en invernaderos….)

Root-Cooler®.

Incrementos de temperatura en el aire no se traduce en

incrementos similares en el suelo, ya que este amortigua

la temperatura. El sistema Root-Cooler® permite analizar

el efecto del exceso de temperatura con el sistema

radicular en un a Tª amortiguada, como ocurre en la

naturaleza

0

5

10

15

nm

ol P

i/pla

nta

hoja raíz

hoja raíz

hoja raíz

35/22ºC 22/22ºC 35/35ºC

35ºC ---- 22ºC

35ºC ---- 35ºC

300 genes cambian la expresión

>1000 g

enes c

am

bia

n la e

xpre

sió

n

>200 g

enes

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Incrementos de temperatura en la raíz reduce tamaño y acelera la floración

35ºC ---- 22ºC

35ºC ---- 35ºC

Plantas de 4 semanas:

Análisis con Root-Cooler® muestran que incremento de Tª sobre la

raíz afecta al desarrollo de la parte aérea, reduciendo el crecimiento

y acelerando la floración.

Invernadero Root-Cooler® Invernadero control

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Las formación de micorrizas favorecen la toma de Pi

La hifas de los

hongos extienden

el área de

absorción de

recursos

Protegen contra

patógenos

Incrementan la

resistencia a

estreses

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Uso del Root-Cooler® es idóneo para estudiar la interacción raíz-microbiota

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Rastreo de sustancias químicas:

- De origen natural

- Nº limitado

- Sintéticas

- Alto número

- Problemas legales, seguridad alimentaria y medio-ambiental

Medio

completo Medio

con bajo

fosfato

Plantas con marcadores de respuesta nutricional

Adicción

químicos

Control

A

B

C

β -Glucuronidasa pIPS1

pIPS1::GUS

RSA: Arquitectura del sistema radicular Nuevas estrategias

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BiAux

BiAux, un nuevo químico que potencia el crecimiento radicular

Biological Activity

Chemical synthesis in lab

BiAux BiAux-I

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BiAux

BiAux

BiAux incrementa específicamente la formación de raíces laterales

Colaboración con TimacAgro (Roullier group)

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solvente BiAux

1 mM

BiAux también incrementa el Sistema radicular en tomate

0

0,5

1

1,5

2

2,5

3

3,5

4

Control 1 mM BiAux 1 mM BiAux

Fw

(g

r) r

oo

t/p

lan

t

solvente BiAux

1 mM

Colaboración con TimacAgro (Roullier group)

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0

5

10

15

20

25

30

7 8 9 10 11 12 14 16 18 20

Weeks of treatment

tom

ate

s/1

0 p

lan

ts

* *

*

*

*

Control 1 mM BiAux

control

BiAux

control BiAux

2 w 5 w

BiAux acelera la producción de frutos

Colaboración con TimacAgro (Roullier group)

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BiAux regula la expression génica BiAux regula la expresión génica

Parte de los cambios son similares a los

inducidos por la deficiencia de Pi

Colaboración con TimacAgro (Roullier group)

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