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Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 Le déconfinement Antoine Flahault – 23 avril 2020 1

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Page 1: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

Le point sur l’épidémiologie du COVID-19Le déconfinementAntoine Flahault – 23 avril 2020

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Page 2: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

Histoire naturelle du COVID-19

Days 0 5 8 21 25

contagious?

contagious

contagious

Asymptomatic

Mild symptoms

Hospitalized forsevere symptoms

ICU forcritical symptoms

5-10%

80-85%

15%

5%

No symptoms

No symptoms

No symptoms

No symptoms

Immune

Immune

Immune

Immune

Mildsymptoms

Severesymptoms

Criticalsymptoms

Hospitalization

ICU/VentilationDeath

contagious

Credits: Antoine Flahault UNIGE-HUG) and Frédérique Jacquerioz (HUG) Source: http://www.intrahug.ch/sites/intranet/files/structures/directions/communication/Coronavirus-COVID19/Recommandations-Institutionnelles/criteres_de_sortie_transfert_et_levee_des_mesures_covid-19_suspectes_ou_confirmes_2.0.pdf

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Page 3: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

Diagnostic high-tech

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Page 4: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

1. Les nombres2. La transmissibilité3. La sévérité

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Page 5: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

Les nombres officiels (23 avril, 2020)

Diamond Princess712 confirmed cases/3,711 passg+crew(attack rate=19.2%)331 (46.5%) of tested were asymptomatic13 deaths / 712 cases (CFR = 1.8%)

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Page 6: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

Incertitude sur les nombres…

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Page 7: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

Prévisions à 8 jours

https://renkulab.shinyapps.io/COVID-19-Epidemic-Forecasting/ 7

Page 8: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

2. La transmissibilité

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Page 9: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

R0 est une variable, avec sa propre

distributionR0 = 2.5 en moyenne!

Ro for SRAS in Singapore (Lloyd-Smith, 2005)

6 days

3d 2.4

R0, nombre de reproduction de base

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Page 10: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

R-eff < 1 Un outil pour planifier les mesures de contrôle

R0 = 2,5 = 5% x 10 pers x 5 jours

R-eff = 0,4 = 4% x 2 pers x 5 jours10

Page 11: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

Réduire la probabilité de transmission

Mesures temporaires individuelles– Masques de protection– Lavage des mains– Mouchage dans le coude, mouchoirs jetables– Antiviraux

Mesures à long terme– Vaccins 11

Page 12: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

Restreindre les contacts

Mesures temporairesDistance sociale personnalisée

– Testing de masse, Tracing exhaustif– Isolement et séparation après exposition

Distance sociale populationnelle (confinement)– Fermeture des écoles, des universités,– Interdiction des rassemblements– Limitation des déplacements– Cordons sanitairesWHO, Feb 25, 2020

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Page 13: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

Ecourter la duréede la période infectieuse

Mesures temporaires individuelles

– Antiviraux– Antitussifs ?

d = 4-5 jours13

Page 14: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

3. La sévérité de l’infection

0.3 – 3%

Case Fatality Rate (CFR)= Taux de mortalité

Estimation provisoireà partir du Diamond Princess13 décès/712 cas confirmés (CFR=1,8%)

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Page 15: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

Nombre x Transmission x SévéritéAxe vertical : transmissibilité (R0)

Axe horizontal taux de mortalité

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Page 16: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

Agir pour aplatir la courbe

d’après US-CDC, 2017 (pour une pandémie de grippe)

Vague pandémique en l’absence d’intervention

Moindre accélération du nombre de cas

Pic plus faible et moindre tension sur le système de santé

Réduction de la morbi-mortalité

Vague pandémique avec intervention

Temps depuis le premier cas

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Page 17: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

Notion de pics et de plateaux

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Page 18: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

Risque de nouvelles vagues

Miller M et al. NEJM, 2009 18

Page 19: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

Le déconfinement

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Page 20: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

Déconfinement : les préalables1. Pourquoi le confinement ?

a. Suppression de la pandémieb. Eviter l’engorgement des hôpitaux

2. Quand déconfiner ?a. Pas durant le plateaub. À la décrue

3. Y-aura-t-il un freinage estival ?a. Oui, puissantb. Oui, limitéc. Non

4. Quel niveau d’immunité protectrice dans la population ?a. Immunité grégaire (70% de la populaition)b. Immunité faible (10-15%)c. Situation hétérogène

5. Quel risque de flambée épidémique lors du déconfinementa. Haut risque : pas de frein saisonnier ou immunité faibleb. Faible risque : frein saisonnier puissant ou immunité grégaire atteinte et générale

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Page 21: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

Déconfinement : les options

Mesures temporaires individuelles– Masques de protection– Lavage des mains– Mouchage dans le coude, mouchoirs jetables– Antiviraux

Mesures à long terme– Vaccins

Distance sociale personnalisée– Testing de masse, Tracing exhaustif– Isolement et séparation après exposition

Confinement +/- strict– Fermeture des écoles, des universités,– interdiction des rassemblements– Limitation des déplacements– Cordons sanitaires

Mesures temporaires individuelles

– Antiviraux– Antitussifs ?

R-eff = 0,4 = 4% x 2 pers x 5 jours

< 1R-eff

R-eff = 0,5 = 1% x 10 pers x 5 jours 21

Page 22: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

SARS-CoV-2 TestingRT-PCR

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Page 23: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

Contact tracing

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Page 24: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

Isolation/quarantaine

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Page 25: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

https://www.pepp-pt.org/ https://actu.epfl.ch/search/ic/

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Page 26: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

Conclusions• Le risque est élevé de nouvelles vagues pandémiques• Rappel à propos de la Chine : un régime autoritaire et violent

• Le confinement strict est une «invention» chinoise• Les pays de langue française regroupe parmi les plus anciennes

démocraties du monde • Les droits de l’homme sont au cœur de nos valeurs

• L’enjeu est de concilier valeurs démocratiques et humanistes et lutte efficace contre la pandémie

• Le recours aux technologies de l’information doit se faire dans le respect le plus strict des règles de confidentialité et de respect de la personne (PEPP-PT ou dp3t ?)

• Il sera probablement nécessaire de combiner, sans dogme, certaines mesures de confinement, le port de masques, lavage des mains et des mesures de distanciation sociale personnalisées 26

Page 27: Le point sur l’épidémiologie du COVID-19 - AUF

Twitter: @Flahault

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