neuroenergetics: modeling brain cell metabolic phenotypes

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Neuroenergetics: Modeling brain cell metabolic phenotypes lving biological problems that require Math Project supervised by: Luc Pellerin Aitana Morton de Lachapelle

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Neuroenergetics: Modeling brain cell metabolic phenotypes. “Solving biological problems that require Maths” Project supervised by: Luc Pellerin Aitana Morton de Lachapelle. Plan général du projet. Introduction à la neuroénergétique - rôle du glucose - rôle du lactate Buts du projet - PowerPoint PPT Presentation

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Page 1: Neuroenergetics: Modeling brain cell metabolic phenotypes

Neuroenergetics: Modeling brain cell metabolic

phenotypes“Solving biological problems that require Maths”

Project supervised by:Luc Pellerin

Aitana Morton de Lachapelle

Page 2: Neuroenergetics: Modeling brain cell metabolic phenotypes

Plan général du projet

• Introduction à la neuroénergétique- rôle du glucose

- rôle du lactate

• Buts du projet- reproduire les résultats dans Barros et al. sur le rôle du transport

du glucose- modélisation de profils métaboliques différents (neurone vs

astrocyte)- rôle du transport de lactate pour le métabolisme des neurones

• Outils mathématiques- équations différentielles ordinaires- Matlab

Page 3: Neuroenergetics: Modeling brain cell metabolic phenotypes

NEURONNEURON ASTROCYTEASTROCYTE CAPILLARYCAPILLARY

Glucose

Glucose

GlutamineGlutamine

GlutamateGlutamate

Glucose

GlycolysisGlycolysis

Lactate

Pyruvate

ATP

GlutamineGlutamine

GlutamateGlutamate

GlutamateGlutamate

Lactate

Pyruvate

GlycolysisGlycolysis

Glucose transporterGLUT-1 in capillaries and in astrocytesGLUT-3 in neurons

Monocarboxylate transporterMCT1 in astrocytesMCT2 in neurons

Glutamine transporterSN-1 System N transporter 1 in astrocytesSAT Sodium-dependent aminoacid transporter in neuronsGlutamate transporterEAAT (excitatory aminoacid trasporter) in astrocytes

ATP

Astrocyte-Neuron Lactate ShuttleAstrocyte-Neuron Lactate Shuttle

Page 4: Neuroenergetics: Modeling brain cell metabolic phenotypes

Plan général du projet

• Introduction à la neuroénergétique- rôle du glucose

- rôle du lactate

• Buts du projet- reproduire les résultats dans Barros et al. sur le rôle du transport

du glucose- modélisation de profils métaboliques différents (neurone vs

astrocyte)- rôle du transport de lactate pour le métabolisme des neurones

• Outils mathématiques- équations différentielles ordinaires- Matlab

Page 5: Neuroenergetics: Modeling brain cell metabolic phenotypes

Barros et al. (2005) TINS 28:117-119Barros et al. (2005) TINS 28:117-119

RRôôle du transport du glucose pour son utilisation par les cellulesle du transport du glucose pour son utilisation par les cellules

Page 6: Neuroenergetics: Modeling brain cell metabolic phenotypes

Modélisation de phénotypes métaboliques différentsModélisation de phénotypes métaboliques différentsNeurone vs AstrocyteNeurone vs Astrocyte

Page 7: Neuroenergetics: Modeling brain cell metabolic phenotypes

Plan général du projet

• Introduction à la neuroénergétique- rôle du glucose

- rôle du lactate

• Buts du projet- reproduire les résultats dans Barros et al. sur le rôle du transport

du glucose- modélisation de profils métaboliques différents (neurone vs

astrocyte)- rôle du transport de lactate pour le métabolisme des neurones

• Outils mathématiques- équations différentielles ordinaires- Matlab

Page 8: Neuroenergetics: Modeling brain cell metabolic phenotypes

Outils mathématiques• Une équation différentielle est une relation

entre une ou plusieurs fonctions inconnues et leurs dérivées.

• Les équations différentielles sont utilisées pour construire des modèles mathématiques de phénomènes physiques ou biologiques par ex.

• MATLAB est à la fois un langage de programmation et un environnement de développement utilisé pour le calcul numérique.