Package EnvStatsMay 3, 2018

Type Package

Title Package for Environmental Statistics, Including US EPA Guidance

Version 2.3.0

Date 2017-10-09

Author Steven P. Millard

Maintainer Steven P. Millard

Depends R (>= 3.1)

Imports MASS, ggplot2, nortest

Suggests lattice, qcc, sp, boot

Description Graphical and statistical analyses of environmental data, withfocus on analyzing chemical concentrations and physical parameters, usually inthe context of mandated environmental monitoring. Major environmentalstatistical methods found in the literature and regulatory guidance documents,with extensive help that explains what these methods do, how to use them,and where to find them in the literature. Numerous built-in data sets fromregulatory guidance documents and environmental statistics literature. Includesscripts reproducing analyses presented in the book ``EnvStats: An R Package forEnvironmental Statistics'' (Millard, 2013, Springer, ISBN 978-1-4614-8455-4,).

License GPL (>= 3)

URL http://www.probstatinfo.com

LazyLoad yes

LazyData yes

NeedsCompilation no

Repository CRAN

Date/Publication 2017-10-09 22:35:30 UTC

1

http://www.probstatinfo.com

2 R topics documented:

R topics documented:EnvStats-package . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10ACE.13.TCE.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15anovaPE . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16aovN . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 18aovPower . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21base . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 26Benthic.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27boxcox . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30boxcox.object . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 39boxcoxCensored . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 42boxcoxCensored.object . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 51boxcoxLm.object . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55boxcoxTransform . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 57calibrate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61calibrate.object . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64CastilloAndHadi1994 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66cdfCompare . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 68cdfCompareCensored . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 73cdfPlot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 82chenTTest . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85Chi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91ciBinomHalfWidth . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 93ciBinomN . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 99ciNormHalfWidth . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 107ciNormN . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 111ciNparConfLevel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115ciNparN . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 119ciTableMean . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121ciTableProp . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128cv . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132detectionLimitCalibrate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 135distChoose . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139distChoose.object . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151distChooseCensored . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154distChooseCensored.object . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 168Distribution.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172ebeta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 180ebinom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 183ecdfPlot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 190ecdfPlotCensored . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 194eevd . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 199eexp . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 205egamma . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 208egammaAltCensored . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 218egammaCensored . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 227egeom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 236

R topics documented: 3

egevd . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 238ehyper . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 245elnorm . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 248elnorm3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 250elnormAlt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 263elnormAltCensored . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 275elnormCensored . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 293elogis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 302Empirical . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 306enbinom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 311enorm . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 314enormCensored . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 318enparCensored . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 339Environmental . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 349EPA.02d.Ex.2.ug.per.L.vec . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 350EPA.02d.Ex.4.mg.per.kg.vec . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 351EPA.02d.Ex.6.mg.per.kg.vec . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 351EPA.02d.Ex.9.mg.per.L.vec . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 352EPA.09.Ex.10.1.nickel.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 352EPA.09.Ex.11.1.arsenic.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 353EPA.09.Ex.12.1.ccl4.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 354EPA.09.Ex.12.4.naphthalene.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 354EPA.09.Ex.13.1.iron.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 355EPA.09.Ex.14.1.manganese.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 356EPA.09.Ex.14.3.alkalinity.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 357EPA.09.Ex.14.4.arsenic.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 357EPA.09.Ex.14.8.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 358EPA.09.Ex.15.1.manganese.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 359EPA.09.Ex.16.1.sulfate.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 360EPA.09.Ex.16.2.benzene.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 360EPA.09.Ex.16.4.copper.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 361EPA.09.Ex.16.5.PCE.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 362EPA.09.Ex.17.1.loglead.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 363EPA.09.Ex.17.2.toluene.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 363EPA.09.Ex.17.3.chrysene.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 364EPA.09.Ex.17.3.log.chrysene.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 365EPA.09.Ex.17.4.copper.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 366EPA.09.Ex.17.5.chloride.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 366EPA.09.Ex.17.6.sulfate.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 367EPA.09.Ex.17.7.sodium.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 368EPA.09.Ex.18.1.arsenic.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 369EPA.09.Ex.18.2.chrysene.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 369EPA.09.Ex.18.3.TCE.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 370EPA.09.Ex.18.4.xylene.df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .