s · web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836...

of 31 /31
S. aureus 5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209 2194 2193 2209 2212 2191 2213 2213 2231 2210 2212 2231 2230 2213 2230 2232 2253 2232 2232 2254 2253 2230 2252 2254 2281 2254 2254 2281 2269 2252 2269 2272 2299 2282 2281 2299 2280 2298 2280 2281 2319 2300 2300 2320 2299 2319 2298 2299 2339 2320 2320 2338 2320 2339 2320 2320 2417 2418 2339 2418 2339 2357 2339 2338 2629 2632 2419 2629 2417 2627 2357 2419 2677 2677 2630 2668 2628 2676 2627 2629 2973 2974 2678 2974 2666 2992 2676 2678 3039 3040 2995 3001 2973 3001 2992 2964 4301 4303 3001 3040 3000 3038 3001 3001 4523 4522 3040 4302 3038 4299 3038 3040 5028 5030 4302 4523 4299 4523 4299 4302 5505 5505 4522 5029 4523 5029 4523 4523 5520 6887 5029 5508 5029 5505 5029 5029 6887 9625 5506 6890 5504 5519 5504 5506 9620 5508 9623 5518 6890 5520 5508 6886 6889 9618 6892 6887 9623 9618 9617 9622

Author: others

Post on 05-Jan-2020

4 views

Category:

Documents


0 download

Embed Size (px)

TRANSCRIPT

S

S. aureus

5006167

5011449

5022466

5103096

5115449

5118630

5119616

5119851

836

836

836

836

836

835

835

835

859

859

859

859

859

859

859

859

965

965

965

965

964

965

964

964

2193

2209

2194

2193

2209

2212

2191

2213

2213

2231

2210

2212

2231

2230

2213

2230

2232

2253

2232

2232

2254

2253

2230

2252

2254

2281

2254

2254

2281

2269

2252

2269

2272

2299

2282

2281

2299

2280

2298

2280

2281

2319

2300

2300

2320

2299

2319

2298

2299

2339

2320

2320

2338

2320

2339

2320

2320

2417

2418

2339

2418

2339

2357

2339

2338

2629

2632

2419

2629

2417

2627

2357

2419

2677

2677

2630

2668

2628

2676

2627

2629

2973

2974

2678

2974

2666

2992

2676

2678

3039

3040

2995

3001

2973

3001

2992

2964

4301

4303

3001

3040

3000

3038

3001

3001

4523

4522

3040

4302

3038

4299

3038

3040

5028

5030

4302

4523

4299

4523

4299

4302

5505

5505

4522

5029

4523

5029

4523

4523

5520

6887

5029

5508

5029

5505

5029

5029

6887

9625

5506

6890

5504

5519

5504

5506

9620

5508

9623

5518

6890

5520

5508

6886

6889

9618

6892

6887

9623

9618

9617

9622

S. aureus

5120759

5138847

6002164

6002196

6002348

6107124

6107130

835

836

836

836

836

836

836

859

859

860

859

860

859

859

964

965

965

965

965

965

965

2191

2194

2193

2192

2214

2192

2192

2214

2211

2213

2213

2232

2209

2211

2231

2232

2232

2232

2254

2231

2232

2253

2255

2254

2254

2281

2254

2254

2280

2282

2281

2281

2299

2280

2281

2298

2300

2300

2299

2320

2299

2299

2319

2321

2339

2320

2339

2320

2320

2338

2340

2418

2339

2419

2339

2338

2417

2419

2630

2418

2629

2418

2418

2628

2631

2678

2629

2678

2629

2630

2677

2679

2964

2678

2964

2678

2668

2963

2965

3002

2964

3001

2974

2974

3000

3003

3040

3001

3040

4302

3001

3039

3041

4303

3040

4303

4522

3040

4300

4304

4522

4302

4523

5029

4302

4523

4523

5030

4523

5030

5507

4523

5028

5032

5507

5029

5507

5508

5028

5519

5524

5508

5506

5508

6889

5507

6888

6888

6887

5508

6889

9623

5508

9619

9626

9625

6889

9623

6889

9623

9623

S. aureus

6107365

6107551

6108170

6105207

6108208

6108222

835

836

836

836

836

835

859

859

859

859

859

859

965

965

965

965

964

964

2192

2215

2213

2193

2193

2192

2209

2231

2232

2210

2210

2210

2231

2254

2254

2232

2231

2230

2253

2270

2281

2254

2253

2252

2280

2281

2300

2281

2281

2280

2299

2300

2320

2300

2299

2298

2319

2320

2339

2321

2319

2319

2339

2338

2359

2339

2338

2339

2417

2358

2630

2359

2359

2358

2629

2630

2678

2630

2629

2628

2677

2678

2974

2678

2677

2676

2992

2974

3040

2994

2973

2992

3000

3039

4303

3001

3001

3000

3039

4302

4522

3040

3040

3040

4300

4523

5029

4303

4301

4300

4523

5029

5506

4522

4523

4523

5029

5508

5508

5030

5028

5029

5504

6889

6889

5506

5505

5504

5519

9622

9623

5508

5521

5519

6889

6889

6890

6887

9618

9624

9623

9618

S. aureus

6002356

6002568

6108455

6108456

6108864

6109526

837

836

837

837

837

837

854

853

853

854

854

853

966

966

966

967

966

966

2195

2194

2196

2196

2216

2216

2217

2216

2217

2217

2234

2234

2233

2233

2234

2234

2256

2256

2256

2255

2256

2256

2284

2284

2283

2282

2284

2284

2303

2302

2302

2301

2302

2302

2322

2322

2322

2321

2323

2322

2341

2341

2340

2340

2341

2341

2362

2362

2361

2361

2361

2362

2633

2631

2631

2630

2632

2632

2676

2680

2670

2669

2675

2675

2978

2977

2996

2976

2976

2968

3005

3004

3003

3041

3042

3004

3043

3042

3042

4303

4305

3043

4306

4305

4305

4523

4525

4306

4526

4525

4524

5031

5033

4525

5035

5033

5033

5509

5510

5034

5507

5510

5510

5524

5526

5511

6892

5526

5526

6889

6890

5527

9631

6890

6890

9627

9628

6892

9629

9628

9631

S. aureus

6109976

6109981

6110369

6111646

6100468

6111646

837

836

837

813

1492

813

855

853

853

833

1765

833

966

966

966

850

1845

850

2195

2194

2196

856

2149

856

2214

2217

2214

1252

2163

1252

2233

2234

2235

1689

2207

1689

2256

2255

2252

1764

2230

1764

2283

2283

2265

1782

2251

1782

2301

2321

2284

1802

2280

1802

2321

2340

2321

2190

2298

2190

2340

2360

2341

2230

2320

2211

2361

2631

2362

2280

2339

2230

2631

2678

2632

2299

2628

2280

2670

2976

2675

2319

2677

2299

2987

3003

2967

2334

2765

2319

3003

3041

3005

2626

2963

2334

3041

4305

3038

2646

3001

2573

4304

4524

4305

2676

3039

2626

4524

5032

4525

3001

3137

2646

5032

5510

5033

3039

4482

2676

5510

5526

5511

3436

4522

3001

6890

6892

5527

4480

5508

3039

9628

9632

6890

4523

6891

3436

9628

5028

4480

5508

4523

5558

5028

6550

5508

6887

5558

6924

6550

6887

6924

7024

S. aureus

6000039

5127126

5227145

5020883

5020914

5021036

1306

2071

661

1493

1493

1493

1786

2089

712

1765

1765

1766

1846

2158

743

1783

1783

1783

2063

2172

766

2166

2164

2165

2208

2183

805

2192

2192

2193

2230

2200

822

2210

2210

2211

2280

2215

859

2231

2231

2234

2298

2235

866

2252

2252

2253

2320

2260

881

2280

2280

2281

2342

2285

972

2298

2298

2299

2417

2301

1775

2319

2320

2319

2617

2324

1793

2339

2338

2339

2629

2342

2200

2600

2600

2600

2667

2426

2235

2629

2629

2677

2765

2443

2290

2958

2958

2960

3001

2586

2308

2963

2963

2964

4482

2593

2339

3001

3001

3003

4523

2609

2342

3039

3039

3041

5510

2621

2678

3138

3138

3139

5526

2638

2983

3436

3438

3439

6892

2653

3010

4482

4482

4484

2676

3049

4522

4523

4524

2774

4525

5030

5031

5034

3010

5509

5508

5509

5507

3043

5571

6552

6554

6556

4310

6893

6889

6890

6893

4489

6935

7030

7027

7030

4524

5036

5510

5530

6893

S. aureus

5020316

5020624

5020626

5169478

5169479

20914

1766

1767

1766

1766

1766

1505

1784

1783

1783

1783

1783

1508

2223

2193

2192

2223

2223

1555

2243

2223

2223

2235

2235

1556

2263

2235

2235

2262

2262

1557

2281

2262

2263

2281

2281

1559

2299

2282

2281

2299

2299

2202

2319

2299

2299

2339

2340

2213

2629

2340

2341

2629

2629

2236

2864

2678

2629

2863

2863

2251

2959

2863

2863

2960

2959

2286

2995

2960

2959

2964

2966

2301

3002

2995

2995

3002

3002

2320

3041

3002

3001

3040

3040

2340

3439

3041

3041

3438

3438

2343

3505

3439

3439

3505

3504

2633

4304

3506

3505

4304

4303

2679

4523

4304

4304

5032

5031

2757

5032

5032

5032

5510

5525

2968

5510

5510

5510

5663

5663

3006

5662

5662

5662

6554

6554

3039

6556

6555

6555

6820

6891

3042

6893

6893

6821

6892

6929

3044

6930

6929

6892

6929

7028

3060

7029

7029

6931

7028

9632

3159

9637

9635

7029

9634

3442

9635

3508

4307

4488

4524

4816

5509

5530

5938

6431

6560

6621

6853

6880

6893

7032

8903

9641

S. aureus

14st1

10st2

15st3

20st4

21st5

23st6

2067

2047

2062

2067

2065

2048

2170

2066

2135

2138

2134

2139

2197

2136

2210

2198

2195

2215

2215

2197

2232

2213

2212

2235

2239

2213

2248

2232

2234

2285

2258

2236

2283

2286

2283

2305

2285

2256

2298

2303

2301

2319

2303

2285

2320

2321

2323

2340

2320

2303

2336

2581

2342

2678

2423

2319

2343

2595

2543

2753

2439

2421

2591

2608

2577

2823

2499

2577

2631

2635

2591

2965

2544

2593

2750

2651

2616

2984

2567

2633

2758

2753

2631

3011

2578

2650

2806

2760

2647

3025

2593

2751

2821

2824

2673

3038

2606

2808

2960

2879

2768

3056

2634

2822

2978

2966

2821

3189

2715

2866

3003

2990

2868

3210

2768

2979

3039

3005

2978

3446

2822

3006

3051

3024

3004

3510

2869

3039

3208

3040

3019

3523

2966

3279

3278

3056

3039

3641

2979

3441

3441

3280

3278

3666

3042

3493

3494

3444

3442

3895

3143

3508

3507

3510

3507

4310

3442

3639

3636

3525

3638

4446

3510

3665

3664

3641

3891

4463

3522

3965

3963

3895

3982

4491

3641

4122

3979

3984

4176

4526

3985

4177

4121

4179

4192

4820

4178

4193

4176

4196

4306

5038

4198

4307

4192

4309

4486

5174

4308

4487

4305

4489

4526

5308

4441

4525

4349

4819

4815

5509

4463

4879

4649

4827

5034

5668

4490

5509

4877

5039

5305

5881

4528

5564

5033

5510

5510

6365

4883

6248

5506

5531

5564

6430

5035

6428

5561

5569

5663

6561

5508

6557

5662

5668

6357

6624

5570

6618

6424

6016

6426

6855

6556

6877

6593

6431

6555

6892

6616

6893

6614

6560

6616

6990

6893

7030

6844

6621

6847

7034

6931

9632

6890

6893

6891

7171

7031

9660

6928

6936

6930

8906

9663

7024

7033

7027

9641

8151

8160

7571

9774

9636

9634

10120

9664

S. aureus

24st7

25st8

114456

129817

150456

81820

2064

2066

2067

2170

2210

2066

2135

2137

2138

2215

2232

2085

2197

2198

2198

2235

2248

2136

2285

2215

2213

2258

2283

2197

2301

2235

2235

2287

2298

2213

2320

2286

2286

2303

2320

2236

2341

2304

2303

2320

2591

2285

2575

2321

2321

2423

2750

2303

2592

2514

2344

2606

2758

2319

2633

2580

2595

2634

2806

2593

2649

2595

2635

2869

2821

2633

2749

2635

2651

2979

2978

2650

2759

2651

2824

3005

3003

2751

2821

2753

2869

3042

3039

2822

2864

2761

3005

3442

3051

2962

2978

2824

3024

4425

3278

2969

3005

2966

3040

4490

3441

3006

3021

2980

3056

5511

3507

3039

3038

3023

3444

6893

3664

3279

3053

3039

3510

3963

3441

3274

3055

3895

4121

3508

3441

3211

4309

4176

3665

3507

3280

5039

4192

3965

3519

3296

5511

4305

4177

3637

3445

5531

4649

4193

4176

3510

5668

4877

4307

4192

3524

6016

5033

4487

4306

3641

6431

5509

4527

4815

3667

6560

5561

4879

4829

3984

6621

5662

5509

5034

4180

6893

6424

5564

5511

4195

6936

6593

6557

5527

4308

7033

6614

6618

5566

4424

6844

6877

5664

4489

6890

6893

6012

4818

6928

7030

6427

4832

7024

9632

6556

5038

9660

6616

5511

6848

5531

6876

5668

6893

5939

6931

6430

7001

6600

7029

6621

7044

6895

8156

7031

8897

8159

9633

9635

9661

9663

S. aureus

6108207

6022466

5062476

5108457

5002174

5108325

1495

1768

1495

1135

1135

1134

1693

2194

1693

1495

1145

1494

1768

2210

1768

1848

1495

1692

1849

2232

1849

2165

1694

1767

2193

2254

2165

2213

1768

1848

2210

2282

2193

2213

1849

2192

2232

2300

2210

2232

2165

2209

2254

2320

2254

2254

2193

2210

2281

2339

2281

2281

2213

2230

2300

2418

2300

2299

2232

2252

2321

2436

2321

2320

2254

2280

2339

2541

2339

2339

2281

2298

2418

2650

2418

2418

2300

2319

2436

2679

2436

2436

2320

2339

2541

2718

2541

2541

2339

2417

2602

2817

2602

2602

2418

2435

2613

2964

2613

2629

2436

2539

2630

3040

2630

2668

2541

2600

2651

3139

2651

2709

2602

2612

2668

3439

2668

2766

2613

2628

2710

4303

2710

2964

2630

2648

2767

4522

2767

3040

2668

2666

2954

4560

2964

3138

2710

2708

2986

5030

2986

4302

2767

2765

3002

5301

3002

4481

2994

2972

3041

5509

3041

4523

2986

2981

3139

6422

3139

5029

3021

3000

4303

6551

4303

5508

3040

3038

4482

6843

4482

6889

3138

3136

4522

6871

4522

9623

4303

4300

5030

6891

5030

4482

4479

5508

6925

5508

4522

4523

6590

7023

6590

5030

5030

6870

9625

6870

5508

5509

6893

6890

6591

6889

7023

7023

6844

9618

9624

9624

6871

9652

9652

6887

6925

7023

9625

S. aureus

5123568

5102587

5236589

6110379

6111746

1766

1767

1494

1770

1252

1847

1848

1848

2196

1689

2191

2192

2193

2214

1764

2213

2209

2209

2235

1782

2230

2231

2210

2256

1802

2252

2253

2231

2284

1821

2269

2280

2253

2302

2190

2280

2299

2281

2321

2211

2298

2319

2299

2341

2230

2320

2339

2319

2632

2281

2339

2417

2338

2647

2299

2416

2435

2417

2670

2319

2435

2540

2435

2963

2340

2539

2600

2540

2977

2537

2599

2611

2601

3005

2573

2627

2629

2612

3020

2626

2649

2667

2629

3038

2646

2676

2709

2677

3441

2674

2707

2765

2719

3508

3039

2764

2962

2766

4305

3436

2972

2982

2963

4486

4480

3001

3000

2983

5033

4523

3021

3039

3001

5507

5028

3038

3137

3039

5563

5508

3136

4300

3137

6594

5558

4299

4479

4301

6616

6550

4478

4523

4480

6890

6815

4523

5509

5031

6928

6889

5510

6587

5508

7027

6924

6892

6839

6890

9628

7024

9617

6867

9623

9656

6888

6921

7019

9618

9646

S. caprae S. cohni urealyticum

CIP 104000

CIP 104520

CIP 104024

CIP 104025

1004

1001

2072

1060

1019

1016

2094

1079

2640

1039

2111

1098

2660

2412

2133

1102

2678

2550

2149

1117

2715

2589

2417

1139

2918

2639

2418

1177

2954

2661

4477

1324

5211

2678

6071

1341

5259

2698

6537

1357

7040

2715

6581

1361

2917

1381

2955

1395

5214

1419

7042

1438

2072

2095

2111

2130

2399

2438

4263

4895

6081

6101

6118

6139

6157

6217

6388

6544

6563

6581

S. epidermidis

LL1

LL2

LL3

LL4

LL5

LL6

LL7

LL8

LL9

LL10

LL11

LL12

1911

1041

2036

3344

2843

2420

5121

2841

3343

1234

3349

3344

2057

1234

2653

4298

2855

2458

5262

3345

5119

3344

3349

4298

2841

1577

2803

4678

3346

2842

5346

4299

5256

4298

4292

5119

3338

2419

2841

5120

4678

2855

6688

5120

5346

5120

5122

5257

5115

2458

2855

5251

5122

3345

6725

5261

6688

5262

5264

5346

5256

2842

3346

5345

5264

5122

6827

5347

6725

5345

5346

5394

5341

2853

3749

6688

5346

5264

6688

6826

6689

6688

6459

5888

2879

4679

6725

5397

5345

6726

6725

6726

6688

6582

3344

5122

6825

6462

5396

6827

6825

6824

6725

6684

4299

5263

6688

6591

6825

6722

4678

5345

6725

6688

6820

5262

5396

6828

6726

8237

5346

6462

6828

8702

5395

6688

6588

6828

6688

6724

6825

S. epidermidis

LL13

LL14

LL15

LL16

CC4

ALA4

abm1

abm2

abm3

abm4

AMT1

AMT2

2242

2246

3342

2841

2623

2494

1310

1151

2887

1151

1487

1486

2838

2840

5117

2854

2663

2652

1442

2840

3339

2837

1517

1516

3342

3343

5254

3343

4301

2671

1683

3341

3743

2881

2203

2213

3748

3746

5343

5119

5122

2691

2191

4296

4900

3338

2418

2417

5345

5119

6455

5260

5255

2841

2297

4901

5117

4293

2457

2437

5532

5261

6686

5345

5344

2856

2630

5054

5344

4898

2554

2456

6689

5345

6723

6671

6462

3344

2839

5345

6672

5342

2593

2841

6725

6457

6822

6688

6688

5121

3332

6688

6686

6686

2752

2853

6934

6688

6725

6726

5253

4284

6725

6724

6724

2842

2876

6726

6824

6829

5344

4888

6827

6825

6823

2854

4901

6590

4926

9634

3344

5345

6674

5295

9662

4903

6688

6689

5332

5119

6726

6725

5343

5346

6826

6826

6388

6688

6659

6725

6685

6826

6815

6832

7542

S. epidermidis

AMT3

AMT4

AMT5

AMT6

AMT7

mej1

mej2

dja

far1

boc

faua1

1041

1486

1041

1797

2214

3341

3339

1636

2644

1523

1036

1488

1516

1458

2214

2419

4294

5116

3336

3335

1638

1159

1518

2201

1487

2419

2436

4899

5248

5113

4290

3341

1273

2215

2212

1501

2436

2457

5115

5343

5244

4670

5119

1273

2252

2417

1518

2457

2493

5341

6672

5339

5113

5251

1442

2420

2435

1531

2493

2854

6684

6688

6683

5245

5345

1525

2438

2457

1560

2840

2870

6720

6725

6721

5339

5479

1527

2458

2841

2173

2870

2889

6823

6823

6817

6666

6674

1551

2835

2853

2203

3345

4680

9657

6683

6688

1555

2889

2880

2215

4679

5345

6817

6725

1558

4680

3343

2233

4906

6689

6826

1565

4905

4903

2420

5345

6725

1569

5345

5345

2436

6688

1681

6678

6688

2459

6725

2010

6688

6826

2841

2413

6726

2855

2426

2889

2430

2919

2833

3345

2842

4680

2847

4905

2876

5345

2880

6688

3339

6725

3339

6829

3743

4292

4679

4899

5000

5116

5343

6688

6827

S. epidermidis

faua2

rem

yos1

yos2

yos3

sec2

sec3

omz1

omz4

ban1

bem1

bem2

1457

1033

3341

2648

1036

3339

3339

3340

3340

2837

1441

2839

1487

1427

4294

2850

1572

5116

5117

3743

3744

2877

2483

2877

1517

1440

5340

5345

1688

5249

5249

4295

4295

3337

2836

3342

2172

1468

6683

6689

2648

5343

5344

5115

5118

5114

2878

5119

2203

1555

6817

6826

2851

6508

6508

5342

5344

5340

2883

5345

2214

1567

3341

6687

6672

6684

6673

6668

3332

6674

2418

2640

4296

6725

6688

6719

6688

6684

5336

6688

2457

2679

4674

6824

6726

6820

6725

6723

6120

6725

2554

2830

5345

6824

6827

6820

6655

6826

2593

2835

6689

6684

2752

2836

6727

6725

2842

2875

6825

6809

2854

2880

2888

3335

3344

3736

4903

3774

5119

4286

5345

4663

6673

5108

6687

5240

6727

5338

6826

5370

6390

6576

6684

6722

6748

6813

9614

9643

S. epidermidis

bem3

bem5

mah1

mah2

mah3

mah4

mah5

mal1

mal2

mal3

mal4

dew2

2838

1035

1448

2837

2842

3337

2643

3338

2410

1036

2415

1039

2883

1451

1563

3339

3338

4293

2835

4293

3337

3339

3340

3340

3340

2137

3338

4294

5116

5115

2845

4897

4898

4900

4900

4899

5053

2837

4294

5116

5252

5342

3337

5114

5115

5117

5117

5115

5344

2882

5116

5254

5342

6670

5115

5340

5341

5344

5344

5342

6687

3340

5248

5342

6671

6688

5250

6665

6670

6688

6673

6685

6725

3742

5342

6402

6687

6725

5342

6682

6686

6726

6689

6723

6825

4295

6671

6688

6725

6824

6688

6818

6823

6824

6725

6820

5117

6686

6725

6824

6724

8232

8242

8243

6825

5344

6724

6823

6824

8697

8708

8709

6586

6821

6686

6725

6825

9635

9663

S. epidermidis

blf1

blf2

blf3

guc1

guc2

taj1

gau1

gau2

gau3

gau4

gau5

faa1

1032

1037

3340

3343

1441

1033

1439

1131

1156

1449

1165

3339

2134

1452

4900

5117

1556

1226

1516

1146

1271

1563

1280

4293

3337

2138

5118

5249

2647

1524

1631

1163

1325

3341

1334

5116

3740

3341

5344

5343

2836

1553

5345

1264

1439

5117

1449

5250

4898

4901

6589

6584

2850

2836

6685

1278

1554

5342

1563

5312

5115

5118

6673

6669

3337

3337

1333

1567

6686

1732

5342

5341

5344

6689

6685

3742

3740

1416

1681

6822

1847

6401

6585

6689

6725

6820

5116

5115

1428

1723

3341

6671

6686

6826

6825

5248

5341

1431

1837

5343

6686

6723

5343

6585

1447

2840

6671

6724

6823

6588

6686

1547

3333

6686

6827

6673

6724

1561

5109

6725

6844

6688

6825

1730

5335

6822

7556

6823

1830

6663

9216

1845

6680

2014

6717

2130

6816

3339

5116

5342

6670

6687

6725

6821

S. epidermidis

ves2

ves4

ves5

ves6

fes2

fes3

lem1

lem2

lea1

lea2

3336

2490

1035

3339

2414

1166

3337

2834

2485

2646

5114

2648

2490

4294

3339

1449

4293

3337

2549

2685

5341

2797

2648

5116

4899

1563

5116

3741

2645

2843

6585

2839

2798

5343

5116

1734

5342

4293

2841

3340

6669

2849

2838

6671

5342

3343

6688

5116

3338

3743

6686

2888

2849

6687

6671

4900

6724

5342

4294

4671

6823

3342

2871

6824

6688

5117

6825

6688

4672

5118

9664

3745

2889

6725

5343

6825

5117

5251

4297

3340

6824

6688

5249

5345

4674

3744

8708

6824

5343

6460

5120

4296

8708

6585

6674

5345

4674

6672

6688

6688

5118

6689

6726

6726

5309

6824

6827

6820

5345

9638

8101

9667

6588

9666

9639

6673

9665

6689

6727

6826

9638

9666

S. haemolyticus

ALA1

ban2

ban3

ban4

ban5

ban6

rib2

1668

2236

1016

1267

1321

2236

2492

1725

3443

1030

1695

2259

3445

3441

2256

4481

1045

1949

2496

3922

4478

2273

4613

1071

4481

3445

4296

4610

2296

4999

1109

4613

3922

4467

4940

2494

5134

1126

4999

4295

4484

4981

4481

6471

1137

5134

4483

4616

4999

4583

6877

1157

6471

4617

4986

5039

4593

6894

1271

6687

4677

5000

5131

4758

7030

1326

6878

5001

5136

5150

4943

1341

6894

5135

6474

6497

5000

1394

7031

5864

6882

6894

5042

1443

9003

5940

6895

6895

1478

6379

7034

1508

6473

9009

1556

6787

1580

6881

1693

6895

1708

7034

1724

9007

1840

9710

1897

1932

1946

2012

2033

2126

2223

2232

2257

2274

2295

2313

3130

3918

4292

4479

4515

4612

4672

4998

5136

6469

6895

7030

S. haemolyticus

rib3

rib4

rib5

fes1

marn1

marn2

CIP 104114

1324

2255

2491

1131

4477

1444

4474

1723

2490

4292

1267

4996

4477

4976

2255

4982

4480

1334

5038

4938

4995

2492

4998

4612

1363

5130

4995

5013

4989

5131

4941

2254

6892

5016

5030

5004

6895

4998

2259

5036

5125

5138

5131

2295

5129

6886

6900

6894

2737

6891

4293

4478

4611

4997

5040

5136

6470

6893

9000

S. hominis hominisS. hominis novobiosepticusS. pasteuri

CIP 104689

CIP 8157

CIP 105719

CIP 103830

CIP 103832

CIP 103540

1134

1136

1135

2174

2172

2178

1147

1236

1153

2212

2211

2216

1150

1257

2493

2349

2347

2353

1171

1317

2532

2372

2389

2376

1185

1356

2649

2391

2428

2395

1216

1394

2818

2412

2780

2417

1232

2428

2835

2430

2802

2434

1255

2447

2856

2592

2819

2471

1269

2644

2874

2781

2840

2597

1315

2836

4696

2804

2861

2786

1338

3677

4915

2820

2884

2808

1354

4560

5224

2843

2901

2825

1392

4598

6479

2863

2920

2847

1434

4691

2886

2938

2867

2277

4730

2902

4525

2890

2316

5219

2922

2906

2836

5257

2939

2927

4564

5350

4523

2945

4695

6472

4531

4733

6492

5222

6510

5261

6602

5355

6640

6440

6478

6497

6516

6611

6649

S. saprophyticus bovis S. saprophyticus saprophyticus S. sciuri sciuri

CIP 105261

CIP 105262

CIP 76125T

CIP 103545

CIP 103583

CIP 105825

CIP 8162

1015

1321

1000

1005

1001

1089

1005

1100

1480

1435

1011

1016

1102

1080

1431

1604

1438

1012

1018

1116

1103

1435

1606

2121

1020

1058

1139

1105

1473

2127

2350

1028

1060

1158

1117

2121

2479

2474

1043

1074

1178

1119

2172

2497

2512

1082

1076

1181

1119

2211

2518

2551

1100

1098

1314

1140

2427

2541

2824

1103

1113

1329

1143

2473

2556

4259

1105

1118

1343

1143

2496

2830

4932

1139

1134

1356

1159

2512

4264

4970

1142

1136

1367

1315

2536

4937

4983

1439

1149

1381

1331

2550

4988

5006

1443

1156

1395

1343

2551

5025

5021

1479

1169

1421

1358

2804

5894

5063

1481

1170

1433

1370

2822

6038

6226

1695

1174

1445

1384

2883

6289

6263

1784

1178

1462

1385

2884

6384

6615

2048

1192

1724

1397

2900

6399

6653

2075

1195

2245

1409

2938

6618

2086

1232

2709

1424

4260

2099

1309

2718

1435

4933

2114

1314

2723

1435

4985

2127

1325

2732

1437

5023

2355

1338

2755

1442

6287

2478

1360

2767

1444

6381

2499

1363

2772

1624

6398

2501

1377

2783

2376

6616

2517

1379

2800

2716

2555

1382

2816

2732

2557

1392

2825

2735

2709

1403

2841

2746

2828

1423

4305

2755

2867

1428

4915

2770

4261

1430

5518

2774

4932

1438

5556

2779

4971

1619

5650

2785

4983

1640

5689

2791

5004

1692

2801

5021

1693

5521

5062

1733

5652

6031

1758

6632

6223

1822

6242

1952

6261

1956

6378

2037

6394

2180

6611

2240

6633

2254

6649

2257

6667

2266

6747

2267

6784

2281

2373

2668

4304

4918

5520

5652

5691

6500

6631

S. warneri

CIP 106511

CIP 8165

CC1

CC2

CC3

del

kho1

kho2

2178

2172

2182

2182

2181

1387

2380

1406

2200

2190

2224

2335

2223

2177

2585

1440

2338

2332

2338

2380

2341

2309

2786

1554

2377

2371

2356

2590

2367

2337

2897

1699

2586

2392

2474

2777

2380

2557

2941

1786

2625

2409

2512

2790

2590

2586

4970

1857

2787

2430

2590

2817

2776

2625

5457

1988

2809

2581

2633

2829

2790

2758

5906

2011

2825

2620

2790

2907

2816

2786

6042

2337

2847

2657

2828

2932

2829

2824

2356

2937

2803

2936

5466

2906

2869

2380

5458

2820

5910

5911

2930

2897

2586

5907

2879

2945

5906

2786

5945

2893

5911

2825

2932

2835

2969

2898

5456

3002

5905

3337

5944

3739

3823

4829

4972

5083

5115

5248

5352

5390

5459

5478

5894

5910

6045

6242

6457

S. xylosus S. lugdunensisS. capitis capitisS. capitis ureolyticus

CIP 103720

CIP 104065

CIP 103584

CIP 103688CIP 104192

2113

1112

2543

2638

6790

2430

1134

2566

2676

6752

2452

1216

2582

5096

6735

2469

1315

2608

2606

6714

2508

1354

2644

2904

5233

2619

1392

2740

6712

5174

4237

1417

2778

2660

5157

4896

1689

2918

2943

5135

4963

2109

3073

5134

5119

6065

2263

4347

2714

5097

6103

2425

4385

2698

5080

6386

2448

4457

6750

1216

6524

2464

4495

5117

6572

2502

4564

6733

6610

2615

4602

2441

2785

4950

2926

3322

5162

4234

5200

4876

7355

4893

7394

4914

4931

4960

5028

6065

6103

6200

6386

6525

6571

6610

S. schleiferi coagulansS. intermedius M. luteus

CIP 104366

CIP 81.60T

CIP A270

999

6731

1134

1096

2129

1134

1110

4274

1323

1113

4793

1325

1131

3785

1340

1313

6769

1342

1352

6242

1356

1353

2113

1357

1375

6750

1379

1393

2151

1393

1412

2810

1417

1434

2811

2473

1484

6868

2474

2128

1112

2632

2168

6717

2751

2169

4314

2790

2264

2087

4330

2302

2167

5249

2527

4830

5471

2621

4311

5509

2813

1046

6247

2841

1437

6269

2853

2089

6286

2856

2164

6430

4270

1089

6431

4845

1153

7390

4867

6342

4883

1324

4905

1000

4922

6807

4942

2587

4960

1073

4977

6791

4999

6785

5016

5844

6396

2772

6678

5300

6717

9633

6753

6766

6786

6804

1096

1110

1113