s · web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836...

31
S. aureus 5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209 2194 2193 2209 2212 2191 2213 2213 2231 2210 2212 2231 2230 2213 2230 2232 2253 2232 2232 2254 2253 2230 2252 2254 2281 2254 2254 2281 2269 2252 2269 2272 2299 2282 2281 2299 2280 2298 2280 2281 2319 2300 2300 2320 2299 2319 2298 2299 2339 2320 2320 2338 2320 2339 2320 2320 2417 2418 2339 2418 2339 2357 2339 2338 2629 2632 2419 2629 2417 2627 2357 2419 2677 2677 2630 2668 2628 2676 2627 2629 2973 2974 2678 2974 2666 2992 2676 2678 3039 3040 2995 3001 2973 3001 2992 2964 4301 4303 3001 3040 3000 3038 3001 3001 4523 4522 3040 4302 3038 4299 3038 3040 5028 5030 4302 4523 4299 4523 4299 4302 5505 5505 4522 5029 4523 5029 4523 4523 5520 6887 5029 5508 5029 5505 5029 5029 6887 9625 5506 6890 5504 5519 5504 5506 9620 5508 9623 5518 6890 5520 5508 6886 6889 9618 6892 6887 9623 9618 9617 9622

Upload: others

Post on 05-Jan-2020

11 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: S · Web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209

S. aureus

5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851836 836 836 836 836 835 835 835859 859 859 859 859 859 859 859965 965 965 965 964 965 964 9642193 2209 2194 2193 2209 2212 2191 22132213 2231 2210 2212 2231 2230 2213 22302232 2253 2232 2232 2254 2253 2230 22522254 2281 2254 2254 2281 2269 2252 22692272 2299 2282 2281 2299 2280 2298 22802281 2319 2300 2300 2320 2299 2319 22982299 2339 2320 2320 2338 2320 2339 23202320 2417 2418 2339 2418 2339 2357 23392338 2629 2632 2419 2629 2417 2627 23572419 2677 2677 2630 2668 2628 2676 26272629 2973 2974 2678 2974 2666 2992 26762678 3039 3040 2995 3001 2973 3001 29922964 4301 4303 3001 3040 3000 3038 30013001 4523 4522 3040 4302 3038 4299 30383040 5028 5030 4302 4523 4299 4523 42994302 5505 5505 4522 5029 4523 5029 45234523 5520 6887 5029 5508 5029 5505 50295029 6887 9625 5506 6890 5504 5519 55045506 9620 5508 9623 5518 6890 55205508 6886 6889 9618 68926887 9623 9618 96179622

Page 2: S · Web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209

S. aureus

5120759 5138847 6002164 6002196 6002348 6107124 6107130835 836 836 836 836 836 836859 859 860 859 860 859 859964 965 965 965 965 965 9652191 2194 2193 2192 2214 2192 21922214 2211 2213 2213 2232 2209 22112231 2232 2232 2232 2254 2231 22322253 2255 2254 2254 2281 2254 22542280 2282 2281 2281 2299 2280 22812298 2300 2300 2299 2320 2299 22992319 2321 2339 2320 2339 2320 23202338 2340 2418 2339 2419 2339 23382417 2419 2630 2418 2629 2418 24182628 2631 2678 2629 2678 2629 26302677 2679 2964 2678 2964 2678 26682963 2965 3002 2964 3001 2974 29743000 3003 3040 3001 3040 4302 30013039 3041 4303 3040 4303 4522 30404300 4304 4522 4302 4523 5029 43024523 4523 5030 4523 5030 5507 45235028 5032 5507 5029 5507 5508 50285519 5524 5508 5506 5508 6889 55076888 6888 6887 5508 6889 9623 55089619 9626 9625 6889 9623 6889

9623 9623

Page 3: S · Web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209

S. aureus

6107365 6107551 6108170 6105207 6108208 6108222835 836 836 836 836 835859 859 859 859 859 859965 965 965 965 964 9642192 2215 2213 2193 2193 21922209 2231 2232 2210 2210 22102231 2254 2254 2232 2231 22302253 2270 2281 2254 2253 22522280 2281 2300 2281 2281 22802299 2300 2320 2300 2299 22982319 2320 2339 2321 2319 23192339 2338 2359 2339 2338 23392417 2358 2630 2359 2359 23582629 2630 2678 2630 2629 26282677 2678 2974 2678 2677 26762992 2974 3040 2994 2973 29923000 3039 4303 3001 3001 30003039 4302 4522 3040 3040 30404300 4523 5029 4303 4301 43004523 5029 5506 4522 4523 45235029 5508 5508 5030 5028 50295504 6889 6889 5506 5505 55045519 9622 9623 5508 5521 55196889 6889 6890 68879618 9624 9623 9618

Page 4: S · Web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209

S. aureus

6002356 6002568 6108455 6108456 6108864 6109526837 836 837 837 837 837854 853 853 854 854 853966 966 966 967 966 9662195 2194 2196 2196 2216 22162217 2216 2217 2217 2234 22342233 2233 2234 2234 2256 22562256 2255 2256 2256 2284 22842283 2282 2284 2284 2303 23022302 2301 2302 2302 2322 23222322 2321 2323 2322 2341 23412340 2340 2341 2341 2362 23622361 2361 2361 2362 2633 26312631 2630 2632 2632 2676 26802670 2669 2675 2675 2978 29772996 2976 2976 2968 3005 30043003 3041 3042 3004 3043 30423042 4303 4305 3043 4306 43054305 4523 4525 4306 4526 45254524 5031 5033 4525 5035 50335033 5509 5510 5034 5507 55105510 5524 5526 5511 6892 55265526 6889 6890 5527 9631 68906890 9627 9628 6892 96299628 9631

Page 5: S · Web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209

S. aureus

6109976 6109981 6110369 6111646 6100468 6111646837 836 837 813 1492 813855 853 853 833 1765 833966 966 966 850 1845 8502195 2194 2196 856 2149 8562214 2217 2214 1252 2163 12522233 2234 2235 1689 2207 16892256 2255 2252 1764 2230 17642283 2283 2265 1782 2251 17822301 2321 2284 1802 2280 18022321 2340 2321 2190 2298 21902340 2360 2341 2230 2320 22112361 2631 2362 2280 2339 22302631 2678 2632 2299 2628 22802670 2976 2675 2319 2677 22992987 3003 2967 2334 2765 23193003 3041 3005 2626 2963 23343041 4305 3038 2646 3001 25734304 4524 4305 2676 3039 26264524 5032 4525 3001 3137 26465032 5510 5033 3039 4482 26765510 5526 5511 3436 4522 30016890 6892 5527 4480 5508 30399628 9632 6890 4523 6891 3436

9628 5028 44805508 45235558 50286550 55086887 55586924 6550

688769247024

Page 6: S · Web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209

S. aureus

6000039 5127126 5227145 5020883 5020914 50210361306 2071 661 1493 1493 14931786 2089 712 1765 1765 17661846 2158 743 1783 1783 17832063 2172 766 2166 2164 21652208 2183 805 2192 2192 21932230 2200 822 2210 2210 22112280 2215 859 2231 2231 22342298 2235 866 2252 2252 22532320 2260 881 2280 2280 22812342 2285 972 2298 2298 22992417 2301 1775 2319 2320 23192617 2324 1793 2339 2338 23392629 2342 2200 2600 2600 26002667 2426 2235 2629 2629 26772765 2443 2290 2958 2958 29603001 2586 2308 2963 2963 29644482 2593 2339 3001 3001 30034523 2609 2342 3039 3039 30415510 2621 2678 3138 3138 31395526 2638 2983 3436 3438 34396892 2653 3010 4482 4482 4484

2676 3049 4522 4523 45242774 4525 5030 5031 50343010 5509 5508 5509 55073043 5571 6552 6554 65564310 6893 6889 6890 68934489 6935 7030 7027 703045245036551055306893

Page 7: S · Web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209

S. aureus

5020316 5020624 5020626 5169478 5169479 209141766 1767 1766 1766 1766 15051784 1783 1783 1783 1783 15082223 2193 2192 2223 2223 15552243 2223 2223 2235 2235 15562263 2235 2235 2262 2262 15572281 2262 2263 2281 2281 15592299 2282 2281 2299 2299 22022319 2299 2299 2339 2340 22132629 2340 2341 2629 2629 22362864 2678 2629 2863 2863 22512959 2863 2863 2960 2959 22862995 2960 2959 2964 2966 23013002 2995 2995 3002 3002 23203041 3002 3001 3040 3040 23403439 3041 3041 3438 3438 23433505 3439 3439 3505 3504 26334304 3506 3505 4304 4303 26794523 4304 4304 5032 5031 27575032 5032 5032 5510 5525 29685510 5510 5510 5663 5663 30065662 5662 5662 6554 6554 30396556 6555 6555 6820 6891 30426893 6893 6821 6892 6929 30446930 6929 6892 6929 7028 30607029 7029 6931 7028 9632 31599637 9635 7029 9634 3442

9635 35084307448845244816550955305938643165606621685368806893703289039641

Page 8: S · Web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209

S. aureus

14st1 10st2 15st3 20st4 21st5 23st62067 2047 2062 2067 2065 20482170 2066 2135 2138 2134 21392197 2136 2210 2198 2195 22152215 2197 2232 2213 2212 22352239 2213 2248 2232 2234 22852258 2236 2283 2286 2283 23052285 2256 2298 2303 2301 23192303 2285 2320 2321 2323 23402320 2303 2336 2581 2342 26782423 2319 2343 2595 2543 27532439 2421 2591 2608 2577 28232499 2577 2631 2635 2591 29652544 2593 2750 2651 2616 29842567 2633 2758 2753 2631 30112578 2650 2806 2760 2647 30252593 2751 2821 2824 2673 30382606 2808 2960 2879 2768 30562634 2822 2978 2966 2821 31892715 2866 3003 2990 2868 32102768 2979 3039 3005 2978 34462822 3006 3051 3024 3004 35102869 3039 3208 3040 3019 35232966 3279 3278 3056 3039 36412979 3441 3441 3280 3278 36663042 3493 3494 3444 3442 38953143 3508 3507 3510 3507 43103442 3639 3636 3525 3638 44463510 3665 3664 3641 3891 44633522 3965 3963 3895 3982 44913641 4122 3979 3984 4176 45263985 4177 4121 4179 4192 48204178 4193 4176 4196 4306 50384198 4307 4192 4309 4486 51744308 4487 4305 4489 4526 53084441 4525 4349 4819 4815 55094463 4879 4649 4827 5034 56684490 5509 4877 5039 5305 58814528 5564 5033 5510 5510 63654883 6248 5506 5531 5564 64305035 6428 5561 5569 5663 65615508 6557 5662 5668 6357 66245570 6618 6424 6016 6426 68556556 6877 6593 6431 6555 68926616 6893 6614 6560 6616 69906893 7030 6844 6621 6847 70346931 9632 6890 6893 6891 71717031 9660 6928 6936 6930 89069663 7024 7033 7027 9641

8151 8160 7571 97749636 9634 101209664

Page 9: S · Web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209

S. aureus

24st7 25st8 114456 129817 150456 818202064 2066 2067 2170 2210 20662135 2137 2138 2215 2232 20852197 2198 2198 2235 2248 21362285 2215 2213 2258 2283 21972301 2235 2235 2287 2298 22132320 2286 2286 2303 2320 22362341 2304 2303 2320 2591 22852575 2321 2321 2423 2750 23032592 2514 2344 2606 2758 23192633 2580 2595 2634 2806 25932649 2595 2635 2869 2821 26332749 2635 2651 2979 2978 26502759 2651 2824 3005 3003 27512821 2753 2869 3042 3039 28222864 2761 3005 3442 3051 29622978 2824 3024 4425 3278 29693005 2966 3040 4490 3441 30063021 2980 3056 5511 3507 30393038 3023 3444 6893 3664 32793053 3039 3510 3963 34413274 3055 3895 4121 35083441 3211 4309 4176 36653507 3280 5039 4192 39653519 3296 5511 4305 41773637 3445 5531 4649 41934176 3510 5668 4877 43074192 3524 6016 5033 44874306 3641 6431 5509 45274815 3667 6560 5561 48794829 3984 6621 5662 55095034 4180 6893 6424 55645511 4195 6936 6593 65575527 4308 7033 6614 66185566 4424 6844 68775664 4489 6890 68936012 4818 6928 70306427 4832 7024 96326556 5038 96606616 55116848 55316876 56686893 59396931 64307001 66007029 66217044 68958156 70318897 81599633 96359661 9663

Page 10: S · Web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209

S. aureus

6108207 6022466 5062476 5108457 5002174 51083251495 1768 1495 1135 1135 11341693 2194 1693 1495 1145 14941768 2210 1768 1848 1495 16921849 2232 1849 2165 1694 17672193 2254 2165 2213 1768 18482210 2282 2193 2213 1849 21922232 2300 2210 2232 2165 22092254 2320 2254 2254 2193 22102281 2339 2281 2281 2213 22302300 2418 2300 2299 2232 22522321 2436 2321 2320 2254 22802339 2541 2339 2339 2281 22982418 2650 2418 2418 2300 23192436 2679 2436 2436 2320 23392541 2718 2541 2541 2339 24172602 2817 2602 2602 2418 24352613 2964 2613 2629 2436 25392630 3040 2630 2668 2541 26002651 3139 2651 2709 2602 26122668 3439 2668 2766 2613 26282710 4303 2710 2964 2630 26482767 4522 2767 3040 2668 26662954 4560 2964 3138 2710 27082986 5030 2986 4302 2767 27653002 5301 3002 4481 2994 29723041 5509 3041 4523 2986 29813139 6422 3139 5029 3021 30004303 6551 4303 5508 3040 30384482 6843 4482 6889 3138 31364522 6871 4522 9623 4303 43005030 6891 5030 4482 44795508 6925 5508 4522 45236590 7023 6590 5030 50306870 9625 6870 5508 55096893 6890 6591 68897023 7023 6844 96189624 9624 68719652 9652 6887

692570239625

Page 11: S · Web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209

S. aureus

5123568 5102587 5236589 6110379 61117461766 1767 1494 1770 12521847 1848 1848 2196 16892191 2192 2193 2214 17642213 2209 2209 2235 17822230 2231 2210 2256 18022252 2253 2231 2284 18212269 2280 2253 2302 21902280 2299 2281 2321 22112298 2319 2299 2341 22302320 2339 2319 2632 22812339 2417 2338 2647 22992416 2435 2417 2670 23192435 2540 2435 2963 23402539 2600 2540 2977 25372599 2611 2601 3005 25732627 2629 2612 3020 26262649 2667 2629 3038 26462676 2709 2677 3441 26742707 2765 2719 3508 30392764 2962 2766 4305 34362972 2982 2963 4486 44803001 3000 2983 5033 45233021 3039 3001 5507 50283038 3137 3039 5563 55083136 4300 3137 6594 55584299 4479 4301 6616 65504478 4523 4480 6890 68154523 5509 5031 6928 68895510 6587 5508 7027 69246892 6839 6890 9628 70249617 6867 9623 9656

68886921701996189646

Page 12: S · Web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209

S. caprae S. cohni urealyticum

CIP 104000 CIP 104520 CIP 104024 CIP 1040251004 1001 2072 10601019 1016 2094 10792640 1039 2111 10982660 2412 2133 11022678 2550 2149 11172715 2589 2417 11392918 2639 2418 11772954 2661 4477 13245211 2678 6071 13415259 2698 6537 13577040 2715 6581 1361

2917 13812955 13955214 14197042 1438

207220952111213023992438426348956081610161186139615762176388654465636581

Page 13: S · Web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209

S. epidermidis

LL1 LL2 LL3 LL4 LL5 LL6 LL7 LL8 LL9 LL10 LL11 LL121911 1041 2036 3344 2843 2420 5121 2841 3343 1234 3349 33442057 1234 2653 4298 2855 2458 5262 3345 5119 3344 3349 42982841 1577 2803 4678 3346 2842 5346 4299 5256 4298 4292 51193338 2419 2841 5120 4678 2855 6688 5120 5346 5120 5122 52575115 2458 2855 5251 5122 3345 6725 5261 6688 5262 5264 53465256 2842 3346 5345 5264 5122 6827 5347 6725 5345 5346 53945341 2853 3749 6688 5346 5264 6688 6826 6689 6688 64595888 2879 4679 6725 5397 5345 6726 6725 6726 66886582 3344 5122 6825 6462 5396 6827 6825 6824 67256684 4299 5263 6688 6591 68256722 4678 5345 6725 66886820 5262 5396 6828 67268237 5346 6462 68288702 5395 6688

6588 6828668867246825

Page 14: S · Web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209

S. epidermidis

LL13 LL14 LL15 LL16 CC4 ALA4 abm1 abm2 abm3 abm4 AMT1 AMT22242 2246 3342 2841 2623 2494 1310 1151 2887 1151 1487 14862838 2840 5117 2854 2663 2652 1442 2840 3339 2837 1517 15163342 3343 5254 3343 4301 2671 1683 3341 3743 2881 2203 22133748 3746 5343 5119 5122 2691 2191 4296 4900 3338 2418 24175345 5119 6455 5260 5255 2841 2297 4901 5117 4293 2457 24375532 5261 6686 5345 5344 2856 2630 5054 5344 4898 2554 24566689 5345 6723 6671 6462 3344 2839 5345 6672 5342 2593 28416725 6457 6822 6688 6688 5121 3332 6688 6686 6686 2752 28536934 6688 6725 6726 5253 4284 6725 6724 6724 2842 2876

6726 6824 6829 5344 4888 6827 6825 6823 2854 49016590 4926 9634 3344 53456674 5295 9662 4903 66886689 5332 5119 67266725 5343 5346 68266826 6388 6688

6659 67256685 6826681568327542

Page 15: S · Web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209

S. epidermidis

AMT3 AMT4 AMT5 AMT6 AMT7 mej1 mej2 dja far1 boc faua11041 1486 1041 1797 2214 3341 3339 1636 2644 1523 10361488 1516 1458 2214 2419 4294 5116 3336 3335 1638 11591518 2201 1487 2419 2436 4899 5248 5113 4290 3341 12732215 2212 1501 2436 2457 5115 5343 5244 4670 5119 12732252 2417 1518 2457 2493 5341 6672 5339 5113 5251 14422420 2435 1531 2493 2854 6684 6688 6683 5245 5345 15252438 2457 1560 2840 2870 6720 6725 6721 5339 5479 15272458 2841 2173 2870 2889 6823 6823 6817 6666 6674 15512835 2853 2203 3345 4680 9657 6683 6688 15552889 2880 2215 4679 5345 6817 6725 15584680 3343 2233 4906 6689 6826 15654905 4903 2420 5345 6725 15695345 5345 2436 6688 16816678 6688 2459 6725 20106688 6826 2841 24136726 2855 2426

2889 24302919 28333345 28424680 28474905 28765345 28806688 33396725 33396829 3743

42924679489950005116534366886827

Page 16: S · Web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209

S. epidermidis

faua2 rem yos1 yos2 yos3 sec2 sec3 omz1 omz4 ban1 bem1 bem21457 1033 3341 2648 1036 3339 3339 3340 3340 2837 1441 28391487 1427 4294 2850 1572 5116 5117 3743 3744 2877 2483 28771517 1440 5340 5345 1688 5249 5249 4295 4295 3337 2836 33422172 1468 6683 6689 2648 5343 5344 5115 5118 5114 2878 51192203 1555 6817 6826 2851 6508 6508 5342 5344 5340 2883 53452214 1567 3341 6687 6672 6684 6673 6668 3332 66742418 2640 4296 6725 6688 6719 6688 6684 5336 66882457 2679 4674 6824 6726 6820 6725 6723 6120 67252554 2830 5345 6824 6827 6820 6655 68262593 2835 6689 66842752 2836 6727 67252842 2875 6825 68092854 28802888 33353344 37364903 37745119 42865345 46636673 51086687 52406727 53386826 5370

63906576668467226748681396149643

Page 17: S · Web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209

S. epidermidis

bem3 bem5 mah1 mah2 mah3 mah4 mah5 mal1 mal2 mal3 mal4 dew22838 1035 1448 2837 2842 3337 2643 3338 2410 1036 2415 10392883 1451 1563 3339 3338 4293 2835 4293 3337 3339 3340 33403340 2137 3338 4294 5116 5115 2845 4897 4898 4900 4900 48995053 2837 4294 5116 5252 5342 3337 5114 5115 5117 5117 51155344 2882 5116 5254 5342 6670 5115 5340 5341 5344 5344 53426687 3340 5248 5342 6671 6688 5250 6665 6670 6688 6673 66856725 3742 5342 6402 6687 6725 5342 6682 6686 6726 6689 67236825 4295 6671 6688 6725 6824 6688 6818 6823 6824 6725 6820

5117 6686 6725 6824 6724 8232 8242 8243 68255344 6724 6823 6824 8697 8708 87096586 682166866725682596359663

Page 18: S · Web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209

S. epidermidis

blf1 blf2 blf3 guc1 guc2 taj1 gau1 gau2 gau3 gau4 gau5 faa11032 1037 3340 3343 1441 1033 1439 1131 1156 1449 1165 33392134 1452 4900 5117 1556 1226 1516 1146 1271 1563 1280 42933337 2138 5118 5249 2647 1524 1631 1163 1325 3341 1334 51163740 3341 5344 5343 2836 1553 5345 1264 1439 5117 1449 52504898 4901 6589 6584 2850 2836 6685 1278 1554 5342 1563 53125115 5118 6673 6669 3337 3337 1333 1567 6686 1732 53425341 5344 6689 6685 3742 3740 1416 1681 6822 1847 64016585 6689 6725 6820 5116 5115 1428 1723 3341 66716686 6826 6825 5248 5341 1431 1837 5343 66866723 5343 6585 1447 2840 6671 67246823 6588 6686 1547 3333 6686 6827

6673 6724 1561 5109 6725 68446688 6825 1730 5335 6822 75566823 1830 6663 9216

1845 66802014 67172130 68163339511653426670668767256821

Page 19: S · Web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209

S. epidermidis

ves2 ves4 ves5 ves6 fes2 fes3 lem1 lem2 lea1 lea23336 2490 1035 3339 2414 1166 3337 2834 2485 26465114 2648 2490 4294 3339 1449 4293 3337 2549 26855341 2797 2648 5116 4899 1563 5116 3741 2645 28436585 2839 2798 5343 5116 1734 5342 4293 2841 33406669 2849 2838 6671 5342 3343 6688 5116 3338 37436686 2888 2849 6687 6671 4900 6724 5342 4294 46716823 3342 2871 6824 6688 5117 6825 6688 4672 51189664 3745 2889 6725 5343 6825 5117 5251

4297 3340 6824 6688 5249 53454674 3744 8708 6824 5343 64605120 4296 8708 6585 66745345 4674 6672 66886688 5118 6689 67266726 5309 6824 68276820 5345 9638 81019667 6588 9666 9639

6673 966566896727682696389666

Page 20: S · Web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209

S. haemolyticus

ALA1 ban2 ban3 ban4 ban5 ban6 rib21668 2236 1016 1267 1321 2236 24921725 3443 1030 1695 2259 3445 34412256 4481 1045 1949 2496 3922 44782273 4613 1071 4481 3445 4296 46102296 4999 1109 4613 3922 4467 49402494 5134 1126 4999 4295 4484 49814481 6471 1137 5134 4483 4616 49994583 6877 1157 6471 4617 4986 50394593 6894 1271 6687 4677 5000 51314758 7030 1326 6878 5001 5136 51504943 1341 6894 5135 6474 64975000 1394 7031 5864 6882 68945042 1443 9003 5940 68956895 1478 6379 7034

1508 6473 90091556 67871580 68811693 68951708 70341724 90071840 9710189719321946201220332126222322322257227422952313313039184292447945154612467249985136646968957030

Page 21: S · Web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209

S. haemolyticus

rib3 rib4 rib5 fes1 marn1 marn2 CIP 1041141324 2255 2491 1131 4477 1444 44741723 2490 4292 1267 4996 4477 49762255 4982 4480 1334 5038 4938 49952492 4998 4612 1363 5130 4995 50134989 5131 4941 2254 6892 5016 50305004 6895 4998 2259 5036 51255138 5131 2295 5129 68866900 6894 2737 6891

429344784611499750405136647068939000

Page 22: S · Web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209

S. hominis hominis S. hominis novobiosepticus S. pasteuri

CIP 104689 CIP 8157 CIP 105719 CIP 103830 CIP 103832 CIP 1035401134 1136 1135 2174 2172 21781147 1236 1153 2212 2211 22161150 1257 2493 2349 2347 23531171 1317 2532 2372 2389 23761185 1356 2649 2391 2428 23951216 1394 2818 2412 2780 24171232 2428 2835 2430 2802 24341255 2447 2856 2592 2819 24711269 2644 2874 2781 2840 25971315 2836 4696 2804 2861 27861338 3677 4915 2820 2884 28081354 4560 5224 2843 2901 28251392 4598 6479 2863 2920 28471434 4691 2886 2938 28672277 4730 2902 4525 28902316 5219 2922 29062836 5257 2939 29274564 5350 4523 29454695 6472 45314733 64925222 65105261 66025355 6640644064786497651666116649

Page 23: S · Web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209

S. saprophyticus bovis S. saprophyticus saprophyticus S. sciuri sciuri

CIP 105261 CIP 105262 CIP 76125T CIP 103545 CIP 103583 CIP 105825 CIP 81621015 1321 1000 1005 1001 1089 10051100 1480 1435 1011 1016 1102 10801431 1604 1438 1012 1018 1116 11031435 1606 2121 1020 1058 1139 11051473 2127 2350 1028 1060 1158 11172121 2479 2474 1043 1074 1178 11192172 2497 2512 1082 1076 1181 11192211 2518 2551 1100 1098 1314 11402427 2541 2824 1103 1113 1329 11432473 2556 4259 1105 1118 1343 11432496 2830 4932 1139 1134 1356 11592512 4264 4970 1142 1136 1367 13152536 4937 4983 1439 1149 1381 13312550 4988 5006 1443 1156 1395 13432551 5025 5021 1479 1169 1421 13582804 5894 5063 1481 1170 1433 13702822 6038 6226 1695 1174 1445 13842883 6289 6263 1784 1178 1462 13852884 6384 6615 2048 1192 1724 13972900 6399 6653 2075 1195 2245 14092938 6618 2086 1232 2709 14244260 2099 1309 2718 14354933 2114 1314 2723 14354985 2127 1325 2732 14375023 2355 1338 2755 14426287 2478 1360 2767 14446381 2499 1363 2772 16246398 2501 1377 2783 23766616 2517 1379 2800 2716

2555 1382 2816 27322557 1392 2825 27352709 1403 2841 27462828 1423 4305 27552867 1428 4915 27704261 1430 5518 27744932 1438 5556 27794971 1619 5650 27854983 1640 5689 27915004 1692 28015021 1693 55215062 1733 56526031 1758 66326223 18226242 19526261 19566378 20376394 21806611 22406633 22546649 22576667 22666747 22676784 2281

237326684304491855205652569165006631

Page 24: S · Web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209

S. warneri

CIP 106511 CIP 8165 CC1 CC2 CC3 del kho1 kho22178 2172 2182 2182 2181 1387 2380 14062200 2190 2224 2335 2223 2177 2585 14402338 2332 2338 2380 2341 2309 2786 15542377 2371 2356 2590 2367 2337 2897 16992586 2392 2474 2777 2380 2557 2941 17862625 2409 2512 2790 2590 2586 4970 18572787 2430 2590 2817 2776 2625 5457 19882809 2581 2633 2829 2790 2758 5906 20112825 2620 2790 2907 2816 2786 6042 23372847 2657 2828 2932 2829 2824 23562937 2803 2936 5466 2906 2869 23805458 2820 5910 5911 2930 2897 25865907 2879 2945 5906 27865945 2893 5911 2825

2932 28352969 28985456 30025905 33375944 3739

382348294972508351155248535253905459547858945910604562426457

Page 25: S · Web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209

S. xylosus S. lugdunensis S. capitis capitis S. capitis ureolyticus

CIP 103720 CIP 104065 CIP 103584 CIP 103688 CIP 1041922113 1112 2543 2638 67902430 1134 2566 2676 67522452 1216 2582 5096 67352469 1315 2608 2606 67142508 1354 2644 2904 52332619 1392 2740 6712 51744237 1417 2778 2660 51574896 1689 2918 2943 51354963 2109 3073 5134 51196065 2263 4347 2714 50976103 2425 4385 2698 50806386 2448 4457 6750 12166524 2464 4495 51176572 2502 4564 67336610 2615 4602 2441

2785 4950 29263322 51624234 52004876 73554893 739449144931496050286065610362006386652565716610

Page 26: S · Web view5006167 5011449 5022466 5103096 5115449 5118630 5119616 5119851 836 836 836 836 836 835 835 835 859 859 859 859 859 859 859 859 965 965 965 965 964 965 964 964 2193 2209

S. schleiferi coagulans S. intermedius M. luteus

CIP 104366 CIP 81.60T CIP A270999 6731 11341096 2129 11341110 4274 13231113 4793 13251131 3785 13401313 6769 13421352 6242 13561353 2113 13571375 6750 13791393 2151 13931412 2810 14171434 2811 24731484 6868 24742128 1112 26322168 6717 27512169 4314 27902264 2087 43302302 2167 52492527 4830 54712621 4311 55092813 1046 62472841 1437 62692853 2089 62862856 2164 64304270 1089 64314845 1153 73904867 63424883 13244905 10004922 68074942 25874960 10734977 67914999 67855016 58446396 27726678 53006717 96336753676667866804109611101113