stratégia hľadania štruktúry neznámej zlúčeniny pomocou nmr - príklad rastlinných ...
DESCRIPTION
... Why Just NMR? – Because there is hardly another technique that is so informative for many different types of applications, and because there is no other technique that provides so much fun. Richard R. Ernst: Nobelova cena 1991: FT NMR. - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
![Page 1: Stratégia hľadania štruktúry neznámej zlúčeniny pomocou NMR - príklad rastlinných metabolitov](https://reader035.vdocument.in/reader035/viewer/2022062309/5681552d550346895dc306e7/html5/thumbnails/1.jpg)
... Why Just NMR? – Because there is hardly another technique that is so informative for many different types of applications, and because there is no other technique that provides so much fun.
Richard R. Ernst: Nobelova cena 1991: FT NMR
![Page 2: Stratégia hľadania štruktúry neznámej zlúčeniny pomocou NMR - príklad rastlinných metabolitov](https://reader035.vdocument.in/reader035/viewer/2022062309/5681552d550346895dc306e7/html5/thumbnails/2.jpg)
STRATÉGIA HĽADANIA ŠTRUKTÚRY NEZNÁMEJ ZLÚČENINY POMOCOU NMR - príklad rastlinných
metabolitov.
Mária Vilkováa, Ján Imricha, Miroslav Repčákb, Veronika Porackáb
aLaboratórium NMR spektroskopie, Ústav chémie, Prírodovedecká fakulta, Univerzita Pavla Jozefa Šafárika, Moyzesova 11, 040 01 Košice
bKatedra botaniky, Ústav biologických a ekologických vied, Prírodovedecká fakulta, Univerzita Pavla Jozefa Šafárika, Moyzesova 11, 040 01 Košice
![Page 3: Stratégia hľadania štruktúry neznámej zlúčeniny pomocou NMR - príklad rastlinných metabolitov](https://reader035.vdocument.in/reader035/viewer/2022062309/5681552d550346895dc306e7/html5/thumbnails/3.jpg)
Varian VNMRS 600 NMR spektrometer:
• gradientová sonda PFG OneNMR (dutina 5 mm)
• 1H NMR (599.877 MHz), 13C NMR (150.855 MHz)
• interný štandard: tetrametylsilán (TMS, 0 ppm)
• deuterované rozpúšťadla: metanol (CD3OD) alebo dimetylsulfoxid (DMSO)
• chemické posuny - stupnica [ppm]
• interakčné konštanty - J [Hz]
• protón-protón a protón-uhlík korelácie - gradientové selektívne homonukleárne a heteronukleárne experimenty s adiabatickými pulzmi
NMR spektroskopia
VNMRS 600 NMR spektrometer(vpredu konzola a RF inteface, vzadu magnet).
Sonda OneNMR.Vzorka v NMR kyvetev rotore (vpravo).
Prierez magnetom.
![Page 4: Stratégia hľadania štruktúry neznámej zlúčeniny pomocou NMR - príklad rastlinných metabolitov](https://reader035.vdocument.in/reader035/viewer/2022062309/5681552d550346895dc306e7/html5/thumbnails/4.jpg)
VZORKA 1: zmes rastlinných metabolitov
1H a 13C NMR spektrum
Obrázok 1. 1H NMR (600 MHz, CD3OD) spektrum (8,50 – 3,00 ppm) zmesi metabolitov.
Obrázok 2. 13C NMR (150 MHz, CD3OD) spektrum (175,0 – 40,0 ppm) zmesi metabolitov.
![Page 5: Stratégia hľadania štruktúry neznámej zlúčeniny pomocou NMR - príklad rastlinných metabolitov](https://reader035.vdocument.in/reader035/viewer/2022062309/5681552d550346895dc306e7/html5/thumbnails/5.jpg)
VZORKA 1: zmes rastlinných metabolitov
1H a 13C NMR spektrum
Obrázok 1. 1H NMR (600 MHz, CD3OD) spektrum (8,50 – 3,00 ppm) vzorky 1.
Obrázok 2. 13C NMR (150 MHz, CD3OD) spektrum (175,0 – 40,0 ppm) vzorky 1.
Obrázok 3. Spektrum DEPT (150 MHz, CD3OD) spektrum (175,0 – 40,0 ppm) vzorky 1.
![Page 6: Stratégia hľadania štruktúry neznámej zlúčeniny pomocou NMR - príklad rastlinných metabolitov](https://reader035.vdocument.in/reader035/viewer/2022062309/5681552d550346895dc306e7/html5/thumbnails/6.jpg)
[13C,1H]-HSQC
Obrázok 4. HSQC (CD3OD) spektrum zmesimetabolitov (vpravo oblasť aromatických protónov a uhlíkov).
H
H
H H
H
HH
(1H) (13C) [ppm] [ppm]8.02 141.17.86 146.17.67 132.77.55 129.97.24 138.37.22 114.47.08 119.66.85 102.76.79 102.56.64 109.96.56 108.66.40 116.56.29 114.65.84 119.3
![Page 7: Stratégia hľadania štruktúry neznámej zlúčeniny pomocou NMR - príklad rastlinných metabolitov](https://reader035.vdocument.in/reader035/viewer/2022062309/5681552d550346895dc306e7/html5/thumbnails/7.jpg)
[13C,1H]-HSQC
H
H
H H
H
HH
(1H) (13C) [ppm] [ppm]4.96 102.54.94 103.64.91 102.8
Obrázok 4. HSQC (CD3OD) spektrum zmesimetabolitov (vpravo oblasť anomérnych protónov a uhlíkov).
![Page 8: Stratégia hľadania štruktúry neznámej zlúčeniny pomocou NMR - príklad rastlinných metabolitov](https://reader035.vdocument.in/reader035/viewer/2022062309/5681552d550346895dc306e7/html5/thumbnails/8.jpg)
[13C,1H]-HSQC
H
H
H H
H
HH
(1H) (13C) [ppm] [ppm]3.90 62.63.69 62.5
62.43.82 56.03.80 55.93.56 74.93.48 78.5
78.13.43 71.4
71.2
Obrázok 4. HSQC (CD3OD) spektrum zmesimetabolitov (vpravo oblasť protónov a uhlíkov patriacich cukorným zložkám).
![Page 9: Stratégia hľadania štruktúry neznámej zlúčeniny pomocou NMR - príklad rastlinných metabolitov](https://reader035.vdocument.in/reader035/viewer/2022062309/5681552d550346895dc306e7/html5/thumbnails/9.jpg)
[1H,1H]-COSY
H
H
H H
H
HH
H
H
H
6.79(1.8)
6.56(1.8, 9.0)
7.67(9.0)
102.5
108.6
132.7
H
H5.84(12.6)
7.24(14.4)
138.8
119.3
H
H
H
6.85(1.8)
6.64(1.8, 9.0)
7.56(9.0)
102.5
109.9
132.7
H
H
6.40(16.2)
8.02(15.6)
141.2
116.5
H
H
7.08(7.8)
7.22(9.6)
114.4
119.6
H
H
7.86(9.6)
6.29(9.6)
114.6
146.1
O
OH
OH
OH
OOH
H4.96(7.8)
102.5
O
OH
OH
OH
OOH
H4.94(7.8)
103.6
O
OH
OH
OH
OOH
H4.91(7.8)
102.8Obrázok 5. COSY spektrum (CD3OD, 8,50 – 3,00 ppm) zmesi metabolitov (vpravo oblasť aromatických protónov a protónov na násobných väzbách).
![Page 10: Stratégia hľadania štruktúry neznámej zlúčeniny pomocou NMR - príklad rastlinných metabolitov](https://reader035.vdocument.in/reader035/viewer/2022062309/5681552d550346895dc306e7/html5/thumbnails/10.jpg)
[13C,1H]-HMBC
H
H
H H
H
HH
163.17.67 (132.7) 158.2
138.3
7.24 (138.8) 158.2 132.7
163.16.79 (102.5) 158.2
119.1 108.6
6.56 (108.6) 119.1 102.5
5.84 (119.3) 171.0 119.1
H
H
H
6.79(1.8)
6.56(1.8, 9.0)
7.67(9.0)
102.5
108.6
132.7H
H5.84(12.6)
7.24(14.4)
138.8
119.3
Obrázok 6. HMBC spektrum (CD3OD) zmesi metabolitov (vpravo prenosy magnetizácie z protónov na uhlíky).
![Page 11: Stratégia hľadania štruktúry neznámej zlúčeniny pomocou NMR - príklad rastlinných metabolitov](https://reader035.vdocument.in/reader035/viewer/2022062309/5681552d550346895dc306e7/html5/thumbnails/11.jpg)
[13C,1H]-HMBC
H
H
H H
H
HH
163.17.67 (132.7) 158.2
138.3 (7.24)
7.24 (138.8) 158.2 132.7 (7.67)
163.16.79 (102.5) 158.2
119.1 108.6 (6.56)
6.56 (108.6) 119.1 102.5 (6.79)
5.84 (119.3) 171.0 (C=O) 119.1
H
H
H
6.79(1.8)
6.56(1.8, 9.0)
7.67(9.0)
102.5
108.6
132.7H
H5.84(12.6)
7.24(14.4)
138.8
119.3
H
H
H
H
H
6.79(1.8)
6.56(1.8, 9.0)
7.67(9.0)
102.5
108.6
132.75.84(12.6)
7.24(14.4)
138.8
119.3
Obrázok 6. HMBC spektrum (CD3OD) zmesi metabolitov (vpravo prenosy magnetizácie z protónov na uhlíky).
![Page 12: Stratégia hľadania štruktúry neznámej zlúčeniny pomocou NMR - príklad rastlinných metabolitov](https://reader035.vdocument.in/reader035/viewer/2022062309/5681552d550346895dc306e7/html5/thumbnails/12.jpg)
[13C,1H]-HMBC
H
H
H H
H
HH
163.17.67 (132.7) 158.2
138.3 (7.24)
7.24 (138.8) 158.2 132.7 (7.67)
163.16.79 (102.5) 158.2
119.1 108.6 (6.56)
6.56 (108.6) 119.1 102.5 (6.79)
5.84 (119.3) 171.0 (C=O) 119.1
H
H
H
6.79(1.8)
6.56(1.8, 9.0)
7.67(9.0)
102.5
108.6
132.7H
H5.84(12.6)
7.24(14.4)
138.8
119.3
H
H
H
H
H
6.79(1.8)
6.56(1.8, 9.0)
7.67(9.0)
102.5
108.6
132.7
7.24(14.4)
138.8
119.3
158.2163.1
Obrázok 6. HMBC spektrum (CD3OD) zmesi metabolitov (vpravo prenosy magnetizácie z protónov na uhlíky).
![Page 13: Stratégia hľadania štruktúry neznámej zlúčeniny pomocou NMR - príklad rastlinných metabolitov](https://reader035.vdocument.in/reader035/viewer/2022062309/5681552d550346895dc306e7/html5/thumbnails/13.jpg)
[13C,1H]-HMBC
H
H
H H
H
HH
163.17.67 (132.7) 158.2
138.3 (7.24)
7.24 (138.8) 158.2 132.7 (7.67)
163.16.79 (102.5) 158.2
119.1 108.6 (6.56)
6.56 (108.6) 119.1 102.5 (6.79)
5.84 (119.3) 171.0 (C=O) 119.1H
H
H
6.79(1.8)
6.56(1.8, 9.0)
7.67(9.0)
102.5
108.6
132.7H
H5.84(12.6)
7.24(14.4)
138.8
119.3
H
H
H
H
H
6.79(1.8)
6.56(1.8, 9.0)
7.67(9.0)
102.5
108.6
132.7
7.24(14.4)
138.8
119.3
158.2163.1
H
H
H
H
H
OCOOH
O
6.79(1.8)
6.56(1.8, 9.0)
7.67(9.0)
102.5
108.6
132.7
7.24(14.4)
138.8
119.3
158.2163.1
119.1
171.0
??? ???
Obrázok 6. HMBC spektrum (CD3OD) zmesi metabolitov.
![Page 14: Stratégia hľadania štruktúry neznámej zlúčeniny pomocou NMR - príklad rastlinných metabolitov](https://reader035.vdocument.in/reader035/viewer/2022062309/5681552d550346895dc306e7/html5/thumbnails/14.jpg)
[13C,1H]-HMBC
171.98.02 (141.1) 159.0
129.9 117.0
164.07.55 (132.7) 159.0
141.1
164.36.85 (102.7) 159.0
118.1 109.9
6.64 (109.9) 118.1 102.7
6.40 (116.5) 171.9 118.1
H
H
H H
H
HH
H
H
H
H
H
COOH
O O
6.85(1.8)
6.64(1.8, 9.0)
7.56(9.0)
102.7
109.9
132.7
6.40(16.2)
8.02(15.6)
141.2
116.5
??? ???
164.3
171.9
118.1
159.0
H
H
6.40(16.2)
8.02(15.6)
141.2
116.5
H
H
H
6.85(1.8)
6.64(1.8, 9.0)
7.56(9.0)
102.7
109.9
132.7
Obrázok 6. HMBC spektrum (CD3OD) zmesi metabolitov (vpravo prenosy magnetizácie z protónov na uhlíky).
![Page 15: Stratégia hľadania štruktúry neznámej zlúčeniny pomocou NMR - príklad rastlinných metabolitov](https://reader035.vdocument.in/reader035/viewer/2022062309/5681552d550346895dc306e7/html5/thumbnails/15.jpg)
[13C,1H]-HMBC
H
H
H H
H
HH
162.87.86 (146.1) 144.4
119.6 116.5 (sl.)
149.77.22 (114.4) 135.9
119.6 116.5
149.77.08 (119.6) 146.1
144.4
6.29 (114.6) 162.8 116.5
H
H
7.08(7.8)
7.22(9.6)
114.4
119.6
H
H
7.86(9.6)
6.29(9.6)
114.6
146.1
H
H H
H
7.86(9.6)
6.29(9.6)
114.6
146.1
7.08(7.8)
7.22(9.6)
114.4
119.6
Obrázok 6. HMBC spektrum (CD3OD) zmesi metabolitov (vpravo prenosy magnetizácie z protónov na uhlíky).
![Page 16: Stratégia hľadania štruktúry neznámej zlúčeniny pomocou NMR - príklad rastlinných metabolitov](https://reader035.vdocument.in/reader035/viewer/2022062309/5681552d550346895dc306e7/html5/thumbnails/16.jpg)
[13C,1H]-HMBC
H
H
H H
H
HH
162.87.86 (146.1) 144.4
119.6 116.5 (sl.)
149.77.22 (114.4) 135.9
119.6 116.5
149.77.08 (119.6) 146.1
144.4
6.29 (114.6) 162.8 116.5
H
H
7.08(7.8)
7.22(9.6)
114.4
119.6
H
H
7.86(9.6)
6.29(9.6)
114.6
146.1
H
H H
H
7.86(9.6)
6.29(9.6)
114.6
146.1
7.08(7.8)
7.22(9.6)
114.4
119.6
144.4
116.5
Obrázok 6. HMBC spektrum (CD3OD) zmesi metabolitov (vpravo prenosy magnetizácie z protónov na uhlíky).
![Page 17: Stratégia hľadania štruktúry neznámej zlúčeniny pomocou NMR - príklad rastlinných metabolitov](https://reader035.vdocument.in/reader035/viewer/2022062309/5681552d550346895dc306e7/html5/thumbnails/17.jpg)
[13C,1H]-HMBC
H
H
H H
H
HH
162.87.86 (146.1) 144.4
119.6 116.5 (sl.)
149.77.22 (114.4) 135.9
119.6 116.5
149.77.08 (119.6) 146.1
144.4
6.29 (114.6) 162.8 116.5
H
H
7.08(7.8)
7.22(9.6)
114.4
119.6
H
H
7.86(9.6)
6.29(9.6)
114.6
146.1
H
H H
H
O
7.86(9.6)
6.29(9.6)
114.6
146.1
7.08(7.8)
7.22(9.6)
114.4
119.6
144.4
116.5
162.8
Obrázok 6. HMBC spektrum (CD3OD) zmesi metabolitov (vpravo prenosy magnetizácie z protónov na uhlíky).
![Page 18: Stratégia hľadania štruktúry neznámej zlúčeniny pomocou NMR - príklad rastlinných metabolitov](https://reader035.vdocument.in/reader035/viewer/2022062309/5681552d550346895dc306e7/html5/thumbnails/18.jpg)
[13C,1H]-HMBC
H
H
H H
H
HH
162.87.86 (146.1) 144.4
119.6 116.5 (sl.)
149.77.22 (114.4) 135.9
119.6 116.5
149.77.08 (119.6) 146.1
144.4
6.29 (114.6) 162.8 116.5
H
H
7.08(7.8)
7.22(9.6)
114.4
119.6
H
H
7.86(9.6)
6.29(9.6)
114.6
146.1
H
H H
H
O
7.86(9.6)
6.29(9.6)
114.6
146.1
7.08(7.8)
7.22(9.6)
114.4
119.6
144.4
116.5
162.8
H
H H
H
O OO
OH
7.86(9.6)
6.29(9.6)
114.6
146.1
7.08(7.8)
7.22(9.6)
114.4
119.6
144.4
116.5
162.8??? 149.7
135.9
Obrázok 6. HMBC spektrum (CD3OD) zmesi metabolitov.
![Page 19: Stratégia hľadania štruktúry neznámej zlúčeniny pomocou NMR - príklad rastlinných metabolitov](https://reader035.vdocument.in/reader035/viewer/2022062309/5681552d550346895dc306e7/html5/thumbnails/19.jpg)
Obrázok 6. HMBC spektrum (CD3OD) zmesi metabolitov.
[13C,1H]-HMBC
H
H
H H
H
HH
Anomérne protóny4.96 (102.5) 159.0 4.94 (103.6) 158.24.91 (102.8) 149.7
Metylové skupiny3.80 (56.0) 164.33.71 (56.2) 163.1
H
H
H
H
H
OCOOH
O
6.79(1.8)
6.56(1.8, 9.0)
7.67(9.0)
102.5
108.6
132.7
7.24(14.4)
138.8
119.3
158.2163.1
119.1
171.0
??? ???
H
H
H
H
H
COOH
O O
6.85(1.8)
6.64(1.8, 9.0)
7.56(9.0)
102.7
109.9
132.7
6.40(16.2)
8.02(15.6)
141.2
116.5
??? ???
164.3
171.9
118.1
159.0
H
H H
H
O OO
OH
7.86(9.6)
6.29(9.6)
114.6
146.1
7.08(7.8)
7.22(9.6)
114.4
119.6
144.4
116.5
162.8??? 149.7
135.9
![Page 20: Stratégia hľadania štruktúry neznámej zlúčeniny pomocou NMR - príklad rastlinných metabolitov](https://reader035.vdocument.in/reader035/viewer/2022062309/5681552d550346895dc306e7/html5/thumbnails/20.jpg)
[13C,1H]-HMBC
H
H
H H
H
HH
Anomérne protóny4.96 (102.5) 159.0 4.94 (103.6) 158.24.91 (102.8) 149.7
Metylové skupiny3.80 (56.0) 164.33.71 (56.2) 163.1
O
OH
OH
OH
O
OH
H
H
H
H
H
H
OCOOH
CH3
6.79(1.8)
6.56(1.8, 9.0)
7.67(9.0)
102.5
108.6
132.7
7.24(14.4)
138.8
119.3
158.2163.1
119.1
171.0
56.23.71
4.94(7.8)
103.6
H
H
H
H
H
COOH
O O
6.85(1.8)
6.64(1.8, 9.0)
7.56(9.0)
102.7
109.9
132.7
6.40(16.2)
8.02(15.6)
141.2
116.5
??? ???
164.3
171.9
118.1
159.0
Obrázok 6. HMBC spektrum (CD3OD) zmesi metabolitov.
H
H H
H
O OO
OH
7.86(9.6)
6.29(9.6)
114.6
146.1
7.08(7.8)
7.22(9.6)
114.4
119.6
144.4
116.5
162.8??? 149.7
135.9
![Page 21: Stratégia hľadania štruktúry neznámej zlúčeniny pomocou NMR - príklad rastlinných metabolitov](https://reader035.vdocument.in/reader035/viewer/2022062309/5681552d550346895dc306e7/html5/thumbnails/21.jpg)
[13C,1H]-HMBC
H
H
H H
H
HH
Anomérne protóny4.96 (102.5) 159.0 4.94 (103.6) 158.24.91 (102.8) 149.7
Metylové skupiny3.80 (56.0) 164.33.71 (56.2) 163.1
O
OH
OH
OH
O
OH
H
H
H
H
H
H
OCOOH
CH3
6.79(1.8)
6.56(1.8, 9.0)
7.67(9.0)
102.5
108.6
132.7
7.24(14.4)
138.8
119.3
158.2163.1
119.1
171.0
56.23.71
4.94(7.8)
103.6
H
H H
H
O OO
OH
7.86(9.6)
6.29(9.6)
114.6
146.1
7.08(7.8)
7.22(9.6)
114.4
119.6
144.4
116.5
162.8??? 149.7
135.9
Obrázok 6. HMBC spektrum (CD3OD) zmesi metabolitov.
O
OH
OH
OH
O
OH
H
H
H
H
H
H
COOH
O
CH3
6.85(1.8)
6.64(1.8, 9.0)
7.56(9.0)
102.7
109.9
132.7
6.40(16.2)
8.02(15.6)
141.2
116.5
164.3
171.9
118.1
159.0
4.96(7.8)
102.5
![Page 22: Stratégia hľadania štruktúry neznámej zlúčeniny pomocou NMR - príklad rastlinných metabolitov](https://reader035.vdocument.in/reader035/viewer/2022062309/5681552d550346895dc306e7/html5/thumbnails/22.jpg)
[13C,1H]-HMBC
H
H
H H
H
HH
Anomérne protóny4.96 (102.5) 159.0 4.94 (103.6) 158.24.91 (102.8) 149.7
Metylové skupiny3.80 (56.0) 164.33.71 (56.2) 163.1
O
OH
OH
OH
O
OH
H
H
H
H
H
H
OCOOH
CH3
6.79(1.8)
6.56(1.8, 9.0)
7.67(9.0)
102.5
108.6
132.7
7.24(14.4)
138.8
119.3
158.2163.1
119.1
171.0
56.23.71
4.94(7.8)
103.6
O
OH
OH
OH
O
OH
H
H
H H
H
O O
OH
7.86(9.6)
6.29(9.6)
114.6
146.1
7.08(7.8)
7.22(9.6)
114.4
119.6
144.4
116.5
162.8149.7
135.9
4.91(7.8)102.8
O
OH
OH
OH
O
OH
H
H
H
H
H
H
COOH
O
CH3
6.85(1.8)
6.64(1.8, 9.0)
7.56(9.0)
102.7
109.9
132.7
6.40(16.2)
8.02(15.6)
141.2
116.5
164.3
171.9
118.1
159.0
4.96(7.8)
102.5
![Page 23: Stratégia hľadania štruktúry neznámej zlúčeniny pomocou NMR - príklad rastlinných metabolitov](https://reader035.vdocument.in/reader035/viewer/2022062309/5681552d550346895dc306e7/html5/thumbnails/23.jpg)
Doc. RNDr. Ján Imrich, CSc. Ing. Jan Pelnař, CSc.
Mgr. Branislav Horváth, PhD. RNDr. Marianna Prokaiová
Prof. RNDr. Miroslav Repčák, DrSc.RNDr. Veronika Poracká
POĎAKOVANIE
![Page 24: Stratégia hľadania štruktúry neznámej zlúčeniny pomocou NMR - príklad rastlinných metabolitov](https://reader035.vdocument.in/reader035/viewer/2022062309/5681552d550346895dc306e7/html5/thumbnails/24.jpg)
ĎAKUJEM ZA POZORNOSŤ!