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1 SULCOMANIA 2018 23-12-2018 Installation 2 Hauptmenu 2 Symbole 1 Programm verlassen 2 Liste mit Namen oder Liste mit Feldnummern 2 3 Setup: Wählen der Sprache 2 4 Drucken 5 5 Landkarte zeigen 4 6 Karte nach links oder rechts 4 7 Landkarte vergrößern 4 8 Anzeige Höhe auf Landkarte 4 9 Rahmen mit Merkmalen 3 10 Liste Namen oder Feldnummern zeigen 11 Thumbnails 2 12 Zusammenfassung Betrieb des Programmes Menu 4 Foto’s 6 Menu Suchen 7 Menu Vergleichen 10 Menu UPGMA 12 Menu Information 13 18 Diagnose 4 19 Liste anderer Feldnummern 4

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Page 1: SULCOMANIA 2018 · 2018. 12. 29. · Z = Abbildung eines Samenkornes, gemacht mit einem Mikroskop S = Foto eines Sämlinges, der meistens 4 Monate alt ist D = Makro-Abbildung eines

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SULCOMANIA 2018 23-12-2018

Installation 2 Hauptmenu 2 Symbole 1 Programm verlassen 2 Liste mit Namen oder Liste mit Feldnummern 2 3 Setup: Wählen der Sprache 2 4 Drucken 5 5 Landkarte zeigen 4 6 Karte nach links oder rechts 4 7 Landkarte vergrößern 4 8 Anzeige Höhe auf Landkarte 4 9 Rahmen mit Merkmalen 3

10 Liste Namen oder Feldnummern zeigen

11 Thumbnails 2 12 Zusammenfassung Betrieb des

Programmes Menu 4 Foto’s 6 Menu Suchen 7 Menu Vergleichen 10 Menu UPGMA 12 Menu Information 13 18 Diagnose 4 19 Liste anderer Feldnummern 4

Page 2: SULCOMANIA 2018 · 2018. 12. 29. · Z = Abbildung eines Samenkornes, gemacht mit einem Mikroskop S = Foto eines Sämlinges, der meistens 4 Monate alt ist D = Makro-Abbildung eines

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Installieren: (Programm Cactus) Öffne Explorer Selektiere DVD-Laufwerk, Selektiere Verzeichnis INSTALCACTUS, Doppelklick auf SETUP.exe. Hauptmenu

Klick auf um eine andere Sprache zu wählen. SulcoMania basiert sich auf Feldnummern. Die gewählten Namen sind oft arbiträr, aber werden trotzdem häufig verwendet. Man kann einen Namen oder eine Feldnummer selektieren. Beim Starten des Programmes ist eine Liste mit Namen verfügbar [1].

Wer sofort eine Feldnummer selektieren will, klickt auf [2] Bewege den Cursor nach der oberen linken Ecke des Bildschirmes. Eine Liste mit Namen oder Feldnummern erscheint. Selektiere einen Namen und danach eine Feldnummer [1] oder sofort eine Feldnummer [2]. Rahmen mit Thumbnails Links unten erscheint ein Rahmen mit kleinen Abbildungen (= Thumbnails). Ein Klick auf einen Thumbnail: die Abbildung wird gezeigt. Ein Klick auf die Abbildung: die Abbildung verschwindet.

Namen der Abbildungen Die ersten 7 Zeichen sind reserviert worden für die Feldnummer. Danach folgt ein Zeichen, das den Bildtyp zeigt:

F = Foto einer blühenden Pflanze P = Foto einer Pflanze ohne Blüte H = Foto einer Pflanze in ihrem natürlichen Fundort B = Abbildung eines Blütenschnittes, meistens von einem Fotoscanner Z = Abbildung eines Samenkornes, gemacht mit einem Mikroskop S = Foto eines Sämlinges, der meistens 4 Monate alt ist D = Makro-Abbildung eines Randdornes, manchma; mit Areole

Der Rahmen mit den Thumbnails verschwindet durch einen Klick auf den Rahmen

oder auf .

Der Rahmen mit den Thumbnails wird wieder sichtbar wenn man auf klickt.

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Rahmen mit Merkmalen Rechts oben erscheint ein Rahmen mit 22 Merkmalen.

- Sprossen stark sprossend: mehr als 1 Sproß pro Jahr - Areole Form strich = keine Wolle schmal = länglich mit Wolle oval - Stand Randdornen nach unten zeigend - Farbe Randdornen hell + dunkle Sp. = hell mit dunkler Spitze - Loben Randdornen

glatt rauh Scheinloben - % St.Durchm./Länge Durchmesser Stil × 100% Länge Stil - Verklebung Griffel sehe Abbildung Blüte: - % Narben/Stil sehe Abbildung Blüte: - Winkel Röhre Sehe Abbildung Blüte: dunkelblaue linien

- Blüte Modell Das Model ist definiert durch A(0,0),(0,yB),(0,yC),(xD,1)

B A

D C

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Die Höhe des Fundortes wurde arithmetisch abgerundet auf 25 m. Die Koordinaten werden aufgeführt als dezimale Zahlen, abge-rundet auf 0,05°. Das wirkliche Fundort findet sich in einem Rechteck von etwa 5,5 km länge und Breite. In einem Info Fenster können weitere Informationen vorkommen. Wenn Picture right tab aktiv ist, wird eine Abbildung völlig rechts gezeigt. Klick auf ein Item in der Liste mit “Andere Feldnummern”. Dieser Record wird aktiv. N.B. Feldnummern vom gleichen Gebiet müssen nicht zum gleichen Taxon gehören. Oft sind Auffassungen was das anbelangt arbiträr. Darum werden in SulcoMania mehrere Populationen benannt als “Species von einem Ort”. Der Rahmen mit Merkmalen verschwindet durch einen Klick auf den Rahmen.

Der Rahmen mit Merkmalen wird wieder sichtbar wenn auf geklickt wird.

Wenn der Fundort der selektierten Feldnummer bekannt ist, wird das Symbol mit Erdkugel farbig sein. Klick auf das Symbol um die Landkarte zu sehen. Der Name der Karte wird gefunden auf den Rahmen mit Merkmalen.

Klick auf um die Karte zu vergrößern oder zu verkleinern auf die ursprüngliche Größe.

Klick auf um die Karte nach links oder nach rechts zu bewegen. Klick mit der rechten Maustaste auf die Karte. Falls verfügbar wird eine Liste mit alternativen Karten angezeigt. Klick auf einen Kartenamen in dieser Liste. Wenn der Cursor über die Karte nicht bewegt und auf diese Stelle Weingartien / Sulcorebu-tien gefunden worden sind, werden die Feld-nummern gezeigt auf der Karte, sehe den Cursor auf der Karte. Die Farben der Landkarte stellen die Höhen dar. Klick

auf um die Beziehung zwischen Farbe und Höhe zu sehen. Klick auf die Karte um sie zu verstecken.

Wenn eine Erstbeschreibung des Names verfügbar ist, erscheint rechts oben

. Wenn der Text rot markiert ist, gehörte die Typepflanze zur Population der selektierten Feldnummer.

Klick auf : der Text der Erstbeschreibung erscheint. Klick auf den Text: der Text der Erstbeschreibung verschwindet.

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UPGMA Die Methode wird verwendet um Feldnummern mit sehr ähnlichen Pflanzen zu zweit zu clustern.

Wähle ein Kriterium um eine Selektion Feldnummern zu machen. Selektieren: Eine nach der anderen: jedes einzelne erwünschte Item wird handmäßig selektiert. Auswahl durch Namen: alle Pflanzen mit dem Namen des selektierten Item werden markiert. Am meisten ähnlich: von allen Feldnummern in der Liste werden die Merkmale verglichen mit diesen des selektierten Items. Die 40 Items mit der höchsten Übereinstimmung werden markiert. Auswahl auf Habitat: Items mit gleichen Koordinaten werden markiert. Wenn die Anzahl kleiner als 40 ist wird auch noch in der Umgebung

gesucht. Sehe Vergleichen – Felder.

Gewähltes Item JK053. Klick auf Dendrogramm und das Dendrogramm wird berechnet. Klick mit der linken Maustaste auf eine Feldnummer im Dendrogramm. Der Mauszeiger ändert sich in einem kleinen Kaktus und der Text wird rot. Halte die linke Maustaste nach unten und schleppe nach einem der drei Rahmen rechts vom Dendrogramm. Wenn ein Foto verfügbar ist, wird sie hier gezeigt. Klick mit der rechten Maustaste auf das Dendrogramm. Das Dendrogramm wird als Bilddatei (.BMP) gespeichert im Verzeichnis C:\SulcoMania.

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Drucken Die Liste basiert sich auf Namen. Klick auf um einen Namen zu selektieren. Eine List erscheint. Selektiere ein Item von dieser Liste. Auf dem Lay-out erscheinen die Merkmale und der Text des Feldes mit zusätzlicher Information. Darunter befindet sich eine Landkarte. Die Höhe dieser Karte wird bestimmt durch den verfügbaren Raum auf dem Blatt (A4). Rects oben erscheinen die Thumbnails die zur selektierten Feldnummer gehören. Wähle ein oder mehr Bilder, indem Sie auf die Thumbnails klicken. Wenn Bilder hinzugefügt werden wird der Raum für die Landkarte kleiner. Es ist nicht ausgeschlossen, dass durch Auswahl von viel Foto’s die Höhe dieses Raumes negativ wird. Das führt zu einem Run-time-error.

Foto versetzen: klick mit der linken Maustaste auf das Bild, halte die Taste nach unten und schleppe nach der erwünschten Stelle. Foto vergrößern oder verkleinern: klick mit der rechten Maustaste auf das Bild. Trage die neu gewählte Breite ein und klick auf O.K.

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4 Foto's

Klick auf ein Item der Liste. Der Mauszeiger ändert sich in . Halte die linke Maustaste nach unten und schleppe nach einem der vier Rahmen.

Der Mauszeiger ändert sich in . Lasse die linke Maustaste los über den erwünschten Rahmen. Die Abbildung erscheint in der Größe des Rahmens: die Höhe wird neu gepasst. Klick auf die Abbildung um das originale Format zu sehen. Klick auf die originale Abbildung um sie zu verstecken.

Das Programm bietet die Gesamtliste der Abbildungen. Man kann auch ein Teil der Liste ausschließen oder sich beschränken zu einer bestimmten Kategorie Abbildungen.

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Analyse Es gibt mehrere Optionen. - Suchen nach Feldnummern, die ein selektiertes Merkmal oder eine Kombination

von selektierten Merkmalen haben. - Suchen nach allen Feldnummern mit einem selektierten Akronym. - Suchen nach allen Feldnummern mit einem selektierten Name. - Suchen nach Feldnummern mit einem hohen Grad an Ähnlichkeit in Merkmalen

mit diesen einer selektierten Feldnummer. Suchen nach Feldnummern, die ein selektiertes Merkmal oder eine Kombination von selektierten Merkmalen haben Es gibt 22 Listen mit Merkmalen. Klick in einer Liste auf ein oder mehr Items. Klick auf Suchen.

Im Beispiel wird in Merkmal Anzahl Rippen 13 selektiert. Pflanzen einer Feldnummer können verschiedene Anzahlen Rippen haben. Wenn einer von diesen 13 ist, wird das Feldnummer aufgenommen in Ergebnis. Dieses Ergebnis erscheint rechtsoben. Über die gefundenen Feldnummern steht “Ergebnis 349/746 46%[9%]”. Von 746 Rekords ist die Anzahl Rippen eingetra-

gen. In 349 ReKords wird die Anzahl 13 gefunden. Das ist 46% von 746. Wenn die Rippenzahlen von 6 bis >15 gleichmäßig verteilt wären, hätte man als Ergebnis 9% bekommen. Offenbar kommt 13 relativ sehr oft vor. 13 ist eine Fibonacci-Zahl. Klick auf ein Item in der Liste von Ergebnis. Eine Liste mit Abbildungen gehörend zur selektierten Feldnummer erscheint. Klick auf ein Item dieser Liste. Die Abbildung erscheint. Klick auf die Abbildung und sie verschwindet. Links neben dieser Liste kann man wählen welche Art

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Abbildungen man sehen will (“Alle foto’s”, “Pflanze + Blüte”, usw.) Karte: eine Landkarte wird gezeigt. Hierauf kann man sehen wo die Ergebnisse vorkommen. Klick mit der rechten Maustaste um eine andere Karte zu wählen. Klick auf Drucken um die Karte zu drucken. Es können mehr Items pro Merkmal selektiert werden. Es können mehr Merkmale selektiert werden. Clear: alle Auswähle in den Listen der Merkmale werden ausgeglichen. Suchen nach allen Feldnummern mit einem selektierten Akronym

Klick auf des Combiboxes von Feldnummern. Selektiere ein Akronym. Klick auf Suchen. Halte den Mauscursor 1 Sekunde über das Textfach, wenn ein Akronym selektiert worden ist. Die Bedeutung des Akronymes wird gezeigt in einem “Tooltiptext”, wenn bekannt.

Suchen nach allen Feldnummern mit einem selektierten Name Klick auf des Combiboxes von Namen. Selektiere einen Namen. Klick auf Suchen. Suchen nach Feldnummern mit einem hohen Grad an Ähnlichkeit in Merkmalen mit diesen einer selektierten Feldnummer Von allen Feldnummern in der Liste sind 19 oder mehr Merkmale von Daten versehen. Klick unter Umständen auf des Combiboxes unter die Liste um diese Anzahl Merkmale zu ändern. Selektiere eine Feldnummer.

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In der Tabelle Ergebnis stehen die Feldnummern in Reihenfolge der Prozentsätze Übereinstimmung. N.B. Wenn die Anzahl verwendeten Merkmale geringer ist, wird die Farbe der Buchstaben heller sein. Das wird spürbar sein wenn Minimale Anzahl von Merkmale um zu vergleichen deutlich niedriger eingestellt wird. Die kleine Karte zeigt wo die 25 Feldnummern mit den höchsten Prozentsätzen vorkommen. Unten auf dem Bildschirm wird ein Histogramm gezeigt für die 25 Feldnummern mit den höchsten Prozentsätzen. Jedes Item von jedem Merkmal wird dargestellt durch eine Spalte. Die Höhe der Spalte wird bestimmt durch die Anzahl Male, dass dieses Item gefunden wird bei den 25 “besten” Ergebnissen. Die Items die bei die selektierte Feldnummer passen sind rot gefarbt.

In diesem Beispiel hat die Form der Schuppen auf der Röhre wenig Bedeutung, denn sie sind alle rot gefarbt. Berechnung: Verglichen wird ein Merkmal von Feldnummer A und Feldnummer B. - MerkmalA = rauh, MerkmalB = rauh: Übereinstimmung = 1 - MerkmalA = rauh, MerkmalB = glatt, rauh: Übereinstimmung = 0,8 Der Prozentsatz Übereinstimmung wird berechnet durch

Manche Leute sind der Meinung, dass nah zu einander wachsende Populationen enger verwandt sein würden. Wenn man +Habitat activiert, wird der Fundort als 23e Merkmal benützt.

Mit Hilfde der Koordinaten wird der Distanz berechnet. Nun wird der Prozentsatz Übereinstimmung berechnet durch:

Wenn Save aktiviert worden ist, werden Ergebnis als Textdatei und die kleine Karte als bmp-Datei gespeichert in einem Ordner C:\SulcoMania.

Unten findet man ein Teil der verschiedene Ergebnisse bis 81%, gehörend zu diesem Beispiel. Zwischen [] findet man die Anzahl verwendete Merkmale. +Habitat uit +Habitat aan 100% JK053 canigueralii[33] 100% JK053 canigueralii[34] 84% WR671 pojoniensis n.n.[33] 85% WR599 canigueralii[34] 84% WR599 canigueralii[33] 84% WR479 aureiflora[34] 84% WR479 aureiflora[33] 84% VZ159 canigueralii[32] 84% VZ159 canigueralii[31] 84% HJ0952 callichroma[34] 84% HJ0952 callichroma[33] 83% WR281 canigueralii[32] 83% WR281 canigueralii[31] 82% WR671 pojoniensis n.n.[34] 82% L387 pasopayana[31] 82% L387 pasopayana[32] 82% JK189 aureiflora[33] 82% JK189 aureiflora[34] 82% JK066 tarabucoensis[33] 82% JK066 tarabucoensis[34] 82% JK063 aureiflora[33] 82% JK063 aureiflora[34] 82% HS125A sp.Mandinga[33] 82% HS125A sp.Mandinga[34] 82% HJ0966 sp.Ecia.Saucoyo[33] 82% HJ0966 sp.Ecia.Saucoyo[34] 82% HJ0961 sp.Co.Santiago[33] 82% HJ0961 sp.Co.Santiago[34]

Summe günstige Ergebnisse + 0,0625 × (4 – Distanz)2 Anzahl Merkmale mit Daten + 1

Summe günstige Ergebnisse . Anzahl Merkmale mit Daten

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Vergleichen 2 Feldnummern

Merkmal in beiden Spalten völlig gleich: grüne fette Buchstabe, (Wert 100) Merkmal in beiden Spalten teilweise gleich: grüne Buchstabe, (Wert 80) Merkmal in beiden Spalten völlig ungleich: rote Buchstabe (Wert 0) Für Anzahl Rippen, Anzahl Randdornen und Länge Randdornen wird berechnet: abs(φlog(eerste)- φlog(tweede)). (Wert 100×( 1-Ergebnis)) Unter die Spalten findet sich ein Streifen mit grüner, roter und gauer Farbe. Grün = (Summe der Werte) / 33 [66%] Grau = (Summe der Werte, wo ein Merkmal leer ist) / 33 [ 3 %] Rot = 100 – 66 – 3 = 31%. Von allen Items in der Liste für 2 Feldnummern sind mindestens 30 der Merkmalen bekannt. In der Liste für Felder stehen alle Items, auch diese wovon noch keine Daten eingetragen wurden. Felder Es ist der Ziel um zu sehen, welche Feldnummern in der Nähe einer selektierten Feldnummer vorkommen. Dazu wird ein Viereck in 9 Abschnitte unterteilt. Jeder Abschnitt stellt ein Teil der Landkarte von ± 5,5 × 5,5 km dar. Klick auf ein Item in der Liste. Diese Feldnummer wird mit roten Buchstaben in den zentralen Abschnitt gestellt. Wenn vorhanden werden pro Abschnitt 10 Feldnummern gestellt.

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Wenn von der selektierten Feldnummer Merkmale bekannt sind, werden diese verglichen mit diesen der anderen gestellten Feldnummern. Mit den Farben grün, rot und grau wird wieder der Grad von Übereinstimmung dargestellt.

Klick auf eine Feldnummer für ein Bild. Klick auf Karte um die Landkarte zu zeigen, in der das Quadrat mit 9 Abschnitte sichtbar ist. Danksagung. Jährlich wird der Bestand der Abbildungen verbessert und vergrößert durch die Mithilfe einer großen Zahl Personen. Das ist nicht nur erfreulich, aber es stimuliert auch diese Arbeit weiter auszubauen. Klick auf Exit um das Fenster zu schließen. Ich bedanke mich bei Dr. Rolf Märtin für die Bearbeitung des deutschen Textes. 24 september 2014 Johan Pot (e-mail: [email protected]) Gagarinstraat 17 1562 TA Krommenie