zgodovina logp - university of ljubljana · zgodovina logp 1872 – porazdelitveni koeficient prvi...
TRANSCRIPT
ZGODOVINA logP1872 –
porazdelitveni koeficient prvič
definiran –
Berthelot in Jungfleisch: “On the laws that operate for partitition of a substance between two solvents.”
1899 –
Meyer porazd. koef. prvič
uporabljen za korelacijo in razlago1901 –
Overton učinkovitosti bioaktivnih spojin (narkotiki)
Uporaba porazd. koef. za korelacijo z bioaktivnostjo se zelo
razširi: zamudni postopki določanja koncentracije učinkovin (porazdeljevanje –
separacija [npr. timol iz oljne faze z destilacijo z vodno paro] –
detekcija [titracija ipd.]).-
razvoj UV spektroskopije → za večino spojin (ki absorbirajo svetlobo) –enostavno določanje koncentracije-
določanje P v različnih “kombinacijah”
organsko topilo/voda: olivno olje, arašidovo olje, ricinovo olje, laneno olje, kot tudi heptan idr...-
1964 –
začetek “splošne”
uporabe logP kot lipofilni faktor: Hansch uvaja oktanol/voda sistem za določanje logP-
1971 –
Leo, Hansch in Elkins –
publicirajo pregledni članek s podatki za logPza skoraj 6000 spojin (z vključno svojimi 800 meritvami) v sistemu okt./voda
PORAZDELITVENI KOEFICIENT
Oznake (kratice): P, Kp, DD –
distribution koefficient (Pnav, upoštevajte pH)
Definicija: P = c0 / cw
(konc. –
aktivnost)γ
= 1
Termodinamika: molski ulomki, xi
prehod topljenca iz organske v vodno fazo
( ) ( )μ=μ ii 0w
xlnRTxlnRT 000w
0w +μ=+μ
PlnRTxxlnRTG
w
000
0w
0 ==μ−μ=Δ
Povezava med “obema P”:
molski ulomek:
(n = nA
+ nB
+ ...)
2 komp.:
n = c ·
V → →
zanemarimo
= 18 mL → nw
= 55,5 mol/L
= 157,5 mL → n0
= 6,35 mol/L
nnx A
A =
nnnx
BA
AA +=
VVVcVc
xm
A +⋅⋅
=
V0w
V0okt
nnPVVPVV
xc
xxPVcx 0wc
0w
00c
w
0
w
0
w
0TmA ⋅=⋅=⋅==⇒⋅≈
Aditivnost logP vrednosti:Standardni kemijski potencial se razdeli na lipofilno in hidrofilno komponento (predpostavka)
n –
št. hidrofilnih skupin
Kemijski potencial za obe fazi lahko zapišemo: μ
= μ0+ RT...
Če uporabimo koncentracije:
μ0i
( ) ( ) ( )μ+μ=μ 0H
0L
0i www
n
( ) ( ) ( )μ+μ=μ 0H
0L
0i 000
n
( ) ( ) ( ) xlnRTn wwww0H
0Li +μ+μ=μ
( ) ( ) ( ) xlnRTn 00000H
0Li +μ+μ=μ
( ) ( ) ( ) VlnRTclnRTn 0wwwww
0H
0Li ++μ+μ=μ
( ) ( ) ( ) VlnRTclnRTn 000000
0H
0Li ++μ+μ=μ
V RAVNOTEŽJU:; p, T = konst. in ob upoštevanju P = c0
/ cw
:
Potrditev predpostavke:
Če v grafu nanašamo vrednosti lnP za homologno vrsto v odvisnosti
od n, dobimo premico; naklon = , odsek na osi
( ) ( )μ=μ ii 0w
( ) ( ) ( ) ( )[ ]VVlnRTPlnRT 0
0
0w
0w0w0H
0H
0L
0L +μ−μ+μ−μ=
VVln
RTn
RTPln 0
0
0w
0H
0L +
μΔ+
μΔ=
( ) ( )( )μ−μ=μΔ 000w
0
RT/0HμΔ
( )VVlnRT/y 00
0w
0L +μΔ=
DOLOČANJE P (oziroma logP)
a) računsko iz fragmentalnih prispevkovb) eksperimentalno
Ad a):
empirično (baza podatkov)
Hansch:
log P(R –
X)
= log P(R –
H)
+ π(X)
H (vodik) –
nima prispevka k lipofilnosti, korekcije
Rekker:
fi
–
hidrofobna fragmentna konstanta za fragment iai
–
mnogokratnik teh fragmentov v molekulik·cM
–
dodatni člen, “popravki”
–
v različnih primerihpotrebno korigirati vrednost kot mnogokratnik“magične konstante”
(cM)
ckfaPlog M
n
iii ⋅+∑=
Ad b):
-
konvencionalna (klasična) metoda stresanja –
“shake flask method”
-
metoda kontinuiranega vzorčenja (modifikacija gornje metode) –“filter probe”
-
metoda kontinuiranega spiranja kolone –
“regeneration column
method”: dobimo nasičene raztopine (spiranje topljenca, vezanega na
stacionarno fazo v koloni) → gre za razmerje topnosti –
neekzaktno!!
-
uporaba kromatografskih metod (TLC, HPLC), RPLC; ekstrapolacija,
izbor določenega razmerja MeOH : vodna faza; vpliv pH, izbor kolone:
nasičena z oktanolom, blokirane silanolne skupine, RP kolone
Omejitve: majhne polarne molekule (vezanje na stacionarno fazo);
velike molekule –
velikost por
IZBOR ORGANSKEGA TOPILA ZA PORAZDELJEVANJE
n–oktanol -
najbolj uporabljan, najpomembnejši
Nepolarna ali delno polarna topila:cikloheksan, ogljikov tetraklorid, benzen, kloroform-
topljenec prehaja z molekulami vode iz vodne v organsko fazo (hidroksilne spojine, amini, anilini, karboksilne kisline). Tvorba H –
vezi.-
asociacija topljencev v organski fazi (karboksilne kisline). Dimerizacija.
Alkanoli (alkoholi):-
asociirani (linearni, ciklični multimeri)-
mešanje z vodo: do C3
–
mešanje, C4
in C5
– močne interakcije z vodo, C6
– C12
–
šibkejše interakcije, nad C12
–
trdne spojine.-
n-heptanol in n-nonanol –
podobna n-oktanolu; vsebnost vode različna (2.57 mol/L –
heptanol, 2.15 mol/L –
oktanol, 1.93 mol/L –
nonanol; T = 22 ±
1°C)
- različne teorije o asociatih molekul oktanola in vode: tetraedri (Hahsch) –razmerje W/A v z vodo nasičenem oktanolu = 0,28!?; novejše teorije –
“
clustri”-
oktanol nasičen z vodo (2.3 mola H2O/L pri 25°C)-
metode preučevanja: NMR raziskave, dielektrična konstanta, viskoznost...NI SPREMEMB V VSEBNOSTI VODE PRI PORAZDELJEVANJU (kot pri nepolarnih topilih)-
n-heptanol, n-nonanol –
podobna n-oktanolu, možna alternativa
logR : R = H2O površina / CH2
površina; razmerje površin pod trakovoma v NMR spektru za raztopljeno vodo v alkoholu in za protona CH2
skupine, nakatero je pripeta alkoholna OH skupina.
Razmerje W/A >
0.4 pri C4
in C5
alkoholih, pri alkoholih C6
– C12: W/A <
0.4;spremembe strukture niso tako izrazite pri n >
6.log 0.4 ≈
-
0.4 (-
0.398)
Estri:največ
olivno olje-
problemi: ↑viskoznost, naravna snov → problematična točnost (neenakost)sestave; kvarjenje –
oksidacija. -
etilacetat –
hidroliza (neprimeren).
COLLANDER-ove ENAČBE
logP2
= a ·
logP1
+ b pomemben a→1; b –
ni pomemben
EKSTRATERMODINAMSKA ZVEZA (Hansch to že ugotovi)
logPizo-pentanol
= 1.17 logPizo-butanol
–
0.17 logPn-oktanol
= 1.24 logPn-butanol
– 0.42
Topnost H2O v n-butanolu: 9.53 mola H2O/L0,977 mol/L –
topnost n-butanola v H2OOstale zveze: CH3Cl/H2O, CHCl4/H2O, ksilen/H2O, benzen/ H2O idr.
Uporabnost logP:
-
predvidevanje biološke aktivnosti (npr. prehod preko membran; QSAR)
-
določevanje asociatov v vodni oziroma organski fazi
-
predvidevanje vodotopnosti (Yalkowsky)
-
določanje pKa
Vpliv medsebojnega (delnega) mešanja vode in oktanola;
P ≠
S0/Sw
Slika 1: Odvisnost odseka na ordinati (●) in naklona (○) Collanderove enačbe od volumskega deleža metanola v mobilni fazi (ø).
Slika 2: Odvisnost logk’
od volumskega deleža metanola v mobilni fazi (ø); □
-
adenin, ●
-
adenozin, ○
-
adenozin 3’, 5’
–
monofosfat.
Table 1: Calculated logk values for tested guanine derivatives at differentmethanol concentrations (v/v) in mobile phase.
Table 2: The equations for logk values of tested guanine derivatives versus percentage MeOH (v/v) in mobile phase obtained by the least-squares linear regression method (using data from Table 1) with Pearsons coefficients ofcorrelation (R).
Figure 4: Relationship between logk values of tested substances and methanol concentration (v/v%) in the mobile phase. The points represent experimentally determined values, the lines are obtained by the least squares linear regression method. The equations are given in Table 2.▲ ACV; Δ
NAcACV; ●
OAcACV;+
diAcACV; x
DCV; ○
NAcDCV;■
OAcDCV; □
diAcDCV.
Table 3: Experimental and calculated logP values by different programs (HYPERCHEM, PACO, CLOGP, KOWWIN, MICROQUSAR and PROLOGP: ATOMIC, ATOMIC5, CDR andcombined)
Table 4: The Pearson correlation coefficients obtained by the least-squares linear regression method for experimentally determined logP values and those calculateda.
Table 5: The differences between calculated and experimentally determined data (Δ
= logPcalc
–
logPexp) with averages of their absolute values (n = 8), are givena).