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hola Universidad Católica San Antonio de Murcia Tlf: (+34) 968 278 160 [email protected] www.ucam.edu Guía Docente 2017/2018 Bioestadística Biostatistics Grado en Medicina Modalidad de enseñanza presencial

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Page 1: Guía Docente 2017/2018 · Estadística descriptiva, Inferencia estadística y Diseño de experimentos. Distribuciones de una variable: Media, Desviación y % de casos en intervalos

hola

Universidad Católica San Antonio de Murcia – Tlf: (+34) 968 278 160 [email protected] – www.ucam.edu

Guía Docente 2017/2018

Bioestadística

Biostatistics

Grado en Medicina

Modalidad de enseñanza presencial

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Bioestadística

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Índice

BIOESTADÍSTICA ................................................................................................................2

Breve descripción de la asignatura ...................................................................................2

Requisitos Previos ..............................................................................................................3

Objetivos ..............................................................................................................................3

Competencias ......................................................................................................................3

Metodología .........................................................................................................................5

Temario .................................................................................................................................6

Relación con otras materias ...............................................................................................9

Sistema de evaluación ........................................................................................................9

Bibliografía y fuentes de referencia ................................................................................. 10

Web relacionadas .............................................................................................................. 11

Recomendaciones para el estudio y la docencia ........................................................... 11

Material necesario ............................................................................................................. 11

Tutorías .............................................................................................................................. 11

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Bioestadística

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BIOESTADÍSTICA

Módulo: Medicina Social, Habilidades de comunicación e iniciación a la investigación

Materia: Estadística Médica

Carácter: Básica

Nº de créditos: 6 ECTS

Unidad Temporal: 1º Curso – 2º Cuatrimestre

Profesor/a de la asignatura: Dr. Luis Prieto Valiente Dra. Carmen carazo

Email: [email protected] y [email protected]

Horario de atención a los alumnos/as: Lunes 13.00 a13.30

Profesor coordinador de módulo: Dr. José López González

http://www.ucam.edu/estudios/grados/medicina-presencial/profesorado

Breve descripción de la asignatura

La bioestadística es la aplicación del ANÁLISIS ESTADÍSTICO DE DATOS a las ciencias

biológicas y a las ciencias de la salud. Todas las encuestas que evalúan las opciones que elegirán

los votantes, los productos que prefiere el consumidor, el alivio del dolor que produce un fármaco, el

perjuicio que para la salud supone el sedentarismo… son analizadas con los mismos métodos.

Conocer los fundamentos lógicos, que no matemáticos, de esta materia es una necesidad

para el científico y el profesional de este siglo, porque ello le permite entender aspectos importantes

de la información que son inaccesibles al que ignore esos conceptos básicos. Al aprender estos

métodos se está adquiriendo una herramienta útil en todos los campos de investigación. Básicamente

se trata de los mismos métodos en todas las aplicaciones, y por ello de la misma asignatura en todas

los estudios universitarias.

Brief Description

Biostatistics is the application of statistical analysis of data to life and health sciences. All

surveys that assess options chosen by voters, consumers preferred products, pain relief produced by

a drug, the harm to health caused by a sedentary lifestyle…. are analyzed with the same methods of

statistical analysis.

Knowing the rationale, not the mathematical fundamentals, of this matter is a need for scientific

and practitioner of this century, because it allows then to understand important aspects of information

inaccessible to those who ignore these basic concepts. These methods are becoming a needed tool

in all research fields. It's essentially the same methods in all applications, and therefore the same

subject in all university courses.

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Requisitos Previos

Ninguno.

Objetivos

1. Conocer los conceptos básicos implicados en el diseño de estudios médicos, tanto a nivel

experimental como a nivel clínico.

2. Comprender los métodos de la Estadística Descriptiva, uni y multivariantes, siendo capaces de

resumir el comportamiento de variables cuali y cuantitativas, así como la relación entre dos o más

variables.

3. Conocer las diferentes técnicas de inferencia estadística que permitan extrapolar los

conocimientos adquiridos en las muestras estudiadas a las poblaciones de las que proceden.

Competencias

Competencias Básicas y Generales

CB 1. Que los estudiantes hayan demostrado poseer y comprender conocimientos en un área de

estudio que parte de la base de la educación secundaria general, y se suele encontrar a un nivel que,

si bien se apoya en libros de texto avanzados, incluye también algunos aspectos que implican

conocimientos procedentes de la vanguardia de su campo de estudio.

CB 2. Que los estudiantes sepan aplicar sus conocimientos a su trabajo o vocación de una forma

profesional y posean las competencias que suelen demostrarse por medio de la elaboración y

defensa de argumentos y la resolución de problemas dentro de su área de estudio.

CB 3. Que los estudiantes tengan la capacidad de reunir e interpretar datos relevantes (normalmente

dentro de su área de estudio) para emitir juicios que incluyan una reflexión sobre temas relevantes

de índole social, científica o ética.

CB 4. Que los estudiantes puedan transmitir información, ideas, problemas y soluciones a un público

tanto especializado como no especializado.

CB 5. Que los estudiantes hayan desarrollado aquellas habilidades de aprendizaje necesarias para

emprender estudios posteriores con un alto grado de autonomía.

CG 0. Hablar bien en público.

Competencias Transversales

CGT 01. Capacidad de análisis y de síntesis.

CGT 02. Capacidad de organización y planificación.

CGT 03. Comunicación oral y escrita en lengua nativa.

CGT 05. Conocimientos de informática relativos al ámbito de estudio.

CGT 06. Capacidad de gestión de la información.

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CGT 14. Compromiso ético.

CGT 15. Aprendizaje autónomo.

CGT 16. Adaptación a nuevas situaciones.

CGT 21. Motivación por la calidad.

Competencias Específicas

CET 31. Conocer, valorar críticamente y saber utilizar las fuentes de información clínica y biomédica para obtener, organizar, interpretar y comunicar la información científica y sanitaria.

CET 32. Saber utilizar las tecnologías de la información y la comunicación en las actividades clínicas, terapéuticas, preventivas y de investigación.

CET 33. Mantener y utilizar los registros con información del paciente para su posterior análisis, preservando la confidencialidad de los datos.

CET 34. Tener, en la actividad profesional, un punto de vista crítico, creativo, con escepticismo constructivo y orientado a la investigación.

CET 35. Comprender la importancia y las limitaciones del pensamiento científico en el estudio, la prevención y el manejo de las enfermedades.

CET 36. Ser capaz de formular hipótesis, recolectar y valorar de forma crítica la información para la resolución de problemas, siguiendo el método científico.

CET 37. Adquirir la formación básica para la actividad investigadora.

CM2.31. Conocer los conceptos básicos de bioestadística y su aplicación a la ciencia médicas

CM2.32. Ser capaza de diseñar y realizar estudios estadísticos sencillos utilizando programas informáticos e interpretar los resultados.

CM2.33. Entender e interpretar los datos estadísticos en la literatura médica

CM2.40. Conocer los principios del método científico, la investigación biomédica y el ensayo clínico.

Resultados de aprendizaje

RA 3. Saber hacer y haberlo practicado analizar, calcular e interpretar los métodos estadísticos más frecuentes

RA 4. Saber hacer y haberlo practicado crear una base de datos.

RA 5. Haber visto practicar por un experto calcular la medida adecuada en un estudio epidemiológico.

RA 6. Diseñar y ejecutar bajo supervisión un proyecto científico elemental.

RA 7. Comunicar los resultados del proyecto científico por escrito y oralmente.

RA 8. Revisar, resumir y presentar un tema de investigación biomédica a partir de distintas fuentes.

RA 9. Manejar con autonomía un ordenador personal y los programas de interés médico más frecuentes.

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RA 10. Identificar, acceder y utilizar los principales sistemas de búsqueda y manejo de bibliografía.

RA 11. Manejar a nivel de usuario de las principales bases de datos de enfermedades.

RA 12. Acceder a bases de datos moleculares de interés en ciencias biomédicas.

RA 13. Utilizar programas informáticos que permiten el manejo de la imagen desde un nivel molecular a tisular y sistémico.

RA 14. Elaborar una historia clínica informatizada.

RA 15. Utilizar las posibilidades que las nuevas tecnologías permiten en la consulta a distancia.

RA 16. Fuentes de información farmacológicas y terapéuticas

RA 17 Conocer los conceptos básicos de bioestadística y su aplicabilidad a las ciencias biomédicas

RA 18 Diseñar y analizar estudios sencillos.

RA19 Conocer las principales técnicas estadísticas y su aplicación.

RA 20 Utilidad y aplicaciones de programas informáticos de estadística.

RA 21 Distinguir entre muestra y población, así como entre muestras aleatorias y no aleatorias.

RA 22 Analizar de modo descriptivo un conjunto de datos.

Metodología

Metodología Horas Horas de trabajo

presencial

Horas de trabajo

no presencial

Clases teóricas 53,7

75 horas (50 %) Seminarios teórico-prácticos 13,3

Evaluación 4

Tutoría 4

Estudio de la materia impartida 37.5

75 horas (50 %)

Resolución de cuestiones y/o

problemas

7.5

Realización de trabajos de forma

individual o en equipo 7.5

Preparación de exámenes 22.5

TOTAL 150 75 75

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Temario

Programa de la enseñanza teórica

Primer Taller El Análisis estadístico: Distribuciones de Frecuencia y Valor P

Tema 1.1 El problema y la solución. Ignorancia, temor y resignación.

Tema 1.2 El Análisis Estadístico compara Medias o % en dos o mas grupos.

Estadística descriptiva, Inferencia estadística y Diseño de experimentos.

Distribuciones de una variable: Media, Desviación y % de casos en intervalos

Tema 1.3 Qué es y cómo se calcula el valor P del test: Valor Estandarizado y Distribución

Normal

Tema 1.4 Cómo se usa el valor P. Rechazar o no rechazar una hipótesis.

Tema 1.5 Pensar versus Actuar. El valor P solo dice el % de individuos más extremos

Segundo Taller: Muestreo Repetido. Probabilidad en ciencias biomédicas.

La Inferencia Estadística con una media y una proporción. Test “t de Student”

y test “Chi-cuadrado”

Tema 2.1 Poblaciones y muestras. La inferencia estadística. Muestreo Repetido, MR.

Probabilidad.

Tema 2.2 Test e Intervalo de Confianza. Error estándar de la media Teorema central del

límite.

Tema 2.3 La distribución “t de Student”.

Tema 2.4 Test para una proporción: cuanto no vale la proporción poblacional. Test “Chi-

cuadrado”

Tema 2.5 No hay puntos de corte, sino zonas de transición progresiva.

Tema 2.6 El valor del test NO es la probabilidad de que la hipótesis Nula sea cierta o sea

Falsa

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Tercer Taller: La Inferencia Estadística en la comparación de medias y de

proporciones. Ensayos clínicos. Diseños Caso-Control. Test no paramétricos.

Tema 3.1 Comparación de dos medias Test e Intervalo de Confianza

Tema 3.2 Dos medias con datos apareados

Tema 3.3 Comparación de dos proporciones Test e Intervalo de Confianza

Tema 3.4 Ensayos Clínicos. Riesgo Relativo. Odd Ratio. Diseños Caso-Control.

Tema 3.5 Comparación de dos Distribuciones Discretas: Tablas de contingencia

Tema 3.6 Las comparaciones básicas del Análisis Estadístico

Cuarto Taller: ANOVA. Regresión Lineal.

Tema 4.1 Relación entre dos variables: dependencia e independencia.

Tema 4.2 ANOVA: Análisis de Varianza. Test no Paramétricos.

Tema 4.3 La Geometría Analítica. Ecuación de la recta. Pendiente o Coeficiente de

Regresión.

Tema 4.4 Regresión Lineal en la muestra. Recta de mínimos cuadrados. Error estándar de la

estimación

Tema 4.5 Inferencia estadística con regresión. Error Estándar del Coeficiente de Regresión.

Tema 4.6 Coeficiente de Correlación y Coeficiente de Determinación

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Quinto Taller: El presunto tamaño de muestra necesario. Potencia estadística

Tema 5.1 Mitos y realidad.

Tema 5.2 Anchura razonable del Intervalo de Confianza. Tamaño de muestra estimando una

media. La formula y su utilidad.

Tema 5.3 Tamaño de muestra estimando una proporción

Tema 5.4 Potencia estadística y magnitud del efecto real. Uso razonable de la potencia

Tema 5.5 Tamaño de muestra para test con una media. Tablas de tamaños

Tema 5.6 Errores y que consumen tiempo y energía a la mayoría y no benefician a nadie

Sexto Taller: Factores de Confusión. Análisis estratificado. Los fundamentos

lógicos del Análisis Multivariado.

Tema 6.1 Factor de confusión con variable dicotómica

Tema 6.2 Interacción

Tema 6.3 Factor de confusión con variable cuantitativa

Tema 6.4 Metanálisis

Tema 6.5 Factores “intermedios”

Tema 6.6 Dos confusores simultáneamente

Séptimo Taller: Introducción a la Inferencia bayesiana. Probabilidad a priori

y probabilidad a posteriori.

Tema 7.1 Es deseable e inevitable usar la información previa

Tema 7.2 Porcentaje de un porcentaje. El teorema de Bayes

Tema 7.3 El valor P del test no es la probabilidad de que sea cierta o sea falsa la hipótesis nula.

Tema 7.4 Inferencia bayesiana.

Tema 7.5 Inferencia bayesiana en medicina

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Programa de la enseñanza práctica

1. Manejo de una base de datos con un paquete de programas informáticos para análisis

estadístico. Análisis descriptivos basicos.

2. Inferencia con una muestra: test de Significación e Intervalos de confianza para una media y

una proporción. Interpretación correcta de resultados

3. Inferencia con dos muestras: test de Significación e Intervalos de confianza para diferencia

de dos medias y dos proporciones. Interpretación correcta de resultados

4. Inferencia con tres o mas muestras. ANOVA. Tablas de contingencia

5. Correlación y regresión.

Relación con otras materias

Esta asignatura es una herramienta fundamental en el análisis de datos obtenidos en TODAS las

investigaciones médicas. Todos los profesores de todas las asignaturas hacen uso - explícito o

implícito - de los conceptos básicos del análisis estadístico.

Sistema de evaluación

Convocatoria de Febrero/Junio/Septiembre:

Parte teórica: 70% del total de la nota. Se realizarán dos pruebas escritas tipo test, 1º Parcial: 30%

y final: 40%.

Como nota del primer parcial se toma la mayor entre las que obtuvo cuando se hizo el examen

parcial y cuando se hizo su recuperación.

Parte práctica: 20% del total de la nota.

Trabajo del alumno en Tutorías, Seminarios y Prácticas: 10%.

Las notas correspondientes al trabajo y a la parte práctica sólo se contabilizarán una vez superada

la parte teórica.

El alumno superará la asignatura cuando la media ponderada sea igual o superior a 5 puntos y se

hayan superado todas las partes que componen el sistema de evaluación cuya ponderación global

sea igual o superior al 20%.

Si el alumno tiene menos de un 5 en alguna de las partes cuya ponderación sea igual o superior al

20%, la asignatura estará suspensa y deberá recuperar esa/s parte/s en la siguiente convocatoria

dentro del mismo curso académico. La/s parte/s superada/s en convocatorias oficiales

(Febrero/Junio) se guardarán para las sucesivas convocatorias que se celebren en el mismo curso

académico.

En caso de que no se supere la asignatura en la Convocatoria de Septiembre, no contarán las partes

aprobadas para sucesivos cursos académicos.

El sistema de calificaciones (RD 1.125/2003. de 5 de septiembre) será el siguiente:

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0-4,9 Suspenso (SS)

5,0-6,9 Aprobado (AP)

7,0-8,9 Notable (NT)

9,0-10 Sobresaliente (SB)

La mención de “matrícula de honor” podrá ser otorgada a alumnos que hayan obtenido una

calificación igual o superior a 9,0. Su número no podrá exceder del 5% de los alumnos matriculados

en una materia en el correspondiente curso académico, salvo que el número de alumnos

matriculados sea inferior a 20, en cuyo caso se podrá conceder una sola matrícula de honor.

Bibliografía y fuentes de referencia

Bibliografía básica

Prieto Valiente, L. y Herranz Tejedor, I. Proyecto Anna Sullivan. Un puente necesario entre el análisis

estadístico y los médicos. Arcadia Madrid . 2017

Prieto Valiente, L. y Herranz Tejedor, I. Bioestadística sin dificultades matemáticas. Diaz de Santos.

Madrid . 2016

Almenara Barrios J. at al “Historia de la Bioestadistica” Quorum Ed. Cadiz 2003

Box G.E., Hunter W.G., Hunter J.S. “Statistics for experimenters”. John Wiley. 2008.

Prieto Valiente, L. y Herranz Tejedor, I “¿Qué significa estadísticamente significativo?. La falacia del

criterio del 5% en la investigación científica”. Edit. Diaz de Santos. Madrid . 2005

Moyé. L.A. “Statistical Reasoning in Medicine. The intuitive P-Value Pimer”. Springer. 2000.

Prieto Valiente, L. y Herranz Tejedor, I. “Diseño y análisis de experimentos en ciencias de la salud”. Edit.

Universitaria. Madrid. Madrid. 2007

Armitage P., Berry G. “Statistical methods for medical researchers”. Blackwell. 2006.

Prieto L., Herranz I. “Bioestadística”. Editorial universitaria. Madrid. 2008.

Romero R., Zúnica L. “Estadística”. Universidad de Valencia. 2004.

Silva, L. C. “La Investigación Medical y sus laberintos”. Díaz de Santos. 2009.

Bibliografía complementaria

Altman D. G. y Moher D.“Elaboración de directrices para la publicación de investigación biomédica:

proceso y fundamento científico” Medicina Clinica 125 (supl 1) 8-13 2006

Bolstad W. M. “Introduction to Bayesian Statistics”. Wiley-Interscience. N.Jersey. 2

Casas, A. “El LHC y la frontera de la fisica” CSIC 2009

Feinstein A.R. “Clinical epidemiology: the arquitecture of clinical researche”. Philadelphia, WB saunders .

1985. Citado por F.L. Redondo. “El error en las pruebas de diagnostico clínico”. Diaz de Santos. 2002.

Good, P. y Hardin, J. “Common errors in Statistics” Willey. 2009.

Young, J. SWISS MED WKLY 2007 137: 41–43 · Editorial “Statistical errors in medical research – a

chronic disease?”

Zinsmeister, A. y Connor, J. Ten Common Statistical Errors. and How to Avoid Them “Am J

Gastroenterol” 2008;103:262–266

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Prieto, L., Herranz, I., Matinez-Sellés, M., Alonso,R. “Tests of significance vs tests of hypothesis Far east

journal of theoretical statistics, Volume 21 No.1) pp. 97 -111 (2007)

Duran A., “Pasiones, piojos, dioses....y matemáticas”. Edit. Destino. 2009

Rothman K., “Modern Epidemiology”. Little Brown. Toronto. 1986

Web relacionadas

Revista Biometrica http://biomet.oxfordjournals.org/

Revista Biometrics http://www.biometrics.tibs.org/

Escuela de higiene y medicina tropical de la Universidad de Londres http://www.lshtm.ac.uk/

Recomendaciones para el estudio y la docencia

Se recomienda estudiar la asignatura de forma diaria, continuada y ordenada, para poder seguir el

ritmo de las clases y seminarios.

Material necesario

Calculadora. Ordenador. Paquete estadístico de distribución abierta.

Tutorías

Las actividades que se realizan dentro de las tutorías académicas en esta asignatura son:

-Orientación personal sobre los contenidos de la asignatura y los sistemas de evaluación.

-Consolidación de conocimientos, habilidades, destrezas y actitudes de trabajo en grupo,

comunicación oral y escrita.

-Planificación y fomento del aprendizaje del alumno mediante la facilitación de fuentes

bibliográficas y documentales.

-Asesoramiento sobre cómo abordar las actividades de los seminarios prácticos.

La Universidad, además, dispone de un Cuerpo Especial de Tutores que realiza tutoría personal con

los estudiantes matriculados en el grado. El tutor/a personal acompaña a los estudiantes durante

toda la etapa universitaria. Se puede consultar el siguiente enlace:

http://www.ucam.edu/servicios/tutorias/preguntas-frecuentes/que-es-tutoria