Étude comparée de quatre logiciels de gestion de

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Tous droits réservés © Association pour l'avancement des sciences et des techniques de la documentation (ASTED), 2012 This document is protected by copyright law. Use of the services of Érudit (including reproduction) is subject to its terms and conditions, which can be viewed online. https://apropos.erudit.org/en/users/policy-on-use/ This article is disseminated and preserved by Érudit. Érudit is a non-profit inter-university consortium of the Université de Montréal, Université Laval, and the Université du Québec à Montréal. Its mission is to promote and disseminate research. https://www.erudit.org/en/ Document generated on 06/16/2022 4:03 p.m. Documentation et bibliothèques Étude comparée de quatre logiciels de gestion de références bibliographiques libres ou gratuits A Comparative Review of Four Free Reference Management Software Estudio comparado de cuatro programas de gestión de referencias bibliográficas libres o gratuitas Gérald Kembellec and Claire Scopsi Volume 58, Number 4, October–December 2012 URI: https://id.erudit.org/iderudit/1028836ar DOI: https://doi.org/10.7202/1028836ar See table of contents Publisher(s) Association pour l'avancement des sciences et des techniques de la documentation (ASTED) ISSN 0315-2340 (print) 2291-8949 (digital) Explore this journal Cite this article Kembellec, G. & Scopsi, C. (2012). Étude comparée de quatre logiciels de gestion de références bibliographiques libres ou gratuits. Documentation et bibliothèques, 58(4), 187–197. https://doi.org/10.7202/1028836ar Article abstract This article is the result of the analysis of various bibliographic reference management tools, especially those that are free. The use of editorial tools by bibliographic editors has evolved rapidly since 2007. But, until recently, free software has fallen short when it comes to ergonomics or use. The functional and technical panorama offered by free software is the result of the comparison of JabRef, Mendeley Desktop, BibDesk and Zotero software undertaken in January 2012 by two research professors affiliated with the Institut national français des techniques de la documentation (INTD).

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Documentation et bibliothegraveques

Eacutetude compareacutee de quatre logiciels de gestion de reacutefeacuterencesbibliographiques libres ou gratuitsA Comparative Review of Four Free Reference ManagementSoftwareEstudio comparado de cuatro programas de gestioacuten dereferencias bibliograacuteficas libres o gratuitasGeacuterald Kembellec and Claire Scopsi

Volume 58 Number 4 OctoberndashDecember 2012

URI httpsideruditorgiderudit1028836arDOI httpsdoiorg1072021028836ar

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Publisher(s)Association pour lavancement des sciences et des techniques de ladocumentation (ASTED)

ISSN0315-2340 (print)2291-8949 (digital)

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Cite this articleKembellec G amp Scopsi C (2012) Eacutetude compareacutee de quatre logiciels de gestionde reacutefeacuterences bibliographiques libres ou gratuits Documentation etbibliothegraveques 58(4) 187ndash197 httpsdoiorg1072021028836ar

Article abstractThis article is the result of the analysis of various bibliographic referencemanagement tools especially those that are free The use of editorial tools bybibliographic editors has evolved rapidly since 2007 But until recently freesoftware has fallen short when it comes to ergonomics or use The functionaland technical panorama offered by free software is the result of thecomparison of JabRef Mendeley Desktop BibDesk and Zotero softwareundertaken in January 2012 by two research professors affiliated with theInstitut national franccedilais des techniques de la documentation (INTD)

MMMmjaMHMMK Eacutetude compareacutee dequatre i ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ j logiciels de gestion de reacutefeacuterences p ^ p ^ i ^ ^ ^ l bibliographiques libres ou gratuits

GEacuteRAgraveLD KEMBELLEC Laboratoire Paragraphe Universiteacute Paris 8 Courriel geraldkembelleccnamfr

CLAIRE SCOPSI Laboratoire Dicen Conservatoire National desArts et Meacutetiers Courriel clairescbpsicnamfr

REacuteSUMEacute | ABSTRACTS | REacuteSUME

Cet article reacutesulte dune reacuteflexion sur leslt outils de gestion de reacutefeacuteshyrences bibliographiques particuliegraverement ceux proposeacutes sous une forme libre ou gratuite Depuis 2007 linteraction des outils de reacutedaction avec les eacutediteurs bibliographiques eacutevolue rapidement mais par le passeacute les logiciels libres ont pu souffrir de la compashyraison en termes dergonomie ou dusage avec loffre proprieacutetaire Ce panorama fonctionnel et technique approfondi des solutions

libres ou gratuites actuelles reacutesulte de la comparaison des logiciels JabRef Mendeley Desktop BibDesk et Zotero meneacutee en janvier 2012 par deux enseignants chercheurs au sein de lInstitut national franccedilais des techniques de la documentation (INTD)

A Comparative Review of Four Free Reference Management Software

This article is the result of the analysis of various bibliographic reference management tools especially those that are free The use of editorial tools by bibliographic editors has evolved rapidly since 2007 But until recently free software has fallen short when

it comes to ergonomics or use The functional and technical panoshyrama offered by free software is the result of the comparison of JabRef Mendeley Desktop BibDesk and Zotero software undershytaken in January 2012 by two research professors affiliated with the Institut national franccedilais des techniques de la-documentation (INTD)

Estudio comparado de cuatro programas de gestion de referencias bibliogrdficas libres 0 gratuitas

Este articuio es elproducto de una reflexion sobre herramientas de gestion de referencias bibliogrdficas en especial las que se ofrecen en forma libre ogratuita Desde 2007 la interacciocircn que existe entre las herramientas de redacciocircn y los editores bibliogracircficos evolucionagrave racircpidamente aunque en el pasado estos programas libres hayagraven sido comparados en teacuterminosde eumlrgonomia ode uso con la oferta propietaria Esta perspectiva funciorial y teacutecnica que complementan las socirclucioneacutes libres 0 gratuitas actuates reacutesulta de la comparagraveciocircn de los programas JabRef Mendeley Desktop BibDesk y Zotero que dos profesores-investigadores del Instituto nacionalfranceacutesdeteacutecnicasdelagravedocumegraventaciocircn (INTD) llevaron a cabo en enero de 2012

Introduction

LEacuteTAPE DE LA COLLECTE DINFORMATION est CrU-

ciale dans le processus deacutecriture scientifique ou technique et elle peut ecirctre grandement faciliteacutee

par le choix dun outil numeacuterique deacutedieacute performant Un logiciel de gestion de reacutefeacuterences bibliographiques (LGRB) est un programme destineacute agrave eacutetablir trier et publier des listes de citations relatives agrave des revues des articles des sites Web des ouvrages principalement dans le cadre de publications scientifiques Ces logiciels sont notamment utiliseacutes par les eacutetudiants enseignants et chercheurs de lenseignement supeacuterieur ainsi que par les bibliotheacutecaires et documentalistes deacutes milieux acashydeacutemiques Ils sont geacuteneacuteralement composeacutes dune intershyface de gestion relieacutee agrave une base de donneacutees qui peut ecirctre alimenteacutee de diffeacuterentes faccedilons et se distinguent souvent par leur capaciteacute agrave importer et exporter les difshyfeacuterents formats informatiques reconnus

Bien sucircr une collection de notices bibliograshyphiques peut ecirctre conccedilue agrave laide dun eacutediteur de texte classique Quel avantage trouve-t-on alors agrave utiliser un outil deacutedieacute Tout dabord ce type de logiciel garanshytit linteacutegriteacute et la coheacutesiondes reacutefeacuterences dans la base de donneacutees car il fonctionne avec des regravegles strictes fondeacutees sur les normes en vigueur et eacutevite doublier des ponctuations ou des informations obligatoires Par ailshyleurs avec le temps une collection saccroicirct et la mainteshynir manuellement agrave laide dun eacutediteur de texte devient complexe il nest pas rare quune thegravese par exemple comporte une bibliographie de plusieurs milliers de lignes Enfin les outils bibliographiques integravegrent des fonctionnaliteacutes de classement de recherche voire dannotation dans la collection dont linteacuterecirct nest pas neacutegligeable

Dans ce panorama nous confronterons les diverses fonctionnaliteacutes de ces outils aux besoins des usagers ce qui situe notre eacutetude dans la continuiteacute des travaux de Zweifel (Zweifer20o8) et de Masur (Masur 2009) Il est inteacuteressant en effet de rendre compte de lavancement de leurs fonctionnaliteacutes depuis ces derniegraveres anneacutees et dajouter comme le suggeacuterait Carole Zweifel des laquo retours dexpeacuterience dutilisations reacuteellesraquo Le respect des standards et la compatibiliteacute sont agrave analyser avec un soin particulier car au-delagrave des fonctionnaliteacutes dusage

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la qualiteacute que perccediloit lutilisateur de ces logiciels deacutepend des formats dimport et dexport De son cocircteacute leacutetude de Masur (2009) concluait que les logiciels de gestion de reacutefeacuterences bibliographiques libres sont encore meacuteconshynus du grand public et peinent agrave se faire une place au sein du marcheacute

Une offre diversifieacutee

les logiciels de bibliographie les plus connus et usiteacutes sont RefWorks et Endnote (DeUOrso 2010) Ces produits de qualiteacute issus de socieacuteteacutes eacuteditrices traditionshynelles sont dun coucirct eacuteleveacute et leur licence dexploitashytion limite strictement leur usage et leur diffusion De plus leurs codes sources (maniegravere dont les logiciels sont eacutecrits) sont souvent proteacutegeacutes Il est donc impossible agrave lutilisateur pour des raisons contractuelles (lagrave licence dutilisation) et mateacuterielles (le blocage de laccegraves aux sources) de programmer des extensions1 Cela interdit donc ladaptation de loutil aux besoins speacutecifiques dun usager ou dune eacutequipe de recherche

Pour ces raisons nous examinons deux types de LGRB dune part loffre libre cest-agrave-dire une gamme de logiciels dont le code ouvert est modifiable et dont la licence autorise un usage et une diffusion gratuits dautre part des logiciels dont la licence reste proprieacuteshytaire mais dont lusage est gratuit Ces deux familles de logiciels sont en effet particuliegraverement priseacutees dans les milieux universitaires

Dans le premier temps de notre eacutetude nous preacuteshysentons les conditions de reacutealisation des essais et disshycutons les critegraveres que nous consideacuterons les plus pertishynents pour leacutevaluation de ces produits Ces critegraveres se regroupent en quatre domaines

bull les critegraveres laquonon techniques raquo concernant les licences et les conditions de deacuteveloppement du logiciel

bull les plateformes techniques supporteacutees bull la compatibiliteacute et le respect des formats

standards bull les fonctionnaliteacutes dusage

Dans un deuxiegraveme temps nous livrons les reacutesulshytats des essais de quatre logiciels JabRef Mendeley Desktop BibDesk et Zotero Une eacutetude reacutecente montre que ces produits sont priseacutes par les eacutetudiants les enseishygnants-chercheurs et les documentalistes de lenseigneshyment supeacuterieur (Kembellec 2012)

La troisiegraveme partie eacutevalue ladeacutequation de ces logishyciels aux attentes de trois cateacutegories dutilisateurs les eacutetudiants de 3e cycle les chercheurs et les bibliotheacuteshycaires ou documentalistes Leacutetude preacuteceacutedemment citeacutee montre en effet quEndNote (dans le monde proprieacuteshytaire) Zotero et Mendeley (dans le monde libre) sont particuliegraverement adapteacutes aux documentalistes tandis

que les pratiques des eacutetudiants et enseignants-chershycheurs sont influenceacutees par les usages deacutecriture scienshytifique Sans entrer dans les deacutetails en sciences techshyniques et meacutedecine lusage conjoint de Zotero avec JabRef ou Mendeley est freacutequent tandis quen sciences humaines et sociales Zotero est tregraves largement utiliseacute parfois en collaboration avec Mendeley

Les conditions de revaluation

Les critegraveres deacutevaluation

Les critegraveres fonctionnels sont au cœur de cette eacutevashyluation mais ils ne doivent pas occulter les critegraveres lieacutes agrave 1a licence qui deacuteterminent les usages autoriseacutes les conditions deacutevolution du produit et ceux lieacutes agrave larchishytecture qui conditionnent leur exploitation technique et leur peacuterenniteacute De par leur nature les logiciels de biblioshygraphie concernent des usages au domicile ou en milieu professionnel (laboratoire universiteacute bibliothegraveque) et peuvent ecirctre manipuleacutes par des usagers plus ou moins aguerris Enfin la seacutecuriteacute des donneacutees ne doit pas ecirctre perdue de vue certaines reacutefeacuterences bibliographiques accompagnent un chercheur pendant de longues anneacutees

Mode de deacuteveloppement et droits dfusages

Licence libre ou non

Les logiciels libres sont le plus souvent gratuits mais les logiciels gratuits ne sont pas forceacutement libres Les logiciels sous licence libre respectent les regravegles fonshydamentales eacutemises par Richard Stallman (1992) (libre accegraves au code source pour leacutetudier et le modifier libre usage y compris en situation professionnelle ou comshymerciale libre diffusion - y compris payante - du logishyciel lui-mecircme ou dune version modifieacutee) et sont partishyculiegraverement adapteacutes au domaine de lenseignement et de la recherche Procircnant le respect des standards ils sont appreacutecieacutes dans les laboratoires en raison de leur adaptabiliteacute ils peuvent en outre ecirctre diffuseacutes aupregraves de collaborateurs et deacutetudiants ou sur les postes dun Service Commun de Documentation en toute leacutegaliteacute et sans paiement de redevance

Il existe eacutegalement dans le domaine bibliograshyphique des logiciels dont les licences ne sont pas libres mais dont lusage est gratuit Nous nous inteacuteressons agrave ces produits tout en eacutemettant les reacuteserves dusage car si leur utilisation individuelle est libre de droits leur diffusion (par exemple sur les postes dun centre de ressources) est le plus souvent interdite et laccegraves et la modification du code source sont rarement autoriseacutes Il est donc important de prendre connaissance des termes de la licence et de ne pas deacuteduire de sa gratuiteacute quun logiciel est dutilisation libre

Une extension est un laquo greffon raquo logiciel cest-agrave-dire un morceau de programme venant eacutelargir les fonctionnaliteacutes du logiciel

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Caracteacuteristiques de la structure de deacuteveloppement

Les logiciels libres peuvent ecirctre publieacutes par une socieacuteteacute eacuteditrice ou par une communauteacute libre Comme pour les logiciels proprieacutetaires il est preacutefeacuterable de veacuterishyfier en consultant les sites et forums de la communauteacute En effet une communauteacute active a une plus grande capaciteacute agrave produire de nouvelles versions et garantit un logiciel peacuterenne

Si limage dun deacuteveloppement collaboratif est souvent associeacutee au libre et fortement deacutefendue par Richard Stallman (Stallman 1992) la reacutealiteacute est plus nuanceacutee (Jullien et Zimmerman 2005 Bergquist et Ljungberg 2001) Il nest pas rare quun eacutediteur ou une communauteacute limite ou refuse les contributions des usagers pour preacuteserver luniteacute et la qualiteacute du produit Dans ce cas il sera toujours possible agrave lusager de modishyfier le logiciel et de diffuser ces modifications sans que ces eacutevolutions soient reacuteinteacutegreacutees au logiciel dorigine

Certains logiciels libres dont le deacuteveloppement est tregraves controcircleacute sont structureacutes de faccedilon a accepter des modules additionnels (greffons ou add-on) deacuteveloppeacutes par les Usagers sans ecirctre inteacutegreacutes dans leacute code du logiciel principal Ces modules ne sont pas toujours valideacutes par la communauteacute ou leacutediteur et sont parfois diffuseacutes sous dautres plateformes Il faut les choisir et les tester avec soin mais ce proceacutedeacute offre des possibiliteacutes dextension du logiciel

Architecture logicielle

Lourd Leacuteger Hybride

Le terme laquo client lourd raquo fait reacutefeacuterence agrave une intershyface homme-machine individuelle permettant de piloter une base de connaissances locale ou distante Le code de lapplication sexeacutecute sur une machine locale ou sur un serveur dapplications apregraves avoir eacuteteacute chargeacute en meacutemoire Ce code peut neacutecessiter une compilation preacutealable Nous nous inteacuteresserons dans un premier temps agrave ces LGRB que lon installe sur une station de travail Dans un deuxiegraveme temps nous aborderons les laquo Rich Internet Applications (RIA) raquo heacutebergeacutees sur un serveur Web et utiliseacutees au travers dun navigateur (on parle aussi de laquo client leacuteger raquo)

Enfin il existe un mode laquo hybride raquo car certains LGRB occupent une place agrave mi-chemin entre le client lourd et le RIA Il sagit le plus souvent de greffons pour navigateurs Web qui prennent en charge le glanage dinformations par deacutetection de meacutetadonneacutees embarshyqueacutees dans une page Web ou le moissonnage et limport massif depuis un deacutepocirct de documents

Cette question a une incidence sur le deacuteploiement et lutilisation des outils Le logiciel lourd neacutecessitant une installation poste par poste le deacuteploiement et la mise agrave jour sur le lieu de travail doivent ecirctre organi-

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ses surtout dans les structures qui nautorisent pas les droits dinstallation aux collaborateurs Les RIA nont pas cet inconveacutenient puisquil suffit de connaicirctre lURL de lapplication et de disposer dun identifiant pour lutiliser depuis nimporte quel poste connecteacute agrave Intershynet Cest un avantage pour les utilisateurs nomades qui utilisent diffeacuterents ordinateurs (les eacutetudiants dans une bibliothegraveque ou une salle de ressources informatiques par exemple)

Les logiciels hybrides comportent un eacuteleacutement actif installeacute sur le poste de travail Comme les logiciels lourds cet eacuteleacutement doit ecirctre deacuteployeacute localement et le niveau de seacutecuriteacute du navigateur doit ecirctre parameacutetreacute de faccedilon agrave autoriser son exeacutecution

Stockage des donneacutees

Le mode de stockage des donneacutees importeacutees peut eacutegalement diffeacuterer Certains logiciels stockent les inforshymations dans un fichier dit laquo agrave plat raquo cest-agrave-dire dans un fichier texte structureacute selon un format speacutecifique Les diffeacuterents eacuteleacutements sont alors seacutepareacutes par des caracshytegraveres deacutetermineacutes (point-virgule tabulation) ou encashydreacutes par des balises XML Dautres outils utilisent une base de donneacutees relationnelle (MySQL par exemple) ce qui permet de manipuler les donneacutees avec un logiciel dadministration de bases de donneacutees standard Cela peut faciliter lexploitation des donneacutees (la sauvegarde) leur versement dans un logiciel documentaire ou leur migration vers unautre outil bibliographique

Interopeacuterabiliteacute et respect des standards

La compatibiliteacute des LGRB avec les plateformes de diffusion cest-agrave-dire leur capaciteacute agrave importer et exporshyter des bibliographies normeacutees est un critegravere essentiel de leacutevaluation Ainsi bien quinvisibles pour lutilisateur les structures des donneacutees sont repeacuterables par des logishyciels adapteacutes (Poupeau 2011) mais aussi par les moteurs de recherche22 Ces meacutetadonneacutees sont dites laquo exposeacutees raquo ou laquoglanablesraquo sil existe une ou plusieurs meacutethodes de valoriser les contenus pour un systegraveme informatique tiers Les formats dexposition Web de notices testeacutes sont les suivants

bull le BibTEX format de bibliographie pour leacutecrishyture scientifique associeacute agrave leacutecriture au format LaTEX- i

bull le Dublin Core sous forme de meacutetadonneacutees aux formats RDFa ou Microformats (Poupeau 2011)

bull le format COinS (Trainor et Price 2010 Van de Sompel 2001) de la norme Z39-883 bullbullbull

bull les informations DOI (Lupovici 1998)

2 La nouvelle mouture de lalgorithme de Google laquo Panda raquo se base principalement sur ces donneacutees descriptives pour juger de la qualiteacute dune page Web

3 Voir le blogue dEmmanuelle Bermegraves de la BnF lthttpwwwfigoblogorgdocu-mentii3iphpgt acceacutedeacute le 1er septembre 2012

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Les formats

Les fonctionnaliteacutes eacutetudieacutees sont limport et lexport de notices ainsi que la compatibiliteacute avec les traitements de texte

bull Le logiciel doit ecirctre capable dimporter des bibliographies ou des collections complegravetes preacuteshyformateacutees par dautres LGRB sans perte ni corshyruption de donneacutees

bull Il est indispensable de pouvoir exporter tout ou partie de la base de notices dans un ou plusieurs formats en respectant les normes en vigueur

bull Il est important de pouvoir verser directement des reacutefeacuterences bibliographiques dans son traiteshyment de texte

Les LGBR proposent parfois la gestion des doushyblons (qui garantit lagrave qualiteacute de la base) et la deacutetection derreur de typage documentaire (repeacuterage deacuteleacutements manifestement manquants pour un type de document comme le numeacutero de page dans un article de revue)

Fonctionnaliteacutes dusage

Pour retrouver les reacutefeacuterences correspondant aux citations et auteurs lutilisateur peut souhaiter annoter sa base de citations ou effectuer des classements par sujet Une base indexeacutee offre la possibiliteacute dutiliser des filtres de recherche

Pour des travaux collaboratifs la possibiliteacute de parshytager sa bibliothegraveque de citations est une option indisshypensable Cette fonctionnaliteacute est parfois offerte sous la forme dun reacutepliquacirct de la base de connaissance sur un serveur Internet Cette option permet eacutegalement de saushyvegarder sa base bibliographique

Les logiciels eacutevalueacutes

JabRef (lthttpjabrefsourceforgenetgt)

JabRef est une interface graphique de gestion qui permet de maintenir exclusivement des bibliographies au format BibTEX Ce logiciel est multiplateforme car deacuteveloppeacute en Java Cette programmation autorise donc une compatibiliteacute maximale en termes de systegravemes dexploitation Ainsi le portage de ce logiciel se fera aussi bien sur MAC OS et Windows que sur Linux

Le projet JabRef est neacute de la rencontre de Morten O Alver et Nizar Batada Le premier avait deacuteveloppeacute JBibtexManager et le second BibKeeper La premiegravere version de JabRef neacutee de la fusion des deux logiciels a eacuteteacute diffuseacutee en 2003 Le nom JabRef signifie pour Java a pour Alver b pour Batada et Ref pour Reacutefeacuterence Ce projet libre a rapidement connu un franc succegraves dans la sphegravere delagrave recherche universitaireLes eacutediteurs de sysshytegravemes dexploitation libres lont inteacutegreacute dans de nomshybreuses versions de Linux depuis 2007

Mendeiey Desktop (lthttp wwwmendeieycomgt)

Mendeiey Desktop est un logiciel installeacute localeshyment sur le disque dur de lordinateur Cette applicashytion est speacutecialiseacutee en gestion bibliographique et permet eacutegalement de partager des reacutefeacuterences agrave travers son intershyface Web

Mendeiey Ltd est une socieacuteteacute londonienne La preshymiegravere mouture du logiciel eacuteppnyme a eacuteteacute publieacutee en 2008 Cette solution est gratuite mais nest pas de type laquo Open Source raquo et lextension de stockage en ligne est payante De nouvelles fonctionnaliteacutes sont preacutevues sous forme dextensions payantes comme Mendeiey Institushytional Edition pour les eacutetablissements denseignement supeacuterieur

Bib Desk (lthttpbibdesksourceforgenetgt)

BibDesk est une solution logicielle libre et gratuite qui permet de creacuteer geacuterer et utiliser des donneacutees biblioshygraphiques au format BibTEX Ce programme doteacute dune interface graphique claire et efficace nest disposhynible que pour les ordinateurs Apple

Lanceacute publiquement en 2002 BibDesk est en deacuteveshyloppement continu depuis cette date Bibdesk est un exemple de logiciel libre supporteacute par de nombreux ccedilontributeurs gracircce agrave la plateforme Sourceforge Agrave lorishygine le deacuteveloppeur eacutetait Michael McCracken une grande partie du code a eacuteteacute eacutecrite par Adam Maxwell et Christiaan Hofmacircn Disponible directement agrave partir de SourceForge il est actuellement livreacute avec la distribushytion de TEX MacTEX

Zotero le module du navigateur Firefox (lthttpwwwzoteroorggt)

Zotero est un module logiciel (plug-in) deacuteveloppeacute par le Center for History and New Media de la George Mason University Zotero est agrave part dans le panorama des LGRB car ce module sexeacutecute au sein ducirc navigashyteur Firefox dont il est une composante optionnelle Zotero permet de saisir manuellement des notices au sein dune base locale de les classer et de leacutes exporter sous diffeacuterents formats bibliographiques

La premiegravere version de Zotero a eacuteteacute mise agrave la disshyposition des utilisateurs en octobre 2006 en tant que greffon logiciel pour le navigateur Web Firefox (Laskowski) Depuis une tregraves importante communauteacute internationale sest regroupeacutee pour participer agrave la creacuteashytion de styles bibliographiques Depuis janvier 2011 il existe une version de type logiciel lourd de Zotero laquo standalone Zotero raquo comportant les mecircmes fonctionshynaliteacutes sans neacutecessiter lusage de Firefox

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Protocole de test

Lorsque cela eacutetait possible ces quatre logiciels ont eacuteteacute testeacutes dans les environnements suivants

bull Mac OS X sur un MacBook Pro eacutequipeacute de MS Office 2008 et 2011 LyX Texstudio TexWorks et OpenOffice

bull un ordinateur portable reacutecent eacutequipeacute de Windows 7 MS Office 2007 LyX et OpenOffice

Pour les logiciels compatibles avec le glanage de notices bibliographiques sur les pages Web nous avons deacuteposeacute un fichier HTML bien formeacute avec des notices au format laquo Web de donneacutees raquo sur un site Internet de test Gracircce agrave cette URL nous pouvons juger de la compatibishyliteacute du logiciel avec la navigation en mode glanage dinshyformations Nous avons eacutegalement testeacute la compatibiliteacute des logiciels avec les meacutetadonneacutees associeacutees aux docushyments Pour y parvenir nous proposons aux logiciels de charger un panel de documents scientifiques au format PDF Le corpus est composeacute de fichiers PDF bien formeacutes et correctement annoteacutes gracircce agrave des meacutetadonneacutees au format XMP4

Cet acronyme signifie extensible Metadata Platform plateforme de meacutetadonneacutees extensible Il sagit dun standard proposeacute par Adobe pour inteacutegrer des meacutetadonshyneacutees agrave des fichiers de type PDF

Reacutesultats

Les reacutesultats de la comshyparaison sont preacutesenteacutes ici de faccedilon seacutequentielle pour les quatre logiciels

JabRef

Formats dimport de JabRef

JabRef importe principashylement les notices gracircce agrave des fichiers BibTEX et BibTEXML mais aussi RIS et Refer Bien que ce logiciel sappuie sur une interface graphique son moteur peut ecirctre alimenteacute en ligne de commande Cette opeacuteration peut trouver son inteacuterecirct lors de traitements par lot en shell script Les adeptes de la ligne de commande tels les amateurs de Linux seront particuliegraverement inteacuteresseacutes par cette possibiliteacute de charger des bibliographies issues de divers fichiers aux formats diffeacuterents

Formats dexport de JabRef

Les principaux formats dexport normes supporteacutes sont le RIS le MODS le RDF ((Poupeau 2011) Outre ces quelques formats dexport classiques (Figure 1) JabRef offre la possibiliteacute de se connecter agrave une base de donneacutees et dexporter sa bibliographie sous MySQL Cette possishybiliteacute est particuliegraverement attractive apregraves un moissonshynage ou un glanage intensif dinformation avec export en format norme Le processus est donc presque autoshymatiseacute entre la navigation avec le module de Firefox Zotero et la geacuteneacuteration dune base de connaissances de tous les articles inteacuteressants sur un sujet Il suffit pour cela de configurer une connexion agrave un serveur MySQL local ou distant

Fonctionnaliteacutes de JabRef

Pour les reacutedacteurs en sciences dites dures lutishylisation de LaTEX et lusage de BibTEX avec un fichier bien formaliseacute forment un preacuterequis implicite pour soushymettre des articles dans la plupart des revues JabRef offre lopportuniteacute de formaliser des bibliographies de maniegravere tregraves stricte Si les champs obligatoires ne sont pas renseigneacutes ou sont mal renseigneacutes le logiciel le signale de maniegravere claire par un point rouge Un autre

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avantage de ce logiciel est quil est gratuit et sinstalle facishylement Toulin Chazelas et Palencia (2008) preacutesentent JabRef comme compatible avec plusieurs traitements de texte dont MS Word via le format RTF La suite de bureautique la plus compatible est OpenOfrke et sa version redevenue libre LibreOffice JabRef est capable de geacuteneacuterer une bibliographie au format OpenDocument (ods) le format du tableur de LibreOfshyfice pour ensuite limporter dans le traitement de texte Ce nest que depuis janvier 2011 et la version 27 becircta du logishyciel quun deacutebut de compatishybiliteacute avec Word de MS Office se concreacutetise autrement que par un export RTF5 Il semble quavec quelques manipulashytions de configuration JabRef soit compatible avec MS Word directement en mode insertion

Une autre fonctionnashyliteacute de JabRef deacutecrite par les auteurs du logiciel permet dinscrire ses propres meacutetadonneacutees dans les fichiers PDF gracircce agrave la technologie XMP Gracircce agrave ces meacutetashydonneacutees les chercheurs peuvent eacutechanger des fichiers annoteacutes et enrichis de mots cleacutes et de commentaires Ainsi les chercheurs ont accegraves non seulement au docushyment primaire et agrave sa notice mais aussi aux annotations et meacutetadonneacutees ajouteacutees par leurs collegravegues

Le point faible de ce logiciel reacuteside dans sa meacutediocre interaction avec les outils de traitement de texte En effet une phase dexport en XML OpenDocument est neacutecessaire pour importer les citations dans MS Word et cette manipulation nest pas anodine pour un utilisashyteur non aguerri Cependant comme son usage est claishyrement orienteacute pour le couple BibTEX LaTEX lincon-fort reste mineur Son point fort est la souplesse dutishylisation ladaptabiliteacute mais eacutegalement la rigueur de creacuteation de fichier BibTcX

Mendeley Desktop

Formats dimport de Mendeley Desktop

Mendeley Desktop permet dimporter directement les meacutetadonneacutees depuis les documents notamment les fichiers PDF Les autres formats dimport sont le Ovid le RIS le BibTEX le EndNote XML le TXT (texte brut) mais aussi et cest un avantage la base Sqlite du module Zotero de Firefox

Formats dexport de Mendeley Desktop

Mendeley propose de creacuteer des bibliographies sous divers formats libres et proprieacutetaires Les plus usiteacutes sont le BibTEX RIS texte brut XML Zotero (zotero sqlite) PDF Il est possible de copiercoller des citations vers BibTEX directement de Mendeley par le presse-papier du systegraveme dexploitation Mendeley propose eacutegalement un module de reacutedaction de citation agrave inteacuteshygrer directement dans Word et Open Office sous forme dune barre doutils

5 lthttpjabrefsourceforgenetrevisionhistoryphpgt consulteacute le 1er septembre 2012

Fonctionnaliteacutes de Mendeley Desktop

Le logiciel offre la possibiliteacute de partager des reacutefeacuteshyrences et les fichiers associeacutes au sein de librairies

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partageacutees entre plusieurs utilisateurs dun mecircme groupe Dans ce cadre lespace de stockage est limiteacute agrave 500 meacutega-octets par compte Les groupes ne peuvent pas accueillir plus de 10 participants par collection parshytageacutee ou laquo Shared Collection raquo dans ce cadre la deacutetecshytion des doublons nest pas geacutereacutee Des options payantes permettent daugmenter lespace de stockage Mendeley permet de partager ses reacutefeacuterences et les documents attashycheacutes ainsi que les meacutetadonneacutees personnaliseacutees Ce logishyciel offre une gestion des fichiers de type PDF capable de lire les meacutetadonneacutees des documents On peut donc geacuteneacuterer les notices bibliographiques depuis les docushyments Cette commoditeacute neacutecessite tout de mecircme une relecture systeacutematique En effet selon les eacutediteurs de textes et les modegraveles fournis par les organisateurs de confeacuterences lorganisation des meacutetadonneacutees peut ecirctre alteacutereacutee Mendeley est compatible avec les logiciels MS Word et OpenOmce nous avons pu tester le module pour Word 2008 et 2011 qui autorise linsertion de reacutefeacuteshyrences dans le texte et leacutedition de la bibliographie

Lextension laquo bookmarklet raquo une fois inteacutegreacutee au navigateur permet de deacutetecter les notices au format COinS et de les importer dans Mendeley agrave la condition davoir un compte en ligne

Dun point de vue fonctionnel un eacuteleacutement tregraves appreacuteciable est la possibiliteacute dannoter un document PDF au sein mecircme du logiciel qui reacutealise la bibliograshyphie Dans lexemple expliciteacute par la capture (Figure 2)

le document de lauteur Dinet a pu ecirctre annoteacute (1) et reacuteutishyliseacute ulteacuterieurement En effet au cours de la lecture nous avions pu surligner (2) les passages cleacutes et annoter le document gracircce agrave Mendeley Desktop Par la suite la note apparaicirct comme un post-it flotshytant dans le document pregraves de son point dancrage (3)

Bibdesk

Plateforme dexeacutecution et format dimport unique

Leacutediteur graphique BibDesk nest disponible que sur plateshyforme Apple Il est deacutedieacute aux bibliographies LaTEX cest-agrave-dire au format BibTEX et ne gegravere donc que les fichiers agrave extensionbib Linterface est simple La Figure 3 montre leacutedition dun article avec sur la partie de droite les hypershyliens (2) et la bibliothegraveque numeacuterique (1) ougrave larticle est officiellement reacutefeacuterenceacute Les

auteurs sont eacutegalement clairement identifieacutes en bas agrave droite (3) La partie de gauche est reacuteserveacutee aux meacutetashydonneacutees de larticle dont les mots cleacutes qui revecirctent une importance particuliegravere (4)

Formats dexport de BibDesk

Le premier et principal format dexport de BibDesk est bien sucircr le BibTEX Utiliser un logiciel limite les posshysibiliteacutes derreur agrave la compilation du document LaTEX qui par exemple exige que tous les caractegraveres accenshytueacutes soient reformateacutes pour ecirctre valides et cette option de laquo nettoyage raquo nest pas neacutegligeable lors de la compishylation dune thegravese comportant plus dune centaine de citations Un temps conseacutequent de deacutebogage peut ainsi ecirctre gagneacute BibDesk propose eacutegalement dexporter des notices bibliographiques ou des bibliographies comshyplegravetes dans les formats RIS et COinS dans un site Web par BibDesk

Fonctionnaliteacutes compleacutementaires de BibDesk

Le logiciel ne sarrecircte pas agrave leacutedition des notices contenues dans une bibliographie au format LaTEX il integravegre en outre un systegraveme dauto completion des mots cleacutes et des fonctionnaliteacutes de classement laquo intelshyligent raquo gracircce agrave ces mecircmes mots cleacutes Le classement

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s effectue eacutegalement agrave partir de filtres sur des opeacuterateurs de type laquo est raquo ou laquo contient raquo et peut sappliquer sur nimshyporte quel champs BibTEX par exemple lauteur le titre ou les mots cleacutes Dans lexemple de la Figure 4 les eacuteleacutements (1) repreacutesentent les champs laquo tester raquo avec 1 laquo opeacuterateur raquo (2) et les laquo arguments raquo (3) Cela peut ecirctre traduit en langage naturel par laquo creacuteation dun groupe filtrant les documents comportant les mots cleacutes ACM et CCS raquo

BibDesk possegravede son propre moteur dindexation auquel il est possible dapshypliquer des regravegles de classeshyment en groupes intelligents Le moteur de recherche de BibDesk permet danalyser la structure des fichiers biblioshygraphiques au format BibTEX ainsi que bon nombre de bases de connaissances preacutedeacutefinies Parmi ces bases de connaissances citons

bull des sites dont laccegraves en consultation est gratuit comme ACM (meta donneacutees et reacutesumeacutes en accegraves libre) arXiv CiteULike Google Scholar IACR (Cryptologie)

bull des sites accessibles par abonnement comme IEEE Xplore MathSciNet Project Euclid Sprin-gerLink Zentralblatt Math

bull les sites respectant les normes bibliographiques BibTEX COinS HCite cette option permet dutiliser BibDesk comme navigateur Web deacutedieacute agrave la recherche scientifique et dinseacuterer agrave la voleacutee les notices neacutecessaires agrave leacutetablissement dune bibliographie

BibDesk possegravede une interface de navigation Web qui propose la deacutetection de notices bibliographiques au format OpenURL Il est ainsi possible dinseacuterer direcshytement les citations dans la base de notices dun simple clic sur le bouton laquo importer raquo

Depuis janvier 2011 la communauteacute Bibdesk propose un module qui permet dutiliser BibDesk avec le traitement de texte MS Word pour inseacuterer dynamishyquement des citations et geacuteneacuterer la bibliographie dun document

Zotero

Formats dimport de Zotero

Bien sucircr la capaciteacute de Zotero agrave deacutetecter un docushyment ou une notice deacutependra de lexposition des meacuteta-

donneacutees Il faut agrave minima que le document soit deacutecrit de maniegravere correcte en Dublin Core sur la page XHTML Les reacutesultats visibles agrave lœil cest-agrave-dire les liens vers les ressources sont ainsi accompagneacutes par des meacuteta-donneacutees descriptives normaliseacutees Zotero est agrave mecircme de comprendre ces meacutetadonneacutees et de les proposer agrave lusager soit en import massif soit en ne seacutelectionnant que les documents inteacuteressant le chercheur Les notices glaneacutees peuvent ensuite ecirctre eacutediteacutees trieacutees et classeacutees Un moteur de recherche inteacutegreacute permet dacceacuteder intuishytivement au catalogue ainsi reacutealiseacute

Formats dexport de Zotero

Zotero permet lexport de tout ou partie de sa base de citations aux formats RIS BibTEX RDF Refer et MODS Il est possible de copier une reacutefeacuterence dans le presse-papier pour ensuite la coller dans son traitement de texte favori en tant queacuteleacutement de bibliographie ou texte formateacute Il existe un module dinteacutegration pour MS Word qui permet limport formateacute depuis Zotero

Fonctionnaliteacutes de Zotero

Notons que Zotero permet la geacuteneacuteration de fichiers au format BibTEX Il semble que le gros avantage de Zotero soit de pouvoir deacutetecter intelligemment aussi bien les reacutefeacuterences bibliographiques que les documents eux-mecircmes Zotero offre donc une chaicircne de producshytion quasi automatiseacutee allant de la deacutetection ou limport jusquagrave la geacuteneacuteration de bibliographies en de nombreux styles et sous de nombreux formats Il est compatible avec Word lautre outil de production scientifique et il est mecircme possible dexporter une citation biblio-

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graphique par un simple laquo cliquer deacuteplacer raquo vers un eacutediteur ou un client de messagerie Sous Word 2008 et 2011 (MAC OS) un portage a eacuteteacute proposeacute pour inseacuterer des citations depuis Zotero et geacuteneacuterer dynamiquement la bibliographie avec quelques styles

Ce module possegravede eacutegalement un moteur de recherche inteacutegreacute permettant de parcourir les reacutefeacuterences enregistreacutees dans la base de lutilisateur Le reacuteel inteacuterecirct de Zotero est de proposer la possibiliteacute de deacutetecter sur le Web des ressources documentaires de diffeacuterents types et denregistrer en masse des notices bibliographiques gracircce aux meacutetadonneacutees exposeacutees par le site Web

Ici agrave lissue dune requecircte sur Google Scholar la reacuteponse est constitueacutee deacuteleacutements bibliographiques deacutetectables seacutepareacutement Licocircne Zotero de la barre de navigation signale la preacutesence de multiples entreacutees En cliquant sur cette icocircne une fenecirctre dalerte propose denregistrer une ou plusieurs notices dans la base (Figure 5)

Zotero permet eacutegalement au navigateur de deacutetecshyter et denregistrer un eacuteleacutement isoleacute comme la page pershysonnelle dun chercheur offrant la lecture de son dernier article Sil sagit dun document unique deacutecrit sur une page Web le module preacutecisera le type du document (un article un livre ou une videacuteo) lors de sa deacutetection en affichant une icocircne agrave droite dans la barre de navigation (par exemple un livre un chapitre un article dencycloshypeacutedie sera symboliseacute par un petit livre bleu)

Linterface de Zotero est inteacutegreacutee agrave Mozilla Firefox et peut sactiver agrave tout moment en cliquant sur le logo Zotero en bas agrave droite du navigateur Dans la Figure 6 sur la gauche (1) les collections sont classeacutees dans la

laquo Bibliothegraveque raquo qui repreacuteshysente lensemble des notices bibliographiques Au centre (2) il est possible de visuashyliser lensemble des articles composant une collection Un encart (3) permet de visualishyser et deacutediter les informations formant la notice relative agrave un document Longlet (4) offre la possibiliteacute dafficher les mots cleacutes potentiellement associeacutes agrave la fiche Comme ces champs sont rarement renseigneacutes il est possible de les choisir soi-mecircme Cette option est preacuteshycieuse pour ceux qui deacutesirent filtrer les articles par mots cleacutes gracircce au moteur inteacutegreacute (5) En cas dexport dune biblioshygraphie les mots cleacutes seront eacutegalement exporteacutes

La force du logiciel est dautoriser la creacuteation et lexport de bibliographies aux

formats deacutediteurs de textes les plus reacutepandus De plus Zotero offre une mise en forme bibliographique adapshytable au domaine de recherche de lutilisateur voire mecircme au type de revue gracircce agrave un vaste panel de styles bibliographiques pour les traitements de texte Depuis janvier 2012 Zotero existe eacutegalement sous forme de logiciel indeacutependant ce qui noblige plus agrave utiliser Firefox

Quel LGRB pour quel usage

Pour connaicirctre les pratiques en matiegravere de creacuteashytion assisteacutee de bibliographies nous nous reacutefeacuterons agrave une enquecircte reacutealiseacutee en deacutecembre 2011 (Kembellec 2012) aupregraves dun panel dutilisateurs de 195 personnes Le groupe est constitueacute de conservateurs et de docushymentalistes de Services Communs de Documentation duniversiteacutes parisiennes denseignants chercheurs en matheacutematiques informatique sciences de la comshymunication et mecircme dun maicirctre de confeacuterences en lettres ayant fait sa thegravese en LaTEX (bien que ces prashytiques soient moins reacutepandues hors des sciences dures et des domaines techniques) Ils ont eacuteteacute interrogeacutes sur la maniegravere dont ils eacutecrivaient leurs bibliographies et les reacuteponses montrent que les usages et pratiques divergent selon les profils dutilisateurs mais aussi selon le type de sciences de rattachement

En STM BibTeX est souvent imposeacute comme format de bibliographie par les revues et eacutediteurs scientishyfiques Pour geacuterer leur bibliographie les chercheurs en sciences dures utilisent pour plus de la moitieacute dentre eux un logiciel deacutedieacute souvent JabRef ou Mendeley en

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collaboration avec Zotero Un usage conjoint de Zotero avec un autre outil permet de repeacuterer et denregistrer les notices depuis Internet puis de geacuterer la bibliographie avec un logiciel deacutedieacute En meacutedecine le format biblioshygraphique Ovid associeacute agrave MS Word pour leacutecriture geacutereacute par Mendeley est une alternative reconnue Nous proshyposons donc en sciences dures (sauf meacutedecine) lusage de JabRef ou BibDesk si lon preacutefegravere eacutecrire sous LaTEX Dans le cas dune pratique deacutecriture sous Ms Word il faut preacutefeacuterer Zotero ou Mendeley

En SHS les documents scientifiques eacutetant essentielshylement reacutedigeacutes avec des traitements de texte classiques les outils deacutedieacutes agrave LaTEX sont hors de propos Mecircme sils commencent agrave devenir compatibles mieux vaut privileacuteshygier des logiciels eacuteprouveacutes tels que Zotero ou Mendeley Cependant ceux qui preacutesentent des travaux agrave la mise en page avanceacutee avec des polices de caractegravere inteacutegrant des caractegraveres de langues mortes ou rares preacutefeacutereront parfois LaTEX Dans ce cas preacutecis assez rare lusage de JabRef ou BibDesk peut ecirctre utile

Dans les centres de documentation les usagers de linformation bibliographique sont souvent deacutejagrave eacutequipeacutes dun LGRB souvent payant comme EndNote Cela ne les empecircche pas de connaicirctre et dutiliser Zotero en compleacutement

Leacutetude montre que toutes les cateacutegories dusashygers (enseignants eacutetudiants documentalistes) utilisent souvent Zotero en association avec un autre logiciel Parmi les logiciels libres ou gratuits Zotero a semble-t-il le monopole de deacutetection des notices bibliograshyphiques et Mendeley celui de la gestion des bibliograshyphies Cependant avec larriveacutee du Zotero autonome (standalone) nous allons peut-ecirctre assister agrave leacutemershygence dun monopole

Conclusion

De plus en plus de solutions libres et gratuites de gestion de bibliographies sont opeacuterationnelles et les logishyciels proprieacutetaires nont plus le monopole de la qualiteacute en ce domaine Il existe donc un vrai choix de logishyciels selon le systegraveme dexploitation et le format biblioshygraphique Comme le faisait remarquer Carole Zweifel (2008) ces logiciels preacutesentent autant sinon plus dinshynovations fonctionnelles que les produits payants Car avec leacutevolution des usages tels le Web 20 et le Web seacutemantique les creacuteateurs de ces produits en sont les premiers usagers Parmi toutes ces applications libres les chercheurs devraient trouver un logiciel offrant une compatibiliteacute satisfaisante en matiegravere dimport dexport de deacutetection et de pratique collaborative

Il est tout agrave fait possible dutiliser les compatibishyliteacutes de formats entre les logiciels pour effectuer une veille technologique une recherche et un formatage norme depuis divers logiciels Par exemple le greffon de Firefox Zotero est particuliegraverement indiqueacute pour glaner

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des notices exposeacutees sur Internet Ensuite les fiches seront exporteacutees au format BibTEX ou RIS dans JabRef Bibdesk ou Mendeley Le fichier dexport enbib ou autre contenant la bibliographie pourra eacutegalement ecirctre exporteacute vers une interface Internet riche (RIA) qui sera accessible depuis nimporte quel poste nomade eacutequipeacute dInternet et dun navigateur Notons que presque tous les logiciels lourds (Mendeley) ou hybride (Zotero) posshysegravedent une plateforme de sauvegarde ou de synchronishysation en ligne qui peut parfois eacutegalement servir de base communautaire Le chaicircnage logiciel requiert une cershytaine expertise rapidement acquise par la manipulation Mais pour ceux qui souhaitent un minimum de manishypulation et une tranquilliteacute desprit sur la qualiteacute de leur bibliographie JabRef est le bon compromis car la posshysibiliteacute de deacutetecter et de manipuler les meacutetadonneacutees des articles au format PDF rend son usage simple et convishyvial De plus les formats dimport-export eacutetant devenus compatibles avec tous les environnements son usage ne se cantonne plus agrave creacuteer des bibliographies pour les eacutedishyteurs OpenOffice et LaTEX

Agrave la question peut on trouver une alternative seacuterieuse aux logiciels de gestion bibliographique laquo proshyfessionnels raquo payants la reacuteponse est claire oui bien sucircr Il existe maintenant des programmes de qualiteacute adapteacutes agrave chaque speacutecialiteacute scientifique mais aussi en accord avec les sensibiliteacutes individuelles face aux diffeacuteshyrents modegraveles eacuteconomiques de distribution reg

Sources consulteacutees

Bergquist M and J Ljungberg 2001 The Power of Gifts Organizshying Social Relationships in Open Source Communities Inforshymation Systems Journal 11 (4) 305-320

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Kembellec G 2012 Technologie et pratiques bibliographiques assoshycieacutees agrave leacutecriture scientifique en milieu universitaire En ligne lthttphalarchives-0uvertesfrhal-00661550gt (consulteacute le ier septembre 2012)

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Lupovici C 1998 Le Digital Object Identifier Bulletin des biblioshythegraveques de France 43 (3) 49-54

Masur R 2009 Eacutetude sur la valorisation des logiciels de gestion de reacutefeacuterences bibliographiques (LGRB) dans le milieu des bibliothegraveques universitaires romandes et sur les avantages et limites du plug-in Zotero Genegraveve Haute eacutecole de gestion de Genegraveve (HEG-GE) En ligne lthttpdocreroch

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lmphp Url=iooo4i92009iii2i42i4i-PATDB_2ioipdfgt (consulteacute le 1er septembre 2012)

Poupeau G 2011 Microformats RDF microdata repreacutesenter le contenu dune page Web Documentaliste-Sciences de Vlnjor-mation 48 4) 33

mdashbull RDF La grammaire universelle des machines Documentashyliste-Sciences de lInformation 4 (4) 31 bull

Stallman R 1992 Why Software Should Be Free Software Ownershyship and Intellectual Property Rights 31 En ligne lthttp wwwgnuorgphilpsophyshouldbefreeenhtmlgt (consulteacute le 14 septembre 2012)

Toulin S M Ghazelas and F Palencia 2009 JabRef outil de gestion de donneacutees bibliographiques utilisation avantages et inconveacutenients E-migrinter (3) 58-63

Trainor C and J Price 2010 Chapter 4 The Future of OpenURL Linking Adaptation and Expansion Library Technology

Reports46(7) 27-33 Van deSompel H 2001 Generalizing the OpenURL Framework

Beyond References to Scholarly Works The Bison-Futeacute Model D-lib 7 (78) En ligne lthttpwwwdliborgdlibjulyoi vandesompelo7vandesompelhtmlgt (consulteacute le Ier septembre 2012)

Zweifel C 2008 Logiciels de gestion deacute references bibliograshyphiques Citons le Libre Reumlssi Revue eacutelectronique suisse deacute science de linformation 7 Eh ligne lthttpwwwressich nodei47gt (consulteacute le 14 septembre 2012)

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Page 2: Étude comparée de quatre logiciels de gestion de

MMMmjaMHMMK Eacutetude compareacutee dequatre i ^ ^ ^ ^ ^ ^ ^ j logiciels de gestion de reacutefeacuterences p ^ p ^ i ^ ^ ^ l bibliographiques libres ou gratuits

GEacuteRAgraveLD KEMBELLEC Laboratoire Paragraphe Universiteacute Paris 8 Courriel geraldkembelleccnamfr

CLAIRE SCOPSI Laboratoire Dicen Conservatoire National desArts et Meacutetiers Courriel clairescbpsicnamfr

REacuteSUMEacute | ABSTRACTS | REacuteSUME

Cet article reacutesulte dune reacuteflexion sur leslt outils de gestion de reacutefeacuteshyrences bibliographiques particuliegraverement ceux proposeacutes sous une forme libre ou gratuite Depuis 2007 linteraction des outils de reacutedaction avec les eacutediteurs bibliographiques eacutevolue rapidement mais par le passeacute les logiciels libres ont pu souffrir de la compashyraison en termes dergonomie ou dusage avec loffre proprieacutetaire Ce panorama fonctionnel et technique approfondi des solutions

libres ou gratuites actuelles reacutesulte de la comparaison des logiciels JabRef Mendeley Desktop BibDesk et Zotero meneacutee en janvier 2012 par deux enseignants chercheurs au sein de lInstitut national franccedilais des techniques de la documentation (INTD)

A Comparative Review of Four Free Reference Management Software

This article is the result of the analysis of various bibliographic reference management tools especially those that are free The use of editorial tools by bibliographic editors has evolved rapidly since 2007 But until recently free software has fallen short when

it comes to ergonomics or use The functional and technical panoshyrama offered by free software is the result of the comparison of JabRef Mendeley Desktop BibDesk and Zotero software undershytaken in January 2012 by two research professors affiliated with the Institut national franccedilais des techniques de la-documentation (INTD)

Estudio comparado de cuatro programas de gestion de referencias bibliogrdficas libres 0 gratuitas

Este articuio es elproducto de una reflexion sobre herramientas de gestion de referencias bibliogrdficas en especial las que se ofrecen en forma libre ogratuita Desde 2007 la interacciocircn que existe entre las herramientas de redacciocircn y los editores bibliogracircficos evolucionagrave racircpidamente aunque en el pasado estos programas libres hayagraven sido comparados en teacuterminosde eumlrgonomia ode uso con la oferta propietaria Esta perspectiva funciorial y teacutecnica que complementan las socirclucioneacutes libres 0 gratuitas actuates reacutesulta de la comparagraveciocircn de los programas JabRef Mendeley Desktop BibDesk y Zotero que dos profesores-investigadores del Instituto nacionalfranceacutesdeteacutecnicasdelagravedocumegraventaciocircn (INTD) llevaron a cabo en enero de 2012

Introduction

LEacuteTAPE DE LA COLLECTE DINFORMATION est CrU-

ciale dans le processus deacutecriture scientifique ou technique et elle peut ecirctre grandement faciliteacutee

par le choix dun outil numeacuterique deacutedieacute performant Un logiciel de gestion de reacutefeacuterences bibliographiques (LGRB) est un programme destineacute agrave eacutetablir trier et publier des listes de citations relatives agrave des revues des articles des sites Web des ouvrages principalement dans le cadre de publications scientifiques Ces logiciels sont notamment utiliseacutes par les eacutetudiants enseignants et chercheurs de lenseignement supeacuterieur ainsi que par les bibliotheacutecaires et documentalistes deacutes milieux acashydeacutemiques Ils sont geacuteneacuteralement composeacutes dune intershyface de gestion relieacutee agrave une base de donneacutees qui peut ecirctre alimenteacutee de diffeacuterentes faccedilons et se distinguent souvent par leur capaciteacute agrave importer et exporter les difshyfeacuterents formats informatiques reconnus

Bien sucircr une collection de notices bibliograshyphiques peut ecirctre conccedilue agrave laide dun eacutediteur de texte classique Quel avantage trouve-t-on alors agrave utiliser un outil deacutedieacute Tout dabord ce type de logiciel garanshytit linteacutegriteacute et la coheacutesiondes reacutefeacuterences dans la base de donneacutees car il fonctionne avec des regravegles strictes fondeacutees sur les normes en vigueur et eacutevite doublier des ponctuations ou des informations obligatoires Par ailshyleurs avec le temps une collection saccroicirct et la mainteshynir manuellement agrave laide dun eacutediteur de texte devient complexe il nest pas rare quune thegravese par exemple comporte une bibliographie de plusieurs milliers de lignes Enfin les outils bibliographiques integravegrent des fonctionnaliteacutes de classement de recherche voire dannotation dans la collection dont linteacuterecirct nest pas neacutegligeable

Dans ce panorama nous confronterons les diverses fonctionnaliteacutes de ces outils aux besoins des usagers ce qui situe notre eacutetude dans la continuiteacute des travaux de Zweifel (Zweifer20o8) et de Masur (Masur 2009) Il est inteacuteressant en effet de rendre compte de lavancement de leurs fonctionnaliteacutes depuis ces derniegraveres anneacutees et dajouter comme le suggeacuterait Carole Zweifel des laquo retours dexpeacuterience dutilisations reacuteellesraquo Le respect des standards et la compatibiliteacute sont agrave analyser avec un soin particulier car au-delagrave des fonctionnaliteacutes dusage

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la qualiteacute que perccediloit lutilisateur de ces logiciels deacutepend des formats dimport et dexport De son cocircteacute leacutetude de Masur (2009) concluait que les logiciels de gestion de reacutefeacuterences bibliographiques libres sont encore meacuteconshynus du grand public et peinent agrave se faire une place au sein du marcheacute

Une offre diversifieacutee

les logiciels de bibliographie les plus connus et usiteacutes sont RefWorks et Endnote (DeUOrso 2010) Ces produits de qualiteacute issus de socieacuteteacutes eacuteditrices traditionshynelles sont dun coucirct eacuteleveacute et leur licence dexploitashytion limite strictement leur usage et leur diffusion De plus leurs codes sources (maniegravere dont les logiciels sont eacutecrits) sont souvent proteacutegeacutes Il est donc impossible agrave lutilisateur pour des raisons contractuelles (lagrave licence dutilisation) et mateacuterielles (le blocage de laccegraves aux sources) de programmer des extensions1 Cela interdit donc ladaptation de loutil aux besoins speacutecifiques dun usager ou dune eacutequipe de recherche

Pour ces raisons nous examinons deux types de LGRB dune part loffre libre cest-agrave-dire une gamme de logiciels dont le code ouvert est modifiable et dont la licence autorise un usage et une diffusion gratuits dautre part des logiciels dont la licence reste proprieacuteshytaire mais dont lusage est gratuit Ces deux familles de logiciels sont en effet particuliegraverement priseacutees dans les milieux universitaires

Dans le premier temps de notre eacutetude nous preacuteshysentons les conditions de reacutealisation des essais et disshycutons les critegraveres que nous consideacuterons les plus pertishynents pour leacutevaluation de ces produits Ces critegraveres se regroupent en quatre domaines

bull les critegraveres laquonon techniques raquo concernant les licences et les conditions de deacuteveloppement du logiciel

bull les plateformes techniques supporteacutees bull la compatibiliteacute et le respect des formats

standards bull les fonctionnaliteacutes dusage

Dans un deuxiegraveme temps nous livrons les reacutesulshytats des essais de quatre logiciels JabRef Mendeley Desktop BibDesk et Zotero Une eacutetude reacutecente montre que ces produits sont priseacutes par les eacutetudiants les enseishygnants-chercheurs et les documentalistes de lenseigneshyment supeacuterieur (Kembellec 2012)

La troisiegraveme partie eacutevalue ladeacutequation de ces logishyciels aux attentes de trois cateacutegories dutilisateurs les eacutetudiants de 3e cycle les chercheurs et les bibliotheacuteshycaires ou documentalistes Leacutetude preacuteceacutedemment citeacutee montre en effet quEndNote (dans le monde proprieacuteshytaire) Zotero et Mendeley (dans le monde libre) sont particuliegraverement adapteacutes aux documentalistes tandis

que les pratiques des eacutetudiants et enseignants-chershycheurs sont influenceacutees par les usages deacutecriture scienshytifique Sans entrer dans les deacutetails en sciences techshyniques et meacutedecine lusage conjoint de Zotero avec JabRef ou Mendeley est freacutequent tandis quen sciences humaines et sociales Zotero est tregraves largement utiliseacute parfois en collaboration avec Mendeley

Les conditions de revaluation

Les critegraveres deacutevaluation

Les critegraveres fonctionnels sont au cœur de cette eacutevashyluation mais ils ne doivent pas occulter les critegraveres lieacutes agrave 1a licence qui deacuteterminent les usages autoriseacutes les conditions deacutevolution du produit et ceux lieacutes agrave larchishytecture qui conditionnent leur exploitation technique et leur peacuterenniteacute De par leur nature les logiciels de biblioshygraphie concernent des usages au domicile ou en milieu professionnel (laboratoire universiteacute bibliothegraveque) et peuvent ecirctre manipuleacutes par des usagers plus ou moins aguerris Enfin la seacutecuriteacute des donneacutees ne doit pas ecirctre perdue de vue certaines reacutefeacuterences bibliographiques accompagnent un chercheur pendant de longues anneacutees

Mode de deacuteveloppement et droits dfusages

Licence libre ou non

Les logiciels libres sont le plus souvent gratuits mais les logiciels gratuits ne sont pas forceacutement libres Les logiciels sous licence libre respectent les regravegles fonshydamentales eacutemises par Richard Stallman (1992) (libre accegraves au code source pour leacutetudier et le modifier libre usage y compris en situation professionnelle ou comshymerciale libre diffusion - y compris payante - du logishyciel lui-mecircme ou dune version modifieacutee) et sont partishyculiegraverement adapteacutes au domaine de lenseignement et de la recherche Procircnant le respect des standards ils sont appreacutecieacutes dans les laboratoires en raison de leur adaptabiliteacute ils peuvent en outre ecirctre diffuseacutes aupregraves de collaborateurs et deacutetudiants ou sur les postes dun Service Commun de Documentation en toute leacutegaliteacute et sans paiement de redevance

Il existe eacutegalement dans le domaine bibliograshyphique des logiciels dont les licences ne sont pas libres mais dont lusage est gratuit Nous nous inteacuteressons agrave ces produits tout en eacutemettant les reacuteserves dusage car si leur utilisation individuelle est libre de droits leur diffusion (par exemple sur les postes dun centre de ressources) est le plus souvent interdite et laccegraves et la modification du code source sont rarement autoriseacutes Il est donc important de prendre connaissance des termes de la licence et de ne pas deacuteduire de sa gratuiteacute quun logiciel est dutilisation libre

Une extension est un laquo greffon raquo logiciel cest-agrave-dire un morceau de programme venant eacutelargir les fonctionnaliteacutes du logiciel

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Caracteacuteristiques de la structure de deacuteveloppement

Les logiciels libres peuvent ecirctre publieacutes par une socieacuteteacute eacuteditrice ou par une communauteacute libre Comme pour les logiciels proprieacutetaires il est preacutefeacuterable de veacuterishyfier en consultant les sites et forums de la communauteacute En effet une communauteacute active a une plus grande capaciteacute agrave produire de nouvelles versions et garantit un logiciel peacuterenne

Si limage dun deacuteveloppement collaboratif est souvent associeacutee au libre et fortement deacutefendue par Richard Stallman (Stallman 1992) la reacutealiteacute est plus nuanceacutee (Jullien et Zimmerman 2005 Bergquist et Ljungberg 2001) Il nest pas rare quun eacutediteur ou une communauteacute limite ou refuse les contributions des usagers pour preacuteserver luniteacute et la qualiteacute du produit Dans ce cas il sera toujours possible agrave lusager de modishyfier le logiciel et de diffuser ces modifications sans que ces eacutevolutions soient reacuteinteacutegreacutees au logiciel dorigine

Certains logiciels libres dont le deacuteveloppement est tregraves controcircleacute sont structureacutes de faccedilon a accepter des modules additionnels (greffons ou add-on) deacuteveloppeacutes par les Usagers sans ecirctre inteacutegreacutes dans leacute code du logiciel principal Ces modules ne sont pas toujours valideacutes par la communauteacute ou leacutediteur et sont parfois diffuseacutes sous dautres plateformes Il faut les choisir et les tester avec soin mais ce proceacutedeacute offre des possibiliteacutes dextension du logiciel

Architecture logicielle

Lourd Leacuteger Hybride

Le terme laquo client lourd raquo fait reacutefeacuterence agrave une intershyface homme-machine individuelle permettant de piloter une base de connaissances locale ou distante Le code de lapplication sexeacutecute sur une machine locale ou sur un serveur dapplications apregraves avoir eacuteteacute chargeacute en meacutemoire Ce code peut neacutecessiter une compilation preacutealable Nous nous inteacuteresserons dans un premier temps agrave ces LGRB que lon installe sur une station de travail Dans un deuxiegraveme temps nous aborderons les laquo Rich Internet Applications (RIA) raquo heacutebergeacutees sur un serveur Web et utiliseacutees au travers dun navigateur (on parle aussi de laquo client leacuteger raquo)

Enfin il existe un mode laquo hybride raquo car certains LGRB occupent une place agrave mi-chemin entre le client lourd et le RIA Il sagit le plus souvent de greffons pour navigateurs Web qui prennent en charge le glanage dinformations par deacutetection de meacutetadonneacutees embarshyqueacutees dans une page Web ou le moissonnage et limport massif depuis un deacutepocirct de documents

Cette question a une incidence sur le deacuteploiement et lutilisation des outils Le logiciel lourd neacutecessitant une installation poste par poste le deacuteploiement et la mise agrave jour sur le lieu de travail doivent ecirctre organi-

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ses surtout dans les structures qui nautorisent pas les droits dinstallation aux collaborateurs Les RIA nont pas cet inconveacutenient puisquil suffit de connaicirctre lURL de lapplication et de disposer dun identifiant pour lutiliser depuis nimporte quel poste connecteacute agrave Intershynet Cest un avantage pour les utilisateurs nomades qui utilisent diffeacuterents ordinateurs (les eacutetudiants dans une bibliothegraveque ou une salle de ressources informatiques par exemple)

Les logiciels hybrides comportent un eacuteleacutement actif installeacute sur le poste de travail Comme les logiciels lourds cet eacuteleacutement doit ecirctre deacuteployeacute localement et le niveau de seacutecuriteacute du navigateur doit ecirctre parameacutetreacute de faccedilon agrave autoriser son exeacutecution

Stockage des donneacutees

Le mode de stockage des donneacutees importeacutees peut eacutegalement diffeacuterer Certains logiciels stockent les inforshymations dans un fichier dit laquo agrave plat raquo cest-agrave-dire dans un fichier texte structureacute selon un format speacutecifique Les diffeacuterents eacuteleacutements sont alors seacutepareacutes par des caracshytegraveres deacutetermineacutes (point-virgule tabulation) ou encashydreacutes par des balises XML Dautres outils utilisent une base de donneacutees relationnelle (MySQL par exemple) ce qui permet de manipuler les donneacutees avec un logiciel dadministration de bases de donneacutees standard Cela peut faciliter lexploitation des donneacutees (la sauvegarde) leur versement dans un logiciel documentaire ou leur migration vers unautre outil bibliographique

Interopeacuterabiliteacute et respect des standards

La compatibiliteacute des LGRB avec les plateformes de diffusion cest-agrave-dire leur capaciteacute agrave importer et exporshyter des bibliographies normeacutees est un critegravere essentiel de leacutevaluation Ainsi bien quinvisibles pour lutilisateur les structures des donneacutees sont repeacuterables par des logishyciels adapteacutes (Poupeau 2011) mais aussi par les moteurs de recherche22 Ces meacutetadonneacutees sont dites laquo exposeacutees raquo ou laquoglanablesraquo sil existe une ou plusieurs meacutethodes de valoriser les contenus pour un systegraveme informatique tiers Les formats dexposition Web de notices testeacutes sont les suivants

bull le BibTEX format de bibliographie pour leacutecrishyture scientifique associeacute agrave leacutecriture au format LaTEX- i

bull le Dublin Core sous forme de meacutetadonneacutees aux formats RDFa ou Microformats (Poupeau 2011)

bull le format COinS (Trainor et Price 2010 Van de Sompel 2001) de la norme Z39-883 bullbullbull

bull les informations DOI (Lupovici 1998)

2 La nouvelle mouture de lalgorithme de Google laquo Panda raquo se base principalement sur ces donneacutees descriptives pour juger de la qualiteacute dune page Web

3 Voir le blogue dEmmanuelle Bermegraves de la BnF lthttpwwwfigoblogorgdocu-mentii3iphpgt acceacutedeacute le 1er septembre 2012

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Les formats

Les fonctionnaliteacutes eacutetudieacutees sont limport et lexport de notices ainsi que la compatibiliteacute avec les traitements de texte

bull Le logiciel doit ecirctre capable dimporter des bibliographies ou des collections complegravetes preacuteshyformateacutees par dautres LGRB sans perte ni corshyruption de donneacutees

bull Il est indispensable de pouvoir exporter tout ou partie de la base de notices dans un ou plusieurs formats en respectant les normes en vigueur

bull Il est important de pouvoir verser directement des reacutefeacuterences bibliographiques dans son traiteshyment de texte

Les LGBR proposent parfois la gestion des doushyblons (qui garantit lagrave qualiteacute de la base) et la deacutetection derreur de typage documentaire (repeacuterage deacuteleacutements manifestement manquants pour un type de document comme le numeacutero de page dans un article de revue)

Fonctionnaliteacutes dusage

Pour retrouver les reacutefeacuterences correspondant aux citations et auteurs lutilisateur peut souhaiter annoter sa base de citations ou effectuer des classements par sujet Une base indexeacutee offre la possibiliteacute dutiliser des filtres de recherche

Pour des travaux collaboratifs la possibiliteacute de parshytager sa bibliothegraveque de citations est une option indisshypensable Cette fonctionnaliteacute est parfois offerte sous la forme dun reacutepliquacirct de la base de connaissance sur un serveur Internet Cette option permet eacutegalement de saushyvegarder sa base bibliographique

Les logiciels eacutevalueacutes

JabRef (lthttpjabrefsourceforgenetgt)

JabRef est une interface graphique de gestion qui permet de maintenir exclusivement des bibliographies au format BibTEX Ce logiciel est multiplateforme car deacuteveloppeacute en Java Cette programmation autorise donc une compatibiliteacute maximale en termes de systegravemes dexploitation Ainsi le portage de ce logiciel se fera aussi bien sur MAC OS et Windows que sur Linux

Le projet JabRef est neacute de la rencontre de Morten O Alver et Nizar Batada Le premier avait deacuteveloppeacute JBibtexManager et le second BibKeeper La premiegravere version de JabRef neacutee de la fusion des deux logiciels a eacuteteacute diffuseacutee en 2003 Le nom JabRef signifie pour Java a pour Alver b pour Batada et Ref pour Reacutefeacuterence Ce projet libre a rapidement connu un franc succegraves dans la sphegravere delagrave recherche universitaireLes eacutediteurs de sysshytegravemes dexploitation libres lont inteacutegreacute dans de nomshybreuses versions de Linux depuis 2007

Mendeiey Desktop (lthttp wwwmendeieycomgt)

Mendeiey Desktop est un logiciel installeacute localeshyment sur le disque dur de lordinateur Cette applicashytion est speacutecialiseacutee en gestion bibliographique et permet eacutegalement de partager des reacutefeacuterences agrave travers son intershyface Web

Mendeiey Ltd est une socieacuteteacute londonienne La preshymiegravere mouture du logiciel eacuteppnyme a eacuteteacute publieacutee en 2008 Cette solution est gratuite mais nest pas de type laquo Open Source raquo et lextension de stockage en ligne est payante De nouvelles fonctionnaliteacutes sont preacutevues sous forme dextensions payantes comme Mendeiey Institushytional Edition pour les eacutetablissements denseignement supeacuterieur

Bib Desk (lthttpbibdesksourceforgenetgt)

BibDesk est une solution logicielle libre et gratuite qui permet de creacuteer geacuterer et utiliser des donneacutees biblioshygraphiques au format BibTEX Ce programme doteacute dune interface graphique claire et efficace nest disposhynible que pour les ordinateurs Apple

Lanceacute publiquement en 2002 BibDesk est en deacuteveshyloppement continu depuis cette date Bibdesk est un exemple de logiciel libre supporteacute par de nombreux ccedilontributeurs gracircce agrave la plateforme Sourceforge Agrave lorishygine le deacuteveloppeur eacutetait Michael McCracken une grande partie du code a eacuteteacute eacutecrite par Adam Maxwell et Christiaan Hofmacircn Disponible directement agrave partir de SourceForge il est actuellement livreacute avec la distribushytion de TEX MacTEX

Zotero le module du navigateur Firefox (lthttpwwwzoteroorggt)

Zotero est un module logiciel (plug-in) deacuteveloppeacute par le Center for History and New Media de la George Mason University Zotero est agrave part dans le panorama des LGRB car ce module sexeacutecute au sein ducirc navigashyteur Firefox dont il est une composante optionnelle Zotero permet de saisir manuellement des notices au sein dune base locale de les classer et de leacutes exporter sous diffeacuterents formats bibliographiques

La premiegravere version de Zotero a eacuteteacute mise agrave la disshyposition des utilisateurs en octobre 2006 en tant que greffon logiciel pour le navigateur Web Firefox (Laskowski) Depuis une tregraves importante communauteacute internationale sest regroupeacutee pour participer agrave la creacuteashytion de styles bibliographiques Depuis janvier 2011 il existe une version de type logiciel lourd de Zotero laquo standalone Zotero raquo comportant les mecircmes fonctionshynaliteacutes sans neacutecessiter lusage de Firefox

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Protocole de test

Lorsque cela eacutetait possible ces quatre logiciels ont eacuteteacute testeacutes dans les environnements suivants

bull Mac OS X sur un MacBook Pro eacutequipeacute de MS Office 2008 et 2011 LyX Texstudio TexWorks et OpenOffice

bull un ordinateur portable reacutecent eacutequipeacute de Windows 7 MS Office 2007 LyX et OpenOffice

Pour les logiciels compatibles avec le glanage de notices bibliographiques sur les pages Web nous avons deacuteposeacute un fichier HTML bien formeacute avec des notices au format laquo Web de donneacutees raquo sur un site Internet de test Gracircce agrave cette URL nous pouvons juger de la compatibishyliteacute du logiciel avec la navigation en mode glanage dinshyformations Nous avons eacutegalement testeacute la compatibiliteacute des logiciels avec les meacutetadonneacutees associeacutees aux docushyments Pour y parvenir nous proposons aux logiciels de charger un panel de documents scientifiques au format PDF Le corpus est composeacute de fichiers PDF bien formeacutes et correctement annoteacutes gracircce agrave des meacutetadonneacutees au format XMP4

Cet acronyme signifie extensible Metadata Platform plateforme de meacutetadonneacutees extensible Il sagit dun standard proposeacute par Adobe pour inteacutegrer des meacutetadonshyneacutees agrave des fichiers de type PDF

Reacutesultats

Les reacutesultats de la comshyparaison sont preacutesenteacutes ici de faccedilon seacutequentielle pour les quatre logiciels

JabRef

Formats dimport de JabRef

JabRef importe principashylement les notices gracircce agrave des fichiers BibTEX et BibTEXML mais aussi RIS et Refer Bien que ce logiciel sappuie sur une interface graphique son moteur peut ecirctre alimenteacute en ligne de commande Cette opeacuteration peut trouver son inteacuterecirct lors de traitements par lot en shell script Les adeptes de la ligne de commande tels les amateurs de Linux seront particuliegraverement inteacuteresseacutes par cette possibiliteacute de charger des bibliographies issues de divers fichiers aux formats diffeacuterents

Formats dexport de JabRef

Les principaux formats dexport normes supporteacutes sont le RIS le MODS le RDF ((Poupeau 2011) Outre ces quelques formats dexport classiques (Figure 1) JabRef offre la possibiliteacute de se connecter agrave une base de donneacutees et dexporter sa bibliographie sous MySQL Cette possishybiliteacute est particuliegraverement attractive apregraves un moissonshynage ou un glanage intensif dinformation avec export en format norme Le processus est donc presque autoshymatiseacute entre la navigation avec le module de Firefox Zotero et la geacuteneacuteration dune base de connaissances de tous les articles inteacuteressants sur un sujet Il suffit pour cela de configurer une connexion agrave un serveur MySQL local ou distant

Fonctionnaliteacutes de JabRef

Pour les reacutedacteurs en sciences dites dures lutishylisation de LaTEX et lusage de BibTEX avec un fichier bien formaliseacute forment un preacuterequis implicite pour soushymettre des articles dans la plupart des revues JabRef offre lopportuniteacute de formaliser des bibliographies de maniegravere tregraves stricte Si les champs obligatoires ne sont pas renseigneacutes ou sont mal renseigneacutes le logiciel le signale de maniegravere claire par un point rouge Un autre

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avantage de ce logiciel est quil est gratuit et sinstalle facishylement Toulin Chazelas et Palencia (2008) preacutesentent JabRef comme compatible avec plusieurs traitements de texte dont MS Word via le format RTF La suite de bureautique la plus compatible est OpenOfrke et sa version redevenue libre LibreOffice JabRef est capable de geacuteneacuterer une bibliographie au format OpenDocument (ods) le format du tableur de LibreOfshyfice pour ensuite limporter dans le traitement de texte Ce nest que depuis janvier 2011 et la version 27 becircta du logishyciel quun deacutebut de compatishybiliteacute avec Word de MS Office se concreacutetise autrement que par un export RTF5 Il semble quavec quelques manipulashytions de configuration JabRef soit compatible avec MS Word directement en mode insertion

Une autre fonctionnashyliteacute de JabRef deacutecrite par les auteurs du logiciel permet dinscrire ses propres meacutetadonneacutees dans les fichiers PDF gracircce agrave la technologie XMP Gracircce agrave ces meacutetashydonneacutees les chercheurs peuvent eacutechanger des fichiers annoteacutes et enrichis de mots cleacutes et de commentaires Ainsi les chercheurs ont accegraves non seulement au docushyment primaire et agrave sa notice mais aussi aux annotations et meacutetadonneacutees ajouteacutees par leurs collegravegues

Le point faible de ce logiciel reacuteside dans sa meacutediocre interaction avec les outils de traitement de texte En effet une phase dexport en XML OpenDocument est neacutecessaire pour importer les citations dans MS Word et cette manipulation nest pas anodine pour un utilisashyteur non aguerri Cependant comme son usage est claishyrement orienteacute pour le couple BibTEX LaTEX lincon-fort reste mineur Son point fort est la souplesse dutishylisation ladaptabiliteacute mais eacutegalement la rigueur de creacuteation de fichier BibTcX

Mendeley Desktop

Formats dimport de Mendeley Desktop

Mendeley Desktop permet dimporter directement les meacutetadonneacutees depuis les documents notamment les fichiers PDF Les autres formats dimport sont le Ovid le RIS le BibTEX le EndNote XML le TXT (texte brut) mais aussi et cest un avantage la base Sqlite du module Zotero de Firefox

Formats dexport de Mendeley Desktop

Mendeley propose de creacuteer des bibliographies sous divers formats libres et proprieacutetaires Les plus usiteacutes sont le BibTEX RIS texte brut XML Zotero (zotero sqlite) PDF Il est possible de copiercoller des citations vers BibTEX directement de Mendeley par le presse-papier du systegraveme dexploitation Mendeley propose eacutegalement un module de reacutedaction de citation agrave inteacuteshygrer directement dans Word et Open Office sous forme dune barre doutils

5 lthttpjabrefsourceforgenetrevisionhistoryphpgt consulteacute le 1er septembre 2012

Fonctionnaliteacutes de Mendeley Desktop

Le logiciel offre la possibiliteacute de partager des reacutefeacuteshyrences et les fichiers associeacutes au sein de librairies

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partageacutees entre plusieurs utilisateurs dun mecircme groupe Dans ce cadre lespace de stockage est limiteacute agrave 500 meacutega-octets par compte Les groupes ne peuvent pas accueillir plus de 10 participants par collection parshytageacutee ou laquo Shared Collection raquo dans ce cadre la deacutetecshytion des doublons nest pas geacutereacutee Des options payantes permettent daugmenter lespace de stockage Mendeley permet de partager ses reacutefeacuterences et les documents attashycheacutes ainsi que les meacutetadonneacutees personnaliseacutees Ce logishyciel offre une gestion des fichiers de type PDF capable de lire les meacutetadonneacutees des documents On peut donc geacuteneacuterer les notices bibliographiques depuis les docushyments Cette commoditeacute neacutecessite tout de mecircme une relecture systeacutematique En effet selon les eacutediteurs de textes et les modegraveles fournis par les organisateurs de confeacuterences lorganisation des meacutetadonneacutees peut ecirctre alteacutereacutee Mendeley est compatible avec les logiciels MS Word et OpenOmce nous avons pu tester le module pour Word 2008 et 2011 qui autorise linsertion de reacutefeacuteshyrences dans le texte et leacutedition de la bibliographie

Lextension laquo bookmarklet raquo une fois inteacutegreacutee au navigateur permet de deacutetecter les notices au format COinS et de les importer dans Mendeley agrave la condition davoir un compte en ligne

Dun point de vue fonctionnel un eacuteleacutement tregraves appreacuteciable est la possibiliteacute dannoter un document PDF au sein mecircme du logiciel qui reacutealise la bibliograshyphie Dans lexemple expliciteacute par la capture (Figure 2)

le document de lauteur Dinet a pu ecirctre annoteacute (1) et reacuteutishyliseacute ulteacuterieurement En effet au cours de la lecture nous avions pu surligner (2) les passages cleacutes et annoter le document gracircce agrave Mendeley Desktop Par la suite la note apparaicirct comme un post-it flotshytant dans le document pregraves de son point dancrage (3)

Bibdesk

Plateforme dexeacutecution et format dimport unique

Leacutediteur graphique BibDesk nest disponible que sur plateshyforme Apple Il est deacutedieacute aux bibliographies LaTEX cest-agrave-dire au format BibTEX et ne gegravere donc que les fichiers agrave extensionbib Linterface est simple La Figure 3 montre leacutedition dun article avec sur la partie de droite les hypershyliens (2) et la bibliothegraveque numeacuterique (1) ougrave larticle est officiellement reacutefeacuterenceacute Les

auteurs sont eacutegalement clairement identifieacutes en bas agrave droite (3) La partie de gauche est reacuteserveacutee aux meacutetashydonneacutees de larticle dont les mots cleacutes qui revecirctent une importance particuliegravere (4)

Formats dexport de BibDesk

Le premier et principal format dexport de BibDesk est bien sucircr le BibTEX Utiliser un logiciel limite les posshysibiliteacutes derreur agrave la compilation du document LaTEX qui par exemple exige que tous les caractegraveres accenshytueacutes soient reformateacutes pour ecirctre valides et cette option de laquo nettoyage raquo nest pas neacutegligeable lors de la compishylation dune thegravese comportant plus dune centaine de citations Un temps conseacutequent de deacutebogage peut ainsi ecirctre gagneacute BibDesk propose eacutegalement dexporter des notices bibliographiques ou des bibliographies comshyplegravetes dans les formats RIS et COinS dans un site Web par BibDesk

Fonctionnaliteacutes compleacutementaires de BibDesk

Le logiciel ne sarrecircte pas agrave leacutedition des notices contenues dans une bibliographie au format LaTEX il integravegre en outre un systegraveme dauto completion des mots cleacutes et des fonctionnaliteacutes de classement laquo intelshyligent raquo gracircce agrave ces mecircmes mots cleacutes Le classement

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s effectue eacutegalement agrave partir de filtres sur des opeacuterateurs de type laquo est raquo ou laquo contient raquo et peut sappliquer sur nimshyporte quel champs BibTEX par exemple lauteur le titre ou les mots cleacutes Dans lexemple de la Figure 4 les eacuteleacutements (1) repreacutesentent les champs laquo tester raquo avec 1 laquo opeacuterateur raquo (2) et les laquo arguments raquo (3) Cela peut ecirctre traduit en langage naturel par laquo creacuteation dun groupe filtrant les documents comportant les mots cleacutes ACM et CCS raquo

BibDesk possegravede son propre moteur dindexation auquel il est possible dapshypliquer des regravegles de classeshyment en groupes intelligents Le moteur de recherche de BibDesk permet danalyser la structure des fichiers biblioshygraphiques au format BibTEX ainsi que bon nombre de bases de connaissances preacutedeacutefinies Parmi ces bases de connaissances citons

bull des sites dont laccegraves en consultation est gratuit comme ACM (meta donneacutees et reacutesumeacutes en accegraves libre) arXiv CiteULike Google Scholar IACR (Cryptologie)

bull des sites accessibles par abonnement comme IEEE Xplore MathSciNet Project Euclid Sprin-gerLink Zentralblatt Math

bull les sites respectant les normes bibliographiques BibTEX COinS HCite cette option permet dutiliser BibDesk comme navigateur Web deacutedieacute agrave la recherche scientifique et dinseacuterer agrave la voleacutee les notices neacutecessaires agrave leacutetablissement dune bibliographie

BibDesk possegravede une interface de navigation Web qui propose la deacutetection de notices bibliographiques au format OpenURL Il est ainsi possible dinseacuterer direcshytement les citations dans la base de notices dun simple clic sur le bouton laquo importer raquo

Depuis janvier 2011 la communauteacute Bibdesk propose un module qui permet dutiliser BibDesk avec le traitement de texte MS Word pour inseacuterer dynamishyquement des citations et geacuteneacuterer la bibliographie dun document

Zotero

Formats dimport de Zotero

Bien sucircr la capaciteacute de Zotero agrave deacutetecter un docushyment ou une notice deacutependra de lexposition des meacuteta-

donneacutees Il faut agrave minima que le document soit deacutecrit de maniegravere correcte en Dublin Core sur la page XHTML Les reacutesultats visibles agrave lœil cest-agrave-dire les liens vers les ressources sont ainsi accompagneacutes par des meacuteta-donneacutees descriptives normaliseacutees Zotero est agrave mecircme de comprendre ces meacutetadonneacutees et de les proposer agrave lusager soit en import massif soit en ne seacutelectionnant que les documents inteacuteressant le chercheur Les notices glaneacutees peuvent ensuite ecirctre eacutediteacutees trieacutees et classeacutees Un moteur de recherche inteacutegreacute permet dacceacuteder intuishytivement au catalogue ainsi reacutealiseacute

Formats dexport de Zotero

Zotero permet lexport de tout ou partie de sa base de citations aux formats RIS BibTEX RDF Refer et MODS Il est possible de copier une reacutefeacuterence dans le presse-papier pour ensuite la coller dans son traitement de texte favori en tant queacuteleacutement de bibliographie ou texte formateacute Il existe un module dinteacutegration pour MS Word qui permet limport formateacute depuis Zotero

Fonctionnaliteacutes de Zotero

Notons que Zotero permet la geacuteneacuteration de fichiers au format BibTEX Il semble que le gros avantage de Zotero soit de pouvoir deacutetecter intelligemment aussi bien les reacutefeacuterences bibliographiques que les documents eux-mecircmes Zotero offre donc une chaicircne de producshytion quasi automatiseacutee allant de la deacutetection ou limport jusquagrave la geacuteneacuteration de bibliographies en de nombreux styles et sous de nombreux formats Il est compatible avec Word lautre outil de production scientifique et il est mecircme possible dexporter une citation biblio-

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graphique par un simple laquo cliquer deacuteplacer raquo vers un eacutediteur ou un client de messagerie Sous Word 2008 et 2011 (MAC OS) un portage a eacuteteacute proposeacute pour inseacuterer des citations depuis Zotero et geacuteneacuterer dynamiquement la bibliographie avec quelques styles

Ce module possegravede eacutegalement un moteur de recherche inteacutegreacute permettant de parcourir les reacutefeacuterences enregistreacutees dans la base de lutilisateur Le reacuteel inteacuterecirct de Zotero est de proposer la possibiliteacute de deacutetecter sur le Web des ressources documentaires de diffeacuterents types et denregistrer en masse des notices bibliographiques gracircce aux meacutetadonneacutees exposeacutees par le site Web

Ici agrave lissue dune requecircte sur Google Scholar la reacuteponse est constitueacutee deacuteleacutements bibliographiques deacutetectables seacutepareacutement Licocircne Zotero de la barre de navigation signale la preacutesence de multiples entreacutees En cliquant sur cette icocircne une fenecirctre dalerte propose denregistrer une ou plusieurs notices dans la base (Figure 5)

Zotero permet eacutegalement au navigateur de deacutetecshyter et denregistrer un eacuteleacutement isoleacute comme la page pershysonnelle dun chercheur offrant la lecture de son dernier article Sil sagit dun document unique deacutecrit sur une page Web le module preacutecisera le type du document (un article un livre ou une videacuteo) lors de sa deacutetection en affichant une icocircne agrave droite dans la barre de navigation (par exemple un livre un chapitre un article dencycloshypeacutedie sera symboliseacute par un petit livre bleu)

Linterface de Zotero est inteacutegreacutee agrave Mozilla Firefox et peut sactiver agrave tout moment en cliquant sur le logo Zotero en bas agrave droite du navigateur Dans la Figure 6 sur la gauche (1) les collections sont classeacutees dans la

laquo Bibliothegraveque raquo qui repreacuteshysente lensemble des notices bibliographiques Au centre (2) il est possible de visuashyliser lensemble des articles composant une collection Un encart (3) permet de visualishyser et deacutediter les informations formant la notice relative agrave un document Longlet (4) offre la possibiliteacute dafficher les mots cleacutes potentiellement associeacutes agrave la fiche Comme ces champs sont rarement renseigneacutes il est possible de les choisir soi-mecircme Cette option est preacuteshycieuse pour ceux qui deacutesirent filtrer les articles par mots cleacutes gracircce au moteur inteacutegreacute (5) En cas dexport dune biblioshygraphie les mots cleacutes seront eacutegalement exporteacutes

La force du logiciel est dautoriser la creacuteation et lexport de bibliographies aux

formats deacutediteurs de textes les plus reacutepandus De plus Zotero offre une mise en forme bibliographique adapshytable au domaine de recherche de lutilisateur voire mecircme au type de revue gracircce agrave un vaste panel de styles bibliographiques pour les traitements de texte Depuis janvier 2012 Zotero existe eacutegalement sous forme de logiciel indeacutependant ce qui noblige plus agrave utiliser Firefox

Quel LGRB pour quel usage

Pour connaicirctre les pratiques en matiegravere de creacuteashytion assisteacutee de bibliographies nous nous reacutefeacuterons agrave une enquecircte reacutealiseacutee en deacutecembre 2011 (Kembellec 2012) aupregraves dun panel dutilisateurs de 195 personnes Le groupe est constitueacute de conservateurs et de docushymentalistes de Services Communs de Documentation duniversiteacutes parisiennes denseignants chercheurs en matheacutematiques informatique sciences de la comshymunication et mecircme dun maicirctre de confeacuterences en lettres ayant fait sa thegravese en LaTEX (bien que ces prashytiques soient moins reacutepandues hors des sciences dures et des domaines techniques) Ils ont eacuteteacute interrogeacutes sur la maniegravere dont ils eacutecrivaient leurs bibliographies et les reacuteponses montrent que les usages et pratiques divergent selon les profils dutilisateurs mais aussi selon le type de sciences de rattachement

En STM BibTeX est souvent imposeacute comme format de bibliographie par les revues et eacutediteurs scientishyfiques Pour geacuterer leur bibliographie les chercheurs en sciences dures utilisent pour plus de la moitieacute dentre eux un logiciel deacutedieacute souvent JabRef ou Mendeley en

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collaboration avec Zotero Un usage conjoint de Zotero avec un autre outil permet de repeacuterer et denregistrer les notices depuis Internet puis de geacuterer la bibliographie avec un logiciel deacutedieacute En meacutedecine le format biblioshygraphique Ovid associeacute agrave MS Word pour leacutecriture geacutereacute par Mendeley est une alternative reconnue Nous proshyposons donc en sciences dures (sauf meacutedecine) lusage de JabRef ou BibDesk si lon preacutefegravere eacutecrire sous LaTEX Dans le cas dune pratique deacutecriture sous Ms Word il faut preacutefeacuterer Zotero ou Mendeley

En SHS les documents scientifiques eacutetant essentielshylement reacutedigeacutes avec des traitements de texte classiques les outils deacutedieacutes agrave LaTEX sont hors de propos Mecircme sils commencent agrave devenir compatibles mieux vaut privileacuteshygier des logiciels eacuteprouveacutes tels que Zotero ou Mendeley Cependant ceux qui preacutesentent des travaux agrave la mise en page avanceacutee avec des polices de caractegravere inteacutegrant des caractegraveres de langues mortes ou rares preacutefeacutereront parfois LaTEX Dans ce cas preacutecis assez rare lusage de JabRef ou BibDesk peut ecirctre utile

Dans les centres de documentation les usagers de linformation bibliographique sont souvent deacutejagrave eacutequipeacutes dun LGRB souvent payant comme EndNote Cela ne les empecircche pas de connaicirctre et dutiliser Zotero en compleacutement

Leacutetude montre que toutes les cateacutegories dusashygers (enseignants eacutetudiants documentalistes) utilisent souvent Zotero en association avec un autre logiciel Parmi les logiciels libres ou gratuits Zotero a semble-t-il le monopole de deacutetection des notices bibliograshyphiques et Mendeley celui de la gestion des bibliograshyphies Cependant avec larriveacutee du Zotero autonome (standalone) nous allons peut-ecirctre assister agrave leacutemershygence dun monopole

Conclusion

De plus en plus de solutions libres et gratuites de gestion de bibliographies sont opeacuterationnelles et les logishyciels proprieacutetaires nont plus le monopole de la qualiteacute en ce domaine Il existe donc un vrai choix de logishyciels selon le systegraveme dexploitation et le format biblioshygraphique Comme le faisait remarquer Carole Zweifel (2008) ces logiciels preacutesentent autant sinon plus dinshynovations fonctionnelles que les produits payants Car avec leacutevolution des usages tels le Web 20 et le Web seacutemantique les creacuteateurs de ces produits en sont les premiers usagers Parmi toutes ces applications libres les chercheurs devraient trouver un logiciel offrant une compatibiliteacute satisfaisante en matiegravere dimport dexport de deacutetection et de pratique collaborative

Il est tout agrave fait possible dutiliser les compatibishyliteacutes de formats entre les logiciels pour effectuer une veille technologique une recherche et un formatage norme depuis divers logiciels Par exemple le greffon de Firefox Zotero est particuliegraverement indiqueacute pour glaner

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des notices exposeacutees sur Internet Ensuite les fiches seront exporteacutees au format BibTEX ou RIS dans JabRef Bibdesk ou Mendeley Le fichier dexport enbib ou autre contenant la bibliographie pourra eacutegalement ecirctre exporteacute vers une interface Internet riche (RIA) qui sera accessible depuis nimporte quel poste nomade eacutequipeacute dInternet et dun navigateur Notons que presque tous les logiciels lourds (Mendeley) ou hybride (Zotero) posshysegravedent une plateforme de sauvegarde ou de synchronishysation en ligne qui peut parfois eacutegalement servir de base communautaire Le chaicircnage logiciel requiert une cershytaine expertise rapidement acquise par la manipulation Mais pour ceux qui souhaitent un minimum de manishypulation et une tranquilliteacute desprit sur la qualiteacute de leur bibliographie JabRef est le bon compromis car la posshysibiliteacute de deacutetecter et de manipuler les meacutetadonneacutees des articles au format PDF rend son usage simple et convishyvial De plus les formats dimport-export eacutetant devenus compatibles avec tous les environnements son usage ne se cantonne plus agrave creacuteer des bibliographies pour les eacutedishyteurs OpenOffice et LaTEX

Agrave la question peut on trouver une alternative seacuterieuse aux logiciels de gestion bibliographique laquo proshyfessionnels raquo payants la reacuteponse est claire oui bien sucircr Il existe maintenant des programmes de qualiteacute adapteacutes agrave chaque speacutecialiteacute scientifique mais aussi en accord avec les sensibiliteacutes individuelles face aux diffeacuteshyrents modegraveles eacuteconomiques de distribution reg

Sources consulteacutees

Bergquist M and J Ljungberg 2001 The Power of Gifts Organizshying Social Relationships in Open Source Communities Inforshymation Systems Journal 11 (4) 305-320

DellOrso F 2010 Bibliography Management Software Analysis and Comparison of Some Packages Text ES Burioni Ricerche Bibliografiche En ligne lthttpwwwburioniitforumdel-lorsobms-dasptextindexhtmlgt (consulteacute le 1er septembre 2012)

Jullien N and JB Zimmerman 2005 Peut-on envisager une eacutecoshylogie du logiciel libre favorable aux nuls Cahier de recherche Mocircle armoricain de recherche sur la socieacuteteacute de linformation et les usages dInternet (MARSOIN) (9-2005) En ligne lthttp wwwmarsouinorgspipphp article65gt (consulteacute le ier sepshytembre 2012)

Kembellec G 2012 Technologie et pratiques bibliographiques assoshycieacutees agrave leacutecriture scientifique en milieu universitaire En ligne lthttphalarchives-0uvertesfrhal-00661550gt (consulteacute le ier septembre 2012)

Laskowski T Center for History and New Media Launches Zotero Research Tool The George Mason University Gazette En ligne lthttpgazettegmueduarticles9088gt (consulteacute le ier sepshytembre 2012)

Lupovici C 1998 Le Digital Object Identifier Bulletin des biblioshythegraveques de France 43 (3) 49-54

Masur R 2009 Eacutetude sur la valorisation des logiciels de gestion de reacutefeacuterences bibliographiques (LGRB) dans le milieu des bibliothegraveques universitaires romandes et sur les avantages et limites du plug-in Zotero Genegraveve Haute eacutecole de gestion de Genegraveve (HEG-GE) En ligne lthttpdocreroch

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lmphp Url=iooo4i92009iii2i42i4i-PATDB_2ioipdfgt (consulteacute le 1er septembre 2012)

Poupeau G 2011 Microformats RDF microdata repreacutesenter le contenu dune page Web Documentaliste-Sciences de Vlnjor-mation 48 4) 33

mdashbull RDF La grammaire universelle des machines Documentashyliste-Sciences de lInformation 4 (4) 31 bull

Stallman R 1992 Why Software Should Be Free Software Ownershyship and Intellectual Property Rights 31 En ligne lthttp wwwgnuorgphilpsophyshouldbefreeenhtmlgt (consulteacute le 14 septembre 2012)

Toulin S M Ghazelas and F Palencia 2009 JabRef outil de gestion de donneacutees bibliographiques utilisation avantages et inconveacutenients E-migrinter (3) 58-63

Trainor C and J Price 2010 Chapter 4 The Future of OpenURL Linking Adaptation and Expansion Library Technology

Reports46(7) 27-33 Van deSompel H 2001 Generalizing the OpenURL Framework

Beyond References to Scholarly Works The Bison-Futeacute Model D-lib 7 (78) En ligne lthttpwwwdliborgdlibjulyoi vandesompelo7vandesompelhtmlgt (consulteacute le Ier septembre 2012)

Zweifel C 2008 Logiciels de gestion deacute references bibliograshyphiques Citons le Libre Reumlssi Revue eacutelectronique suisse deacute science de linformation 7 Eh ligne lthttpwwwressich nodei47gt (consulteacute le 14 septembre 2012)

DOCUMENTATION ET BIBLIOTHEgraveQUES | OCTOBRE bull DEacuteCEMBRE 2012 | 1 9 7

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Page 3: Étude comparée de quatre logiciels de gestion de

la qualiteacute que perccediloit lutilisateur de ces logiciels deacutepend des formats dimport et dexport De son cocircteacute leacutetude de Masur (2009) concluait que les logiciels de gestion de reacutefeacuterences bibliographiques libres sont encore meacuteconshynus du grand public et peinent agrave se faire une place au sein du marcheacute

Une offre diversifieacutee

les logiciels de bibliographie les plus connus et usiteacutes sont RefWorks et Endnote (DeUOrso 2010) Ces produits de qualiteacute issus de socieacuteteacutes eacuteditrices traditionshynelles sont dun coucirct eacuteleveacute et leur licence dexploitashytion limite strictement leur usage et leur diffusion De plus leurs codes sources (maniegravere dont les logiciels sont eacutecrits) sont souvent proteacutegeacutes Il est donc impossible agrave lutilisateur pour des raisons contractuelles (lagrave licence dutilisation) et mateacuterielles (le blocage de laccegraves aux sources) de programmer des extensions1 Cela interdit donc ladaptation de loutil aux besoins speacutecifiques dun usager ou dune eacutequipe de recherche

Pour ces raisons nous examinons deux types de LGRB dune part loffre libre cest-agrave-dire une gamme de logiciels dont le code ouvert est modifiable et dont la licence autorise un usage et une diffusion gratuits dautre part des logiciels dont la licence reste proprieacuteshytaire mais dont lusage est gratuit Ces deux familles de logiciels sont en effet particuliegraverement priseacutees dans les milieux universitaires

Dans le premier temps de notre eacutetude nous preacuteshysentons les conditions de reacutealisation des essais et disshycutons les critegraveres que nous consideacuterons les plus pertishynents pour leacutevaluation de ces produits Ces critegraveres se regroupent en quatre domaines

bull les critegraveres laquonon techniques raquo concernant les licences et les conditions de deacuteveloppement du logiciel

bull les plateformes techniques supporteacutees bull la compatibiliteacute et le respect des formats

standards bull les fonctionnaliteacutes dusage

Dans un deuxiegraveme temps nous livrons les reacutesulshytats des essais de quatre logiciels JabRef Mendeley Desktop BibDesk et Zotero Une eacutetude reacutecente montre que ces produits sont priseacutes par les eacutetudiants les enseishygnants-chercheurs et les documentalistes de lenseigneshyment supeacuterieur (Kembellec 2012)

La troisiegraveme partie eacutevalue ladeacutequation de ces logishyciels aux attentes de trois cateacutegories dutilisateurs les eacutetudiants de 3e cycle les chercheurs et les bibliotheacuteshycaires ou documentalistes Leacutetude preacuteceacutedemment citeacutee montre en effet quEndNote (dans le monde proprieacuteshytaire) Zotero et Mendeley (dans le monde libre) sont particuliegraverement adapteacutes aux documentalistes tandis

que les pratiques des eacutetudiants et enseignants-chershycheurs sont influenceacutees par les usages deacutecriture scienshytifique Sans entrer dans les deacutetails en sciences techshyniques et meacutedecine lusage conjoint de Zotero avec JabRef ou Mendeley est freacutequent tandis quen sciences humaines et sociales Zotero est tregraves largement utiliseacute parfois en collaboration avec Mendeley

Les conditions de revaluation

Les critegraveres deacutevaluation

Les critegraveres fonctionnels sont au cœur de cette eacutevashyluation mais ils ne doivent pas occulter les critegraveres lieacutes agrave 1a licence qui deacuteterminent les usages autoriseacutes les conditions deacutevolution du produit et ceux lieacutes agrave larchishytecture qui conditionnent leur exploitation technique et leur peacuterenniteacute De par leur nature les logiciels de biblioshygraphie concernent des usages au domicile ou en milieu professionnel (laboratoire universiteacute bibliothegraveque) et peuvent ecirctre manipuleacutes par des usagers plus ou moins aguerris Enfin la seacutecuriteacute des donneacutees ne doit pas ecirctre perdue de vue certaines reacutefeacuterences bibliographiques accompagnent un chercheur pendant de longues anneacutees

Mode de deacuteveloppement et droits dfusages

Licence libre ou non

Les logiciels libres sont le plus souvent gratuits mais les logiciels gratuits ne sont pas forceacutement libres Les logiciels sous licence libre respectent les regravegles fonshydamentales eacutemises par Richard Stallman (1992) (libre accegraves au code source pour leacutetudier et le modifier libre usage y compris en situation professionnelle ou comshymerciale libre diffusion - y compris payante - du logishyciel lui-mecircme ou dune version modifieacutee) et sont partishyculiegraverement adapteacutes au domaine de lenseignement et de la recherche Procircnant le respect des standards ils sont appreacutecieacutes dans les laboratoires en raison de leur adaptabiliteacute ils peuvent en outre ecirctre diffuseacutes aupregraves de collaborateurs et deacutetudiants ou sur les postes dun Service Commun de Documentation en toute leacutegaliteacute et sans paiement de redevance

Il existe eacutegalement dans le domaine bibliograshyphique des logiciels dont les licences ne sont pas libres mais dont lusage est gratuit Nous nous inteacuteressons agrave ces produits tout en eacutemettant les reacuteserves dusage car si leur utilisation individuelle est libre de droits leur diffusion (par exemple sur les postes dun centre de ressources) est le plus souvent interdite et laccegraves et la modification du code source sont rarement autoriseacutes Il est donc important de prendre connaissance des termes de la licence et de ne pas deacuteduire de sa gratuiteacute quun logiciel est dutilisation libre

Une extension est un laquo greffon raquo logiciel cest-agrave-dire un morceau de programme venant eacutelargir les fonctionnaliteacutes du logiciel

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Caracteacuteristiques de la structure de deacuteveloppement

Les logiciels libres peuvent ecirctre publieacutes par une socieacuteteacute eacuteditrice ou par une communauteacute libre Comme pour les logiciels proprieacutetaires il est preacutefeacuterable de veacuterishyfier en consultant les sites et forums de la communauteacute En effet une communauteacute active a une plus grande capaciteacute agrave produire de nouvelles versions et garantit un logiciel peacuterenne

Si limage dun deacuteveloppement collaboratif est souvent associeacutee au libre et fortement deacutefendue par Richard Stallman (Stallman 1992) la reacutealiteacute est plus nuanceacutee (Jullien et Zimmerman 2005 Bergquist et Ljungberg 2001) Il nest pas rare quun eacutediteur ou une communauteacute limite ou refuse les contributions des usagers pour preacuteserver luniteacute et la qualiteacute du produit Dans ce cas il sera toujours possible agrave lusager de modishyfier le logiciel et de diffuser ces modifications sans que ces eacutevolutions soient reacuteinteacutegreacutees au logiciel dorigine

Certains logiciels libres dont le deacuteveloppement est tregraves controcircleacute sont structureacutes de faccedilon a accepter des modules additionnels (greffons ou add-on) deacuteveloppeacutes par les Usagers sans ecirctre inteacutegreacutes dans leacute code du logiciel principal Ces modules ne sont pas toujours valideacutes par la communauteacute ou leacutediteur et sont parfois diffuseacutes sous dautres plateformes Il faut les choisir et les tester avec soin mais ce proceacutedeacute offre des possibiliteacutes dextension du logiciel

Architecture logicielle

Lourd Leacuteger Hybride

Le terme laquo client lourd raquo fait reacutefeacuterence agrave une intershyface homme-machine individuelle permettant de piloter une base de connaissances locale ou distante Le code de lapplication sexeacutecute sur une machine locale ou sur un serveur dapplications apregraves avoir eacuteteacute chargeacute en meacutemoire Ce code peut neacutecessiter une compilation preacutealable Nous nous inteacuteresserons dans un premier temps agrave ces LGRB que lon installe sur une station de travail Dans un deuxiegraveme temps nous aborderons les laquo Rich Internet Applications (RIA) raquo heacutebergeacutees sur un serveur Web et utiliseacutees au travers dun navigateur (on parle aussi de laquo client leacuteger raquo)

Enfin il existe un mode laquo hybride raquo car certains LGRB occupent une place agrave mi-chemin entre le client lourd et le RIA Il sagit le plus souvent de greffons pour navigateurs Web qui prennent en charge le glanage dinformations par deacutetection de meacutetadonneacutees embarshyqueacutees dans une page Web ou le moissonnage et limport massif depuis un deacutepocirct de documents

Cette question a une incidence sur le deacuteploiement et lutilisation des outils Le logiciel lourd neacutecessitant une installation poste par poste le deacuteploiement et la mise agrave jour sur le lieu de travail doivent ecirctre organi-

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ses surtout dans les structures qui nautorisent pas les droits dinstallation aux collaborateurs Les RIA nont pas cet inconveacutenient puisquil suffit de connaicirctre lURL de lapplication et de disposer dun identifiant pour lutiliser depuis nimporte quel poste connecteacute agrave Intershynet Cest un avantage pour les utilisateurs nomades qui utilisent diffeacuterents ordinateurs (les eacutetudiants dans une bibliothegraveque ou une salle de ressources informatiques par exemple)

Les logiciels hybrides comportent un eacuteleacutement actif installeacute sur le poste de travail Comme les logiciels lourds cet eacuteleacutement doit ecirctre deacuteployeacute localement et le niveau de seacutecuriteacute du navigateur doit ecirctre parameacutetreacute de faccedilon agrave autoriser son exeacutecution

Stockage des donneacutees

Le mode de stockage des donneacutees importeacutees peut eacutegalement diffeacuterer Certains logiciels stockent les inforshymations dans un fichier dit laquo agrave plat raquo cest-agrave-dire dans un fichier texte structureacute selon un format speacutecifique Les diffeacuterents eacuteleacutements sont alors seacutepareacutes par des caracshytegraveres deacutetermineacutes (point-virgule tabulation) ou encashydreacutes par des balises XML Dautres outils utilisent une base de donneacutees relationnelle (MySQL par exemple) ce qui permet de manipuler les donneacutees avec un logiciel dadministration de bases de donneacutees standard Cela peut faciliter lexploitation des donneacutees (la sauvegarde) leur versement dans un logiciel documentaire ou leur migration vers unautre outil bibliographique

Interopeacuterabiliteacute et respect des standards

La compatibiliteacute des LGRB avec les plateformes de diffusion cest-agrave-dire leur capaciteacute agrave importer et exporshyter des bibliographies normeacutees est un critegravere essentiel de leacutevaluation Ainsi bien quinvisibles pour lutilisateur les structures des donneacutees sont repeacuterables par des logishyciels adapteacutes (Poupeau 2011) mais aussi par les moteurs de recherche22 Ces meacutetadonneacutees sont dites laquo exposeacutees raquo ou laquoglanablesraquo sil existe une ou plusieurs meacutethodes de valoriser les contenus pour un systegraveme informatique tiers Les formats dexposition Web de notices testeacutes sont les suivants

bull le BibTEX format de bibliographie pour leacutecrishyture scientifique associeacute agrave leacutecriture au format LaTEX- i

bull le Dublin Core sous forme de meacutetadonneacutees aux formats RDFa ou Microformats (Poupeau 2011)

bull le format COinS (Trainor et Price 2010 Van de Sompel 2001) de la norme Z39-883 bullbullbull

bull les informations DOI (Lupovici 1998)

2 La nouvelle mouture de lalgorithme de Google laquo Panda raquo se base principalement sur ces donneacutees descriptives pour juger de la qualiteacute dune page Web

3 Voir le blogue dEmmanuelle Bermegraves de la BnF lthttpwwwfigoblogorgdocu-mentii3iphpgt acceacutedeacute le 1er septembre 2012

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Les formats

Les fonctionnaliteacutes eacutetudieacutees sont limport et lexport de notices ainsi que la compatibiliteacute avec les traitements de texte

bull Le logiciel doit ecirctre capable dimporter des bibliographies ou des collections complegravetes preacuteshyformateacutees par dautres LGRB sans perte ni corshyruption de donneacutees

bull Il est indispensable de pouvoir exporter tout ou partie de la base de notices dans un ou plusieurs formats en respectant les normes en vigueur

bull Il est important de pouvoir verser directement des reacutefeacuterences bibliographiques dans son traiteshyment de texte

Les LGBR proposent parfois la gestion des doushyblons (qui garantit lagrave qualiteacute de la base) et la deacutetection derreur de typage documentaire (repeacuterage deacuteleacutements manifestement manquants pour un type de document comme le numeacutero de page dans un article de revue)

Fonctionnaliteacutes dusage

Pour retrouver les reacutefeacuterences correspondant aux citations et auteurs lutilisateur peut souhaiter annoter sa base de citations ou effectuer des classements par sujet Une base indexeacutee offre la possibiliteacute dutiliser des filtres de recherche

Pour des travaux collaboratifs la possibiliteacute de parshytager sa bibliothegraveque de citations est une option indisshypensable Cette fonctionnaliteacute est parfois offerte sous la forme dun reacutepliquacirct de la base de connaissance sur un serveur Internet Cette option permet eacutegalement de saushyvegarder sa base bibliographique

Les logiciels eacutevalueacutes

JabRef (lthttpjabrefsourceforgenetgt)

JabRef est une interface graphique de gestion qui permet de maintenir exclusivement des bibliographies au format BibTEX Ce logiciel est multiplateforme car deacuteveloppeacute en Java Cette programmation autorise donc une compatibiliteacute maximale en termes de systegravemes dexploitation Ainsi le portage de ce logiciel se fera aussi bien sur MAC OS et Windows que sur Linux

Le projet JabRef est neacute de la rencontre de Morten O Alver et Nizar Batada Le premier avait deacuteveloppeacute JBibtexManager et le second BibKeeper La premiegravere version de JabRef neacutee de la fusion des deux logiciels a eacuteteacute diffuseacutee en 2003 Le nom JabRef signifie pour Java a pour Alver b pour Batada et Ref pour Reacutefeacuterence Ce projet libre a rapidement connu un franc succegraves dans la sphegravere delagrave recherche universitaireLes eacutediteurs de sysshytegravemes dexploitation libres lont inteacutegreacute dans de nomshybreuses versions de Linux depuis 2007

Mendeiey Desktop (lthttp wwwmendeieycomgt)

Mendeiey Desktop est un logiciel installeacute localeshyment sur le disque dur de lordinateur Cette applicashytion est speacutecialiseacutee en gestion bibliographique et permet eacutegalement de partager des reacutefeacuterences agrave travers son intershyface Web

Mendeiey Ltd est une socieacuteteacute londonienne La preshymiegravere mouture du logiciel eacuteppnyme a eacuteteacute publieacutee en 2008 Cette solution est gratuite mais nest pas de type laquo Open Source raquo et lextension de stockage en ligne est payante De nouvelles fonctionnaliteacutes sont preacutevues sous forme dextensions payantes comme Mendeiey Institushytional Edition pour les eacutetablissements denseignement supeacuterieur

Bib Desk (lthttpbibdesksourceforgenetgt)

BibDesk est une solution logicielle libre et gratuite qui permet de creacuteer geacuterer et utiliser des donneacutees biblioshygraphiques au format BibTEX Ce programme doteacute dune interface graphique claire et efficace nest disposhynible que pour les ordinateurs Apple

Lanceacute publiquement en 2002 BibDesk est en deacuteveshyloppement continu depuis cette date Bibdesk est un exemple de logiciel libre supporteacute par de nombreux ccedilontributeurs gracircce agrave la plateforme Sourceforge Agrave lorishygine le deacuteveloppeur eacutetait Michael McCracken une grande partie du code a eacuteteacute eacutecrite par Adam Maxwell et Christiaan Hofmacircn Disponible directement agrave partir de SourceForge il est actuellement livreacute avec la distribushytion de TEX MacTEX

Zotero le module du navigateur Firefox (lthttpwwwzoteroorggt)

Zotero est un module logiciel (plug-in) deacuteveloppeacute par le Center for History and New Media de la George Mason University Zotero est agrave part dans le panorama des LGRB car ce module sexeacutecute au sein ducirc navigashyteur Firefox dont il est une composante optionnelle Zotero permet de saisir manuellement des notices au sein dune base locale de les classer et de leacutes exporter sous diffeacuterents formats bibliographiques

La premiegravere version de Zotero a eacuteteacute mise agrave la disshyposition des utilisateurs en octobre 2006 en tant que greffon logiciel pour le navigateur Web Firefox (Laskowski) Depuis une tregraves importante communauteacute internationale sest regroupeacutee pour participer agrave la creacuteashytion de styles bibliographiques Depuis janvier 2011 il existe une version de type logiciel lourd de Zotero laquo standalone Zotero raquo comportant les mecircmes fonctionshynaliteacutes sans neacutecessiter lusage de Firefox

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Protocole de test

Lorsque cela eacutetait possible ces quatre logiciels ont eacuteteacute testeacutes dans les environnements suivants

bull Mac OS X sur un MacBook Pro eacutequipeacute de MS Office 2008 et 2011 LyX Texstudio TexWorks et OpenOffice

bull un ordinateur portable reacutecent eacutequipeacute de Windows 7 MS Office 2007 LyX et OpenOffice

Pour les logiciels compatibles avec le glanage de notices bibliographiques sur les pages Web nous avons deacuteposeacute un fichier HTML bien formeacute avec des notices au format laquo Web de donneacutees raquo sur un site Internet de test Gracircce agrave cette URL nous pouvons juger de la compatibishyliteacute du logiciel avec la navigation en mode glanage dinshyformations Nous avons eacutegalement testeacute la compatibiliteacute des logiciels avec les meacutetadonneacutees associeacutees aux docushyments Pour y parvenir nous proposons aux logiciels de charger un panel de documents scientifiques au format PDF Le corpus est composeacute de fichiers PDF bien formeacutes et correctement annoteacutes gracircce agrave des meacutetadonneacutees au format XMP4

Cet acronyme signifie extensible Metadata Platform plateforme de meacutetadonneacutees extensible Il sagit dun standard proposeacute par Adobe pour inteacutegrer des meacutetadonshyneacutees agrave des fichiers de type PDF

Reacutesultats

Les reacutesultats de la comshyparaison sont preacutesenteacutes ici de faccedilon seacutequentielle pour les quatre logiciels

JabRef

Formats dimport de JabRef

JabRef importe principashylement les notices gracircce agrave des fichiers BibTEX et BibTEXML mais aussi RIS et Refer Bien que ce logiciel sappuie sur une interface graphique son moteur peut ecirctre alimenteacute en ligne de commande Cette opeacuteration peut trouver son inteacuterecirct lors de traitements par lot en shell script Les adeptes de la ligne de commande tels les amateurs de Linux seront particuliegraverement inteacuteresseacutes par cette possibiliteacute de charger des bibliographies issues de divers fichiers aux formats diffeacuterents

Formats dexport de JabRef

Les principaux formats dexport normes supporteacutes sont le RIS le MODS le RDF ((Poupeau 2011) Outre ces quelques formats dexport classiques (Figure 1) JabRef offre la possibiliteacute de se connecter agrave une base de donneacutees et dexporter sa bibliographie sous MySQL Cette possishybiliteacute est particuliegraverement attractive apregraves un moissonshynage ou un glanage intensif dinformation avec export en format norme Le processus est donc presque autoshymatiseacute entre la navigation avec le module de Firefox Zotero et la geacuteneacuteration dune base de connaissances de tous les articles inteacuteressants sur un sujet Il suffit pour cela de configurer une connexion agrave un serveur MySQL local ou distant

Fonctionnaliteacutes de JabRef

Pour les reacutedacteurs en sciences dites dures lutishylisation de LaTEX et lusage de BibTEX avec un fichier bien formaliseacute forment un preacuterequis implicite pour soushymettre des articles dans la plupart des revues JabRef offre lopportuniteacute de formaliser des bibliographies de maniegravere tregraves stricte Si les champs obligatoires ne sont pas renseigneacutes ou sont mal renseigneacutes le logiciel le signale de maniegravere claire par un point rouge Un autre

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avantage de ce logiciel est quil est gratuit et sinstalle facishylement Toulin Chazelas et Palencia (2008) preacutesentent JabRef comme compatible avec plusieurs traitements de texte dont MS Word via le format RTF La suite de bureautique la plus compatible est OpenOfrke et sa version redevenue libre LibreOffice JabRef est capable de geacuteneacuterer une bibliographie au format OpenDocument (ods) le format du tableur de LibreOfshyfice pour ensuite limporter dans le traitement de texte Ce nest que depuis janvier 2011 et la version 27 becircta du logishyciel quun deacutebut de compatishybiliteacute avec Word de MS Office se concreacutetise autrement que par un export RTF5 Il semble quavec quelques manipulashytions de configuration JabRef soit compatible avec MS Word directement en mode insertion

Une autre fonctionnashyliteacute de JabRef deacutecrite par les auteurs du logiciel permet dinscrire ses propres meacutetadonneacutees dans les fichiers PDF gracircce agrave la technologie XMP Gracircce agrave ces meacutetashydonneacutees les chercheurs peuvent eacutechanger des fichiers annoteacutes et enrichis de mots cleacutes et de commentaires Ainsi les chercheurs ont accegraves non seulement au docushyment primaire et agrave sa notice mais aussi aux annotations et meacutetadonneacutees ajouteacutees par leurs collegravegues

Le point faible de ce logiciel reacuteside dans sa meacutediocre interaction avec les outils de traitement de texte En effet une phase dexport en XML OpenDocument est neacutecessaire pour importer les citations dans MS Word et cette manipulation nest pas anodine pour un utilisashyteur non aguerri Cependant comme son usage est claishyrement orienteacute pour le couple BibTEX LaTEX lincon-fort reste mineur Son point fort est la souplesse dutishylisation ladaptabiliteacute mais eacutegalement la rigueur de creacuteation de fichier BibTcX

Mendeley Desktop

Formats dimport de Mendeley Desktop

Mendeley Desktop permet dimporter directement les meacutetadonneacutees depuis les documents notamment les fichiers PDF Les autres formats dimport sont le Ovid le RIS le BibTEX le EndNote XML le TXT (texte brut) mais aussi et cest un avantage la base Sqlite du module Zotero de Firefox

Formats dexport de Mendeley Desktop

Mendeley propose de creacuteer des bibliographies sous divers formats libres et proprieacutetaires Les plus usiteacutes sont le BibTEX RIS texte brut XML Zotero (zotero sqlite) PDF Il est possible de copiercoller des citations vers BibTEX directement de Mendeley par le presse-papier du systegraveme dexploitation Mendeley propose eacutegalement un module de reacutedaction de citation agrave inteacuteshygrer directement dans Word et Open Office sous forme dune barre doutils

5 lthttpjabrefsourceforgenetrevisionhistoryphpgt consulteacute le 1er septembre 2012

Fonctionnaliteacutes de Mendeley Desktop

Le logiciel offre la possibiliteacute de partager des reacutefeacuteshyrences et les fichiers associeacutes au sein de librairies

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partageacutees entre plusieurs utilisateurs dun mecircme groupe Dans ce cadre lespace de stockage est limiteacute agrave 500 meacutega-octets par compte Les groupes ne peuvent pas accueillir plus de 10 participants par collection parshytageacutee ou laquo Shared Collection raquo dans ce cadre la deacutetecshytion des doublons nest pas geacutereacutee Des options payantes permettent daugmenter lespace de stockage Mendeley permet de partager ses reacutefeacuterences et les documents attashycheacutes ainsi que les meacutetadonneacutees personnaliseacutees Ce logishyciel offre une gestion des fichiers de type PDF capable de lire les meacutetadonneacutees des documents On peut donc geacuteneacuterer les notices bibliographiques depuis les docushyments Cette commoditeacute neacutecessite tout de mecircme une relecture systeacutematique En effet selon les eacutediteurs de textes et les modegraveles fournis par les organisateurs de confeacuterences lorganisation des meacutetadonneacutees peut ecirctre alteacutereacutee Mendeley est compatible avec les logiciels MS Word et OpenOmce nous avons pu tester le module pour Word 2008 et 2011 qui autorise linsertion de reacutefeacuteshyrences dans le texte et leacutedition de la bibliographie

Lextension laquo bookmarklet raquo une fois inteacutegreacutee au navigateur permet de deacutetecter les notices au format COinS et de les importer dans Mendeley agrave la condition davoir un compte en ligne

Dun point de vue fonctionnel un eacuteleacutement tregraves appreacuteciable est la possibiliteacute dannoter un document PDF au sein mecircme du logiciel qui reacutealise la bibliograshyphie Dans lexemple expliciteacute par la capture (Figure 2)

le document de lauteur Dinet a pu ecirctre annoteacute (1) et reacuteutishyliseacute ulteacuterieurement En effet au cours de la lecture nous avions pu surligner (2) les passages cleacutes et annoter le document gracircce agrave Mendeley Desktop Par la suite la note apparaicirct comme un post-it flotshytant dans le document pregraves de son point dancrage (3)

Bibdesk

Plateforme dexeacutecution et format dimport unique

Leacutediteur graphique BibDesk nest disponible que sur plateshyforme Apple Il est deacutedieacute aux bibliographies LaTEX cest-agrave-dire au format BibTEX et ne gegravere donc que les fichiers agrave extensionbib Linterface est simple La Figure 3 montre leacutedition dun article avec sur la partie de droite les hypershyliens (2) et la bibliothegraveque numeacuterique (1) ougrave larticle est officiellement reacutefeacuterenceacute Les

auteurs sont eacutegalement clairement identifieacutes en bas agrave droite (3) La partie de gauche est reacuteserveacutee aux meacutetashydonneacutees de larticle dont les mots cleacutes qui revecirctent une importance particuliegravere (4)

Formats dexport de BibDesk

Le premier et principal format dexport de BibDesk est bien sucircr le BibTEX Utiliser un logiciel limite les posshysibiliteacutes derreur agrave la compilation du document LaTEX qui par exemple exige que tous les caractegraveres accenshytueacutes soient reformateacutes pour ecirctre valides et cette option de laquo nettoyage raquo nest pas neacutegligeable lors de la compishylation dune thegravese comportant plus dune centaine de citations Un temps conseacutequent de deacutebogage peut ainsi ecirctre gagneacute BibDesk propose eacutegalement dexporter des notices bibliographiques ou des bibliographies comshyplegravetes dans les formats RIS et COinS dans un site Web par BibDesk

Fonctionnaliteacutes compleacutementaires de BibDesk

Le logiciel ne sarrecircte pas agrave leacutedition des notices contenues dans une bibliographie au format LaTEX il integravegre en outre un systegraveme dauto completion des mots cleacutes et des fonctionnaliteacutes de classement laquo intelshyligent raquo gracircce agrave ces mecircmes mots cleacutes Le classement

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s effectue eacutegalement agrave partir de filtres sur des opeacuterateurs de type laquo est raquo ou laquo contient raquo et peut sappliquer sur nimshyporte quel champs BibTEX par exemple lauteur le titre ou les mots cleacutes Dans lexemple de la Figure 4 les eacuteleacutements (1) repreacutesentent les champs laquo tester raquo avec 1 laquo opeacuterateur raquo (2) et les laquo arguments raquo (3) Cela peut ecirctre traduit en langage naturel par laquo creacuteation dun groupe filtrant les documents comportant les mots cleacutes ACM et CCS raquo

BibDesk possegravede son propre moteur dindexation auquel il est possible dapshypliquer des regravegles de classeshyment en groupes intelligents Le moteur de recherche de BibDesk permet danalyser la structure des fichiers biblioshygraphiques au format BibTEX ainsi que bon nombre de bases de connaissances preacutedeacutefinies Parmi ces bases de connaissances citons

bull des sites dont laccegraves en consultation est gratuit comme ACM (meta donneacutees et reacutesumeacutes en accegraves libre) arXiv CiteULike Google Scholar IACR (Cryptologie)

bull des sites accessibles par abonnement comme IEEE Xplore MathSciNet Project Euclid Sprin-gerLink Zentralblatt Math

bull les sites respectant les normes bibliographiques BibTEX COinS HCite cette option permet dutiliser BibDesk comme navigateur Web deacutedieacute agrave la recherche scientifique et dinseacuterer agrave la voleacutee les notices neacutecessaires agrave leacutetablissement dune bibliographie

BibDesk possegravede une interface de navigation Web qui propose la deacutetection de notices bibliographiques au format OpenURL Il est ainsi possible dinseacuterer direcshytement les citations dans la base de notices dun simple clic sur le bouton laquo importer raquo

Depuis janvier 2011 la communauteacute Bibdesk propose un module qui permet dutiliser BibDesk avec le traitement de texte MS Word pour inseacuterer dynamishyquement des citations et geacuteneacuterer la bibliographie dun document

Zotero

Formats dimport de Zotero

Bien sucircr la capaciteacute de Zotero agrave deacutetecter un docushyment ou une notice deacutependra de lexposition des meacuteta-

donneacutees Il faut agrave minima que le document soit deacutecrit de maniegravere correcte en Dublin Core sur la page XHTML Les reacutesultats visibles agrave lœil cest-agrave-dire les liens vers les ressources sont ainsi accompagneacutes par des meacuteta-donneacutees descriptives normaliseacutees Zotero est agrave mecircme de comprendre ces meacutetadonneacutees et de les proposer agrave lusager soit en import massif soit en ne seacutelectionnant que les documents inteacuteressant le chercheur Les notices glaneacutees peuvent ensuite ecirctre eacutediteacutees trieacutees et classeacutees Un moteur de recherche inteacutegreacute permet dacceacuteder intuishytivement au catalogue ainsi reacutealiseacute

Formats dexport de Zotero

Zotero permet lexport de tout ou partie de sa base de citations aux formats RIS BibTEX RDF Refer et MODS Il est possible de copier une reacutefeacuterence dans le presse-papier pour ensuite la coller dans son traitement de texte favori en tant queacuteleacutement de bibliographie ou texte formateacute Il existe un module dinteacutegration pour MS Word qui permet limport formateacute depuis Zotero

Fonctionnaliteacutes de Zotero

Notons que Zotero permet la geacuteneacuteration de fichiers au format BibTEX Il semble que le gros avantage de Zotero soit de pouvoir deacutetecter intelligemment aussi bien les reacutefeacuterences bibliographiques que les documents eux-mecircmes Zotero offre donc une chaicircne de producshytion quasi automatiseacutee allant de la deacutetection ou limport jusquagrave la geacuteneacuteration de bibliographies en de nombreux styles et sous de nombreux formats Il est compatible avec Word lautre outil de production scientifique et il est mecircme possible dexporter une citation biblio-

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graphique par un simple laquo cliquer deacuteplacer raquo vers un eacutediteur ou un client de messagerie Sous Word 2008 et 2011 (MAC OS) un portage a eacuteteacute proposeacute pour inseacuterer des citations depuis Zotero et geacuteneacuterer dynamiquement la bibliographie avec quelques styles

Ce module possegravede eacutegalement un moteur de recherche inteacutegreacute permettant de parcourir les reacutefeacuterences enregistreacutees dans la base de lutilisateur Le reacuteel inteacuterecirct de Zotero est de proposer la possibiliteacute de deacutetecter sur le Web des ressources documentaires de diffeacuterents types et denregistrer en masse des notices bibliographiques gracircce aux meacutetadonneacutees exposeacutees par le site Web

Ici agrave lissue dune requecircte sur Google Scholar la reacuteponse est constitueacutee deacuteleacutements bibliographiques deacutetectables seacutepareacutement Licocircne Zotero de la barre de navigation signale la preacutesence de multiples entreacutees En cliquant sur cette icocircne une fenecirctre dalerte propose denregistrer une ou plusieurs notices dans la base (Figure 5)

Zotero permet eacutegalement au navigateur de deacutetecshyter et denregistrer un eacuteleacutement isoleacute comme la page pershysonnelle dun chercheur offrant la lecture de son dernier article Sil sagit dun document unique deacutecrit sur une page Web le module preacutecisera le type du document (un article un livre ou une videacuteo) lors de sa deacutetection en affichant une icocircne agrave droite dans la barre de navigation (par exemple un livre un chapitre un article dencycloshypeacutedie sera symboliseacute par un petit livre bleu)

Linterface de Zotero est inteacutegreacutee agrave Mozilla Firefox et peut sactiver agrave tout moment en cliquant sur le logo Zotero en bas agrave droite du navigateur Dans la Figure 6 sur la gauche (1) les collections sont classeacutees dans la

laquo Bibliothegraveque raquo qui repreacuteshysente lensemble des notices bibliographiques Au centre (2) il est possible de visuashyliser lensemble des articles composant une collection Un encart (3) permet de visualishyser et deacutediter les informations formant la notice relative agrave un document Longlet (4) offre la possibiliteacute dafficher les mots cleacutes potentiellement associeacutes agrave la fiche Comme ces champs sont rarement renseigneacutes il est possible de les choisir soi-mecircme Cette option est preacuteshycieuse pour ceux qui deacutesirent filtrer les articles par mots cleacutes gracircce au moteur inteacutegreacute (5) En cas dexport dune biblioshygraphie les mots cleacutes seront eacutegalement exporteacutes

La force du logiciel est dautoriser la creacuteation et lexport de bibliographies aux

formats deacutediteurs de textes les plus reacutepandus De plus Zotero offre une mise en forme bibliographique adapshytable au domaine de recherche de lutilisateur voire mecircme au type de revue gracircce agrave un vaste panel de styles bibliographiques pour les traitements de texte Depuis janvier 2012 Zotero existe eacutegalement sous forme de logiciel indeacutependant ce qui noblige plus agrave utiliser Firefox

Quel LGRB pour quel usage

Pour connaicirctre les pratiques en matiegravere de creacuteashytion assisteacutee de bibliographies nous nous reacutefeacuterons agrave une enquecircte reacutealiseacutee en deacutecembre 2011 (Kembellec 2012) aupregraves dun panel dutilisateurs de 195 personnes Le groupe est constitueacute de conservateurs et de docushymentalistes de Services Communs de Documentation duniversiteacutes parisiennes denseignants chercheurs en matheacutematiques informatique sciences de la comshymunication et mecircme dun maicirctre de confeacuterences en lettres ayant fait sa thegravese en LaTEX (bien que ces prashytiques soient moins reacutepandues hors des sciences dures et des domaines techniques) Ils ont eacuteteacute interrogeacutes sur la maniegravere dont ils eacutecrivaient leurs bibliographies et les reacuteponses montrent que les usages et pratiques divergent selon les profils dutilisateurs mais aussi selon le type de sciences de rattachement

En STM BibTeX est souvent imposeacute comme format de bibliographie par les revues et eacutediteurs scientishyfiques Pour geacuterer leur bibliographie les chercheurs en sciences dures utilisent pour plus de la moitieacute dentre eux un logiciel deacutedieacute souvent JabRef ou Mendeley en

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collaboration avec Zotero Un usage conjoint de Zotero avec un autre outil permet de repeacuterer et denregistrer les notices depuis Internet puis de geacuterer la bibliographie avec un logiciel deacutedieacute En meacutedecine le format biblioshygraphique Ovid associeacute agrave MS Word pour leacutecriture geacutereacute par Mendeley est une alternative reconnue Nous proshyposons donc en sciences dures (sauf meacutedecine) lusage de JabRef ou BibDesk si lon preacutefegravere eacutecrire sous LaTEX Dans le cas dune pratique deacutecriture sous Ms Word il faut preacutefeacuterer Zotero ou Mendeley

En SHS les documents scientifiques eacutetant essentielshylement reacutedigeacutes avec des traitements de texte classiques les outils deacutedieacutes agrave LaTEX sont hors de propos Mecircme sils commencent agrave devenir compatibles mieux vaut privileacuteshygier des logiciels eacuteprouveacutes tels que Zotero ou Mendeley Cependant ceux qui preacutesentent des travaux agrave la mise en page avanceacutee avec des polices de caractegravere inteacutegrant des caractegraveres de langues mortes ou rares preacutefeacutereront parfois LaTEX Dans ce cas preacutecis assez rare lusage de JabRef ou BibDesk peut ecirctre utile

Dans les centres de documentation les usagers de linformation bibliographique sont souvent deacutejagrave eacutequipeacutes dun LGRB souvent payant comme EndNote Cela ne les empecircche pas de connaicirctre et dutiliser Zotero en compleacutement

Leacutetude montre que toutes les cateacutegories dusashygers (enseignants eacutetudiants documentalistes) utilisent souvent Zotero en association avec un autre logiciel Parmi les logiciels libres ou gratuits Zotero a semble-t-il le monopole de deacutetection des notices bibliograshyphiques et Mendeley celui de la gestion des bibliograshyphies Cependant avec larriveacutee du Zotero autonome (standalone) nous allons peut-ecirctre assister agrave leacutemershygence dun monopole

Conclusion

De plus en plus de solutions libres et gratuites de gestion de bibliographies sont opeacuterationnelles et les logishyciels proprieacutetaires nont plus le monopole de la qualiteacute en ce domaine Il existe donc un vrai choix de logishyciels selon le systegraveme dexploitation et le format biblioshygraphique Comme le faisait remarquer Carole Zweifel (2008) ces logiciels preacutesentent autant sinon plus dinshynovations fonctionnelles que les produits payants Car avec leacutevolution des usages tels le Web 20 et le Web seacutemantique les creacuteateurs de ces produits en sont les premiers usagers Parmi toutes ces applications libres les chercheurs devraient trouver un logiciel offrant une compatibiliteacute satisfaisante en matiegravere dimport dexport de deacutetection et de pratique collaborative

Il est tout agrave fait possible dutiliser les compatibishyliteacutes de formats entre les logiciels pour effectuer une veille technologique une recherche et un formatage norme depuis divers logiciels Par exemple le greffon de Firefox Zotero est particuliegraverement indiqueacute pour glaner

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des notices exposeacutees sur Internet Ensuite les fiches seront exporteacutees au format BibTEX ou RIS dans JabRef Bibdesk ou Mendeley Le fichier dexport enbib ou autre contenant la bibliographie pourra eacutegalement ecirctre exporteacute vers une interface Internet riche (RIA) qui sera accessible depuis nimporte quel poste nomade eacutequipeacute dInternet et dun navigateur Notons que presque tous les logiciels lourds (Mendeley) ou hybride (Zotero) posshysegravedent une plateforme de sauvegarde ou de synchronishysation en ligne qui peut parfois eacutegalement servir de base communautaire Le chaicircnage logiciel requiert une cershytaine expertise rapidement acquise par la manipulation Mais pour ceux qui souhaitent un minimum de manishypulation et une tranquilliteacute desprit sur la qualiteacute de leur bibliographie JabRef est le bon compromis car la posshysibiliteacute de deacutetecter et de manipuler les meacutetadonneacutees des articles au format PDF rend son usage simple et convishyvial De plus les formats dimport-export eacutetant devenus compatibles avec tous les environnements son usage ne se cantonne plus agrave creacuteer des bibliographies pour les eacutedishyteurs OpenOffice et LaTEX

Agrave la question peut on trouver une alternative seacuterieuse aux logiciels de gestion bibliographique laquo proshyfessionnels raquo payants la reacuteponse est claire oui bien sucircr Il existe maintenant des programmes de qualiteacute adapteacutes agrave chaque speacutecialiteacute scientifique mais aussi en accord avec les sensibiliteacutes individuelles face aux diffeacuteshyrents modegraveles eacuteconomiques de distribution reg

Sources consulteacutees

Bergquist M and J Ljungberg 2001 The Power of Gifts Organizshying Social Relationships in Open Source Communities Inforshymation Systems Journal 11 (4) 305-320

DellOrso F 2010 Bibliography Management Software Analysis and Comparison of Some Packages Text ES Burioni Ricerche Bibliografiche En ligne lthttpwwwburioniitforumdel-lorsobms-dasptextindexhtmlgt (consulteacute le 1er septembre 2012)

Jullien N and JB Zimmerman 2005 Peut-on envisager une eacutecoshylogie du logiciel libre favorable aux nuls Cahier de recherche Mocircle armoricain de recherche sur la socieacuteteacute de linformation et les usages dInternet (MARSOIN) (9-2005) En ligne lthttp wwwmarsouinorgspipphp article65gt (consulteacute le ier sepshytembre 2012)

Kembellec G 2012 Technologie et pratiques bibliographiques assoshycieacutees agrave leacutecriture scientifique en milieu universitaire En ligne lthttphalarchives-0uvertesfrhal-00661550gt (consulteacute le ier septembre 2012)

Laskowski T Center for History and New Media Launches Zotero Research Tool The George Mason University Gazette En ligne lthttpgazettegmueduarticles9088gt (consulteacute le ier sepshytembre 2012)

Lupovici C 1998 Le Digital Object Identifier Bulletin des biblioshythegraveques de France 43 (3) 49-54

Masur R 2009 Eacutetude sur la valorisation des logiciels de gestion de reacutefeacuterences bibliographiques (LGRB) dans le milieu des bibliothegraveques universitaires romandes et sur les avantages et limites du plug-in Zotero Genegraveve Haute eacutecole de gestion de Genegraveve (HEG-GE) En ligne lthttpdocreroch

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lmphp Url=iooo4i92009iii2i42i4i-PATDB_2ioipdfgt (consulteacute le 1er septembre 2012)

Poupeau G 2011 Microformats RDF microdata repreacutesenter le contenu dune page Web Documentaliste-Sciences de Vlnjor-mation 48 4) 33

mdashbull RDF La grammaire universelle des machines Documentashyliste-Sciences de lInformation 4 (4) 31 bull

Stallman R 1992 Why Software Should Be Free Software Ownershyship and Intellectual Property Rights 31 En ligne lthttp wwwgnuorgphilpsophyshouldbefreeenhtmlgt (consulteacute le 14 septembre 2012)

Toulin S M Ghazelas and F Palencia 2009 JabRef outil de gestion de donneacutees bibliographiques utilisation avantages et inconveacutenients E-migrinter (3) 58-63

Trainor C and J Price 2010 Chapter 4 The Future of OpenURL Linking Adaptation and Expansion Library Technology

Reports46(7) 27-33 Van deSompel H 2001 Generalizing the OpenURL Framework

Beyond References to Scholarly Works The Bison-Futeacute Model D-lib 7 (78) En ligne lthttpwwwdliborgdlibjulyoi vandesompelo7vandesompelhtmlgt (consulteacute le Ier septembre 2012)

Zweifel C 2008 Logiciels de gestion deacute references bibliograshyphiques Citons le Libre Reumlssi Revue eacutelectronique suisse deacute science de linformation 7 Eh ligne lthttpwwwressich nodei47gt (consulteacute le 14 septembre 2012)

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Page 4: Étude comparée de quatre logiciels de gestion de

Caracteacuteristiques de la structure de deacuteveloppement

Les logiciels libres peuvent ecirctre publieacutes par une socieacuteteacute eacuteditrice ou par une communauteacute libre Comme pour les logiciels proprieacutetaires il est preacutefeacuterable de veacuterishyfier en consultant les sites et forums de la communauteacute En effet une communauteacute active a une plus grande capaciteacute agrave produire de nouvelles versions et garantit un logiciel peacuterenne

Si limage dun deacuteveloppement collaboratif est souvent associeacutee au libre et fortement deacutefendue par Richard Stallman (Stallman 1992) la reacutealiteacute est plus nuanceacutee (Jullien et Zimmerman 2005 Bergquist et Ljungberg 2001) Il nest pas rare quun eacutediteur ou une communauteacute limite ou refuse les contributions des usagers pour preacuteserver luniteacute et la qualiteacute du produit Dans ce cas il sera toujours possible agrave lusager de modishyfier le logiciel et de diffuser ces modifications sans que ces eacutevolutions soient reacuteinteacutegreacutees au logiciel dorigine

Certains logiciels libres dont le deacuteveloppement est tregraves controcircleacute sont structureacutes de faccedilon a accepter des modules additionnels (greffons ou add-on) deacuteveloppeacutes par les Usagers sans ecirctre inteacutegreacutes dans leacute code du logiciel principal Ces modules ne sont pas toujours valideacutes par la communauteacute ou leacutediteur et sont parfois diffuseacutes sous dautres plateformes Il faut les choisir et les tester avec soin mais ce proceacutedeacute offre des possibiliteacutes dextension du logiciel

Architecture logicielle

Lourd Leacuteger Hybride

Le terme laquo client lourd raquo fait reacutefeacuterence agrave une intershyface homme-machine individuelle permettant de piloter une base de connaissances locale ou distante Le code de lapplication sexeacutecute sur une machine locale ou sur un serveur dapplications apregraves avoir eacuteteacute chargeacute en meacutemoire Ce code peut neacutecessiter une compilation preacutealable Nous nous inteacuteresserons dans un premier temps agrave ces LGRB que lon installe sur une station de travail Dans un deuxiegraveme temps nous aborderons les laquo Rich Internet Applications (RIA) raquo heacutebergeacutees sur un serveur Web et utiliseacutees au travers dun navigateur (on parle aussi de laquo client leacuteger raquo)

Enfin il existe un mode laquo hybride raquo car certains LGRB occupent une place agrave mi-chemin entre le client lourd et le RIA Il sagit le plus souvent de greffons pour navigateurs Web qui prennent en charge le glanage dinformations par deacutetection de meacutetadonneacutees embarshyqueacutees dans une page Web ou le moissonnage et limport massif depuis un deacutepocirct de documents

Cette question a une incidence sur le deacuteploiement et lutilisation des outils Le logiciel lourd neacutecessitant une installation poste par poste le deacuteploiement et la mise agrave jour sur le lieu de travail doivent ecirctre organi-

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ses surtout dans les structures qui nautorisent pas les droits dinstallation aux collaborateurs Les RIA nont pas cet inconveacutenient puisquil suffit de connaicirctre lURL de lapplication et de disposer dun identifiant pour lutiliser depuis nimporte quel poste connecteacute agrave Intershynet Cest un avantage pour les utilisateurs nomades qui utilisent diffeacuterents ordinateurs (les eacutetudiants dans une bibliothegraveque ou une salle de ressources informatiques par exemple)

Les logiciels hybrides comportent un eacuteleacutement actif installeacute sur le poste de travail Comme les logiciels lourds cet eacuteleacutement doit ecirctre deacuteployeacute localement et le niveau de seacutecuriteacute du navigateur doit ecirctre parameacutetreacute de faccedilon agrave autoriser son exeacutecution

Stockage des donneacutees

Le mode de stockage des donneacutees importeacutees peut eacutegalement diffeacuterer Certains logiciels stockent les inforshymations dans un fichier dit laquo agrave plat raquo cest-agrave-dire dans un fichier texte structureacute selon un format speacutecifique Les diffeacuterents eacuteleacutements sont alors seacutepareacutes par des caracshytegraveres deacutetermineacutes (point-virgule tabulation) ou encashydreacutes par des balises XML Dautres outils utilisent une base de donneacutees relationnelle (MySQL par exemple) ce qui permet de manipuler les donneacutees avec un logiciel dadministration de bases de donneacutees standard Cela peut faciliter lexploitation des donneacutees (la sauvegarde) leur versement dans un logiciel documentaire ou leur migration vers unautre outil bibliographique

Interopeacuterabiliteacute et respect des standards

La compatibiliteacute des LGRB avec les plateformes de diffusion cest-agrave-dire leur capaciteacute agrave importer et exporshyter des bibliographies normeacutees est un critegravere essentiel de leacutevaluation Ainsi bien quinvisibles pour lutilisateur les structures des donneacutees sont repeacuterables par des logishyciels adapteacutes (Poupeau 2011) mais aussi par les moteurs de recherche22 Ces meacutetadonneacutees sont dites laquo exposeacutees raquo ou laquoglanablesraquo sil existe une ou plusieurs meacutethodes de valoriser les contenus pour un systegraveme informatique tiers Les formats dexposition Web de notices testeacutes sont les suivants

bull le BibTEX format de bibliographie pour leacutecrishyture scientifique associeacute agrave leacutecriture au format LaTEX- i

bull le Dublin Core sous forme de meacutetadonneacutees aux formats RDFa ou Microformats (Poupeau 2011)

bull le format COinS (Trainor et Price 2010 Van de Sompel 2001) de la norme Z39-883 bullbullbull

bull les informations DOI (Lupovici 1998)

2 La nouvelle mouture de lalgorithme de Google laquo Panda raquo se base principalement sur ces donneacutees descriptives pour juger de la qualiteacute dune page Web

3 Voir le blogue dEmmanuelle Bermegraves de la BnF lthttpwwwfigoblogorgdocu-mentii3iphpgt acceacutedeacute le 1er septembre 2012

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Les formats

Les fonctionnaliteacutes eacutetudieacutees sont limport et lexport de notices ainsi que la compatibiliteacute avec les traitements de texte

bull Le logiciel doit ecirctre capable dimporter des bibliographies ou des collections complegravetes preacuteshyformateacutees par dautres LGRB sans perte ni corshyruption de donneacutees

bull Il est indispensable de pouvoir exporter tout ou partie de la base de notices dans un ou plusieurs formats en respectant les normes en vigueur

bull Il est important de pouvoir verser directement des reacutefeacuterences bibliographiques dans son traiteshyment de texte

Les LGBR proposent parfois la gestion des doushyblons (qui garantit lagrave qualiteacute de la base) et la deacutetection derreur de typage documentaire (repeacuterage deacuteleacutements manifestement manquants pour un type de document comme le numeacutero de page dans un article de revue)

Fonctionnaliteacutes dusage

Pour retrouver les reacutefeacuterences correspondant aux citations et auteurs lutilisateur peut souhaiter annoter sa base de citations ou effectuer des classements par sujet Une base indexeacutee offre la possibiliteacute dutiliser des filtres de recherche

Pour des travaux collaboratifs la possibiliteacute de parshytager sa bibliothegraveque de citations est une option indisshypensable Cette fonctionnaliteacute est parfois offerte sous la forme dun reacutepliquacirct de la base de connaissance sur un serveur Internet Cette option permet eacutegalement de saushyvegarder sa base bibliographique

Les logiciels eacutevalueacutes

JabRef (lthttpjabrefsourceforgenetgt)

JabRef est une interface graphique de gestion qui permet de maintenir exclusivement des bibliographies au format BibTEX Ce logiciel est multiplateforme car deacuteveloppeacute en Java Cette programmation autorise donc une compatibiliteacute maximale en termes de systegravemes dexploitation Ainsi le portage de ce logiciel se fera aussi bien sur MAC OS et Windows que sur Linux

Le projet JabRef est neacute de la rencontre de Morten O Alver et Nizar Batada Le premier avait deacuteveloppeacute JBibtexManager et le second BibKeeper La premiegravere version de JabRef neacutee de la fusion des deux logiciels a eacuteteacute diffuseacutee en 2003 Le nom JabRef signifie pour Java a pour Alver b pour Batada et Ref pour Reacutefeacuterence Ce projet libre a rapidement connu un franc succegraves dans la sphegravere delagrave recherche universitaireLes eacutediteurs de sysshytegravemes dexploitation libres lont inteacutegreacute dans de nomshybreuses versions de Linux depuis 2007

Mendeiey Desktop (lthttp wwwmendeieycomgt)

Mendeiey Desktop est un logiciel installeacute localeshyment sur le disque dur de lordinateur Cette applicashytion est speacutecialiseacutee en gestion bibliographique et permet eacutegalement de partager des reacutefeacuterences agrave travers son intershyface Web

Mendeiey Ltd est une socieacuteteacute londonienne La preshymiegravere mouture du logiciel eacuteppnyme a eacuteteacute publieacutee en 2008 Cette solution est gratuite mais nest pas de type laquo Open Source raquo et lextension de stockage en ligne est payante De nouvelles fonctionnaliteacutes sont preacutevues sous forme dextensions payantes comme Mendeiey Institushytional Edition pour les eacutetablissements denseignement supeacuterieur

Bib Desk (lthttpbibdesksourceforgenetgt)

BibDesk est une solution logicielle libre et gratuite qui permet de creacuteer geacuterer et utiliser des donneacutees biblioshygraphiques au format BibTEX Ce programme doteacute dune interface graphique claire et efficace nest disposhynible que pour les ordinateurs Apple

Lanceacute publiquement en 2002 BibDesk est en deacuteveshyloppement continu depuis cette date Bibdesk est un exemple de logiciel libre supporteacute par de nombreux ccedilontributeurs gracircce agrave la plateforme Sourceforge Agrave lorishygine le deacuteveloppeur eacutetait Michael McCracken une grande partie du code a eacuteteacute eacutecrite par Adam Maxwell et Christiaan Hofmacircn Disponible directement agrave partir de SourceForge il est actuellement livreacute avec la distribushytion de TEX MacTEX

Zotero le module du navigateur Firefox (lthttpwwwzoteroorggt)

Zotero est un module logiciel (plug-in) deacuteveloppeacute par le Center for History and New Media de la George Mason University Zotero est agrave part dans le panorama des LGRB car ce module sexeacutecute au sein ducirc navigashyteur Firefox dont il est une composante optionnelle Zotero permet de saisir manuellement des notices au sein dune base locale de les classer et de leacutes exporter sous diffeacuterents formats bibliographiques

La premiegravere version de Zotero a eacuteteacute mise agrave la disshyposition des utilisateurs en octobre 2006 en tant que greffon logiciel pour le navigateur Web Firefox (Laskowski) Depuis une tregraves importante communauteacute internationale sest regroupeacutee pour participer agrave la creacuteashytion de styles bibliographiques Depuis janvier 2011 il existe une version de type logiciel lourd de Zotero laquo standalone Zotero raquo comportant les mecircmes fonctionshynaliteacutes sans neacutecessiter lusage de Firefox

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Protocole de test

Lorsque cela eacutetait possible ces quatre logiciels ont eacuteteacute testeacutes dans les environnements suivants

bull Mac OS X sur un MacBook Pro eacutequipeacute de MS Office 2008 et 2011 LyX Texstudio TexWorks et OpenOffice

bull un ordinateur portable reacutecent eacutequipeacute de Windows 7 MS Office 2007 LyX et OpenOffice

Pour les logiciels compatibles avec le glanage de notices bibliographiques sur les pages Web nous avons deacuteposeacute un fichier HTML bien formeacute avec des notices au format laquo Web de donneacutees raquo sur un site Internet de test Gracircce agrave cette URL nous pouvons juger de la compatibishyliteacute du logiciel avec la navigation en mode glanage dinshyformations Nous avons eacutegalement testeacute la compatibiliteacute des logiciels avec les meacutetadonneacutees associeacutees aux docushyments Pour y parvenir nous proposons aux logiciels de charger un panel de documents scientifiques au format PDF Le corpus est composeacute de fichiers PDF bien formeacutes et correctement annoteacutes gracircce agrave des meacutetadonneacutees au format XMP4

Cet acronyme signifie extensible Metadata Platform plateforme de meacutetadonneacutees extensible Il sagit dun standard proposeacute par Adobe pour inteacutegrer des meacutetadonshyneacutees agrave des fichiers de type PDF

Reacutesultats

Les reacutesultats de la comshyparaison sont preacutesenteacutes ici de faccedilon seacutequentielle pour les quatre logiciels

JabRef

Formats dimport de JabRef

JabRef importe principashylement les notices gracircce agrave des fichiers BibTEX et BibTEXML mais aussi RIS et Refer Bien que ce logiciel sappuie sur une interface graphique son moteur peut ecirctre alimenteacute en ligne de commande Cette opeacuteration peut trouver son inteacuterecirct lors de traitements par lot en shell script Les adeptes de la ligne de commande tels les amateurs de Linux seront particuliegraverement inteacuteresseacutes par cette possibiliteacute de charger des bibliographies issues de divers fichiers aux formats diffeacuterents

Formats dexport de JabRef

Les principaux formats dexport normes supporteacutes sont le RIS le MODS le RDF ((Poupeau 2011) Outre ces quelques formats dexport classiques (Figure 1) JabRef offre la possibiliteacute de se connecter agrave une base de donneacutees et dexporter sa bibliographie sous MySQL Cette possishybiliteacute est particuliegraverement attractive apregraves un moissonshynage ou un glanage intensif dinformation avec export en format norme Le processus est donc presque autoshymatiseacute entre la navigation avec le module de Firefox Zotero et la geacuteneacuteration dune base de connaissances de tous les articles inteacuteressants sur un sujet Il suffit pour cela de configurer une connexion agrave un serveur MySQL local ou distant

Fonctionnaliteacutes de JabRef

Pour les reacutedacteurs en sciences dites dures lutishylisation de LaTEX et lusage de BibTEX avec un fichier bien formaliseacute forment un preacuterequis implicite pour soushymettre des articles dans la plupart des revues JabRef offre lopportuniteacute de formaliser des bibliographies de maniegravere tregraves stricte Si les champs obligatoires ne sont pas renseigneacutes ou sont mal renseigneacutes le logiciel le signale de maniegravere claire par un point rouge Un autre

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avantage de ce logiciel est quil est gratuit et sinstalle facishylement Toulin Chazelas et Palencia (2008) preacutesentent JabRef comme compatible avec plusieurs traitements de texte dont MS Word via le format RTF La suite de bureautique la plus compatible est OpenOfrke et sa version redevenue libre LibreOffice JabRef est capable de geacuteneacuterer une bibliographie au format OpenDocument (ods) le format du tableur de LibreOfshyfice pour ensuite limporter dans le traitement de texte Ce nest que depuis janvier 2011 et la version 27 becircta du logishyciel quun deacutebut de compatishybiliteacute avec Word de MS Office se concreacutetise autrement que par un export RTF5 Il semble quavec quelques manipulashytions de configuration JabRef soit compatible avec MS Word directement en mode insertion

Une autre fonctionnashyliteacute de JabRef deacutecrite par les auteurs du logiciel permet dinscrire ses propres meacutetadonneacutees dans les fichiers PDF gracircce agrave la technologie XMP Gracircce agrave ces meacutetashydonneacutees les chercheurs peuvent eacutechanger des fichiers annoteacutes et enrichis de mots cleacutes et de commentaires Ainsi les chercheurs ont accegraves non seulement au docushyment primaire et agrave sa notice mais aussi aux annotations et meacutetadonneacutees ajouteacutees par leurs collegravegues

Le point faible de ce logiciel reacuteside dans sa meacutediocre interaction avec les outils de traitement de texte En effet une phase dexport en XML OpenDocument est neacutecessaire pour importer les citations dans MS Word et cette manipulation nest pas anodine pour un utilisashyteur non aguerri Cependant comme son usage est claishyrement orienteacute pour le couple BibTEX LaTEX lincon-fort reste mineur Son point fort est la souplesse dutishylisation ladaptabiliteacute mais eacutegalement la rigueur de creacuteation de fichier BibTcX

Mendeley Desktop

Formats dimport de Mendeley Desktop

Mendeley Desktop permet dimporter directement les meacutetadonneacutees depuis les documents notamment les fichiers PDF Les autres formats dimport sont le Ovid le RIS le BibTEX le EndNote XML le TXT (texte brut) mais aussi et cest un avantage la base Sqlite du module Zotero de Firefox

Formats dexport de Mendeley Desktop

Mendeley propose de creacuteer des bibliographies sous divers formats libres et proprieacutetaires Les plus usiteacutes sont le BibTEX RIS texte brut XML Zotero (zotero sqlite) PDF Il est possible de copiercoller des citations vers BibTEX directement de Mendeley par le presse-papier du systegraveme dexploitation Mendeley propose eacutegalement un module de reacutedaction de citation agrave inteacuteshygrer directement dans Word et Open Office sous forme dune barre doutils

5 lthttpjabrefsourceforgenetrevisionhistoryphpgt consulteacute le 1er septembre 2012

Fonctionnaliteacutes de Mendeley Desktop

Le logiciel offre la possibiliteacute de partager des reacutefeacuteshyrences et les fichiers associeacutes au sein de librairies

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partageacutees entre plusieurs utilisateurs dun mecircme groupe Dans ce cadre lespace de stockage est limiteacute agrave 500 meacutega-octets par compte Les groupes ne peuvent pas accueillir plus de 10 participants par collection parshytageacutee ou laquo Shared Collection raquo dans ce cadre la deacutetecshytion des doublons nest pas geacutereacutee Des options payantes permettent daugmenter lespace de stockage Mendeley permet de partager ses reacutefeacuterences et les documents attashycheacutes ainsi que les meacutetadonneacutees personnaliseacutees Ce logishyciel offre une gestion des fichiers de type PDF capable de lire les meacutetadonneacutees des documents On peut donc geacuteneacuterer les notices bibliographiques depuis les docushyments Cette commoditeacute neacutecessite tout de mecircme une relecture systeacutematique En effet selon les eacutediteurs de textes et les modegraveles fournis par les organisateurs de confeacuterences lorganisation des meacutetadonneacutees peut ecirctre alteacutereacutee Mendeley est compatible avec les logiciels MS Word et OpenOmce nous avons pu tester le module pour Word 2008 et 2011 qui autorise linsertion de reacutefeacuteshyrences dans le texte et leacutedition de la bibliographie

Lextension laquo bookmarklet raquo une fois inteacutegreacutee au navigateur permet de deacutetecter les notices au format COinS et de les importer dans Mendeley agrave la condition davoir un compte en ligne

Dun point de vue fonctionnel un eacuteleacutement tregraves appreacuteciable est la possibiliteacute dannoter un document PDF au sein mecircme du logiciel qui reacutealise la bibliograshyphie Dans lexemple expliciteacute par la capture (Figure 2)

le document de lauteur Dinet a pu ecirctre annoteacute (1) et reacuteutishyliseacute ulteacuterieurement En effet au cours de la lecture nous avions pu surligner (2) les passages cleacutes et annoter le document gracircce agrave Mendeley Desktop Par la suite la note apparaicirct comme un post-it flotshytant dans le document pregraves de son point dancrage (3)

Bibdesk

Plateforme dexeacutecution et format dimport unique

Leacutediteur graphique BibDesk nest disponible que sur plateshyforme Apple Il est deacutedieacute aux bibliographies LaTEX cest-agrave-dire au format BibTEX et ne gegravere donc que les fichiers agrave extensionbib Linterface est simple La Figure 3 montre leacutedition dun article avec sur la partie de droite les hypershyliens (2) et la bibliothegraveque numeacuterique (1) ougrave larticle est officiellement reacutefeacuterenceacute Les

auteurs sont eacutegalement clairement identifieacutes en bas agrave droite (3) La partie de gauche est reacuteserveacutee aux meacutetashydonneacutees de larticle dont les mots cleacutes qui revecirctent une importance particuliegravere (4)

Formats dexport de BibDesk

Le premier et principal format dexport de BibDesk est bien sucircr le BibTEX Utiliser un logiciel limite les posshysibiliteacutes derreur agrave la compilation du document LaTEX qui par exemple exige que tous les caractegraveres accenshytueacutes soient reformateacutes pour ecirctre valides et cette option de laquo nettoyage raquo nest pas neacutegligeable lors de la compishylation dune thegravese comportant plus dune centaine de citations Un temps conseacutequent de deacutebogage peut ainsi ecirctre gagneacute BibDesk propose eacutegalement dexporter des notices bibliographiques ou des bibliographies comshyplegravetes dans les formats RIS et COinS dans un site Web par BibDesk

Fonctionnaliteacutes compleacutementaires de BibDesk

Le logiciel ne sarrecircte pas agrave leacutedition des notices contenues dans une bibliographie au format LaTEX il integravegre en outre un systegraveme dauto completion des mots cleacutes et des fonctionnaliteacutes de classement laquo intelshyligent raquo gracircce agrave ces mecircmes mots cleacutes Le classement

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s effectue eacutegalement agrave partir de filtres sur des opeacuterateurs de type laquo est raquo ou laquo contient raquo et peut sappliquer sur nimshyporte quel champs BibTEX par exemple lauteur le titre ou les mots cleacutes Dans lexemple de la Figure 4 les eacuteleacutements (1) repreacutesentent les champs laquo tester raquo avec 1 laquo opeacuterateur raquo (2) et les laquo arguments raquo (3) Cela peut ecirctre traduit en langage naturel par laquo creacuteation dun groupe filtrant les documents comportant les mots cleacutes ACM et CCS raquo

BibDesk possegravede son propre moteur dindexation auquel il est possible dapshypliquer des regravegles de classeshyment en groupes intelligents Le moteur de recherche de BibDesk permet danalyser la structure des fichiers biblioshygraphiques au format BibTEX ainsi que bon nombre de bases de connaissances preacutedeacutefinies Parmi ces bases de connaissances citons

bull des sites dont laccegraves en consultation est gratuit comme ACM (meta donneacutees et reacutesumeacutes en accegraves libre) arXiv CiteULike Google Scholar IACR (Cryptologie)

bull des sites accessibles par abonnement comme IEEE Xplore MathSciNet Project Euclid Sprin-gerLink Zentralblatt Math

bull les sites respectant les normes bibliographiques BibTEX COinS HCite cette option permet dutiliser BibDesk comme navigateur Web deacutedieacute agrave la recherche scientifique et dinseacuterer agrave la voleacutee les notices neacutecessaires agrave leacutetablissement dune bibliographie

BibDesk possegravede une interface de navigation Web qui propose la deacutetection de notices bibliographiques au format OpenURL Il est ainsi possible dinseacuterer direcshytement les citations dans la base de notices dun simple clic sur le bouton laquo importer raquo

Depuis janvier 2011 la communauteacute Bibdesk propose un module qui permet dutiliser BibDesk avec le traitement de texte MS Word pour inseacuterer dynamishyquement des citations et geacuteneacuterer la bibliographie dun document

Zotero

Formats dimport de Zotero

Bien sucircr la capaciteacute de Zotero agrave deacutetecter un docushyment ou une notice deacutependra de lexposition des meacuteta-

donneacutees Il faut agrave minima que le document soit deacutecrit de maniegravere correcte en Dublin Core sur la page XHTML Les reacutesultats visibles agrave lœil cest-agrave-dire les liens vers les ressources sont ainsi accompagneacutes par des meacuteta-donneacutees descriptives normaliseacutees Zotero est agrave mecircme de comprendre ces meacutetadonneacutees et de les proposer agrave lusager soit en import massif soit en ne seacutelectionnant que les documents inteacuteressant le chercheur Les notices glaneacutees peuvent ensuite ecirctre eacutediteacutees trieacutees et classeacutees Un moteur de recherche inteacutegreacute permet dacceacuteder intuishytivement au catalogue ainsi reacutealiseacute

Formats dexport de Zotero

Zotero permet lexport de tout ou partie de sa base de citations aux formats RIS BibTEX RDF Refer et MODS Il est possible de copier une reacutefeacuterence dans le presse-papier pour ensuite la coller dans son traitement de texte favori en tant queacuteleacutement de bibliographie ou texte formateacute Il existe un module dinteacutegration pour MS Word qui permet limport formateacute depuis Zotero

Fonctionnaliteacutes de Zotero

Notons que Zotero permet la geacuteneacuteration de fichiers au format BibTEX Il semble que le gros avantage de Zotero soit de pouvoir deacutetecter intelligemment aussi bien les reacutefeacuterences bibliographiques que les documents eux-mecircmes Zotero offre donc une chaicircne de producshytion quasi automatiseacutee allant de la deacutetection ou limport jusquagrave la geacuteneacuteration de bibliographies en de nombreux styles et sous de nombreux formats Il est compatible avec Word lautre outil de production scientifique et il est mecircme possible dexporter une citation biblio-

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graphique par un simple laquo cliquer deacuteplacer raquo vers un eacutediteur ou un client de messagerie Sous Word 2008 et 2011 (MAC OS) un portage a eacuteteacute proposeacute pour inseacuterer des citations depuis Zotero et geacuteneacuterer dynamiquement la bibliographie avec quelques styles

Ce module possegravede eacutegalement un moteur de recherche inteacutegreacute permettant de parcourir les reacutefeacuterences enregistreacutees dans la base de lutilisateur Le reacuteel inteacuterecirct de Zotero est de proposer la possibiliteacute de deacutetecter sur le Web des ressources documentaires de diffeacuterents types et denregistrer en masse des notices bibliographiques gracircce aux meacutetadonneacutees exposeacutees par le site Web

Ici agrave lissue dune requecircte sur Google Scholar la reacuteponse est constitueacutee deacuteleacutements bibliographiques deacutetectables seacutepareacutement Licocircne Zotero de la barre de navigation signale la preacutesence de multiples entreacutees En cliquant sur cette icocircne une fenecirctre dalerte propose denregistrer une ou plusieurs notices dans la base (Figure 5)

Zotero permet eacutegalement au navigateur de deacutetecshyter et denregistrer un eacuteleacutement isoleacute comme la page pershysonnelle dun chercheur offrant la lecture de son dernier article Sil sagit dun document unique deacutecrit sur une page Web le module preacutecisera le type du document (un article un livre ou une videacuteo) lors de sa deacutetection en affichant une icocircne agrave droite dans la barre de navigation (par exemple un livre un chapitre un article dencycloshypeacutedie sera symboliseacute par un petit livre bleu)

Linterface de Zotero est inteacutegreacutee agrave Mozilla Firefox et peut sactiver agrave tout moment en cliquant sur le logo Zotero en bas agrave droite du navigateur Dans la Figure 6 sur la gauche (1) les collections sont classeacutees dans la

laquo Bibliothegraveque raquo qui repreacuteshysente lensemble des notices bibliographiques Au centre (2) il est possible de visuashyliser lensemble des articles composant une collection Un encart (3) permet de visualishyser et deacutediter les informations formant la notice relative agrave un document Longlet (4) offre la possibiliteacute dafficher les mots cleacutes potentiellement associeacutes agrave la fiche Comme ces champs sont rarement renseigneacutes il est possible de les choisir soi-mecircme Cette option est preacuteshycieuse pour ceux qui deacutesirent filtrer les articles par mots cleacutes gracircce au moteur inteacutegreacute (5) En cas dexport dune biblioshygraphie les mots cleacutes seront eacutegalement exporteacutes

La force du logiciel est dautoriser la creacuteation et lexport de bibliographies aux

formats deacutediteurs de textes les plus reacutepandus De plus Zotero offre une mise en forme bibliographique adapshytable au domaine de recherche de lutilisateur voire mecircme au type de revue gracircce agrave un vaste panel de styles bibliographiques pour les traitements de texte Depuis janvier 2012 Zotero existe eacutegalement sous forme de logiciel indeacutependant ce qui noblige plus agrave utiliser Firefox

Quel LGRB pour quel usage

Pour connaicirctre les pratiques en matiegravere de creacuteashytion assisteacutee de bibliographies nous nous reacutefeacuterons agrave une enquecircte reacutealiseacutee en deacutecembre 2011 (Kembellec 2012) aupregraves dun panel dutilisateurs de 195 personnes Le groupe est constitueacute de conservateurs et de docushymentalistes de Services Communs de Documentation duniversiteacutes parisiennes denseignants chercheurs en matheacutematiques informatique sciences de la comshymunication et mecircme dun maicirctre de confeacuterences en lettres ayant fait sa thegravese en LaTEX (bien que ces prashytiques soient moins reacutepandues hors des sciences dures et des domaines techniques) Ils ont eacuteteacute interrogeacutes sur la maniegravere dont ils eacutecrivaient leurs bibliographies et les reacuteponses montrent que les usages et pratiques divergent selon les profils dutilisateurs mais aussi selon le type de sciences de rattachement

En STM BibTeX est souvent imposeacute comme format de bibliographie par les revues et eacutediteurs scientishyfiques Pour geacuterer leur bibliographie les chercheurs en sciences dures utilisent pour plus de la moitieacute dentre eux un logiciel deacutedieacute souvent JabRef ou Mendeley en

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collaboration avec Zotero Un usage conjoint de Zotero avec un autre outil permet de repeacuterer et denregistrer les notices depuis Internet puis de geacuterer la bibliographie avec un logiciel deacutedieacute En meacutedecine le format biblioshygraphique Ovid associeacute agrave MS Word pour leacutecriture geacutereacute par Mendeley est une alternative reconnue Nous proshyposons donc en sciences dures (sauf meacutedecine) lusage de JabRef ou BibDesk si lon preacutefegravere eacutecrire sous LaTEX Dans le cas dune pratique deacutecriture sous Ms Word il faut preacutefeacuterer Zotero ou Mendeley

En SHS les documents scientifiques eacutetant essentielshylement reacutedigeacutes avec des traitements de texte classiques les outils deacutedieacutes agrave LaTEX sont hors de propos Mecircme sils commencent agrave devenir compatibles mieux vaut privileacuteshygier des logiciels eacuteprouveacutes tels que Zotero ou Mendeley Cependant ceux qui preacutesentent des travaux agrave la mise en page avanceacutee avec des polices de caractegravere inteacutegrant des caractegraveres de langues mortes ou rares preacutefeacutereront parfois LaTEX Dans ce cas preacutecis assez rare lusage de JabRef ou BibDesk peut ecirctre utile

Dans les centres de documentation les usagers de linformation bibliographique sont souvent deacutejagrave eacutequipeacutes dun LGRB souvent payant comme EndNote Cela ne les empecircche pas de connaicirctre et dutiliser Zotero en compleacutement

Leacutetude montre que toutes les cateacutegories dusashygers (enseignants eacutetudiants documentalistes) utilisent souvent Zotero en association avec un autre logiciel Parmi les logiciels libres ou gratuits Zotero a semble-t-il le monopole de deacutetection des notices bibliograshyphiques et Mendeley celui de la gestion des bibliograshyphies Cependant avec larriveacutee du Zotero autonome (standalone) nous allons peut-ecirctre assister agrave leacutemershygence dun monopole

Conclusion

De plus en plus de solutions libres et gratuites de gestion de bibliographies sont opeacuterationnelles et les logishyciels proprieacutetaires nont plus le monopole de la qualiteacute en ce domaine Il existe donc un vrai choix de logishyciels selon le systegraveme dexploitation et le format biblioshygraphique Comme le faisait remarquer Carole Zweifel (2008) ces logiciels preacutesentent autant sinon plus dinshynovations fonctionnelles que les produits payants Car avec leacutevolution des usages tels le Web 20 et le Web seacutemantique les creacuteateurs de ces produits en sont les premiers usagers Parmi toutes ces applications libres les chercheurs devraient trouver un logiciel offrant une compatibiliteacute satisfaisante en matiegravere dimport dexport de deacutetection et de pratique collaborative

Il est tout agrave fait possible dutiliser les compatibishyliteacutes de formats entre les logiciels pour effectuer une veille technologique une recherche et un formatage norme depuis divers logiciels Par exemple le greffon de Firefox Zotero est particuliegraverement indiqueacute pour glaner

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des notices exposeacutees sur Internet Ensuite les fiches seront exporteacutees au format BibTEX ou RIS dans JabRef Bibdesk ou Mendeley Le fichier dexport enbib ou autre contenant la bibliographie pourra eacutegalement ecirctre exporteacute vers une interface Internet riche (RIA) qui sera accessible depuis nimporte quel poste nomade eacutequipeacute dInternet et dun navigateur Notons que presque tous les logiciels lourds (Mendeley) ou hybride (Zotero) posshysegravedent une plateforme de sauvegarde ou de synchronishysation en ligne qui peut parfois eacutegalement servir de base communautaire Le chaicircnage logiciel requiert une cershytaine expertise rapidement acquise par la manipulation Mais pour ceux qui souhaitent un minimum de manishypulation et une tranquilliteacute desprit sur la qualiteacute de leur bibliographie JabRef est le bon compromis car la posshysibiliteacute de deacutetecter et de manipuler les meacutetadonneacutees des articles au format PDF rend son usage simple et convishyvial De plus les formats dimport-export eacutetant devenus compatibles avec tous les environnements son usage ne se cantonne plus agrave creacuteer des bibliographies pour les eacutedishyteurs OpenOffice et LaTEX

Agrave la question peut on trouver une alternative seacuterieuse aux logiciels de gestion bibliographique laquo proshyfessionnels raquo payants la reacuteponse est claire oui bien sucircr Il existe maintenant des programmes de qualiteacute adapteacutes agrave chaque speacutecialiteacute scientifique mais aussi en accord avec les sensibiliteacutes individuelles face aux diffeacuteshyrents modegraveles eacuteconomiques de distribution reg

Sources consulteacutees

Bergquist M and J Ljungberg 2001 The Power of Gifts Organizshying Social Relationships in Open Source Communities Inforshymation Systems Journal 11 (4) 305-320

DellOrso F 2010 Bibliography Management Software Analysis and Comparison of Some Packages Text ES Burioni Ricerche Bibliografiche En ligne lthttpwwwburioniitforumdel-lorsobms-dasptextindexhtmlgt (consulteacute le 1er septembre 2012)

Jullien N and JB Zimmerman 2005 Peut-on envisager une eacutecoshylogie du logiciel libre favorable aux nuls Cahier de recherche Mocircle armoricain de recherche sur la socieacuteteacute de linformation et les usages dInternet (MARSOIN) (9-2005) En ligne lthttp wwwmarsouinorgspipphp article65gt (consulteacute le ier sepshytembre 2012)

Kembellec G 2012 Technologie et pratiques bibliographiques assoshycieacutees agrave leacutecriture scientifique en milieu universitaire En ligne lthttphalarchives-0uvertesfrhal-00661550gt (consulteacute le ier septembre 2012)

Laskowski T Center for History and New Media Launches Zotero Research Tool The George Mason University Gazette En ligne lthttpgazettegmueduarticles9088gt (consulteacute le ier sepshytembre 2012)

Lupovici C 1998 Le Digital Object Identifier Bulletin des biblioshythegraveques de France 43 (3) 49-54

Masur R 2009 Eacutetude sur la valorisation des logiciels de gestion de reacutefeacuterences bibliographiques (LGRB) dans le milieu des bibliothegraveques universitaires romandes et sur les avantages et limites du plug-in Zotero Genegraveve Haute eacutecole de gestion de Genegraveve (HEG-GE) En ligne lthttpdocreroch

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lmphp Url=iooo4i92009iii2i42i4i-PATDB_2ioipdfgt (consulteacute le 1er septembre 2012)

Poupeau G 2011 Microformats RDF microdata repreacutesenter le contenu dune page Web Documentaliste-Sciences de Vlnjor-mation 48 4) 33

mdashbull RDF La grammaire universelle des machines Documentashyliste-Sciences de lInformation 4 (4) 31 bull

Stallman R 1992 Why Software Should Be Free Software Ownershyship and Intellectual Property Rights 31 En ligne lthttp wwwgnuorgphilpsophyshouldbefreeenhtmlgt (consulteacute le 14 septembre 2012)

Toulin S M Ghazelas and F Palencia 2009 JabRef outil de gestion de donneacutees bibliographiques utilisation avantages et inconveacutenients E-migrinter (3) 58-63

Trainor C and J Price 2010 Chapter 4 The Future of OpenURL Linking Adaptation and Expansion Library Technology

Reports46(7) 27-33 Van deSompel H 2001 Generalizing the OpenURL Framework

Beyond References to Scholarly Works The Bison-Futeacute Model D-lib 7 (78) En ligne lthttpwwwdliborgdlibjulyoi vandesompelo7vandesompelhtmlgt (consulteacute le Ier septembre 2012)

Zweifel C 2008 Logiciels de gestion deacute references bibliograshyphiques Citons le Libre Reumlssi Revue eacutelectronique suisse deacute science de linformation 7 Eh ligne lthttpwwwressich nodei47gt (consulteacute le 14 septembre 2012)

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Page 5: Étude comparée de quatre logiciels de gestion de

Les formats

Les fonctionnaliteacutes eacutetudieacutees sont limport et lexport de notices ainsi que la compatibiliteacute avec les traitements de texte

bull Le logiciel doit ecirctre capable dimporter des bibliographies ou des collections complegravetes preacuteshyformateacutees par dautres LGRB sans perte ni corshyruption de donneacutees

bull Il est indispensable de pouvoir exporter tout ou partie de la base de notices dans un ou plusieurs formats en respectant les normes en vigueur

bull Il est important de pouvoir verser directement des reacutefeacuterences bibliographiques dans son traiteshyment de texte

Les LGBR proposent parfois la gestion des doushyblons (qui garantit lagrave qualiteacute de la base) et la deacutetection derreur de typage documentaire (repeacuterage deacuteleacutements manifestement manquants pour un type de document comme le numeacutero de page dans un article de revue)

Fonctionnaliteacutes dusage

Pour retrouver les reacutefeacuterences correspondant aux citations et auteurs lutilisateur peut souhaiter annoter sa base de citations ou effectuer des classements par sujet Une base indexeacutee offre la possibiliteacute dutiliser des filtres de recherche

Pour des travaux collaboratifs la possibiliteacute de parshytager sa bibliothegraveque de citations est une option indisshypensable Cette fonctionnaliteacute est parfois offerte sous la forme dun reacutepliquacirct de la base de connaissance sur un serveur Internet Cette option permet eacutegalement de saushyvegarder sa base bibliographique

Les logiciels eacutevalueacutes

JabRef (lthttpjabrefsourceforgenetgt)

JabRef est une interface graphique de gestion qui permet de maintenir exclusivement des bibliographies au format BibTEX Ce logiciel est multiplateforme car deacuteveloppeacute en Java Cette programmation autorise donc une compatibiliteacute maximale en termes de systegravemes dexploitation Ainsi le portage de ce logiciel se fera aussi bien sur MAC OS et Windows que sur Linux

Le projet JabRef est neacute de la rencontre de Morten O Alver et Nizar Batada Le premier avait deacuteveloppeacute JBibtexManager et le second BibKeeper La premiegravere version de JabRef neacutee de la fusion des deux logiciels a eacuteteacute diffuseacutee en 2003 Le nom JabRef signifie pour Java a pour Alver b pour Batada et Ref pour Reacutefeacuterence Ce projet libre a rapidement connu un franc succegraves dans la sphegravere delagrave recherche universitaireLes eacutediteurs de sysshytegravemes dexploitation libres lont inteacutegreacute dans de nomshybreuses versions de Linux depuis 2007

Mendeiey Desktop (lthttp wwwmendeieycomgt)

Mendeiey Desktop est un logiciel installeacute localeshyment sur le disque dur de lordinateur Cette applicashytion est speacutecialiseacutee en gestion bibliographique et permet eacutegalement de partager des reacutefeacuterences agrave travers son intershyface Web

Mendeiey Ltd est une socieacuteteacute londonienne La preshymiegravere mouture du logiciel eacuteppnyme a eacuteteacute publieacutee en 2008 Cette solution est gratuite mais nest pas de type laquo Open Source raquo et lextension de stockage en ligne est payante De nouvelles fonctionnaliteacutes sont preacutevues sous forme dextensions payantes comme Mendeiey Institushytional Edition pour les eacutetablissements denseignement supeacuterieur

Bib Desk (lthttpbibdesksourceforgenetgt)

BibDesk est une solution logicielle libre et gratuite qui permet de creacuteer geacuterer et utiliser des donneacutees biblioshygraphiques au format BibTEX Ce programme doteacute dune interface graphique claire et efficace nest disposhynible que pour les ordinateurs Apple

Lanceacute publiquement en 2002 BibDesk est en deacuteveshyloppement continu depuis cette date Bibdesk est un exemple de logiciel libre supporteacute par de nombreux ccedilontributeurs gracircce agrave la plateforme Sourceforge Agrave lorishygine le deacuteveloppeur eacutetait Michael McCracken une grande partie du code a eacuteteacute eacutecrite par Adam Maxwell et Christiaan Hofmacircn Disponible directement agrave partir de SourceForge il est actuellement livreacute avec la distribushytion de TEX MacTEX

Zotero le module du navigateur Firefox (lthttpwwwzoteroorggt)

Zotero est un module logiciel (plug-in) deacuteveloppeacute par le Center for History and New Media de la George Mason University Zotero est agrave part dans le panorama des LGRB car ce module sexeacutecute au sein ducirc navigashyteur Firefox dont il est une composante optionnelle Zotero permet de saisir manuellement des notices au sein dune base locale de les classer et de leacutes exporter sous diffeacuterents formats bibliographiques

La premiegravere version de Zotero a eacuteteacute mise agrave la disshyposition des utilisateurs en octobre 2006 en tant que greffon logiciel pour le navigateur Web Firefox (Laskowski) Depuis une tregraves importante communauteacute internationale sest regroupeacutee pour participer agrave la creacuteashytion de styles bibliographiques Depuis janvier 2011 il existe une version de type logiciel lourd de Zotero laquo standalone Zotero raquo comportant les mecircmes fonctionshynaliteacutes sans neacutecessiter lusage de Firefox

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Protocole de test

Lorsque cela eacutetait possible ces quatre logiciels ont eacuteteacute testeacutes dans les environnements suivants

bull Mac OS X sur un MacBook Pro eacutequipeacute de MS Office 2008 et 2011 LyX Texstudio TexWorks et OpenOffice

bull un ordinateur portable reacutecent eacutequipeacute de Windows 7 MS Office 2007 LyX et OpenOffice

Pour les logiciels compatibles avec le glanage de notices bibliographiques sur les pages Web nous avons deacuteposeacute un fichier HTML bien formeacute avec des notices au format laquo Web de donneacutees raquo sur un site Internet de test Gracircce agrave cette URL nous pouvons juger de la compatibishyliteacute du logiciel avec la navigation en mode glanage dinshyformations Nous avons eacutegalement testeacute la compatibiliteacute des logiciels avec les meacutetadonneacutees associeacutees aux docushyments Pour y parvenir nous proposons aux logiciels de charger un panel de documents scientifiques au format PDF Le corpus est composeacute de fichiers PDF bien formeacutes et correctement annoteacutes gracircce agrave des meacutetadonneacutees au format XMP4

Cet acronyme signifie extensible Metadata Platform plateforme de meacutetadonneacutees extensible Il sagit dun standard proposeacute par Adobe pour inteacutegrer des meacutetadonshyneacutees agrave des fichiers de type PDF

Reacutesultats

Les reacutesultats de la comshyparaison sont preacutesenteacutes ici de faccedilon seacutequentielle pour les quatre logiciels

JabRef

Formats dimport de JabRef

JabRef importe principashylement les notices gracircce agrave des fichiers BibTEX et BibTEXML mais aussi RIS et Refer Bien que ce logiciel sappuie sur une interface graphique son moteur peut ecirctre alimenteacute en ligne de commande Cette opeacuteration peut trouver son inteacuterecirct lors de traitements par lot en shell script Les adeptes de la ligne de commande tels les amateurs de Linux seront particuliegraverement inteacuteresseacutes par cette possibiliteacute de charger des bibliographies issues de divers fichiers aux formats diffeacuterents

Formats dexport de JabRef

Les principaux formats dexport normes supporteacutes sont le RIS le MODS le RDF ((Poupeau 2011) Outre ces quelques formats dexport classiques (Figure 1) JabRef offre la possibiliteacute de se connecter agrave une base de donneacutees et dexporter sa bibliographie sous MySQL Cette possishybiliteacute est particuliegraverement attractive apregraves un moissonshynage ou un glanage intensif dinformation avec export en format norme Le processus est donc presque autoshymatiseacute entre la navigation avec le module de Firefox Zotero et la geacuteneacuteration dune base de connaissances de tous les articles inteacuteressants sur un sujet Il suffit pour cela de configurer une connexion agrave un serveur MySQL local ou distant

Fonctionnaliteacutes de JabRef

Pour les reacutedacteurs en sciences dites dures lutishylisation de LaTEX et lusage de BibTEX avec un fichier bien formaliseacute forment un preacuterequis implicite pour soushymettre des articles dans la plupart des revues JabRef offre lopportuniteacute de formaliser des bibliographies de maniegravere tregraves stricte Si les champs obligatoires ne sont pas renseigneacutes ou sont mal renseigneacutes le logiciel le signale de maniegravere claire par un point rouge Un autre

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avantage de ce logiciel est quil est gratuit et sinstalle facishylement Toulin Chazelas et Palencia (2008) preacutesentent JabRef comme compatible avec plusieurs traitements de texte dont MS Word via le format RTF La suite de bureautique la plus compatible est OpenOfrke et sa version redevenue libre LibreOffice JabRef est capable de geacuteneacuterer une bibliographie au format OpenDocument (ods) le format du tableur de LibreOfshyfice pour ensuite limporter dans le traitement de texte Ce nest que depuis janvier 2011 et la version 27 becircta du logishyciel quun deacutebut de compatishybiliteacute avec Word de MS Office se concreacutetise autrement que par un export RTF5 Il semble quavec quelques manipulashytions de configuration JabRef soit compatible avec MS Word directement en mode insertion

Une autre fonctionnashyliteacute de JabRef deacutecrite par les auteurs du logiciel permet dinscrire ses propres meacutetadonneacutees dans les fichiers PDF gracircce agrave la technologie XMP Gracircce agrave ces meacutetashydonneacutees les chercheurs peuvent eacutechanger des fichiers annoteacutes et enrichis de mots cleacutes et de commentaires Ainsi les chercheurs ont accegraves non seulement au docushyment primaire et agrave sa notice mais aussi aux annotations et meacutetadonneacutees ajouteacutees par leurs collegravegues

Le point faible de ce logiciel reacuteside dans sa meacutediocre interaction avec les outils de traitement de texte En effet une phase dexport en XML OpenDocument est neacutecessaire pour importer les citations dans MS Word et cette manipulation nest pas anodine pour un utilisashyteur non aguerri Cependant comme son usage est claishyrement orienteacute pour le couple BibTEX LaTEX lincon-fort reste mineur Son point fort est la souplesse dutishylisation ladaptabiliteacute mais eacutegalement la rigueur de creacuteation de fichier BibTcX

Mendeley Desktop

Formats dimport de Mendeley Desktop

Mendeley Desktop permet dimporter directement les meacutetadonneacutees depuis les documents notamment les fichiers PDF Les autres formats dimport sont le Ovid le RIS le BibTEX le EndNote XML le TXT (texte brut) mais aussi et cest un avantage la base Sqlite du module Zotero de Firefox

Formats dexport de Mendeley Desktop

Mendeley propose de creacuteer des bibliographies sous divers formats libres et proprieacutetaires Les plus usiteacutes sont le BibTEX RIS texte brut XML Zotero (zotero sqlite) PDF Il est possible de copiercoller des citations vers BibTEX directement de Mendeley par le presse-papier du systegraveme dexploitation Mendeley propose eacutegalement un module de reacutedaction de citation agrave inteacuteshygrer directement dans Word et Open Office sous forme dune barre doutils

5 lthttpjabrefsourceforgenetrevisionhistoryphpgt consulteacute le 1er septembre 2012

Fonctionnaliteacutes de Mendeley Desktop

Le logiciel offre la possibiliteacute de partager des reacutefeacuteshyrences et les fichiers associeacutes au sein de librairies

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partageacutees entre plusieurs utilisateurs dun mecircme groupe Dans ce cadre lespace de stockage est limiteacute agrave 500 meacutega-octets par compte Les groupes ne peuvent pas accueillir plus de 10 participants par collection parshytageacutee ou laquo Shared Collection raquo dans ce cadre la deacutetecshytion des doublons nest pas geacutereacutee Des options payantes permettent daugmenter lespace de stockage Mendeley permet de partager ses reacutefeacuterences et les documents attashycheacutes ainsi que les meacutetadonneacutees personnaliseacutees Ce logishyciel offre une gestion des fichiers de type PDF capable de lire les meacutetadonneacutees des documents On peut donc geacuteneacuterer les notices bibliographiques depuis les docushyments Cette commoditeacute neacutecessite tout de mecircme une relecture systeacutematique En effet selon les eacutediteurs de textes et les modegraveles fournis par les organisateurs de confeacuterences lorganisation des meacutetadonneacutees peut ecirctre alteacutereacutee Mendeley est compatible avec les logiciels MS Word et OpenOmce nous avons pu tester le module pour Word 2008 et 2011 qui autorise linsertion de reacutefeacuteshyrences dans le texte et leacutedition de la bibliographie

Lextension laquo bookmarklet raquo une fois inteacutegreacutee au navigateur permet de deacutetecter les notices au format COinS et de les importer dans Mendeley agrave la condition davoir un compte en ligne

Dun point de vue fonctionnel un eacuteleacutement tregraves appreacuteciable est la possibiliteacute dannoter un document PDF au sein mecircme du logiciel qui reacutealise la bibliograshyphie Dans lexemple expliciteacute par la capture (Figure 2)

le document de lauteur Dinet a pu ecirctre annoteacute (1) et reacuteutishyliseacute ulteacuterieurement En effet au cours de la lecture nous avions pu surligner (2) les passages cleacutes et annoter le document gracircce agrave Mendeley Desktop Par la suite la note apparaicirct comme un post-it flotshytant dans le document pregraves de son point dancrage (3)

Bibdesk

Plateforme dexeacutecution et format dimport unique

Leacutediteur graphique BibDesk nest disponible que sur plateshyforme Apple Il est deacutedieacute aux bibliographies LaTEX cest-agrave-dire au format BibTEX et ne gegravere donc que les fichiers agrave extensionbib Linterface est simple La Figure 3 montre leacutedition dun article avec sur la partie de droite les hypershyliens (2) et la bibliothegraveque numeacuterique (1) ougrave larticle est officiellement reacutefeacuterenceacute Les

auteurs sont eacutegalement clairement identifieacutes en bas agrave droite (3) La partie de gauche est reacuteserveacutee aux meacutetashydonneacutees de larticle dont les mots cleacutes qui revecirctent une importance particuliegravere (4)

Formats dexport de BibDesk

Le premier et principal format dexport de BibDesk est bien sucircr le BibTEX Utiliser un logiciel limite les posshysibiliteacutes derreur agrave la compilation du document LaTEX qui par exemple exige que tous les caractegraveres accenshytueacutes soient reformateacutes pour ecirctre valides et cette option de laquo nettoyage raquo nest pas neacutegligeable lors de la compishylation dune thegravese comportant plus dune centaine de citations Un temps conseacutequent de deacutebogage peut ainsi ecirctre gagneacute BibDesk propose eacutegalement dexporter des notices bibliographiques ou des bibliographies comshyplegravetes dans les formats RIS et COinS dans un site Web par BibDesk

Fonctionnaliteacutes compleacutementaires de BibDesk

Le logiciel ne sarrecircte pas agrave leacutedition des notices contenues dans une bibliographie au format LaTEX il integravegre en outre un systegraveme dauto completion des mots cleacutes et des fonctionnaliteacutes de classement laquo intelshyligent raquo gracircce agrave ces mecircmes mots cleacutes Le classement

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s effectue eacutegalement agrave partir de filtres sur des opeacuterateurs de type laquo est raquo ou laquo contient raquo et peut sappliquer sur nimshyporte quel champs BibTEX par exemple lauteur le titre ou les mots cleacutes Dans lexemple de la Figure 4 les eacuteleacutements (1) repreacutesentent les champs laquo tester raquo avec 1 laquo opeacuterateur raquo (2) et les laquo arguments raquo (3) Cela peut ecirctre traduit en langage naturel par laquo creacuteation dun groupe filtrant les documents comportant les mots cleacutes ACM et CCS raquo

BibDesk possegravede son propre moteur dindexation auquel il est possible dapshypliquer des regravegles de classeshyment en groupes intelligents Le moteur de recherche de BibDesk permet danalyser la structure des fichiers biblioshygraphiques au format BibTEX ainsi que bon nombre de bases de connaissances preacutedeacutefinies Parmi ces bases de connaissances citons

bull des sites dont laccegraves en consultation est gratuit comme ACM (meta donneacutees et reacutesumeacutes en accegraves libre) arXiv CiteULike Google Scholar IACR (Cryptologie)

bull des sites accessibles par abonnement comme IEEE Xplore MathSciNet Project Euclid Sprin-gerLink Zentralblatt Math

bull les sites respectant les normes bibliographiques BibTEX COinS HCite cette option permet dutiliser BibDesk comme navigateur Web deacutedieacute agrave la recherche scientifique et dinseacuterer agrave la voleacutee les notices neacutecessaires agrave leacutetablissement dune bibliographie

BibDesk possegravede une interface de navigation Web qui propose la deacutetection de notices bibliographiques au format OpenURL Il est ainsi possible dinseacuterer direcshytement les citations dans la base de notices dun simple clic sur le bouton laquo importer raquo

Depuis janvier 2011 la communauteacute Bibdesk propose un module qui permet dutiliser BibDesk avec le traitement de texte MS Word pour inseacuterer dynamishyquement des citations et geacuteneacuterer la bibliographie dun document

Zotero

Formats dimport de Zotero

Bien sucircr la capaciteacute de Zotero agrave deacutetecter un docushyment ou une notice deacutependra de lexposition des meacuteta-

donneacutees Il faut agrave minima que le document soit deacutecrit de maniegravere correcte en Dublin Core sur la page XHTML Les reacutesultats visibles agrave lœil cest-agrave-dire les liens vers les ressources sont ainsi accompagneacutes par des meacuteta-donneacutees descriptives normaliseacutees Zotero est agrave mecircme de comprendre ces meacutetadonneacutees et de les proposer agrave lusager soit en import massif soit en ne seacutelectionnant que les documents inteacuteressant le chercheur Les notices glaneacutees peuvent ensuite ecirctre eacutediteacutees trieacutees et classeacutees Un moteur de recherche inteacutegreacute permet dacceacuteder intuishytivement au catalogue ainsi reacutealiseacute

Formats dexport de Zotero

Zotero permet lexport de tout ou partie de sa base de citations aux formats RIS BibTEX RDF Refer et MODS Il est possible de copier une reacutefeacuterence dans le presse-papier pour ensuite la coller dans son traitement de texte favori en tant queacuteleacutement de bibliographie ou texte formateacute Il existe un module dinteacutegration pour MS Word qui permet limport formateacute depuis Zotero

Fonctionnaliteacutes de Zotero

Notons que Zotero permet la geacuteneacuteration de fichiers au format BibTEX Il semble que le gros avantage de Zotero soit de pouvoir deacutetecter intelligemment aussi bien les reacutefeacuterences bibliographiques que les documents eux-mecircmes Zotero offre donc une chaicircne de producshytion quasi automatiseacutee allant de la deacutetection ou limport jusquagrave la geacuteneacuteration de bibliographies en de nombreux styles et sous de nombreux formats Il est compatible avec Word lautre outil de production scientifique et il est mecircme possible dexporter une citation biblio-

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graphique par un simple laquo cliquer deacuteplacer raquo vers un eacutediteur ou un client de messagerie Sous Word 2008 et 2011 (MAC OS) un portage a eacuteteacute proposeacute pour inseacuterer des citations depuis Zotero et geacuteneacuterer dynamiquement la bibliographie avec quelques styles

Ce module possegravede eacutegalement un moteur de recherche inteacutegreacute permettant de parcourir les reacutefeacuterences enregistreacutees dans la base de lutilisateur Le reacuteel inteacuterecirct de Zotero est de proposer la possibiliteacute de deacutetecter sur le Web des ressources documentaires de diffeacuterents types et denregistrer en masse des notices bibliographiques gracircce aux meacutetadonneacutees exposeacutees par le site Web

Ici agrave lissue dune requecircte sur Google Scholar la reacuteponse est constitueacutee deacuteleacutements bibliographiques deacutetectables seacutepareacutement Licocircne Zotero de la barre de navigation signale la preacutesence de multiples entreacutees En cliquant sur cette icocircne une fenecirctre dalerte propose denregistrer une ou plusieurs notices dans la base (Figure 5)

Zotero permet eacutegalement au navigateur de deacutetecshyter et denregistrer un eacuteleacutement isoleacute comme la page pershysonnelle dun chercheur offrant la lecture de son dernier article Sil sagit dun document unique deacutecrit sur une page Web le module preacutecisera le type du document (un article un livre ou une videacuteo) lors de sa deacutetection en affichant une icocircne agrave droite dans la barre de navigation (par exemple un livre un chapitre un article dencycloshypeacutedie sera symboliseacute par un petit livre bleu)

Linterface de Zotero est inteacutegreacutee agrave Mozilla Firefox et peut sactiver agrave tout moment en cliquant sur le logo Zotero en bas agrave droite du navigateur Dans la Figure 6 sur la gauche (1) les collections sont classeacutees dans la

laquo Bibliothegraveque raquo qui repreacuteshysente lensemble des notices bibliographiques Au centre (2) il est possible de visuashyliser lensemble des articles composant une collection Un encart (3) permet de visualishyser et deacutediter les informations formant la notice relative agrave un document Longlet (4) offre la possibiliteacute dafficher les mots cleacutes potentiellement associeacutes agrave la fiche Comme ces champs sont rarement renseigneacutes il est possible de les choisir soi-mecircme Cette option est preacuteshycieuse pour ceux qui deacutesirent filtrer les articles par mots cleacutes gracircce au moteur inteacutegreacute (5) En cas dexport dune biblioshygraphie les mots cleacutes seront eacutegalement exporteacutes

La force du logiciel est dautoriser la creacuteation et lexport de bibliographies aux

formats deacutediteurs de textes les plus reacutepandus De plus Zotero offre une mise en forme bibliographique adapshytable au domaine de recherche de lutilisateur voire mecircme au type de revue gracircce agrave un vaste panel de styles bibliographiques pour les traitements de texte Depuis janvier 2012 Zotero existe eacutegalement sous forme de logiciel indeacutependant ce qui noblige plus agrave utiliser Firefox

Quel LGRB pour quel usage

Pour connaicirctre les pratiques en matiegravere de creacuteashytion assisteacutee de bibliographies nous nous reacutefeacuterons agrave une enquecircte reacutealiseacutee en deacutecembre 2011 (Kembellec 2012) aupregraves dun panel dutilisateurs de 195 personnes Le groupe est constitueacute de conservateurs et de docushymentalistes de Services Communs de Documentation duniversiteacutes parisiennes denseignants chercheurs en matheacutematiques informatique sciences de la comshymunication et mecircme dun maicirctre de confeacuterences en lettres ayant fait sa thegravese en LaTEX (bien que ces prashytiques soient moins reacutepandues hors des sciences dures et des domaines techniques) Ils ont eacuteteacute interrogeacutes sur la maniegravere dont ils eacutecrivaient leurs bibliographies et les reacuteponses montrent que les usages et pratiques divergent selon les profils dutilisateurs mais aussi selon le type de sciences de rattachement

En STM BibTeX est souvent imposeacute comme format de bibliographie par les revues et eacutediteurs scientishyfiques Pour geacuterer leur bibliographie les chercheurs en sciences dures utilisent pour plus de la moitieacute dentre eux un logiciel deacutedieacute souvent JabRef ou Mendeley en

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collaboration avec Zotero Un usage conjoint de Zotero avec un autre outil permet de repeacuterer et denregistrer les notices depuis Internet puis de geacuterer la bibliographie avec un logiciel deacutedieacute En meacutedecine le format biblioshygraphique Ovid associeacute agrave MS Word pour leacutecriture geacutereacute par Mendeley est une alternative reconnue Nous proshyposons donc en sciences dures (sauf meacutedecine) lusage de JabRef ou BibDesk si lon preacutefegravere eacutecrire sous LaTEX Dans le cas dune pratique deacutecriture sous Ms Word il faut preacutefeacuterer Zotero ou Mendeley

En SHS les documents scientifiques eacutetant essentielshylement reacutedigeacutes avec des traitements de texte classiques les outils deacutedieacutes agrave LaTEX sont hors de propos Mecircme sils commencent agrave devenir compatibles mieux vaut privileacuteshygier des logiciels eacuteprouveacutes tels que Zotero ou Mendeley Cependant ceux qui preacutesentent des travaux agrave la mise en page avanceacutee avec des polices de caractegravere inteacutegrant des caractegraveres de langues mortes ou rares preacutefeacutereront parfois LaTEX Dans ce cas preacutecis assez rare lusage de JabRef ou BibDesk peut ecirctre utile

Dans les centres de documentation les usagers de linformation bibliographique sont souvent deacutejagrave eacutequipeacutes dun LGRB souvent payant comme EndNote Cela ne les empecircche pas de connaicirctre et dutiliser Zotero en compleacutement

Leacutetude montre que toutes les cateacutegories dusashygers (enseignants eacutetudiants documentalistes) utilisent souvent Zotero en association avec un autre logiciel Parmi les logiciels libres ou gratuits Zotero a semble-t-il le monopole de deacutetection des notices bibliograshyphiques et Mendeley celui de la gestion des bibliograshyphies Cependant avec larriveacutee du Zotero autonome (standalone) nous allons peut-ecirctre assister agrave leacutemershygence dun monopole

Conclusion

De plus en plus de solutions libres et gratuites de gestion de bibliographies sont opeacuterationnelles et les logishyciels proprieacutetaires nont plus le monopole de la qualiteacute en ce domaine Il existe donc un vrai choix de logishyciels selon le systegraveme dexploitation et le format biblioshygraphique Comme le faisait remarquer Carole Zweifel (2008) ces logiciels preacutesentent autant sinon plus dinshynovations fonctionnelles que les produits payants Car avec leacutevolution des usages tels le Web 20 et le Web seacutemantique les creacuteateurs de ces produits en sont les premiers usagers Parmi toutes ces applications libres les chercheurs devraient trouver un logiciel offrant une compatibiliteacute satisfaisante en matiegravere dimport dexport de deacutetection et de pratique collaborative

Il est tout agrave fait possible dutiliser les compatibishyliteacutes de formats entre les logiciels pour effectuer une veille technologique une recherche et un formatage norme depuis divers logiciels Par exemple le greffon de Firefox Zotero est particuliegraverement indiqueacute pour glaner

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des notices exposeacutees sur Internet Ensuite les fiches seront exporteacutees au format BibTEX ou RIS dans JabRef Bibdesk ou Mendeley Le fichier dexport enbib ou autre contenant la bibliographie pourra eacutegalement ecirctre exporteacute vers une interface Internet riche (RIA) qui sera accessible depuis nimporte quel poste nomade eacutequipeacute dInternet et dun navigateur Notons que presque tous les logiciels lourds (Mendeley) ou hybride (Zotero) posshysegravedent une plateforme de sauvegarde ou de synchronishysation en ligne qui peut parfois eacutegalement servir de base communautaire Le chaicircnage logiciel requiert une cershytaine expertise rapidement acquise par la manipulation Mais pour ceux qui souhaitent un minimum de manishypulation et une tranquilliteacute desprit sur la qualiteacute de leur bibliographie JabRef est le bon compromis car la posshysibiliteacute de deacutetecter et de manipuler les meacutetadonneacutees des articles au format PDF rend son usage simple et convishyvial De plus les formats dimport-export eacutetant devenus compatibles avec tous les environnements son usage ne se cantonne plus agrave creacuteer des bibliographies pour les eacutedishyteurs OpenOffice et LaTEX

Agrave la question peut on trouver une alternative seacuterieuse aux logiciels de gestion bibliographique laquo proshyfessionnels raquo payants la reacuteponse est claire oui bien sucircr Il existe maintenant des programmes de qualiteacute adapteacutes agrave chaque speacutecialiteacute scientifique mais aussi en accord avec les sensibiliteacutes individuelles face aux diffeacuteshyrents modegraveles eacuteconomiques de distribution reg

Sources consulteacutees

Bergquist M and J Ljungberg 2001 The Power of Gifts Organizshying Social Relationships in Open Source Communities Inforshymation Systems Journal 11 (4) 305-320

DellOrso F 2010 Bibliography Management Software Analysis and Comparison of Some Packages Text ES Burioni Ricerche Bibliografiche En ligne lthttpwwwburioniitforumdel-lorsobms-dasptextindexhtmlgt (consulteacute le 1er septembre 2012)

Jullien N and JB Zimmerman 2005 Peut-on envisager une eacutecoshylogie du logiciel libre favorable aux nuls Cahier de recherche Mocircle armoricain de recherche sur la socieacuteteacute de linformation et les usages dInternet (MARSOIN) (9-2005) En ligne lthttp wwwmarsouinorgspipphp article65gt (consulteacute le ier sepshytembre 2012)

Kembellec G 2012 Technologie et pratiques bibliographiques assoshycieacutees agrave leacutecriture scientifique en milieu universitaire En ligne lthttphalarchives-0uvertesfrhal-00661550gt (consulteacute le ier septembre 2012)

Laskowski T Center for History and New Media Launches Zotero Research Tool The George Mason University Gazette En ligne lthttpgazettegmueduarticles9088gt (consulteacute le ier sepshytembre 2012)

Lupovici C 1998 Le Digital Object Identifier Bulletin des biblioshythegraveques de France 43 (3) 49-54

Masur R 2009 Eacutetude sur la valorisation des logiciels de gestion de reacutefeacuterences bibliographiques (LGRB) dans le milieu des bibliothegraveques universitaires romandes et sur les avantages et limites du plug-in Zotero Genegraveve Haute eacutecole de gestion de Genegraveve (HEG-GE) En ligne lthttpdocreroch

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lmphp Url=iooo4i92009iii2i42i4i-PATDB_2ioipdfgt (consulteacute le 1er septembre 2012)

Poupeau G 2011 Microformats RDF microdata repreacutesenter le contenu dune page Web Documentaliste-Sciences de Vlnjor-mation 48 4) 33

mdashbull RDF La grammaire universelle des machines Documentashyliste-Sciences de lInformation 4 (4) 31 bull

Stallman R 1992 Why Software Should Be Free Software Ownershyship and Intellectual Property Rights 31 En ligne lthttp wwwgnuorgphilpsophyshouldbefreeenhtmlgt (consulteacute le 14 septembre 2012)

Toulin S M Ghazelas and F Palencia 2009 JabRef outil de gestion de donneacutees bibliographiques utilisation avantages et inconveacutenients E-migrinter (3) 58-63

Trainor C and J Price 2010 Chapter 4 The Future of OpenURL Linking Adaptation and Expansion Library Technology

Reports46(7) 27-33 Van deSompel H 2001 Generalizing the OpenURL Framework

Beyond References to Scholarly Works The Bison-Futeacute Model D-lib 7 (78) En ligne lthttpwwwdliborgdlibjulyoi vandesompelo7vandesompelhtmlgt (consulteacute le Ier septembre 2012)

Zweifel C 2008 Logiciels de gestion deacute references bibliograshyphiques Citons le Libre Reumlssi Revue eacutelectronique suisse deacute science de linformation 7 Eh ligne lthttpwwwressich nodei47gt (consulteacute le 14 septembre 2012)

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Page 6: Étude comparée de quatre logiciels de gestion de

Protocole de test

Lorsque cela eacutetait possible ces quatre logiciels ont eacuteteacute testeacutes dans les environnements suivants

bull Mac OS X sur un MacBook Pro eacutequipeacute de MS Office 2008 et 2011 LyX Texstudio TexWorks et OpenOffice

bull un ordinateur portable reacutecent eacutequipeacute de Windows 7 MS Office 2007 LyX et OpenOffice

Pour les logiciels compatibles avec le glanage de notices bibliographiques sur les pages Web nous avons deacuteposeacute un fichier HTML bien formeacute avec des notices au format laquo Web de donneacutees raquo sur un site Internet de test Gracircce agrave cette URL nous pouvons juger de la compatibishyliteacute du logiciel avec la navigation en mode glanage dinshyformations Nous avons eacutegalement testeacute la compatibiliteacute des logiciels avec les meacutetadonneacutees associeacutees aux docushyments Pour y parvenir nous proposons aux logiciels de charger un panel de documents scientifiques au format PDF Le corpus est composeacute de fichiers PDF bien formeacutes et correctement annoteacutes gracircce agrave des meacutetadonneacutees au format XMP4

Cet acronyme signifie extensible Metadata Platform plateforme de meacutetadonneacutees extensible Il sagit dun standard proposeacute par Adobe pour inteacutegrer des meacutetadonshyneacutees agrave des fichiers de type PDF

Reacutesultats

Les reacutesultats de la comshyparaison sont preacutesenteacutes ici de faccedilon seacutequentielle pour les quatre logiciels

JabRef

Formats dimport de JabRef

JabRef importe principashylement les notices gracircce agrave des fichiers BibTEX et BibTEXML mais aussi RIS et Refer Bien que ce logiciel sappuie sur une interface graphique son moteur peut ecirctre alimenteacute en ligne de commande Cette opeacuteration peut trouver son inteacuterecirct lors de traitements par lot en shell script Les adeptes de la ligne de commande tels les amateurs de Linux seront particuliegraverement inteacuteresseacutes par cette possibiliteacute de charger des bibliographies issues de divers fichiers aux formats diffeacuterents

Formats dexport de JabRef

Les principaux formats dexport normes supporteacutes sont le RIS le MODS le RDF ((Poupeau 2011) Outre ces quelques formats dexport classiques (Figure 1) JabRef offre la possibiliteacute de se connecter agrave une base de donneacutees et dexporter sa bibliographie sous MySQL Cette possishybiliteacute est particuliegraverement attractive apregraves un moissonshynage ou un glanage intensif dinformation avec export en format norme Le processus est donc presque autoshymatiseacute entre la navigation avec le module de Firefox Zotero et la geacuteneacuteration dune base de connaissances de tous les articles inteacuteressants sur un sujet Il suffit pour cela de configurer une connexion agrave un serveur MySQL local ou distant

Fonctionnaliteacutes de JabRef

Pour les reacutedacteurs en sciences dites dures lutishylisation de LaTEX et lusage de BibTEX avec un fichier bien formaliseacute forment un preacuterequis implicite pour soushymettre des articles dans la plupart des revues JabRef offre lopportuniteacute de formaliser des bibliographies de maniegravere tregraves stricte Si les champs obligatoires ne sont pas renseigneacutes ou sont mal renseigneacutes le logiciel le signale de maniegravere claire par un point rouge Un autre

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avantage de ce logiciel est quil est gratuit et sinstalle facishylement Toulin Chazelas et Palencia (2008) preacutesentent JabRef comme compatible avec plusieurs traitements de texte dont MS Word via le format RTF La suite de bureautique la plus compatible est OpenOfrke et sa version redevenue libre LibreOffice JabRef est capable de geacuteneacuterer une bibliographie au format OpenDocument (ods) le format du tableur de LibreOfshyfice pour ensuite limporter dans le traitement de texte Ce nest que depuis janvier 2011 et la version 27 becircta du logishyciel quun deacutebut de compatishybiliteacute avec Word de MS Office se concreacutetise autrement que par un export RTF5 Il semble quavec quelques manipulashytions de configuration JabRef soit compatible avec MS Word directement en mode insertion

Une autre fonctionnashyliteacute de JabRef deacutecrite par les auteurs du logiciel permet dinscrire ses propres meacutetadonneacutees dans les fichiers PDF gracircce agrave la technologie XMP Gracircce agrave ces meacutetashydonneacutees les chercheurs peuvent eacutechanger des fichiers annoteacutes et enrichis de mots cleacutes et de commentaires Ainsi les chercheurs ont accegraves non seulement au docushyment primaire et agrave sa notice mais aussi aux annotations et meacutetadonneacutees ajouteacutees par leurs collegravegues

Le point faible de ce logiciel reacuteside dans sa meacutediocre interaction avec les outils de traitement de texte En effet une phase dexport en XML OpenDocument est neacutecessaire pour importer les citations dans MS Word et cette manipulation nest pas anodine pour un utilisashyteur non aguerri Cependant comme son usage est claishyrement orienteacute pour le couple BibTEX LaTEX lincon-fort reste mineur Son point fort est la souplesse dutishylisation ladaptabiliteacute mais eacutegalement la rigueur de creacuteation de fichier BibTcX

Mendeley Desktop

Formats dimport de Mendeley Desktop

Mendeley Desktop permet dimporter directement les meacutetadonneacutees depuis les documents notamment les fichiers PDF Les autres formats dimport sont le Ovid le RIS le BibTEX le EndNote XML le TXT (texte brut) mais aussi et cest un avantage la base Sqlite du module Zotero de Firefox

Formats dexport de Mendeley Desktop

Mendeley propose de creacuteer des bibliographies sous divers formats libres et proprieacutetaires Les plus usiteacutes sont le BibTEX RIS texte brut XML Zotero (zotero sqlite) PDF Il est possible de copiercoller des citations vers BibTEX directement de Mendeley par le presse-papier du systegraveme dexploitation Mendeley propose eacutegalement un module de reacutedaction de citation agrave inteacuteshygrer directement dans Word et Open Office sous forme dune barre doutils

5 lthttpjabrefsourceforgenetrevisionhistoryphpgt consulteacute le 1er septembre 2012

Fonctionnaliteacutes de Mendeley Desktop

Le logiciel offre la possibiliteacute de partager des reacutefeacuteshyrences et les fichiers associeacutes au sein de librairies

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partageacutees entre plusieurs utilisateurs dun mecircme groupe Dans ce cadre lespace de stockage est limiteacute agrave 500 meacutega-octets par compte Les groupes ne peuvent pas accueillir plus de 10 participants par collection parshytageacutee ou laquo Shared Collection raquo dans ce cadre la deacutetecshytion des doublons nest pas geacutereacutee Des options payantes permettent daugmenter lespace de stockage Mendeley permet de partager ses reacutefeacuterences et les documents attashycheacutes ainsi que les meacutetadonneacutees personnaliseacutees Ce logishyciel offre une gestion des fichiers de type PDF capable de lire les meacutetadonneacutees des documents On peut donc geacuteneacuterer les notices bibliographiques depuis les docushyments Cette commoditeacute neacutecessite tout de mecircme une relecture systeacutematique En effet selon les eacutediteurs de textes et les modegraveles fournis par les organisateurs de confeacuterences lorganisation des meacutetadonneacutees peut ecirctre alteacutereacutee Mendeley est compatible avec les logiciels MS Word et OpenOmce nous avons pu tester le module pour Word 2008 et 2011 qui autorise linsertion de reacutefeacuteshyrences dans le texte et leacutedition de la bibliographie

Lextension laquo bookmarklet raquo une fois inteacutegreacutee au navigateur permet de deacutetecter les notices au format COinS et de les importer dans Mendeley agrave la condition davoir un compte en ligne

Dun point de vue fonctionnel un eacuteleacutement tregraves appreacuteciable est la possibiliteacute dannoter un document PDF au sein mecircme du logiciel qui reacutealise la bibliograshyphie Dans lexemple expliciteacute par la capture (Figure 2)

le document de lauteur Dinet a pu ecirctre annoteacute (1) et reacuteutishyliseacute ulteacuterieurement En effet au cours de la lecture nous avions pu surligner (2) les passages cleacutes et annoter le document gracircce agrave Mendeley Desktop Par la suite la note apparaicirct comme un post-it flotshytant dans le document pregraves de son point dancrage (3)

Bibdesk

Plateforme dexeacutecution et format dimport unique

Leacutediteur graphique BibDesk nest disponible que sur plateshyforme Apple Il est deacutedieacute aux bibliographies LaTEX cest-agrave-dire au format BibTEX et ne gegravere donc que les fichiers agrave extensionbib Linterface est simple La Figure 3 montre leacutedition dun article avec sur la partie de droite les hypershyliens (2) et la bibliothegraveque numeacuterique (1) ougrave larticle est officiellement reacutefeacuterenceacute Les

auteurs sont eacutegalement clairement identifieacutes en bas agrave droite (3) La partie de gauche est reacuteserveacutee aux meacutetashydonneacutees de larticle dont les mots cleacutes qui revecirctent une importance particuliegravere (4)

Formats dexport de BibDesk

Le premier et principal format dexport de BibDesk est bien sucircr le BibTEX Utiliser un logiciel limite les posshysibiliteacutes derreur agrave la compilation du document LaTEX qui par exemple exige que tous les caractegraveres accenshytueacutes soient reformateacutes pour ecirctre valides et cette option de laquo nettoyage raquo nest pas neacutegligeable lors de la compishylation dune thegravese comportant plus dune centaine de citations Un temps conseacutequent de deacutebogage peut ainsi ecirctre gagneacute BibDesk propose eacutegalement dexporter des notices bibliographiques ou des bibliographies comshyplegravetes dans les formats RIS et COinS dans un site Web par BibDesk

Fonctionnaliteacutes compleacutementaires de BibDesk

Le logiciel ne sarrecircte pas agrave leacutedition des notices contenues dans une bibliographie au format LaTEX il integravegre en outre un systegraveme dauto completion des mots cleacutes et des fonctionnaliteacutes de classement laquo intelshyligent raquo gracircce agrave ces mecircmes mots cleacutes Le classement

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s effectue eacutegalement agrave partir de filtres sur des opeacuterateurs de type laquo est raquo ou laquo contient raquo et peut sappliquer sur nimshyporte quel champs BibTEX par exemple lauteur le titre ou les mots cleacutes Dans lexemple de la Figure 4 les eacuteleacutements (1) repreacutesentent les champs laquo tester raquo avec 1 laquo opeacuterateur raquo (2) et les laquo arguments raquo (3) Cela peut ecirctre traduit en langage naturel par laquo creacuteation dun groupe filtrant les documents comportant les mots cleacutes ACM et CCS raquo

BibDesk possegravede son propre moteur dindexation auquel il est possible dapshypliquer des regravegles de classeshyment en groupes intelligents Le moteur de recherche de BibDesk permet danalyser la structure des fichiers biblioshygraphiques au format BibTEX ainsi que bon nombre de bases de connaissances preacutedeacutefinies Parmi ces bases de connaissances citons

bull des sites dont laccegraves en consultation est gratuit comme ACM (meta donneacutees et reacutesumeacutes en accegraves libre) arXiv CiteULike Google Scholar IACR (Cryptologie)

bull des sites accessibles par abonnement comme IEEE Xplore MathSciNet Project Euclid Sprin-gerLink Zentralblatt Math

bull les sites respectant les normes bibliographiques BibTEX COinS HCite cette option permet dutiliser BibDesk comme navigateur Web deacutedieacute agrave la recherche scientifique et dinseacuterer agrave la voleacutee les notices neacutecessaires agrave leacutetablissement dune bibliographie

BibDesk possegravede une interface de navigation Web qui propose la deacutetection de notices bibliographiques au format OpenURL Il est ainsi possible dinseacuterer direcshytement les citations dans la base de notices dun simple clic sur le bouton laquo importer raquo

Depuis janvier 2011 la communauteacute Bibdesk propose un module qui permet dutiliser BibDesk avec le traitement de texte MS Word pour inseacuterer dynamishyquement des citations et geacuteneacuterer la bibliographie dun document

Zotero

Formats dimport de Zotero

Bien sucircr la capaciteacute de Zotero agrave deacutetecter un docushyment ou une notice deacutependra de lexposition des meacuteta-

donneacutees Il faut agrave minima que le document soit deacutecrit de maniegravere correcte en Dublin Core sur la page XHTML Les reacutesultats visibles agrave lœil cest-agrave-dire les liens vers les ressources sont ainsi accompagneacutes par des meacuteta-donneacutees descriptives normaliseacutees Zotero est agrave mecircme de comprendre ces meacutetadonneacutees et de les proposer agrave lusager soit en import massif soit en ne seacutelectionnant que les documents inteacuteressant le chercheur Les notices glaneacutees peuvent ensuite ecirctre eacutediteacutees trieacutees et classeacutees Un moteur de recherche inteacutegreacute permet dacceacuteder intuishytivement au catalogue ainsi reacutealiseacute

Formats dexport de Zotero

Zotero permet lexport de tout ou partie de sa base de citations aux formats RIS BibTEX RDF Refer et MODS Il est possible de copier une reacutefeacuterence dans le presse-papier pour ensuite la coller dans son traitement de texte favori en tant queacuteleacutement de bibliographie ou texte formateacute Il existe un module dinteacutegration pour MS Word qui permet limport formateacute depuis Zotero

Fonctionnaliteacutes de Zotero

Notons que Zotero permet la geacuteneacuteration de fichiers au format BibTEX Il semble que le gros avantage de Zotero soit de pouvoir deacutetecter intelligemment aussi bien les reacutefeacuterences bibliographiques que les documents eux-mecircmes Zotero offre donc une chaicircne de producshytion quasi automatiseacutee allant de la deacutetection ou limport jusquagrave la geacuteneacuteration de bibliographies en de nombreux styles et sous de nombreux formats Il est compatible avec Word lautre outil de production scientifique et il est mecircme possible dexporter une citation biblio-

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graphique par un simple laquo cliquer deacuteplacer raquo vers un eacutediteur ou un client de messagerie Sous Word 2008 et 2011 (MAC OS) un portage a eacuteteacute proposeacute pour inseacuterer des citations depuis Zotero et geacuteneacuterer dynamiquement la bibliographie avec quelques styles

Ce module possegravede eacutegalement un moteur de recherche inteacutegreacute permettant de parcourir les reacutefeacuterences enregistreacutees dans la base de lutilisateur Le reacuteel inteacuterecirct de Zotero est de proposer la possibiliteacute de deacutetecter sur le Web des ressources documentaires de diffeacuterents types et denregistrer en masse des notices bibliographiques gracircce aux meacutetadonneacutees exposeacutees par le site Web

Ici agrave lissue dune requecircte sur Google Scholar la reacuteponse est constitueacutee deacuteleacutements bibliographiques deacutetectables seacutepareacutement Licocircne Zotero de la barre de navigation signale la preacutesence de multiples entreacutees En cliquant sur cette icocircne une fenecirctre dalerte propose denregistrer une ou plusieurs notices dans la base (Figure 5)

Zotero permet eacutegalement au navigateur de deacutetecshyter et denregistrer un eacuteleacutement isoleacute comme la page pershysonnelle dun chercheur offrant la lecture de son dernier article Sil sagit dun document unique deacutecrit sur une page Web le module preacutecisera le type du document (un article un livre ou une videacuteo) lors de sa deacutetection en affichant une icocircne agrave droite dans la barre de navigation (par exemple un livre un chapitre un article dencycloshypeacutedie sera symboliseacute par un petit livre bleu)

Linterface de Zotero est inteacutegreacutee agrave Mozilla Firefox et peut sactiver agrave tout moment en cliquant sur le logo Zotero en bas agrave droite du navigateur Dans la Figure 6 sur la gauche (1) les collections sont classeacutees dans la

laquo Bibliothegraveque raquo qui repreacuteshysente lensemble des notices bibliographiques Au centre (2) il est possible de visuashyliser lensemble des articles composant une collection Un encart (3) permet de visualishyser et deacutediter les informations formant la notice relative agrave un document Longlet (4) offre la possibiliteacute dafficher les mots cleacutes potentiellement associeacutes agrave la fiche Comme ces champs sont rarement renseigneacutes il est possible de les choisir soi-mecircme Cette option est preacuteshycieuse pour ceux qui deacutesirent filtrer les articles par mots cleacutes gracircce au moteur inteacutegreacute (5) En cas dexport dune biblioshygraphie les mots cleacutes seront eacutegalement exporteacutes

La force du logiciel est dautoriser la creacuteation et lexport de bibliographies aux

formats deacutediteurs de textes les plus reacutepandus De plus Zotero offre une mise en forme bibliographique adapshytable au domaine de recherche de lutilisateur voire mecircme au type de revue gracircce agrave un vaste panel de styles bibliographiques pour les traitements de texte Depuis janvier 2012 Zotero existe eacutegalement sous forme de logiciel indeacutependant ce qui noblige plus agrave utiliser Firefox

Quel LGRB pour quel usage

Pour connaicirctre les pratiques en matiegravere de creacuteashytion assisteacutee de bibliographies nous nous reacutefeacuterons agrave une enquecircte reacutealiseacutee en deacutecembre 2011 (Kembellec 2012) aupregraves dun panel dutilisateurs de 195 personnes Le groupe est constitueacute de conservateurs et de docushymentalistes de Services Communs de Documentation duniversiteacutes parisiennes denseignants chercheurs en matheacutematiques informatique sciences de la comshymunication et mecircme dun maicirctre de confeacuterences en lettres ayant fait sa thegravese en LaTEX (bien que ces prashytiques soient moins reacutepandues hors des sciences dures et des domaines techniques) Ils ont eacuteteacute interrogeacutes sur la maniegravere dont ils eacutecrivaient leurs bibliographies et les reacuteponses montrent que les usages et pratiques divergent selon les profils dutilisateurs mais aussi selon le type de sciences de rattachement

En STM BibTeX est souvent imposeacute comme format de bibliographie par les revues et eacutediteurs scientishyfiques Pour geacuterer leur bibliographie les chercheurs en sciences dures utilisent pour plus de la moitieacute dentre eux un logiciel deacutedieacute souvent JabRef ou Mendeley en

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collaboration avec Zotero Un usage conjoint de Zotero avec un autre outil permet de repeacuterer et denregistrer les notices depuis Internet puis de geacuterer la bibliographie avec un logiciel deacutedieacute En meacutedecine le format biblioshygraphique Ovid associeacute agrave MS Word pour leacutecriture geacutereacute par Mendeley est une alternative reconnue Nous proshyposons donc en sciences dures (sauf meacutedecine) lusage de JabRef ou BibDesk si lon preacutefegravere eacutecrire sous LaTEX Dans le cas dune pratique deacutecriture sous Ms Word il faut preacutefeacuterer Zotero ou Mendeley

En SHS les documents scientifiques eacutetant essentielshylement reacutedigeacutes avec des traitements de texte classiques les outils deacutedieacutes agrave LaTEX sont hors de propos Mecircme sils commencent agrave devenir compatibles mieux vaut privileacuteshygier des logiciels eacuteprouveacutes tels que Zotero ou Mendeley Cependant ceux qui preacutesentent des travaux agrave la mise en page avanceacutee avec des polices de caractegravere inteacutegrant des caractegraveres de langues mortes ou rares preacutefeacutereront parfois LaTEX Dans ce cas preacutecis assez rare lusage de JabRef ou BibDesk peut ecirctre utile

Dans les centres de documentation les usagers de linformation bibliographique sont souvent deacutejagrave eacutequipeacutes dun LGRB souvent payant comme EndNote Cela ne les empecircche pas de connaicirctre et dutiliser Zotero en compleacutement

Leacutetude montre que toutes les cateacutegories dusashygers (enseignants eacutetudiants documentalistes) utilisent souvent Zotero en association avec un autre logiciel Parmi les logiciels libres ou gratuits Zotero a semble-t-il le monopole de deacutetection des notices bibliograshyphiques et Mendeley celui de la gestion des bibliograshyphies Cependant avec larriveacutee du Zotero autonome (standalone) nous allons peut-ecirctre assister agrave leacutemershygence dun monopole

Conclusion

De plus en plus de solutions libres et gratuites de gestion de bibliographies sont opeacuterationnelles et les logishyciels proprieacutetaires nont plus le monopole de la qualiteacute en ce domaine Il existe donc un vrai choix de logishyciels selon le systegraveme dexploitation et le format biblioshygraphique Comme le faisait remarquer Carole Zweifel (2008) ces logiciels preacutesentent autant sinon plus dinshynovations fonctionnelles que les produits payants Car avec leacutevolution des usages tels le Web 20 et le Web seacutemantique les creacuteateurs de ces produits en sont les premiers usagers Parmi toutes ces applications libres les chercheurs devraient trouver un logiciel offrant une compatibiliteacute satisfaisante en matiegravere dimport dexport de deacutetection et de pratique collaborative

Il est tout agrave fait possible dutiliser les compatibishyliteacutes de formats entre les logiciels pour effectuer une veille technologique une recherche et un formatage norme depuis divers logiciels Par exemple le greffon de Firefox Zotero est particuliegraverement indiqueacute pour glaner

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des notices exposeacutees sur Internet Ensuite les fiches seront exporteacutees au format BibTEX ou RIS dans JabRef Bibdesk ou Mendeley Le fichier dexport enbib ou autre contenant la bibliographie pourra eacutegalement ecirctre exporteacute vers une interface Internet riche (RIA) qui sera accessible depuis nimporte quel poste nomade eacutequipeacute dInternet et dun navigateur Notons que presque tous les logiciels lourds (Mendeley) ou hybride (Zotero) posshysegravedent une plateforme de sauvegarde ou de synchronishysation en ligne qui peut parfois eacutegalement servir de base communautaire Le chaicircnage logiciel requiert une cershytaine expertise rapidement acquise par la manipulation Mais pour ceux qui souhaitent un minimum de manishypulation et une tranquilliteacute desprit sur la qualiteacute de leur bibliographie JabRef est le bon compromis car la posshysibiliteacute de deacutetecter et de manipuler les meacutetadonneacutees des articles au format PDF rend son usage simple et convishyvial De plus les formats dimport-export eacutetant devenus compatibles avec tous les environnements son usage ne se cantonne plus agrave creacuteer des bibliographies pour les eacutedishyteurs OpenOffice et LaTEX

Agrave la question peut on trouver une alternative seacuterieuse aux logiciels de gestion bibliographique laquo proshyfessionnels raquo payants la reacuteponse est claire oui bien sucircr Il existe maintenant des programmes de qualiteacute adapteacutes agrave chaque speacutecialiteacute scientifique mais aussi en accord avec les sensibiliteacutes individuelles face aux diffeacuteshyrents modegraveles eacuteconomiques de distribution reg

Sources consulteacutees

Bergquist M and J Ljungberg 2001 The Power of Gifts Organizshying Social Relationships in Open Source Communities Inforshymation Systems Journal 11 (4) 305-320

DellOrso F 2010 Bibliography Management Software Analysis and Comparison of Some Packages Text ES Burioni Ricerche Bibliografiche En ligne lthttpwwwburioniitforumdel-lorsobms-dasptextindexhtmlgt (consulteacute le 1er septembre 2012)

Jullien N and JB Zimmerman 2005 Peut-on envisager une eacutecoshylogie du logiciel libre favorable aux nuls Cahier de recherche Mocircle armoricain de recherche sur la socieacuteteacute de linformation et les usages dInternet (MARSOIN) (9-2005) En ligne lthttp wwwmarsouinorgspipphp article65gt (consulteacute le ier sepshytembre 2012)

Kembellec G 2012 Technologie et pratiques bibliographiques assoshycieacutees agrave leacutecriture scientifique en milieu universitaire En ligne lthttphalarchives-0uvertesfrhal-00661550gt (consulteacute le ier septembre 2012)

Laskowski T Center for History and New Media Launches Zotero Research Tool The George Mason University Gazette En ligne lthttpgazettegmueduarticles9088gt (consulteacute le ier sepshytembre 2012)

Lupovici C 1998 Le Digital Object Identifier Bulletin des biblioshythegraveques de France 43 (3) 49-54

Masur R 2009 Eacutetude sur la valorisation des logiciels de gestion de reacutefeacuterences bibliographiques (LGRB) dans le milieu des bibliothegraveques universitaires romandes et sur les avantages et limites du plug-in Zotero Genegraveve Haute eacutecole de gestion de Genegraveve (HEG-GE) En ligne lthttpdocreroch

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lmphp Url=iooo4i92009iii2i42i4i-PATDB_2ioipdfgt (consulteacute le 1er septembre 2012)

Poupeau G 2011 Microformats RDF microdata repreacutesenter le contenu dune page Web Documentaliste-Sciences de Vlnjor-mation 48 4) 33

mdashbull RDF La grammaire universelle des machines Documentashyliste-Sciences de lInformation 4 (4) 31 bull

Stallman R 1992 Why Software Should Be Free Software Ownershyship and Intellectual Property Rights 31 En ligne lthttp wwwgnuorgphilpsophyshouldbefreeenhtmlgt (consulteacute le 14 septembre 2012)

Toulin S M Ghazelas and F Palencia 2009 JabRef outil de gestion de donneacutees bibliographiques utilisation avantages et inconveacutenients E-migrinter (3) 58-63

Trainor C and J Price 2010 Chapter 4 The Future of OpenURL Linking Adaptation and Expansion Library Technology

Reports46(7) 27-33 Van deSompel H 2001 Generalizing the OpenURL Framework

Beyond References to Scholarly Works The Bison-Futeacute Model D-lib 7 (78) En ligne lthttpwwwdliborgdlibjulyoi vandesompelo7vandesompelhtmlgt (consulteacute le Ier septembre 2012)

Zweifel C 2008 Logiciels de gestion deacute references bibliograshyphiques Citons le Libre Reumlssi Revue eacutelectronique suisse deacute science de linformation 7 Eh ligne lthttpwwwressich nodei47gt (consulteacute le 14 septembre 2012)

DOCUMENTATION ET BIBLIOTHEgraveQUES | OCTOBRE bull DEacuteCEMBRE 2012 | 1 9 7

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Page 7: Étude comparée de quatre logiciels de gestion de

avantage de ce logiciel est quil est gratuit et sinstalle facishylement Toulin Chazelas et Palencia (2008) preacutesentent JabRef comme compatible avec plusieurs traitements de texte dont MS Word via le format RTF La suite de bureautique la plus compatible est OpenOfrke et sa version redevenue libre LibreOffice JabRef est capable de geacuteneacuterer une bibliographie au format OpenDocument (ods) le format du tableur de LibreOfshyfice pour ensuite limporter dans le traitement de texte Ce nest que depuis janvier 2011 et la version 27 becircta du logishyciel quun deacutebut de compatishybiliteacute avec Word de MS Office se concreacutetise autrement que par un export RTF5 Il semble quavec quelques manipulashytions de configuration JabRef soit compatible avec MS Word directement en mode insertion

Une autre fonctionnashyliteacute de JabRef deacutecrite par les auteurs du logiciel permet dinscrire ses propres meacutetadonneacutees dans les fichiers PDF gracircce agrave la technologie XMP Gracircce agrave ces meacutetashydonneacutees les chercheurs peuvent eacutechanger des fichiers annoteacutes et enrichis de mots cleacutes et de commentaires Ainsi les chercheurs ont accegraves non seulement au docushyment primaire et agrave sa notice mais aussi aux annotations et meacutetadonneacutees ajouteacutees par leurs collegravegues

Le point faible de ce logiciel reacuteside dans sa meacutediocre interaction avec les outils de traitement de texte En effet une phase dexport en XML OpenDocument est neacutecessaire pour importer les citations dans MS Word et cette manipulation nest pas anodine pour un utilisashyteur non aguerri Cependant comme son usage est claishyrement orienteacute pour le couple BibTEX LaTEX lincon-fort reste mineur Son point fort est la souplesse dutishylisation ladaptabiliteacute mais eacutegalement la rigueur de creacuteation de fichier BibTcX

Mendeley Desktop

Formats dimport de Mendeley Desktop

Mendeley Desktop permet dimporter directement les meacutetadonneacutees depuis les documents notamment les fichiers PDF Les autres formats dimport sont le Ovid le RIS le BibTEX le EndNote XML le TXT (texte brut) mais aussi et cest un avantage la base Sqlite du module Zotero de Firefox

Formats dexport de Mendeley Desktop

Mendeley propose de creacuteer des bibliographies sous divers formats libres et proprieacutetaires Les plus usiteacutes sont le BibTEX RIS texte brut XML Zotero (zotero sqlite) PDF Il est possible de copiercoller des citations vers BibTEX directement de Mendeley par le presse-papier du systegraveme dexploitation Mendeley propose eacutegalement un module de reacutedaction de citation agrave inteacuteshygrer directement dans Word et Open Office sous forme dune barre doutils

5 lthttpjabrefsourceforgenetrevisionhistoryphpgt consulteacute le 1er septembre 2012

Fonctionnaliteacutes de Mendeley Desktop

Le logiciel offre la possibiliteacute de partager des reacutefeacuteshyrences et les fichiers associeacutes au sein de librairies

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partageacutees entre plusieurs utilisateurs dun mecircme groupe Dans ce cadre lespace de stockage est limiteacute agrave 500 meacutega-octets par compte Les groupes ne peuvent pas accueillir plus de 10 participants par collection parshytageacutee ou laquo Shared Collection raquo dans ce cadre la deacutetecshytion des doublons nest pas geacutereacutee Des options payantes permettent daugmenter lespace de stockage Mendeley permet de partager ses reacutefeacuterences et les documents attashycheacutes ainsi que les meacutetadonneacutees personnaliseacutees Ce logishyciel offre une gestion des fichiers de type PDF capable de lire les meacutetadonneacutees des documents On peut donc geacuteneacuterer les notices bibliographiques depuis les docushyments Cette commoditeacute neacutecessite tout de mecircme une relecture systeacutematique En effet selon les eacutediteurs de textes et les modegraveles fournis par les organisateurs de confeacuterences lorganisation des meacutetadonneacutees peut ecirctre alteacutereacutee Mendeley est compatible avec les logiciels MS Word et OpenOmce nous avons pu tester le module pour Word 2008 et 2011 qui autorise linsertion de reacutefeacuteshyrences dans le texte et leacutedition de la bibliographie

Lextension laquo bookmarklet raquo une fois inteacutegreacutee au navigateur permet de deacutetecter les notices au format COinS et de les importer dans Mendeley agrave la condition davoir un compte en ligne

Dun point de vue fonctionnel un eacuteleacutement tregraves appreacuteciable est la possibiliteacute dannoter un document PDF au sein mecircme du logiciel qui reacutealise la bibliograshyphie Dans lexemple expliciteacute par la capture (Figure 2)

le document de lauteur Dinet a pu ecirctre annoteacute (1) et reacuteutishyliseacute ulteacuterieurement En effet au cours de la lecture nous avions pu surligner (2) les passages cleacutes et annoter le document gracircce agrave Mendeley Desktop Par la suite la note apparaicirct comme un post-it flotshytant dans le document pregraves de son point dancrage (3)

Bibdesk

Plateforme dexeacutecution et format dimport unique

Leacutediteur graphique BibDesk nest disponible que sur plateshyforme Apple Il est deacutedieacute aux bibliographies LaTEX cest-agrave-dire au format BibTEX et ne gegravere donc que les fichiers agrave extensionbib Linterface est simple La Figure 3 montre leacutedition dun article avec sur la partie de droite les hypershyliens (2) et la bibliothegraveque numeacuterique (1) ougrave larticle est officiellement reacutefeacuterenceacute Les

auteurs sont eacutegalement clairement identifieacutes en bas agrave droite (3) La partie de gauche est reacuteserveacutee aux meacutetashydonneacutees de larticle dont les mots cleacutes qui revecirctent une importance particuliegravere (4)

Formats dexport de BibDesk

Le premier et principal format dexport de BibDesk est bien sucircr le BibTEX Utiliser un logiciel limite les posshysibiliteacutes derreur agrave la compilation du document LaTEX qui par exemple exige que tous les caractegraveres accenshytueacutes soient reformateacutes pour ecirctre valides et cette option de laquo nettoyage raquo nest pas neacutegligeable lors de la compishylation dune thegravese comportant plus dune centaine de citations Un temps conseacutequent de deacutebogage peut ainsi ecirctre gagneacute BibDesk propose eacutegalement dexporter des notices bibliographiques ou des bibliographies comshyplegravetes dans les formats RIS et COinS dans un site Web par BibDesk

Fonctionnaliteacutes compleacutementaires de BibDesk

Le logiciel ne sarrecircte pas agrave leacutedition des notices contenues dans une bibliographie au format LaTEX il integravegre en outre un systegraveme dauto completion des mots cleacutes et des fonctionnaliteacutes de classement laquo intelshyligent raquo gracircce agrave ces mecircmes mots cleacutes Le classement

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s effectue eacutegalement agrave partir de filtres sur des opeacuterateurs de type laquo est raquo ou laquo contient raquo et peut sappliquer sur nimshyporte quel champs BibTEX par exemple lauteur le titre ou les mots cleacutes Dans lexemple de la Figure 4 les eacuteleacutements (1) repreacutesentent les champs laquo tester raquo avec 1 laquo opeacuterateur raquo (2) et les laquo arguments raquo (3) Cela peut ecirctre traduit en langage naturel par laquo creacuteation dun groupe filtrant les documents comportant les mots cleacutes ACM et CCS raquo

BibDesk possegravede son propre moteur dindexation auquel il est possible dapshypliquer des regravegles de classeshyment en groupes intelligents Le moteur de recherche de BibDesk permet danalyser la structure des fichiers biblioshygraphiques au format BibTEX ainsi que bon nombre de bases de connaissances preacutedeacutefinies Parmi ces bases de connaissances citons

bull des sites dont laccegraves en consultation est gratuit comme ACM (meta donneacutees et reacutesumeacutes en accegraves libre) arXiv CiteULike Google Scholar IACR (Cryptologie)

bull des sites accessibles par abonnement comme IEEE Xplore MathSciNet Project Euclid Sprin-gerLink Zentralblatt Math

bull les sites respectant les normes bibliographiques BibTEX COinS HCite cette option permet dutiliser BibDesk comme navigateur Web deacutedieacute agrave la recherche scientifique et dinseacuterer agrave la voleacutee les notices neacutecessaires agrave leacutetablissement dune bibliographie

BibDesk possegravede une interface de navigation Web qui propose la deacutetection de notices bibliographiques au format OpenURL Il est ainsi possible dinseacuterer direcshytement les citations dans la base de notices dun simple clic sur le bouton laquo importer raquo

Depuis janvier 2011 la communauteacute Bibdesk propose un module qui permet dutiliser BibDesk avec le traitement de texte MS Word pour inseacuterer dynamishyquement des citations et geacuteneacuterer la bibliographie dun document

Zotero

Formats dimport de Zotero

Bien sucircr la capaciteacute de Zotero agrave deacutetecter un docushyment ou une notice deacutependra de lexposition des meacuteta-

donneacutees Il faut agrave minima que le document soit deacutecrit de maniegravere correcte en Dublin Core sur la page XHTML Les reacutesultats visibles agrave lœil cest-agrave-dire les liens vers les ressources sont ainsi accompagneacutes par des meacuteta-donneacutees descriptives normaliseacutees Zotero est agrave mecircme de comprendre ces meacutetadonneacutees et de les proposer agrave lusager soit en import massif soit en ne seacutelectionnant que les documents inteacuteressant le chercheur Les notices glaneacutees peuvent ensuite ecirctre eacutediteacutees trieacutees et classeacutees Un moteur de recherche inteacutegreacute permet dacceacuteder intuishytivement au catalogue ainsi reacutealiseacute

Formats dexport de Zotero

Zotero permet lexport de tout ou partie de sa base de citations aux formats RIS BibTEX RDF Refer et MODS Il est possible de copier une reacutefeacuterence dans le presse-papier pour ensuite la coller dans son traitement de texte favori en tant queacuteleacutement de bibliographie ou texte formateacute Il existe un module dinteacutegration pour MS Word qui permet limport formateacute depuis Zotero

Fonctionnaliteacutes de Zotero

Notons que Zotero permet la geacuteneacuteration de fichiers au format BibTEX Il semble que le gros avantage de Zotero soit de pouvoir deacutetecter intelligemment aussi bien les reacutefeacuterences bibliographiques que les documents eux-mecircmes Zotero offre donc une chaicircne de producshytion quasi automatiseacutee allant de la deacutetection ou limport jusquagrave la geacuteneacuteration de bibliographies en de nombreux styles et sous de nombreux formats Il est compatible avec Word lautre outil de production scientifique et il est mecircme possible dexporter une citation biblio-

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graphique par un simple laquo cliquer deacuteplacer raquo vers un eacutediteur ou un client de messagerie Sous Word 2008 et 2011 (MAC OS) un portage a eacuteteacute proposeacute pour inseacuterer des citations depuis Zotero et geacuteneacuterer dynamiquement la bibliographie avec quelques styles

Ce module possegravede eacutegalement un moteur de recherche inteacutegreacute permettant de parcourir les reacutefeacuterences enregistreacutees dans la base de lutilisateur Le reacuteel inteacuterecirct de Zotero est de proposer la possibiliteacute de deacutetecter sur le Web des ressources documentaires de diffeacuterents types et denregistrer en masse des notices bibliographiques gracircce aux meacutetadonneacutees exposeacutees par le site Web

Ici agrave lissue dune requecircte sur Google Scholar la reacuteponse est constitueacutee deacuteleacutements bibliographiques deacutetectables seacutepareacutement Licocircne Zotero de la barre de navigation signale la preacutesence de multiples entreacutees En cliquant sur cette icocircne une fenecirctre dalerte propose denregistrer une ou plusieurs notices dans la base (Figure 5)

Zotero permet eacutegalement au navigateur de deacutetecshyter et denregistrer un eacuteleacutement isoleacute comme la page pershysonnelle dun chercheur offrant la lecture de son dernier article Sil sagit dun document unique deacutecrit sur une page Web le module preacutecisera le type du document (un article un livre ou une videacuteo) lors de sa deacutetection en affichant une icocircne agrave droite dans la barre de navigation (par exemple un livre un chapitre un article dencycloshypeacutedie sera symboliseacute par un petit livre bleu)

Linterface de Zotero est inteacutegreacutee agrave Mozilla Firefox et peut sactiver agrave tout moment en cliquant sur le logo Zotero en bas agrave droite du navigateur Dans la Figure 6 sur la gauche (1) les collections sont classeacutees dans la

laquo Bibliothegraveque raquo qui repreacuteshysente lensemble des notices bibliographiques Au centre (2) il est possible de visuashyliser lensemble des articles composant une collection Un encart (3) permet de visualishyser et deacutediter les informations formant la notice relative agrave un document Longlet (4) offre la possibiliteacute dafficher les mots cleacutes potentiellement associeacutes agrave la fiche Comme ces champs sont rarement renseigneacutes il est possible de les choisir soi-mecircme Cette option est preacuteshycieuse pour ceux qui deacutesirent filtrer les articles par mots cleacutes gracircce au moteur inteacutegreacute (5) En cas dexport dune biblioshygraphie les mots cleacutes seront eacutegalement exporteacutes

La force du logiciel est dautoriser la creacuteation et lexport de bibliographies aux

formats deacutediteurs de textes les plus reacutepandus De plus Zotero offre une mise en forme bibliographique adapshytable au domaine de recherche de lutilisateur voire mecircme au type de revue gracircce agrave un vaste panel de styles bibliographiques pour les traitements de texte Depuis janvier 2012 Zotero existe eacutegalement sous forme de logiciel indeacutependant ce qui noblige plus agrave utiliser Firefox

Quel LGRB pour quel usage

Pour connaicirctre les pratiques en matiegravere de creacuteashytion assisteacutee de bibliographies nous nous reacutefeacuterons agrave une enquecircte reacutealiseacutee en deacutecembre 2011 (Kembellec 2012) aupregraves dun panel dutilisateurs de 195 personnes Le groupe est constitueacute de conservateurs et de docushymentalistes de Services Communs de Documentation duniversiteacutes parisiennes denseignants chercheurs en matheacutematiques informatique sciences de la comshymunication et mecircme dun maicirctre de confeacuterences en lettres ayant fait sa thegravese en LaTEX (bien que ces prashytiques soient moins reacutepandues hors des sciences dures et des domaines techniques) Ils ont eacuteteacute interrogeacutes sur la maniegravere dont ils eacutecrivaient leurs bibliographies et les reacuteponses montrent que les usages et pratiques divergent selon les profils dutilisateurs mais aussi selon le type de sciences de rattachement

En STM BibTeX est souvent imposeacute comme format de bibliographie par les revues et eacutediteurs scientishyfiques Pour geacuterer leur bibliographie les chercheurs en sciences dures utilisent pour plus de la moitieacute dentre eux un logiciel deacutedieacute souvent JabRef ou Mendeley en

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collaboration avec Zotero Un usage conjoint de Zotero avec un autre outil permet de repeacuterer et denregistrer les notices depuis Internet puis de geacuterer la bibliographie avec un logiciel deacutedieacute En meacutedecine le format biblioshygraphique Ovid associeacute agrave MS Word pour leacutecriture geacutereacute par Mendeley est une alternative reconnue Nous proshyposons donc en sciences dures (sauf meacutedecine) lusage de JabRef ou BibDesk si lon preacutefegravere eacutecrire sous LaTEX Dans le cas dune pratique deacutecriture sous Ms Word il faut preacutefeacuterer Zotero ou Mendeley

En SHS les documents scientifiques eacutetant essentielshylement reacutedigeacutes avec des traitements de texte classiques les outils deacutedieacutes agrave LaTEX sont hors de propos Mecircme sils commencent agrave devenir compatibles mieux vaut privileacuteshygier des logiciels eacuteprouveacutes tels que Zotero ou Mendeley Cependant ceux qui preacutesentent des travaux agrave la mise en page avanceacutee avec des polices de caractegravere inteacutegrant des caractegraveres de langues mortes ou rares preacutefeacutereront parfois LaTEX Dans ce cas preacutecis assez rare lusage de JabRef ou BibDesk peut ecirctre utile

Dans les centres de documentation les usagers de linformation bibliographique sont souvent deacutejagrave eacutequipeacutes dun LGRB souvent payant comme EndNote Cela ne les empecircche pas de connaicirctre et dutiliser Zotero en compleacutement

Leacutetude montre que toutes les cateacutegories dusashygers (enseignants eacutetudiants documentalistes) utilisent souvent Zotero en association avec un autre logiciel Parmi les logiciels libres ou gratuits Zotero a semble-t-il le monopole de deacutetection des notices bibliograshyphiques et Mendeley celui de la gestion des bibliograshyphies Cependant avec larriveacutee du Zotero autonome (standalone) nous allons peut-ecirctre assister agrave leacutemershygence dun monopole

Conclusion

De plus en plus de solutions libres et gratuites de gestion de bibliographies sont opeacuterationnelles et les logishyciels proprieacutetaires nont plus le monopole de la qualiteacute en ce domaine Il existe donc un vrai choix de logishyciels selon le systegraveme dexploitation et le format biblioshygraphique Comme le faisait remarquer Carole Zweifel (2008) ces logiciels preacutesentent autant sinon plus dinshynovations fonctionnelles que les produits payants Car avec leacutevolution des usages tels le Web 20 et le Web seacutemantique les creacuteateurs de ces produits en sont les premiers usagers Parmi toutes ces applications libres les chercheurs devraient trouver un logiciel offrant une compatibiliteacute satisfaisante en matiegravere dimport dexport de deacutetection et de pratique collaborative

Il est tout agrave fait possible dutiliser les compatibishyliteacutes de formats entre les logiciels pour effectuer une veille technologique une recherche et un formatage norme depuis divers logiciels Par exemple le greffon de Firefox Zotero est particuliegraverement indiqueacute pour glaner

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des notices exposeacutees sur Internet Ensuite les fiches seront exporteacutees au format BibTEX ou RIS dans JabRef Bibdesk ou Mendeley Le fichier dexport enbib ou autre contenant la bibliographie pourra eacutegalement ecirctre exporteacute vers une interface Internet riche (RIA) qui sera accessible depuis nimporte quel poste nomade eacutequipeacute dInternet et dun navigateur Notons que presque tous les logiciels lourds (Mendeley) ou hybride (Zotero) posshysegravedent une plateforme de sauvegarde ou de synchronishysation en ligne qui peut parfois eacutegalement servir de base communautaire Le chaicircnage logiciel requiert une cershytaine expertise rapidement acquise par la manipulation Mais pour ceux qui souhaitent un minimum de manishypulation et une tranquilliteacute desprit sur la qualiteacute de leur bibliographie JabRef est le bon compromis car la posshysibiliteacute de deacutetecter et de manipuler les meacutetadonneacutees des articles au format PDF rend son usage simple et convishyvial De plus les formats dimport-export eacutetant devenus compatibles avec tous les environnements son usage ne se cantonne plus agrave creacuteer des bibliographies pour les eacutedishyteurs OpenOffice et LaTEX

Agrave la question peut on trouver une alternative seacuterieuse aux logiciels de gestion bibliographique laquo proshyfessionnels raquo payants la reacuteponse est claire oui bien sucircr Il existe maintenant des programmes de qualiteacute adapteacutes agrave chaque speacutecialiteacute scientifique mais aussi en accord avec les sensibiliteacutes individuelles face aux diffeacuteshyrents modegraveles eacuteconomiques de distribution reg

Sources consulteacutees

Bergquist M and J Ljungberg 2001 The Power of Gifts Organizshying Social Relationships in Open Source Communities Inforshymation Systems Journal 11 (4) 305-320

DellOrso F 2010 Bibliography Management Software Analysis and Comparison of Some Packages Text ES Burioni Ricerche Bibliografiche En ligne lthttpwwwburioniitforumdel-lorsobms-dasptextindexhtmlgt (consulteacute le 1er septembre 2012)

Jullien N and JB Zimmerman 2005 Peut-on envisager une eacutecoshylogie du logiciel libre favorable aux nuls Cahier de recherche Mocircle armoricain de recherche sur la socieacuteteacute de linformation et les usages dInternet (MARSOIN) (9-2005) En ligne lthttp wwwmarsouinorgspipphp article65gt (consulteacute le ier sepshytembre 2012)

Kembellec G 2012 Technologie et pratiques bibliographiques assoshycieacutees agrave leacutecriture scientifique en milieu universitaire En ligne lthttphalarchives-0uvertesfrhal-00661550gt (consulteacute le ier septembre 2012)

Laskowski T Center for History and New Media Launches Zotero Research Tool The George Mason University Gazette En ligne lthttpgazettegmueduarticles9088gt (consulteacute le ier sepshytembre 2012)

Lupovici C 1998 Le Digital Object Identifier Bulletin des biblioshythegraveques de France 43 (3) 49-54

Masur R 2009 Eacutetude sur la valorisation des logiciels de gestion de reacutefeacuterences bibliographiques (LGRB) dans le milieu des bibliothegraveques universitaires romandes et sur les avantages et limites du plug-in Zotero Genegraveve Haute eacutecole de gestion de Genegraveve (HEG-GE) En ligne lthttpdocreroch

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lmphp Url=iooo4i92009iii2i42i4i-PATDB_2ioipdfgt (consulteacute le 1er septembre 2012)

Poupeau G 2011 Microformats RDF microdata repreacutesenter le contenu dune page Web Documentaliste-Sciences de Vlnjor-mation 48 4) 33

mdashbull RDF La grammaire universelle des machines Documentashyliste-Sciences de lInformation 4 (4) 31 bull

Stallman R 1992 Why Software Should Be Free Software Ownershyship and Intellectual Property Rights 31 En ligne lthttp wwwgnuorgphilpsophyshouldbefreeenhtmlgt (consulteacute le 14 septembre 2012)

Toulin S M Ghazelas and F Palencia 2009 JabRef outil de gestion de donneacutees bibliographiques utilisation avantages et inconveacutenients E-migrinter (3) 58-63

Trainor C and J Price 2010 Chapter 4 The Future of OpenURL Linking Adaptation and Expansion Library Technology

Reports46(7) 27-33 Van deSompel H 2001 Generalizing the OpenURL Framework

Beyond References to Scholarly Works The Bison-Futeacute Model D-lib 7 (78) En ligne lthttpwwwdliborgdlibjulyoi vandesompelo7vandesompelhtmlgt (consulteacute le Ier septembre 2012)

Zweifel C 2008 Logiciels de gestion deacute references bibliograshyphiques Citons le Libre Reumlssi Revue eacutelectronique suisse deacute science de linformation 7 Eh ligne lthttpwwwressich nodei47gt (consulteacute le 14 septembre 2012)

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Page 8: Étude comparée de quatre logiciels de gestion de

partageacutees entre plusieurs utilisateurs dun mecircme groupe Dans ce cadre lespace de stockage est limiteacute agrave 500 meacutega-octets par compte Les groupes ne peuvent pas accueillir plus de 10 participants par collection parshytageacutee ou laquo Shared Collection raquo dans ce cadre la deacutetecshytion des doublons nest pas geacutereacutee Des options payantes permettent daugmenter lespace de stockage Mendeley permet de partager ses reacutefeacuterences et les documents attashycheacutes ainsi que les meacutetadonneacutees personnaliseacutees Ce logishyciel offre une gestion des fichiers de type PDF capable de lire les meacutetadonneacutees des documents On peut donc geacuteneacuterer les notices bibliographiques depuis les docushyments Cette commoditeacute neacutecessite tout de mecircme une relecture systeacutematique En effet selon les eacutediteurs de textes et les modegraveles fournis par les organisateurs de confeacuterences lorganisation des meacutetadonneacutees peut ecirctre alteacutereacutee Mendeley est compatible avec les logiciels MS Word et OpenOmce nous avons pu tester le module pour Word 2008 et 2011 qui autorise linsertion de reacutefeacuteshyrences dans le texte et leacutedition de la bibliographie

Lextension laquo bookmarklet raquo une fois inteacutegreacutee au navigateur permet de deacutetecter les notices au format COinS et de les importer dans Mendeley agrave la condition davoir un compte en ligne

Dun point de vue fonctionnel un eacuteleacutement tregraves appreacuteciable est la possibiliteacute dannoter un document PDF au sein mecircme du logiciel qui reacutealise la bibliograshyphie Dans lexemple expliciteacute par la capture (Figure 2)

le document de lauteur Dinet a pu ecirctre annoteacute (1) et reacuteutishyliseacute ulteacuterieurement En effet au cours de la lecture nous avions pu surligner (2) les passages cleacutes et annoter le document gracircce agrave Mendeley Desktop Par la suite la note apparaicirct comme un post-it flotshytant dans le document pregraves de son point dancrage (3)

Bibdesk

Plateforme dexeacutecution et format dimport unique

Leacutediteur graphique BibDesk nest disponible que sur plateshyforme Apple Il est deacutedieacute aux bibliographies LaTEX cest-agrave-dire au format BibTEX et ne gegravere donc que les fichiers agrave extensionbib Linterface est simple La Figure 3 montre leacutedition dun article avec sur la partie de droite les hypershyliens (2) et la bibliothegraveque numeacuterique (1) ougrave larticle est officiellement reacutefeacuterenceacute Les

auteurs sont eacutegalement clairement identifieacutes en bas agrave droite (3) La partie de gauche est reacuteserveacutee aux meacutetashydonneacutees de larticle dont les mots cleacutes qui revecirctent une importance particuliegravere (4)

Formats dexport de BibDesk

Le premier et principal format dexport de BibDesk est bien sucircr le BibTEX Utiliser un logiciel limite les posshysibiliteacutes derreur agrave la compilation du document LaTEX qui par exemple exige que tous les caractegraveres accenshytueacutes soient reformateacutes pour ecirctre valides et cette option de laquo nettoyage raquo nest pas neacutegligeable lors de la compishylation dune thegravese comportant plus dune centaine de citations Un temps conseacutequent de deacutebogage peut ainsi ecirctre gagneacute BibDesk propose eacutegalement dexporter des notices bibliographiques ou des bibliographies comshyplegravetes dans les formats RIS et COinS dans un site Web par BibDesk

Fonctionnaliteacutes compleacutementaires de BibDesk

Le logiciel ne sarrecircte pas agrave leacutedition des notices contenues dans une bibliographie au format LaTEX il integravegre en outre un systegraveme dauto completion des mots cleacutes et des fonctionnaliteacutes de classement laquo intelshyligent raquo gracircce agrave ces mecircmes mots cleacutes Le classement

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s effectue eacutegalement agrave partir de filtres sur des opeacuterateurs de type laquo est raquo ou laquo contient raquo et peut sappliquer sur nimshyporte quel champs BibTEX par exemple lauteur le titre ou les mots cleacutes Dans lexemple de la Figure 4 les eacuteleacutements (1) repreacutesentent les champs laquo tester raquo avec 1 laquo opeacuterateur raquo (2) et les laquo arguments raquo (3) Cela peut ecirctre traduit en langage naturel par laquo creacuteation dun groupe filtrant les documents comportant les mots cleacutes ACM et CCS raquo

BibDesk possegravede son propre moteur dindexation auquel il est possible dapshypliquer des regravegles de classeshyment en groupes intelligents Le moteur de recherche de BibDesk permet danalyser la structure des fichiers biblioshygraphiques au format BibTEX ainsi que bon nombre de bases de connaissances preacutedeacutefinies Parmi ces bases de connaissances citons

bull des sites dont laccegraves en consultation est gratuit comme ACM (meta donneacutees et reacutesumeacutes en accegraves libre) arXiv CiteULike Google Scholar IACR (Cryptologie)

bull des sites accessibles par abonnement comme IEEE Xplore MathSciNet Project Euclid Sprin-gerLink Zentralblatt Math

bull les sites respectant les normes bibliographiques BibTEX COinS HCite cette option permet dutiliser BibDesk comme navigateur Web deacutedieacute agrave la recherche scientifique et dinseacuterer agrave la voleacutee les notices neacutecessaires agrave leacutetablissement dune bibliographie

BibDesk possegravede une interface de navigation Web qui propose la deacutetection de notices bibliographiques au format OpenURL Il est ainsi possible dinseacuterer direcshytement les citations dans la base de notices dun simple clic sur le bouton laquo importer raquo

Depuis janvier 2011 la communauteacute Bibdesk propose un module qui permet dutiliser BibDesk avec le traitement de texte MS Word pour inseacuterer dynamishyquement des citations et geacuteneacuterer la bibliographie dun document

Zotero

Formats dimport de Zotero

Bien sucircr la capaciteacute de Zotero agrave deacutetecter un docushyment ou une notice deacutependra de lexposition des meacuteta-

donneacutees Il faut agrave minima que le document soit deacutecrit de maniegravere correcte en Dublin Core sur la page XHTML Les reacutesultats visibles agrave lœil cest-agrave-dire les liens vers les ressources sont ainsi accompagneacutes par des meacuteta-donneacutees descriptives normaliseacutees Zotero est agrave mecircme de comprendre ces meacutetadonneacutees et de les proposer agrave lusager soit en import massif soit en ne seacutelectionnant que les documents inteacuteressant le chercheur Les notices glaneacutees peuvent ensuite ecirctre eacutediteacutees trieacutees et classeacutees Un moteur de recherche inteacutegreacute permet dacceacuteder intuishytivement au catalogue ainsi reacutealiseacute

Formats dexport de Zotero

Zotero permet lexport de tout ou partie de sa base de citations aux formats RIS BibTEX RDF Refer et MODS Il est possible de copier une reacutefeacuterence dans le presse-papier pour ensuite la coller dans son traitement de texte favori en tant queacuteleacutement de bibliographie ou texte formateacute Il existe un module dinteacutegration pour MS Word qui permet limport formateacute depuis Zotero

Fonctionnaliteacutes de Zotero

Notons que Zotero permet la geacuteneacuteration de fichiers au format BibTEX Il semble que le gros avantage de Zotero soit de pouvoir deacutetecter intelligemment aussi bien les reacutefeacuterences bibliographiques que les documents eux-mecircmes Zotero offre donc une chaicircne de producshytion quasi automatiseacutee allant de la deacutetection ou limport jusquagrave la geacuteneacuteration de bibliographies en de nombreux styles et sous de nombreux formats Il est compatible avec Word lautre outil de production scientifique et il est mecircme possible dexporter une citation biblio-

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graphique par un simple laquo cliquer deacuteplacer raquo vers un eacutediteur ou un client de messagerie Sous Word 2008 et 2011 (MAC OS) un portage a eacuteteacute proposeacute pour inseacuterer des citations depuis Zotero et geacuteneacuterer dynamiquement la bibliographie avec quelques styles

Ce module possegravede eacutegalement un moteur de recherche inteacutegreacute permettant de parcourir les reacutefeacuterences enregistreacutees dans la base de lutilisateur Le reacuteel inteacuterecirct de Zotero est de proposer la possibiliteacute de deacutetecter sur le Web des ressources documentaires de diffeacuterents types et denregistrer en masse des notices bibliographiques gracircce aux meacutetadonneacutees exposeacutees par le site Web

Ici agrave lissue dune requecircte sur Google Scholar la reacuteponse est constitueacutee deacuteleacutements bibliographiques deacutetectables seacutepareacutement Licocircne Zotero de la barre de navigation signale la preacutesence de multiples entreacutees En cliquant sur cette icocircne une fenecirctre dalerte propose denregistrer une ou plusieurs notices dans la base (Figure 5)

Zotero permet eacutegalement au navigateur de deacutetecshyter et denregistrer un eacuteleacutement isoleacute comme la page pershysonnelle dun chercheur offrant la lecture de son dernier article Sil sagit dun document unique deacutecrit sur une page Web le module preacutecisera le type du document (un article un livre ou une videacuteo) lors de sa deacutetection en affichant une icocircne agrave droite dans la barre de navigation (par exemple un livre un chapitre un article dencycloshypeacutedie sera symboliseacute par un petit livre bleu)

Linterface de Zotero est inteacutegreacutee agrave Mozilla Firefox et peut sactiver agrave tout moment en cliquant sur le logo Zotero en bas agrave droite du navigateur Dans la Figure 6 sur la gauche (1) les collections sont classeacutees dans la

laquo Bibliothegraveque raquo qui repreacuteshysente lensemble des notices bibliographiques Au centre (2) il est possible de visuashyliser lensemble des articles composant une collection Un encart (3) permet de visualishyser et deacutediter les informations formant la notice relative agrave un document Longlet (4) offre la possibiliteacute dafficher les mots cleacutes potentiellement associeacutes agrave la fiche Comme ces champs sont rarement renseigneacutes il est possible de les choisir soi-mecircme Cette option est preacuteshycieuse pour ceux qui deacutesirent filtrer les articles par mots cleacutes gracircce au moteur inteacutegreacute (5) En cas dexport dune biblioshygraphie les mots cleacutes seront eacutegalement exporteacutes

La force du logiciel est dautoriser la creacuteation et lexport de bibliographies aux

formats deacutediteurs de textes les plus reacutepandus De plus Zotero offre une mise en forme bibliographique adapshytable au domaine de recherche de lutilisateur voire mecircme au type de revue gracircce agrave un vaste panel de styles bibliographiques pour les traitements de texte Depuis janvier 2012 Zotero existe eacutegalement sous forme de logiciel indeacutependant ce qui noblige plus agrave utiliser Firefox

Quel LGRB pour quel usage

Pour connaicirctre les pratiques en matiegravere de creacuteashytion assisteacutee de bibliographies nous nous reacutefeacuterons agrave une enquecircte reacutealiseacutee en deacutecembre 2011 (Kembellec 2012) aupregraves dun panel dutilisateurs de 195 personnes Le groupe est constitueacute de conservateurs et de docushymentalistes de Services Communs de Documentation duniversiteacutes parisiennes denseignants chercheurs en matheacutematiques informatique sciences de la comshymunication et mecircme dun maicirctre de confeacuterences en lettres ayant fait sa thegravese en LaTEX (bien que ces prashytiques soient moins reacutepandues hors des sciences dures et des domaines techniques) Ils ont eacuteteacute interrogeacutes sur la maniegravere dont ils eacutecrivaient leurs bibliographies et les reacuteponses montrent que les usages et pratiques divergent selon les profils dutilisateurs mais aussi selon le type de sciences de rattachement

En STM BibTeX est souvent imposeacute comme format de bibliographie par les revues et eacutediteurs scientishyfiques Pour geacuterer leur bibliographie les chercheurs en sciences dures utilisent pour plus de la moitieacute dentre eux un logiciel deacutedieacute souvent JabRef ou Mendeley en

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collaboration avec Zotero Un usage conjoint de Zotero avec un autre outil permet de repeacuterer et denregistrer les notices depuis Internet puis de geacuterer la bibliographie avec un logiciel deacutedieacute En meacutedecine le format biblioshygraphique Ovid associeacute agrave MS Word pour leacutecriture geacutereacute par Mendeley est une alternative reconnue Nous proshyposons donc en sciences dures (sauf meacutedecine) lusage de JabRef ou BibDesk si lon preacutefegravere eacutecrire sous LaTEX Dans le cas dune pratique deacutecriture sous Ms Word il faut preacutefeacuterer Zotero ou Mendeley

En SHS les documents scientifiques eacutetant essentielshylement reacutedigeacutes avec des traitements de texte classiques les outils deacutedieacutes agrave LaTEX sont hors de propos Mecircme sils commencent agrave devenir compatibles mieux vaut privileacuteshygier des logiciels eacuteprouveacutes tels que Zotero ou Mendeley Cependant ceux qui preacutesentent des travaux agrave la mise en page avanceacutee avec des polices de caractegravere inteacutegrant des caractegraveres de langues mortes ou rares preacutefeacutereront parfois LaTEX Dans ce cas preacutecis assez rare lusage de JabRef ou BibDesk peut ecirctre utile

Dans les centres de documentation les usagers de linformation bibliographique sont souvent deacutejagrave eacutequipeacutes dun LGRB souvent payant comme EndNote Cela ne les empecircche pas de connaicirctre et dutiliser Zotero en compleacutement

Leacutetude montre que toutes les cateacutegories dusashygers (enseignants eacutetudiants documentalistes) utilisent souvent Zotero en association avec un autre logiciel Parmi les logiciels libres ou gratuits Zotero a semble-t-il le monopole de deacutetection des notices bibliograshyphiques et Mendeley celui de la gestion des bibliograshyphies Cependant avec larriveacutee du Zotero autonome (standalone) nous allons peut-ecirctre assister agrave leacutemershygence dun monopole

Conclusion

De plus en plus de solutions libres et gratuites de gestion de bibliographies sont opeacuterationnelles et les logishyciels proprieacutetaires nont plus le monopole de la qualiteacute en ce domaine Il existe donc un vrai choix de logishyciels selon le systegraveme dexploitation et le format biblioshygraphique Comme le faisait remarquer Carole Zweifel (2008) ces logiciels preacutesentent autant sinon plus dinshynovations fonctionnelles que les produits payants Car avec leacutevolution des usages tels le Web 20 et le Web seacutemantique les creacuteateurs de ces produits en sont les premiers usagers Parmi toutes ces applications libres les chercheurs devraient trouver un logiciel offrant une compatibiliteacute satisfaisante en matiegravere dimport dexport de deacutetection et de pratique collaborative

Il est tout agrave fait possible dutiliser les compatibishyliteacutes de formats entre les logiciels pour effectuer une veille technologique une recherche et un formatage norme depuis divers logiciels Par exemple le greffon de Firefox Zotero est particuliegraverement indiqueacute pour glaner

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des notices exposeacutees sur Internet Ensuite les fiches seront exporteacutees au format BibTEX ou RIS dans JabRef Bibdesk ou Mendeley Le fichier dexport enbib ou autre contenant la bibliographie pourra eacutegalement ecirctre exporteacute vers une interface Internet riche (RIA) qui sera accessible depuis nimporte quel poste nomade eacutequipeacute dInternet et dun navigateur Notons que presque tous les logiciels lourds (Mendeley) ou hybride (Zotero) posshysegravedent une plateforme de sauvegarde ou de synchronishysation en ligne qui peut parfois eacutegalement servir de base communautaire Le chaicircnage logiciel requiert une cershytaine expertise rapidement acquise par la manipulation Mais pour ceux qui souhaitent un minimum de manishypulation et une tranquilliteacute desprit sur la qualiteacute de leur bibliographie JabRef est le bon compromis car la posshysibiliteacute de deacutetecter et de manipuler les meacutetadonneacutees des articles au format PDF rend son usage simple et convishyvial De plus les formats dimport-export eacutetant devenus compatibles avec tous les environnements son usage ne se cantonne plus agrave creacuteer des bibliographies pour les eacutedishyteurs OpenOffice et LaTEX

Agrave la question peut on trouver une alternative seacuterieuse aux logiciels de gestion bibliographique laquo proshyfessionnels raquo payants la reacuteponse est claire oui bien sucircr Il existe maintenant des programmes de qualiteacute adapteacutes agrave chaque speacutecialiteacute scientifique mais aussi en accord avec les sensibiliteacutes individuelles face aux diffeacuteshyrents modegraveles eacuteconomiques de distribution reg

Sources consulteacutees

Bergquist M and J Ljungberg 2001 The Power of Gifts Organizshying Social Relationships in Open Source Communities Inforshymation Systems Journal 11 (4) 305-320

DellOrso F 2010 Bibliography Management Software Analysis and Comparison of Some Packages Text ES Burioni Ricerche Bibliografiche En ligne lthttpwwwburioniitforumdel-lorsobms-dasptextindexhtmlgt (consulteacute le 1er septembre 2012)

Jullien N and JB Zimmerman 2005 Peut-on envisager une eacutecoshylogie du logiciel libre favorable aux nuls Cahier de recherche Mocircle armoricain de recherche sur la socieacuteteacute de linformation et les usages dInternet (MARSOIN) (9-2005) En ligne lthttp wwwmarsouinorgspipphp article65gt (consulteacute le ier sepshytembre 2012)

Kembellec G 2012 Technologie et pratiques bibliographiques assoshycieacutees agrave leacutecriture scientifique en milieu universitaire En ligne lthttphalarchives-0uvertesfrhal-00661550gt (consulteacute le ier septembre 2012)

Laskowski T Center for History and New Media Launches Zotero Research Tool The George Mason University Gazette En ligne lthttpgazettegmueduarticles9088gt (consulteacute le ier sepshytembre 2012)

Lupovici C 1998 Le Digital Object Identifier Bulletin des biblioshythegraveques de France 43 (3) 49-54

Masur R 2009 Eacutetude sur la valorisation des logiciels de gestion de reacutefeacuterences bibliographiques (LGRB) dans le milieu des bibliothegraveques universitaires romandes et sur les avantages et limites du plug-in Zotero Genegraveve Haute eacutecole de gestion de Genegraveve (HEG-GE) En ligne lthttpdocreroch

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lmphp Url=iooo4i92009iii2i42i4i-PATDB_2ioipdfgt (consulteacute le 1er septembre 2012)

Poupeau G 2011 Microformats RDF microdata repreacutesenter le contenu dune page Web Documentaliste-Sciences de Vlnjor-mation 48 4) 33

mdashbull RDF La grammaire universelle des machines Documentashyliste-Sciences de lInformation 4 (4) 31 bull

Stallman R 1992 Why Software Should Be Free Software Ownershyship and Intellectual Property Rights 31 En ligne lthttp wwwgnuorgphilpsophyshouldbefreeenhtmlgt (consulteacute le 14 septembre 2012)

Toulin S M Ghazelas and F Palencia 2009 JabRef outil de gestion de donneacutees bibliographiques utilisation avantages et inconveacutenients E-migrinter (3) 58-63

Trainor C and J Price 2010 Chapter 4 The Future of OpenURL Linking Adaptation and Expansion Library Technology

Reports46(7) 27-33 Van deSompel H 2001 Generalizing the OpenURL Framework

Beyond References to Scholarly Works The Bison-Futeacute Model D-lib 7 (78) En ligne lthttpwwwdliborgdlibjulyoi vandesompelo7vandesompelhtmlgt (consulteacute le Ier septembre 2012)

Zweifel C 2008 Logiciels de gestion deacute references bibliograshyphiques Citons le Libre Reumlssi Revue eacutelectronique suisse deacute science de linformation 7 Eh ligne lthttpwwwressich nodei47gt (consulteacute le 14 septembre 2012)

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Page 9: Étude comparée de quatre logiciels de gestion de

s effectue eacutegalement agrave partir de filtres sur des opeacuterateurs de type laquo est raquo ou laquo contient raquo et peut sappliquer sur nimshyporte quel champs BibTEX par exemple lauteur le titre ou les mots cleacutes Dans lexemple de la Figure 4 les eacuteleacutements (1) repreacutesentent les champs laquo tester raquo avec 1 laquo opeacuterateur raquo (2) et les laquo arguments raquo (3) Cela peut ecirctre traduit en langage naturel par laquo creacuteation dun groupe filtrant les documents comportant les mots cleacutes ACM et CCS raquo

BibDesk possegravede son propre moteur dindexation auquel il est possible dapshypliquer des regravegles de classeshyment en groupes intelligents Le moteur de recherche de BibDesk permet danalyser la structure des fichiers biblioshygraphiques au format BibTEX ainsi que bon nombre de bases de connaissances preacutedeacutefinies Parmi ces bases de connaissances citons

bull des sites dont laccegraves en consultation est gratuit comme ACM (meta donneacutees et reacutesumeacutes en accegraves libre) arXiv CiteULike Google Scholar IACR (Cryptologie)

bull des sites accessibles par abonnement comme IEEE Xplore MathSciNet Project Euclid Sprin-gerLink Zentralblatt Math

bull les sites respectant les normes bibliographiques BibTEX COinS HCite cette option permet dutiliser BibDesk comme navigateur Web deacutedieacute agrave la recherche scientifique et dinseacuterer agrave la voleacutee les notices neacutecessaires agrave leacutetablissement dune bibliographie

BibDesk possegravede une interface de navigation Web qui propose la deacutetection de notices bibliographiques au format OpenURL Il est ainsi possible dinseacuterer direcshytement les citations dans la base de notices dun simple clic sur le bouton laquo importer raquo

Depuis janvier 2011 la communauteacute Bibdesk propose un module qui permet dutiliser BibDesk avec le traitement de texte MS Word pour inseacuterer dynamishyquement des citations et geacuteneacuterer la bibliographie dun document

Zotero

Formats dimport de Zotero

Bien sucircr la capaciteacute de Zotero agrave deacutetecter un docushyment ou une notice deacutependra de lexposition des meacuteta-

donneacutees Il faut agrave minima que le document soit deacutecrit de maniegravere correcte en Dublin Core sur la page XHTML Les reacutesultats visibles agrave lœil cest-agrave-dire les liens vers les ressources sont ainsi accompagneacutes par des meacuteta-donneacutees descriptives normaliseacutees Zotero est agrave mecircme de comprendre ces meacutetadonneacutees et de les proposer agrave lusager soit en import massif soit en ne seacutelectionnant que les documents inteacuteressant le chercheur Les notices glaneacutees peuvent ensuite ecirctre eacutediteacutees trieacutees et classeacutees Un moteur de recherche inteacutegreacute permet dacceacuteder intuishytivement au catalogue ainsi reacutealiseacute

Formats dexport de Zotero

Zotero permet lexport de tout ou partie de sa base de citations aux formats RIS BibTEX RDF Refer et MODS Il est possible de copier une reacutefeacuterence dans le presse-papier pour ensuite la coller dans son traitement de texte favori en tant queacuteleacutement de bibliographie ou texte formateacute Il existe un module dinteacutegration pour MS Word qui permet limport formateacute depuis Zotero

Fonctionnaliteacutes de Zotero

Notons que Zotero permet la geacuteneacuteration de fichiers au format BibTEX Il semble que le gros avantage de Zotero soit de pouvoir deacutetecter intelligemment aussi bien les reacutefeacuterences bibliographiques que les documents eux-mecircmes Zotero offre donc une chaicircne de producshytion quasi automatiseacutee allant de la deacutetection ou limport jusquagrave la geacuteneacuteration de bibliographies en de nombreux styles et sous de nombreux formats Il est compatible avec Word lautre outil de production scientifique et il est mecircme possible dexporter une citation biblio-

1 9 4 OCTOBRE bull DEacuteCEMBRE 2012 | DOCUMENTATION ET BIBLIOTHEgraveQUES

graphique par un simple laquo cliquer deacuteplacer raquo vers un eacutediteur ou un client de messagerie Sous Word 2008 et 2011 (MAC OS) un portage a eacuteteacute proposeacute pour inseacuterer des citations depuis Zotero et geacuteneacuterer dynamiquement la bibliographie avec quelques styles

Ce module possegravede eacutegalement un moteur de recherche inteacutegreacute permettant de parcourir les reacutefeacuterences enregistreacutees dans la base de lutilisateur Le reacuteel inteacuterecirct de Zotero est de proposer la possibiliteacute de deacutetecter sur le Web des ressources documentaires de diffeacuterents types et denregistrer en masse des notices bibliographiques gracircce aux meacutetadonneacutees exposeacutees par le site Web

Ici agrave lissue dune requecircte sur Google Scholar la reacuteponse est constitueacutee deacuteleacutements bibliographiques deacutetectables seacutepareacutement Licocircne Zotero de la barre de navigation signale la preacutesence de multiples entreacutees En cliquant sur cette icocircne une fenecirctre dalerte propose denregistrer une ou plusieurs notices dans la base (Figure 5)

Zotero permet eacutegalement au navigateur de deacutetecshyter et denregistrer un eacuteleacutement isoleacute comme la page pershysonnelle dun chercheur offrant la lecture de son dernier article Sil sagit dun document unique deacutecrit sur une page Web le module preacutecisera le type du document (un article un livre ou une videacuteo) lors de sa deacutetection en affichant une icocircne agrave droite dans la barre de navigation (par exemple un livre un chapitre un article dencycloshypeacutedie sera symboliseacute par un petit livre bleu)

Linterface de Zotero est inteacutegreacutee agrave Mozilla Firefox et peut sactiver agrave tout moment en cliquant sur le logo Zotero en bas agrave droite du navigateur Dans la Figure 6 sur la gauche (1) les collections sont classeacutees dans la

laquo Bibliothegraveque raquo qui repreacuteshysente lensemble des notices bibliographiques Au centre (2) il est possible de visuashyliser lensemble des articles composant une collection Un encart (3) permet de visualishyser et deacutediter les informations formant la notice relative agrave un document Longlet (4) offre la possibiliteacute dafficher les mots cleacutes potentiellement associeacutes agrave la fiche Comme ces champs sont rarement renseigneacutes il est possible de les choisir soi-mecircme Cette option est preacuteshycieuse pour ceux qui deacutesirent filtrer les articles par mots cleacutes gracircce au moteur inteacutegreacute (5) En cas dexport dune biblioshygraphie les mots cleacutes seront eacutegalement exporteacutes

La force du logiciel est dautoriser la creacuteation et lexport de bibliographies aux

formats deacutediteurs de textes les plus reacutepandus De plus Zotero offre une mise en forme bibliographique adapshytable au domaine de recherche de lutilisateur voire mecircme au type de revue gracircce agrave un vaste panel de styles bibliographiques pour les traitements de texte Depuis janvier 2012 Zotero existe eacutegalement sous forme de logiciel indeacutependant ce qui noblige plus agrave utiliser Firefox

Quel LGRB pour quel usage

Pour connaicirctre les pratiques en matiegravere de creacuteashytion assisteacutee de bibliographies nous nous reacutefeacuterons agrave une enquecircte reacutealiseacutee en deacutecembre 2011 (Kembellec 2012) aupregraves dun panel dutilisateurs de 195 personnes Le groupe est constitueacute de conservateurs et de docushymentalistes de Services Communs de Documentation duniversiteacutes parisiennes denseignants chercheurs en matheacutematiques informatique sciences de la comshymunication et mecircme dun maicirctre de confeacuterences en lettres ayant fait sa thegravese en LaTEX (bien que ces prashytiques soient moins reacutepandues hors des sciences dures et des domaines techniques) Ils ont eacuteteacute interrogeacutes sur la maniegravere dont ils eacutecrivaient leurs bibliographies et les reacuteponses montrent que les usages et pratiques divergent selon les profils dutilisateurs mais aussi selon le type de sciences de rattachement

En STM BibTeX est souvent imposeacute comme format de bibliographie par les revues et eacutediteurs scientishyfiques Pour geacuterer leur bibliographie les chercheurs en sciences dures utilisent pour plus de la moitieacute dentre eux un logiciel deacutedieacute souvent JabRef ou Mendeley en

DOCUMENTATION ET BIBLIOTHEgraveQUES | OCTOBRE bull DEacuteCEMBRE 2012 | 1 9 5

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collaboration avec Zotero Un usage conjoint de Zotero avec un autre outil permet de repeacuterer et denregistrer les notices depuis Internet puis de geacuterer la bibliographie avec un logiciel deacutedieacute En meacutedecine le format biblioshygraphique Ovid associeacute agrave MS Word pour leacutecriture geacutereacute par Mendeley est une alternative reconnue Nous proshyposons donc en sciences dures (sauf meacutedecine) lusage de JabRef ou BibDesk si lon preacutefegravere eacutecrire sous LaTEX Dans le cas dune pratique deacutecriture sous Ms Word il faut preacutefeacuterer Zotero ou Mendeley

En SHS les documents scientifiques eacutetant essentielshylement reacutedigeacutes avec des traitements de texte classiques les outils deacutedieacutes agrave LaTEX sont hors de propos Mecircme sils commencent agrave devenir compatibles mieux vaut privileacuteshygier des logiciels eacuteprouveacutes tels que Zotero ou Mendeley Cependant ceux qui preacutesentent des travaux agrave la mise en page avanceacutee avec des polices de caractegravere inteacutegrant des caractegraveres de langues mortes ou rares preacutefeacutereront parfois LaTEX Dans ce cas preacutecis assez rare lusage de JabRef ou BibDesk peut ecirctre utile

Dans les centres de documentation les usagers de linformation bibliographique sont souvent deacutejagrave eacutequipeacutes dun LGRB souvent payant comme EndNote Cela ne les empecircche pas de connaicirctre et dutiliser Zotero en compleacutement

Leacutetude montre que toutes les cateacutegories dusashygers (enseignants eacutetudiants documentalistes) utilisent souvent Zotero en association avec un autre logiciel Parmi les logiciels libres ou gratuits Zotero a semble-t-il le monopole de deacutetection des notices bibliograshyphiques et Mendeley celui de la gestion des bibliograshyphies Cependant avec larriveacutee du Zotero autonome (standalone) nous allons peut-ecirctre assister agrave leacutemershygence dun monopole

Conclusion

De plus en plus de solutions libres et gratuites de gestion de bibliographies sont opeacuterationnelles et les logishyciels proprieacutetaires nont plus le monopole de la qualiteacute en ce domaine Il existe donc un vrai choix de logishyciels selon le systegraveme dexploitation et le format biblioshygraphique Comme le faisait remarquer Carole Zweifel (2008) ces logiciels preacutesentent autant sinon plus dinshynovations fonctionnelles que les produits payants Car avec leacutevolution des usages tels le Web 20 et le Web seacutemantique les creacuteateurs de ces produits en sont les premiers usagers Parmi toutes ces applications libres les chercheurs devraient trouver un logiciel offrant une compatibiliteacute satisfaisante en matiegravere dimport dexport de deacutetection et de pratique collaborative

Il est tout agrave fait possible dutiliser les compatibishyliteacutes de formats entre les logiciels pour effectuer une veille technologique une recherche et un formatage norme depuis divers logiciels Par exemple le greffon de Firefox Zotero est particuliegraverement indiqueacute pour glaner

1 9 6 OCTOBRE bull DEacuteCEMBRE 2012 | DOCUMENTATION ET BIBLIOTHEgraveQUES

des notices exposeacutees sur Internet Ensuite les fiches seront exporteacutees au format BibTEX ou RIS dans JabRef Bibdesk ou Mendeley Le fichier dexport enbib ou autre contenant la bibliographie pourra eacutegalement ecirctre exporteacute vers une interface Internet riche (RIA) qui sera accessible depuis nimporte quel poste nomade eacutequipeacute dInternet et dun navigateur Notons que presque tous les logiciels lourds (Mendeley) ou hybride (Zotero) posshysegravedent une plateforme de sauvegarde ou de synchronishysation en ligne qui peut parfois eacutegalement servir de base communautaire Le chaicircnage logiciel requiert une cershytaine expertise rapidement acquise par la manipulation Mais pour ceux qui souhaitent un minimum de manishypulation et une tranquilliteacute desprit sur la qualiteacute de leur bibliographie JabRef est le bon compromis car la posshysibiliteacute de deacutetecter et de manipuler les meacutetadonneacutees des articles au format PDF rend son usage simple et convishyvial De plus les formats dimport-export eacutetant devenus compatibles avec tous les environnements son usage ne se cantonne plus agrave creacuteer des bibliographies pour les eacutedishyteurs OpenOffice et LaTEX

Agrave la question peut on trouver une alternative seacuterieuse aux logiciels de gestion bibliographique laquo proshyfessionnels raquo payants la reacuteponse est claire oui bien sucircr Il existe maintenant des programmes de qualiteacute adapteacutes agrave chaque speacutecialiteacute scientifique mais aussi en accord avec les sensibiliteacutes individuelles face aux diffeacuteshyrents modegraveles eacuteconomiques de distribution reg

Sources consulteacutees

Bergquist M and J Ljungberg 2001 The Power of Gifts Organizshying Social Relationships in Open Source Communities Inforshymation Systems Journal 11 (4) 305-320

DellOrso F 2010 Bibliography Management Software Analysis and Comparison of Some Packages Text ES Burioni Ricerche Bibliografiche En ligne lthttpwwwburioniitforumdel-lorsobms-dasptextindexhtmlgt (consulteacute le 1er septembre 2012)

Jullien N and JB Zimmerman 2005 Peut-on envisager une eacutecoshylogie du logiciel libre favorable aux nuls Cahier de recherche Mocircle armoricain de recherche sur la socieacuteteacute de linformation et les usages dInternet (MARSOIN) (9-2005) En ligne lthttp wwwmarsouinorgspipphp article65gt (consulteacute le ier sepshytembre 2012)

Kembellec G 2012 Technologie et pratiques bibliographiques assoshycieacutees agrave leacutecriture scientifique en milieu universitaire En ligne lthttphalarchives-0uvertesfrhal-00661550gt (consulteacute le ier septembre 2012)

Laskowski T Center for History and New Media Launches Zotero Research Tool The George Mason University Gazette En ligne lthttpgazettegmueduarticles9088gt (consulteacute le ier sepshytembre 2012)

Lupovici C 1998 Le Digital Object Identifier Bulletin des biblioshythegraveques de France 43 (3) 49-54

Masur R 2009 Eacutetude sur la valorisation des logiciels de gestion de reacutefeacuterences bibliographiques (LGRB) dans le milieu des bibliothegraveques universitaires romandes et sur les avantages et limites du plug-in Zotero Genegraveve Haute eacutecole de gestion de Genegraveve (HEG-GE) En ligne lthttpdocreroch

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lmphp Url=iooo4i92009iii2i42i4i-PATDB_2ioipdfgt (consulteacute le 1er septembre 2012)

Poupeau G 2011 Microformats RDF microdata repreacutesenter le contenu dune page Web Documentaliste-Sciences de Vlnjor-mation 48 4) 33

mdashbull RDF La grammaire universelle des machines Documentashyliste-Sciences de lInformation 4 (4) 31 bull

Stallman R 1992 Why Software Should Be Free Software Ownershyship and Intellectual Property Rights 31 En ligne lthttp wwwgnuorgphilpsophyshouldbefreeenhtmlgt (consulteacute le 14 septembre 2012)

Toulin S M Ghazelas and F Palencia 2009 JabRef outil de gestion de donneacutees bibliographiques utilisation avantages et inconveacutenients E-migrinter (3) 58-63

Trainor C and J Price 2010 Chapter 4 The Future of OpenURL Linking Adaptation and Expansion Library Technology

Reports46(7) 27-33 Van deSompel H 2001 Generalizing the OpenURL Framework

Beyond References to Scholarly Works The Bison-Futeacute Model D-lib 7 (78) En ligne lthttpwwwdliborgdlibjulyoi vandesompelo7vandesompelhtmlgt (consulteacute le Ier septembre 2012)

Zweifel C 2008 Logiciels de gestion deacute references bibliograshyphiques Citons le Libre Reumlssi Revue eacutelectronique suisse deacute science de linformation 7 Eh ligne lthttpwwwressich nodei47gt (consulteacute le 14 septembre 2012)

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Page 10: Étude comparée de quatre logiciels de gestion de

graphique par un simple laquo cliquer deacuteplacer raquo vers un eacutediteur ou un client de messagerie Sous Word 2008 et 2011 (MAC OS) un portage a eacuteteacute proposeacute pour inseacuterer des citations depuis Zotero et geacuteneacuterer dynamiquement la bibliographie avec quelques styles

Ce module possegravede eacutegalement un moteur de recherche inteacutegreacute permettant de parcourir les reacutefeacuterences enregistreacutees dans la base de lutilisateur Le reacuteel inteacuterecirct de Zotero est de proposer la possibiliteacute de deacutetecter sur le Web des ressources documentaires de diffeacuterents types et denregistrer en masse des notices bibliographiques gracircce aux meacutetadonneacutees exposeacutees par le site Web

Ici agrave lissue dune requecircte sur Google Scholar la reacuteponse est constitueacutee deacuteleacutements bibliographiques deacutetectables seacutepareacutement Licocircne Zotero de la barre de navigation signale la preacutesence de multiples entreacutees En cliquant sur cette icocircne une fenecirctre dalerte propose denregistrer une ou plusieurs notices dans la base (Figure 5)

Zotero permet eacutegalement au navigateur de deacutetecshyter et denregistrer un eacuteleacutement isoleacute comme la page pershysonnelle dun chercheur offrant la lecture de son dernier article Sil sagit dun document unique deacutecrit sur une page Web le module preacutecisera le type du document (un article un livre ou une videacuteo) lors de sa deacutetection en affichant une icocircne agrave droite dans la barre de navigation (par exemple un livre un chapitre un article dencycloshypeacutedie sera symboliseacute par un petit livre bleu)

Linterface de Zotero est inteacutegreacutee agrave Mozilla Firefox et peut sactiver agrave tout moment en cliquant sur le logo Zotero en bas agrave droite du navigateur Dans la Figure 6 sur la gauche (1) les collections sont classeacutees dans la

laquo Bibliothegraveque raquo qui repreacuteshysente lensemble des notices bibliographiques Au centre (2) il est possible de visuashyliser lensemble des articles composant une collection Un encart (3) permet de visualishyser et deacutediter les informations formant la notice relative agrave un document Longlet (4) offre la possibiliteacute dafficher les mots cleacutes potentiellement associeacutes agrave la fiche Comme ces champs sont rarement renseigneacutes il est possible de les choisir soi-mecircme Cette option est preacuteshycieuse pour ceux qui deacutesirent filtrer les articles par mots cleacutes gracircce au moteur inteacutegreacute (5) En cas dexport dune biblioshygraphie les mots cleacutes seront eacutegalement exporteacutes

La force du logiciel est dautoriser la creacuteation et lexport de bibliographies aux

formats deacutediteurs de textes les plus reacutepandus De plus Zotero offre une mise en forme bibliographique adapshytable au domaine de recherche de lutilisateur voire mecircme au type de revue gracircce agrave un vaste panel de styles bibliographiques pour les traitements de texte Depuis janvier 2012 Zotero existe eacutegalement sous forme de logiciel indeacutependant ce qui noblige plus agrave utiliser Firefox

Quel LGRB pour quel usage

Pour connaicirctre les pratiques en matiegravere de creacuteashytion assisteacutee de bibliographies nous nous reacutefeacuterons agrave une enquecircte reacutealiseacutee en deacutecembre 2011 (Kembellec 2012) aupregraves dun panel dutilisateurs de 195 personnes Le groupe est constitueacute de conservateurs et de docushymentalistes de Services Communs de Documentation duniversiteacutes parisiennes denseignants chercheurs en matheacutematiques informatique sciences de la comshymunication et mecircme dun maicirctre de confeacuterences en lettres ayant fait sa thegravese en LaTEX (bien que ces prashytiques soient moins reacutepandues hors des sciences dures et des domaines techniques) Ils ont eacuteteacute interrogeacutes sur la maniegravere dont ils eacutecrivaient leurs bibliographies et les reacuteponses montrent que les usages et pratiques divergent selon les profils dutilisateurs mais aussi selon le type de sciences de rattachement

En STM BibTeX est souvent imposeacute comme format de bibliographie par les revues et eacutediteurs scientishyfiques Pour geacuterer leur bibliographie les chercheurs en sciences dures utilisent pour plus de la moitieacute dentre eux un logiciel deacutedieacute souvent JabRef ou Mendeley en

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collaboration avec Zotero Un usage conjoint de Zotero avec un autre outil permet de repeacuterer et denregistrer les notices depuis Internet puis de geacuterer la bibliographie avec un logiciel deacutedieacute En meacutedecine le format biblioshygraphique Ovid associeacute agrave MS Word pour leacutecriture geacutereacute par Mendeley est une alternative reconnue Nous proshyposons donc en sciences dures (sauf meacutedecine) lusage de JabRef ou BibDesk si lon preacutefegravere eacutecrire sous LaTEX Dans le cas dune pratique deacutecriture sous Ms Word il faut preacutefeacuterer Zotero ou Mendeley

En SHS les documents scientifiques eacutetant essentielshylement reacutedigeacutes avec des traitements de texte classiques les outils deacutedieacutes agrave LaTEX sont hors de propos Mecircme sils commencent agrave devenir compatibles mieux vaut privileacuteshygier des logiciels eacuteprouveacutes tels que Zotero ou Mendeley Cependant ceux qui preacutesentent des travaux agrave la mise en page avanceacutee avec des polices de caractegravere inteacutegrant des caractegraveres de langues mortes ou rares preacutefeacutereront parfois LaTEX Dans ce cas preacutecis assez rare lusage de JabRef ou BibDesk peut ecirctre utile

Dans les centres de documentation les usagers de linformation bibliographique sont souvent deacutejagrave eacutequipeacutes dun LGRB souvent payant comme EndNote Cela ne les empecircche pas de connaicirctre et dutiliser Zotero en compleacutement

Leacutetude montre que toutes les cateacutegories dusashygers (enseignants eacutetudiants documentalistes) utilisent souvent Zotero en association avec un autre logiciel Parmi les logiciels libres ou gratuits Zotero a semble-t-il le monopole de deacutetection des notices bibliograshyphiques et Mendeley celui de la gestion des bibliograshyphies Cependant avec larriveacutee du Zotero autonome (standalone) nous allons peut-ecirctre assister agrave leacutemershygence dun monopole

Conclusion

De plus en plus de solutions libres et gratuites de gestion de bibliographies sont opeacuterationnelles et les logishyciels proprieacutetaires nont plus le monopole de la qualiteacute en ce domaine Il existe donc un vrai choix de logishyciels selon le systegraveme dexploitation et le format biblioshygraphique Comme le faisait remarquer Carole Zweifel (2008) ces logiciels preacutesentent autant sinon plus dinshynovations fonctionnelles que les produits payants Car avec leacutevolution des usages tels le Web 20 et le Web seacutemantique les creacuteateurs de ces produits en sont les premiers usagers Parmi toutes ces applications libres les chercheurs devraient trouver un logiciel offrant une compatibiliteacute satisfaisante en matiegravere dimport dexport de deacutetection et de pratique collaborative

Il est tout agrave fait possible dutiliser les compatibishyliteacutes de formats entre les logiciels pour effectuer une veille technologique une recherche et un formatage norme depuis divers logiciels Par exemple le greffon de Firefox Zotero est particuliegraverement indiqueacute pour glaner

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des notices exposeacutees sur Internet Ensuite les fiches seront exporteacutees au format BibTEX ou RIS dans JabRef Bibdesk ou Mendeley Le fichier dexport enbib ou autre contenant la bibliographie pourra eacutegalement ecirctre exporteacute vers une interface Internet riche (RIA) qui sera accessible depuis nimporte quel poste nomade eacutequipeacute dInternet et dun navigateur Notons que presque tous les logiciels lourds (Mendeley) ou hybride (Zotero) posshysegravedent une plateforme de sauvegarde ou de synchronishysation en ligne qui peut parfois eacutegalement servir de base communautaire Le chaicircnage logiciel requiert une cershytaine expertise rapidement acquise par la manipulation Mais pour ceux qui souhaitent un minimum de manishypulation et une tranquilliteacute desprit sur la qualiteacute de leur bibliographie JabRef est le bon compromis car la posshysibiliteacute de deacutetecter et de manipuler les meacutetadonneacutees des articles au format PDF rend son usage simple et convishyvial De plus les formats dimport-export eacutetant devenus compatibles avec tous les environnements son usage ne se cantonne plus agrave creacuteer des bibliographies pour les eacutedishyteurs OpenOffice et LaTEX

Agrave la question peut on trouver une alternative seacuterieuse aux logiciels de gestion bibliographique laquo proshyfessionnels raquo payants la reacuteponse est claire oui bien sucircr Il existe maintenant des programmes de qualiteacute adapteacutes agrave chaque speacutecialiteacute scientifique mais aussi en accord avec les sensibiliteacutes individuelles face aux diffeacuteshyrents modegraveles eacuteconomiques de distribution reg

Sources consulteacutees

Bergquist M and J Ljungberg 2001 The Power of Gifts Organizshying Social Relationships in Open Source Communities Inforshymation Systems Journal 11 (4) 305-320

DellOrso F 2010 Bibliography Management Software Analysis and Comparison of Some Packages Text ES Burioni Ricerche Bibliografiche En ligne lthttpwwwburioniitforumdel-lorsobms-dasptextindexhtmlgt (consulteacute le 1er septembre 2012)

Jullien N and JB Zimmerman 2005 Peut-on envisager une eacutecoshylogie du logiciel libre favorable aux nuls Cahier de recherche Mocircle armoricain de recherche sur la socieacuteteacute de linformation et les usages dInternet (MARSOIN) (9-2005) En ligne lthttp wwwmarsouinorgspipphp article65gt (consulteacute le ier sepshytembre 2012)

Kembellec G 2012 Technologie et pratiques bibliographiques assoshycieacutees agrave leacutecriture scientifique en milieu universitaire En ligne lthttphalarchives-0uvertesfrhal-00661550gt (consulteacute le ier septembre 2012)

Laskowski T Center for History and New Media Launches Zotero Research Tool The George Mason University Gazette En ligne lthttpgazettegmueduarticles9088gt (consulteacute le ier sepshytembre 2012)

Lupovici C 1998 Le Digital Object Identifier Bulletin des biblioshythegraveques de France 43 (3) 49-54

Masur R 2009 Eacutetude sur la valorisation des logiciels de gestion de reacutefeacuterences bibliographiques (LGRB) dans le milieu des bibliothegraveques universitaires romandes et sur les avantages et limites du plug-in Zotero Genegraveve Haute eacutecole de gestion de Genegraveve (HEG-GE) En ligne lthttpdocreroch

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lmphp Url=iooo4i92009iii2i42i4i-PATDB_2ioipdfgt (consulteacute le 1er septembre 2012)

Poupeau G 2011 Microformats RDF microdata repreacutesenter le contenu dune page Web Documentaliste-Sciences de Vlnjor-mation 48 4) 33

mdashbull RDF La grammaire universelle des machines Documentashyliste-Sciences de lInformation 4 (4) 31 bull

Stallman R 1992 Why Software Should Be Free Software Ownershyship and Intellectual Property Rights 31 En ligne lthttp wwwgnuorgphilpsophyshouldbefreeenhtmlgt (consulteacute le 14 septembre 2012)

Toulin S M Ghazelas and F Palencia 2009 JabRef outil de gestion de donneacutees bibliographiques utilisation avantages et inconveacutenients E-migrinter (3) 58-63

Trainor C and J Price 2010 Chapter 4 The Future of OpenURL Linking Adaptation and Expansion Library Technology

Reports46(7) 27-33 Van deSompel H 2001 Generalizing the OpenURL Framework

Beyond References to Scholarly Works The Bison-Futeacute Model D-lib 7 (78) En ligne lthttpwwwdliborgdlibjulyoi vandesompelo7vandesompelhtmlgt (consulteacute le Ier septembre 2012)

Zweifel C 2008 Logiciels de gestion deacute references bibliograshyphiques Citons le Libre Reumlssi Revue eacutelectronique suisse deacute science de linformation 7 Eh ligne lthttpwwwressich nodei47gt (consulteacute le 14 septembre 2012)

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Page 11: Étude comparée de quatre logiciels de gestion de

collaboration avec Zotero Un usage conjoint de Zotero avec un autre outil permet de repeacuterer et denregistrer les notices depuis Internet puis de geacuterer la bibliographie avec un logiciel deacutedieacute En meacutedecine le format biblioshygraphique Ovid associeacute agrave MS Word pour leacutecriture geacutereacute par Mendeley est une alternative reconnue Nous proshyposons donc en sciences dures (sauf meacutedecine) lusage de JabRef ou BibDesk si lon preacutefegravere eacutecrire sous LaTEX Dans le cas dune pratique deacutecriture sous Ms Word il faut preacutefeacuterer Zotero ou Mendeley

En SHS les documents scientifiques eacutetant essentielshylement reacutedigeacutes avec des traitements de texte classiques les outils deacutedieacutes agrave LaTEX sont hors de propos Mecircme sils commencent agrave devenir compatibles mieux vaut privileacuteshygier des logiciels eacuteprouveacutes tels que Zotero ou Mendeley Cependant ceux qui preacutesentent des travaux agrave la mise en page avanceacutee avec des polices de caractegravere inteacutegrant des caractegraveres de langues mortes ou rares preacutefeacutereront parfois LaTEX Dans ce cas preacutecis assez rare lusage de JabRef ou BibDesk peut ecirctre utile

Dans les centres de documentation les usagers de linformation bibliographique sont souvent deacutejagrave eacutequipeacutes dun LGRB souvent payant comme EndNote Cela ne les empecircche pas de connaicirctre et dutiliser Zotero en compleacutement

Leacutetude montre que toutes les cateacutegories dusashygers (enseignants eacutetudiants documentalistes) utilisent souvent Zotero en association avec un autre logiciel Parmi les logiciels libres ou gratuits Zotero a semble-t-il le monopole de deacutetection des notices bibliograshyphiques et Mendeley celui de la gestion des bibliograshyphies Cependant avec larriveacutee du Zotero autonome (standalone) nous allons peut-ecirctre assister agrave leacutemershygence dun monopole

Conclusion

De plus en plus de solutions libres et gratuites de gestion de bibliographies sont opeacuterationnelles et les logishyciels proprieacutetaires nont plus le monopole de la qualiteacute en ce domaine Il existe donc un vrai choix de logishyciels selon le systegraveme dexploitation et le format biblioshygraphique Comme le faisait remarquer Carole Zweifel (2008) ces logiciels preacutesentent autant sinon plus dinshynovations fonctionnelles que les produits payants Car avec leacutevolution des usages tels le Web 20 et le Web seacutemantique les creacuteateurs de ces produits en sont les premiers usagers Parmi toutes ces applications libres les chercheurs devraient trouver un logiciel offrant une compatibiliteacute satisfaisante en matiegravere dimport dexport de deacutetection et de pratique collaborative

Il est tout agrave fait possible dutiliser les compatibishyliteacutes de formats entre les logiciels pour effectuer une veille technologique une recherche et un formatage norme depuis divers logiciels Par exemple le greffon de Firefox Zotero est particuliegraverement indiqueacute pour glaner

1 9 6 OCTOBRE bull DEacuteCEMBRE 2012 | DOCUMENTATION ET BIBLIOTHEgraveQUES

des notices exposeacutees sur Internet Ensuite les fiches seront exporteacutees au format BibTEX ou RIS dans JabRef Bibdesk ou Mendeley Le fichier dexport enbib ou autre contenant la bibliographie pourra eacutegalement ecirctre exporteacute vers une interface Internet riche (RIA) qui sera accessible depuis nimporte quel poste nomade eacutequipeacute dInternet et dun navigateur Notons que presque tous les logiciels lourds (Mendeley) ou hybride (Zotero) posshysegravedent une plateforme de sauvegarde ou de synchronishysation en ligne qui peut parfois eacutegalement servir de base communautaire Le chaicircnage logiciel requiert une cershytaine expertise rapidement acquise par la manipulation Mais pour ceux qui souhaitent un minimum de manishypulation et une tranquilliteacute desprit sur la qualiteacute de leur bibliographie JabRef est le bon compromis car la posshysibiliteacute de deacutetecter et de manipuler les meacutetadonneacutees des articles au format PDF rend son usage simple et convishyvial De plus les formats dimport-export eacutetant devenus compatibles avec tous les environnements son usage ne se cantonne plus agrave creacuteer des bibliographies pour les eacutedishyteurs OpenOffice et LaTEX

Agrave la question peut on trouver une alternative seacuterieuse aux logiciels de gestion bibliographique laquo proshyfessionnels raquo payants la reacuteponse est claire oui bien sucircr Il existe maintenant des programmes de qualiteacute adapteacutes agrave chaque speacutecialiteacute scientifique mais aussi en accord avec les sensibiliteacutes individuelles face aux diffeacuteshyrents modegraveles eacuteconomiques de distribution reg

Sources consulteacutees

Bergquist M and J Ljungberg 2001 The Power of Gifts Organizshying Social Relationships in Open Source Communities Inforshymation Systems Journal 11 (4) 305-320

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